Unnamed: 0
int64 0
10.6k
| sequence_id
stringlengths 11
16
| sequences
stringlengths 33
498
| dot_bracket
stringlengths 33
498
|
---|---|---|---|
1,600 |
bpRNA_RFAM_38243
|
GAGAACUCUUAUUUUGAGAAUUGGAAUGAUGGGGUAACGCCCUGAAACGAUUCCCCUAAUCUCCGACAUGCGUUUAUCUCGUGCAAAAGAUAAAGGUGUGAAGCUCGGUAAAGUCGGCUGAAAGAUACCGUACGGAAAUCUCUACGUGAAAUAGAGAAGGUAAACGAAAGUGCCUUAGCGGUAAGGUAUGUAUCUGAUAGGUCGGGGGUCGGAAAA
|
.................((((((......(((((.....)))))...)))))).......(((((((((((.(((((..((......))))))).)))))....))))))...((((((...(((((((((............((..............))..)))...((((((((....))))))))))))))....))))))...........
|
1,601 |
bpRNA_RFAM_1396
|
GCAGCAAGGGUGGUCUCAACCUGGGUUCAUUCCCCAGCUAAUAAAGUUCGAUUCUUUGUAGCGGCU
|
.((((((..((((..)))).(((((.......)))))....(((((.......)))))))))))..
|
1,602 |
bpRNA_RFAM_8295
|
AACUCAUCCAGAGGGGUGGAGGGAUCGGCCCUAUGAAACCCCGGCAACCGCAGGCAGCAAUGCUUGGACUGGUGCUAAGUCCGACAGAAUCAUUCUGGAAGAUGAGGG
|
.(((((((......(((...(((.....)))......)))..(((.((((((.............)))..))))))........((((.....))))...))))))).
|
1,603 |
bpRNA_RFAM_40672
|
UAGACGGCCAAGAGACUGAAGUCCUCCAUUUUUUCACAGAACAGGUAGAACAUGGACAACAGCAAUUCAAGUUUUCCCCACACUGCCCUGCCAAUGUGCCUCGAUCCUGACCUGGGGGGGCCACCUCUGGGGUGAGAGGGUGGCUCAUUCAUUCAGUCCUUGGCCAUUCUUCUGAAACAGCCAAC
|
.(((..((..((..((((((..(((((.((((((..(((.(.....(..((((((.....(((((.................)))))......)))))).)...).)))..(((((((.....))))))).).))))))))))........)))))))))..))...))................
|
1,604 |
bpRNA_RFAM_10257
|
UCUCGUGAUGAAAACUCUGUCCAGUUCUGCUACUGAAGGGAGAGAGAUGAGAGCCUUUUAGGCUGAGGAA
|
.(.(.................((((......))))................................)).
|
1,605 |
bpRNA_RFAM_21966
|
UUCAUUCUUUCAGUGUUGAAACAUUCUCUACUGAACCAAGCUCCAAAACAAGUUCACUGGGGUUUGUUUCACUAUUGCAAGAAUUGCUAAGUAUGAAGC
|
.((((((((.((((((((((((((.(((((.(((((...............))))).))))).)))))))))))))).)))))).))............
|
1,606 |
bpRNA_RFAM_27186
|
AUUGCAGACCGGUGAUGAAACUGUUCUAGGAAGUGCCGUCUUAGAAACAAUGAUUAUGAAUUGGACGCUGAGGUCA
|
......((((.............................................................)))).
|
1,607 |
bpRNA_RFAM_33544
|
GAAUUUUUGAUUAACGCUUGUAAAUGAACCGCCUUAAUGUCGUCGUGCAGACAUUAAAUCGGCUUAUGCACAAGUCACUUGGAAG
|
...............(((((((..............................................)))))))..........
|
1,608 |
bpRNA_CRW_16293
|
CUGGUGGCUAUAGCGCGGGGGAAACACCUCUUCUCAUUUCGAACAGAGAAGUUAAGUCCCGCAGCGCCGAUGGUACUGGCCGUUGGCCGGUAGAGUAGGACGUUGCCAGG
|
(((((((.....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((..((((((...))))))..)))))))...))))))).
|
1,609 |
bpRNA_RFAM_31838
|
UUUGGGCGCGGUGAUGGAGUUCACCAUCUACUACAAAUAUGGAAAACCGUCCAACUUCUUUAGCCGGACUAAUAACUCCUACCUAUAA
|
...............((((((...........................((((.............))))....)))))).........
|
1,610 |
bpRNA_RFAM_22821
|
AUUUAUUGAAGACUCCGAGCAUUAUUUCCUAACUCUAAAAAUUAAAGACAAAUUUUUGAUAUGGAAUUUAUGCCAGUAACAGCAUAAAGCUGUUCAAAGGAUAACUUAGAAAUGGGUUGUCCUCUCGUGUUUAGAAAGGUGUCAAAUGCAGUCUAUU
|
..((.(....((((((..(((((((((((...((((....................))))..))))))))))).....(((((.....)))))....(((((((((((....)))))))))))((.......))...))))))....).))......
|
1,611 |
bpRNA_RNP_407
|
AAACGCAGAGGACCAGAACUUUGGGACGGGAGGCGGGGGUUUUGUUCGCAGGCUCCUUCUUCCCGCUCCUGGUUCUACGCGGCGUGCGCUGUACCACCAUCGGUGGUUAUGGCGCUUACCCCGUGAGGGGGGCUUGGGGAACCGAGUCUAGCGUUGUUAUAAGAAAUCAAUCUUUUGGAUCCAGCCAGGGUCCUCUAGCAGAAAAGGGGGAUGGGGCUCUCUUGGGCUCUCCCCUCCACGCCUGCGGGAUUCUGAUGGGAAUGACAACGGUCGGUCCAUUUGACUUUAUCAUUACGAUGGUUCUAGUCGUGUUAUGGUAAAGGUCUGUUGAGUGCAAUUGUAGAGCAAAUUGAUUCAAUUUGAA
|
........((((((........................................................................................................((((....))))(((((((....)))))))...(((((((................................................((((..(((((((....))))))).))))...........................)))))))...))))))...((((((((((((((.(((((....)))))))))))))))).)))....................(((((((...)))))))..
