Unnamed: 0
int64
0
10.6k
sequence_id
stringlengths
11
16
sequences
stringlengths
33
498
dot_bracket
stringlengths
33
498
600
bpRNA_RFAM_26916
AAACUACAACUCUCUGGAUCCCUUGGGCCAUUUCUCGUUCCCAGUGCGAUCCUCAUCAGUUGUCGAAGAAG
...(((((((.....(((......((..............)).......)))......)))))))......
601
bpRNA_RFAM_15795
CCUUGGGACACUCCUCCCCAACGAGGAGCAACUAUCUGUAAGGAUAGAAGAC
..........((((((......))))))...((((((....)))))).....
602
bpRNA_RFAM_20712
GAUAAAUGCAUCUUGCAGGCGAGACCCUAUCAAUAUUGCCUCUGCUUUUCUCACUGUUUAUGGAGUAGUGCAAUAUUGCUUAUAGGGUCUUGACUUUAAGGCUAAUCUGCAAUAUC
.(((.......((((...(((((((((((((((((((((..(((((.................))))).)))))))))...))))))))))))...))))............))).
603
bpRNA_RFAM_16981
UUGUGAUCAUUCACUCUGCCUAAGACUCAGGGGGCGUAAGCCUUAAUUAUCCUGCCGAGGUGGUAUCGGAAACACUAGAUACCUCUAUGUCUUGGUAGACAUGGAGUUUUUUUAUAUUUAA
............................(((((((....))).......)))).............................((((((((((....))))))))))...............
604
bpRNA_RFAM_5555
UGUAUCCUUCGGGGCUGGGUGAAAAUCCCGACCGGCGGUAAUAAGGCGCUCCUGCGCUUUACAGCCCGUGACCCGUAUGCAUCUGUAUACGGUGGAUUCAGUGAAAAGCUGAAGCCGACAGUGAAAGUCUGGAUGGGAGAAGGAUGAG
..((((((((......(((.......))).....((((...........................))))...........................(((((.......))))).....(((.......))).......))))))))..
605
bpRNA_RFAM_9226
AGGCAUAAUACAGCCGCCGGUUGCCCUUCGGGGCCGAAGAGGGAACACAGUGCCACUGUGGCUGCCCCCGCAACUGUAUGCAGCGAGUCCGCCUGCGCUUCACGCCACUGGUUCGACCGGGAAGGCCGCAGCGGACCAUGACCUGCCAGCCAGGAGACCUGCCGGCGAGACUGUUCGUGCC
...............((((((.(((......))).....(((...(((((.....)))))..(((....))).(((...((((........((((((......(((.((((((.))))))...)))))))))..........))))....)))....)))))))))...............
606
bpRNA_CRW_16283
CUAGGUGGCUAUAGAGAGAGGGAAACGCCUGGUCCCAUUCCGAACCCAGAAGCUAAGCCUCUCAUCGCUGAUAAUACUGAUCCUUGCAGGAUUGGAAAUGUAGGUCGCUGCCUAGU
((((((((.....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((..((((((((...))))))))..)))))))...)))))))).
607
bpRNA_RFAM_16681
AAAAAGGGUGCUCGUCCUGGCAUGUUCCCGUAUUAGGAACUUAAAUGCAGACGCAUUGCGUCAUUGGCCCAAUCCUACGUUCCUUGAAUGGGGCGGGGGCGUGCGCUGAAUUGCCGCCUUUGUUGGGAUCCAAUGUGCCCAGUGGGGUAUGGCUUUGCAUAUCCAGUGCGUAAUUUUUGUAUUUCGGGGCAGGCGGCUGCACGCUUUCUGAGCAGCUGGAUAGCAGAUACUUCUGCGUGCCAGCAGCUCGUGCGCUGCGCCCCA
.......((((((((((...............................)))))((((((((((((..................................................................)))).))))))))(((((((......)))))))))))).................((((..(((((.((((...............................................)))))))))))))..
608
bpRNA_RFAM_10114
AGCUCAGUGAUUUCAACCAGUCACAUUGGUUUUAUACGCUAUUCUGAUUGGAGCUGUUGAAAAAUAAUACUUAUGAGAGCU
.((((.......................................................................)))).
609
bpRNA_RFAM_20809
UGUUGCCUGUUGCUACGCGUGUUACCUCAGUACCUAGGCUGGGGUUUUUCGAAAGUCAGGUACCUGAAGUAGCGCGCGCAGCGGUGGUGCA
......((..((((((((((((((...(((.(((..(((((.............))).)))..)))...))))))))))))))..)).)).
610
bpRNA_RFAM_37345
CGCGUCCACUGGCAACGGUGGGCGUGACGGUGCAGAAGUCAGCAGAAGCCAUAGUAGGCAGCCAGGUGUCGGGCUGCCGAAGGGC
.(.((((((((....)))))))).)............(((....)))(((......((((((..........))))))....)))
611
bpRNA_RFAM_9355
UACACUCCGCCCGCCUAUGGUGCCCCGGCCGCAAAUCCGGGGUUAAAAGGGAACGCCCGGAGCGCAUGCUCUUUCUUCGAGGCGGCUGCCCCCGCAACUGUAAGCGGCGAGCUUUUUCCGAUUGUGCCACUGGAUGUCCGGGAAGGCAGGGAAGGGCGAAGACCCGCGAGCCAGGAAACCUGCCACAGGCUGUCGUCCGUCU
...............((((((.(((..............))).....(((...(((((.....................)))))..(((....))).(((...((((.......((((((.....(((.(((((())))))...)))))))))..........))))....)))....)))))))))...............
612
bpRNA_RFAM_18845
GGUAUUACGGGAUAUUGGUGCGGUUCAAUAAGAAAGCAGUGCUCGCAAUCUUUUUGAGUUCUGGUUUUUGAUUGAGCCGUGCCAAUAUCACGUGUCAUUGC
.......(..(((((((((..((((((.((.......................................)).))))))..)))))))))..).........
613
bpRNA_RFAM_5470
AAGCGUUCUCAGGGCGGGGUGAAAUUCCCCACCGGCGGUAGCGAACACAGGAUCGGGAAUGGUCGGUGGUCGGAGCCCGCGAGCGCUUCGCAUUUCGUGCGAAGGUCAGCAGAUCCGGUCGAAUUCCGGAGCCGACGGUUAUAGUCCGGAUGGAAGAGAGCAAGC
..((((((((......(((.......))).....((((......................................)))).................................(((((.......))))).....(((.......))).......))))))))..
