Search is not available for this dataset
id
stringlengths 9
65
| sequence
stringlengths 28
512
| secondary_structure
stringlengths 28
512
| family
stringclasses 9
values |
|---|---|---|---|
5S_rRNA-Bacillus-cereus-4
|
UCUGGUAAUGAUGGCAGAGAGGUCACACCCGUUCCCAUACCGAACACGGAAGUUAAGCUCUCUAGCGCCGAUGGUAGUUGGGACCUUGUCCCUGUGAGAGUAGGACGUUGCCAGGCAAA
|
((((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((.(((((...))))).))....)).))...))))))))....
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Bacillus-cereus-5
|
UUGGUGAUGAUGGCAGAGAGGUCACACCCGUUCCCAUACCGAACACGGAAGUUAAGCUCUCUAGCGCCGAUGGUAGUUGGGACCUUGUCCCUGUGAGAGUAGGACGUCGCCAAGCAAC
|
(((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((.(((((...))))).))....)).))...))))))).....
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Bacillus-cereus-6
|
UGGUAAUGAUGGCAGAGAGGUCACACCCGUUCCCAUACCGAACACGGAAGUUAAGCUCUCUAGCGCCGAUGGUAGUUGGGACCUUGUCCCUGUGAGAGUAGGACGUUGCCAGGC
|
((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((.(((((...))))).))....)).))...))))))...
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Bacillus-cereus-7
|
UUGGUGAUGAUGGCAGAGAGGUCACACCCGUUCCCAUACCGAACACGGAAGUUAAGCUCUCUAGCGCCGAUGGUAGUUGGGACCUUGUCCCUGUGAGAGUAGGACGUCGCCAAGCUAU
|
(((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((.(((((...))))).))....)).))...))))))).....
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Bacillus-cereus-8
|
UUGGUGAUGAUGGCAGAGAGGUCACACCCGUUCCCAUACCGAACACGGAAGUUAAGCUCUCUAGCGCCGAUGGUAGUUGGGACCUUGUCCCUGUGAGAGUAGGACGUCGCCAAGCAAG
|
(((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((.(((((...))))).))....)).))...))))))).....
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Bacillus-cereus-9
|
UUGGUGAUGAUGGCAGAGAGGUCACACCCGUUCCCAUACCGAACACGGAAGUUAAGCUCUCUAGCGCCGAUGGUAGUUGGGACCUUGUCCCUGUGAGAGUAGGACGUCGCCAAGCAAA
|
(((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((.(((((...))))).))....)).))...))))))).....
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Bacillus-clausii-1
|
UCCGGUGACAAUGGCAAAGAGGUCACACCCGUUCCCAUGCCGAACACGGCCGUUAAGCUCUUUUGCGCCGAUGGUAGUUGGAGGCUUCCUCCCGCGAGAGUAGGACGUUGCCGGGC
|
((((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((.(((((...))))).))....)).))...)))))))).
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Bacillus-clausii-2
|
UCCGGUGACAAUGGCAAAGAGGUCACACCCGUUCCCAUGCCGAACACGGCCGUUAAGCUCUUUUGCGCCGAUGGUAGUUGGAGGCUUCCUCCUGCGAGAGUAGGACGUUGCCGGGC
|
((((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((.(((((...))))).))....)).))...)))))))).
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Bacillus-clausii-3
|
UCCGGUGACAAUGGCAAAGAGGUCACACCCGUUCCCAUGCCGAACACGGCCGUUAAGCUCUUUUGCGCCGAUGGUAGUUGGAGGCUUCCUCCUGUGAGAGUAGGACGUUGCCGGGC
|
((((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((.(((((...))))).))....)).))...)))))))).
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Bacillus-firmus-1
|
UCUGGUGGCGAUAGCGAGAAGGUCACACCCGUUCCCAUACCGAACACGGAAGUUAAGCUUCUCAGCGCCGAUGGUAGUUAGGGGCUGUCCCCUGUGAGAGUAGGACGCUGCCAGGC
|
((((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((..((((...))))..))....)).))...)))))))).
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Bacillus-halodurans-1
|
UUUGGUGGCGAUAGCGAAGAGGUCACACCCGUUCCCAUGCCGAACACGGUCGUUAAGCUCUUCAGCGCCGAUGGUAGUUGGGGCCUUGCCCCUGCGAGAGUAGGACGCUGCCAAGC
|
((((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((.(((((...))))).))....)).))...)))))))).
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Bacillus-halodurans-2
|
UUUGGUGGCGAUAGCGAAGAGGCCACACCCGUUCCCAUGCCGAACACGGUCGUUAAGCUCUUCAGCGCCGAUGGUAGUUGGGGGCUUCCCCCUGCGAGAGUAGGACGCUGCCAAAC
|
((((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((.(((((...))))).))....)).))...)))))))).
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Bacillus-halodurans-3
|
UUUGGUGGCGAUAGCGAAGAGGCCACACCCGUUCCCAUGCCGAACACGGUCGUUAAGCUCUUCAGCGCCGAUGGUAGUUGGGGGCUUCCCCCUGCGAGAGUAGGACGCUGCCAAGC
|
((((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((.(((((...))))).))....)).))...)))))))).
