Unnamed: 0
int64 0
10.6k
| sequence_id
stringlengths 11
16
| sequences
stringlengths 33
498
| dot_bracket
stringlengths 33
498
|
---|---|---|---|
8,500 |
bpRNA_RFAM_20487
|
GAAAUAGGUUCUUUUAGCAACCGGUUUUCUCUGUGAUCUACAGAAUGACAGCUAAUCGUCUGAGAUCAUCGUGAAAGCCAGUUGUUUUUAUGAACUCUU
|
........(((((..((((((.(((((((((.(((((((.(((((((.....)))...))))))))))).))))))))).))))))...))))).....
|
8,501 |
bpRNA_RFAM_11809
|
GGGAAAUGAGGAGUGGUUAUUUUCUCGCUUUUAUUAUGCGAGAAGAGCGUUUCGCUCCGCCUGUUACGACAAUUGAGCGCUCUCCUUUGUCUUACCAUCUGAUCCC
|
.(((.........(((.((....(((((.........))))).((((.((((........((((.......)))))).)).)))).......))))).....))).
|
8,502 |
bpRNA_RFAM_37898
|
UCUAUCGUGAGAUGGCUUCUGAAAGAAGUUGGCAGCAAACAUUUGGCUUGACGGACAAAAACUUCAUACAAGGUAUUUAAUCGUGGACAAGGUUACCAAACAGACCAAAGCCUCAUAGCUAUUCAGAACGGUUGGUGCAAAUAAAAUAAGUAUAAGAUGAAAAGACAAGAUC
|
.(((((....))))).............((((..((...(((((((((((...........((((((.....(((.((.((((.((((..((((........))))...))))...............)))))).)))..)))))))))))...)))))....))..)))))
|
8,503 |
bpRNA_RFAM_27547
|
ACUCAACACUAUUUUUUUUAAAAAAGGUGAGUCUGUAUGCUAGAGCGCGCCCUAAGGGGAUUUUCGAAUAUUCAGUUAGCCUUAAACUUGUAUAACAGGAGUUU
|
........................((((.....(((((....(((....(((.....))...)))....)))))....))))).....................
|
8,504 |
bpRNA_RFAM_28758
|
CGAUACCAGGUCAAAAAGGUCAUGAAUACGAUCCAAGCUCGCUUGCAGGAGAAUUCUAGAACUUGGAACCCGCCUAAAACAUGAGUAAGAAGCCAUGUUCGGAAGAUGAAUGAGCGGAUUACGAAUGUGUUCAGAAUGGCGAGAGAGCAAAGCACGUAGCAAUUCGGUAUCA
|
.((((((..((......(((((((((((.((((.(((....))))).)))))))))))))))..............((((((..((((...(((((...........)..)).))...))))..))))))...(((((((....((((...))))...))))))))))))).
|
8,505 |
bpRNA_RFAM_23007
|
CCGUCCGAGGGGCGCUGCAGCAGGUCGGUCGACACCGGUUUGUCAGGCUCGGAUGGGGCGUUAACCAUACGCAUCAACGGCGCCCAUUCGCA
|
.(((((((............((((((..........))))))......))))))).....................................
|
8,506 |
bpRNA_RFAM_34853
|
AAAUAUUAUAGAGAUGUUGAAGUAUAUUCUAUUAUUGGGCACCUUAUGGAUAUACUGAGUCAGUGGUGCAACCGGCUAUGAAUAUA
|
.((((((((((.(((......((((((((.......[[[[[[[....))))))))...)))...]]]]]..]]..)))))))))).
|
8,507 |
bpRNA_RFAM_35823
|
ACGACCUUACUUGAACAGGAUCUGUUCUAUAGGCUCGUACCGUUGCAUCCUUUACCAAUAAGGAGGCAAGCACUCAAGUCUGGUUGAUGCGACAUGACCUCUGGGCCAGAGCGUGAUUAACGGCCAGGAUGACUCCCGAUGCGGGCUCAUCCGACGGCUGUAGAGGAUCGUUCCUGCCUGGUUCACUCCAGUGCAGGGUGGCCCAGAGGUUGUCUGACAGACA
|
.((.(((.....((((((...))))))...))).).).....((((.((((((.....)))))).))))........(((((..............((((((((((((.((((......(((((((((((((((((......)))))))))))..)))))).......))))(((((.(((......))))).)))..)))))))))))).......))))).
|
8,508 |
bpRNA_RFAM_36088
|
GAGAGUAAGUCGUGCCGGUGGCGAUCGCGGACUUCAAAUCCGAUGAAAGGGCGGUUGACCGUUCUUUGGGGGGUUCGAUUCCCUCACUCUCUC
|
.(((((..(((((.(....))))))((((((.......)))))).(((((............)))))..((((.......))))..)))))..
|
8,509 |
bpRNA_RFAM_37515
|
GGGGGACGGCCCCGCGAAGUCGGCUUGCAGGAGCAGGCUUCAAACCGCCACAAGCUGCGCGGGUAGGGUUGAGUCGCAAGCAACGCCAGACGUCAUGG
|
.((((.....)))).((((((.((((....)))).))))))...((.((((((((.(()).)).....)))))).....(.............)..))
|
8,510 |
bpRNA_RFAM_11290
|
GGUCUCUCAGCUCCGCUUAACCACACGGGUCCAGUGUGUGCUUGGCGUGUUUUCAGGGAGGCAGAGAAAGGCUCUCCUAAUGCACGACAGACCCGCCCAGAAUGGCCUCUCUGUUCCUAGGAGUGCGACAAUU
|
.(((((((..(((((...((((((((.........))))))))..........))))).)))))))........(((((.((......(((.(((((......))))).)))...))).))))..........
|
8,511 |
bpRNA_RFAM_36775
|
GCAAUGAAAUGGAACAGCAUGGAGCUUCAGCAAGGGUGCUUGACUUUAUAACCCGGCUUAAAUUAAUCGUGGUUGUAGAGUCAUGCACCUCUGCUGGCUCUCCUGCUUGGACAUUAUACUUGU
|
....................((((..(((....((((((.(((((((((.(((.................))).))))))))).))))))....)))..))))....................
