Unnamed: 0
int64
0
10.6k
sequence_id
stringlengths
11
16
sequences
stringlengths
33
498
dot_bracket
stringlengths
33
498
9,200
bpRNA_RFAM_20614
AAAAUUAAAAAUUAGACUUUCUCUUCCUGGUUCCUAGCAGAGUCAGGAAAAGCUUUGUUGAGAGGGCGGGGUGAAAAAAACU
.................((((((..(((((((.((((((....)))))).)))))))..)))))).................
9,201
bpRNA_CRW_31070
UGAGAUAUAGCCAAGUGGUAAGGUAUUGGUUUUUGAUACCAAAUAUCCUAGGUUCGAUUCCUAGUAUCUCAG
(((((((..((((.......))))((((((.......))))))....(((((.......)))))))))))).
9,202
bpRNA_SRP_286
GCUCGGAUAUUUUACGAAUAUCUGUGACCAUAAGGUUUGGGAGCUUAAAAAUUGGAAUUGGUGUUUUGAGAAGUAGAUGUGUUUGAGACUACCUCGAUCCAUAUCUUCGUUCAUCACUGCGAGUUUUUCGGAAGAGAGGCUUUUGGGGAUGGUAAGGAACAGGGUAAUGCGUCAGGCCGGCAACGGAGCAGCGAAAACCUGUCGACGAAUGAUAGACCUGGAACGAAAUGGAUGUCAAGUGUUUACCAAUCAAAAUGCUGGGACUGAUUUU
((((((((((((...))))))))....(((.(...).)))))))...((((((((..((((((((((((...(((((((..(((..(((.....(..(((((((.((((((((((.(((.(((((((((....))))))))).))).)))).(...).(((((....(.(((....(((....)))....))).)..))))).))))))..)))....)))).......)...)))))))))))))...))))))))))))..))))))))
9,203
bpRNA_RFAM_34845
AGGCACCUCGGAGGCGACGAAGCCUGUCCUGCAAUCUGGGCGCCUGGGACAGGUGGAGCCAGUGGCGCAACCGGCCGAGGGCGGG
.((((((((((.(((......((((((((........[[[[[[[..))))))))...)))...]]]]]..]]..)))))))))).
9,204
bpRNA_RFAM_16515
AUUGAUUACGUCCAUCACUAAAACUAUAGCAAUGAGAUUUUCAUAAAUCAAUAAAUUGUUGUAGUAUUCUAAAUGGACUACAACAAACUGAUAAACUACUCCUCUUAAGGAUAUCGUCUCGAAGAUAUAACCUUAAUAAAGUUCAAAAAUCAACAAAAUCAUCAU
.........((((((.......((((((((((((...................)))))))))))).......))))))...........((((...........((((((.(((..........)))...))))))...........))))..............
9,205
bpRNA_tmRNA_596
GGGGCUGACCGGUUUUGACAGCGGGCAGAAGUGGUUUGUAAGCAUGCAGUGCGUCGUUGGCCGGCACUUUAAUCUCGGUUGAUCCAAUUUUAACUGGCGAAAAUAACUACGCUCUCGCUGCUUAAUCGAAGCACAGUAGAUUGAAGCUUAAUCCUUACACAAGGUGUUUGGACGAGACAUCACCCGGAAGCCGUGGCUUCGAGGCAAUCCGAACCGGUGGUGCAGAAAUGUCGGAGAUAGCUUGACGGAUGUCCCGUACGGCAAGUGAAAAUUCAGGGAAUAAGGUUGCGGUGGGUGGCUUCGGUCUUGCCGCAGCACGAAAAUGAAGGCGAAGAUAAGCAUGUAGAAAGCAAAUUAGUUCCUCGUUUGGACGAGAGUUCGAAUCUCUCCAGCUCCACAU
(((((((...........(((..((..(((.((((((((...((((([[[[[...(((((((.]]]]]........))))))).............................(((((..((((((((.(.......).))))).)))....(((..((((...))))..))))))))((((((.((((.(((....[[[[[[)))..)))).....))))))........]]]]]]...(((((.((.((.[[[[)).)).))))).........]]]].(...(((((((((((...[[[[[..)))))))))))...).........]]]]]....)))))......)))))))).))).))..)))...(((((.......))))))))))))....
9,206
bpRNA_RFAM_36392
AUGGGGCCAGGGAGGGUGGGGGAUCUCGCCAAUCCCUGUGACCCGCAAGGCGUAAUGCGGGCACCAGUAACUCCUACCCCAUGGUGUCUCCUAUCUGUAGGUCCCAGUGGAGCUAUGAAGGCUGCCCAGCGGGGCUUGGCGGUCAUGGGCUUCCUCUCCGGAGGGAGGGGAAGUACCACGAUAGCUGGGGGAAUCGGCGAGGCCCGGAAGGGAGCAGCCGUGCCCGGACGCCAGCGUUCGCUGGUCAACAGCCAGAGUGAAACUGGGGCAAGCCUAUAGAUAGGUAGGCCAUGGAGUAGGGGGUCUGGCCCCAU
.((((((((....((((((((((((.....)))))))....((((((.......).))))))))))..(((((((((((((((.(((..(((((((((((((((((((((((((((.(..(((((((((((((((((.(((((((((((((((((((((....))))))))))).)))))))..((((.((....(((....(((....)))....))))).)).)).)))).)))).))))))...))))))))))))))))))))))...).)))))))))).))).)))))))))))))))))))))))).
9,207
bpRNA_RFAM_858
UAAAUUACAAUGUUGUAGUUAGCUAUAUAUCAAAAAAUAUAGCAACUAAGGUGGAGCAAGUCAUUGUACUAAAGAUGUUUGUAAUACCUUGAUGUUCCCGCUGGGAGCAAUAACAACAAAAUUUCUGAUUGGAAAUAGUCAUUAAACUAACUGGCUAUUUC
...........((((((((((.(((((..........)))))))))))(((.....(((.((...........))..)).).....)))....((.((....)).))......))))...............(((((.(((((......))))).))))).
9,208
bpRNA_RFAM_34819
GAAUCCAUUUAAUUCAAUCACAGGUUGACCGUGAAAUCCGUUUGGAGUCUAAUUGUUUUAUAGAAAAUGG
.............(((((.....)))))....(((.(((....))).)))....................
