Unnamed: 0
int64 0
10.6k
| sequence_id
stringlengths 11
16
| sequences
stringlengths 33
498
| dot_bracket
stringlengths 33
498
|
---|---|---|---|
8,000 |
bpRNA_RFAM_33358
|
GUUGAGGCGACGGUCUUGACACGGGAGUGACUGAAUAAACUUGCUGGCAUAAGGCUAGUUAAGGUGAUGAGACACAGGUGGUGCUGCUGCUCGCAAGAGUAGAACCGACCUACCAGUCGGGUCUCAGAUAGUACAGUAAAAAUCUACUCAAUGUAGCAAUGCCCUGUACUUGUUGGUAAACAUGAACCCAACCUCCCACCC
|
.((((...........))))..(((((..((...........(((((.......)))))....))..(((((..(((.[[[[.)))..((((.....))))...(((((..]]]])))))))))))...(((((((.......((((...[[)))).......))))))).(((((...]..]....))))))))).....
|
8,001 |
bpRNA_RFAM_27432
|
GAGGCUUCGGCGAAAAUUUGUGCACAAAUGGAAAGCAGCUUGUCAAGGGUUGAGAGCGUUAGGCUCUAAACGCUUGAU
|
.((((....((....(((((....))))).....)).))))((((((.(((.(((((.....))))).))).))))))
|
8,002 |
bpRNA_RFAM_27254
|
UGGCAAUGAUCGAAUUAUCAUUGAGCCAAUCCUUUUCUGAAUUCUGUGAGGAUGUAAAUGAUAGGUCUGAGCCA
|
.(((..................................................................))).
|
8,003 |
bpRNA_RFAM_10575
|
GAAAUAGCGAUGAAUUGGAGUAGUAAUCUGCAUAUUUUGAUGUGAAGAGAGCUGACGGUUGGUGCAAGUCAGUCACAAAAUCUGGAUGAACUUACCAUGGAGCUUGGGUGUAUCCCCGUUUUCCGCGUUAAGGAAUUGAUAAGUUGAGUGGUCAAACACUAAUGUGGGUGGUACCGCGGGAGAAGCAUCUCUCGUCCCAUGG
|
......((......((((.......((((((........(((........((((((...........))))))))).....)))))).......))))...))...((((.)))).(((.....)))...................((((((()))))))....((((.......(((((..........)))))))))...
|
8,004 |
bpRNA_RFAM_26941
|
AAGGAGUGCAUUGAGUCCUACCGCUCCCCCACUACUGAGCGCGUGGGAGCAUCAACUCUCCGAGA
|
..((((.(.......(((((((((((..........))))).)))))).......).))))....
|
8,005 |
bpRNA_RFAM_34130
|
CCACUUGUGCAAUCGCUGGUUUUUCCGGCAUCCCAGGUAGCCAUAACCUUUGAGGCUACGUCACGCAUGUGAUGGUUACCCCGAAAUGCGAUUCGCGUUCGGCAGCUCGCAUGGUCACCGUUCCCCGGUGAUGAACGC
|
...........(..((((((...)))))))......((((((...........)))))).((((.....)))).................................(((....((((((((...))))))))...)))
|
8,006 |
bpRNA_RFAM_31337
|
UAACUAGUGGAAUGAUUUGAAUGCUUGCAACCACCAAAAAAAGCUAAAACGAACUUA
|
.....(((((....(((.....)))[[[[.)))))......]]].]...........
|
8,007 |
bpRNA_RFAM_22706
|
CACGCUUCAGGGCAAUUCACCCGUACCCAGGGUGAAGCGCAAAGCCGCGGGUCCGGUGAACGCCGGACGGCCGUGGCCGCCGUG
|
...........((...((((((.......))))))...))..((((.((((((((((....)))))))..))).))))......
|
8,008 |
bpRNA_CRW_28788
|
UCCCACAUGGUCUAGCGGUUAGGAUUCCUGGUUUUCACCCAGGCGGCCCGGGUUCGACUCCCGGUGUGGGAA
|
(((((((..((((........))))((((((.......))))))...(((((.......)))))))))))).
|
8,009 |
bpRNA_RFAM_25614
|
GCUGCCGCAAAAUCGGCAGCCGGGCGUGAGAACCCGAGCAAUCUAACGGCGACAUAUGACGCGCCAUGCGUCUUUUUU
|
.((((((......)))))).(((((......)))))....................((((((.....)))))).....
|
8,010 |
bpRNA_RFAM_25890
|
UGUAGAUUAAAGGCAAAUGUUACCUGAACAGGAGCAUUUUCUAUUAUGUGUUUUUUAGUAAGUGCUACCUUGUUUGGGUGACAUUUACCU
|
...........((((.(.(..(((((.(((..((((((.(((..............))).))))))...).)).)))))....)))))).
|
8,011 |
bpRNA_RFAM_40266
|
GUAGGGGACACUUCCCACUGAGGGUUUCCCGGCGUAAGUUCCUGAACAAUUUGCGGAAAUUGGUGUGGGUCGUAUUGUCCCCCCCUCUCCGCCAGAUUGAGGCGAGUAGGUGCGCCAGUGCCGCGUGGGUUUCGCCGGCGGCAUUGGGGGGUGAGA
|
...............(...((((((..(((((.......)))))...).))))..))......................((((((....((((.......))))..............(((((.(((.....)))))))).....)))))).....