|
8,512 |
bpRNA_RFAM_11058
|
GCUCCUGAUUGUCCAAACGCAAUUCUCGAGUCUAUGGCUCUGGCCGAGAGUUGAGUCUGGACGUCCCGAGCC
|
.........((((((..(((((((((((................)))))))))))..)))))).........
|
8,513 |
bpRNA_CRW_40121
|
UAGAUCCGUAGCUCAGCCUGGUUAGAGCACUACACUGAUAAUGUAGGGGUCACCAGUUCAAAUCUGGUCGGGUCUA
|
.(((((((..((((..........))))((((((.......))))))....(((((.......)))))))))))).
|
8,514 |
bpRNA_RFAM_7570
|
CGGCGUAGCGCUAGACUCUGCCGCCUUUCGGCGCCUAUGAGCCUGGCGCCACCCGUUUUGUGAAUCGGAGAUAUUCGGAUGGCCCGUAUUGCAGGCGUUAACAUCCCGGAA
|
...((((((((((..........[[[..[[[[....{{{....)))))))))).............................]]]]......]]]............}}}.
|
8,515 |
bpRNA_CRW_31193
|
AGCCCAGUAGUGUAGUGGCCAAUCAUCCGUGCCUUUGGAGCAUGGGACCGCGGUUCGAAUCCGCGCUGGGCUACCA
|
(((((((..((((.........))))((((((.......))))))...(((((.......))))))))))))....
|
8,516 |
bpRNA_RFAM_37258
|
CGUCCUGCAUGGCAACAUGCAGGAUGAUCAGGCAGGAGUCAGCCGAGGCCAUAGUAGUUCCGGGCAACGGAACGAAGGGC
|
.(.((((((((....)))))))).)............(((....)))(((......((((((.....))))))....)))
|
8,517 |
bpRNA_RFAM_29947
|
CAUUAGCCCCGAUUGAAGAGGAAAUUAUUUUGCUUUUUUCUUUAAAAAAGCAAAAUGAUUGCAACGAAAAGCGGGAACUAUU
|
........(((.((...((...((((..((..((((((.....))).)))...)).))))...))...)).)))........
|
8,518 |
bpRNA_tmRNA_133
|
GGGGGCGAAAAGGUCUCGACGGCGAGUCGGAGCCUUGAGCUGCAGGCAGGGUUGGCUGCCACACCUUAAAAAGGGUAGCAAGGCAAAAAUAAAUGCCGAACCAGAAUUUGCACUAGCUGCUUAAUGUAAGCAGCCGCUCUCCAAACUGAGGCUGCAUAAGUUUGGAAGAGCGUCAACCCAUGCAGCGGCUCUUAAGCAGUGGCACCAGCUGUUUAAGGGUGAAAAGAGUGGUGCUGGGCAGUGCGGUUGGGCUUCCUGGGCUGCACUGUCGAGACUUCACAGGAGGGCUAAGCCUGUAGACGCGAAAGGUGGCGGCUCGUCGGACGCGGGUUCGAUUCCCGCCGCCUCCACCA
|
(((((((............((((((((((..(((((..((..((((([[[....((((((...]]].......))))))....................................((((((((...))))))))((((((.((((((.(.[[[[[.).))))))..))))))............]]]]][.[......[.(((((((......]......].].....))))))).[[[[[.....[...((((.((].......]]]]]...........)).))))...))))).....))..)))))..))))))))))...(((((.......))))))))))))....
|
8,519 |
bpRNA_RFAM_24939
|
UUUACUGAAUUAAACGUAUCAGAGAACUGAAUGCCAUUGCCAUGGCAUGACAGACACGAAUACACUCAUAGAAUAUGAGCAUA
|
..((.((........................................................................))))
|
8,520 |
bpRNA_RFAM_38462
|
AGAAACCUGCCGAGGUAAAAGUCAGAAACCUUGUAGCUAGGAUAGCAGGGUUAAAGGAAACUGAGAUUCUGGAGUCUAUCGACAAUAUUAUCCAAGGGAUGAUAGCGAGUUGCCAGGCCGUAGCGAAAGCGAACGCAUAGGUGGCCUCGAAAGUGCGUAGUCCCGAAGGCUGAGCCCGCAACCGUAGGGUGAAAGCAGCAUGGACAGUUGAAAACUGACUGAUACAACUGUUCCACUUCGGCGGGGUGGUAGCGAC
|
...........(((((........)..))))....((..((((((((((.((((((....)))))).)))...))).))))..)).......................................................(..((((((.............(((((.(((..((((.........))))...)))....((((((((((..............)))))).)))).)))))))))))...).....
|
8,521 |
bpRNA_CRW_35363
|
GUGACGGUAGUUCAGUUGGUAGAGCUCCAGGCUGUGAUCUUGGUAGUCACGGGUUCGAUCCCCGUCCGUCACCCCA
|
(((((((..((((........))))((((((.......))))))....(((((.......))))))))))))....
|
8,522 |
bpRNA_RFAM_38297
|
GAGAACUGACAAUCUGAUAGGUAGAAUGAUGGGGUAACGCCUUGAAAUGCCUACACUGAUACUCCGAUUGGCAAUGAAUAUUAGACUAUUUCAUUGUCAAAAGCUCGGUGAAGUCGGCAGAGAGUAGCCGUAAGACUGAUAUUAACAUCAGACACGAAAGCUGUUCAGAGGUGGACGGUGCUACCUAUAUGCCGGGUGUCGAAUAC
|
.................((((((......(((((.....)))))...)))))).........((((((((((.(((((............)))).)))))....))))))...((((((...(((((((((......................)))...((((((((....))))))))))))))....))))))...........
|
8,523 |
bpRNA_RFAM_6247
|
GUGCGGCCUGAAAAACAGUGCAGUGCCCUUGUAACUCAUCAUAAUAAUUUACGGCGCAGCCAAGAUUUCCCUGGUGUUGGCGCAGUAUUCGCGCACCCCGGUCUAGCC
|
...................((((((((.........................))))))))............(((....((((.......)))))))...........