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Bacillus-halodurans-4
|
UUUGGUGGCGAUAGCGAAGAGGCCACACCCGUUCCCAUGCCGAACACGGUCGUUAAGCUCUUCAGCGCCGAUGGUAGUUGGGGCCUUGCCCCUGCGAGAGUAGGACGUUGCCAAGC
|
((((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((.(((((...))))).))....)).))...)))))))).
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Bacillus-halodurans-5
|
UUUGGUGGCGAUAGCGAAGAGGCCACACCCGUUCCCAUGCCGAACACGGUCGUUAAGCUCUUCAGCGCCGAUGGUAGUUGGGGACUUCCCCCUGCGAGAGUAGGACGCUGCCAAGC
|
((((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((.((((.....)))).))....)).))...)))))))).
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Bacillus-halodurans-6
|
UUUGGUGGCGAUAGCGAAGAGGCCACACCCGUUCCCAUGCCGAACACGGUCGUUAAGCUCUUCAGCGCCGAUGGUAGUUGGGGGCUUCCCCCUGCGAGAGUAGGACGCUGCCAAG
|
((((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((.(((((...))))).))....)).))...))))))))
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Bacillus-licheniformis-1
|
UCUGGUGAUGAUGGCGAAGAGGUCACACCCGUUCCCAUGCCGAACACGGAAGUUAAGCUCUUCAGCGCCGAUGGUAGUUGGGGGCUUCCCCCUGCGAGAGUAGGACAUCGCCAGGC
|
((((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((.(((((...))))).))....)).))...)))))))).
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Bacillus-licheniformis-2
|
UUUGGUGGCGAUAGCGAAGAGGUCACACCCGUUCCCAUGCCGAACACGGAAGUUAAGCUCUUCAGCGCCGAUGGUAGUUGGGGGCUUCCCCCUGUGAGAGUAGGACGCCGCCAAGC
|
((((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((.(((((...))))).))....)).))...)))))))).
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Bacillus-licheniformis-5
|
UUGGUGGCGAUAGCGAAGAGGUCACACCCGUUCCCAUGCCGAACACGGAAGUUAAGCUCUUCAGCGCCGAUGGUAGUUGGGGGCUUCCCCCUGUGAGAGUAGGACGCCGCCAAGCG
|
(((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((.(((((...))))).))....)).))...)))))))...
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Bacillus-licheniformis-6
|
UUUGGUGGCGAUAGCGAAGAGGUCACACCCGUUCCCAUGCCGAACACGGAAGUUAAGCUCUUCAGCGCCGAUGGUAGUUGGGGGCUUCCCCCUGUGAGAGUAGGACGCCGCCAAG
|
((((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((.(((((...))))).))....)).))...))))))))
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Bacillus-megaterium-1
|
UCUGGUGGCGAUAGCGAAGAGGUCACACCCGUUCCCAUACCGAACACGGAAGUUAAGCUCUUUAGCGCCAAUGGUAGUUGGGACUUUGUCCCUGUGAGAGUAGGACGUUGCCAGGC
|
((((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((.(((((...))))).))....)).))...)))))))).
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Bacillus-megaterium-2
|
UCUGGUGGCGAUAGCGAAGAGGUCACACCCGUUCCCAUACCGAACACGGAAGUUAAGCUCUUUAGCGCCGAUGGUAGUUGGGACUUUGUCCCUGUGAGAGUAGGACGUUGCCAGGC
|
((((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((.(((((...))))).))....)).))...)))))))).
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Bacillus-methanolicus-7
|
CCUGGUGGCGAUGGCGAGAAGGUCACACCCGUUCCCAUACCGAACACGGAAGUUAAGCUUCUCAGCGCCGAUGGUAGUUGGGGCAUUGCCCCUGCGAGAGUAGGACGCUGCCAGGC
|
((((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((.(((((...))))).))....)).))...)))))))).
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Bacillus-methanolicus-8
|
CCUGGUGGCGAUGGCGAGAAGGUCACACCCGUUCCCAUACCGAACACGGAAGUUAAGCUUCUCAGCGCCGAUGGUAGUUGGGGCAUUGCCCCUGCGAGAGUAGGACGUUGCCAGGC
|
((((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((.(((((...))))).))....)).))...)))))))).
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Bacillus-methanolicus-9
|
CCUGGUGGCGAUGGCGAGAAGGACACACCCGUUCCCAUACCGAACACGGAAGUUAAGCUUCUCAGCGCCGAUGGUAGUUGGGGCAUUGCCCCUGCGAGAGUAGGACGCUGCCAGGC
|
((((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((.(((((...))))).))....)).))...)))))))).
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Bacillus-sp.-1
|
UCUGGUGAUGAUGGCGAAGAGGUCACACCCGUUCCCAUGCCGAACACGGAAGUUAAGCUCUUCAGCGCCGAUGGUAGUCGGGGGCUUCCCCCUGUGAGAGUAGGACAUCGCCAGGC
|
((((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((.(((((...))))).))....)).))...)))))))).