614
bpRNA_RFAM_38537
CCAUCUAUGUCACUAGAUGAAUCUAAGGGUAUGAAAAAGAGCUACCCUGACAAUGUGACGAAAUACUCUUAAGCAUAGGGAAAAUCUCGUGAAAGCAAUUUCUUUCUAAUAAUCACAAUCAGAUAAGUUG
.((((((......)))))).......(((((...........)))))...............((((((....))))))(((.(...((....)).....)))).((((((.......)))))).......
615
bpRNA_RFAM_9283
GGCUAUUGUUGUGGCGCUGGUCGGCCCGACCGGCCCGAUGAGUAGGUAGGAAGCCGGUGUGAAUCCGGCAUGGUCCCGCCACUGUGACUGGGGAGCGAACCCCACAUCGACCACGGCUUGACGGCUGGAAGGUCGGGGUGAGCACUGAUCCAGAAGUCAGGAUACUGCUCUCAUUGGCCCUCUUGCU
................((((((((.............))).......((...(((((.......)))))..(((...)))..((...((((.......((((((.....(((.(((((.....))))...)))))))))..........))))....)))....)).)))))...............
616
bpRNA_RFAM_20582
AAAGGAAAGAAAUAGGCCUUCUAUUCCUGGUUUUUCCCAGAGUUGGGAAAAGCUGGGUUGAGAAAGCAAAUAAAUAAAUAGA
.................((((((..(((((((.((((((....)))))).)))))))..)))))).................
617
bpRNA_RFAM_38968
CGGAGUAGUCUAGUAUUUGGUCGUUCAAAAGAUGACUAAGCUUACGACAGACCACUACUUCGACACAUCCACGACACACACUUAAAAUGAAUUUAAGUCAAAUUAAAUACAAUUAAGCAAGAGUGUCUGUCAGGUAUCAGUGAAAGGUGACUACAUAGUAAUGAGCCGUUCAUUGCACAUGAUGACCGCAAGUCUGACUGUAAUCUUACCAAAGACCUCUAUUCCCGCAAGGAAGAGUUGGGGAGGCAUCCUCAAAGAGAGUUGAGUAAUUAGAGAGUAAUUGAUACCUCAAGGAGUGGUGUACCUAAAAGACCGUCAUUGAGAAAUACUUUCCAAAAGAAAGUGGAUAUUAAGGGAAACAAUAAUCCUUAUAAAGGUUCUCACAAAUAGGUGUAAUCUCAGCCU
.(((((((((((((..(((((((((.....)))))))))))).))........))))))))......................................................................((((((((((................((((((.......))))))((.(..((((.....))))..)).)..(((((........((((.((((.....))))...(((.((......)).)))))))..........))))).....))))))))))........((((((.....))))))......((((((.((((((......)))))).....((((((.........)))))).....)))))).......(((.........))).
618
bpRNA_CRW_35657
GUGGGUGUAGCUCAAAUGGUCAGAGUGCCGGGUUGUGGCCCCGGAGGUUGAGGGUUCAAGUCCCUUCACUCACCCCA
(((((((..((((.........))))((((((.......))))))....(((((.......))))))))))))....
619
bpRNA_RFAM_5642
GAAUGCAUUCCGUAUGGAAGACUAGUGAUUUUGUUGUUUGGUCUUUAAUAAAAUUAACAAUAAAUCCCUUGUCUUCUUAUGGCGUGUAUUU
.(((((((((((((.((.......(((((.((((((((.................)))))))))))))......)).))))))))))))).
620
bpRNA_RFAM_3891
GGGGCUGACUUGGAUUUCGACAGAUUUCUUGUCGCACAGAUAGCAUGCCAAGCGCUGCUUGUAAAACAGCAACAAAAAUAACUGUAAACAACACAGAUUACGCUCCAGCUUACGCUAAAGCUGCGUGAGUUAAUCUCCUUUUGGAGCUGGACUGAUUAGAAUUUCUAGCGUUUUAAUCGCUCCAUAACCUUAAGCUAGACGCUUUUAAAAGGUGGUUCGCCUUUUAAACUAAGAAACAAGAACUCUUGAAACUAUCUCAAGGUUUUAGAAAGUUGGACCAGAGCUAGUUUUAAGGCUAAAAAACCAACCAAUUUUCUAAGCAUUGUAGAAGUUUGUGUUUAGGGCAAGAUUUUUGGACUGGGGUUCGAUUCCCCACAGCUCCACCA
.((((((...........((((((((((((....(((.(((((((((((((((.[[))))).......]]..........................................(...((((.................)))))......((((((((.((((..[[[[[[.)))).)))).))))........].]]]]]...(((((((((...[[[...)))))))))...........]]]..((((((((((.....(((....[[[[..[[[)))....))))))))))..............]]]..]]]]...)))))....)))))))..))))....)))))))))....(((((.......))))))))))).....
621
bpRNA_RFAM_36370
GUGUGGACUAGGUUGGGCAGUUAGGCCCUGCUCUUCAACCCACCAUUUCGGUCUUGAGUGGGAACCAAAUCCGGGUGCGUUCGGUCAGACCGGUGCAGGCCCCGGAAGCCAACUAAGAAACCUCGUCCUUCGGGGACGGCGGUCCGUUGACGCUGACCGCAGGGUCAGUCCGAGACGGUUCGUCGCCGGUAUCCCGUCAGGCGCGGAAGCGAGCAGCGAACUGGUGAACGUUCGUCGCUCGAAGGGCCGCGGGGUGGAGGAGGCAACUGGGACUCCCUGUAUCGGAACGCCGAGCAACCCUGUUGUCCGCUA
.((((((((((((((((((((.....))))).))....(((((((..........)))))))))))).(..((((((((((((((..((((((((((((((((((((((((((((...((((((((((((((((((((.(((((((((.(((((((((....))))))))))))))))....(((((((...(((((....(((....)))....)))))))))))).)))).))))).))))))...))))))))))))))))))))))))...))))))))))))))).)))))))))))..))))))))
