Unnamed: 0
int64
0
10.6k
sequence_id
stringlengths
11
16
sequences
stringlengths
33
498
dot_bracket
stringlengths
33
498
2,900
bpRNA_RFAM_2153
GUGCCUUAAACUAAUGAGUAAGGAAAAUUAAGAGCACUGUUAGCGCUUUGCUCAGCUUCCGCACAUUGGGCCGAACUUCCCGAAUGGGAUUCGGUUUCGUAAGCAGAAAUUUUUCCUAGAGGUACAGGUCGUCCCCUCGCAGUCGUCGCCGCCUACUUUUGCGGCGAUACUCGGGCGUGCCAGCGAUCUGCCUC
...(((((..........)))))........((((((((......))))))))(((((..........................................))))).............(((((..(((((((..((...(((((...(((((........)))))..))))).)).......))))))))))))
2,901
bpRNA_RFAM_21405
UAAAAAACGUCCCAAAAUUCCGAUCCGGCUUCCACAUCGAGCCUCAGCUAGAUCCAUAACUUGCUGGCAAGAUGUUGGCAGUCGCAUUGGAUAAAGGAGACAC
........(((((.....((((((.(((((((((((((..((..((((..............))))))..))))).)))))))).))))))....)).)))..
2,902
bpRNA_RFAM_3635
GUGCCUGUUGGUAAACUAAAAUACCACCAUCUCUUGCAUUUUUCCAGAGAUGGCAGUGGUUUGCCAAUUCAUUAGGGCCACACGCCAAUCUUUGCAGCCCCGUCGGGGUU
..((((.(((((((((((........((((((((...........))))))))...))))))))))).......)))).................(((((((.)))))))
2,903
bpRNA_CRW_33151
GCGGGUAUGGUGUAGUGGUAGCGCGCCGGCUUCCCAAGCCUGAAGUGCGGGUUCGAUUCCCGCUACCCGCUCCA
(((((((..((((.......))))((((((.......))))))...(((((.......))))))))))))....
2,904
bpRNA_RFAM_18158
GUGUCAUUUGAAAGGAGAGCAGGUUAGCACUCCCCUUGACAAGGAUGGAACACAUACCCUGAGAUCAGUGGGCACCCAGAGAAAACCUGAUCUCGGCCAUUUUUUUCGAUGACUUUUAGGUUUUUGC
......................................................((((....))))...............((((.......((((((.....))))))....))))..........
2,905
bpRNA_RFAM_42416
GCAUGCCGGGUGACAACCGGCCGUAACAGGGAAUUGGCGGACGCAGCUCAUUUUGCCGGUUUCUGGCUGCGACAUCAACGUAUCGGUACGCGCUGACGCCUAACCUGUUCCCGGC
.....((((.((((.....)))).((((((.....((((..(((((((................)))))))((..(........))).........))))...)))))).)))).
2,906
bpRNA_RFAM_9151
UUAGAUCAUGUCAUCUCAGGUGCCGCUUCGUGACGACGGGGCGGAGAAUUGGGAAGCCGGUCAAAGUCCGGCGCUGCCCCCGCAACGGUGGUGGAGUUCAAGUCGCAACGGGAGACCACUGGGCAAAAGCCUGGGAAGGUGUCGCGACCGUCCGCAAGGACACUCCAGAGCCCGGAAACCAGCCCGAGAUUUUUGAACUCGA
...............((((((.(((................))).....(((...(((((.......)))))..(((....))).(((...((((........((((((.....(((.((((((....))))))...))))))))).................))))....)))....)))))))))...............
2,907
bpRNA_RFAM_26701
UUGAAGAGAGGUUGGCGUUGCGGGCGCAGGGCGACGGGACAUCUUCCCGGGACCGACCUGUGUGCUGGUCCCGGAUUGACGGGUUUCCGACUCGUGUCUCUUGAUGGAGGCUCCCGGAGCCCGGCGGGCUUGGGCCUCAGUAUUAACAGAA
............((.)).................(.(((.(((.((..(((..(..((........))..)))....))..)))))).))............((((...(((((((........))))))).))))...............
2,908
bpRNA_RFAM_29488
AAUCGUCCGAUCUACCAUUUCAUUUGAUAGACCGCAGUAGGACUCAAGCCAUAGGACGGGGACUUGAG
...[[[[[.(((((.............)))))..........((((((((...]]]]].)).))))))
2,909
bpRNA_RFAM_25604
GCACCUCAUAAAACGGGUGCCGGGUUUCGCAGCCCGGAAAUGUACGAGGCGACACAUGACGCGCCGAGCGUCUUUUUU
.((((((......)))))).(((((......)))))....................((((((.....)))))).....
2,910
bpRNA_CRW_24590
GGGGGUGUAGUUCAGUUGGCAGAACACCCGCUUUGCAAGCGGGAUGUCGCAGGUUCGAUGCCUGUCACCUCCACCA
(((((((..((((........))))((((((.......))))))....(((((.......))))))))))))....
2,911
bpRNA_CRW_18842
GAGUACGACCAUACUUGAGUGAAAGCACCAUAUCCCGUCCGAUUUGUGAAGUUAAGCACCCACAGGCUUAGUUAGUACUGAGGUCAGUGAUGACUCGGGAACCCUGAGUGCCGUACUCCCAACUUCUUUUU
(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))).............
2,912
bpRNA_RFAM_38100
AUCCGGGUUCCAAUCCCGGCGGGCAACUUCGCUCCAGCCCGAAGCACUGGGAGCGAUUCAGGAGGUAACAAAUGAAUUGAAGUACUACCAGAAAAGGGCCGUGCAAAGCGGUCCAGCGAACCAUGCAGGCCGUAACGCGC
...................(((((............))))).......(((((((((((...((....))...)))))).....)))))......((((((.......)))))).(((............))).......
2,913
bpRNA_RFAM_21259
CGAGUCGGCGCCGUCUAAGUGAAUGCUUUGCCACAGUCUUCGACCAUGUCAAAUGAAGCCUGGGCUAAGAUUCGCUUAGGCCGGCGUUUUUCGACACG
.(((((((((((((((((((((((.((..(((.(((((((((...........))))))))))))..))))))))))))).))))))....)))))).