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Bacillus-sp.-2
|
UUUGGUGGCGAUAGCGAAGAGGUCACACCCGUUCCCAUGCCGAACACGGAAGUUAAGCUCUUCAGCGCCGAUGGUAGUCGGGGGUUUCCCCCUGUGAGAGUAGGACGCCGCCAAGC
|
((((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((.(((((...))))).))....)).))...)))))))).
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Bacillus-subtilis-1
|
UCUGGUGAUGAUGGCGAAGAGGUCACACCCGUUCCCAUGCCGAACACGGAAGUUAAGCUCUUCAGCGCCGAUGGUAGUCGGGGGUUUCCCCCUGUGAGAGUAGGACAUCGCCAGGC
|
((((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((.(((((...))))).))....)).))...)))))))).
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Bacillus-subtilis-2
|
UUUGGUGGCGAUAGCGAAGAGGUCACACCCGUUCCCAUACCGAACACGGAAGUUAAGCUCUUCAGCGCCGAUGGUAGUCGGGGGUUUCCCCCUGUGAGAGUAGGACGCCGCCAAGC
|
((((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((.(((((...))))).))....)).))...)))))))).
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Bacillus-subtilis-4
|
UUUGGUGGCGAUAGCGAAGAGGUCACACCCGUUCCCAUACCGAACACGGAAGUUAAGCUCUUCAGCGCCGAUGGUAGUCGGGGGUUUCCCCCUGUGAGAGUAGGACGCCGCCAAGC
|
((((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((.(((((...))))).))....)).))...)))))))).
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Bacillus-subtilis-5
|
UUGGUGGCGAUAGCGAAGAGGUCACACCCGUUCCCAUACCGAACACGGAAGUUAAGCUCUUCAGCGCCGAUGGUAGUCGGGGGUUUCCCCCUGUGAGAGUAGGACGCCGCCAAGC
|
(((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((.(((((...))))).))....)).))...)))))))..
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Bacillus-subtilis-6
|
UUUGGUGGCGAUAGCGAAGAGGUCACACCCGUUCCCAUACCGAACACGGUAGUUAAGCUCUUCAGCGCCGAUGGUGAGUGGGGGCUUCCCCCUGUGAGAGUAGGACGCCGCCAAGC
|
((((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....(..(((((...)))))..)....)).))...)))))))).
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Bacillus-thuringiensis-1
|
UUGGUGAUGAUGGCAGAGAGGUCACACCCGUUCCCAUACCGAACACGGAAGUUAAGCUCUCUAGCGCCGAUGGUAGUUGGGACCUUGUCCCUGUGAGAGUAGGACGUCGCCAAGCAAC
|
(((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((.(((((...))))).))....)).))...))))))).....
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Bacillus-thuringiensis-2
|
UGGUAAUGAUGGCAGAGAGGUCACACCCGUUCCCAUACCGAACACGGAAGUUAAGCUCUCUAGCGCCGAUGGUAGUUGGGACCUUGUCCCUGUGAGAGUAGGACGUUGCCAGGC
|
((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((.(((((...))))).))....)).))...))))))...
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Bacillus-thuringiensis-3
|
UUGGUGAUGAUGGCAGAGAGGUCACACCCGUUCCCAUACCGAACACGGAAGUUAAGCUCUCUAGCGCCGAUGGUAGUUGGGACCUUGUCCCUGUGAGAGUAGGACGUCGCCAAGCUAU
|
(((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((.(((((...))))).))....)).))...))))))).....
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Bacillus-thuringiensis-4
|
UUGGUGAUGAUGGCAGAGAGGUCACACCCGUUCCCAUACCGAACACGGAAGUUAAGCUCUCUAGCGCCGAUGGUAGUUGGGACCUUGUCCCUGUGAGAGUAGGACGUCGCCAAGCAAG
|
(((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((.(((((...))))).))....)).))...))))))).....
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Bacillus-thuringiensis-5
|
UUGGUGAUGAUGGCAGAGAGGUCACACCCGUUCCCAUACCGAACACGGAAGUUAAGCUCUCUAGCGCCGAUGGUAGUUGGGACCUUGUCCCUGUGAGAGUAGGACGUCGCCAAGCAAA
|
(((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((.(((((...))))).))....)).))...))))))).....
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Bacillus-thuringiensis-6
|
UGGUAAUGAUGGCAGAGAGGCCACACCCGUUCCCAUACCGAACACGGAAGUUAAGCUCUCUAGCGCCGAUGGUAGUUGGGACCUUGUCCCUGUGAGAGUAGGACGUUGCCAGGC
|
((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((.(((((...))))).))....)).))...))))))...
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Bacteroides-capillosus-1
|
CCAGGUGGCUAUGGCGGCGGUGUUCCACCUCUUCCCAUUCCGAACAGAGAAGUUAAGCCUGUUUGCGCCGACAAUACUUAGAUUUACUUCUAGGGAAUAUAGGUCUUCGCCAAUG
|
...(((((.....(((((((......((((((.............))))..)).....))))).)).((.(.....((((((......)))))).....).))...)))))....
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Bacteroides-fragilis-1
|
ACUAUAGCAUCAGGGUUCCACCUCUUCCCAUUCCGAACAGAGAAGUUAAGCCUGAUCACGCCGAUGGUACUGCGUAACAGUGGGAGAGUAGGUAGUCGCCGUU
|
(.....(.((((((.....((((((.............))))..))....))))))..).((.((....(((((...).))))....)).))...).......