|
1,612 |
bpRNA_SRP_424
|
GCCGGAGCGUUGCUCUGUAACCUUCGGGGGCUUCCUAGGUGGAGCGGGGGUGUCGUGGACCAGCGAGGGUGGCGCGCUGCGUUGACGCGGUGCUCUGCUUGGCUGUGUGUCGGUGUGGCCUGCCCCCCUGUAGAGGGGUGUCGUAGGCUACCCGUUGAAGCGAGGGAAACCGGGUCAGGCCGGAAACGGAACAGCCCAUCCUGCGCACGUCCGCCGUUGCAGAAUCACGCCGCGGAGCAUGACCGCACUUGAGCCCCACGCGCCGUCGCAAAACCUUUU
|
((((((((...)))))....(((..)))))).....((((...((((.((((.(((((....((..((((((.....(((.((..(((((((.(((((..(((.((((((..(.((...(.((.(((((....))))).)).)...))).....(...)(((.(((.....((((....(((....)))....)))).))))))))))))..)))...)))))....))))))))))))...))))..))..)).))))))))).))))...))))...
|
1,613 |
bpRNA_RFAM_4322
|
GGCGGGUUGCGGGAGCUGCGAGCGGCCGUCUCGUCUAACCCUAAAGAGAAAGGCGUAGGUGCUUGGCCUUGGCGACUCGCCCGCUGUUUUUUGGCUGGCUUUCAGCGGGUGAAGAGGCCCAAGACCUACCGCCACCCACCGUCUAGUGUCUUAAGGGCACAAAGUCCUGCCCGCCACCCUUCGAGGAGCGAAACCCAAAAAAGUCAGCCCCUGGCCGCCUCUCGCCCUCUCGCAACCCGCCUCCGUCCCAGCCUCCAUCCCCGCCCCAGGCCGCGGUCGGUCCGGGCUUCUUCGGAAGUCCCGUUGCCGUCGCGAAGAGUUCGCCUCUGUCAGCCGCGGGGCUUGGGGCCAGGGACGGGACCCUGUCCGCAGGGAGAGAAACUGGAGCCGGGCCCUCCACGGUGCCUCCCCGAGCUGUGGGAUCUGCACCCGGGACUCGAACCCUACACUU
|
.......((((((((.((((((.(((((.....................................(((((.......(((((((((.......[[[[[[[[[)))))))))..)))))................................................................................]]].]]]]]]...)))))....))))))))))))))..((((...((.(((.(((((....(((((.......(((((.((((..(((.............)))...))))))))).((((.....)))).......))))).....))))..)))).))...........))))...........(((((.((.((......((((.((((........))))....)))..)))).).)))))........
|
1,614 |
bpRNA_RFAM_18658
|
GAUGUUCGAAAGGAGGUUGUCCGUGAUGUAUUUGCUUUGUUUAUGGCAGAUAUUGCACGGUUGAUCUCUUUUCAUCAUC
|
.(((((.(.(((..((((..(((((....(((((............)))))....)))))..)))))..))).))))).
|
1,615 |
bpRNA_RFAM_25383
|
CAUCAUAUCUUAUUGCACGCAUAGCGGAUUGAAAC
|
.................(((...))).........
|
1,616 |
bpRNA_RFAM_9279
|
GUUGGUGAGCACUGCCGAGGUUCCCUGCUGCAGGCGUUUCAGCAGGGCUAAGACGGGAAGCCGAUGGCGCUCGCGUUGAGCGGAAUUCGGCGCUGCCCCCGCAACUGUGAGCGGCGAGCGGCGGUUCGAUGGGUGUCACUGGCGUUUACGAAGCGCUGGGAAGGCUAGAACCGUCGCGACGACCCGUGAGCCAGGAGACCUGCCUUUGGCGUGAUGACGUUC
|
...............((((((.(((...................))).....(.((...(((((......................)))))..(((....))).(((...((((.......((((((.......(((.((((((.........))))))...)))..))))))..........))))....)))....)))))))))...............
|
1,617 |
bpRNA_RFAM_13518
|
AGCUCAUUUCAAAGAGGGCUUGUGGAACUGAGACCAAGAGCUCUUAAGGCUGUGACCAAAGAUUGAGAUUUGCCAUAGAAUGCCACAGUCACUCCCUAGUGCUGUUUUCUCCUGUGGAGAUACAAGA
|
.((((((......((((((((.(((........)).)))))))))......))))))............(((((..((((....((((.((((....))))))))....))))..))))).......
|
1,618 |
bpRNA_RFAM_6372
|
AUAGGUGUGAUGAUUUUAGAUUACCGCCCCAGUCUGAUUUAUCUGACUGAUUGGUACCCCUCUGAACCUUU
|
..((...............................................................))..
|
1,619 |
bpRNA_RFAM_33580
|
UGGGCAGUAUCAUAAUGAACUGCACCUUUCUAUCUUUUUAUAUUGAAUAGUUUCUGCCUAGAUCCAGCAUAUGGACCGGGACAGAGGG
|
.(((((((.((.....))))))).))...........................((((((((.(((.......)))))))).)))....
|
1,620 |
bpRNA_RFAM_27564
|
ACUCAACACAUAAUUCUUUAAAAAAGGUGAGUCGUGGUUGUAAAAGCAAGCCGGACCUAGGAGCCGGAUCCUUGAUCAAUCAGUUAACCUUAAACUUUAUUUAAGGAGUUC
|
.......................(((((......(((((....(((....((((.........))))...)))....)))))....)))))....................
|
1,621 |
bpRNA_RFAM_36960
|
UGAUGGAUGAGCAGUGCUUUCCAGGACUGUCCAACCUGAGAAUGCUUGAGUUUUGGUCAAUCUCAGGUUCGUCAGCCCAUGAAAAACUGUCUCGCUCAAAGCC
|
........((((((((.((.(..((.(((.(.(((((((((.((.............)).))))))))).).))).))..).))...))))))))........