2,914
bpRNA_RFAM_41234
GGGUUACUCCUUUGCGCUUUCAGCGCUCAAUUUGAUAAAGAUUCGCACCUCUAUCAAACCGGGUAACCCCACCUUUGGCAAGGCCUACUGUCAGAUUAAAUCUGAACUACUACAAAUGAACAGAUACUUAGUCCAGCUCGACUUCAUCUCCUUUAUAAAAUUCAACUCGUUGUCGUUCUGUUGCGCCAAUACGCUGUUU
.((((((.((...((((.....))))..(((((((((.((........)).)))))))))))))))))..((...(((...((.((...(((((((...))))).)).((((.(.............)))))..)).))....))).................(((.(((((((.....)).)))))))).....))..
2,915
bpRNA_RFAM_2933
GAGGAAAGUCCGGGCUCGCACAUUCUGUGAUGAAUGUAGUGUUUGUGCUGGAUGAAACGAUAAAUCCAGGCAGCGUAAGCUGACGGCUGGAGAAGGCCUGUGGUGAAAGCUAUGGCGGACUCCUUUAAAAGUGCCACAGAAACGAGCUUUUCGGGAAACCGGAAAGAUGGAACGGGUAAACCCCGCAAGCGAGAAACCCAAAUUUGGUAGGGGAAUCUAAUCACGGCAAAACGAAGCCAGUGAUCGGAACGUGGAAACACGUAGAUAAAUGACUGCCACUUUCGCAAGAGAGUACAAAACACGGCUUA
.....(((.((((((((((((((((......)))))).....(((((((((((..........))))))[((((.....))).)((..((....((((...(((....)))..)))).....))].....(((((...........((((((((....))))))))........)))..))))))))))))))...(((..........)))...(((((((...................))))))).((((.....)))).................((((.....)))).......)))))))).
2,916
bpRNA_RFAM_38374
AGAGAGCCAUACAGGAAAGGGGGUAACGGACCGUCCUGGCCCCGAGUCAUGCGUGGGCGACCGUGAGGGCGCCGGCGAAGCGUUGACAGGGGAACGCGCAGGCGAGGUAUUGAGCCGCGAAAUCAGGCUGAACCAGUGUGCCGACGCCGUCUGAGUAGGCGGAAGGCGAAACCGGAGGGGGCAUUAGCGUGAGUCCUCAUCUGGACGGGCGCGGUCGGAGACCC
...........(((((..(((........))).))))).((((..((((((((((.((((((....)))))).)))...))).)))).)))).....................((((((.............((.(.(.(((..((((.........))))...)))....(((((((((((..........))))))))).)).)).)))))))...).....
2,917
bpRNA_RFAM_24313
UUAAGAGAUGUGUUUCUGCUGUAAAUAUGGCUGGAGAACAAUUGGUAGGCUUUAGCUGGGCAGCCAAUGAGUAUUGGAUUGCCCAUAAAGAUUCUACUAACAUUG
............................................(((((.(((..(((((((.................)))))))..))).)))))........
2,918
bpRNA_RFAM_36356
AGCCGGACUAGGUUGGGAAGCCAGGCUCUUCCUGUUACCCGAAGCCUAUACGCGGGAACGACAGUCCAGAGAGGCCAACCUGGCCUCUGUUAAGCCUUGAGGAAUCAAUGAGAUUUCGGCCCAGCGGAUCGGAGGAUUACAGAAAGCAAUUCAAAGGAAAUGUUUUCCGUAACUUAUUCACCAACCCCGCCAGGUCCGGAAGGGAGCAACGGUAGGUGGAACUUUUGGUGCUGCUGGAUACCGGGGUCGAGUGAACUCGGGGGUAAACUUAGCAGGACGUCAGGCCCAAUCUGGGCGCGUCCGGUA
.((((((((((((((((((((.....)))))))....(((((.......)..))))))))).(((((((((((((((.(((.((((((((((((.(((((((((((((...((((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))..(((((((....(((....(((....)))....))))).)))))..)))).))))).))))))..)))))))))))))))))))))))....)))))))))))).))).)))))))))))).)))))))).
2,919
bpRNA_RFAM_27394
AUCGGAUGACGGCACACCAAGGGAGGGGCCGACAUGUUCUUCGACAACGUGGUUAUCGCCGGUGUGGUAACGGUCGGGCUGAUGUUGGCGUUCUUCGCCGGUCUGGGAAUUUUCAUCUGGAAGGAUUCGAACAAGCGCAAGCAGCGCUGAUCCUUCCCGAUUCACGAGCACGCAAGGCAUUUAGGGCGACUUCGGUCGCCCAUUUUUUUG
.........((((...................................(((.....)))................((((....)))).........))))...................................................................((.(....))).....(((((((....))))))).........
2,920
bpRNA_RFAM_9907
CCUCCAUUUCUUGGCGGAGGCCGGGUGCUUAGUCCUGGCCCCCGUUAUGUACGGAGGCAGAACAAGGGGACCCUGGGUCCCCCCGGCGUCAUGUCUUCGGUGCCGGCGGUUCCCCAUCCGCCGGUUCUAUCCUCAAUCGCCGGGACACCG
.((((.........((((((.((((........)))).))))))........))))...........................((((((.............(((((((........)))))))............))))))........
2,921
bpRNA_RFAM_33175
AAUAAUUAAAAAAACGAGGUCCAAUAAAUGACUUAUUUACAAGCUUCUCUUAACUUGUUGUUGAAGGAGGGCUCACACUAGCUAAUUUAAGCUAAAUGUGUGAGUCCUCUUUGACGUUUGUCAUUAACGAGGACGAAGAGACGUCCUCAGGACGUCUUUUU
..........................((((((......(((((.((.....)))))))..........((.((((((((((((......)))))...))))))).))............))))))...(((((((......))))))).............
2,922
bpRNA_SRP_632
AUCGGCUGUAAUGGUCAUAUUGGUUAAGGAGACGCCUGAAAAUCUUCUCCCGACUCCAGUCUCAUAUCCAUGAGAACUUCCCCCGUGGCGCCCAGCGUGAAUCUUGCGGUGGCCACCCACUCGCACGGGUAACCUGCGAUGCUGCGCCGUGGCCCUAAGCAAUGAAGAUGAUACUUGAGGGAGGCUUCACUCUGCAGAGGCAUCUUCACCGUCCGAUGGCAGGCUGGAUCACGAUCGUGGGGGGAAUGUGAGAUGGAGCGGAGAGGUGGGGAUGUCGACUCCGAUUUU
...(((.......))).....((((...........(.(.(.(.((.(......(.(.......(.(......).)....(((((((.((.(((((.((.(((..((((.((....(((.(((((.((....)))))))))..)..))......(...)...(((((((....(((....(((......)))....)))..)))))))))))..)))..)).)))))....))..))))))).............).)....).))....).).)..)....))))..