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Bacteroides-fragilis-2
|
ACAGGUGACUAUAGCAUCAGGGUUCCACCUCUUCCCAUUCCGAACAGAGAAGUUAAGCCUGAUCACGCCGAUGGUACUGCGUAACAGUGGGAGAGUAGGUAGUCGCCGUU
|
(..(((((.....(.((((((.....((((((.............))))..))....))))))..).((.((....(((((...).))))....)).))...)))))..)
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Bacteroides-fragilis-3
|
ACUAUAGCAUCAGGGUUCCACCUCUUCCCAUUCCGAACAGAGAAGUUAAGCCUGAUCACGCCGAUGGUACUGCGUAACAGUGGGAGAGUAGGUAGUCGCCAUU
|
(.....(.((((((.....((((((.............))))..))....))))))..).((.((....(((((...).))))....)).))...).......
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Bacteroides-fragilis-4
|
ACUAUAGCAUCAGGGUUCCACCUCUUCCCAUUCCGAACAGAGAAGUUAAGCCUGAUCACGCCGAUGGUACUGCGUAACAGUGGGAGAGUAGGUAGUCGCCGUU
|
(.....(.((((((.....((((((.............))))..))....))))))..).((.((....(((((...).))))....)).))...).......
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Bacteroides-fragilis-5
|
ACUAUAGCAUCAGGGUUCCACCUCUUCCCAUUCCGAACAGAGAAGUUAAGCCUGAUCACGCCGAUGGUACUGCGUAACAGUGGGAGAGUAGGUAGUCGCCGUU
|
(.....(.((((((.....((((((.............))))..))....))))))..).((.((....(((((...).))))....)).))...).......
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Bacteroides-fragilis-6
|
GGUGACUAUAGCAUCAGGGUUCCACCUCUUCCCAUUCCGAACAGAGAAGUUAAGCCUGAUCACGCCGAUGGUACUGCGUAACAGUGGGAGAGUAGGUAGUCGCCGUU
|
(((((.....(.((((((.....((((((.............))))..))....))))))..).((.((....(((((...).))))....)).))...)))))...
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Bacteroides-thetaiotaomicron-1
|
UCAGGUGACUAUAGCAUCAGGGUUCCACCUCUUCCCAUUCCGAACAGAGAAGUUAAGCCUGAUCACGCCGAUGGUACUGCGUAACAGUGGGAGAGUAGGCAGUCGCCGCCG
|
...(((((.....(.((((((.....((((((.............))))..))....))))))..).((.((....(((((...).))))....)).))...)))))....
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Bacteroides-veroralis-1
|
AUAGGUGGUUAUUGCGUCGGGGUUCCACCUCUUCCCAUUCCGAACAGAGAAGUUAAGCCCGUCUGCGCCGAUGGUACUGCAAUGCAAUGCGGGAGAGUAGGUCGCCGCCUUC
|
..((((((.....(((.((((.....((((((.............))))..))....)))).).)).((.((....(((((......)))))....)).))...))))))..
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Bartonella-bacilliformis-1
|
GACUUGGUGGUUAUGGCGGAACGCCUGCACCCGAUCCCAUCCCGAACUCGGCCGUGAAACGUUCCAGCGCUGAUGGUACUUUGUCUUAAGGCACGGGAGAGUAAGUCGCUGCCAGGUCU
|
((((((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((.((((....)))).))....)).))...)))))))))).
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Bartonella-henselae-1
|
GACUUGGUGGUUAUGGCGGAGUGAACGCACCCGAUCCCAUCCCGAACUCGGCCGUGAAACGCUCCAGCGCUGAUGGUACUUUGCCUUAAGGCACGGGAGAGUAAGUCGCUGCCAGGUCU
|
((((((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((.((((....)))).))....)).))...)))))))))).
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Bartonella-henselae-2
|
GACUUGGUGGUUAUGGCGGAGUGAACGCACCCGAUCCCAUCCCGAACUCGGCCGUGAAACGCUCCAGCGCUGAUGGUACUUUGCCUCAAGGCACGGCAGAGUAAGUCGUUGCCAGGUCU
|
((((((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((.((((....)))).))....)).))...)))))))))).
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Bartonella-quintana-1
|
GACUUGGUGGUUAUGGCGGAGCGAACGCACCCGAUCCCAUCCCGAACUCGGCCGUGAAACGUUCCAGCGCUGAUGGUACUUUGCCUUAAGGCACGGGAGAGUAAGUCGCUGCCAGGUCU
|
((((((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((.((((....)))).))....)).))...)))))))))).
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Bartonella-quintana-2
|
GACUUGGUGGUUAUGGCGGAGCGAACGCACCCGAUCCCAUCCCGAACUCGGCCGUGAAACGUUCCAGCGCUGAUGGUACUUUGCCUCAAGGCACGGCAGAGUAAGUCGUUGCCAGGUCU
|
((((((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((.((((....)))).))....)).))...)))))))))).