|
1,622 |
bpRNA_RFAM_513
|
CCUGGUGUCUCUAGCGCUUUGGAACCACUUCGAUUCCAUCCCGAACUCGAUUGUGAAACUUUGCUGCGGCUAAGAUACUUGCUGGGUUGCUGGCUGGGAAAAUAGCUCGAUGCCAGGA
|
.((((((((....((.(((((...((...((((((.......))..))))..))....)))))..))(((.((..(.((....((....)).....)).).)).))).))))))))..
|
1,623 |
bpRNA_RFAM_37810
|
GCCGUCGUGAGGCGGGAUCUGAAGGAAGCGUGGAGCAAAACCAUGACCUGACGAACAGAAAUCCGAUAUGAGGCCUACCCGGCUGGCGGAGCAAGCCAUUGAUUGCAAAGGCCAUAACCAUCAAGAGCCGGGGGGGUAGAUUGGGCAGGUGUGUGGUGAAAGCGGCUGAGC
|
.(((((....)))))............(((((..((...(((((((((((...........((((((.....(((.(((((((.((((..((((........))))...)))).............))))))).)))..))))))))))).))))))....))...)))))
|
1,624 |
bpRNA_RFAM_21280
|
UUUAAAAGCACCACUCGGAACCACUGAAUUUAUGUGUGUACUUGACGGCCAACAAGAGCAUCGAUCUAGCACCAUAUAAAUUCAGUAAUUUCGCGUCGAGAGCUAUUCUG
|
......(((....(.(((((((((((((((((((((.((.((.((((..............)).)).)).))))))))))))))))))))))).)......)))......
|
1,625 |
bpRNA_RFAM_42014
|
CGAUAAAAUCUGAUUACAAGAUGUAGUCAGAUUUUGGUAACUUCUAAAACUAA
|
...((((((((((((((.....)))))))))))))).................
|
1,626 |
bpRNA_RFAM_20996
|
AUUGUUCACUCUCUCUGAAGGCUUCAAACAGUCUCCAGCUGGCCUCAAGUUUGAGGCCUUUGGUUAGAGUGGACAAAAG
|
.....((((((((((((((((((((...........................)))))))))))))))))))).......
|
1,627 |
bpRNA_RFAM_6066
|
UUGCUGUGAUGAAACUAACUAGCUCACUUUGAUUAAACAUGAAAAGCUUUGAACUCCUGAGCAUC
|
.(((........................................................)))..
|
1,628 |
bpRNA_RFAM_23271
|
GUAGUGGUUUUUGUGUGAUGGCAUUUUUUAAAUCUGCCCCUAAGAAAAUCCUCCUAGCCUUAUUAGUGUAGGUUUGUUGAACUUAUGCGCAUGUAAAAGUAGCGGUCAUCUGGGU
|
..((.(((((..........((((((....))..)))).......)))))))...............(((((((.....))))))).............................
|
1,629 |
bpRNA_RFAM_36667
|
AUCAGGAAGAGGAAGAAAAGAGGGUCUGAGAGCGGUGGGCAUGGGAACAUGGAGGAAAGCCCAAACUCUUCUUCGCCUCUAGAACUAGGGGCUGAGAUUUGGUUUCCUUGUUUUCCUGAUGCCUCCCAUGCCUAUUGUUCUCAGAUGCUCCUUCCUCUUCCUUUUGGUU
|
........(((((.(((..(((..((((((((((.(((((((((((.(((.(.(((((((.................................................)))))))).)))..))))))))))).))))))))))..))).))).))))).........
|
1,630 |
bpRNA_RFAM_12040
|
GGGUGGAAUGAUGAUAACGAUUUUUCGGAUAUAUUAAUUUAUUCUGUCGACCAAAACUCAGACUACAAUUAUCUGACUAAUU
|
.(((((......................................................................))))).
|
1,631 |
bpRNA_RFAM_20929
|
UUAACCCAUUUAACAAUUUAAUCCAUCAAAUUAAAUGAGUUAUGGAUUGACACAACCCAUUUUGUUAAAUGGGUUGUGUCAAUCCAUAACUCAUUUAACCCUAAACUUAUUUGAUUAUGAGU
|
................................((((((((((((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))))))))))..........................
|
1,632 |
bpRNA_RFAM_9153
|
CUACGGUGGGUGCGUGAUGGUCCCCGCGCCGAAAGGCAAGGGGUGAAAAGGGAACACGGUGAGACCUCAAAAGGUCGAGACCGUGGCUGCCCCCGCAACUGUAAGCGGAGAGCAAGAUCCGACAUGCCACUGGCCGGCAAGGCUGGGAAGGCAGGAUUGCGCUGAGACCCGCGAGCCAGGAGACCUGCCAUCACUGAGUUGACCGGA
|
...............(((((((((................))).....(((...(((((.....................)))))..(((....))).(((...((((......((((((.....(((.((((((.....))))))...))).)))))).........))))....)))....)))))))))...............
|
1,633 |
bpRNA_RFAM_41238
|
GGGUUACUCCUUGGCGUUUACGCGCUGGUUUAAUAAAGAUUCGCCCCCCUAUCAAACUGGGUAACCCCACCCUUUGGCAAGGCCUUCUGUCCGAUCAAGUCGGAACUACUACACCUGAAGCCAGCCUAUAUCAAUCUGAUUACUACUGUAGUCGUUCGGUGAACGAUUUCAUCAUCAACUGCUAAGUUGACUACUUUGCAUUGCCCGUUA
|
.((((((.((...((((....)))).(((((((((.((........)).)))))))))))))))))..((....(((...((.((...(((((((...))))).))...........................................))))...))).................(((.(((((((.....))))))))))....))..
|
1,634 |
bpRNA_RFAM_19981
|
AGCCUUAGGAAAAAUAUUUCUUACUAGAUUAGAUUAUGGAAAGGAGUGUGUAGAAAUGCAUCUGCUACAUA
|
........(((...(((((((.(((.....................)))))))))))).)...........
|
1,635 |
bpRNA_RFAM_15907
|
CGGGCAGGCCUUUCAGGCAUCCUCUCCCAAACUUUUCCGGCCCGGUUGGCUCGUCCAGCCGGGCCUUUUUCUUGUCCGCG
|
.......((((...))))....................(((((((((.........)))))))))...............