2,923
bpRNA_RFAM_15346
CUGGGGUAUGGCGACAUGGUACCAAAAACCAUAGCAGGGAAGAUUUUCGGGUCUAUCUGCUCACUGAGCGGAGUCUUGGUCAUCGCGCUACCCGUGCCUGUGAUCGUGUCUAAC
.(.((.(((((.((((.((.((..............((((........(((.........)))..........))))................)))).)))).))))).)).).
2,924
bpRNA_RFAM_19623
UCAUCUCUGAGAUAUGUUUGAUAUUCUUGGUUGUUUUAUUUAAUUUCAACCAAAUAUCGAACAUAUUUCAAGGCUGAAA
.((.((((..((((((((((..(((((.(((((.............))))).)))))))))))))))...)))).))..
2,925
bpRNA_RFAM_20840
GGUGUAUCUAUGGUAUGACUAUAAAGCAAUGAUACUGAUUCUCCAUUUGGGUUAUGGAAAUCAGUCUCAUUACCUUAUAGUUGCACUGGGUCUUC
......(((((..(((((((((((((...((((((.((((.(((((.......))))))))).))))))...)))))))))))))).))))....
2,926
bpRNA_CRW_26898
UCUCCUUUAGUAUAGGGGUAGUACACAAGCCUGUCACGCUUGCAGCCCGGGUUCGAAUCCCGGAGGGAGAG
(((((((..((((.......))))((((((.......))))))...(((((.......)))))))))))).
2,927
bpRNA_RFAM_24396
GUUGGUUGAAAAUCACCCCCGGUUUUGGCCGUGGCCGCGGGUGAAAUUCGGCGCCCAAGAGCCUCCGGGGGCCUCAGCUCACCGCGUGCUGCCGCCAUGUGCGGCGGUGAAACCCAGGCCCCGACAGGG
....((((((..((((....((((........))))....))))..))))))...............(.(((((....(((((...(((.........)))....))))).....))))).).......
2,928
bpRNA_RFAM_28079
AGCCGCACAUGUGCGAUUGGGAAACUCAUUCAGUUUAUUUUAUUUCCGAGACAAAGCUCUUGUCGUCAAUGGCGAGCCGAAACCUUCGAGGGCAUGCUUCACAACGGCGGUAUUAACAAGGAUGGCAAAGAACUCAAUUCCUGUCAUAACGAGUUUGUCCUAUUCUACGUGCGGUUUCUUUA
.......................................................(((.((((((((..((.....((((.(((.....)))..(((...)))...))))......))..)))))))))))...................................................
2,929
bpRNA_RFAM_18713
GGUGCUCGAGGAGAGGUCGCCCGUGGCGCGUUCGCAUCCAUCAUGACGCACAAUACACGGUCGACCUCUCUUCAGUACC
.(((((.(.(((..((((..(((((....(((((............)))))....)))))..)))))..))).))))).
2,930
bpRNA_RFAM_33778
CGGGUGGCACGCGACUGGCGAUAGGCUCUCAACCCGGCAAGGGCGUGAGACGCUGAAGUGGGAACACCACGGGGGAGCGUGCCGCAUUGCCAAUGUGGCAACUGUGUUUAGCCGUUCGCCUGGGCAGCCCUG
..((((((((((....................(((.....)))..............((((.....))))......))))))))))......................(((((.........))))).....
2,931
bpRNA_RFAM_13768
CUGCAGGCUGUUCAGCGAGGCUGAGUCUCCUGUGACUCUGUCCUUUCCUUUAUGUCUGCUAGAUAGACAUGGAGUGGUUUGAGACCCUGUUGUCUACUAAAUACAGCGUGGUUAUAGAAACUCCAGAUAAAC
..((((((.........(((..(((((......)))))...))).........))))))..........(((((..........((((((.(((.......))).)))))).........))))).......
2,932
bpRNA_RFAM_33888
AUGAUUGUGCUCAAAGCAUUGUCUCCGCAGACUAGGAUUCUUACCCUUUCCUACUUAAGCUUUGGGCACAAAAAC
.....((((((((((.((..............(((((...........)))))....)).)))))))))).....
2,933
bpRNA_RFAM_10797
GUCCACCUCCUCGCGUUCACUGCCGGAGCCGUUAUGUAUAUUUAAAAUUCAUAAGGCACGCGGUGAAUGCCAAGAGCGGACUC
..(((((((...((((.(((.........(((((((.............)))))))......))).))))...)))))))...
2,934
bpRNA_RFAM_28596
AUCAUGCCUCACGCCCGUGAGGUAGAGUAGGAGGAAUGGGGGCCUCCUGCUCACUGUUUAAAGCGGCC
....((((((((....))))))))((((((((((........))))))))))................
2,935
bpRNA_RFAM_42607
CUGUGGGGAUUUGUUGGGGAGAAAUGAAGUGGAUGUGUGUGUCGAUCCCGCCAGCUGUUACAAUCAGUCCCUCACCCGCGAGCGCUUCGGUGGCAGGCCCCACGCAUAGAUUGUUGUCUACACCAUCUUGCAUGUCUUUGUUGCCAGCCUUGCCAAUGCCCGCAAUCUUGCCAUCCUUAAUGCCAAUAUCGGCUUUGUAAAUGCCGGUAUAAUCCACGAUCAGAGCAUUGGUGAUGACCAAAUCCAACUCAUAGGAGCUAGGGCUGUUAGUUUGCCCCAUCCCAUCUCGAAUGG
.((.(((((.(((((((((((((......(((.((.((((....)))))))))...(((.......))).)))))).(..(((.(....((((((((((....((.(((((.((.......)).)))))))..))).)))))))..)).)..))....)))))))....((((..(((((((((......(((((((........((......)).....))))))).(((..(.((..(((......))))).)..))).)).))))))).))))........)))))..)).