|
8,012 |
bpRNA_RFAM_7162
|
AUGGCCCUUUUCGCCGUCUCGCAAACGGGCGCUGGCUUUAGGAAAGAAUGUUCCAUGACCGUAAAUACAGGCACCCCACAGUGCUUGCUAUCGCGGCAAUAUCGCCAGUGGUGCUGUCGUGAUGCGGUCUUCGCAUGGACCGCACAAUGAAGAUACGGUGCUUCUGUAUCGUACUUAUUGUUUCUGGUGCGCUGUUAACCGAGGUAAAUAAUAACCGGAGUCUCUCCGGCGACAAUUUACUGGUGAUUAACAACCUUCAGAGCAGCAGGUAAGCCCGAAUGCCGCCCUUUGGGGCGGCAUAUUUU
|
......((((((.((((.......))))((....))....))))))...........(((.......(((((((......)))))))..(((((((((.(((((....))))).)))))))))(((((((......)))))))(((((((...((((((((....)))))))).)))))))....)))((.(((((....................((((...))))..............(((........))).....)))))...))......(((((((((((....))))))))).))..
|
8,013 |
bpRNA_RFAM_34176
|
UUCGUUAGAACACUACCUAAGGCUUUCGCUGCAAUGGCGAAGGCACAGAAGGUUCGCCACGCCGGCAGCGGACCUUCGCAGGCAGAUACGUCUGCCAGGCCUUGCCACAAGGCCAACGGGACAUAACAGUCAAC
|
.....................(..((((((.....)))))).).......(((((((..........)))))))......((((((....)))))).((((((.....))))))....................
|
8,014 |
bpRNA_CRW_19850
|
GAUACGGCCAUAUCUACUGAAAACCACCGGAACCCAUCAGAACUCCGAAGUUAAACCAGUAUGAGCUUAAUUAGUACUAAGAAGGGAGACCACUUGGGAACGUUGGGUGCUGUAUUU
|
((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))).
|
8,015 |
bpRNA_RFAM_18318
|
CAUCCGUGAAACUGGCACAGCCCCUGCAUCGAGAAAACCGACAGAUCACAUAAGCAUUGCCUUCAACGUGGAGGGCAGUGUUUCCCGACAGAACGGGAAUGGACAAAGGCGUCCUCGCUGGGUAACCGGCGGGACGCC
|
...........((((((.......)))..........................(((((.((.((......)).)).))))).(((((......))))).....))).(((((((.((((((....)))))))))))))
|
8,016 |
bpRNA_RFAM_41533
|
CUCAACAAACUUAUGAUGGGGUGCGCGCUUUUUUAUUGUACAAGAUAACGGAUUUGUAGACAUU
|
.........((((((((((((.........)))))))..)))))....................
|
8,017 |
bpRNA_RFAM_26202
|
UGUAGCCUAACAAAGGAAAAGGAUUGAGAGUGGGACUCACAGUACGUACUUCACCUAAAGUAGCAUCAAAAAUACCACCGAAUACAGUAGCUUUUAACACAAACAAGAAAGCACCUACUCCUAAGAAAAUGAGGUGAUGACCGAAAAUAAAGGUUAACUUGUUGCCAUCAGACCA
|
....................................................................................................................................((((((..(((((................)))))))))))...
|
8,018 |
bpRNA_RFAM_23313
|
UUGCGAUCCGCUAACCGGUCAAGCCGUGUCGCGGAAGGUUGAAUAACCCGCUGAACUCCGGCAUUCCCGGAGAAUAGUGAGCG
|
.(((..(((((....((((...))))....))))).((((....))))((((....(((((.....))))))...)))..)))
|
8,019 |
bpRNA_RFAM_19197
|
AGCUGAUUUUUGGCAUAAUCUCAGCUGGCAACUGUGAGUAGUGUUUUCAUCCCUCUCACAGGCGCUGCUGGGGUUCUGUCACACACAGCA
|
........(((((...(((((((...((....((((....................))))....))..)))))))...))))).......
|
8,020 |
bpRNA_RFAM_40736
|
AAGCGAAACCGCGCACAUUGAAAUAUGUGCGCGGUCUGCCCGGCGUGGUUGCCGGGUACUGAUGAGCAGCCAACG
|
.((....((((((................)))))).(((((((((...)).))))))).......))........
|
8,021 |
bpRNA_RFAM_28456
|
UUUUAUGGUGGCUGUGCGUGUGGGCACGCUUGCGUGCGCCGGAGCUUUUCGUGAUUUUACCGCCGGUCUGUCAACCCACGUACAGCUGCCACCCCA
|
.....(((((((((((((((.(((((((....)))))(((((....................))))).......))))))))))))))))).....
|
8,022 |
bpRNA_RFAM_27734
|
ACCGGUCUCCGGUAGUGGCCUCCGGGCAUCCGGCAUCUCGCCGAUCCGCCCGGGCGCUUCGAUCGAAGACCGGC
|
.((((((..((((...(((.((((((....((..............)))))))).)))...))))..)))))).
|
8,023 |
bpRNA_RFAM_19526
|
CCACCACUUAAAUGUGGGUGUUCUUGCUUUGAAAUUAAAAAAGAAAGUACUUCCAUACUUUAGAGAUGG
|
.(...(((..(((((((((((((.......................)))))))))))))..)))...).
|
8,024 |
bpRNA_RFAM_28474
|
CGUUUUGGCAGCUGUGCAUGGGGCACCUCGCGUGCGCCGGUUUUGGUCUGUUCACCGGUCUGUCAACCCAUGUACAGCUGCCGCCU
|
.....(((((((((((((((((.(((......)))(((((..............))))).......)))))))))))))))))...
|
8,025 |
bpRNA_RFAM_35868
|
AAGACUGUACUCGUACAGGAUCAUGUCUAUAGUAGUUACUUACACUUUGCUUCAGCAAAUGUAGGCAACCAACCAAGCUAGAAUGAUUCAGCAUGCACUCUGAUCUAUAAUUAGGAAUAUGAAUCCAUUCUAUUUCAUGGAAUGCGAUUCGCGAUGCCCAUCCAUAUUUGUUGUGCCCUAAUAUUCUUUAUGGAUAUUGGAGCCUUCAAAUAUGUGAAGAUUUGAGUGUGUCUGACUAGCU
|
.((.((.((((.....((((...))))...)))))..)))......((((((.(.....))).)))).........(((((..............(((((.((((((...((((......(((..(.................)...))).......)))).....((((.(..................................).))))....)))))).))))).......))))).