|
1,636 |
bpRNA_RFAM_11172
|
GUUGGUAACCAUCAAAAGUAACAGCAUCUCCACUGGAAAUUGGUACACAGUCCACAUGGAGUUGCUGUUACACUUGAUAACACCAUU
|
..((((...((((((..(((((((((.(((((.((((.............))))..))))).)))))))))..))))))..))))..
|
1,637 |
bpRNA_RFAM_13407
|
UGCCUUUGUGUUGCCCGUUCAUUAUUUUCUACAAUGAAUGUGGUGUCAGACAAGGCAUAUAUUAAGUCUAGUUGGCAUGUGUUUUAGAGUGGGUCAUACACCCUUCUCUUCAUUUCAGCUAGAACAUAC
|
.((((((.((.((((((((((((.........)))))))).)))).))..))))))...........((.(((((....((((((((...((........))...)).)))))))))))).).......
|
1,638 |
bpRNA_CRW_28079
|
GGUGGGUUAGCCAAGCGGUUAGGCAGCGGCCUGCAAAGCCGUAUAGACGAGUUCGACUCUCGUACCCACCU
|
(((((((..((((.......))))((((((.......))))))...(((((.......)))))))))))).
|
1,639 |
bpRNA_RFAM_41560
|
UGAAAGCAGGUACUUUAGAAGCUGCGAUUUGCAUUUCUUCACCAGUUUGUGGGUUACGGCCUGUACGAGCAGCUCUUUCACGAACUUCGAAUGUACCGAAUCCGAUAAGUUGUACUUUUUCACCAGCAGCUAAAGUGUUAGUGAUUGA
|
......(..((((.((((..((((((...................(((((((..((((......(((((...)))))...)))))))))))......((((................)))).)))..)))))))))))....).....
|
1,640 |
bpRNA_RFAM_21398
|
AAAAGGUCCGCACUUUUGGGCUUCCAUAUCUUUCCCAGCUCCUCUCAUUUACUAUGGAUGCUGGCAAGAAAUGGCAGUCUAGAUGUGCAAAAUCCUGC
|
.........((((((.((((((.((((.((((..(((((....................))))).)))).)))).))))).)))))))..........
|
1,641 |
bpRNA_RFAM_13311
|
GUAGUCAGUGUGUGGAGGUGGAUUAGAGCCACCUUGGUACGACAAGUAGCUUUAGCUGCUUGAACGUCACGACAGUGACGGCCCGGAGGGUGAGGCUCGCAGAGCCGAAUAAUCCACCUCCCGCCACCA
|
..............(((((((.(........((....((((...((............))....((((((....))))))...)))).)))....................).))))))..........
|
1,642 |
bpRNA_RFAM_5243
|
UAACCCAUCAAACGGUUGUGAAAUGUUGCAUUUAUCAAAUCAUAUCACAGCCAUUUUGAUGAGUUUCG
|
....(((((((((((((((((..(((...............))))))))))))).)))))))......
|
1,643 |
bpRNA_RFAM_21803
|
AGAAUAUUGCGUAGGCCUUUGCUUCGAAAGAAACACUUUACUGUUCGCAGCAAUCUCCUCCGCAAUAUUUU
|
.((((((((((.(((...(((((.((((...............)))).)))))...))).)))))))))).
|
1,644 |
bpRNA_RFAM_9262
|
AAAUUGUAUAUUAGCUUAGGUGUCUGAUUAAUUUCAGGUGAAAAGGGAAUACGGUGAAAAUCCGUAACAGCCCCCGCUACUGUAAUGUGGACAAAUCUAAAACCACUGGUUUAUAACCGGGAAGGAAGAGGAGGAUGAAACUAAGUCAGGAGACCUGCCUAAGCUUUGGAUAAAGAC
|
...............((((((.(((..........))).....(((...(((((.......)))))..(((....))).(((...((((......(((...(((.((((((...))))))...)))))).........))))....)))....)))))))))...............
|
1,645 |
bpRNA_RFAM_9391
|
CCGUAUCUAACAGAUGACGGUUCUCCGAAAGGAGAGAUUUAGGGAACACGGUGCGGGUCUUCGACCCCAAGCCGCGGCUGCCCCCGCAACUGUAAUCGGCGAGUGUGAGGCCAAGACACCACUGGGCAACCGGGAAGGUGGUCUCACGCAGCGACCCGAGAGCCAGGAGACCUGCCGUCGACAUUGCUGUUGGC
|
...............(((((((((........))).....(((...(((((....................)))))..(((....))).(((...((((.......((((((.....(((.((((....))))...)))))))))..........))))....)))....)))))))))...............
|
1,646 |
bpRNA_RFAM_22722
|
GCUGGAAAAAAGCAAAUUAAGGGAAACCUUAAUACGCAAAACCACCGGCCUGUUGAUUGACUAUUUAGUCUAUGGCAGCGGAGUUACCAAG
|
...........((...((((((....))))))...))..((((.((((((....((((........))))...)))..)))))))......
|
1,647 |
bpRNA_RFAM_5541
|
AAAUGCUAACGGGAUACGGUGAGAUUCCGAACCGGUGGUGAAAGUCCACAAGCCAUAUUUAUUAUGGUUGAUUUGGUGAAAUUCCAAAACCGACAGUAUAGUCUGGAAGGGAGUUAGCAUUG
|
..((((((((......(((.......))).....((((.......))))......................(((((.......))))).....(((......))).......))))))))..
|
1,648 |
bpRNA_RFAM_29255
|
UUACGUUGAGCCACAAGGCUGCAGUAAAUGCUUACCAGGCAACGGGGGUAAGUU
|
...[[[[[..((.....)).........((((((((...]]]]].)).))))))
|
1,649 |
bpRNA_RFAM_4791
|
GAUGCGUCCAUGAAGUCACCAGCCCCAAGCCCCUCGUGGUGGGUGGUGAUGGAACCGUCAAAGCAGU
|
.((((.........((((((((((.....(((...)))..))))))))))............)))).