2,936
bpRNA_RFAM_18268
AGGGGGGUCCCGGGGGCCAUUGAAGGAGCGUUCACGUCGCGGCCCCUGUCAGAUGAAAAUCUGCGAAUCCUUCA
............[[[[[...((((((((((..{....))).]]]]].}.(((((..)..))))....)))))))
2,937
bpRNA_RFAM_22810
ACUGAACAUAAACUCCUAGCCUUGGUGUCUACGUUGUCCGGUGUCGCGAAUACGUUUUUCGUUUACCGGCAAUAUGAUGCUCUGGCCGUGGCUUUAAGCCACCAGGGUGCGAGGUAGAAAUGCCUGCAUCUCCCGUAUUUGGAAAGGUGUUAUGGUACAACUUAC
..((.(....((((((..(((((((((((...((((.................................))))..))))))))))).(((((.....)))))..((((((.(((((....)))))))))))((.......))...))))))....).))......
2,938
bpRNA_RFAM_36059
GGAAGAGAUCGUUCCCCGGUGGGACGGCCGGUCUUCAAAACCGGCAGGGCCUGUCAAACAGGCUUGGGUAGGUUCGACUCCUGCUCUCUUCC
.((((((..(((.(((....))))))((((((.......)))))).(((((.........)))))...((((.......)))))..))))).
2,939
bpRNA_RFAM_7405
UCUGUCGUUGAUGAUACAUUUACAGCUUUGCUUGAGUUUAACGACCAUGAGAAAACUCUCAUGCACUACCAUCUGAGACAGA
.(((((......................................................................))))).
2,940
bpRNA_RFAM_33429
CCACCUUGCUUCAUCCAACGGACCGUCGGGCACGUACCUGCCCGGAGAAGGAAGUGAAA
........(((((((...........((((((......)))))))))))))........
2,941
bpRNA_RFAM_36099
GAGAGCGCAUGUGGCCCGGUGGCUGUCGCGGUCUUCAAAACCGUUGGGCGGAGUGACGAACUACGCCGGUGGGUUCGACUCCCACGCGCUCUC
.((((((((.((((((....))))))((((((.......)))))..).(((((..........))))).((((.......)))))))))))).
2,942
bpRNA_RFAM_27956
AGGCAAGGAAACUCGGCUAAAGGCCCUCACAUCCUGUGAGGAACGCCCAGUACCUUCGUCCUGAAGG
..........(((((((........(((((.....)))))....))))))).(((((.....)))))
2,943
bpRNA_RFAM_21979
GCUGCUGUUGGGAGACCCUGGUCUGCACUCUAUCUGUAUUCUUACUGAAGGGAGCGCAGGGCAGGGUUUCCCAUACAGAGGGC
....((((((((((((((((.(((((.((((.((.(((....))).))..)))).))))).)))))))))))).)))).....
2,944
bpRNA_RFAM_34697
UAAUUUAGACAAACAAAAAGGAAGCCUUGCAUUAACAAGACUUCCCCAGUAGAGCCGUUUAAGACGGUAGCAAUUAAUUAGUGAUUAAAUA
.........................((((......))))..............((((((...)))))).......................
2,945
bpRNA_RFAM_37267
UACCGACCCCGAGAGGUGUCGGGAUGCGCCUGCAGAAGUCAGCAGAAGGCAUAGUAGGUUGGGGACGAAGCGGAGAGCCCGAGAAGAACUCUGACCGAAGGCC
.(((((((((....))))))))..)............(((....)))(((......(((...............................)..)))....)).
2,946
bpRNA_CRW_30763
UGGGGAAUAGUUCAAUGGUAGAACGACGGACUCUGACUCCGUUAAUCUUGGUUCGAGUCCAGGUUCCCCAGCCAAUC
(((((((..((((.......))))((((((.......))))))...(((((.......)))))))))))).......
2,947
bpRNA_RFAM_32014
AGAAGAACAGGCGAUGAUGUUCGCCGCAAAUGAUUGUGUAGCAAUCUGAUGACGUCUACUGAAAC
...............((((((..........((((.......))))....)))))).........
2,948
bpRNA_RFAM_28770
UUUUUGAUUACAGUGUACAAGUCCAGUCAUCCACCUGUGCUUGCACAAAGGUGGAUGACUGGACUUAGGACACGCCCCAAGAAUGAGCAUAAAGUGAAGCGAAAGCUUCACGAUAUGCGAAUGCUUGGGAAGGAUUGCGGGAGUGCGAAGCACGUAGCAAUCCGGAAAGCAAAAA
....(((((((...(....((((((((((((((((.(((....))))).)))))))))))))))............((((((((..((((...(((((((....)))))))...))))..))))))))...(((((((....((((...))))...))))))).)))))))....
2,949
bpRNA_SPR_557
UGCGCGGUAGGAGAGUGGAACUCCGACGGGCUCAUAACCCGUAGGUCCCAGGAUCGAAACCUGGCCGCGCAACCA
(((((((..((((.......)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
2,950
bpRNA_RFAM_7795
GUGCCGUGAUGGAUUUAACGAUCGACACAUCAUUCCGAAACGAGCGGUGUGGACAGCUAAUGACUGAGCACA
.(((...............................................................)))..
2,951
bpRNA_RFAM_11410
AGCCGCUGAUGACUUCCAUUAACUUUUUCUGACACCUCGUAUGAAAGCUGUAUUUCAGCAUCUGAUUAUAAACUUAAGUCUGAGGCUC
..((..........................................(((((.....)))........................)))).
2,952
bpRNA_RFAM_34711
UUGGCGACCGGGUCGACUUCCCGGGUCACCACCAGGUAUUCGCGCAGUGCGAUGGCGUGCAGGUGCUC
...(((.((.(((.((((.....)))))))....((((.(((((...))))))))).)).))).....
2,953
bpRNA_RFAM_9331
CCUGCGCGCCUUGCUUCAGGUGCCCCGCGUCGUCUCCAUCGACGGCGCCGGGGUGAAACAGGGAAGCCGGUUCCAAUGCCGGCGCUGCCCCCGCAACGGUAGGUGAGUCAAACGCUGUUUCAGGCCACUGUGCAAUGCACGGGAAGGCGCAGCGUCGAACCUUUCAGGUUCGCUCACGAGCCCGGAGACCGGCCUGUCGCAGUUCCACGGCA
...............((((((.(((.........................))).....(.((...(((((........)))))..(((....))).(((...((((......((((((.....(((.((((((...))))))...)))))))))...................))))....)))....)))))))))...............