|
8,524 |
bpRNA_RFAM_6616
|
UCCUAAUGAAGAAAACCAGCACCUGUCUUACUCCUUGUCCUGGCCCCAGAGCCUGCAAAGGCGAACCCACUGGGGUCGGCUGGGGGAGAAGAUGAUAAUCUGUUCCAGCGGGAACAGUCUGAGGGAC
|
.(((......................................................................................................................)))..
|
8,525 |
bpRNA_RFAM_31799
|
AUGCGAUGAGUCGAAUAAUUCUACUUUUGUAGAAUUUCGAAGCUAAGGAGUGCUGGGAAAUUGAGUUUUCCGCGCAGGAAGCGUGAGCAUUUGUCAAAAUGUGUGAACCUUUUUGACACACUUUUAGUGCCUUAAAAAGCCCUUGUAAAAGGGCUUUUUU
|
...........(((((..((((((....))))))))))).....((((((((....................(((.....)))....))))((((((((...........))))))))((((...)))))))).....((((((.....)))))).....
|
8,526 |
bpRNA_RFAM_5786
|
AACAACCACUAGGGGUGCGUAAAGCUGAGAUUAACGACUGUUAGAUCCCUCUGACUCAAUCUAGGUAAUGCUAGCUGAUGGAAGUGGAAAUGAUAAUGG
|
.....(((((((((..(((().))).....((((((..))))))..))))....((((..((((......))))..))))..)))))............
|
8,527 |
bpRNA_RFAM_18781
|
CGGCCAGGGGAAUUCCUGGCAGAGUGAUUUUUGAGACUACAGGACUGAAUCACAUUGCCAGGGAUUUCCAAUGGCUG
|
..........(((((((((......(((((................)))))......)))))))))...........
|
8,528 |
bpRNA_RFAM_39873
|
AUUGUGACAUGUUAAACAAAAAAGCCCAACGGGUAUGCGCCGCCGGGCGUUAAUGACAGAG
|
.((((..........)))).....(((.(((((....).)))).)))..............
|
8,529 |
bpRNA_RFAM_159
|
GGGUGCGAUCAUACUAGCACUAAAGCACCGGAUCCUAUCAGAACUCCGCAGUUAAGCAUGCUUGGGCCAGAGUAGUACUAGGAUGGGGGAUCUCCUAGUAAGUCCUUGUUAGGUGGUCA
|
..(((((((....((.(((((...((..((((((......))..))))..))....)))))..))(((.((....(.((.....((....)).....)).)..)).))).).)))))).
|
8,530 |
bpRNA_RFAM_37993
|
UUUAUGCUUAGAUGAAAUAUGAAUGAAAUCUAUACAGAGUCUAGUCUGAGAGAUAGGAAUUAUAUAGAGUCUUACUAAUGAUGGAGAAGUUUGCUAAGCAAAACAAAGUCCAACACUAUCUAAAUCCUUAGGAAUAAAUAUAAGAGACAUAUGAUAUAAAGGUUAUAU
|
.(((((....)))))...............(..((...(((.((((((...........((((((....(((.(((((.((.((((..((((........))))...)))).............)).))))).)...)))))))))))...))).))....))...))
|
8,531 |
bpRNA_RFAM_14868
|
CCUCAUCAGCCGAGGUGGGAGGGCGGCCACAUGUGGCCGUUACCUCUUCAACUGGGCUGUGAAG
|
......((((((((((((....(((((.....))))).....)))))).....)))))).....
|
8,532 |
bpRNA_RFAM_2629
|
UAAGUAAAUCAGAUAGUCGCAGGCAUUUAUUUGCCUGAGGAAAGUCGGAGCUCCAUAGGGCAGGGUGCUGGAUAACAUCCAGUGGGGGUGACCCCAAGGAAAGUGCCACAGAAAGAAACCGCCGGAAAUGGAGACCAGAGCGGAGGACGGAAGUCGGAUGUCGGAAGACCGAUGUUUGAUUACGGAAGAAGGAAUUCCGGGUUCUGGUCUCCGUUUUCGGCAAGGGUGGAAAGGUGAGGUAAGAGCUCACCAGCAUUCAGGCGACUGAAUGGCUCGGCAAACCCCACCUGGAGCAAGACCGAAUAGGGGAACAAUGAGGCGGCCCGUCUCGUUCCCGGGUUAGGUCGCUUGAGGUAGCAGGUAACUGCUGUCCCAGAUAGAUGACUAUCUAAUACAGAACUCCGCUUAUAGAUUUACUUACUUU
|
.(((((((((([[[[[[[.((((((((()))))))))....(((.(((((((((...[[[[.((((((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((...........(((((((((((...................................................................................)))))))))..)).......((((((.......))))))..(((((((.....)))))).)..)))..)))))))))))))...((((......((((((...(((((.]]]])))))))))))......))))......((((((((....))))))))..........]]]]]]]..........)))))))).).))))))))).....
|
8,533 |
bpRNA_RFAM_31930
|
AUAAUCCUAGGCGAUGGAGUUCGCCAUAAACGCGCUGCUUAUCUUAUGACUCCUACCAGUAU
|
................(((((..........(...............)))))).........
|
8,534 |
bpRNA_RFAM_29691
|
GCACGUUGGGCCCCAUUCCGUGGGCUGCAGAUCGAUCCACGCCAAGCAACGGGGACGUGGA
|
...[[[[[..(((.........)))..........((((((((...]]]]].)).))))))
|
8,535 |
bpRNA_RFAM_7480
|
CUCAUUUUAUGAUGAAAAUCCAUUGUAUCCCAAUACAUAUUCGACUAGUCAUUGACGAUGCUGUCGUAACUUAUCACCAUCUUUCGACUGAUUAUAAG
|
.((((((....................................................................................)))))).
|
8,536 |
bpRNA_SPR_607
|
GGGCGUUUGGGGCAGUCGGUAGCCCGUGGGUCUCAUAAUCCCAAGGUCGCGAGUUCGAUCCUCGCAGUGCCCA
|
(((((((..((((........)))).((((.........)))).....(((((.......)))))))))))).