|
1,650 |
bpRNA_RFAM_39987
|
UAUAACGAAGUACUUCGUUUUCAGCGAGUUACGCUAAAUAUCAUCUACCGAAGUAUUACUACUUUAGAGGGAGGGGUUAUUGCUUAGUAUCAAACGAGGGGCAUAAAAAAAGCGCCGGGAGGCGCUUUUUACAUUAC
|
...........................................................((......)).......................................((((((((....)))))))).........
|
1,651 |
bpRNA_RFAM_29964
|
UGCUAGCCCUGAUUGUAACGACAUCCUUUUGUGGUGGGGUUCACCACAAAAGAUAUAGUGAAAAGCAGGAAUCAGC
|
........(((.((...((...((((..((((((((.....)))))))).))))...))...)).)))........
|
1,652 |
bpRNA_RFAM_17465
|
UCCACUUCUGUCAAUGAUGCAGAUAGAAUAUAGUAUGAGAUUAUGAUGAUUAUCACAAAUUCUCAUUCGUCACUACCUCUGAGACAGAAAUGGA
|
.(((((((((((......................................................................))))))))))).
|
1,653 |
bpRNA_RFAM_14308
|
AAGCCAGUAUACUUCAUCUGCUUAACUGAACGUGUUUUGCAGAAGGGAUGUGUGAAUAUGCUGGCAAUAGCAUAGCCUGGGUACGAGCCUUGAAGACUCUGUAGUCAUUAAGGUCCCUGAAAUUGGCAACAUCU
|
..(((((.........(((((.................))))).................))))).........((((........(((((((.(((......))).))))))).........)))).......
|
1,654 |
bpRNA_RFAM_37815
|
UCCAUCGUGAGGUGGAAUCUGAAGGAAGCCCUAGGCAAACUCUUGGUCUGACGAACAGAAAUCACAUAAGGCAGUUACGUAGGAUAAGCUUGCCAAACAAAGUAAAGUCCAAUAACUACACGGAAUACGUAAAUGUAUAUGUGGCAGAUAGAUGAGAGGAAAGAACAUGCC
|
.(((((....)))))............(((((..((...(((((((((((...........(((((....(((.(((((((((((..((((........))))...))))...............))))))).)))..).)))))))))...))))))....))..)))))
|
1,655 |
bpRNA_RFAM_16623
|
AGCACCUUAAAGCGUUUUCUUGUCGGCCAAAUUAUAAAAUGCUCUGGAAAAUCGUACAAAGUGUGCAAAACUAAAGUAAAAAACAGUUGCAAGUGAUUCCAAUAAACACAUUGUUGGAAUCCAUUACGCUGAUUACACGC
|
.(((((.....((((((((..((.(..............)))....))))).))).....).))))..............(((((((...(.(((((((.((((.......)))).)))).))))..)))))))......
|
1,656 |
bpRNA_RFAM_22518
|
CCUUAAUCCUUGCAACGAACCUGAGCCACUGAUUCAGUAAAAUACUCAGUGGCACAUGUUUGUUGUGAGGGUCAAAAGA
|
.....(((((((((((..((.((.((((((((.............)))))))).)).))..))))))))))).......
|
1,657 |
bpRNA_RFAM_21894
|
UUUCUGUUCACAGUGCUACCACUUAGUUCAGGUCCUCAUUUUCUCUUGCCUGGACUAUUGAAGUAGCCUUCACUGAACUGGUCUC
|
.(((.(((((.(.(((((((...(((((((((................)))))))))....)))))))).))...))).)))...
|
1,658 |
bpRNA_RFAM_1224
|
GAGGUGUUAGUAAAACAUUAUAUAAUUUUGUCAAAGUUAAGUUACAAGUGAAAGUCCUGUACACCUCA
|
.((((((..((((....)))).(((((.......)))))....(((((.......)))))))))))..
|
1,659 |
bpRNA_RFAM_43171
|
ACUAUGGAACCGAGGGCGGAUCUCGGCAUCUCCAUAAAAAUGUUUGAUAACAUUUUUUGGGGAUGUUUUUAGUAUUCGACAUAGU
|
.(((((...((((((.....))))))(((((((.........................)))))))..............))))).
|
1,660 |
bpRNA_RFAM_7010
|
UUGACAUCGUUGAUUCUUUAACCUAAUUUAGUGAGUAAGGGUAAGGGAGGAUUGCUCCUCCCCUGUGACUGACUGUUAAUAAGCUGGGAAACUUAUGAGUAACAGUACAAUCAGUAUGAUGGCAAGUCGCAUCAUAACCCUUCUCCUUCAA
|
.............................((.((..((((((..(((.............))).((((..........................................))))(((((((........))))))))))))).))))....
|
1,661 |
bpRNA_RFAM_22101
|
UUUAUCACUUGAAUGUUGACCGAAUAUGGAUGAAAAGUUGUUUUCUGUUUCCUUUCCUCCACAUUCGGUCAAUGUUCCAGUGAUGAG
|
.(((((.((((((..((((((((((.((.(((((((.............)..)))))).)).))))))))))..)))))).))))).
|
1,662 |
bpRNA_RFAM_37752
|
UCCAUCGUGAGGUGGAAUCUGAAAGAAGCUGGCGGCAAACAUCUGGUCUGACGAACAGAAACUUCAUAUAAGGCAUAAAAACCGUGGGUAAGGUUGCUACCCAAACCAAAGCCCUAUAGCUAUUCGGAACGGUUAAUGUAGAUGAAGCAGACAUAAGAUUGAAAGUUAAUACC
|
.(((((....))))).............((((..((...(((((((((((...........((((((.....(((.(.(.((((.((((..((((........))))...))))...............)))))).)))..)))))))))))...)))))....))..)))))
|
1,663 |
bpRNA_CRW_43913
|
GGCGAUGUAGCUCAGUCGGUUAGAGCGAACGACUCAUAAUCGUUAGGUCGCCGGUUCGAGUCCGGCCAUCGCUACAA
|
(((((((..((((.........))))((((((.......))))))....(((((.......))))))))))))....
|
1,664 |
bpRNA_RFAM_36484
|
AGCACAGAAGAUGAAGCCGGCUGUGGCUGAACAGUGCUGCGUCGGUGCCGACACUGUGCGAGA
|
.((((((........(((((.....................))))).......))))))....