622
bpRNA_RFAM_19421
UCGGCUUGUGGGACUCAAACUGUGGGGGCACUUUCUGUGCUGAGAGCAAAGUGCCGCCACAGUUUGAGUUCCACCGGCCGA
.(((((.((((((((((((..((.(.(((.((.................)).))).).))..)))))))))))).))))).
623
bpRNA_RFAM_27222
UGCCCGGUCUUUGCCCCGGAUCAACUAAAAUAGUUAUGACGGUUUCCGACACGGGAAAAUGGAAUAUUGCACGACGACAGAAAUUUCAGACCUCGCUCCGAAUGACUCUUGUCGAUGUGCAAAACAUUU
..(((((((......(((....((((.....))))....))).....))).))))...........(((((((.(((((((...(((.((......)).)))....))).)))).))))))).......
624
bpRNA_SPR_7
AAAAAGAUAAGCUAAUUAAGCUAUUGGGUUCAUACCCCACUUAUAAAGGUAAUAAUCCUUUUCUUUUUACCA
(((((((..((((.....))))(.((((.......)))).)...(((((.......))))))))))))....
625
bpRNA_RFAM_38659
CCUGCAAUUCCGUUUGCAGUAGUCUGAGGGUACGUGCAUAAUGAGUAAUCAUUUUGUGCGAAGCUGCCCUGACAAAGUACCCUUUCCGAAAGGAAUAGACCAAAGCGUGAGCCGAGGUCAAUAGCGGAUAACAUCGUUCUGCCGAGGGG
.((((((......))))))........(((((((((((((((((....))))))))))))....)))))............((((((....))))))((((...((....))...))))....((((((.......)))))).......
626
bpRNA_RFAM_7136
CGUGUUAUAUGCCUUUAUUGUCACGUUUAUUUUUCGUUGACGUAUUGAUAGCUAUUAUUAAUUAGCCAGCGAAUAAAUUGACAAGCCCGAACAACCCGUUCGGGCUUUUUUUUGGGUUCCA
......(((((....)).)))..............((((((.......................)))))).........((.((((((((((.....))))))))))))............
627
bpRNA_RFAM_21782
CCUGUGUUGCCUUAGAAACCAAGCAUGGGUGUGGCCUGAAUCCUCCAAUGGCGACCCAUCCUUGGUUUCUGAGGCUGUACAGA
.((((((((((..((((((((((.((((((((((..........)))....).)))))).))))))))))..)))))))))).
628
bpRNA_CRW_52266
CGGAGCGUAGCGCAGCCCGGUAGCGCACUUGACUGGGGGUCAAGGGGUCGUGGGUUCGAAUCCCGCCGCUCCGACCAUUA
(((((((..((((.........))))((((((.......))))))....(((((.......)))))))))))).......
629
bpRNA_CRW_19922
AAUCUACGGCCAUACAGAUAGUAACACACCGGAUCCCGUCUGAUCUCCGCAGUUAAGUCUCUCCUGGUAGCGUCAGUACUAUGGUGGGGGACCACAUGGGAAUACGCUAUGUCGUAGGUU
(.((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))).)
630
bpRNA_RFAM_1103
GUUUCUGUAGUUGAAUUACAACGAUGAUUUUUCAUGUCAUUGGUCGCAGUUGAAUGCUGUGUAGAAAUA
.((((((..((((.....)))).(((((.......)))))....(((((.......)))))))))))..
631
bpRNA_RFAM_41650
UAAAUGCCGGAAUUUUGCUCGCAGGGAUUUCGAUUUCUUCUCCUGUUUGCGGGUUACGUCCUUUACGUGCAGAACGUUCACGAACCUCAAAGUUCCCGAAACCUACCAGUUGCACCUUGUCUCCGUUUUGCAGCGCACCGGAGAUUGC
.........((((.((((((.(((((...................(((((((..((((......(((((...)))))...)))))))))))......((((................)))).)).)..))).))))))))..).....
632
bpRNA_RFAM_6306
UCCAAGUGAUGACUGAAUGAAGUCUCGUUCGUCUGAAAAUCUUUGGAGAAUACUCCUUUUAGCAUGGUGGAGUUCUGAUGGAA
.(((..........................................................................)))..
633
bpRNA_RFAM_31902
CUUACCGGUGGCGAUGGGACUCGCCUGGGGCCUGCAAGGAUUCCCGAACCGCAAUUCCGCUGAUGGUUCCUAUUGACGC
................(((((.............................((.......)....)))))).........
634
bpRNA_RFAM_10890
AUACAAAAAUUAAGAAAAAAACACCAACUGUUUUUCUUUAAGGUAAGUCGCAUUCACAAACUUUGGUCAGGGAGUGAGCGACUUCUUUUUUUGUUUUUUU
....((((........(((((((.....))))))).))))......(((((..((((................)))))))))..................
635
bpRNA_RFAM_35962
CCACUUGCGUUUUUGCACCGGCGCGGCCAUAUUAUCUUCGUCCCGUAAGGGACUAUGGAUGUAGACGGGCUUGUGAAGCUGGAUCGGACGGGGGUGCGAUUCCCCCCACCUCCACCAUUUUACCCUUGGAAACAAGGGCUUGCGGGGGUGAUAUAGGGUCGACGGACGGUGGAGUGAGUACCUGCAUCUCGGUUGGACGCGCCGUUAUCUGCUCAAUCGCAUAGUUGCCAACGACAACCGUGCUCCGGUGGCUCUGGCUGCGUAAGCAGCUCGAACAUCGAAACUUAAGUCCUUGCGCUUAGCCGCGUAAGGCGGGGUUCGCAGGUACCUGGCAACAGAAACCUGCACU
.......................................(((((....))))).....(((.....((((((.......(((.(((...(((((.......)))))(((((((..............................)))))))............)))..).......)))).).).)))))[[[[.(((.((]]]].....).))))....................................................................................................[[[...(((((.]]]...........)))))...
636
bpRNA_RFAM_24281
UGGAUAUGACGAUUCACAGCACUGGGCACUGAAUUUUAAUUUCCACAAAUGGAAUUAUUUUGCAUAUGAGUGACAAUGCUUUUAGUAGGCCUAGAAAACCUACGCAACUGAUCCG
.(((...........................................................................................................))).