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Basidiobolus-magnus-1
|
AAGCAUCGGCCAUACAUACCAGAAAAUACCGGAUCCCGUCCGAUCUCCGAAGUCAAACUGGUAAUGGCCUAGUCAGUACUACGGUGGGGGACCACGUGGGAAUACUAGGUGCUGAUGUUU
|
(.((((((((....((((((((.....((((((............))))..))....)))))).)).((((((.....(((((.(((....))))))))....)))))).))))))))).
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Batrachospermum-ectocarpum-1
|
ACAUACGACCAUAGUACGAGGACAUGCGCAGGAGCCCAUCUCGAACUCCUCAGCUAAAUCCCGUCACGCACGCUUAGUACUCCGGAGGGGGACCACGGUGGAAUCGCGUGUGUCGUAUGUU
|
(((((((((....(((((.(((.....((((((.............))))..))....)))))).)).(((((......(.(((..((....)).))).).....))))).))))))))).
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Beggiatoa-alba-1
|
UUCUUGGCGACCAUAGCAAAUAGGAACCACCCGACCCCAUCCCGAACUCGGUAGUGAAACUGUUCUGCGCCGAUGAUAGUGUGGAUACUCUCCAUGUGAAAGUAGGUUAUCGCCAAGAGC
|
((((((((((.....((.(((((.....((((((.............))))..))....)))))..)).((.((....(((((((.....)))))))....)).))...)))))))))).
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Beta-vulgaris-1
|
GGGUGCGAUCAUACCAGCACUAAUGCACCGGAUCCCAUCAGAACUCCGCAGUUAAGCGUGCUUGGGCGAGAGUAGUACUAGGAUGGGUGACCUCCUGGGAAGUCCUCGUGUUGCACCCCU
|
(((((((((....(((((((......((((((............))))..)).....))))).)).((((.(.....(((((..((....)).)))))....).)))).)))))))))..
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Bifidobacterium-longum-1
|
UUUGCGGCGGCCAUGGCCCAGGUGAGACGCCCGGUCCCAUUCCGAACCCGGAAGCUAAGGCCUGGCACGGCGAUGGUACUGCACCCGACAGGGUGUGGGAGAGUAGCACGCCGCCGCAUC
|
..((((((((.....(.((((((.....((((((.............))))..))....))))))..).((.((....((((((((....))))))))....)).))...))))))))..
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Bifidobacterium-longum-2
|
UUUGCGGCGGCCAUGGCCCAGGUGAGACGCCCGGUCCCAUUCCGAACCCGGAAGCUAAGGCCUGGCACGGCGAUGGUACUGCACCCGACAGGGUGUGGGAGAGUAGCACGCCGCCGCAUCA
|
..((((((((.....(.((((((.....((((((.............))))..))....))))))..).((.((....((((((((....))))))))....)).))...))))))))...
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Bifidobacterium-longum-3
|
UUUGCGGCGGCCAUGGCCCAGGUGAGACGCCCGGUCCCAUUCCGAACCCGGAAGCUAAGGCCUGGCACGGCGAUGGUACUGCACCCGACAGGGUGUGGGAGAGUAGCACGCCGCCGCACC
|
..((((((((.....(.((((((.....((((((.............))))..))....))))))..).((.((....((((((((....))))))))....)).))...))))))))..
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Bjerkandera-adusta-1
|
AUCCACGGCCAUAGGACUCUGAAAGCACCGCAUCCCGUCCGAUCUGCGAAGUUAACCAGAGUGCCGCCUAGUUAGUACCACGGUGGGGGACCACGCGGGAAUCCUAGGUGCUGUGGUU
|
(.(((((((....((((((((.....((((((............))))..))....)))))).)).(((((......((.((.(((....))))).)).....))))).))))))).)
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Blakeslea-trispora-1
|
AAGCUACGGCCAUAUAAUACCGAAAGCACCGGAUCCCGUCCGAUCUCCGCAGUUAAACGGUAUAUAGAUCAGUCAGUACUAUGGUGGGGGACCACAUGGGAAUACUGGUUGCUGUAGUUU
|
(.((((((((....((((((((.....((((((............))))..))....)))))).)).((((((.....(((((.(((....))))))))....)))))).))))))))).
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Blastocladiella-simplex-1
|
AGCUACGGCCAUACACACCAGAAAGCUCCGCAUCCCGUCCGAUCUGCGAAGAUAAUCUGGUGCUGGCGCGGUCAGUACUGUCGUGGGAGACCAGAUGGGAAUACCGCGUGCUGUAGUU
|
(((((((((....((((((((.....((((((............))))..))....)))))).)).((((((.....(((((.(((....))))))))....)))))).)))))))))
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Blastopirellula-marina-1
|
UUCCGGUGACCAUAUCGAAAAGGUCAUACCUGUUCCCAUUCCGAACACAGCCGUCAAGCUUUUCGAGCCGAUGAUAGUACCACAAGUGUGAAAGUAGGUAUCGCCGGAUC
|
.((((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))))).((.((....((((.....))))....)).))..))))))))..