2,954
bpRNA_CRW_54588
CGGAAGGGCACCACCAGGCGUUAACUUAGCAGCAAGCUCAGCGCCUCAAAGUCGAAGGGAAACCUUUGGCUAGUAUCUGGGUGUAGAUUUCACCUAAGUGCAACACUGUUCAAAUUGCGGGAAAGCCCUAAAGCUUUGCUAACCAAGCUGUCCUAGAAAUGGGAUGGUGGCCAGGUGAAAGACCUUGGGUACGGUAAAAUCAGCAAAGAUGCAACAAUGGGCAAUCCGCAGCCAAGCUCCUACGGGCUGUCAAAGCCUAUGGAGAAGGUUCAGAGACUAAAUGGCAGUGGGCAAGCAUGGCAAUGCUUGCUUAAGAUAUAGUCCGUCCCAGCUGAGAAGCUGCCUAUGAGAGGAAUGCCGUAAGGCAGGAGAGCUAAUAGGAAGUAAGUGUCUUUAAUCAACUUACUUGGAUUCCACGGGAGC
...............(((((((.................)))))))...(((((((((....))))))))).(((((((((((.......)))))))))))..(((((.((....((((((....(((.....(((((((((((..(((((((((....)))))))))..(((.((.....))..)))....)))....).))))))).((...))..)))...))))))(((...((((...(((((.....)))))..))))..)))...[.[[[[[...)))))))(((((((((....))))))))).......]]]]]]((..(((((....)))))((((((((.....((((....))))......))))))))((((((((...........)))))))).......))......
2,955
bpRNA_RFAM_37681
UCCAUGGCGACGUGGAAUCUGAAGGAAGCCCUAGGCAAAUCCUCGGUCUGAGGUACACGAAUCACAUUUGAGGUGGACUGUUUCAGGACGAGUUUGCAAAACAAAACAAAGUCCAAAAUAUCCCCGGAUGGAACAGACAUAAAUGUGGCAGAUAUAUGAGGAGAAAGUGGAUGAA
.(((((....)))))............(((((..((...(((((((((((...........((((((.....(((.(.((((((.((((..((((........))))...))))...............))))))).)))..)))))))))))...))))))....))..)))))
2,956
bpRNA_RFAM_12109
CCUAUCCGCAAGAUGAAGCCAACACGGAUGUAAAUGAGCUCUGCUCGCUGUCCGAGAGCGCAAAACCUCGUGUGGAUUGUUCCGUUGCCUUCCUUCUGACCAUACGU
..(((...................((((....................................................))))...................))).
2,957
bpRNA_RFAM_41233
GGGUUACUCCUGCUCUUUCACGCUGUCUUGAUGAAGAUUCGCACCUCUAUCAAAACGGGUAACCCCGCCUCUCUGCAAGGCCUGACUGUCAGAUCAAAUCGGAACUUCUACACUUCAGAACUCGGCACUUUACCUUCCAAUAGGAGCCACUCCAUGCUUUUUCCAACAUUCAAAUCUUGCGUUUGUUGCUACGCUCAUCGCAACGAUAACCGCCU
.((((((.((....(.......).(((((((((.((........)).)))))))))))))))))..((....(((...((..((...(((((((...))))).)).((((.(............................)))))..)).))....))).....................(((.(((((((......))))))))))....))..
2,958
bpRNA_RFAM_8584
AAAAUUGAAUAUCGUUUUACUUGUUUAUGUCGUGAAUUGGCACGACGUUUCUACAAGGUGCCGGAACACCUAACAAUAAGUAAGUCAGCAGUGAGA
.................((((((((.....(((((......))))).........(((((.......)))))..))))))))..............
2,959
bpRNA_RFAM_15863
UUCCAGCUGUCCAAAUGCUGGGAUAACUAUAGAGGCACACCUCAUUGCCUUCAGUGCGGAAGUGGUUUUCUCAACUCCAAUCAAAAAGGCAGAAAAAGUAAAGCAACGCGAUUUUCGCGCUGUUUUUUCGCUGCAUGCAAUGCUGCUUUCUUC
.(((((((.......)))))))...........((((........))))......(((......................((.........)).......(((((....)))))..............)))......................
2,960
bpRNA_RFAM_26362
CUGGAAUGAUGUGAAUUAGCCAAAUCAGACAUUAAUGUGCUCCAUAAGGCAACCGGCAUGAUCGAUCUGCUUGGAUCAUGUUGAUGACCCUCAUGUUGAAGCGCAUUUCUCUGAUGAUCAACAAAGAGAUUGGUUUCUUUUUCCUGACCAGA
.(((...............................................................................................................................................)))..
2,961
bpRNA_RFAM_7408
UGGAUCGGUGAUGAGCAACAAUCACCAUCUUUCGUUUGAGUUUCAUGGCCAUGAGACCAACCCCAUGCACUGCUGCUCUGAGACCCG
.(((((...........................................................................))))).
2,962
bpRNA_RFAM_25426
GUUUCAAUCCCUUUAAGACAGGGCAAGGUCUUUCGAC
...((...((((.......))))...)).........
2,963
bpRNA_RFAM_11463
GCCAAGUGAUGAUGGUUUUUCAGCCUGACCCUCAAAACAUGGAGGUUCUAAUCUGAUUUAAUGAGCCUGAUGG
.(((..................................................................)))
2,964
bpRNA_RFAM_24992
UUGCCCAGUGAUUAUAGCAAGACGCGUUAUUAUGAGGACUUAUGCUGGAACUCUUCCUACUUCUCUUCCUCCUCCUACUUUGCCCCUUCCUCUUUCACCUUAUUCCUCACUUUCCCUAGGGUAUCCAGCGUCCUGUGAGCAAGACUGAGAUAUGAGGGCAA
.(((((............................(((((((......))))))).....................................................................................................))))).