|
8,026 |
bpRNA_SRP_526
|
UAAUCUAGCCAUUACAACAAUUAACACGAACCAUGUCAGGUCAGAAAUGAAGCAGCAUUAAGUAUCUUAAUUGUGUGUAAUGGCUUUUUUAUUUAUUA
|
(((...((((((((((.(((((.(.((.....((((....(((....)))....))))...)).)...)))))))..))))))....))...)))...
|
8,027 |
bpRNA_CRW_35638
|
GCGGGCGUAGCUCAGUUGGUUAGAGCGCGUGGUUGUGGUCCAUGAGGUCGUCGGUUCGAUUCCGAUCGCUCGCCCCA
|
(((((((..((((.........))))((((((.......))))))....(((((.......))))))))))))....
|
8,028 |
bpRNA_RFAM_31858
|
AGGAAGACAGGCGAUGGGGUUCGCCAAAACCGCCCCGGAGAACAGCGGGAGCUGAUGACCCCUACUCCAUU
|
...............((((((..........((((.............))))....)))))).........
|
8,029 |
bpRNA_RFAM_15110
|
UUUUUUAGGGAAGCUAUGGCCUUCCGACAGAGGAAGGCCGGGGAAUUUUCCU
|
...............((((((((((......))))))))))...........
|
8,030 |
bpRNA_RFAM_34448
|
GCGGCGUCCAUUUCCGGAUGCCGGCGGACGAGGGAGCAGUACCCGCACAGACAAGACUGACUCGC
|
....(((((......))))).............(((((((...............)))).)))..
|
8,031 |
bpRNA_RFAM_27154
|
AAGCAGUUCUCCAACAGAAAUAUGUGCAUGAAGUGAUGGUUUGGGUAACCAUUUCAUCUUUUCAUGUCAUAUAUCUCCUGCCUCUCACGGUUUCAUCUGUGAGAAGCUUCAAAGAACUGCAAUAGAAGUCUAGCUCGAGAUGCGUGUGCCGGUUUGCUUUUAAUGCAAUAUGGUUCCUUUUCUCCUCGGGACAGUU
|
..((((((.......(((....)))...((((.(((((................))))).))))..................................................)))))).............((((((..(.....((((((((((.......)))))))))).......)..))))))......
|
8,032 |
bpRNA_RFAM_5215
|
UCGACAUGUGACUAGCGAUCCUCUUCGGGGUUGAUUGCUUUUCUUAGUGGAGCAUCGGGGGCUUUCUGUAAAGUUGACUCCGAUCCACCUUGUCGUAUACCAACAGUCUGUGUGGCCCUCUACCGCUAUUUGAGAUGCCCGGGCUGGAUUGCAUAUUCCUUAUCCUUCCGUAGAUCCUAUGGGUCCGUGACGGUUAGGACAAACCAUGCAAAUUACAAAU
|
.((((((..((..(.(((.((((....))))...)))...).))..((((.....(((((((..........)))..))))...)))).))))))....................................................(((((((.........((((((...((.((...)).)).......)))))).......)))))))........
|
8,033 |
bpRNA_RFAM_23012
|
CUGCCGAGGGGCGCUGCGACCGGAUCCCUUGAGGCCGGCCAGGCUCGGCCAGGUGGUACUGCAACAACGGCGCCCGGCCAGA
|
.((((((............((((((.......))))))......))))))................................
|
8,034 |
bpRNA_RFAM_37713
|
UCUAUCGUAAGGUAGAAUCUGAAGGAAGCUGUAAGCAAACUCUUGGUCCGACGGACAGAAAUCACAUAUGAGGCUAGACAGAUGUACAAUCCAUCUGUCUGUUUGCCGUGCAAAAAAACAGAUAACAAA
|
.(((((....)))))........................((((((((..(...........((((((.....((.(..(..(...(..(....(..))..))))))))..))))))....))..)))))
|
8,035 |
bpRNA_RFAM_16922
|
GGUUAAUAAUUAACUGUACCGAAGACAGUAGGUGACGCAAGUCUUAAUUUCCUACCGAGGACAAUUGUUGAGUUAUAUACAAUUCGGUCCCUCUAUGUCUACGGUGGCAUGGAGUUUUGUUGUUUUACAC
|
...........................(((((((((....)))......))))))..................................((((((((((......))))))))))...............
|
8,036 |
bpRNA_RFAM_6161
|
UUUCAGGGAACAUUCAACGCUGUCGGUGAGUUUGAUGCUAUUGGAGAAACCAUCGACCGUUGAUUGUACCUUGUAU
|
..((((((..((.(((((...(((((((.((((.............))))))))))).))))).))..))))))..
|
8,037 |
bpRNA_CRW_42704
|
UGGGUGUAUAGCUCAGCUGGUUAGAGUGGUGGACUUUUAAUCCGAGGGUCUUGGGUUCAAGUCCCAAUACGCCCA
|
.(((((((..((((.........))))((((((.......))))))....(((((.......)))))))))))).
|
8,038 |
bpRNA_RFAM_37151
|
UAGGGACCCGAGACCUCACUGUCUGCUCCAGGUAACAUCUCUGCUGAUGCUGUCGGCGGACUUAACCCUGCAGACAGCCAUGAGGUCUCACAGCUUAAUG
|
.........((((((((......................(((((((.......))))))).....................))))))))...........
|
8,039 |
bpRNA_SPR_176
|
GCCGAAGUGGCGAAAUCGGUAGACACAGUUGAUUCAAAAUCAACCGUAGAAAUACGUGCCGGUUCGAGUCCGGCCUUCGGCACCA
|
(((((((..(.(...........).).(((((.......))))).............(((((.......))))))))))))....