637
bpRNA_RFAM_3194
AUCCGAGUGCAAGGGCGUUAUCCAUCUCAAUGAGGCUUUGCCGAGAGUGGAUUUUUGCUAGUUGAAAACUAUACACUGACCGCUCCUACUUGGGUUCGCCUGGGUAGGGAAUUUUUGGAACACUUUUCCUAUGGAAACUUUUCUUUCAUUGCGAUCGGUCCUUUAUGAACUGGCGCGAAGAAGG
................((.(((((.(((................))))))))..))....((((............))))...(((((((((((....)))))))))))............((((.......................................................))))
638
bpRNA_CRW_19109
AGCUGGGGCCAUAUGAACCUAUAAGUACCGCAUCCCGUCCCGAUCUGCGAAGUCAAGCAGGUUACAGCUCGGUUAGUACUAUGAUGGGAGACCACAUGGGAAUACCGGGUGUCCCAGCUU
(((((((((....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))).)
639
bpRNA_RFAM_26365
UUGCUAUGAUGAGUGGUACAAACUAAUGAAAGUUUAUACAGCAAUUGCUUCUUGAAAUUUAAUCCUGAGCGGUUAUCUGAGCAA
.(((............................................................................))).
640
bpRNA_RFAM_38248
UACAACUAAUAGAAUGUUGCUCAAAUGAGUGGCUAACACCACAAAGGGGCGCACAUAAACUGCCUACGGCAUGAGUAGCAGCGCCAUGUGAAAAUGUCGGAAAGCUAGGCUGGAGAGCAAAAAUUCGACCCAAACAGUUUUAGCUGUGGAAAUGUUUGUAGAGGUACAGGCUGUCGAAGAUUAUGUAGUGGGCUGUAUA
.................(((((......(((((......)))...)).)))).......(((((((((((.((...........)))........)))))......))))))......((...(((((((((...((......)).)))...((((((((....))))))))))))))....))...............
641
bpRNA_CRW_44147
GGCGAAUUAGCUCAGUCGGUUAGAGCGACGGAAUCAUAAUCCGCAGGUCCGGGGUUCGAGUCCCUGAUUCGCCACCA
(((((((..((((.........))))((((((.......))))))....(((((.......))))))))))))....
642
bpRNA_RFAM_11466
UGUAAAUGAUGAAAGGUCUUUCCCUGAUGUCACAGUGAGGGUGAAAACUGAUUUAAUGAGCCUGAUGC
.(((.............................................................)))
643
bpRNA_RFAM_8031
GUUUUGUACAGUUUGGGUAACCAGGGAAAGAGCCCGAUGAAACCCGGCAACCUGUCCUUUUAAGGAUAAGGUGCCAAUUCUCUCAGAAGAUUUUUUCUUCUGAAAGAUGAGGG
.(((((((.......(((.....(((......)))......))).(((.(((.(((........)))..))))))........((((...........))))...))))))).
644
bpRNA_RFAM_10320
AGCUAGUAGGACAGACUCUUCAGUCUAGGUUGGUGGAAGCAGGAGAACACUGCUUGAGGGUACAGGUUU
..........((((((((........)))))))).............((.((..........))))...
645
bpRNA_RFAM_15447
UUCUCAGGUCCCCAGUGCAGCCCCCAGAUAAGACUGCAGUAUUUUCCUUAUAUGAUCUGGUCCCACCGUGGGCAGCACUGCAUGCCCAGAGCCUGAGAGGAUUAUGAAAACAUGGCAAGGGAAGUGAGGCCAGGGAACCCAGCA
.((.(((((((((......(((((...............................((((((.((...(((((((....)))))))..)).)))))).............................)))))..))))))))))).
646
bpRNA_CRW_41907
GACCUCGUAGCUCAGCUUGGCAGAGCAACGGACUUUUAAUCCGUGAGUCGCAGGUUCGAAUCCUGCCGGGGUCA
(((((((..((((.........))))((((((.......))))))....(((((.......)))))))))))).
647
bpRNA_RFAM_19284
GUGCCUAAAGCCCCUUAUCAUUCUCCUGUCGAGUGUUAAAAUUCUCUACGACUGGACGGAGAACUGAUAAGGGCCCGAGGGUUA
...........(((((((((..((((.(.(((((................))))).))))))).))))))).............
648
bpRNA_RFAM_39010
GUCAGCACCCCGCUCUAAAGAGCAGGGGCCGAAGCGCCUCUCUCUUAGAUAGCUGACCAGCCUAAGUCUUGUUGGACUACGUUUUUAGAGUUAUGACACCUACAAAUGCUUUCCAGUUUGUAGCCCUGUC
.(((((..(((..((....))....)))......................).))))........(((((....)))))................((((.((((((((........))))))))...))))
649
bpRNA_RFAM_33665
AGCGGGGUACGCAACUGGCGAUAGGCGUGGUCCAGGAAGGUUGAAAAACCGGGCCACCGCUGACGUGGAAACCAGCAGAUGCUUGCCGUCUGUGAACCACUGGGGAGCGUACCGCCCAGGCUGAGCCUGAAGCGUUCCGCCGUUCGCCUGGGCAGCCCUU
..((((((((((...........................(((....)))...............((((............................))))......))))))))))....................(((((.........))))).....
650
bpRNA_CRW_16582
UGCUUGGUAACAAUAGCGUUUUGGACCCACCUGACCCCAUGCCGAACUCAGUAGUGAAACGAAACAGCGCCGAUGAUAGUGUAGCAUUUGCUAUGUGAAAGUAGGACAUUGCCAGGC
.(((((((((.....((((((((....(((((((.............))))..)))...)))))).)).(((((((..(((((((....)))))))..)))))))...)))))))))
651
bpRNA_RFAM_14374
GGAUAUUGUUUCUAGGGUUCCGAUUCCUGGUGAUGUGGGGAAUGGCUGGUCCGAGAGAAACAGGCUAGGCUUUGUAAAGAUUUUUGCCACUAGCUACACGGCGGGACAAAAGCCCGGGAGAC
......(((((((.........((((((.........))))))............))))))).(((((((...............))..)))))............................