2,965
bpRNA_RFAM_40234
GAUCGACAGUGCGACUAAUACAAUACCGCAAGGGAAUACGUCCGCUGGAUUAUCUGACCAGUUUUGAGCUGUCGAUCGCCCUAAC
.((((((((...(((..........((.....).....).))...((...........))).......)))))))).........
2,966
bpRNA_RFAM_37512
GGUGGUAGACCCACCAAAGGCGAUUUACAGGAAUAGCCUUUAAACCACUCUACGGUGCUAUGACAGUAAUGUUUUGGUAUUGAACGGCUAGAGAAAAGGCUCCGCUGGUACGGAGUCAGGU
.((((.....)))).((((((.((((....)))).))))))...(..((((((((.(((.((((......)))).))).)).....).)))))....((((((........))))))..).
2,967
bpRNA_RFAM_16977
AUUGUACAGUAAAUUCUACCUAAGACUCGGGUGGCUAACGUGCCUUAAUAUCCCGCCGAGGCCAGAAAAACUAAGAGUUUUAUAACUCCAUGUCUUUUUGGCAUGGAGUUUUUAUUUCGGCUGA
............................(((((((......)))......))))..............................((((((((((.....))))))))))...............
2,968
bpRNA_CRW_19132
GUGUACGGCUAUACUACCGGAAAAGCGCCCGUUCCCGUCCGAUUACGAGAGCCUAGCCCGGUCAGGCCCGACUAGUACUAGGGUGGGGGACCACCUGGGAACAUCGGGUGCUGUACACU
(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))).
2,969
bpRNA_RFAM_16598
CGCACCUAAAAGCGUUUUCUUGAUAGUCUCUUUGAAAUGCUCUUGAAAAUCGUAGAUGUGUGCCAUAGCAAGGCUCAGUUGCAAGUGAUUCUGCCCCAUCGAUGGCAGCAGAAUCAUAAUAAGCUGGCUACAGAU
.(((((.....((((((((..((.(............)))....))))).)))....).))))............((((...(((((((((.((((.......))..)).)))).)))))..)))).........
2,970
bpRNA_RFAM_33281
AAUGGGAUAGCUUCCCGUUAUAGUGAGUGGCUGAAUAAAUCCUACCCAACGGAUUAAGGCACACAAACCUGCUCCAACGGUCAAGUGACUGAGGAGGUGGUGAGUGGUAAGCGAUUACAAAUUAACUACUUAGGUAGUUGGGAGUCGCUUUGGGGGUCAACCAAGAAUCCCCCCUCGCACCC
.((((..........))))...(((((...(.......((((.........)))....))..((.(((....(((.(.............)).))...)))).))....(((((((......((((...[[[.[..))))..)))))))..(((((....]]]]....))))))))).....
2,971
bpRNA_RFAM_38375
AGAGUCCCGUCAGCAAAGGAGGAGCAAUCUAUGCUGUAGCGAACAUUGAGUGACCAAGCCCGGUGACGGGUAACACUAAGCGUAUGGAGCGAAUCCCGUAGGCCGAAAUGCAUUUAGCGUGAAGCGAUUGAGCUCCGACAGAUUAAUAUUCCACUUAAGAUGAUGGUCUAUUCAAGUCAGAAAUCGAAACUGCAAAUCCCGACAAGCGAGGGAUGGGUGAAGUGGCGGAGUCUAAGAGCU
..........(((((..(((.......))).)))))...(..((((((((((..(((..(((....)))))).)))...))).)))..))..........................................(((((.............((.(..(.(((..((((........))))...)))....(((((((((((.........))))))))).)).).)))))))...).....
2,972
bpRNA_RFAM_25878
AACAAUAGCAUAACGGUUACUCAAGGGUGGUCGGCACACUCCCAUGAAAGGGGGUGUUGCUGUAUGACAGUAUUUGAAGGAAUUUCCCUUAUGUUGACGUUUGGGCUUCUGAUCGUUGCAAUGCUGUCAUUUCACAACCACAAAAAAUAAUCCACCCUUGAGUUAGUGGCUCAGGUGGAUUAUUCGUCCAAUCGGCCGAUCCCUUGCAGGGAUCCGAGCUAUUGUUUGACUGAAGGUGUGACAGCACCUUCA
.((((.(((.(.(.((((.((((((((.((((...((((((((......))))))))........(((((((......(((..........)))........((((..........)))).)))))))....................))))..))))))))..(((..............))).........)))))((((.......))))..).))).)))).....((((((((((..))))))))))
2,973
bpRNA_RFAM_26256
UAUGCCCAACAGGUGGCCAAAGGGGUUCCAGUUGGGAGACACCAGGCGCACCUCUCCUGCCACCGGGUCGAACAAGCCGCCAAACACCACUGCCUUGAGCACCAAAAGCCAGGCUCCCAAUCCCAGCAGCACCAGGUGGAUCCCUAGGAUGGUGGUCAUCUUGUUUUUGUCUUGCCA
......................................................................................................................................((((((..(((((................)))))))))))...
2,974
bpRNA_RFAM_13492
AAGUAACACUCUGUGGCAGACACCGUUGUCUGACUCAAUUUUGAGCUUGCUAUAAUAAAAAAAAAAAAGCCUAACCUAUUCCAGUGGUCUCUUUUAAAUGAGACCAUCUGUUAUAUAGACUGUGACAGU
........(((((((.((((((....)))))).)))).....))).....................(((((((...(((..((((....((((......))))...))))..)))))))))).......
2,975
bpRNA_CRW_27140
UCUCGUUAGUAUAGUGGUUAGUAUACCCGCCUGUCACGCGGGUGACCCGGGUUCAAUUCCCGGACGGGAAGCUUCUUUU
(((((...((((........))))((((((.......))))))...(((((.......))))))))))...........
2,976
bpRNA_RFAM_37652
GUGAGGGUGACCGAGCGUGGGGGAGGCAGGCUAUCUGAAAACUGCCAGCUGAUGAACAAGAACAUCAUACGAGGCGCACAGAGUGGGGUGAGUGAGCACAACAUCACGAAAUCCCGUCAUUCGGCUCUGUGCGUAAAUGAUGCGGUUGGGCAGUGGAGGUUUCAGGA
.((........))...............(((((..((...(((((((((((...........((((((.....((((((((((..((((..((((........))))...))))..........))))))))))..))))))))))).))))))....))..)))))