|
8,040 |
bpRNA_RFAM_19570
|
UGUUCGUCGUAGUCAAAUGCUCAGAUUCCUGUAGUGGCUUCUGAUGUACUACAGCUGUCUGAGCAUGUGCCACGGCGUCUG
|
...((((((((((...((((((((((..((((((((.(.......)))))))))..))))))))))..))))))))))...
|
8,041 |
bpRNA_RFAM_2760
|
UGAGUGGAGCGAGGAGGCGCAGCUUUAAAGCUGAGGAAAGUCCGGACUCCGUGGGCAGGGUGCCGGAUAACAUCCGGAGGGAGUGAUCCCUGGACAGGGCCAUAGAGAAGAAAACCACCACUAUGGUAAGGGUGGAACGGUGAGGUAAGAGCUCACCAGGUAUGGAGUAAUCCAUACGCUUGGCAACCCCCACCUGGAGCAAGGUCAAGCAGGGUUUGGGUGGCCCGCCCUAUAACCCGGGUAGACCGCUUGAGGAAUUUGGUAACAAAUUCCCAAGAUAGAUGCCUCCAAAAACAGAAUCCGGCUUACCGCUCCACUCAUUUU
|
.(((((((((([[[[[[[.((((((()))))))....(((.(((((((((..[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))))((...(((((.............((((((...))))..)).......((((((.......)))))).{(((((((.....)))))).)..)))..)))))))))))))...((((.......((((((((.]]]]))))).).)))......)))}......((((((((....))))))))..........]]]]]]].........)))))))).).))))))))).....
|
8,042 |
bpRNA_RFAM_2009
|
UAGAUAGAUGCUCGCUGGUUUGAGUGCUUAGCUGUUAACUAAGAGUUUAAAGGAUCGAGGCCUUUCUGUCUAG
|
.((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))..
|
8,043 |
bpRNA_CRW_53974
|
AGGGAUAUGAUGUCAACGGUAGCAUAACGGUCUCCAAAACCGCUCGUUCGGGUUCGAAUCCUGAUAUCCCUGCCA
|
(((((((..((((........))))((((((.......))))))...(((((.......))))))))))))....
|
8,044 |
bpRNA_RFAM_28331
|
AUCAAUGGUGGGCUGUAUGGGGCCGACUUCAGUCGGGCUGGUUCCCUUGAUUGCCAGUUGUAGCAACCCUGUACAGUCCACCGCCAGC
|
.....((((((((((((((((((((((....)))))(((((............)))))........))))))))))))))))).....
|
8,045 |
bpRNA_RFAM_37781
|
UUUACCGUGAGGCAAGCAGUGAAGGAAGCGAGACUACAAAACCCGGUACUGACGAACAGAAACCGAAUAUGAGGCAUAUAUACUUGGGUGAGCAAGCACACCAUUGCUAAGCCCUAAGUUUACAAAAAGGGUAUAUAUGUAGAUUCGGCAGGUAUUGGAGGAAGGAAAAUGCU
|
.(((((....)))))............(.(((...((...(((((((((((...........((((((.....((.(((((((..((((..((((........))))...))))................))))))).))..))))))))))).))))))....))...))))
|
8,046 |
bpRNA_RFAM_8249
|
UCUUUAUCGAGAGUGGUGGAGGGAUAGGCCCUGUGAAACCACAGCAACCGAUUCGCCGGCGCGAAUGUCAGGUGCUAAUUCCUACCCCUUCAACAGGGGAGAGAUGAGGA
|
.(((((((......(((...(((.....)))......)))..(((.((((((..............))).))))))........((((.......))))...))))))).
|
8,047 |
bpRNA_RFAM_27083
|
UUUGAAUGAUGAAAAAAUAUGCUGUCCUGAUUUAGGGCCAAAGGUUUCCUAUAUUUUUUUUUCUUUUGAAAAAAGAAUGGUAACCUAUAUAAUCUUAAGAUGAUGGCUUAAUCUUCUCACUGACAAAA
|
.((.........................................................................................................................))..
|
8,048 |
bpRNA_RFAM_18612
|
CACCACAAGUUGGUGAAGCUGCCAGCAUGAUCUGAUGAUGAUGAUGAUCCACCUCUCUCAUCUGUGUUCUUGAUUAAUUACGGAUCAAUCGAUCAGGUCAUGCUGUAGUUUCAUCUGCUGGUUGG
|
....(.(((..(.(((.(((((..((((((((((...........................................................)))))))))).))))).))).)..))).)...
|
8,049 |
bpRNA_RFAM_41776
|
GGGUGAUGAUUAAAAAGAGAGAGGCUUGAGUGGGGAGUGUGAACAAAACUCUCAUGGGAUGAAGAAAAAAAAAAGCCCAAAUCGAAAUCGAAGGAGAAAUAACAUUUGAUUAAUGUUUUUUUUCCCUUUUUAUGAUUUAGGGUUCUUUCUUUCAUCCCUAUCCCUCGAUGACGGUCCUUCCAAGUUACACUUGAUAUGAGCCCU
|
.(((....(((((.......((((..((((((.....((....))...)))))).(((.((((((((......((((((((((((((.....(((((((..((((.(....)))))...)))))))...))))))))).))))).))))))...)))))...)))).(((((((.....))..)))))..)))))....)))..
|
8,050 |
bpRNA_RFAM_25632
|
GCACUGGCAAAAUCCAGUGCCGGGAUUGGCGUCCCGGAUUACUAAAAGGCGCAUUCACCGCGCAAGCGGUUUUUUU
|
.((((((......)))))).(((((......)))))...................((((((....)))))).....
|
8,051 |
bpRNA_RFAM_24641
|
AACAUCAUUUUUAUCGCUCACACUGACCCCAUACUCUUUUUUUAGAGAGGGAAGACGCAAUUUUCGAGUUCCUUCUGGUUUUCGGGGUCGGUAAGAAGCGUAGACAGAAUCUCAAGACCGUUGCUGGGCGCCUGAUGUUGAUUUUUUUCAUAAAAAGAGGAUACAUUUGGAAUCAGCUGUUUCUACAAUU
|
..............(((....(((((((((......(((....))).(((((.(((...........))).))))).......))))))))).....)))...............(((((..........((..(((((..(((((.....))))).....)))))..)).......))).)).......
