tokens
listlengths 2
204
| ner_tags
listlengths 2
204
|
---|---|
[
"However",
",",
"it",
"was",
"not",
"detected",
"in",
"lymphoid",
"cells",
"MOLT4",
"(",
"T",
"cell",
")",
"and",
"BALL1",
"(",
"B",
"cell",
")",
",",
"nor",
"in",
"K562",
"erythroblasts",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CELL_TYPE",
"I-CELL_TYPE",
"B-CELL_LINE",
"O",
"B-CELL_TYPE",
"I-CELL_TYPE",
"O",
"O",
"B-CELL_LINE",
"O",
"B-CELL_TYPE",
"I-CELL_TYPE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CELL_LINE",
"I-CELL_LINE",
"O"
] |
[
"Furthermore",
",",
"a",
"specific",
"induction",
"of",
"AhR",
"during",
"monocytic",
"differentiation",
"was",
"investigated",
"in",
"HL60",
"and",
"HEL",
"cells",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CELL_LINE",
"O",
"B-CELL_LINE",
"I-CELL_LINE",
"O"
] |
[
"HL60",
"cells",
"were",
"induced",
"to",
"differentiate",
"toward",
"monocytes-macrophages",
"by",
"incubation",
"with",
"phorbol",
"ester",
",",
"showing",
"a",
"5-",
"to",
"2-fold",
"increase",
"of",
"AhR",
"mRNA",
"."
] |
[
"B-CELL_LINE",
"I-CELL_LINE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CELL_TYPE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-RNA",
"I-RNA",
"O"
] |
[
"The",
"incubation",
"with",
"transforming",
"growth",
"factor",
"beta",
"1",
"and",
"1",
"alpha",
",",
"25-dihydroxyvitamin",
"D3",
"resulted",
"in",
"a",
"5-",
"to",
"7-fold",
"increase",
"of",
"AhR",
"mRNA",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-RNA",
"I-RNA",
"O"
] |
[
"The",
"HEL",
"cells",
"also",
"exhibited",
"a",
"similar",
"elevation",
"of",
"AhR",
"mRNA",
"level",
",",
"when",
"they",
"had",
"differentiated",
"toward",
"monocyte-macrophage",
"cells",
"by",
"these",
"combined",
"inducers",
",",
"but",
"little",
"change",
"in",
"the",
"mRNA",
"level",
"was",
"observed",
"when",
"the",
"cells",
"were",
"induced",
"to",
"differentiate",
"into",
"other",
"cell",
"types",
"."
] |
[
"O",
"B-CELL_LINE",
"I-CELL_LINE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-RNA",
"I-RNA",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CELL_TYPE",
"I-CELL_TYPE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Treatment",
"of",
"the",
"differentiated",
"HL60",
"cells",
"with",
"3-methylcholanthrene",
",",
"a",
"ligand",
"of",
"AhR",
",",
"induced",
"the",
"expression",
"of",
"the",
"P450IA1",
"gene",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B-CELL_LINE",
"I-CELL_LINE",
"I-CELL_LINE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O"
] |
[
"These",
"results",
"indicated",
"that",
"expression",
"of",
"AhR",
"mRNA",
"was",
"significantly",
"induced",
"during",
"monocytic",
"differentiation",
"and",
"that",
"the",
"differentiated",
"cells",
"were",
"responsive",
"to",
"xenobiotics",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-RNA",
"I-RNA",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CELL_TYPE",
"I-CELL_TYPE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Our",
"results",
"suggest",
"that",
"AhR",
"may",
"play",
"an",
"important",
"role",
"in",
"the",
"function",
"of",
"monocytes",
"and",
"also",
"in",
"the",
"eventual",
"activation",
"of",
"environmental",
"carcinogens",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CELL_TYPE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Neutrophils",
"and",
"monocytes",
"express",
"high",
"levels",
"of",
"PU.1",
"(",
"Spi-1",
")",
"but",
"not",
"Spi-B",
"."
] |
[
"B-CELL_TYPE",
"O",
"B-CELL_TYPE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O"
] |
[
"PU.1",
"(",
"the",
"Spi-1",
"oncogene",
")",
"and",
"Spi-B",
"are",
"closely",
"related",
"members",
"of",
"the",
"ets",
"transcription",
"factor",
"family",
",",
"sharing",
"similar",
"DNA",
"binding",
"specificities",
"mediated",
"by",
"similar",
"DNA",
"binding",
"domains",
"."