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Blepharisma-japonicum-1
|
GUUGUCGGCCAUACUAUGCCUAACGCACCAGAUCCCAUCCGAACUCUGAAGUUAAGCGGCAUAAGGCGAGGUUAGUACUUGGGUGGGGGACCGCCAGGGAAGCCCUCGUGCUGACAGCUA
|
(((((((((....(((((((......((((((............))))..)).....))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Bombyx-mori-1
|
GCCAACGUCCAUACCACGUUGAAAACACCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAGUCAAGCAACGUCGGGCGUAGUCAGUACUUGGAUGGGUGACCGCCUGGGAACACUACGUGAUGUUGGCUUU
|
(((((((((....((((((((.....((((((............))))..))....)))))).)).((((((.....((.((.(((....))))).))....)))))).)))))))))...
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Bombyx-mori-2
|
GCCAACGUCCAUACCAUGUUGAAUACACCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAGUCAAGCAACAUCGGGCGUGGUCAGUACUUGGAUGGGUGACCGCCUGGGAACACCACGUGAUGUUGGCUU
|
(((((((((....((((((((.....((((((............))))..))....)))))).)).((((((.....((.((.(((....))))).))....)))))).)))))))))..
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Bombyx-mori-3
|
GCCAACGUCCAUACCAUGUUGAAUACACCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAGUCAAGCAACAUCGGGCGUAGUCAGUACUUGGAUGGGUGACCGCCUGGGAACACUACGUGAUGUUGGCUU
|
(((((((((....((((((((.....((((((............))))..))....)))))).)).((((((.....((.((.(((....))))).))....)))))).)))))))))..
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Bombyx-mori-4
|
GCCAACGUCCAUACCAUGUUGAAUACACUGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAGUCAAGCAACAUCGGGCGUGGUCAGUACUUGGAUGGGUGACCGCCUGGGAACACCACGUGAUGUUGGCU
|
(((((((((....((((((((.....((((((............))))..))....)))))).)).((((((.....((.((.(((....))))).))....)))))).))))))))).
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Bordetella-bronchiseptica-1
|
GCCUGACGACCAUAGCAAGGUGGUCCCACUCCUUCCCAUCCCGAACAGGACAGUGAAACGCCUUCGCGCCGAUGAUAGUGGAUGUACAUCUGUGAAAGUAGGUCAUCGUCAGGCU
|
(((((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((((((....))))))....)).))...))))))))).
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Bordetella-parapertussis-1
|
GCCUGACGACCAUAGCAAGGUGGUCCCACUCCUUCCCAUCCCGAACAGGACAGUGAAACGCCUUCGCGCCGAUGAUAGUGGAUGUACAUCUGUGAAAGUAGGUCAUCGUCAGGCU
|
(((((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((((((....))))))....)).))...))))))))).
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Bordetella-pertussis-1
|
GCCUGACGACCAUAGCAAGGUGGUCCCACUCCUUCCCAUCCCGAACAGGACAGUGAAACGCCUUCGCGCCGAUGAUAGUGGAUGUACAUCUGUGAAAGUAGGUCAUCGUCAGGCU
|
(((((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((((((....))))))....)).))...))))))))).
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Borrelia-burgdorferi-1
|
CCCUGGUGGUUAAAGAAAAGAGGAAACACCUGUUAUCAUUCCGAACACAGAAGUUAAGCUCUUAUUCGCUGAUGGUACUGCGAGUUCGCGGGAGAGUAGGUUAUUGCCAGGG
|
(((((((((.....((.(((((.....((((((.............))))..))....)))))..)).((.((....(((((....)))))....)).))...)))))))))
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Bos-taurus-1
|
GUCUACGGCCAUACCACCCUGAACGCGCCCGAUCUCGUCUGAUCUCGGAAGCUAAGCAGGGUCGGGCCUGGUUAGUACUUGGAUGGGAGACCGCCUGGGAAUACCGGGUGCUGUAGGCUU
|
(((((((((....((((((((.....((((((............))))..))....)))))).)).((((((.....((.((.(((....))))).))....)))))).)))))))))..
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Brachionus-plicatilis-1
|
GCCUAGGACCAUAUCACGUUGAAUGCACCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAGUUAAGCAACGUCGAGCCCGGUUAGUACUUGGAUGGGUGACCGCCUGGGAAUACCGGGUGUUCUAGGCCU
|
(((((((((....((((((((.....((((((............))))..))....)))))).)).((((((.....((.((.(((....))))).))....)))))).)))))))))..
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Bradyrhizobium-japonicum-1
|
GGCCUGGUGGUUUUAGCGAAGAGCCUCAACCCGAUCCCAUCCCGAACUCGGCCGUUAAACUCUUCAGCGCCAAUGGUACUAUGGCUUAAGCCCUGGGAGAGUAGGUCGCUGCCAGGCCU
|
((((((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....(((.(((....))).)))....)).))...)))))))))).
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Branchiostoma-belcheri-1
|
GCCUACGGCCAUAUCACGUUGAGUACACCCGAUCUCGUUCGAUCUCGGAAGUUAAGCAACGUCGAGUCCGGUCAGUACUUGGAUGGGAGACCGCCUGGGAACACCGGGAGUUGUAGGCAU
|
(((((((((....((((((((.....((((((............))))..))....)))))).)).((((((.....((.((.(((....))))).))....)))))).)))))))))..