9,209
bpRNA_RFAM_29475
UAACGUUGAACCCUAUGAGGUUGCAAUAAAACCGACCAUGCAACGGGGGUCGGU
...[[[[[..((.......)).........(((((.(...]]]]]..)).))))
9,210
bpRNA_SPR_504
GGUGAAUAUAUUUCAAUGGUAGAAAAUACGCUUGUGGUGCGUUAAAUCUGAGUUCGAUUCUCAGUAUUCACCCCA
.(((((((..((((.......))))..((((.......)))).....(((((.......))))))))))))....
9,211
bpRNA_RFAM_889
CUCACCUCUCACAGGGCUUAGAUCAUGUGUAGUAUCUGUUCUAAAUAGAUUGACAUCUAUUUUUCCUUGCUCCGGCGAGGAUAUAAUUGUCAUACACUUUUUCCUUGCGGGAGAUCACCGUUCUGGUGCUUGCACCUCGGGAUCUCAUGGAUGUCCUUGGCCCUACACUUCCGCCUUGAGACGUCCGCCGUCC
.......((.(........)))....................((((((........)))))).(((((((....))))))).............................((((((((......(((((..)))))..))))))))..((((((.((((((...........))))))..)))))).......
9,212
bpRNA_RFAM_35720
AGCAACCACGAAGUUCAGGGCCUUAUGAAGACCCGAAGGACAAUUUUUGGAGGCCCCUCCGAGGAGGUGCG
.................(((.(((...))).)))...................((((((....))).))).
9,213
bpRNA_RFAM_29101
GACGGCCUUGGAAGAGCGAUCCGAGAGCCGGCAGAACCAAUGUCUCCCACGCGAGCGAUCGUGGGAGACAAAGUUCUGUGUAAAUGAAUUCUGAAGAGACUUGGUGCAAUUGCCAGCAAGUACUGGUUCGGACCGAGCUUGUUGAAGCAGACACUGCAUCGCUCGGGAAGAGCAAGCUCUUCUCGCAGUUCUGUAGUCCUU
..((((((((((.......)))))).))))(((((((...(((((((((((........)))))))))))..)))))))...................................................................(((((.(((((.......((((((((....)))))))))))))))))).......
9,214
bpRNA_RFAM_31284
UAUCAUCAUCAGGACGGGAGAAAUCCCACCAACCGAGCUUAGGCCACGGUGGUUUGUCAAGUGACAGAUGAGCAGCAAUGCUGAAAAUAUCUGAAACC
.....(((((....(.(((....)))).((..(((((([[.[))).))).))..............))))).((((...))))......].]].....
9,215
bpRNA_RFAM_31874
AAAGAAAAAGGGAAUGAAGUUCUCCCUCGAAGAGAUUCGAAACCGCUUAUUAAGCUGAUGACUUCUGUGCGAUG
................(((((.......................(((......))....)))))).........
9,216
bpRNA_RFAM_21061
UAAUCUUUCUGGGAUAGAUCCUCAUAUAGUUGUAGCAGACUCACACCUGAUCGUUCAGAAUCACACGUUAUCGUAAGCCCGACUAUUUUAUUGACACUAAAAAUCAGAGGACAACUACCUUAUAAACAAUAAUUUUUUAAGAUU
...((((((..(.((..((...(((.(((((..............................................................................)))))..)))..))..)).....)..)).))))..
9,217
bpRNA_RFAM_31190
UCCACGCAUUAAGACUUGGGAGACCAAGCCAACCUGCCGGUCCAGGCAAGGUGGUUACGAGAAAUCGGAUGUGAGCUAUUUCAAGCUAACAAAUGGACUCUC
.....(((((....(.(((....)))).((..(((((([[[[[[))).))).)).............))))).((((......))))......]]]]]]...
9,218
bpRNA_RFAM_5514
CAUCGCUUCAGGGCGGGGUGUAAUUCCCCACCGGUGGUAAAGUUAAUUUUUAUUGUUAAAUUAACAAGCCCACGAGCUUAAAUUAUGUAAUUUGAGCAGAUUUGGUGAAACUCCAAAGCCGACGGUAUAGUCCGGAUGAAAGAAGACGACG
..(((.(((......(((.......))).....((((................................))))...........................(((((.......))))).....(((......))).......))))).)...
9,219
bpRNA_RFAM_33760
AAGGAUAGGAAGAACUGACGGAUUCUGUGGAAUUGACCACGUGAACUUCCUAUUUCGAAAACAAGCCGACCGUCUGGGCAGGGAAA
..((((((((((..............((((......)))).....)))))))))).......(((((.........))))).....
9,220
bpRNA_RFAM_33165
CCAAAAAUAAAAAGAAUCGUCUGAAACGAGGAACAAACUAAAAUGUAAAUUUUAGUUGUUACCGAGUGGAAGAUGAUUACUUUUUACCCUAUGUGUAUACACACAUAG
.......(((((((((((((((...((..((((.((.(((((((....))))))))).)).))..))...)))))))).)))))))..((((((((....))))))))
9,221
bpRNA_RFAM_20856
GACUUGAAUAUAGUAUGAUUAUGAAAUAAUAAGACUAAUUUUGACAUGUGGUUUAUGUAAUUGGUUUCAUUACUUGAUAGCCACACUUGAGACUUUA
.....(((((((((((((((((((((...((((((.((((.(((((.......))))))))).))))))...)))))))))))))))))))))....
9,222
bpRNA_RFAM_22279
AGUGGAAUAGCUGGGUCAUAUGGUAACUUUAAAUUUUGAGUAACUGCCAAAAUGUUUCCCAAUGUGGCUGUACCAUUUUAUAUUCCCACUGGCAAU
......(((((((((.((.((((((((.(((((((.((((((.((....)).))))))..)))))))))).)))))..))....)))...))))))
9,223
bpRNA_RFAM_20327
GAUCCAAGUUUAUGCGAUUUUUGUACUACAAUUAGGUACUGGACACCAGCAGCGAGUGUAUCCAGAAUCUAUACUAGUACAAAAAUAGCUAACAGGAUUAAGAUUU
.............(((((((((((((((....(((((.((((...................)))).)))))...))))))))))))))).................