2,977
bpRNA_RFAM_9121
CCUGCUUGUGCCCACCCCGGUGGGAGCACUACUGUCGCCACGCCUUGGUGAACGGGAAAUCCGGUGUGAUGCCGGUGCGGCCCUCGCCACUGUGAAUCGGGAAGUCCGGCUCCGGCCCUGACGGGCAGCCACUGGAUCGCUUGCGGUCCGGGAAGGCGGAGCACGGGCGGUGGUACCCGUAAGCCAGGAGACCGGCCAAGGCGCGUCGUCCAUCC
...............((((((.(((...................))).....(((...(.((((.......)))))..(((....))).(((....((((.......((((((..............(((.((((((........))))))...))))))))).............))))....)))....)))))))))...............
2,978
bpRNA_RFAM_39946
AUACAUUCGCUCAGGACAGGUUCCGCUAGAUUUUAGAAAAUAAUUCAUAUUAGCUCCGUACAGGAGUCUUUUUUUAUGCCC
........((...(((.....)))...........................((((((.....)))))).........))..
2,979
bpRNA_RFAM_9863
UGCAGGGAUGAUACAUACUUGCCCUCACUUAGACCAGAGGUCGAUGAUGAGAGCUUUGUUCUGAGC
..(.............................................................).
2,980
bpRNA_RFAM_4873
CCAAAGGCUCUUUUCAGAGCCACCCACAUGCGCGCUGAAAAGAUCU
.....((((((....)))))).........................
2,981
bpRNA_RFAM_11265
UGCCCAUACUAAACCCAAGAAUCACAGUUGUGUAGCAGUGAUUUAAACACAGGUGUGCACAGCAAGUGGAUCUCAUCGCCUUUGGGGCUGAGGCUGUGCCACUGGAAGUGAAUCUGGAAGUCUUACACCC
.((((((.((.........((((((((((....)))))))))).......)))))))).........(((((((.....((((.((((.........))))))..)))........))))))........
2,982
bpRNA_RFAM_14595
UCGGCCGUAAACACCCAAUCAUCAGUAGGCCGA
.((((((...(((..........))))))))).
2,983
bpRNA_SRP_924
CUUAGCUGUAAUGGCAUUUUGUCGGAGUGGUAAAUCGUCUUCUUGUUGUGCGUUCGAGUCUUGGGCUCUGCACUUGGCCAUUUGGUUGUCCUUUCCGAAUUCUGCGGUUGAUGGGCGUCUCGGUCUGAGUAAUCGGCUUUGAGAUUUCCGUUCUAAGAUUAACUGGGAAACUUCAGUGGAGCAAUCCAGCAGAGAUCCAGUUGCCGUGGGUAUGGCGGUGGGAUCGCAACCAAGUGGUAUAUGUUAUGGAAGAUAUUUACGAUCACGAUU
....((.......)).....((((..((.((((((.(((((((....(((((.....(.........)))))).((((.(((((((((((((..(((.(((((((((...(((((.(((..((((.((....))))))..))..).)))))((...)).((((((...(.(((....(((....)))....))).).))))))))))))).))..))).)))...)))))))).......)))))).))))))))))))).))..)))).
2,984
bpRNA_RFAM_6741
GGCUCGCGCCCGUAGUCUGGAGAAUCAGUCGCCAGGGUUGCGUUGCGGUAUGCCCCCGGUUCGAGCCUAAGCGCGGCUCGUAUCGGCCGGUUUCCGCGACAAGCGAGGGUUUGGCAGCCCAGUCAUUUCCAAGACCCCGCCAGCCGACUUCUCCAGUUUACGGGAGCGAGCCCUU
.(((((((((((((..((((((............((((....(((((((((..((..((((..................).))).))...))))))))).....((((...........))))..........)))).............))))))..)))))))))))))....
2,985
bpRNA_RFAM_36858
CUUCGGGGUUCCUGGGUGUCACACAGAUCCCAGUGGGGCCUCCAAAUGAAAGAACCUAGUGGGGAAACCCCCACUCAACUCCCACCAAUUCGGCGUGCACCCAAGAAUCACGAACAGACGA
.....(((((((((((............)))))..))))))................................................................................
2,986
bpRNA_tmRNA_42
GGGGACGUUCUGGAUUCGACAGGAAUAGGUCGAGCUUAAGUGGCGAGCCGAGGUGGCGAACUCGUUAAAACGCCAUCGCCAAUAACUGGCAAAGAAAACAACAACUUCGCAUUAGCUGCCUAAGCUAGCAAAUGCGGUUCCGCCCUCCAUCGCCCAUGUGGUAGGUGUCGGGACUCACUUUUAGUGGGCUACGCCUCUCACCCUCCGUCUGUGGGUGAAGGAAGAGAUUUAUCAGACUAGCCUUACGGAAGCCUGUCGCUGGGCUGAAGUAACGGCGAAAUGCGAAUACAGUGACUACGCUCGUAGAAGCUUAAGUACUCGUUAUUUCUGGACGUGGGUUCGAUUCCCACCGUCUCCAUUU
(((((((............(((((((((...(.((((((((..((((([[[[..((((..]]]]......))))......................................((..(((........)))..))..((((((.(((((((.[[[[[[)))).)))...)))))).........]]]]]].....((.((((((...[[[[[.)))))).))...........]]]]]..(((.(.....((((.[[[[[[[))))......).)))............]]]]]]]...))))).....)))))))).)...)))))))))...(((((.......))))))))))))....
2,987
bpRNA_SPR_189
GGAAGUGUGGCCGAGCGGUUGAAGGCACCGGUCUUGAAAACCGGCGACCCGAAAGGGUUCCAGAGUUCGAAUCUCUGCGCUUCCGCCA
(((((((..(((...........))).(((((.......)))))................(((((.......))))))))))))....
2,988
bpRNA_RFAM_7981
CUCUUAUCAAGAGCGGCGGAGGGAUAGGCCCUAUGAUGCCCGGCAACCAGUAGGUGAUGAACUUACUAAGGUGCUAAUUCCUACAGAUUCUUACUUGGAUCUGGCAGAUAAGGG
.(((((((......(((...(((.....)))......))).(((.((((((.............)))..))))))........((((............))))...))))))).