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Brassica-napus-1
|
GGGUGCGAUCAUACCAGCACUAAUGCACCGGAUCCCAUCAGAACUCCGCAGUUAAGCGUGCUUGGGCGAGAGUAGUACUAGGAUGGGUGACCUCCUGGGAAGUCCUCGUGUUGCACCCCU
|
(((((((((....(((((((......((((((............))))..)).....))))).)).((((.(.....(((((..((....)).)))))....).)))).)))))))))..
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Bresslaua-vorax-1
|
GUUAUCGGCCAUACUAAGCCAAAAGCACCGGAUCCCAUUCGAACUCCGAAGUUAAGCGGCUUAAGGCAUGGUUAGUACUAAGGUGGGGGACCGCUUGGGAAGCCCAUGUGCUGAUAGCUU
|
(((((((((....(((((((......((((((............))))..)).....))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).)))))))))..
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Brevibacillus-brevis-1
|
UCUGGUGAUGAUGGCGGAGGGGACACACCCGUUCCCAUACCGAACACGGCCGUUAAGCCCUCCAGCGCCAAUGGUACUUGCUCCGCAGGGAGCCGGGAGAGUAGGACGUCGCCAGGC
|
((((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((.(((((....))))).))....)).))...)))))))).
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Brevibacterium-casei-1
|
UUUUGCGGUGGUGAUAGUGGUGGGGAAACGCCCGGUUAACCGUUCCGAUCCCGGUAGCUAAGCCCAUGUAUGCUGAUGGUACUGCAACUUGGUGGUUGUGGGAGAGUAAGUGACUGCCGCAAU
|
..(((((((((.....((.(((((.....((((((...............))))..))....)))))..)).((.((....((((((((....))))))))....)).))...))))))))).
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Brevibacterium-helvolum-1
|
AUUACGGCGGUCAUAGCGUGGGGGAAACGCCCGGUCCCAUUCCGAACCCGGAAGCUAAGACCCACAGCGCCGAUGGUACUGCACCCGGGAGGGUGUGGGAGAGUAGGUCACCGCCGGAAA
|
.((.((((((.....(((((((......((((((.............))))..)).....))))).)).((.((....((((((((....))))))))....)).))...))))))))..
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Brevibacterium-linens-1
|
UUUUGCGGUGGUGAUAGUGGUGGGGAAACGCCCGGUUAACCGUUCCGAUCCCGGUAGCUAAGCCCAUUCGCGCUGAUGGUACUGCAACUUGGUGGUUGUGGGAGAGUAGGUGACUGCCGCAAU
|
..(((((((((.....((((((((.....((((((...............))))..))....)))))).)).((.((....((((((((....))))))))....)).))...))))))))).
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Brevibacterium-linens-2
|
UUUUGCGGUGGUGAUAGUGGUGGGGAAACGCCCGGUUAACCGUUCCGAUCCCGGUAGCUAAGCCCAUUCGCGCUGAUGGUACUGCAACUUGGUGGUUGUGGGAGAGUAAGUGACUGCCGCAAU
|
..(((((((((.....((((((((.....((((((...............))))..))....)))))).)).((.((....((((((((....))))))))....)).))...))))))))).
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Brucella-abortus-1
|
GACCUGGUGGUUAUGGCGGAGCGGCUGCACCCGAUCCCAUUCCGAACUCGGCCGUGAAACGCUCCAGCGCCAAUGGUACUUCGUCUCAAGACGCGGGAGAGUAGGUCGCUGCCAGGUCU
|
((((((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((.((((....)))).))....)).))...)))))))))).
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Brucella-melitensis-1
|
GACCUGGUGGUUAUGGCGGAGCGGCUGCACCCGAUCCCAUUCCGAACUCGGCCGUGAAACGCUCCAGCGCCAAUGGUACUUCGUCUCAAGACGCGGGAGAGUAGGUCGCUGCCAGGUC
|
((((((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((.((((....)))).))....)).))...))))))))))
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Brucella-melitensis-2
|
GACCUGGUGGUUAUGGCGGAGCGGCUGCACCCGAUCCCAUUCCGAACUCGGCCGUGAAACGCUCCAGCGCCAAUGGUACUUCGUCUCAAGAGGAGGCAGAGUAGGUCGAUGCCAGGUCU
|
(((((((((......((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((((.((....)).))))....)).))....))))))))).
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Brucella-melitensis-3
|
GACCUGGUGGUUAUGGCGGAGCGGCUGCACCCGAUCCCAUUCCGAACUCGGCCGUGAAACGCUCCAGCGCCAAUGGUACUUCGUCUCAAGACGCGGGAGAGUAGGUCGCUGCCAGGUCU
|
((((((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((.((((....)))).))....)).))...)))))))))).
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Brucella-suis-1
|
GACCUGGUGGUUAUGGCGGAGCGGCUGCACCCGAUCCCAUUCCGAACUCGGCCGUGAAACGCUCCAGCGCCAAUGGUACUUCGUCUCAAGACGCGGGAGAGUAGGUCGCUGCCAGGUCUGCAAAG
|
((((((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((.((((....)))).))....)).))...)))))))))).......