652
bpRNA_RFAM_38564
CCUAUCGUUCCUCCGAUAGUAGCCUAAAGGCACGGGCAUCAACAGCAAUGUAAUGUCCGAAGCUGUCUUGACGAUGUAACCCAAUCGAAAGAUGAAGCCAAACCCGCGAGGGCAAAGCGGAACUGCGAGUAUCACGCGGUAGGGUGC
.((((((......)))))).........((((((((((((.(((....)))).))))))....)))))............((((((....))))))((((...((....))...))))...((((((.......)))))).......
653
bpRNA_RFAM_5838
UUUAUAAAUCACGGGUGCUGGACGGCAUACGUUUGCCACAAAGCUGAGACAGGGCGAGAAGACGUGCACGUCCCUGAACCGUUGAACCUGAUCCGGGUAAUACCGGCGAUAGGAAGAAUAAUGAACCGAUCG
.....(((((((((..(((((..................))))).....((((((...............))))))..))))....((((..((((......))))...))))..)))))............
654
bpRNA_RFAM_35970
AGACUUCAAAUAAGGAAUUUUGCCCCUAUAUUGAUGGGUGCCGGACGGAUUUCCGACCGGCUAUGGCGAUAAACGGAUUGUGUAAUAAACCAUUCGGACCCGGGGGCAGUACCCGGCGCCUCCACCAAUUUUCCCUGUCGCGGCAGGGACCUUGGGGGCGAACCAGGAUCGACGAGGGUGUAAAGACAGUCUUUUUGCCCGGCAUGGUUCCGCCGUCAUCGGGCCGUUUUAUAGUUGCCAACGACAACUAUGCUGAGGCGCGUCUCGCUGCUUAAUGCAGUGCGACAACCUCGAUUUAAGUCCUUACCUUUAGCCGGGUAAGGCGGGGUUCGGGGGCACCUGGCAACAGAAGCCCCCACU
.......................................(((((............)))))...(((((.....(((((((........(((.(((...(((((.......)))))(((((((..............................)))))))............)))))).......)))).))).)))))[[[[.(((.(.(]]]].....)).)))....................................................................................................[[[...(((((.]]]...........)))))...
655
bpRNA_RFAM_38969
AUGUGGUGUCUGGUAUUUCGUGUUGAAAGAUACGAAGUCAGUGAGGCCAGCACGUCAUGGUAGGUUACUAGCGGACUCAUACUCCGUUGGGUUGUAGCUCAUUUGGGUAGAGCACUCGUUUUUGGAACGAAUGGUAGCCGGUUCAAAUCCGGUCAACUCAUCCUUGAAAGAUGAAAAAACGCAAAGACUGGCCUCACAGGUAGUACGAAAAUGGCUUAAUGCUUCAGUCCUUCGGGCAAUGAAGCCCUUCGAAGCUCGCAAGGCGGACAAGGUUAGUAGCGAAGCGCACUAUAGCGACGGCCAUCGUUGUAGGUAGCAGAACUACUGAGUACGCUACUUGAUACGUGAAUCGCCACACGUUAAAAAAGGCAGUCAUGCUGGCAGACUCAGGAGCAUCCUUGAUGGAUGGCUUGGGUGGAUAAGCUGGGAACCAAAGGGGUCGCACCCUACGGAUAAUCCAGCAAAGGUGUUAGCGGUGAAGGUGUAAUCUCAGCCU
.((((((((.((..(((((((((......))))))))))))..........)))))))............................................................................................................................................((((((((..............(((((((((.....)))..))))))(((((..((((.....))))..)))))...((((.........(((((((((......)))))).)).........)))))......))))))))...........((((((.......))))))......(((.(((...((((((..................))))))......((((((...((................)).....)))))).....))).)))......(((.........))).
656
bpRNA_RFAM_6106
GUGACAGAAGAGAGUGAGCACACAUGGUGGUUUCUUGCAUGCUUUUUUGAUUAGGGUUUCAUGCUUGAAGCUAUGUGUGCUUACUCUCUCUCUGUCAC
.((((((((((((((((((((.(((...............................................))).)))))))))))).)))))))).
657
bpRNA_SPR_149
GGGGCUAUGCUGGAACUGGUAGACAAUACGGCCUUAGAUUCCGUAGCUUAAAUGCGUGGGAGUUCGAGUCUCCCUAGCCCCACCA
(((((((...((...........)).(((((.........)))))............(((((.......))))))))))))....
658
bpRNA_RFAM_18711
GCUCCCUGAAGAGAGGUUGUCCUUCCGUUGUUAUUAUUUGUGAUGUGUGUUCAAGGGCAAGCUCUCUCCAGAGGGC
.(((((.(..((((((((..(((((...(((((..........)))))...)))))..))))))))))..))))..
659
bpRNA_RFAM_27132
AUUAUAAUGAUGAAAAUAUCCAGGAAGUGCCGUCUGAUUCUUUUUGUUGACGAUAAUUAAAAAUUCUGACCAUAAUUA
....((((..................................................................))))
660
bpRNA_RFAM_2536
AAAGUUAGCUAGACAAUCGCUGUUUAAUACAGAGGAAAGUCCGGGCCCUAAAGAGCAAGAUGCCAGGUAAUUCCUGGGAGGAGUGAUCCUACGACUAGUGCAACAGAAAAAAAACCGCCACUUUUGUUGGUAAGGGUGAAAAGGUGCGAUAAGAGCGUACCGCAAUUUAUGGUAACAUAAUUGGCAGUGUAAACUCCAUCUAGGGCAAGGCCAAAUAAAAGCUUGAUUGCUCGUCUUUAAGCUUUGGUAGGCUGCAAGAAUAAAUAUGUGAAUGUUUAUCUAGAUAAAUGAUUGUCCAAGACAGAACCCGGCUUACAGCUAACUUUAUUU
.(((((((((([[[[[[[.((((.....))))....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............((((((((...))))))..)).......((((((.......))))))((((((.(((....)))))))).)..)))..)))))))))))))...((((......(((((((((.]]]]))))).)..))).....))))......((((((((....))))))))..........]]]]]]]..........)))))))).)))))))))).....
661
bpRNA_RFAM_18496
UCGGGUAUAAUUCAGCAGCGAGGUAUAGAGUUCCUACGUGCUUUGGUUACUGUAGGAACUUCAUACCGUGCUCUUGGAUGUGCCUAAUUCA
...(((((...(((..((((.(((((..((((((((((............))))))))))..))))).))))..)))..))))).......