] |
[
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"B-DNA",
"I-DNA",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O"
] |
[
"PU.1",
"and",
"Spi-B",
"have",
"been",
"previously",
"described",
"as",
"being",
"predominantly",
"expressed",
"coordinately",
"in",
"macrophages",
"and",
"B",
"cells",
",",
"but",
"their",
"expression",
"in",
"early",
"hematopoietic",
"stages",
"and",
"during",
"the",
"course",
"of",
"myeloid",
"differentiation",
"to",
"monocytes",
"and",
"macrophages",
"or",
"to",
"neutrophils",
"has",
"not",
"been",
"extensively",
"investigated",
"."
] |
[
"B-PROTEIN",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CELL_TYPE",
"O",
"B-CELL_TYPE",
"I-CELL_TYPE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CELL_TYPE",
"O",
"B-CELL_TYPE",
"O",
"O",
"B-CELL_TYPE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Here",
",",
"we",
"report",
"that",
"PU.1",
"mRNA",
"is",
"upregulated",
"during",
"myeloid",
"differentiation",
"of",
"human",
"purified",
"CD34+",
"cells",
"and",
"murine",
"multipotential",
"FDCP-mix",
"A4",
"cells",
",",
"suggesting",
"that",
"PU.1",
"is",
"upregulated",
"as",
"an",
"early",
"event",
"during",
"differentiation",
"of",
"multipotential",
"progenitor",
"cells",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-RNA",
"I-RNA",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CELL_LINE",
"I-CELL_LINE",
"I-CELL_LINE",
"I-CELL_LINE",
"O",
"B-CELL_LINE",
"I-CELL_LINE",
"I-CELL_LINE",
"I-CELL_LINE",
"I-CELL_LINE",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CELL_TYPE",
"I-CELL_TYPE",
"I-CELL_TYPE",
"O"
] |
[
"PU.1",
"expression",
"is",
"maintained",
"at",
"stable",
"levels",
"during",
"differentiation",
"of",
"myeloid",
"cell",
"lines",
"U937",
"and",
"HL-60",
"to",
"monocytic",
"and",
"neutrophilic",
"cells",
"."
] |
[
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CELL_LINE",
"I-CELL_LINE",
"I-CELL_LINE",
"B-CELL_LINE",
"O",
"B-CELL_LINE",
"O",
"B-CELL_TYPE",
"I-CELL_TYPE",
"I-CELL_TYPE",
"I-CELL_TYPE",
"O"
] |
[
"PU.1",
"is",
"expressed",
"at",
"highest",
"levels",
"in",
"mature",
"human",
"monocytes",
"and",
"human",
"peripheral",
"blood",
"neutrophils",
"."
] |
[
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CELL_TYPE",
"I-CELL_TYPE",
"I-CELL_TYPE",
"O",
"B-CELL_TYPE",
"I-CELL_TYPE",
"I-CELL_TYPE",
"I-CELL_TYPE",
"O"
] |
[
"In",
"contrast",
"to",
"PU.1",
",",
"significant",
"levels",
"of",
"Spi-B",
"mRNA",
"and",
"protein",
"are",
"found",
"only",
"in",
"some",
"B-cell",
"lines",
"and",
"spleen",
"but",
"are",
"not",
"found",
"in",
"myeloid",
"cell",
"lines",
",",
"neutrophils",
",",
"or",
"macrophages",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-RNA",
"I-RNA",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CELL_LINE",
"I-CELL_LINE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CELL_LINE",
"I-CELL_LINE",
"I-CELL_LINE",
"O",
"B-CELL_TYPE",
"O",
"O",
"B-CELL_TYPE",
"O"
] |
[
"In",
"vitro",
"translated",
"Spi-B",
"protein",
"can",
"bind",
"to",
"PU.1",
"binding",
"sites",
"in",
"myeloid",
"promoters",
"and",
"transactivate",
"these",
"promoters",
"in",
"nonmyeloid",
"cells",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA",
"I-DNA",
"I-DNA",
"O",
"B-DNA",
"I-DNA",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA",
"O",
"B-CELL_TYPE",
"I-CELL_TYPE",
"O"
] |
[
"Therefore",
",",
"although",
"PU.1",
"and",
"Spi-B",
"may",
"bind",
"to",
"similar",
"DNA",
"control",
"elements",
"and",
"have",
"redundancy",
"of",
"transactivation",
"function",
"in",
"vitro",
",",
"the",
"lack",