|
8,052 |
bpRNA_RFAM_23188
|
CGGUGAGGACGACCUCACGACGCACCGCGUGACCACUCCGGGGACGGCCCCA
|
.(((((((....)))))))...................(((((....)))))
|
8,053 |
bpRNA_RFAM_6720
|
GGCUCGCUCCCUGUAGCCGGAGGGUUAUUUUCCAAGGGUUGAGUCGCGGGACCCCCGGUUCGAGUCUCGGGCCGGCCGGACUGCGGCGAACGGGGGUUUGCCUCCCCGUCAUGCAAGACCCCGCUUGCAAAUUCCUCCGGAAACAGGGACGAGCCCCU
|
.(((((.((((((((..(.(((.............((((....(((((((((.((.((((........).)))))..))))))))).....((((..........))))........)))).............))))...)))))))))))))....
|
8,054 |
bpRNA_RFAM_17562
|
AAGAGAAGUCAAUGAUGGUUUCAUCUAACAUUGUCUGAACCUGUCUGACGCAUCUCAAUGAUGCAGUGUUUGUGGUUUCUGAGACUUCUCUGUAU
|
...(((((((........................................................................)))))))......
|
8,055 |
bpRNA_RFAM_33759
|
CAGAUUCCCUGCAACUGACGGACACAGGUGGAGCGCAAACCACCGGGGAGCAGGGAGUUCCGUAAUCAGAUGCACCGUGAAGUGUAUCUCAAUGCCGACCGUCUGGGCAGUGUCG
|
..((((((((((...............((((........))))......))))))))))................................(((((.........))))).....
|
8,056 |
bpRNA_tmRNA_274
|
GGGGGUGUAAUGGUCUCGACAUUGCUUUUCGCACAUGCAGUGCACCUCGGAGGCUCGGCUCCGUCAUCAACGGAACAGUUAAUAUAACUGCAAAGAACGAAAAUUCUUACGCUUUAGCUGCUUAAUAACCAGCUAGCGUGAUCCUUCCGACUUCGCUCAAGGGUCGGGUCUGGGUCUCAAAUUAUUGAGCUACGGUUAAUGUUGCCACCUGAGGCAUUAACAAGAGACUAGUAGGUUAGCUGCGUUGUGUUAGCCUUGCUGGCUGGCGCGACAUCGCGGCGAAUUUUAAAUAAGUCAGCUAUAGGUGUAGAGCUGCAUGUAGCAGGGGUGAUGGACAGGAGUUCGAUUCUCCUCACCUCCAUUA
|
(((((((............(((((((((....(((((((((.(((((((((([.[[[.))))).......]].].]....................................(.(.(..((..........))).).).(((((.((((((((.[[[[[[))))))))...)))))........]]]]]]....(((((((((...[[[[[.)))))))))..........]]]]]..((((((.(((....(((..[[[[[[[)))...))).))))))............]]]]]]]...)))))....)))))))))....)))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
8,057 |
bpRNA_RFAM_2409
|
GGAGUGGCUCGGAUGGUCGCGGCAGGUUUAACCUGUCGAGGAAAGUCCGGGCUGCACAGGGCAGAGCGCCGGAUAACGUCCGGUGGGGGUGACCCCGGGAAAGUGCCACAGAAAACAGACCGCCGCGGCAUGCCGCGGUAAGGGUGAAACGGUGCGGUAAGAGCGCACCGCCCGGUGCGGUAACGGACCGGGGCACGGUAAACCCCGCUCGCAGCAAGGCCAAAUAGGGAAGCGCCAAACGUGGCCCGCGUUUGCUUCCGGGUAGGCUGCUCGAGCCUGUCAGUAAUGGCAGGCCCAGAUGAAUGACCAUCUCCCCGCUCCGGCGGGAGACAGAACCCGGCUUACAGAGCCACUCCGCAU
|
.(((((((((([[[[[[[.(((((((((.)))))))))....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))))((...(((((............((((((((((()))))))))..)).......((((((.......))))))(((((((.((....)).)))))).)..)))..)))))))))))))...((((......((((((....(((((.]]]]))))).)))))).....))))......((((((((....))))))))..........]]]]]]]........................)))))))).).))))))))).....
|
8,058 |
bpRNA_RFAM_1624
|
GAGGAUUUAGCUUAAUUAAAGCAGUUGAUUUGCAUUUAACAGAUGUAAGAUAUAGUCUUACAGUCCUUA
|
.((((((..((((.....)))).(((((.......)))))....(((((.......)))))))))))..
|
8,059 |
bpRNA_RFAM_29000
|
AUUUGUGUGAGGAGCUCAGCAGUUUCACAGAGUCGAAACAAGGAAAGACUUCUUUGAAUUGCUGACCCUG
|
..............((((((..((....((((((............))).)))...))..))))))....
|
8,060 |
bpRNA_RFAM_39804
|
GCAGUGCCACGGCCGCUUAAGCUAACCGGUUGUUAACCGACAUAAAAGGCGCAGAUAUCUGCGCCUUUUUU
|
.(((.((....))...)))........................(((((((((((....)))))))))))..
|
8,061 |
bpRNA_RFAM_26294
|
GGUAACCAAAGAUAACAGCUGGGCUAGUUGUUGGAUUUGUUAUAACACGAACAUCUCCACCGCCGGGCGCCCAAGUAUCAUAAACCCCACCAAAGUAAAGAGCUUUCCAAACAAGGAGCCAAGCACCAAUACCUAAGAUUAUUAAAUGAAUACCUAGGAUAGUGGUCAUUUUAUUUUUAUCACGCCA
|
................................................................................................................................................((((((..(((((................)))))))))))...