662
bpRNA_RFAM_33555
GCAUUUUUGAUUAACGCCCGCCGUUGGCGGGCCUCACCUGAG
...............(((((((...)))))))..........
663
bpRNA_RFAM_19980
UAUUUGGUGUAGCAUUUCUGCAUAGACUGGAUUAUGGAAACCUGUAUAGAAAUGCUUCUGCUGUAUA
.........((.((((((((.(((....................)))))))))).))).........
664
bpRNA_CRW_54199
GCGCUGAUAGUGUAGUGGUAACACGGCAAGCUCCAACCUUGCUAUCUGGGGUUCAAGUCCUCAUCAGCGUG
(((((((..((((.......))))((((((.......))))))....(((((......)))))))))))).
665
bpRNA_RFAM_24256
CGGCUGUAGCUAGAUUGAAUAAGAAGCUAUCGGCCGGUGGUCGCGUAGAGGGAUUUAGAUCUCUCCGGUCGAUUCAUCUGCUUACCGAGUUUCUUACAUUU
....................((((((((...(((.((((((((..........................)))).)))).))).....))))))))......
666
bpRNA_RFAM_22524
GAAGCGCGGCGGGCCAGCUUGCAAUUUCAUGACACACUCUCUCCAUUUCUCUGCCUGUCAUGACUUGGUUGAUCGAUGGAGCGGUGGUUUUCAUUGCCCGAUUGAGGAUCAGGAGUUGGGGAGAGAAUUGAAGAGAGUGCAUUGUGAAUUGCAAGCUCCUCCUUUCUUUUCG
...............((((((((((((.(((((.(((((((((((.((((((((((...............((((((((...................))))))))...........)))))))))).))))))))))).)))))))))))))))))...............
667
bpRNA_RFAM_35947
GCCCUUUCGCCCCAAGCCAUUGCCCCCUAUAUUGGAAGCGUCGGGGCAACCCGACUAUGGAAAUAAAUGGCCGUCGUAAUAAACCAUUCGGACCCGGGGGCAGUACCCGGCGCCUCCACCAAAGCCCGUGAUUCCGCGGGUUUCGGCGGGGGCGAAAUAGGAUCGACGAGGGCGUAAAGGGCUUGCUUUUUCUCGGUAUUGUUCCGCCGUUAUCGGGCUAAUGCAAUAGUUGCCAACGACAACUAUGCUCCGGUUGCUCAGGCUGCGUAACGCGGUUUGAAAGACCAAGUCUAAAGUCCUAACGGGUUAAGCUCCGUUAGGCGGGGUUCGGAGGCACCUGGCAACAGAAGCCUCCACU
.......................................(((((......)))))...(((((.....(((((((........(((.(((...(((((.......)))))(((((((..............................)))))))............)))))).......)))).))).)))))[[[[.(((.(.(]]]].....)).)))........................................................................................................[[[...(((((.]]]...........)))))...
668
bpRNA_RFAM_13462
GCAUGGACGAAUUCUGCUAUAGCUUUCUUCAGUAGCUAUUGCAGUCAGACACUAUGCCAGAUUCAAUUCCCGUUUUACACUCUGGCAUGCUUUUUAUAUGUGAGUGGGCAUGCCCUUGGAAGUGGGAUACAA
.(((((.......((((((...................)))))).......)))))..............((((((...(((((((((((((.............)))))))))))))))))))........
669
bpRNA_RFAM_30850
GUAUGGGUCACCGCAAGGUUUCUGGCCUGAACGCCAGACCGUAUUCUGCGGUUCGCGCGUCGAACCGUAACCGGCAAGUCCGGAUCCGUAGCGGCUGGCGCAUUCGCCGGA
.........(((....))).((((((......))))))........(((((((((.....))))))))).((((.....))))..........((((((......))))))
670
bpRNA_RFAM_25839
UGAACACAAGACAACGAAAGCCCUACCUCUCAAUCGUCACUGCGGCUCCGAAGCCGCGCCGGUGUGAAUUGUAAAACAAAAAAGUCU
.................................(((..(((((((((....)))))))..))..)))....................
671
bpRNA_RFAM_17851
GAACCCCCAUGAUGUAUAUAGCACUGGGCUCUGACCACCAUGGUGAUAUGUUGUGCCUCCAGGACCUUUGACAUCCAGGAGUCUGAGGGGUUU
.((((((...............................................................................)))))).
672
bpRNA_RFAM_9626
UGGAUCAUUGAUGACCAAAAAAAAAAAAACAUCUGGGAGUCCUCUGAGACAUCCAUGAUGACCACAACAUUGGGAGUCUGAGGUCCAC
.(((((...........................................................................)))))..
673
bpRNA_RFAM_3770
CAGCUCUGGUUCCUCUGCAUCCACCGAGAAAUUCUUUCGCCUUUUACUAAAGAUUUCCGUGCAGAGGAACGUUUAUGAGUAUACGCCAAUUUUUGGAGUCCCAGCUUCGGCUAGGGAC
..((((..(((((((((((..........((((((((...........))))))))...)))))))))))......))))................(.((((((.......)))))))
674
bpRNA_RFAM_5678
GGUCCGGAGCAGCGUGGAAGACUAGUGAUUUUGUUGUUUGGUGUCAAAAUUGACAACAAAUCAUUGUCUUCCUCACUGCCCCGAGACG
.(((((((((((((.((.......(((((.((((((((.............)))))))))))))......)).)))))))))).))).
675
bpRNA_RFAM_21836
UCGUGAAGGCUAAAUGGAGAAGAGAGAGAGUACAGCUUUGGGCGGUUUAGUUGUUAGAUGGUGGAAGUACUUGCGACGCCUACUACCCUUUUCACCAAGGCUGUACGCUCCCUCUUCUUCUCUUAGCUUUUUAUG
....((..(..((.((((((((((((((.(((((((((...........................................................))))))))).)))))))))))))).))..)..))....
676
bpRNA_RFAM_28397
AUCAAUGGGUGGGCCUUGGCAGGGAGACCUUCGGGUCUGCCGGUUGCCUCCUAUGCCGGUUCGCCAACCCUGCCUUGUGCCCGCCCGCCCAU
.....(((((((((..(((((((((((((....)))))(((((............))))).......))))))))...))))))))).....