|
8,537 |
bpRNA_RFAM_11848
|
CUUGGGCUUCCGUGAUGAUUUACAAUCAUAAGCAUAGUUCAUCUGAAUUAUUCAUGAAGACAACUACGUAUUUUAUAGUCUUUCGCUCCCAUCUGAUUUUGCCCUUU
|
...(((((...........................................................................................)))))...
|
8,538 |
bpRNA_RFAM_17921
|
GCUGUACAGUGAUGACAACAUGGCUCCCUCUACUGAAAUCUGUUGAGGAAAACAACCAUAAAUGUUACCCUUUAUAUCUGAGUGUACAGC
|
.(((((..............................................................................))))).
|
8,539 |
bpRNA_RFAM_8500
|
CUUCGAAAAGAAUCACUGCCUCAUAUAAUCUUGGAGAUAAGGUCCAUAAGUUUCUACCUGGCAACCAUGAAUUGCUAGACUAUGAGGGGAAAAGUGUGUAAC
|
.................((((((((...(((((((.......)))))))........(((((((.......)))))))..))))))))..............
|
8,540 |
bpRNA_RFAM_27121
|
UAUGCCUUAAUAAAUGUUAACAAUAAUUCAUGAUGUAAAAAUGUUAUGAGGAUGUUUUUAUUAGAGGCUAAAAAAAAAUGUUUAUGCAAUGAUAAAACGAGUUAAGCAUUUUUUUUUAAGUUGCCGACUCACCUGACAUUGGAACAACCAAAAUUAUUGU
|
....................((((((((...........................................................................................................................)))))))).
|
8,541 |
bpRNA_RFAM_6908
|
AGAUUGAUCAUUAUUUCUACAUAGACAUUCCUUGGAAAUCUGAACAAAAUGAGUGAAAAAUCGCUAGCAUUUUGCUUAGAACUUUGUAACAU
|
.((((....................(((((.(((..........)))...)))))................................)))).
|
8,542 |
bpRNA_RFAM_22118
|
CGGCGGCCUCGUGCAGCACAAGCUCAGGCUGUGGUUUCAAGCUGGAGGGUGCUUUCGGGACUUCGGUGGGAAGCACCGCCAGGCUUGACCCACACAGCUUGGGACCAGUCAUCCGGGACUGCC
|
......(((((((...((....(((((((((((((((((((((.((.((.(((((((..........))))))).)))..).)))))))).))))))))))))..))....))))))))....
|
8,543 |
bpRNA_RFAM_35563
|
GGCAGAGUAGGUGGCUAUGCGUAAAUAGUGCUUAAGGAUGGGACGUUGCCUUAAGACGAAAUGCCUAUCAGGCUGCGGUAUAGCCACCGCGUCCGCUGUC
|
.((((....(((((((((((........(.(((((((...[[[[[[...))))))))....((((.....))))...)))))))))))]]]]]].)))).
|
8,544 |
bpRNA_RFAM_37244
|
CUACCGAAGUCGAGAGGCUUCGGGACGGGAGCGCAGAAGUCAGCAGAGGCCGUAGUAGCGAUCGAUGGAUCGUGAAGGGC
|
.(.((((((((....))))))))..)............(((....)))(((......((((((....))))))....)))
|
8,545 |
bpRNA_RFAM_42528
|
GUCCAGAAUGCGGCGGACCAGAGCCAGAGCCCUGCAAAGGUGAUGGCAGCAGCCGGCCAAUAGCGCGUCGUCAUGAUGGCGAGGCCGGCUGC
|
.(((..........))).....((((....((.....))....)))).((((((((((....(((((((......)))))))))))))))))
|
8,546 |
bpRNA_RFAM_22131
|
GUUAUGUGAAGGUAUUCUUGUGUUCUCUAGAUCAGUGCUUUUAGAAAAUUUGUGUGAUCUAAAGAACACAAAGAAUACCUACACAGAACCACCUGC
|
.(((((((((((((((((((((((((((((((((....................)))))))))))))))).)))))))))))))))))........
|
8,547 |
bpRNA_RFAM_23073
|
CAUUCACUAUUUUAAAUCUAACCUGUCAUGAUUUAAGCUAAUGAAUGUCCAUAACCAUGUCGUCUGCUGAGCUUGACUCCGGGCGAUAUGGCAUUUUU
|
.((((((((((((((((((.........))))))))))))))))))......((((((((((((((..(((.....))))))))))))))))).....
|
8,548 |
bpRNA_RFAM_12327
|
GAAUGAUAUGAUGAUUUAUUUUGUUUUCCUAUUGGUUUGAUUGCCGUGAUGAUGGCAUCAAUUGUGUAUUAGCUCUAUCUGAUCAUUC
|
.((((.................................(..((((........)))).)........................)))).
|
8,549 |
bpRNA_RFAM_781
|
AUACUUAACUGGCAAGGGAAAUAACAUGAUCAUUAAAGGUGGAUUUUUCAGGGUGAGGUUUGUCUCUUGCAUUGUGGAUGUGCUGACCCCUGUGGUUUUCUACAAAUGUGGGAAACUUAAUUGCAUAAUUUGUGGUAGUGGGGACUAUGUUGGUUCUCUCCCCU
|
...........((((((((((.(((((...........))))))))))).(((......(((.((..........)).)).).....)))..(((.((.((........))))...))).))))...............(((((...(....)))...)))...
|
8,550 |
bpRNA_RFAM_780
|
AUGUCUUCGUGGCGGGGGAGAGACGCUGUUGGUCCUGAUAAAGUGUUUUUCUUGGGGGAGGGUUUUUACUUUGUGUUUGGGAUGUGUUUGCUCCCGCGAUUUCCCCGAAUGAGAAAACUCGGCUGCAUAACUUGUGGUAGUGGGGGACUGCUUUUGCGCUUUUCUGUC
|
...........((((((((((.(((...((...........)))))))))))..(((......(((.((..........))..)).).....))).(((.((.((.....)).))...))).))))...............(((((.(((((....))))).))))).