9,224
bpRNA_RFAM_7931
GUCUCUGAUGAUGAUUAAAAAUGAUUAACUUUCGUUCUUCUGAUGCGCUUUUCUCAUGGCGCGGUGCGGAAGCAAUCUGGAGACCUGAACUGAGGAGAC
..((((.......................................................................................))))..
9,225
bpRNA_CRW_34653
GAGGGUGUAGCUCAGUUGGUAGAGCGGGGGACUGUGGAUCCCCGUGUCGCGGGUUCGAGUCCCGUCACCCUCC
(((((((..((((........))))((((((.......))))))....(((((.......)))))))))))).
9,226
bpRNA_RFAM_14632
GUGCUCGGUUUGUAGGCAGUGUCAUUAGCUGAUUGUACUGUGGUGGUUACAAUCACUAACUCCACUGCCAUCAAAACAAGGCAC
.(.((((.(((((.((((((((.(((((.((((((..............))))))))))).)))))))).))))).)))))...
9,227
bpRNA_RFAM_25008
UUGCCCGAUGAUUAUAAAAAGAUGCGUUAAAAGGACUUAUGCUGGAUUCUUUUUUUUUCCCUUUUUUGUUUUUACUCUUUCUCUUACUUUUCUAUACUUUUUCUUUCUUUGAAUGUCCAGCGUCCUGUGAACGAAGAUUAUGAGAUAUGAGGGCAA
.(((((.........................((((((............................).)))))..............................................................................))))).
9,228
bpRNA_RFAM_11319
GGUGCAAAUGAUGAUUCUGUAUAGCGACCAAAGUCUGAGAAAGGCUGAUUUCUAUCUCAUUGUCUGAUGCACC
.(((((.............................................................))))).
9,229
bpRNA_RFAM_3103
AUUUCUCUGAGAUGUUCGUUAACGGGGAAAGUCCCCUGAGCCGAUAUUUCAUACAUUAUAGAAUGUGGUGCUCCGUAGUCUGGUGUGCAUGCUCGGUCCAGCCGAGAAGCCUUAAAGCUGCGACGCUGCGUUCACCUUGAACCGAGGGUUCAAGGGUUACUACCUGUAACGGCAUCUUGGAGAAUCU
.((((((((((((((.(((..............((.((((((..................(((.(((((.....(((((((.....((...(((((.....)))))..)).....))))))...))))).))).............)))))).)))............)))))))))))))))))..
9,230
bpRNA_RFAM_24383
GAGGAGUUGAUGAGAACUCUAAUCCAUUCUCUGAGCGAGAAGGAUGGCCGAAGCGGGUUCGCAUUUGAGGCAUUAAGGUAGACGACAGAGUUCUUCUGGAAACUACUGCCUCGCGCUGACGUC
..((.....................................................................................................................))
9,231
bpRNA_RFAM_16698
CAAAAGGGUGCUUGCUCUACGUUUAUAUGGCACACUUGGCAGAGUUUUAACAGACUUGGCCUGGUGAGGUAUGGUUAUCAAGACAUACCUAGCACAUAAUUUUUAACAACAGAAAGCUGUUGACUGCGAAUCCUUGUUCCGUCGGCGCUUUC
.......((((((((((..........)))))((((((((((((..........))))))))))))(((((((..........))))))))))))..................((((.(((((.((((.........)))))))))))))..
9,232
bpRNA_RFAM_20095
UUGCUCACAACCUUCCAAAGAAUUCUCCUUUUGGGCUUUUGAUUCUUAAUUUCAGCCCAAAGGUGAAUUUUUUGGGAUGUUUGAGCU
..((((..((((((((((((((((((((((((((((((..............)))))))))))))))))))))))))))))))))).
9,233
bpRNA_RFAM_41576
UGAAUGCGGGCAGUUUGGAAGCAGCAAUGGUCAUGGGCUCUUUGGUCUGCGGGUUGCGGCCCUGGCGUUCCGGGCGCUCGCGGACUUCAAAGGUGCCAAAGCCAACCAGCGAAACUUUGCCGCCGUUCUUCAGCUCUUCGGUGAU
......(..((((.((((.(((((((...................(((((((..((((......(((((...)))))...)))))))))))......((((..............)))).)))..))))))))))))..).....
9,234
bpRNA_RFAM_35123
GCAGGUGAAUGCAACGUCAAGCGAUGGGCGUUGUGCUCCAUAAUUGUCUUACUUUCUUAUAUUUAGAAUUACUGCAUAGCACAUUGAUUCAUACGAUGCCGGUUUAAUCACCGGCAUUU
.(((..((((((((((((........)))))))))))).....)))...................((((((.((((.))))...))))))........(((((.......)))))....
9,235
bpRNA_RFAM_993
AUACCUUCUCGGCCUUUUGGCUAUGAUCAAGUGUAGUAUCUGUUCUUAUCAGUGUGACAACUGAUAUGGAUCCUACGGGAUCCAAACUCUAGUCACAGAAAUUUUUAUACGGGAGAUAUAGAUCACUGAGCUUGCUCAUAUCAAUGUCGAAAUGUCGCCUCGUCCUUACACUACCGAUGAGAGUGGCAUGCCCUAC
......(((.((((....)))).)))....................((((((........)))))).(((((((..)))))))...............................((((((((....(((((..)))))..))))))))...((((((.((((((...........))))))..)))))).......
9,236
bpRNA_RFAM_9077
UCGCAAUUUUCAGGAGACGGUUCCGCCAUUGCGGCGGAUGAAAAGGGAACACGGUGAAGCCAUAGGGCUGAAACCGAGACUGCCCCCGCAACUGUAACCGGAGAGCUAUCCUCCACAGGCCGCGCAAGCGGCCAAAGCCACUGAAAGCAGCAAUAUGCUGCAAUCGGGAAGGCGGAGGCAAAGCGAAGACCCGGAAGUCAGGAGACCUGCCGUAUCCGGUCACCCAUGC
...............(((((((((...........))).....(((...(((((...................)))))..(((....))).(((...((((......((((((.......................(((.((((((...............))))))...))).))))))..........))))....)))....)))))))))...............