677
bpRNA_RFAM_33114
AUCGUUCAUCUCUUUUCGCUCUAAGGGUUUUCUAGCCCUAAUGUUCAGAGGAGGGGAGACGGAAGUAGGGAGUAAUCCCGAAGGAACGCGCC
..(((((.(((((((.....................................)))))))........((((....))))....)))))....
678
bpRNA_RFAM_2981
AAGAUCAUACUUUUCAGGAUCAUUUCUGUAGUAUGAAUAAUCUUUUGAAGUCGUAGACUUCUGCGCACCAAAACCAUGAUGACGAUUCAUGACAUCUGCGCCUGAGCGUGAGGCAGGCUAUCGUUGAUCUUGUUUAAGGAUCGACUUUAGUCAUCGAUGACCGUUCACCACGGGAGCUCGUCUCUUGUGGGAGGGUGUGGAUGUGAUCUGAGUGGG
.((((((((((...(((((....))))).)))))).))))...........(((((....))))).......(((((...............(((((((((.(..(((.......((((((((..(((((.......)))))..)))))))).........)))..((.(((((((.....))))))).))..))))))))))).......)))).
679
bpRNA_RFAM_13796
AUGCACAUAUCAUUGACCUGCUUCCUUUGCAUUGGCAAGCAGUGUUAUUUCUGAUGUGCUAAAGGAAUGUCUGAAGGCUAAUUAGCAGCUUCGUUUCAUUUAGUGUUGCUGCCAGUCUCCUUCGUACAAGC
..(((((..........(((((...............)))))............)))))............((((((.......(((((((.(((......))).)))))))......)))))).......
680
bpRNA_RFAM_24815
GUUUUAGGGAGGGUGAGUGGCCUGGAGCAUGGGUGUCGUGUGCGGAGCUGUGGUGUCGCGUGGGAGGCGCGUGCUGGCUGAGUGUGAGUGGACGCGUGAGUGUGUGAGUGUGCGCGCUUGGAGCGUGUUAGGCGAGUGCGUGCGCCCACCCCUGCGCCCCUCCUCCCGCUUACACUUUGAUCUUAUUUGAUCGGGUCGUGACCCUAGUCCCGCCGGUCCGACCCGAAAUGAAAAGCUCUCCUCCUGCGAAGCCCCCCACUCGAGGCGCCUGUGCAGAGAGGCCCCUUAGGCGGCGGCAACGCUGCGGUCCCCGAGGUCCUGGAGCUGGCCCUGCGGGGCCCGGCGCUCAGAAGUGAUGAAUUGAUCAGAUAGACGAGGCCGGGCUUGUCCCGGGCCAGUGAUUAUCGAGGCGAUUCUGAUCUGG
...................................................(((((((((((.....))))))................(.((((....)))).)..(((..(((((.((............)).)))))..)))........)))))...........................(((..((((.(((.(..(((.((...)).))))))).)))).....)))....................(...(((((((.(((...((.(((.((((((......)).)))).))).))))))))))))).......((((((((....))).)))))...((((......((((((.............((((.((......)).))))..............))))))...)))).
681
bpRNA_RFAM_19729
CUGAAUCUCACUGCAGCUGCUGGACGCUGCACAAGAUUAGAUAUUUUAGAACUCUUGUGCGUGUGACAGCGGCUAUUGUGGGUAUUCUUAUUCAACAAU
....((((((((..((((((((.(((.((((((.((................)).)))))))).).))))))))..)))))).))..............
682
bpRNA_RFAM_20977
UGACUCCUCCAAGUCUUGGAGUAGGUCAUUGGGUGGAUCCUUUAUUUCCCUAUGUGGGCCACUGGAUGGCUCCUCCAUGUCUUGGCGGAGGUCA
......(((((((.(.(((((..(((((((.(((((.(((...............)))))))).))))))).))))).).))))))).......
683
bpRNA_CRW_35568
GCGGUUGUGGCGAAGUGGUUAACGCACCGGAUUGUGGCUCCGGCAUUCGUGGGUUCGAUUCCCAUCAGUCGCCCCAUUU
(((((((..((((........))))((((((.......))))))....(((((.......)))))))))))).......
684
bpRNA_RFAM_19354
ACGUCAGUCACCAGCACCUUGGCUCUAGACUGAUUACUGUGUGUGUGUGUCUGAGUAACAGUCUACAGUCAUGGCUACUGAGGGUUGGC
................((.((((....(((((.(((((...............))))))))))....)))).))...............
685
bpRNA_RFAM_662
GCUAGUGGCCAUAGUGGCAGGGACCCUCCUGUUCACCUUCCGAACACAGAAGAUAAGCCUGCCCACGUUGCUUACUGUACUGAGGUACAGAGUCCUCGGGAAAUCUGCGUCGCUGCUAGC
.((((((((....((.(((((...((..((((((.......))..))))..))....)))))..))(..((.((...(.((.....((...)).....)).).)).)).).)))))))).
686
bpRNA_RFAM_34139
CCACUACGGAAAUGCCUGCCGACGUCGUCGGCGACAUGCCCAGGUAGCCCGCGGUCAUUGAGGCUACGGCGCAGCACGCUGCGCUGACCGCUACCCGUUCGCCCCGCAUCCUGGCCGCGAACGAUCACCGCUGCUGCGGUGAUGGAUGC
..........(((((..((((((...))))))).)))).....((((((............))))))(((((((....)))))))...............................(((....((((((((....))))))))...)))
687
bpRNA_RFAM_39921
AUUUGCUGUUUAUUAAAAACACUUCUGCAUGGUGAAUCCCCCUGUGCGGAGGGGCGACUGGUGUAGGUAGCAUUUAUUAUGUUAUAGGCAAGCCGACGCGGGUUCAGUGACACCGGCUGAAUUCACCGGGAGGCACCCGGCACCAUGCAAGAAAAAGAAUGUGCAUGCAAACAUGCCCCUCUCCGGAGGGGCAUUUUUUAUGG
..........................((((((((....(((((......)))))......(((.......................)))..((.(.)))((((.(((.........))).)))).(((((.....)))))))))))))..............((((.....(((((((((......)))))))))....))))