2,989
bpRNA_RFAM_3893
GGGGGUGACCCGGUUUCGACAGGGGAACUGAAGGUGAUGUUGCGUGUCGAGGUGCCGUUGGCCUCGUAAACAAACGGCAAAGCCAUUUAACUGGCAACCAGAACUACGCUCUCGCUGCUUAAGUGAGAUGACGACCGUGCAGCCCGGCCUUUGGCGUCGCGGAAGUCACUAAAAAAGAAGGCUAGCCCAGGCGAUUCUCCAUAGCCGACGGCGAAACUUUAUGGAGCUACGGCCUGCGAGAACCUGCCCACUGGUGAGCGCCGGCCCGACAAUCAAACAGUGGGAUACACACGUAGACGCACGCUGGACGGACCUUUGGACGGCGGUUCGACUCCGCCCACCUCCACCA
.((((((..........((((((((((.(..((((((.((((((((([[[[[.(((((((.]]]]].....))))))).............................(..((((((.....))))))).((((.((((.((((...[[[[[[.)))).)))).))))........].]]]]]...[[[[.......((((((....].]]].........)))))).(((((((((.....((([.[[..[[))).....).)))))))).......].]..]]]...)))))...))))).)))))).)).)))))))).(((((.......))))))))))).....
2,990
bpRNA_RFAM_40587
CAUGUGCUCUCUGCCAGCUCAAGGUGUAGUACAGAAAAACCUUGGCUGUAUUCUGCAGGGGUCCUGG
.(((.((((((..((((((((((((((...))......)))))))......))))).))))))))).
2,991
bpRNA_CRW_52889
CGGGGAGUGGCGCAGCUUGGUUAGCGCGCAUGCUUUGGGAGCAUGAGGCCGCGGGUUCGAAUCCCGCCUCCCCGACGA
(((((((..((((..........))))((((((.......))))))....(((((.......))))))))))))....
2,992
bpRNA_RFAM_36777
AGACUAGAGGGUCAGCAAGGGUGUGUGACUCUAUAAUCCAAGCUGUGCUAGUAGAUCGCUUAAGAUCGAAGUGCACACCAAGCAUUCGAUUGUAGAGUCAUACACCUCCACUGACACUUCUAGUCU
.....((((..(((....((((((.(((((((((.(((.................................................))).))))))))).))))))....)))..))))......
2,993
bpRNA_RFAM_22943
AUGAUAUUAAUUCUCCGAGCUUAUGACUCCUAAUAGAUCAAUGGUCUGAUGGAGUGCAAGCCUGUAGGGUAUUGUUGGAAACAAUAAUGCCUCCCAUAGCGGAAAGGAGUGCGCAAAUCUAAUGC
..((.(....((((((..((((((.(((((...((((.......))))..))))))))))).....(((((((((((....)))))))))))((......))...))))))....).))......
2,994
bpRNA_RFAM_14393
UUCAAGGAGAACUAGGGUUCCGGCUCACAGGGAGUGGGCGCUGGUCCGAGAGUUCUCCGGUCCCAGGGACGGGACUACACGGAGGGAUAAAAGCCCGGGAGAC
......(((((((.........((((((.....))))))...........)))))))..(((((.......)))))...........................
2,995
bpRNA_RFAM_22800
UCUGUUAAAAUAAAAACGUUGCUCAAUUGCGAGUCAACCCUUGAGCCUUCUUCCCUUUGCUCAAGCAUAUUAAACGCGACAUUUUGUCGCCAAAGGAGAGUAUUUUG
.................(((((..........).)))).(((((((............))))))).........(((((.......)))))................
2,996
bpRNA_RNP_464
GAACACUGUGGGACACUAUGCCGACCCGCUGACUUUCUCGGUCAACGGGCCGUUUCCGUGAGGAAAGUCUGGGGAACUAGGCUUGCAGCUGCUGUCACAAGAAAUCAACGCUCACAGUAGCGGAUGGGAAGACAGCAGAGUUCCAUUUAGCUUGAACACAACGUUGAUUGUUUAAGGCUUGUUGAGUGCAAUCGUAGGACAAGAA
........((((((......................................(((((....)))))((((((....)))))).......(((((((...........(((((......))))).......)))))))..))))))...((((((((((..........))))))).)))..........................
2,997
bpRNA_RFAM_2115
GUGCCUCAAUCUAAUGAGUAAGGAAAUUAUUGGGCCUUGGUAACACUUGGCAAUUGUCCUUAUUAGGGCGAACUUAUUUUUGUUGGGUACAGGUCGUCCCCUUGAGCCGCUCGCCUACUUUGCAAGCGGCUCGGGUGAAGCGAUUUGCCCU
...(((((..........)))))........((((((((......))))))))(((((........)))))..............(((..(((((((..((..(((((.(((((.......))))).))))).))....))))))))))..
2,998
bpRNA_tmRNA_466
GGGGCCGACCUGGUUUCGACGUGGGUUGCGAAGCAGUAGCGGGCAUACCGAGGACCCGUCACCUCGUUAAUCAAUGGGAACGCAAUAACUGCUAACGACAACCGUUACCAGCUGGCCGCUUAAUUGCGCGCCGUCCUCGCACUAGCUUGCCGAUAGGCUAGGGCCGCAAGGCCACGCGAGGUCAUUCAUAUCGGAUCGCUUCGGCCGGUGUCACGACGGCCGGGGUUAACUCCAAGUGACUCGUCGUCGCGCAGCGUGUUCGUCCGCGUCGCGCCGGUUAAAUCAAAUGACUGAACUAAGUAUGUAGAACGCUCUGUAGAGGACUUGCGGACGCGGGUUCGAUUCCCGCCGGCUCCACCA
(((((((............((((((((.....((((.((((..((((([[[[[.(((((..]]]]].......)))))................................((.(((.............)))))((((((.((((((..[[[[[[))))))((((....))))..)))))).......]]]]]]....((((((((...[[[[[...))))))))..........]]]]]..[[[[.......[[[.(((((((]]].......]]]]..........))).))))...))))).....))))))))....))))))))...(((((.......))))))))))))....
2,999
bpRNA_RFAM_9665
UGGACCAGUGAUGGUGACUGGUGGUGUGUGAGUCAUGCACAGUGAAUAUCAUGUGUCUGGAACUCUGAGGUCCAA
.(((((..............................................................)))))..