9,237
bpRNA_RFAM_13380
GACCUGUGGGUUGCCCAUUCGCUUGCAGAAACCAGUGAAUGUGGUGUCAAAAGGCAUCAAUUAAAUUCUUUGCAGCCAUUUCCGGCCCUUGAACUUGAUAUCUUUGAUGUAGGAACUGCAUGAGUUACAGUU
.((((((.((.((((((((((((..........)))))))).)))).))))))))...........((((((((((....((((((((..((........))...)).)))))))))))).)))).......
9,238
bpRNA_RFAM_1347
GGUUCUUUAACUUAACCGGUAAAGUGUGUUCUUGAUAAGGAUAUGUUCAGUGUUCGAGUCACUGAAGAAUCA
.((((((..((((........)))).(((((.......)))))....(((((.......)))))))))))..
9,239
bpRNA_RFAM_19569
UGCACACCGUGGUCAAAUGCUCAGGCUCCGUGGUAGUUGAUUAUGCACCACGGAUGUUUGAGCAUUUACAAUGGUGUCUA
...((((((((((...((((((((((.((((((((.(.......)))))))))..))))))))))..))))))))))...
9,240
bpRNA_RFAM_26742
UGCUUUUUUCGCCCAGGCGGAGCUCGACCGCGUUCUGAAGAAGUAAACGCUUACAUUGACCAAUAUCGGAGUAUCUAUGGGGUCGAGCCAGUCUGCAAGGUGUUGCAGGUUGCCCCU
...............(((((.......))))).............................................(((((......((.(((((((....))))))).)))))))
9,241
bpRNA_RFAM_42384
GUUGAGGGUGCGUGCUGCACAAUAUUAUUUAAGUUAAAAAGUAAAACCCCCGUUCCUUACCAGUUCGGGGGUUUUACUUU
.((((..(((((...)))))....)))...)......(((((((((((((((.............)))))))))))))))
9,242
bpRNA_SPR_609
GACUCCGUGGCCCAAUGGAUAAGGCGCUGGUCUACGAAACCAGAGAUUCUGGGUUCGAUCCCCAGCGGAGUCGCCA
(((((((..(((..........))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))))....
9,243
bpRNA_RFAM_30973
ACACAACAUGAAGAGUAACUGAAUUAGGUUCACCAACCUGCAAAUGUAAGGUGGUUUCCUCAAGGGCAUGUGACCGUAAGGUAAUAUACAUGCCUCCU
.....(((((......((((.......))))(((..(((((([[))).))).)))...........)))))..((.....)).........]....].
9,244
bpRNA_RFAM_38607
CCGACCGUUCCAUCGGUCGUUCCCUACCCGAACAUGCGAAGUUGGCAACGACUCCGUGUGGAGCUUCGGGGACAACGUAACCACCGGGUGACCGGUCCACCGAACCGUGAGGCGAAGUGGAAACUGCCAGCACAAAGGCGGUGAGGUGC
.((((((......))))))........(((((((((((((((((....))))))))))))....)))))............((((((....))))))(((....((....))...).))...((((((........)))))).......
9,245
bpRNA_RFAM_41236
GGAUUACCCCUUUGAGCUUUCGCGCUGUGUUGAUAAAGUUUCGCAUCUCUAUCAAAUCGGAUAAUCCCACCCGCAAGACUCUGCUGUCAGAUCAAGUCUGAACUACAGCAGAUAAAGUUCAUUAGUCUCACUUCUUGCUUAUUUAUUGUAAAUUUCUUAAUAUUUCCGCUCCGAUGGUAAUAUCAGUUG
.((((((.((...((((....))))..((((.(((.((........)).))))).)).))))))))..((....(...((.((..(((((((...))))).)).((((.(...........)))))..)).....)))..................((((...(((......)).))))).....))..
9,246
bpRNA_RFAM_31914
AUAAAUGAUGGGUAUGGUGCACACCCGAAACCGCUUUAAGAAUAAAAUCUUAAAACUAAUGGCGCCUACAAACAA
...............((((((...........((((................))))....)))))).........
9,247
bpRNA_RFAM_556
AUGAGCCCUCAUAUCAUGUGGAGUGCACCGGAUCUCAUCCGAACUCCGUAGUUAAGCCACAUAGAGCGCGUCUAGUACUGCCGUAGGGGACUAGGUGGGAAGCACGCGUGGGGCUCAUU
.((((((((....((.(((((...((..((((((......))..))))..))....)))))..))(((.((....(.((.....((....)).....)).)..)).)))))))))))..
9,248
bpRNA_CRW_29130
GGUCCGUUGGUCAAGGGGUUAAGACACCGCCUUUUCACAGCGGUAACACGGGUUCGAAUCCCGUACGGACUAUUUUUUGUU
(((((((..((((........))))((((((.......))))))...(((((.......))))))))))))..........
9,249
bpRNA_RFAM_19677
AGACGAAGGUGACCUGUGGCUGGGCCAGGGGCUGCAACACAGGACAUGGGAGCUGUCUCUCACUCCCGCUCGUGUCUUGUGUUGCAGCCAGUGGAACGGCUACACUGU
........................(((..((((.((((((((((((((((..................)))))))))))))))).))))..)))..............
9,250
bpRNA_RFAM_14311
GCUGGCACAAUGAUGACUUAAAUUACUUUUUGCCGUUUACCCAGCUGAGGGUGUCUUUGAAGAAAUAAUUUUAAGACUGAGAUGCCAGU
.((((((...........................................................................)))))).
9,251
bpRNA_RFAM_13480
UUGUGACACUCUGUGUCAGAUGAUUGAAGUUGUCUGAUGCAAUUUGAGCUUGCUAUAGCAAGAAAGUCUAACCUAUUCCAGUGUUCCCCUCCAUGAGACCAACUGUUAUACAGACUUAAACAUU
........(((((((.((((((........)))))).))))....)))...............(((((((...(((..((((..((((......))))...))))..)))))))))).......
9,252
bpRNA_RFAM_22374
UAGGAUGACCAACCAACCUGGUUUGCUUGGGACUGUGCAGGCUCCCAGGAUAGACAGUCCUAGGUAAACCAGGAUAAGUUGGUUACCCUAGGGCUGG
.((((((((((((((...((((((((((((((((((.(.(((......))).)))))))))))))))))))...)).))))))))))))........