688
bpRNA_RFAM_41437
AUUAACAUCUAUUAACAGUAAUUAACAUGAAUACCUAUGAACUUGGUCAGGUUUUUAAAUAAUAUAGCGAUGUAGAUUAGCAAACACUAAUCUCAUGACAUUUCUCCUUUCAACCGAAACUGUUUUAAACAGAUUCGUUGUUCAACGCAAUGAUCACCCCAAUCAUUGCGUUUUUUUUGCAUCUCAUAAUAUUA
.............((((..((((..(((........))).....))))).)))...........(((..(((((((((((.(((.....))).).)).................((((.((((.....)))).)))).......((((((((((.......)))))))))).........)))).))))..)))
689
bpRNA_RFAM_34064
AUCCUGCGGCGCAGGCAGCGGGGACGUUUGCGUCUCCACUUCCCAGCACAGCCGCGGUCUUCGAGGCUGUGGCGCGGGCCACCGCGUCGAUCGCUCCCGUCCGCACCGCAUCCGACACCGCGGACGCCCAGCGCCCAGGCGCUGGAGGAUGC
..........(((((.....((((((....))))))).)))).....((((((...........))))))(((((((....)))))))...............................(((....((((((((....))))))))...)))
690
bpRNA_RFAM_812
UUACUUACCUGGCAUGAGUUUCUGCAGCACAAGAAUUGUGGAGACUCAGUUAUUUGUCUUGGCAUUGCACUGAGCCCUGACGAAUAACUGUGGACUGGCUAAGGUCAGCUCCGGAUGCAUCAUUUUUGAGUUCGUCCCUCAUUUGGGGCA
...........(((((((((((((((..........))))))))))).(((......(((.((..........))..))).....)))..(((.((.((....)).))..))).))))..................(((((..)))))..
691
bpRNA_RFAM_2437
UUAGUUAACCGAAUGAUCGCGCCAAAGUCUUUUGGUGAGGAAAGUCCGGGCUUCGCAGGGCAGGAUGCCGGAUAACGUCCGGUAGGGGUGACCCUCAGGCUAGUGCAACAGAAAUAAACCGCCGGUAUUAGCCGGUAAGGGUGGAAAGGCGGGGUAAGAGCCCACCGCUUGGCUGGUAACAGGCAAGGCACAUGUAAACCCCAUCCGAAGCAAGGCAGGAGAAAAGCUAUGGGCUUGCCCGGUCCGCUUUUCGGUGUGCCGCUGGAGCUUGCUGGCAACAGCAAGUCGAGAUAGAUGAUCAUUUAAGACAGAACCCGGCUUAUAGAUUAGCUAAAUUC
.(((((((((([[[[[[[.((((((((()))))))))....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((...........((((((((....))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....)))))))).)...)))..)))))))))))))...((((....((((((...(((((.]]]]))))))))))).....))))......((((((((....))))))))..........]]]]]]]..........)))))))).).))))))))).....
692
bpRNA_RFAM_17433
CUUCGCUGAUGACUCCCUGUUCGUGCCGUCGUGUCUGGGCCACUGAGACCUGGUGAUGGAGAUGAGGAUCUGAGGAAG
.(((......................................................................))).
693
bpRNA_RFAM_5700
ACCUGCAUUUGGAAGCCGACCACGGGCUGCCUGUGCUCUGGUCAUCCAUAAUGCAGGGAGAGGAGUUGCUGAAAGCCAUUUCCCGUGUUUGAAGGGUCCACUCCUCCCUCUCAAAUGCUGGUGCUUUCACACA
.((((((((.....((((((((.((((.......))))))))))))...))))))))..........(.(((((((..........((((((((((.........))))).)))))......))))))))...
694
bpRNA_RFAM_7223
CUGUAAUUUAUUUAAAGUCGCACAUAUACCGUCACAUCUGCCUGGGUGCCGUGCCUUUGGGCUUCGGUUGGCUGGUGGGGUAUAUGGAGGCCUAAC
......................((((((((....(((((((((....(((((...........)))))))))))))).))))))))..........
695
bpRNA_RFAM_8596
CAACAGUUCAUACAAAAGACUCGUAUAUUUCCGAUAUUAUGGUUGGAAAGUCUCUACCUGCUAUCCGUAAAUUAGCAGACUACGAGGUAGUGUUUUAGUGCU
.................((((((((...(((((((.......)))))))........(((((((.......)))))))..))))))))..............
696
bpRNA_RFAM_15690
CUGGAGCAUGAUUCAUGAUUCGUACCGUUCGUUCUCUCAGCCUACUACUACUAAACGCAUCUCUUUUGCGCGGUAGGCUGGCGAACGAAAUUCAACGUUGAAUCGUCUCCAGUAAACAAGAAACCCGCGCCAUUGCGCGGGUUUUUUU
.....((.((.(((((((......((((((((((.............(((((...((((.......)))).)))))..))))))))))......))).)))).)))..)..........(((((((((((....)))))))))))...
697
bpRNA_CRW_28147
GGACCGGUAGCUCAGGGGUAGAGCGUUCGGCUGCAGUCCGAACGGUCACGCGUUCAAAUCGCGUUCAGUCCU
(((((((..((((.......))))((((((.......))))))....(((((.......)))))))))))).
698
bpRNA_RFAM_11136
GCUCAGCUGAUCUGUGGCUUAGGUAGUUUCAUGUUGUUGGGAUUGAGUUUUGAACUCGGCAACAAGAAACUGCCUGAGUUACAUCAGUCGGU
....(.(((....(((((...((((((((..((((((((((.............))))))))))..))))))))...)))))..))))....
699
bpRNA_RFAM_9025
CUAUCUUUGUCGCGCAUCGGUUUGCAACUCUCACAUACGAGGGAAGCGAUUAAAAGGGAAUCAGGUGUAAAUCCUGAACAGUCCCGCUGCUGUAAGUUCCACACAUUACGUUGCGAGCAACCUACUUUUAGCCACUGGAAAGAAACUUCCGGGAAGGCGCCCGCAACAGGAACAAGUCAGAAGACCUGCCGUGCAACCAAUUUCACUG
...............(((((((((......................))).....(((...(((((.......)))))..(((...))).(((...((((.............((((((............(((.((((((......))))))...))))))))).....))))....)))....)))))))))...............