|
8,551 |
bpRNA_RFAM_11749
|
UAUGGCAGAUGAUGAAUUGAUUACUUGUGCUUAAAUCACAGAAUAAUAGUGUUGACAAACAAUCUCCGCUUAUUAUCUGAUGCCAUG
|
..(((((.........................................................................)))))..
|
8,552 |
bpRNA_SPR_144
|
GGAGGCGUGGCAGAGUGGUUUAAUGCACCGGUCUUGAAAACCGGCAGUCGCUCCGGCGACUCAUAGGUUCAAAUCCUAUCGCCUCCGCCA
|
(((((((..(((...........))).(((((.......)))))..................(((((.......))))))))))))....
|
8,553 |
bpRNA_RFAM_31856
|
AAAUAUAAAGGGAAUGAGGUUCUCCCUAAGUAAUAAAAUUACUUAAACCGCUUAUGAAAGCUGAUGACUUCUGCGAGUAA
|
...............((((((............................((((....))))....)))))).........
|
8,554 |
bpRNA_SPR_117
|
GGGUAUAUAACUCAGUGGAUUAGAGUUUAUGGCUACGAACCAUAAAGUCGGGGGUUCGAAUCCCUCUAUACUCACCA
|
(((((((..((((.........))))((((((.......))))))....(((((.......))))))))))))....
|
8,555 |
bpRNA_RFAM_802
|
AAACUUACCUGGCGCCGGGUUCAGGGUGAUCAGGAAUGCUCUGACCCCGGGUGGAGGCUCACCAUUGCACUUCGGUGGGUUGAAACUCGCGACGAACCCUAAUUGGGUGCGCUCGGGCGUGUAGUUUUUGUCAGUGGGGAGGUCUUCGGAUCAUCCCUU
|
...........((((((((((.(((((..........))))))))))).(((......(((((..........)))).).....)))..(((.((.((......)).))...))).))))...............(((((.(((....))))))))...
|
8,556 |
bpRNA_RFAM_40175
|
AUGACAUAACUAUGUGUUUUAAAGACGGUUUGAUUUAAUUUUUUAUUGAUAAUUGGAUUAGUAACUAGGCGAAUAGAUGAAAUGCAGAAUAAGAAAUGGUACACCCGAGUGGACUCGAACCACCGACCCCUACCA
|
...................(((............)))..............(((.....)))..................................((((((...((.((((.......)))))).))))))...
|
8,557 |
bpRNA_RFAM_2066
|
GCGUCGGUUUAGCUCAGUGGUUACUUCUGGUCAUGUGUUUGCCUUCCCUCGGGCUCUUCUGGGGCCCUGAGUUCGACCACGGGCGCUGUCCGAUGCAUUU
|
.((((((....((((.((((....(.(((...........................................)))))))))))).....)))))).....
|
8,558 |
bpRNA_RFAM_24781
|
CACCAAAACUCUUUGUCAGGAUGUUUUUGCUUGUUUUUUCGAAAGGAAAGACCAUUCACAAAAUCGUCUGUUAAAGUUUUGGAAGAUUGAUACUGUUCGCCUUAUCCAUUCCAUCUUCGUUUUGAAGAUACUUUUUUGGAUAAUUUUAGAAAUUCCUUUCGUUUUGAAAGUUUUAUUUUUAAUCUUAAUUUUAGAGCAGGGAGGAUCAUUAGAGUUGAGCAUUAUUUUGUUGAAGUUUCAUCAAGAAGCUUCAAUCAUUUCGUAUAAUUUGCUCGUAGUAUUGAACCUCACAUUU
|
..(((((...........((((((((((.(((((......)))))..............))))))))))........)))))..........((((((...((((((((..(((((((.....))))))).....))))))))....(((((....(((((...)))))))....)))...............)))))).((((.((((......(((((..((((..(((((((.............)))))))........))))...))))).....)))).))))......
|
8,559 |
bpRNA_RFAM_9359
|
CGCAGAACAGUCAGGCAUGGUUCCCCGUGCCCGCGCCAAGCGCCCGGGGGAUCAAAUGGGAAUGUGGAACGGUCCGAUCCAAACCGGAGGACCAAAGCCUCAGCCGCCCCCGCGACUGUAUGCGGAGAGGGAGAUCGACAUGCCACUGGGGCCCGCCCCGGGAAGGCCGAUCCACCCCGAUGACCCGCGAGCCAGGAGACCAGCCAUGCGCGACACCCUUAGC
|
...............(((((((((........................))).....(((...(((((..............................)))))..(((....))).(((...((((......((((((....(((.((((((....))))))...)))))))))...........))))....)))....)))))))))...............
|
8,560 |
bpRNA_RFAM_17239
|
AAUGGAACCUGUAGAGAACCAACCACGUGGACAGCGGAGAACACCCCUUGUCCACACAUUGCAGUGUUCCUACAUAAACAUGGAGGUCUCUGUCUGACUUAGGACAGCCACAAAGUCAAAUUGUUCCCUCAAUACAGU
|
...(((.(((((.............(((((((....(((.......))))))))))....)))))..)))...........(((((...(.(((.(((((((........))))))).))).)...))))).......
|
8,561 |
bpRNA_RFAM_25971
|
UUGAUGCUUUGCAAACUUUAGUAGCCCGGGAGCUUCGCCUGGGUCACAUAGAGCCUUCGCUUAGUAGAUGGAACACUCCGGUGUUUGUAAUUCAGAAGAAAUCAGGGGCUUUUCGCUUGCUGCAUGACUUGCGCGCUGUCAAUUCUCAACUUAUACCCUUUGGUGUGGUGCAACAGGGAGCACCUGUGUUAUCUGCGGUGCCGGAGGAAUGGGAAGUAACGGCCAUUGACUUGAAGGAUUGUUUUUUCUCAAUACCUCUAGCUGAGCAGGAUAGAGAAGCUUUCGCUUUUAC
|
..........(((......(((((.............................((..((......))..)).................(((((((.......)))))))...)))))...)))....................((....(((((((.....(((((((.(((...((((((((.((....))..))))))))...))).))))))).(((((...........................))))).........)))))))...)).................