9,253
bpRNA_RFAM_9305
UUAUCAUCCCCGUCCUCAGGUGCCCGCUGCCGCAAGGCAAAGGGAGAAUCGGGAAGGCGGUUGGAGUCCGCCGCGUGCCCAACGCUGUAAGGAAGAUGACCCCCGCUCAAUGCCACUGGCCGCCAAGGCCGGGAAGGCGCGGCGGGUCAGAUGAAUCCAAGCCAGAAGACCGGCCUGAACGUUCAUCGCGCUG
...............((((((.(((................))).....(((...(((((.......)))))..(((...))).(((...((((......((((((.....(((.((((((.....))))))...)))))))))..........))))....)))....)))))))))...............
9,254
bpRNA_RFAM_21390
UUAAUCCUGCCUCGACGAGUUGAGGUCGGUUGCAAGCUUCAAUACAUUUAUGAAAUUGAUAUUAAAGCUACCAACCGGCUUCAAAUCGAAAAGUGCGU
........(((((..(((.(((.(((((((((..(((((.(((((((........))).)))).)))))..))))))))).))).)))..).))))..
9,255
bpRNA_RFAM_20578
AAAUAAUACUUCUGGGCCGUCUCUUCCUGGUUCUUCCCAGAGUCAGGAAAACCUGGAUUGAAAGAGUGGUUUAAAAAAAAAAAAAA
.................((((((..(((((((.((((((....)))))).)))))))......)))))).................
9,256
bpRNA_RFAM_6628
CCCCAAUGAUGAAACCUUCACAUGUCCGACCAGCUGCCUGUUGCCAGAGCCUGAAAAGGUGAACCCACUGGCUCAACAGCUGGAGAGGAAGGAUGACUUGUUCCAGCUGGAACUGUCUGAGGGGG
.(((....................................................................................................................)))..
9,257
bpRNA_RFAM_13823
UCGCACAGCGAACACCCAAGUGUGCUCUCUAGUUCUCUUGGUCUAAAUUCUGUGCUAAAGCAAACGUUGUUCUUUUCCUCUGCAAUGAAAGGAGUCCUUUUCCUUUUAUAUGUAUUCAGAAGGACAGCACACGG
..((((((.(..((.(((((.(.(((....))).).)))))...))..))))))).((((((.....)))))).....(((((((((((((((.......))))))).))))....))))..............
9,258
bpRNA_RFAM_11367
GCGAUGAUGAUGUUUUUUGGUUUUGAGCAGCACUGAAAAAGAACUACCAAUUCCUCUAAGAAGUUCUGAGCUC
.(...................................................................)...
9,259
bpRNA_RFAM_9064
UAAAUAUAUAAUAUUAUAGGUUCUUCAAGCAAGAUUAAUAGGGAAAAAGGUUAAAUUCCUUUACAGCCCCCGCUACUGUGAUGCAGACGAAACUUUUGUUAGCCACUAUGAUGAUAUUUUUUAUAUCUCAUGGGAAGGAAGAGGAUUAGGAAGAAGCUAAGUCAGGAGACCUGCCUAAAAUAUUAAAGUAAUU
...............(((((((((.......))).....(((...(((((.......)))))..(((....)))..((...(((......((((((.....(((.((((((................))))))...)))))))))...........))....)))....)))))))))...............
9,260
bpRNA_CRW_31773
GCUCCUAUAGUGUAGCGGUUAUCACCUCGGACUCUGAAUCCGAUAACCCUGGUUCGAGUCCAGGUAGGAGUG
(((((((..((((........))))((((((.......))))))...(((((.......)))))))))))).
9,261
bpRNA_RFAM_43268
AGCAUGGUACGAAUGCUGGUCAGGAUUACAUCUUUCUUAAUGGCUAUCAUCCUGGCUAUUUAUUUGCCAUGCCACCCU
.((..(((((((....((((((((((..((((......))))......))))))))))........))))))..))).
9,262
bpRNA_RFAM_16491
UUUAUUCCAUAAUGAAUGAAUUGGCGGAAGAGUUCUUUAAAGACAAUAUUCGUGACCCAAGACUGACGAAUCCU
.((.......................(((...)))................................)).....
9,263
bpRNA_RFAM_10082
AGCAAAAUGAUGAAGUUGUUUUCUGUCUGAAUCUGGUGUGGAUUACAUAACAUAAACAUACAGGUCUUCAAAGUUCUCUGAUUGCU
.((((............................................................................)))).
9,264
bpRNA_RFAM_5795
AUAGUCUGCUGGGGGAGUUCUUGGGAACUGAGACGGGCAACGCCCGAACCCUUUGAACCUGAUCCGGUUUAUACCGGCGUAGGGAAGCGGCCAGAAACAAUC
.....(((((((((..(((((..))))).....((((((.))))))..)))).....((((..((((......))))..))))..)))))............
9,265
bpRNA_RFAM_2586
CCAGGGGGCCGGGCAGCCGCUCCUUCGACAAGCUCAGGAUGAGCGGGUUGUUAGGAGAGGAAAGUCCGGGCUCCACGAAGCAAGGGUGGCGGGUAACACCCGCCCGGUGACCCCGGAUUACGUCCGGGGGAGCCGAGGGACAGUGCCACAGAGAGCAGACCGCCUGAUCCGUCAGGCAAGGGUGAAAGGGUGCGGUAAGAGCGCACCGGGGGGCUGGCGACAGUCUCCGCAUGGCAAACCCCACCCGGAGCAAGGCCAAAUAGGGACCUCGCGCCGAAAGGCAGGAACGCUUCGUUCCGAGAGGUCCGGGUUGGCUGCUUGAGCGCGCGAGCAAUCGCUCGCCCAGAUGAAUGGCUGCCCCUGCAUCAGCAGGACAGAACCCGGCUUACAGGCCCCCUGGCACU
.(((((((((([[[[[[[.(((((((((....................)))))))))....(((.(((((((((....[[[[.((((((((((.....)))))(((((.......................)))).)((...(((((............((((((((....))))))..)).......((((((.......))))))(((((((((....)))))))).)..)))..)))))))))))))...((((......((((((..............(((((.]]]])))))...)))))).....))))......((((((((....))))))))..........]]]]]]]....................)))))))).).))))))))).....