|
8,062 |
bpRNA_CRW_24626
|
GGGCUUGUAGCUCAGUUGGAAGAGCGCCGCCUUUGCAAGGCGGAGGCCCUGGGUUCAAAUCCCAGCAAGUCCACUA
|
(((((((..((((........))))((((((.......))))))....(((((.......))))))))))))....
|
8,063 |
bpRNA_RFAM_16476
|
UAUCCCUUUCGUGAUGAAUGAUUUAACAGAAGAGUUCUUGAAGACUAUAUUCAUCACCCAAUUCUGAAGUGAUUC
|
.((.........................(((...)))...............................)).....
|
8,064 |
bpRNA_RFAM_14119
|
ACCUCCCACAAAGGCGUGUCUGUGGCUUCCCAUCCAUAGAUACGUAAGAACUGGAGGCAAAGAAAUGAGGAUUAGGAAAAGUUCAAGACUGGCUUACUCAACCCUUGCUGGUCUAGGACUUCCUGUCCAACAAUA
|
.(((((........(((((((..((...)).......)))))))........)))))...........(((.(.................(((((((.........)))))))...........)))).......
|
8,065 |
bpRNA_RFAM_16012
|
CCGCCCGUGGUUCGAAAACCUCCCACAUUAAAAAACUAAGGAAAC
|
.....(((((............)))))..................
|
8,066 |
bpRNA_RFAM_36753
|
CCCACCAGAGCCUUCCACCUGGGGUUCCAUUCGUAUGAGUUUCAUGGACUUUCCCUACAGCUCUAUGACACUGAGUGCGGAGUGGAACCCCUAUGGAUAAUAGUUCUUUGAU
|
.((((.((((((((.(((.(((((((((((((((((((((.(((((((.((........))))))))).)))).))))))).)))))))))))))))..))))))))))...
|
8,067 |
bpRNA_RFAM_39044
|
GUCAACUACCGCACACCAACCCUGAUCGGGUAUGGUGUGGACUUGAAUAAAGUCUGUUGACCAGACGGCUCACCUCGACUUCGCGGGCGUGAGCGGAGCCGAACCGAGCAGCCGUUAAGACUAAGAGUUAAAGUUCGUACCUUGGGAUGCGUGCCAGUUCCAAGCUCUACA
|
.((((((.(((.(((.....((.....))......))))))(((.....)))..)))))).........((.....................................).)........................((((.((((((((........))))))))...))))
|
8,068 |
bpRNA_RFAM_35668
|
UCUAGUAUAGUUCUUCUUGCUGGGCCUUCUUUAAGACCCUAAGAUAAAUUUUGGACGCCUGUCUCUAAGGAGGCAGGUG
|
.....................(((.(((....))).))).................((.(((((......)))))).).
|
8,069 |
bpRNA_RFAM_1549
|
GUCGGAAUAGUUUAGUAGGGUAGAACAGCGGGAUCAUAAUUCGCACACGGGGGUUCAAAUCCCUCUUCCGAUA
|
.((((((..((((.........)))).(((((.......)))))....(((((.......)))))))))))..
|
8,070 |
bpRNA_RFAM_8532
|
AAAAGAAUAUAACCACGUACUCAUAUAAGCCUAGAAAUAAGGUCGGGCGUUUCUACCAAAUACCGUAAAUAUUUGACUAUGAGUGGUCUAGUGUAAAUA
|
.................((((((((....((((.(.......)).))).........(((((........)))))..))))))))..............
|
8,071 |
bpRNA_RFAM_19368
|
GUUGUCUCCAUGGUUACCGUGGCAUUAGAUUGUUACUGUAGCAACUGCACCAGCGGUAACAGUCUACAGCCAUGGUCGCUAGGGGGCAA
|
................((.((((....((((((((((.................))))))))))....)))).))..............
|
8,072 |
bpRNA_SPR_491
|
GGGCGUGUGGCGUAGUCGGUAGCGCGCUCCCUUAGCAUGGGAGAGGUCUCCGGUUCGAUUCCGGACUCGUCCACCA
|
(((((.(..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))).)))))....
|
8,073 |
bpRNA_RFAM_37157
|
UAGGGGAAUGAAACAUCAUUAAGUGCCGCAGGGGUUAUAUCUGCUGACUUUGAAGGCGGCAUGAGGCCAUCUGAUUCACAUGAGGUUUCUCAGCUGAAUG
|
.........((((((((......................(((((((.......))))))).....................))))))))...........
|
8,074 |
bpRNA_RFAM_42491
|
GAAAAACUCGACGGUUCUUAUUGUGGUGGGACAGCGCAUGGGCAGGAUGGUGUAACCAUCCGGCGAUAGCCACCCAUGCGCUAGAUGACAGGCUCCCCAAGGAGCCUUUUUUUAUGCCCGAAA
|
......(.(................).)((((((((((((((..((((((.....)))))).((....))..))))))))))....(..(((((((....)))))))).......))))....
|
8,075 |
bpRNA_RFAM_35136
|
UGCGGUAGCGAGGGAAUUUUUUUGGUGUUACUAGUCGCCUAUUUAUCAUUGCGUUUGCGUAGUCAUUUCGCAGAUAAAGCAACGACGCAAC
|
.......(((................(((((..))))).........(((((((..(((.........))).....)))))))..)))...
|
8,076 |
bpRNA_RFAM_29105
|
CGCAGCAGCACGAGAGCGACCCAUUUGCUGGCAGACAAUCCAGUCUCAUUACAAGGCAAACGUGAUGGGGCUGUUUUCUGCGCUUAACCCCGUCUUCCAAUAAUUGGAAAAAUGCAGUGCAUUGCACUUGAUUGCACAACUCCUCGUCAGCGUUAGGGAACGGACUGCAUUGCUCGGGGCGAACAUCGUUCUCCUCGCGGUUCCGUAGUCCCG
|
..((((((((((.......)))))).))))(((((((....(((((((((((.........)))))))))))..)))))))..............................................................................(((((((((.......((((((((.....)))))))))))))).))).......