|
8,562 |
bpRNA_RFAM_26965
|
ACCGCGGGUUGCACCGUUGUGGAGCACAAACAUUCAUUGCACCAACGGCGGACUUGCCCUCGGGAGA
|
.(((((((......(((((..(((((...........)))))...)))))......)))))))....
|
8,563 |
bpRNA_RFAM_40153
|
CGUAUAAAAUGUUUACAGGCGCUGUUACGCUAGAGACUAAUGAGUUUCCGAGAUUUAAAUUUUUAGGAAAUAUAUUUGAAAAAUCACCAAAAAUUGUAUGAUUCAACUUAUUGGAGAAUGGUGGGCCCGGCAGGACUUGAACCUGCGACCACUCCG
|
.......................(((.......((((......))))....)))................(((.....))).....................................(.((((...((.((((.......)))))).)))))...
|
8,564 |
bpRNA_RFAM_37635
|
UCCUUCGCGAGGGGGAAUCUGAAGGAAGCCGGCGGUAAAUCUCUGGCCUGACGCACAGAAAUCGAAUGAGGCCGUUGGAUGUGGGUGAGUCUGCAUAACAAGACAAAGCCCUAAACUAUCCGAAACAUUCCGCGGUAGAUUCGACAGGUAUAUGGAGAGAAAGUUCACGUU
|
.(((((....)))))............(((((..((...(((((((((((...........(((((....(((.(.((((((((((..((((........))))...)))).............)))))).).)))..).)))))))))...))))))....))..)))))
|
8,565 |
bpRNA_RFAM_3723
|
UUGGAGUGGGACCUCCCAUCGAAUUCACCUCUUGCCUUUUACCAGAUGUGACCGUGGGAUUGGCCCAGCAGACUCCAUUUCAAUAAUCUUUGGCAUUACCUCAUCUGGAUGUUCC
|
..((((..((((((((((......((((((((...........))))))))...)))))).)))))......)))..................(.((((((.......)))))))
|
8,566 |
bpRNA_RFAM_15929
|
AGCUGUUCCCCUCUGGAGGUUCAAGAUCUCCACACUUCAUGGGCCGCGGUUUCCGACGGCCCAUUUUUUUAUCUUUC
|
.......((((...))))......................(((((((((....)))))))))...............
|
8,567 |
bpRNA_RFAM_38984
|
GAGGGUAGUUUAGUAUCGUGUCAUUCAAAAGAUGAUUUGGCUUGUGACGAGCCGCUACCUUCCACAUCCGUAAACCAAACCUUAAUUGUUAAUUCUGGUUUAACAACUAUUAAUUAAAAUCAAGGAAAAGUGCUCGUCAGUCGUUGGAAACAGGUGACUACUUAGUCUUGAGAUGUUCAUGACCGCGUCGGGUCCCAAGCCCUACACGAUUUUCACGAAAGUUCUCUAACCCCGCAAGGGUUCAUCAGGGAGGCAUCCUUGAAGAGUGAUGAGUAAGGAGAGAGUAUUCAGCGACUUCACGAAUGGUUCAACGUAAUUGACCGUCACUGAGAGUUACUACUCAAAAGGUAGUGGAAACGGAGGGAAUCAAUAAUCCUUCUAAAGAUUCUCAUCAGAACUUGUAUUCUCAGAGU
|
.(((((((((((((..(((((((((.....)))))))))))))).........)))))))).............................................................................((((((((((................((((((.......))))))(((((.((((.....)))).)))))..(((((........((((.((((.....))))...(((.((......)).)))))))..........))))).....)))))))))).........(((.(.......)).))......((((((.((((((......)))))).....((((((.........)))))).....)))))).......(((.........))).
|
8,568 |
bpRNA_RFAM_21071
|
UAAUCAAUAAAUUUUUAUUUAGUUAUGACAAAUUCAUACCUGACUGCUCAGAAUCACCCGUUAUCACAAGCCCGACUACAUCAUUGAUAUUGAAAAACACAUGUAUAUUUUGAAAUUUUAAUUAAAA
|
...((((((.((...(((.(((((..............................................................................)))))..)))..))..)).))))..
|
8,569 |
bpRNA_RFAM_38365
|
AAAGAGCCCCACAAAGAAAGGAGUAGCGACCCACUUUGGCUGCGAGUCUUGCGCGAUGUCCGGCGACGGGCAUGGCGAAGCGUAGACAGCAGAAUCAGCGGGCUGGGCUAAUGAGCUUCGAAAAGUACCUCCCGGACGCCGACCUUGUUCAUAUAAGGGGAAGGCAACACGGUGCGUCUCGUAAAUCGCGAGAGGCGCGCCGGUCCGGCGUAGUCAGUGAACC
|
...........(((((...(((.......))).))))).((((..((((((((((.((((((....)))))).)))...))).)))).))))...................(..((((((...........(((((.(((..((((.........))))...)))....(((((((((((...........))))))))))).)))))))))))...).....
|
8,570 |
bpRNA_RFAM_25916
|
UGAAUGUUAGUCACAAAAAUUACCCAAACACGAGCACUGACUUGGAAAUACUAAAUGCGGUAAGUGCUACUUGUUGGGGUACUUUUACUGA
|
...........((((.(.(..(((((.(((..((((((.(((................))).))))))...))).)))))....)))))).
|
8,571 |
bpRNA_SRP_356
|
UGCUUCCUUAUAGACUUAUGCAAUAGGUUUGUGAGACAACGCUUCAGGGUGGGAACACAGCAGAGCAUCUCAUAAAUUUGUGUGCCAUAAGCACCUGUAAGGGAGUUAGAUUU
|
.((((((((((((.(((((((.((((((((((((((....((((....(((....)))....)))).)))))))))))))))...))))))...)))))))))))).......