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Brucella-suis-2
|
GACCUGGUGGUUAUGGCGGAGCGGCUGCACCCGAUCCCAUUCCGAACUCGGCCGUGAAACGCUCCAGCGCCAAUGGUACUUCGUCUCAAGACGCGGGAGAGUAGGUCGCUGCCAGGUCU
|
((((((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((.((((....)))).))....)).))...)))))))))).
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Brugia-malayi-1
|
GUCUACGACCAUACCACGUUGAAAGCACGACAUCUCGUCCGAUCUGUCAAGUUAAGCAACGUUGGGCCUGGUUAGUACUUGGAUCGGAGACGGCCUGGGAAUCCCAGGUGUUGUAGACAUA
|
(((((((((....((((((((.....((((((............))))..))....)))))).)).(((((......((.((.(((....))))).)).....))))).)))))))))...
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Buchnera-aphidicola-1
|
UGGUAAAAAUAGUGUAGUGGUACCACCUGAAUCCAUUCCGAACUCAGAAGUGAAACGCUAUAACGCCGAUGGUAGUACGGGGCCUCCCCGUGUGAGAGUAGGUCAAAUCCAGGAA
|
(((........((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((((((((...))))))))....)).))......)))....
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Buchnera-aphidicola-2
|
UGCCUGGUAAAAAUAGUGUAGUGGUACCACCUGAAUCCAUUCCGAACUCAGAAGUGAAACGCUACAACGCCAAUGGUAGUACGGGGUCUCCCCGUGUGAGAGUAGGUAUCAGCCAGGCAA
|
((((((((.......((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((((((((...))))))))....)).)).....)))))))).
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Buchnera-aphidicola-3
|
UGGUAAAAAUAGUGUUAUGGUACCACCUGAAACCAUGCCGAACUCAGAAGUGAAACAUUUCAACGCCGAUGGUAGUGCAGGGUAUCCCUGUGUGAGAGUAGGACAUUACCAGGUU
|
((((((.....(((..(((.....((((((.............))))..))....)))..).)).((.((....((((((((...))))))))....)).))...))))))....
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Bufo-americanus-1
|
GCCUACGGCCACACCACCCUGAACACGCCCGAUCUCGUCUGAUCUCGGAAGCUAAGCAGGGUCGGGCCUGGUUAGUACUUGGAUGGGAGACCGCCUGGGAAUACCAGGUGUCGUAGGCU
|
(((((((((....((((((((.....((((((............))))..))....)))))).)).((((((.....((.((.(((....))))).))....)))))).))))))))).
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Bugula-neritina-1
|
GUUUACGGCCAUAUCACGUUGAAAACGCCAGUUCUCGUCCGAUCACUGAAGCUAAGCAACGUCGAGCCUGGUUAGUACUUGGAUGGGUGACCGCCUGGGAAUACCAGGUGCUGUAGACUU
|
(((((((((....((((((((.....((((((............))))..))....)))))).)).((((((.....((.((.(((....))))).))....)))))).)))))))))..
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Bullera-alba-1
|
AUCCACGGCCAUAGGACUCAGAAAGUACCGCAUCCCGUCCGAUCUGCGAAGUCAAGCUGAGUACCGCCUAGUUAGUACCACGGUGGGGGACCACGUGGGAAUCCUAGGUGCUGUGGUU
|
(.(((((((....((((((((.....((((((............))))..))....)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))).)
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Burkholderia-caryophylli-1
|
UGCCUGAUGACCAUAGCGAGUUGGUACCACCCCUUCCCAUCCCGAACAGGACCGUGAAACGACUCCACGCCGAUGAUAGUGCGGAUUGCCCGUGUGAAAGUAGGUAAUCGUCAGGC
|
.(((((((((.....(.((((((.....((.(((.............)))...))....))))))..).((.((....((((((.....))))))....)).))...)))))))))
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Burkholderia-cepacia-1
|
GCCUGACGACCAUAGCGAGUCGGUCCCACUCCUUCCCAUCCCGAACAGGACCGUGAAACGACUCUACGCCGAUGAUAGUGCGGAUUCCCGUGUGAAAGUAGGUAAUCGUCAGGCCU
|
(((((((((.....(.((((((.....((((((.............))))..))....))))))..).((.((....((((((....))))))....)).))...)))))))))..
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Burkholderia-cepacia-2
|
GGCCUGAUGACCAUAGCGAGUCGGUCCCACCCCUUCCCAUCCCGAACAGGACCGUGAAACGACUCUACGCCGAUGAUAGUGCGGAUUCCCGUGUGAAAGUAGGUAAUCGUCAGGCU
|
((((((((((.....(.((((((.....((.(((.............)))...))....))))))..).((.((....((((((....))))))....)).))...))))))))))
|
5S_rRNA
|
5S_rRNA-Burkholderia-cepacia-3
|
UGCCUGAUGACCAUAGCGAGUCGGUCCCACCCCUUCCCAUCCCGAACAGGACCGUGAAACGACUCUACGCCGAUGAUAGUGCGGAUUCCCGUGUGAAAGUAGGUAAUCGUCAGGC
|
.(((((((((.....(.((((((.....((.(((.............)))...))....))))))..).((.((....((((((....))))))....)).))...)))))))))
|
5S_rRNA
|
Subsets and Splits
No community queries yet
The top public SQL queries from the community will appear here once available.