|
8,077 |
bpRNA_RFAM_22775
|
GGAGGUGUGUGUCAGUGAUGGCACAGCUGAACAUUGAUCGCUUUAGUUCAGUAGGCUGAUCUGCUCAGUAACGUGCGGUCACGUGGUCGAUCCAGCAACCAAUGGACUCUGACGAUGCCCUAGUCGCACGUCAGUCAUCCUCUGGUUUCUUGAACGUCCGCCAUUUCCAAAUUUGGGGGGUUACGGAUGGGUUUCAUUUAGAACACCUCCAAUAAUCGGCACUGCAGUUACGUAGUUCGCCAUUUUUUCA
|
.(((((((......(((((.......(((.(((..((((((((.........)))).))))))).))).........)))))........................................................................................................................)))))))........((((((((......)))))..))).........
|
8,078 |
bpRNA_RFAM_1946
|
GUCGGUGUCGUAUAUGGUUAUUACAGGCCUUGCCAAGGCUUAGACGGCAGUUCGAUCCUGCUCACCGGCU
|
.((((((..((((.......))))(((((.......)))))....(((((.......)))))))))))..
|
8,079 |
bpRNA_RFAM_33356
|
AGAGAACUGAUCAUUCUCUAUAGGGUAUGCCAGAAUAACAGAUGUGGUCAUGCACUCUGUAAUGGUGAAGUAAGUCAGGGGUGGUGCCCGCUGUGGAAGCACAGAACUCUAACCAAGAGGACUGAAAAGAAUGAGGAUCACUAUUACUACUAGUGAGACCAUCUUCAUUGAGGGUAUAGUAAAAUCCCUCUACCCACCC
|
.((((..........))))...(((((...........(((((.............)))....))....((.(((..(((.[[[[.)))...(((.....)))...((...]]]].).)))))..))....(((((((.....((((..[[.))))....)))))))..(((((...]]......))))))))).....
|
8,080 |
bpRNA_SRP_893
|
UGGGGCUCUGGUCCUCUCGCAACAAUAGCUCGUGAACUCGGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCCGCAGCGUGUGACUUGUGUGCCGGGAUGUGGCUGGGGUCCCACCCUUUAAA
|
(((((((((((((.((((((.((((..((.(((.....((((....(((....)))....))))..))).))...)))))...)))))...))))))))))))).........
|
8,081 |
bpRNA_RFAM_27371
|
GGCGGCGUCUACCUCAGCCCGCUGUUCGUCUAUGCCCUGCUGGCGCUGGCGGCCACCGCCGCGCUGCGGGUGCUGAUCCAGAAAACGCCGUUGCGUCGCUGGGUCUGGCACGAGGCGCUGUUCGACUGCGCCCUG
|
.((((((((((((((((((((((...............))))).))))).)).....))))))))))((.....(((.(((.........))).)))((((((((..(((........)))..))))))))))..
|
8,082 |
bpRNA_RFAM_25607
|
GCAGCGGCAAAAUCCGUUGCUGGGUUUAGCAGCCUGAGACAAAACAGAGCGCACAACCGCGCAGGCGGUUACUAU
|
.((((((......)))))).(((((......)))))..................((((((....)))))).....
|
8,083 |
bpRNA_RFAM_13105
|
UUAAAACAGCCUGUGGGUUGUUCCCACCCACAGGGCCCACUGGGCGCUAGUACACUGGUAUGCCUUACCUCGGUAUUACGGUACCGGUGUAUAUAGUACCCUUGUACGCCUGUUUUAUAU
|
.(((((((.(((((((((.......)))))))))(((.....)))((..((((...((((....................................))))...)))))).)))))))...
|
8,084 |
bpRNA_RFAM_37246
|
UGACAGCGAAGCAAUUUGCUGUGAUCGCAAUGCAGAAAUCAGCAGAGGGCAUAGUAAAUGAGACUCUUGCUCAUUGAAGGCC
|
.(.(((((((.....))))))))..............(((....)))(((......((((((.......))))))....)))
|
8,085 |
bpRNA_RFAM_18671
|
GCUACUUGAAGAAAGGUGGUCCUUCCUGUGGUUGCUUGAUUUGUAAUGAACGUAUAAGACUAAGCUCUCUCUGAGGAGC
|
.(((((.(..((((((((..(((((....(((((............)))))...)))))..))))))))))..))))..
|
8,086 |
bpRNA_RFAM_7943
|
UGGAGCAGAGGCUCUGGCAGCUUUUGCAGCGUUUAUAUAACAUGAAAUAUAUAUACGCAUUCCG
|
.(((..(((((((.....)))))))...((((.((((((........)))))).))))..))).
|
8,087 |
bpRNA_RFAM_37892
|
UCCAUCGUGAGGUGGAAUCUGAAGGAAGCCGCAGGCAAAGUUCUGAGCCGACGAACAGAAAUCGCAUACAAGGCGGGGCAGAGCGGACGAGACUGCAACACAAGUCAAAGUCCCAUACUACCCGGACUCUGCCACGUAAAUGCGGCGGCUACAUGGAAUGAAGGCUAUUGUA
|
.(((((....)))))............(((((..((...(((((((((((...........((((((.....(((.(((((((.((((..((((........))))...)))).............))))))).)))..)))))))))))...))))))....))..)))))
|
8,088 |
bpRNA_RFAM_40168
|
UGUGGACUAGUAUGGACUAUGCAAGGAAAACGCUUUGCCAAUACACAACAUUUUAAUGUCAGCAAUACCAACGGGGAGCAGGUGAUAAAAUUCAGGAAUUACAGAAGGAAAAAUGAUUGGUGCGUCUGAAUGGACUCGAACCAUCGACCCCCACCA
|
...................(((...((((......))))...)))................(((............)))......................................((((((...((.((((.......)))))).))))))...