|
8,572 |
bpRNA_RNP_426
|
CUCAAGCAAAGCGAUUGCAGAGCAACUAGAAGAUGCUCUGAGGAAAGUCCGGGCUCCCUAACUAUUCCAGCUGCUGGAUAAUUUCCAGUGUGAUAUAAUCACGAGGAAAGUGCCACAGAAAGAAACCAAUCAAAUCUCCAUCGAAUGGCUCACAAGCUCUAGGAGAUCUUGGAUUGGGUGCAAAUGUAUUCUUGACGUGAGUUAAGCGUCUGGUAUACCCCAGUCGGGAGCAAGAUGAGGUUAGUUUAUAGAGAAUAGACCAUAGACUAAUCUAUUCCAUUGCUCGAGAGGGUUCAUACAGAACUCUCCAAUCAGAUAAUCUCCACACCUCUCAGGACCAAGCUAGAAACCAGUUUGAGCCUCUCGAGAUUUGUACCGAACCCGGCUUAUUUCUUGAG
|
.(((((.((([[[[[[.((((((((((...)))))))))).....((.((((((((((...[[[[[[.((((((((((.....)))))((((((...))))).)((...(((((...........((((((((((((((.......((((....))))...)))))).)).))))))........(.(((((((((....)))))))))).)))..))))))))))))))...((((((((((((((((...]]]]]]...))))))))))))....))))......((((((((.....)))))))).........]]]]]].(((..(((((((..((((((.......))))))..)))...))))..))).......)))))))..))))))))
|
8,573 |
bpRNA_RFAM_8672
|
AGUGAAGAUAGAGGUGCGAACUUCAUCAGUAAAAGCUUGGAGAAGAAUGAGCUUCAAUGAAAAGCUUUGAAAGGGAACGUUCGCCGAAGUGAAGAAAAACUCAUUUUUUUCUUUGCUGGUCCUGCAUUUAAGAGAUGCCGGAUUGUCAAGGCGGUGCCGCCUUGGAGAGCUAUCUCACUG
|
.....((((((....(((((((((.......((((((((.....................))))))))......))).))))))...((((((((((((......))))))))))))(((((((((((.....))))))))))).(((((((......)))))))....)))))).....
|
8,574 |
bpRNA_RFAM_22139
|
AGACAUGCAACUCAAGAAUAUAUUGAGAGCUCAUCCAUAGUUGUCACUGUCUCAAAUCAGUGACAACUAUGGAUGAGCUCUUAAUAUAUCCCAGGC
|
.................(((((((((((((((((((((((((((((..............))))))))))))))))))))))))))))).......
|
8,575 |
bpRNA_RFAM_39808
|
UUGUCUCUAUGGGGACGCAUCAAAUAAUAAAUCAGUUUUAGAAUAAAAGGCGCAGCGUUCUGCGCCUUUUUU
|
.(((.((....))...))).........................(((((((((((....)))))))))))..
|
8,576 |
bpRNA_RFAM_32178
|
GGUGGCCAGGGCGUUCACGGCAGUCGAUCAACGAAUACUGUUCGCGAGCACUCCCAGCCACC
|
.(((((......((((((((((((((.....))...))))).))))))).......))))).
|
8,577 |
bpRNA_RFAM_21289
|
CUUCUUGUCAAGAUCUCUCUCUGUGACCUGCGUGAGAUUUAUCAUAUAUGAAAACCGCAUCACAGUCUGAGUUCUUGCUGAGCGG
|
.((((((.(((((((((...((((((..((.((....................))))..))))))...))))))))).)))))).
|
8,578 |
bpRNA_RFAM_42467
|
UUGCCCUGCGGAAUGCUCGGGUCCGCCGCAUCUCCUGGGCCCGCAGGUCUGGUCGGCGGGCGAUGGCUCGGAAGGCCUCUCCGUCCCAUCGCCCGCCGAUUCCAGA
|
..((((((((.....((((((............))))))..)))))))).(((((((((((.............................))))))))))).....
|
8,579 |
bpRNA_RFAM_25622
|
GCACCUGCAAAUUCAGGUGCCGGGAUUAGCCUCCUGAUUGACUUCAUCGACGACACAAAGGCGCGUCUGCGCUUUUUUU
|
.((((((......)))))).(((((......)))))......................((((((....)))))).....
|
8,580 |
bpRNA_RFAM_24962
|
CGGAUGGGGAUGAAGCAAUAUUUAAAUAAUCCAACACUUGAUCUGAGACUUUAAUAGUCAAGUGAUGUUAACAUUAUCACUUCUGAAUCCGC
|
.(((...................................................................................)))..
|
8,581 |
bpRNA_RFAM_41493
|
CAUAAACAAAGACCUCCUAACUUUGUUUAGAAAUCCUAAAACUUUUUCAUAAUAAUCUCCAAAACACCGCUGUUCUAUUAUGACAGUGGUGUUU
|
...((((((((.........))))))))....................................(((((((((.........)))))))))...
|
8,582 |
bpRNA_RFAM_26863
|
GUCGAUCGGUCGCCGCGCCCAUCCGUCCCUCAAAGCGGCGAUCGGUUCUCAGGCAAGUCCUGCGGAGACGCGCCGCCUCCCCCAGGCGGCGCGUC
|
...(((((((((((((..................)))))))))))))...................((((((((((((.....))))))))))))
|
8,583 |
bpRNA_RFAM_20843
|
GGCAGAUACAGAAUGUGACUAGAAAGCAAUGAGUCUAGUAUUUGUGUGUGGUGCAUGGAAACCAGCCUCAUUACUUUAUAAUCACACUCUGCGUAGCA
|
.....(((((((((((((((((((((...((((((.((((.(((((.......))))).)))).))))))...)))))))))))))))))))))....
|
8,584 |
bpRNA_RFAM_18125
|
ACCGUCCUUCUCUUGGGGUGGCGCUACUGUCCGAUGAACGUUUAGUGAGGACAGUACUGCUAACGCUCAGGCAACACACUCGCACCUGCUAGGGCUCCGCCUUAACCGGGUGCAAUUUUUGGAACC
|
....(((((.....))))).((((.(((((((.....((.....))..))))))).)))).....................((((((..((((((...))))))...)))))).............