9,266
bpRNA_CRW_19137
GUAUACGGCCAUACUAGGUUGGAAACACAUCAUCCCGUUCGAUCUGAUAAGUAAAUCGACCUCAGGCCUUCCAAGUACUCUGGUUGGAGACAACAGGGGAACAUAGGGUGCUGUAUACU
(((((((((....((((((((....(((((((............))))..)))...)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))).
9,267
bpRNA_RFAM_40836
CCUUGCAUCUUUUGCGACAGACUAUGUUUAUCUAUUAAGCAAAUAGUCUUACUAAUGAUGCUAUAGUAAAUAUCUCUAUCCGUAUCGGACCACUAAUAAAUAGAUGGUUUGAUUUAUUUGAGAUGAAAUCU
...((((.....))))..(((((..(((((.....)))))....)))))((((((((...))))))))..((((((.......((((((((..............))))))))......))))))......
9,268
bpRNA_RFAM_9390
GUAGCCUUGCCGCUUCGAGGUUCUCCGGCGUUGGCCGGAGCUAAGACGGGAACGCGGUCGAUGCCGCGGCUGCCCCCGCAACUGUAGGCACUGGAACGGAUCGGCACAGCCACUGCGCACGCGCGGGAAGGCGCCAUCCCGCUGGCAAUGCUGCCGGCACAGUGCGAGCCAGGAGACCUGCCUCGUGACGUUUUCGACUU
...............((((((.(((............))).....(.((...(((((......)))))..(((....))).(((...((((......((((((.....(((.((((((..))))))...))).))))))......................))))....)))....)))))))))...............
9,269
bpRNA_RFAM_2540
AUGAGUUAGCGUGGUGGUUGCGGGAGUCUGCCACUCCUGAGGAAAGUCCGGGCUUCCGAAAGACCAAGCUUGCUGGGUAACGCCCAGUGCGGGUGACCGCGAGGAAAGUGCCACAGAAAUAAACCGCCGAUGGAGGGAAACCUCACAGGCAAGGGUGCAACGGUGCGGUAAGAGCGCACCAGCAACAUCGAGAGAUGUUGGCUCGGUAAACCCCGGCUGGAAGCAAGGUGUGCUAGCGCUAAGGAACCAGGGUUGGUCUUUUCCCCAGUUCUUUGCUAGCCAGAGCCGCUAGAGGCACUUGGUAACAAGUGUCCCAGAUAGAUAACCACCCUUUGAACAGAACCCGGCUUACGUCUAACUCAUUCAU
.((((((((((.[[[[[[[.(((((((((.)))))))))....(((.(((((((((.....[[[[.(((.(((((((.....)))))(((((....)))).)((...(((((...........(((((..((((((....)))).)))))..)).......((((((.......))))))..(((((((.....)))))).)..)))..))))))))).))))...((((......((((((.............(((((.]]]]))))).)))))).....).)))......((((((((....))))))))..........]]]]]]]............)))))))).).))))))))).....
9,270
bpRNA_RFAM_9006
UAAGAAUCCGCAAGCGAUGGUGCCCUUUUAGGGCAUAAUAGGGAAUCCGGUUCAACGCCGGAGCUGUCCCCGCAACUGUAAGUGUGUACGAAAUGAGCAUCCACUGUAUAUGAACGCUGAAUAGGCGCAUAUAUGGGAAGGGCUCAGAGUAGGAUGAAGCACAAGCCAGGAGACCUGCCAUGCUUGUACGAGUUUCG
...............(((((((((.......))).....(((...(((((.......)))))..(((....))).(((...((((......((((((..(((.((((((.....................))))))...)))))))))..........))))....)))....)))))))))...............
9,271
bpRNA_RFAM_3013
GAGAUCGUACUUCUAGGGAUCAGUCCUAUAGUACGUAUCACCAGGACGUCAAACAAACUAGACCCUGGCUAACCCACCGCGAUGAUGAUCAGUGCGGCCUAGUCCUGAGCGUGAAGCAGGUGUGUGGCUGUCCGUCUAGCUGACUCCCUAUGGAGUUUGUCCGUGCGGACUUGGCCGCCUCCUUGU
.((((((((((..(((((.....))))).)))))).)))).......(((((......)))))...............((..............((((((((((((....(.......((((((((((((......))))).)))).).........))).....)))))))))))).......))
9,272
bpRNA_RFAM_35504
AGUAGAGUAGGUCUUAUACGUAAAGUGUCAUCGGAUGGGGAGACUUCCGGUGAACGAAGGGUUACCGCGUUAUAUGACCGCUUCCGCUACU
.((((.....(((((((((.....((.((((((((...[[[[[..))))))))))....(.....)...)))))))))).]]]]].)))..
9,273
bpRNA_RFAM_22958
UUAAGAAUAUAACUCCGAGCUAAAAGGCCUUCGGUUUCUGCAUGGAUCAUGGUCUGCAGCCGUUAGGGUUGUACUGGAAACGGUUCAGCCUUCCACCACUUGAAAAGGAGUCUGUAUGAAUGUCUCA
..((.(....((((((...(((.((((((...((((........))))..))))))).)).....(((((((((((....)))))))))))((........))...))))).)....).))......
9,274
bpRNA_RFAM_10983
AUAUGCCUGGCUCCCUGUAUGCCACUCGCGUAGCUGCCAAACUCAGUUGAAACAACUGCCUUCUCCCGGCGAGAUUCAGGCAUUGUGUUCGUACGUUUGGCUCUACUGCGGAUGGCGUGCGAGGAGCCAAGCAUGA
.(((((.(((((((.(((((((((..(((..............................................................................)))..))))))))).))))))).))))).
9,275
bpRNA_RFAM_5851
GUUUUCCACUAGGGGAGUCCUUGAUAAGGGCUGAGAUAAAAGUUUGACUUUUAGACCCUCAUAACCUGAACAGGUUCAAACCUGCGUAGGGAAGUGGCACGGUAUUUGA
.....(((((((((..(((((.....))))).....((((((.....))))))..)))).....((((..((((......))))..))))..)))))............
9,276
bpRNA_RFAM_16348
GAGCACUUGAUGAUAAACUACAACCUGAAACGUUGUUGUGGUCUAUUCUUGAACACGUCGAUGUUACCAUGGGAUGGUCGCACUUGCGAGGCAUUUGCCUGAUGCUAAU
..(((.................................................................................................)))....