|
8,089 |
bpRNA_RFAM_29009
|
UGGGGUGUGAGGAGUGCGGAACGUCUCUUCAGGGUCGAAACGAGGACAGACUCCCGAAGAUCGUUCCAACGU
|
..............(..(((((...((...((((((............))).)))...))..))))))....
|
8,090 |
bpRNA_RFAM_8626
|
AGAAAUCAAAUAAGAUGAAUUCGUAUAAUCGCGGGAAUAUGGCUCGCAAGUCUCUACCAAGCUACCGUAAAUGGCUUGACUACGUAAACAUUUCUUUCGU
|
.................((((((((...(((((((.......)))))))........(((((((.......)))))))..))))))))............
|
8,091 |
bpRNA_RFAM_20413
|
ACAGAGCGGGGCCGUCAAACCGUUACCAUUACUGAGUUUAGUAAUGGUAAGGGUUCCACGGCCUCUGCUCAAA
|
.....((((((((((..(((((((((((((((((....)))))))))))))))))..)))))))).)).....
|
8,092 |
bpRNA_RFAM_41697
|
AAGUAGAUGCACCCUGAUAUACGACCUCCACCGUCAUAGGUGGGGGUUUUUUUU
|
.(((......)))...........(((((((((..)).))))))).........
|
8,093 |
bpRNA_RFAM_2624
|
CGAGUUGGCCGGGCGACCGCGGCACAGGGAACCAGCACUUCAGUGCACAGGCCCUGAGUCGAGGAAAGUCCGGACUCCACAGAGCAGGGCGGUUGUUAACGGCAACCCGAGGUGACUCGCGGGACAGUGCCACAGAAAACAGACCGCCGAUGCCACAUCCUCCGGGGUGUGGCGUCGGUCAGGGUGAAACGGUGCGGUAAGAGCGCACCAGCACCCCGGGUGACCGGGGUGGCUAGGUAAACCCCGCCCGGAGCAAGGUUGAAGGCCGCACCGGUUCCUCCGGGAUCCCGGUGCGGCUGCGCAGGUGUUCGAGGGCUGCUCGCCCGAGCCUGCGGGUGAACCGCUCGAGGUACCCGGCGACGGUGUGCCCAGAUGGAUGGUCGCCACCCGGCGCUUCGGCGCCCGGGGACAGGAUCCGGCUUACACGCCAACUCGUUCG
|
.(((((((((([[[[[[[.(((((((((........................)))))))))....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((............(((((((((((................)))))))))..)).......((((((.......)))))).(((((((((....)))))))).)..)))..)))))))))))))...((((((((((.............................................(((((.]]]]))))).)))))).....))))......((((((((....))).))))).........]]]]]]].............................)))))))).).))))))))).....
|
8,094 |
bpRNA_RFAM_34442
|
UGAAGGUUCCCCUCUGGAACCUCCGGACGACGGUUCAGUACCCGGCACGCGACAAGACUGGCCA
|
.....(((((.....))))).............((.(((.................)))).)..
|
8,095 |
bpRNA_RFAM_4445
|
CGAUCUUCGGAUCACUUUGGUCAAAUUGAAACGAUACAGAGAAGAUUGUAAGUACCCCCCUAAGGUCGUGAGUUCGAGUUCCACUAACACCCGUCUAGAGCAUGGCCCCUGCACAAGGAUGACACUGCGACAUUGAGAGAAACCCAAUUUUUUU
|
.((((....)))).............................................................................................................................................
|
8,096 |
bpRNA_RFAM_12952
|
ACAGCAUCUCGUUAGGCGAGGCUCCUGUACAAACAUAGGCCACUGAUCUCACGACAUCCAGAGAUGCCCAAGAUCAGGACAGUUUUCAUCGGAUUAAGGUGUUAACCCAAGUGGCUUUCGCGUGAGCGAAUACGUUGUGCAGUGCUGAAGCUGGGACUCGGGGAAUGAAGU
|
....((((((((....((((((..((((((((......(((((((((((.....((((....))))....)))).....))((((..(((.......)))..))))....))))).(((........)))....)))))))).)).....))).)))....))))))....
|
8,097 |
bpRNA_RFAM_98
|
UUUGGCGACUAUGGCGGAGGGGUUCCACGCGUUCCCAUCUCGAACACGACCGUUAAGCCCUCCAGCGCCGAUGGUACUUGGACCGCAGGGUCCUGGGAGAGCAGGACGUUGCCAAGC
|
.((((((((....((.(((((...((..((((((.......))..))))..))....)))))..))(((.((..(.((....((....)).....)).).)).))).))))))))..
|
8,098 |
bpRNA_RFAM_3810
|
ACUUCCCCUAGCCGGAACGAAAAGUAGGUUUGGUAUCCCAGGUACUGAAAUGCUUUUGGCUUUGUGGUGGUGAUGUUGUGUUUGCAAAUGGUCUGGUAUGCCAGACAUAGUAGCUAAGCUACUGCUUUUUUUCACUUCCUGUACAUUUACCCUGUCUGUCCAUAGUGAUUUUAUGCAGCACCGUUAUUUUGGCGGUGCUUUUUUUU
|
.........((((..((....((((((.((((((((.....))))))))))))))))))))...........................((((((((....))))))))((((((...))))))...................(.(((........................)))).((((((((.......)))))))).......
|
8,099 |
bpRNA_RFAM_32120
|
CGGUGAUGUCUCCUUACCGUUAUCAACGGAGGCACUCGGCCAUGCCGUGGGUGGGGACGAUGACGGUCCUAUCACCUUAGACGCUCGUCGUCGAGGGUGUGGCGUGAGGGCGGGUUAGAUGCCCG
|
.[[[..(((((((..]]].........)))))))((((((((((((..((((((((...........)))..)))))..((((.....))))...)))))))).))))..(((((.....)))))
|
Subsets and Splits
No community queries yet
The top public SQL queries from the community will appear here once available.