|
1,665 |
bpRNA_RFAM_8131
|
AUUGUAUCAAGAGAGGUGGAGGGACUGGCCCUUUGAAACCUCGGCAGCAGGUUCAUUUUUGAAUACUGUGCCACUUCCUGCAAGCUUUAUAGCUUGAAAGAUAGAAU
|
.(((((((......(((...(((.....)))......)))..(((.((((((.........)))..))))))........((((........))))...))))))).
|
1,666 |
bpRNA_RFAM_3588
|
GGCUGGUCCGAUGGCGGUGAGAUUUCAAUUGAUUGCUACAGUGAGUUACAGAACCUCUAUGUUUCUUCUCUCCCCUCCCUCACCGCCGGCCUUGACUAGCUUUUG
|
.(((((((.((..((((((((............(((.((.....................)).)))............))))))...))..))))))))).....
|
1,667 |
bpRNA_RFAM_10395
|
UGCGCUGUGAACAAACGCGGCCUGGCGGGUCGCAGCGCCGCGCGGCGACCGCGAGGCGACCGGGAGCCGCUGGGACCCAGGCUGCGCGCCCCUCGGCCUGCCCGGGAGCCGCGCCAGUCGGAGUCCCGGGCCGAGCGGGGCUUGCCUCCCUCUCAGCGUUCCUCUGUGCGCAGUGCAGCCAGCGGGCAUGACCGAUCCACCAGGGGCGCCGCCGCCGGCGCCUGCAAGCCGCGGGUGAAGAAGAAAGUCCGGCCCCGCUCUUCUCAGAGCGAGAAGGUAGGGAGCAGCAGCAGGGAGUUGACUAGAAGUAAGAAAGUGACCCGUAGCAAGAACGUGACCGGGACCCAGGUAGAGGAGGUGACCAAGAUCGAGGAGGCG
|
..................((((((((.........((((((((((...)))).......((((((((......))))))))......))))))..)))))))).......................................(((((((...............((((((............))))))...............((((((((....))))))))................................(((((......)))))..................................................................................)))))))..................
|
1,668 |
bpRNA_RFAM_15082
|
GGUCAAUGAUGAACAGUAAAAGGUCUGAUUGCCCAGGUGCCCCUGCUUCCCAGCAGUCCCCAGCCGCCUCUCUCCCACAGGCUCCAGGUGUGCUGUUGUGGGCCAGAGGGCUGCUGACACUGUGUGAUGUCCCCAUCCCGCCUUCCCUGAUGAGCCUGGGUGAGGCACGUGGUCGGCAUCCAACAGCAUAGUCACUGAGGGGUCUGGUGUUGGGUGCAGGCGUCUGCGGUGUGAUCUGCCCUUUGCAGCUGAGACC
|
.(((.............................(((((...(((((..........(((((((((((......(((((((.(.........).)).)))))).......))))))........(.((((((.......(((((((((((.......))))))))))).......))))))).................))))......))))))....................))))..............))).
|
1,669 |
bpRNA_RFAM_17797
|
UGGUUGGUUUCCUGGGGAGUGGGCUCAGCAUACCCCACCUCCCCUCAGCCAAGCCUAGAGUAGAGAGGCCAGGCAUCCUCUCUGUGGGGGAGGCAUUCAAGUAAGGUGCCUCGCCUAGGCUAUCCAAGCCUCACAUUG
|
.((.((.......((((((((((..........))))))))))......))))...........(((((.(((...(((......((((...................))))....)))....))).)))))......
|
1,670 |
bpRNA_RFAM_31614
|
CUGAAAAGCUGAUGAAGAAAGUUCUUAAACUUCCCCUAAGACUACAGCACGGAUUGACAAGGAGGUCAAAUCGAGCGAAUACGCAACACGACGUUGCGUAUGAGCGUAUACGUCCGUAUAAAAGACAUAGACGGAAAGUUUUAGAAAGAUCCAAUCAGCUUUCUGG
|
.......((((((..(((((((((...((((((((...........((((((((((((......)))))))))..(((((....(((.....))).....)))))...))).....................))))))))...))))))).)))))))).......
|
1,671 |
bpRNA_RFAM_38033
|
GGCGCCGCGAGGCCGUGUGGGGAGGAAGUCCGAGGCGAACCGCAGCACCGAACGAAAGUGAACCCCCGAGCAGGCCGGAUCGACCGGGUGAGCGUGCCUACAAACGCGACGCCCAAAAUCCAACCGAGGUCGAUACGGUAGUGGGGGCGGGAGCGGCGGGACAUCCAGUGUU
|
.(((((....)))))............(((((..((...(((((((((((............((((((.....(((.(((((((.((((..((((........))))...))))..............))))))).)))..))))))))))).))))))....))..)))))
|
1,672 |
bpRNA_RFAM_27392
|
UUGAACCCAUCGCAACAGGGGCAAGACCAGGAGGCCAGUCAUGUUUUUCGAUAAUGUGGUGUUUGCCGGGGUGUUGACGGUCGGCCUCAUGGUCGUGUUUUUCGCAGGCUUUGGAUUAUUCAUCUGGAAAGACGCGCACAAGCGGAAAAAACCGUAGGUCUUUCCGGCUACAACGAGCACGCAAGGCAUUUUGGGCGACUUCGGUCGCCCUUUUUUUUG
|
.........((((..........................................(((.....)))................((((....)))).........)))).....................................................................((.(....))).....(((((((....))))))).........
|
1,673 |
bpRNA_RFAM_39752
|
GUGCUGAGUGGGUAUUUAUAUUCAAUACAGAUGAUAGACAAAGUAAAGAACCUUGCAUAUUUAUGACGAUGAGGCCGGAGUCUUCUUGUCAGAUAAAACGUUAGAUGCCAUUAAUGAAUUGAGAACUAUUCUAUUAUU
|
.((((((((..(((((((...)))))))..))).))).))(((........)))((((.((((((((((.(((((....))))).)))))..))))))))).((((((((((....))).)))))))...........