9,277
bpRNA_RFAM_9296
CUACCAAGUCGCUGCAUCGGUUUCCGCAAGGAAUGAAAAGGGAAUCCAGCGCGCCCGAUGGGCGCGAAACGGAACUGCCCCCGCAACUGUAGGCGGCGAGCGCGAUCUGGCAGGCCACUGGGCACGAUGUCCGGGAAGGCAGGAUCCGCGCAACGACCCGCCAGUCAGGAGACCUGCCGGCGCGAAUUCACCAGAC
...............(((((((((......))).....(((.....(((....................).))..(((....))).(((...((((......((((((.....(((.((((((.....))))))...))).))))))..........))))....)))....)))))))))...............
9,278
bpRNA_RFAM_1846
CAGAAAAUAGUUUAGUGAGAAUGAUAGCUUUGGGAGCUGUUGGUGUAAGUAUAAAGUCUUGCUUUUCUGA
.((((((..((((.....)))).(((((.......)))))....(((((........)))))))))))..
9,279
bpRNA_RFAM_31880
UUGCGUGCUGGAGAUGGCAUUCUCCAAUGGGUGUCCGGCGUGCGCUUCAACACACGCGCUCGCGCGAACCCAUUAACCGCCUCGUGCUGAUGAUGCCUGCUUCCCC
................(((((.........................................................((......)....)))))).........
9,280
bpRNA_RFAM_16693
AAAAAGGUCGGGUCCAACCUCAUUGGACAGGAAUAAGCAAGCGGAUGGUUCAUUGCGAUCAGAGCCAAUGCAUAUUGACUUUGCUUUGCAGUACCUCACUUGACUCCCUGCGAUUUGGCAGCAUCAAUAACAAACCGCCCGAGUAAUUUUUAAUAUAGGAGGUGUUCUAACGGCCUGUAUUGUAUCUGC
.......((((((((((.....)))))((((((.(((.............................................................)))))).)))..(((((((.............)))))))))))).................(((((((((.((((.)))))))))))))..
9,281
bpRNA_RFAM_42538
UAGCUGGGUGUCGGCGAUGCCUUUGGCAUGCCGAUAGCCCAUAUUAUGGCGGCUGGCAUGGGCGGCAUUCGGACCACCGGAGAUCUGGUGGCCUGGAUGC
......(..(((((((.(((.....))))))))))..)..................................(((((.((....)).)))))........
9,282
bpRNA_RFAM_28983
AUAGAUGUGAGGAGUUGGGAUCCUCCAGCAGUGGAAACAAGGAAACACUCGCUUAAAGAUCCACUAA
..............(..(((((((...((((((............))).)))...))))))))....
9,283
bpRNA_RFAM_26495
CUUCCAACCCGCCAAACAUAUCACAUUUUUGGCAAAGCGAGCGAUAUUUUGGGUUAGAACGAAUGAGUUGGCAAAAAGGAGUAAAGUUACAUAAUCUUGAAACUUCGGUACCGUGUAUAUCUACAACAACUGAGGCUAGACUAGUAGCGGCUGAGAACUCAUCCAUGACUUUUUCAAGAAGCAUUUCAUUGCUUUUGGUUUGUAGUAACAUAGCUAUUCCCCUUUCGGCAAUACUUGGCGUGUUUCUGUCGUUCUUAGUAUAGCAUAUUUAUAAUGCGCUUACAUUUUCUUGCCAUGAAGAUAACAAUAUAUUGCUAAGACUAAUUUCAUAAGAGAAAGCCCAAACCAUGCUCUACUGGAUGGCUUUUUGUCGUUUAUUUUUUUGAAGGCGCAAAAUUGUGUUAAAACACGAUUCGCGUCUUCUUUUUU
..........................(((((((((...((((((((.........((((((..(((((..((..(((((.(...(((((.....(((((...(((((((....((((....))))...))))))))))))...(((((((.(((....))).))...((...(((((.(((((......))))))))))..)).))))).)))))...).)))))..))...)))))...))))))))))))))...(((..((((.......))))...)))((((((.......)))))).........))))))))).............((((((((....(((........)))..))))))))...............((((((((..((((((((....)))))))).))))))))......
9,284
bpRNA_RFAM_21636
UUCCUGGAGCCGGUGACCUGAGACCCACCCUUCUCGACGGGGCAGGUGUUAUAAGUGUCCUGUAGAGUAUGGGUGUGGUUUUAGUGCACGCGGGAG
.........((((((.(((((.(((((((...((((((.(((((..((...))..))))).))))))....)))).))).))))).))).)))...
9,285
bpRNA_CRW_44151
GGUGAUAUAGCUCAGUUGGUUAGAGCGCAGCAUUCAUAAUGCUGAUGUCGGUGGUUCAAAUCCACCUAUCACCACCA
(((((((..((((.........))))((((((.......))))))....(((((.......))))))))))))....
9,286
bpRNA_CRW_30954
GGUUGCGUGGUGUAAUGGUUAUCACUUCAGACUCUGAAUCUGACAAUCUGAGUUCGAAUCUCGGCGCGACCA
(((((((..((((........))))((((((.......))))))...(((((.......)))))))))))).
9,287
bpRNA_RFAM_5537
GAAGACCUUCGGGGCAAGGUGAAAUUCCUGAUCGGCGGUAAUGGUGGCGUGCCCACACAAGCCCGCGAGCCGUAAGGCAGGACCCGGUGUGAUUCCGGGGCCGACGGUAUAGUCCGGAUGGGAGAAGGUCGGC
..((((((((......(((.......))).....((((........................))))................(((((.......))))).....(((......))).......))))))))..
9,288
bpRNA_RFAM_5870
UCAAACUACUAGGGGUGCCCGGAUUUGGCGGGCUGAGAGAAAAACCGGCGUUUUUCAACCCUUUGGACCUGAUCCGGAUCAUACCGGCGUAGGAAAGUAGGAAUUUGUAAAA
.....(((((((((..(((((.......))))).....((((((......))))))..)))).....((((..((((......))))..))))..)))))............