|
8,585 |
bpRNA_RFAM_34983
|
GAUCUCAGAGGUCAACAUUCGACGGCGCGAUGCGUUCUCGGGUGCUAUUUUG
|
...............(((((((..((((...))))..)))))))........
|
8,586 |
bpRNA_RFAM_13648
|
CAGCACUGUCUUUGAACCUGACGUGUCUUCUGUAGCUUCUCGGGCCAAGCCACAGUGCUAGAUUACGACCAGUCCUUGUUAUAGCUGGGGAACUUCAGUUCUGAACUGAAAUGCUCCUUUAAAAACAAGGCACAUCU
|
.(((((((............................................)))))))...............((((((......(((.(..(((((.......)))))..).)))......))))))........
|
8,587 |
bpRNA_RFAM_36459
|
CAUGAAAUUUACCGUGAAUGCAGUUUUUACUUUCUUUUUUAUUCACUUCCCCUGAGGAGGCGGAUUUUCUGUGUAAAAACGAAAGUGAAAAUUCAAAGCCUCCCACCACCGGGAGGCUUUUUUGUU
|
.................(.....((((((((((((((.((((.....((((.....))))(.((...)))..)))).))))))))))))))..)((((((((((......))))))))))......
|
8,588 |
bpRNA_RFAM_7193
|
AUAUUAAACUCUAAAUUACACACACAUAUCGGCACAUGGUGCGGGGUGCUUGGAUUGCUUAAAUGCAAUGCGGGUCGCAACAUGGGAUAUGUGGAGGCAUAAC
|
......................((((((((....(((((((((....(((((..................)))))))))))))).))))))))..........
|
8,589 |
bpRNA_RFAM_17609
|
CUCCUGUCUCAUGAUGAUCCCCACUGCCCUGAGCUGUUGUGAUGCAGGCUUCAAAGUAAACGCUCUGAAGCAAUGGAGCAAGGC
|
.((((.((((.................................................................)))).))))
|
8,590 |
bpRNA_RFAM_17597
|
GUGGUUGCCAUGAAUAUUGGCUGCAUUUGUGAGCAAUACAAUGCAGCCCUAUGCGGCCACAUACAUUAACAAGACUGGAUCCUGCCGACAGCGUCUGCCUAGAUAUCAGAUUCCUGUGCGAUGGUUCCAGACAUU
|
.(((.((((..((((......((((((............))))))))))..)))).)))...............((((..((...((((((((((((((....)).))))).))))).))..))..)))).....
|
8,591 |
bpRNA_RFAM_17236
|
AAUGGAACCUGCAGUCGUCCCCCCGGGUGGGCAAAUGCAGAGCUGUCUUUUGUCCCCCAAUUGCAGUGGUCCUACAGAAACACGGAGGUCUCUGUCGGACUUACAGCAGCUGCUGAGCCCGAUCGUUCCCCUCCACACAGG
|
...(((.(((((.............(((((((....(((.......)))..)))))))....)))))..))).............(((...(.(((.(((((((..........))))).))).)....))))).......
|
8,592 |
bpRNA_RFAM_18209
|
GUGUUGUAUGAAAGGAGAGAAGGUUAGCACUCCCCUUGACAAGGAUGGAAGAGGUCCUAGUGGCCUUCAACACACAUAUGGUUAAGGCAUUGCCACCUACUUCGUGGCAUCUCUAACCAAGUUUUUUAU
|
.....................................................((((....)))).............((((........((((((.......))))))......))))..........
|
8,593 |
bpRNA_SPR_514
|
GGGAGUUUGGCCGAGUGGUUUAAGGCGUCAGAUUUAGGCUCUGAUAUCUUCGGAUGCAAGGGUUCGAAUCCCUUAGCUCUCACCA
|
(((((((..(((...........)))((((((.......))))))............(((((.......))))))))))))....
|
8,594 |
bpRNA_RFAM_4795
|
GUGUGUUUAUGAAGAGCACUAACAAAAGAGUAAUUGACUCAGUUGGUGUUCAGAUGCUCUCAC
|
.((((........((((((((((.....(((.....)))..)))))))))).......)))).
|
8,595 |
bpRNA_RFAM_33609
|
AGGGCGGUAUCCGGGCGCGGAACCGCACCGUAAAAAAGCGUUUUUUUGACAACCUGGUAUUUUUUGGAACCGCUUGGAGCCGGAAGGACCGAGACGGGAGG
|
.(((((((.((........))))))).))........................................((((((((.(((....)))))))).)))....
|
8,596 |
bpRNA_RFAM_11857
|
AAGAAGCCCUGAUGACCAACCAAUGCAUAGUUCACACUGAAUGCAAUUUGUGAAGAUACCAACGAUUUUAGUCUUUCGCUCCUAUCUGACUGGCUUUCU
|
...(((((...................................................................................)))))...
|
8,597 |
bpRNA_RFAM_24192
|
GAGCGGUGAUGAAUGCACGUAUUGCUCUGACACCUCUUAUGUUAGCGGUAAAUUUCCGUGCCGCGAUGAGUCCACUAGGAUCUCUGAGCUC
|
.(((...................................................................................))).
|
8,598 |
bpRNA_RFAM_14410
|
UUUAAAGUUUUAUAGGGUUCCGCAGUUUGAAAUUGAUAAUUGGUCUGGUCCAAGAUAAAACGCACAGUUUGCUGUGUUCACGGAAGGAUAAAAGCCUGGGAGAU
|
......(((((((.........((((((........))))))............))))))).(((((....)))))............................
|
8,599 |
bpRNA_CRW_39119
|
GGCCUGUAGCUCAGCUGGUUAGAGCACCGUGUUGAUAACGCGGGGGUCGGCAGCUCAAGUCUGCCCAGGCCUACCAA
|
((((((..((((.........))))((((((.......))))))....(((((.......)))))))))))......
|
Subsets and Splits
No community queries yet
The top public SQL queries from the community will appear here once available.