|
1,674 |
bpRNA_SRP_459
|
GCCGAGCUUGCACGAUAGCUUGUAACCCGAAUGGGGGCACCAAGAUGGUGGAACAUGGCUAUGACUUCACUGGGUUGGUCUGGUGGUUGCACCUUGUUGGCCUGCCCGCUCCAAGUCGAGAGGUGGGCCAUGUGUCUUUAGUGAAAGCUAAGGUCUUGUGGUUCCUAGACAGGAGGGCAAAGCGUGAGGCUGGUGUCACAGAGCAGCGAACACUUCUGGCUCCUGACAGUGGAGGGAUAACAGGCUGCUGCACCUUCAGCCCACAAAUGCCUAGUGAACCCAGCUACCUGAACUAUCAUUUUCU
|
((((((((........)))))....((((..)))))))...((((((((((..((.(..(..(..((.....(((.((...((.(..((........(((((((.((.(((((.((((.(((..((((((...(.(((((((....))))))).)...)))))).(..)..(((((......(((....(((......)))....)))....)))))..))).))))..)))))))....)))))))...)).)))....))......)))....))..)..)...).))..))))))))))..
|
1,675 |
bpRNA_RFAM_17341
|
GUUCCUUUUUAAGGCUGGCCCAGUGCUCUAAGAGGCUGAUACAGAAGGAUAAAGUUAAGUCUCCACAAAACCCAGGGAAGAGACUGUGAAACUCCUCUUAGAACCUUGUAUGGAGUCAUAGCC
|
.(((((((((...((((.(.(..........)..).))))..))))))))).......(.(((((......(((((((.(((.((....))))).)))))))........))))).)......
|
1,676 |
bpRNA_RFAM_3897
|
GGGGGUGUAUAGGUUUCGACUUGAAAAUGAAGUGUUAAUUGCAUGCGGAGGGCGUUGGCUGGCCUCCUAAAAAGCCAACAAAACAAUAAAUGCCGAACCUAAGGCUGAAUGCGAAAUUAUUAGCUUGUUUGACUCAGUAGAGGAAAGACUAGCUGCUUAAUUAGCAAAAGUUGUUAGCUAGAUAAUCUCUAGGUAACCCGGUAUCUGCGAGCUCCACCAGAGGCUUGCAAAAUACCGUCAUUUAUCUGGUUGGAACUUACUUUCUCUAAUUCUCAAGGAAGUUCGUUCGAGAUUUUUGAGAGUCAUUGGCUGCUAUAGAGGCUUCUAGCUAAGGGAGUCCAAUGUAAACAAUUCUAGAAGAUAAGCAUGUAGAGGUUAGCAGGGAGUUUGUCAAGGACGAGAGUUCGAGUCUCUCCACCUCCAUUA
|
.((((((...........((((((((..(((((((((((((((((([[[[[..(((((((..]]]]].....)))))))......................................................................(((((((((.........))))))))).......................((((((((.((((..[.[[[[[.)))).)))).))))........]]]]]].(((((((..........[[[[[[........)))))))........]]]]]].((((.(.....(((.[.[[..[[[))).....))).))...........]]]..]]]...)))))...)))))))))))))....)))))))).(((((.......))))))))))).....
|
1,677 |
bpRNA_RFAM_31835
|
AAGUCCGAAGGCGGUGGAGUCCGCCACAACCGUCAUGCGCCUGCCGUGGCCAAUGACUCCUGCGGGGUU
|
...............((((((..........((((...........))))....)))))).........
|
1,678 |
bpRNA_RFAM_33459
|
GGAGUAACCUCCAUCCAACGGAUCGUCGGGCACGUACCUGCCCGGAAGGAGAGCUAGAA
|
........(((((((...........((((((......)))))))))))))........
|
1,679 |
bpRNA_RFAM_35023
|
GGGUGCUUGAAGCUGUCUGCUUUAAGUGCUUGCAUCAGGCUGAGAGUAGGCAGAGAAAAGCCCCGUAUCAAUGUUAAUCAAUACGAGGCCCUCUGUAAUGCACGACAACAUUACGGUAGCCUUUUACCCGCCGAAAGGCAAGGAGGCUGAAGAUG
|
.((.(((....((((((((((.......................))))))))))....)))))......................((((..((((.((((........)))).)))).)))).................................
|
1,680 |
bpRNA_RFAM_43235
|
ACAUGGCGAAUGCAUGGGGAACUACAUCUGUGUCGCGAGUUCGAUUCUCGCCAGGGCCUGGUCCUGUAGCUCAGUUGGUAGAGCAAGCUGUUCCCCGGACACUUGUCGUCAUGAC
|
...((((((.....(((((((.(((..........(((((.....))))).((((((...))))))..((((........))))..))).)))))))........))))))....
|
1,681 |
bpRNA_RFAM_31301
|
UUGGUGCAUCCAGAGCGGCUCGCCCGACGCGGUGAGCCCGGCAACCUGCCCGGACCGGCAAGGUGCUUCGCGCAAACCCAGCGCAGAUGUGGCCCAUAGCGGCAACACGAGGUCCAGCC
|
.....(((((....(.(((((............))))))(((..(((((([[[[[[))).))).)))..................))))).((((....)))).......]]]]]]...
|
1,682 |
bpRNA_RFAM_7968
|
CUCUUAUCGAGAGCGGCAGAGGGACUGGCCCGAUGAAGCCCGGCAACCUAACUUUAUUUAAGCGUAAAGUGAAGGUGCUAAUUCCAGCAAAAAUGGUGUAUUCCGUUUUGAUAGAUAAGAG
|
.(((((((......(((...(((.....)))......))).(((.(((.(((................)))..))))))........((((...............))))...))))))).
|
1,683 |
bpRNA_RFAM_21189
|
AAACCCUUGUCGGACCUUUGUGGAUGUUUCCUUUUUCGGUGAAGUUGUUCCGUUGAAUUAUCUUCUUCACCGGGUUAACAUCUACAGAGGUCCUCGAGGGUUU
|
..((((((...(((((((((((((((((.(((....((((((((....................))))))))))).)))))))))))))))))..))))))..