9,289
bpRNA_RFAM_26971
CACCUCAUUAUUAAAGGUCCCUUGGCGACUGUACUUAUCGAUGCCGCUCCACAGGAUACCCAUUGAGGUUAGA
.((((((.........((((....(((((.............)))))......))))......))))))....
9,290
bpRNA_RFAM_27512
ACUCAACACUAAUUCAAUUAAAAGAGGUGAGUUUAAGUUGCAAAAGCAAGCCGCCACCGAGUGGAUCCUUGAACAAUUUGGUAGCCUCAAACCUGUUUAUUUCAGAGUUU
.......................(((((......(((((....(((....((((......))))...)))....)))))....)))))......................
9,291
bpRNA_RFAM_34528
AUCGGUUUGAAAGUACAGACCUAUUUAUGAAAGCAAGUUUUGAAAAGUUCCCCAUCAAGUGUUAUCCAUUGAUAUCCACUCGUAGUGAAUUCCUCCUAAUUAGUUCCAUAAGUAUAAAGAAGUAUCAAACCUAUAUGCCGUGUGGCAACAAUUAAAAUUUAAAGGAAUUCAAUAUGUCUAAUACAAUGACUGGUUUAGUAAAAUGGUUUAACGAAUCUAAAGGCUUUGGCUUUAUUUCUCCUGCUGAUGGCAGCAAAGAUGUGUUCGUACACUUCUCUGCAAUUCAAAGCGACAGCUUCAAAACGCUGAACGAAGGACAAAAAGUUAGCUUCUCAGUAGAGAAUGGUGCAAAAGGUCCAGCGGCUGUAAACGUCGUAGCUCUUUAAGAUACCCGCUUAAUACAGCGCUUAAAAUUUCAAACCCCUGCCAAUUGGCGGGGGUUUUUCG
...((((((......))))))......((..((((......((..(((..(((((.....(.(((.((((((.(.((...(((((((......(((((((.(.(((............))).).............(((....)))...........))))))).....))))))).(((((......)))))...........))))))))).)))).))))....))))))..)))).))..((((((.......((.....))..((((((.((((((.((((((..(((........)))))))))....)).))))))))))......))))))....(((.(((...))))))..(((((((.......))).)))).....(((.((((......)))).)))......((((((((((((....))))))))))))...
9,292
bpRNA_RFAM_33395
CAAUUGAUGCUGCUUUUGGCCUCUGGCCGUUGACUCGAUCCUGGCGCACCUUCCCCGGUGCCAGGCUCUCCAACGGCCAGGGACUAAAGGCAGUAACAAGAUCUGA
.........(((((((.((.((((((((((.((...(..((((((((..........)))))))).)..))))))))))))).)).))))))..............
9,293
bpRNA_RFAM_10465
AUGGGACGCUCUAAUACGGACAUGGUGUGAAGAGUCUACUGAGCUAGUUAGUAGUCCUCCGGCCCCUGAAUGCGGCUAAUCCCAACUGCGGAGCACACAGCUCACAAGCCAGCGAGUAGUGUGUCGUAACGGGCAACUCUGCAGCGGAACCGACUACUUUGGGUGUCCGUGUUUCCUUUUACUCUUAUAUUGGCUGCUUAUGGUGACAAUUAAAGAGUUGUUACCAUAUAGCUAUUGGAUUGGCCAUCCGGUG
...(((...))).......((...)).......((......(((((...((........(((.(((......(((....(((...(((((((.(((((.((((((......))))))).))))((((.)))).....))))))).))).)))........)))...))).............))......))))))).(((((((((((((....))))))))))))).........................
9,294
bpRNA_RFAM_10650
UUAGUUGCCAGUGCGACACCCGUUCCCACACAACGGGCAUGGGUGCAACUCCCCCGUCCCACUCUGGACGGUCACCAGGACCA
...(((((....))))).((((((.......))))))..((((.......))))[[.[....(((((].]]...)))))....
9,295
bpRNA_RFAM_28016
ACGUUUCUAUAUUUGCAACAAUGUUUAAAAUAACUGUACAUACUUGGUGGUGGAAUAACUUACGUCAAACGUCGUGAGCUAGCUACUAGUUUGUAUAAUCUAAUAUAUAAAAAAGGCUUGUC
...................................(((.((((((((.((((...((.((((((.....))).).))).))..)))).))))))))..))......................
9,296
bpRNA_RFAM_28261
CGAUAUGACGGUUGUGCGUGGGAGGCCUUCGGGCCUGCCGGGUUUGCCAUACCCCUGGUCUUCCACCCCGCGUACAACUGUCACCC
.....((((((((((((((((((((((....)))))(((((.............))))).......)))))))))))))))))...
9,297
bpRNA_RFAM_38338
AGAUUCCAAAUCAGGCAAAGUUUAGCGAACAGCCUGUACUCAGUCUUGAUGCCGAAGCCGCGAGGUCAGGUAUAAGCGUAGACAGAGGAGUAUGCGAGCCGCAAUGCGAAAGCGUGAAGCGAUUGAGCCUCGUUAUAACUGAAAGCGGAAGCCGAUGUGUUCGUCCUCACAGCAGGCAGCAAUGUACACUCGUUAUCGCGAGAGUGUUACAGGUUCCGCCGGGGUCAUAGAGCG
...........(((((..(.(.......)).)))))....(.((((((((((.((((((....)).)..)))...))).)))).))))...................................(..((((((............(((((.(((..((((........))))...)))....((((((((((..........)))))).))))..)))))))))))...).....
9,298
bpRNA_RFAM_18890
AGGGUUUGGUAGCCAAGGAUGACUUGCCUAUUUCCUCCAUAAGGCUUUAAAAAGCAUGAAAUGUGGUUUAGAGCUCAAUUGAAGGGUUCAUAGGCAGUCUACUUUGGUUAUCCUAG
..((......(((((.(((((((((.((((............................................................))))).))))))).))))).)))...
9,299
bpRNA_RFAM_5464
UAACAUUUUCGGGGCAAGGCGAAAUUCCUUACCGAUGGUAAUAGUCCAUGAACCUUAAUUGGUUGAUUCAGUGAAAUUCUGAAACCGACGGUAUAGUCCGGAUGGUAGAAAAUGUCA
..((((((((......(((.......))).....((((.......)))).................(((((.......))))).....(((......))).......))))))))..