|
1,684 |
bpRNA_RFAM_8223
|
UUCUUAUCGAGAGAAGCUAAGGGACCUGGCCUGUUGACGCUUCAGCAACCUCUAUCUCCAUUAGAAAGGUGCUACCUCCAGCAAGAUGUAUGUCUUGAAAGAUAAGAG
|
.(((((((......(((...(((......)))......)))..(((.((((((.........)))..))))))........((((........))))...))))))).
|
1,685 |
bpRNA_RFAM_4871
|
CAAUCGGUCCUUUUCAGGACCACCAUUCAGUUUUUAAAAGGAGGAA
|
.....((((((....)))))).........................
|
1,686 |
bpRNA_RFAM_38740
|
AGAAGCCCAGGGGUUGGCUGGCAGAGGAAGGGAAGGGUCCGGGGUCGGCUGAGCAUGCCCUCAGGUUGCUCACUGUUCUUCCCUAGAAUGUCAGGUGAUGUGUCACCCCAA
|
............((((.((((((.....(((((((..(...((((.(.(((((......))))).).))))...)..)))))))....)))))).))))............
|
1,687 |
bpRNA_RFAM_12106
|
GGCGUCAACGUGAUGAACUAUUUACGGAUGUAAAACUGUCCUUCGCGACUUGUCAUUUGUCCGAGAGCGCAAAACCGUGUGGAUGUUUCCGUUGCCUUCCUACUGAUCUGU
|
..(((...................((((...........................................................))))................))).
|
1,688 |
bpRNA_RFAM_28817
|
GGCAGCUCGCAGGAGUGCGGACUGUCGUCUGAUUGUUUGAGGGUGCCAGAUGUAAAUAAUCGGUGGAGCGGCUGCAAAAGAGCCGUCUCGCUGGGUAAAAUCAGGAUGUGCCGCGGAACCCGCUCCUCAGCUAGUCACACUUCGGAAGCGCGGGCAACGCAGGUAUUAUCGUUCUAAAGGGCCGGCUGCAACCGGCCC
|
.(((.((((((((...((((((....))))))...)))))))))))..............((((((.((((((.......)))))).))))))..............((((((((...(((((((...................))...)))))...))).)))))............(((((((......)))))))
|
1,689 |
bpRNA_RFAM_33132
|
AUCGUUCAUCUCUCUAGCAACUUACCUCUGUACUUACCUCUGUAUAGUUAGGCAUCUGGAGAGACGGAAGUAGGGGUUUCCCCGAAGGAACGCGCC
|
..(((((.(((((((..........................................))))))).........((......))....)))))....
|
1,690 |
bpRNA_RFAM_15520
|
UGCCAUCGUCGUCGAUCUCUAUCAACUAUCCUUGCGACUAUGGCA
|
.(((((.(((((.....................))))).))))).
|
1,691 |
bpRNA_CRW_47938
|
GGCCCGGUAGCUCAGUUGGUAGAGCACGCGACUGAAAAUCGCGGUGUCGCCAGUUCGAUUCUGGCCUGGGCCACCACUG
|
(((((((..((((........))))((((((.......))))))....(((((.......)))))))))))).......
|
1,692 |
bpRNA_RFAM_4643
|
ACGAGCCACAUGCAGGGAAACUUGCACGUGUGGUUCUGGCCGGGGACCCCGGUAUACUGUAC
|
..((((((((.(((((....)))))...))))))))..((.((.((......))..))))..
|
1,693 |
bpRNA_RFAM_14561
|
UUGUUUCUUAGAGUUCCUUUGAACGCUUCAUGCAUGAGAAUAUGUAUUUGGUCUAAUAUCCAUUAGAAAAGAUAGUUCUUCAUCAAUGAAGUGUUUGGGGGAACUCUUGGGUUCAA
|
....(((((.((((((((((.((((((((((((((..............................................))))))))))))).))))))))))).)))))....
|
1,694 |
bpRNA_RFAM_41723
|
CCCCGCAUACUGCGCGGGGCCUGUGUUUUGCAUUUGUAACCAAGGGGUCUGCUCGUG
|
.(((((((...))))))).......................................
|
1,695 |
bpRNA_RFAM_5562
|
UCAGAAUAAUGUCAAAGUGCUUACAGUGCAGGUAGUGAUAUGUGCAUCUACUGCAGUGAAGGCACUUGUAGCAUUAUGGUGA
|
.....(((((((..((((((((.((.(((((.(((............)))))))).)).))))))))...))))))).....
|
1,696 |
bpRNA_CRW_19096
|
AGGAACGGCCAUACCACGCCGAUCGCACCAUAUCCCGUCCGCUCUGUGAAGUUAAGCGGCGUCGGGCCAGGCUAGUACUACGGUGGGGGACCACGUGGGAAGCCCUGGUGCUGUUCCU
|
(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))
|
1,697 |
bpRNA_RFAM_26676
|
UGAAGAAUUAUGUAUAAUAACUUUUGCAGAAAAGUGAAAAGAUAAUGGCUAAUCUCUUGAAUAAAGGGGUGAUGCCUAUGGUUCAUAGCUUUAUCUCUAGAUGUAGUAGACAUGUCUGGAUUCGAAAUAUUAUUGCUAAUGGUUGCAUUCGUAACGCUAGUUUUGCUGGGGAUAGACCGUAU
|
............................................(((((...............((((((((.((............)).))))))))...............(((.((((.....)))).)))................)))))....((((.((....)).)))).....
|
1,698 |
bpRNA_RFAM_37541
|
GAGGGUAGACCCCUCGGACUCGCUUUACAGGAAGUGAUUCCAAACCACCCAUAAGCUGCUUUGGUCAAAAGCCACGGUAGUGAGCAUUAUGGGAAAAGGCGAGGCUAUGACUUCGUCAGGU
|
.((((.....)))).((((((.((((....)))).))))))...(..((.((((((.(((.((((.....)))).))).)).....)))).))....((((((........))))))..).
|
1,699 |
bpRNA_RFAM_15957
|
CAGGCAUGCUGGAGCUCCGCAGCGGCGCCCGGGUCGAAAACCCCGACACCGUAUUUCCAUCGGAGCUUGU
|
...........((((((((...(((....((((......)..)))...))).........))))))))..
|
Subsets and Splits
No community queries yet
The top public SQL queries from the community will appear here once available.