"of",
"significant",
"levels",
"of",
"Spi-B",
"in",
"myeloid",
"cells",
"makes",
"it",
"unlikely",
"that",
"Spi-B",
"plays",
"a",
"significant",
"role",
"in",
"myeloid",
"lineage",
"development",
"and",
"gene",
"expression",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"B-CELL_TYPE",
"I-CELL_TYPE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"contrast",
",",
"PU.1",
"is",
"expressed",
"at",
"high",
"levels",
"not",
"only",
"in",
"monocytes",
"and",
"macrophages",
"but",
"also",
"in",
"neutrophils",
",",
"indicating",
"that",
"PU.1",
"can",
"activate",
"gene",
"expression",
"in",
"both",
"major",
"myeloid",
"lineages",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CELL_TYPE",
"O",
"B-CELL_TYPE",
"O",
"O",
"O",
"B-CELL_TYPE",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CELL_TYPE",
"I-CELL_TYPE",
"I-CELL_TYPE",
"O"
] |
[
"Identification",
"of",
"a",
"major",
"positive",
"regulatory",
"element",
"located",
"5",
"'",
"to",
"the",
"human",
"zeta-globin",
"gene",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA",
"I-DNA",
"I-DNA",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA",
"I-DNA",
"I-DNA",
"O"
] |
[
"The",
"function",
"of",
"the",
"zeta-globin",
"promoter",
"was",
"studied",
"using",
"a",
"series",
"of",
"zeta-globin",
"promoter",
"deletion",
"constructs",
"to",
"drive",
"luciferase",
"expression",
"in",
"transiently",
"transfected",
"human",
"erythroleukemia",
"cells",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA",
"I-DNA",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA",
"I-DNA",
"I-DNA",
"I-DNA",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"B-CELL_LINE",
"I-CELL_LINE",
"I-CELL_LINE",
"I-CELL_LINE",
"I-CELL_LINE",
"O"
] |
[
"The",
"promoters",
"were",
"used",
"without",
"enhancers",
",",
"or",
"with",
"enhancers",
"derived",
"from",
"the",
"beta-globin",
"locus",
"control",
"region",
"and",
"the",
"alpha-globin",
"HS-40",
"enhancer",
"."
] |
[
"O",
"B-DNA",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA",
"I-DNA",
"I-DNA",
"I-DNA",
"O",
"O",
"B-DNA",
"I-DNA",
"I-DNA",
"O"
] |
[
"When",
"transfected",
"into",
"K562",
"cells",
",",
"which",
"express",
"zeta-globin",
",",
"comparable",
"amounts",
"of",
"activity",
"were",
"obtained",
"from",
"the",
"-557",
"and",
"-417",
"zeta-luciferase",
"constructs",
"and",
"the",
"alpha-luciferase",
"constructs",
"when",
"no",
"enhancers",
"or",
"the",
"alpha-globin",
"locus",
"enhancers",
"were",
"used",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B-CELL_LINE",
"I-CELL_LINE",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA",
"I-DNA",
"I-DNA",
"I-DNA",
"I-DNA",
"O",
"O",
"B-DNA",
"I-DNA",
"O",
"O",
"B-DNA",
"O",
"O",
"B-DNA",
"I-DNA",
"I-DNA",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"When",
"the",
"constructs",
"were",
"transfected",
"into",
"OCIM1",
"cells",
",",
"which",
"do",
"not",
"express",
"zeta-globin",
",",
"the",
"zeta-globin",
"promoters",
"were",
"at",
"best",
"20",
"%",
"as",
"active",
"as",
"the",
"alpha-globin",
"promoters",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CELL_LINE",
"I-CELL_LINE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"B-DNA",
"I-DNA",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA",
"I-DNA",
"O"
] |
[
"When",
"sequences",
"from",
"-417",
"to",
"-207",
"5",
"'",
"to",
"the",
"zeta-globin",
"mRNA",
"cap",
"site",
"were",
"deleted",
",",
"up",
"to",
"95",
"%",
"of",
"the",
"zeta-globin",
"promoter",
"activity",
"was",
"lost",
"in",
"K562",
"cells",
"."
] |
[
"O",
"B-DNA",
"I-DNA",
"I-DNA",
"I-DNA",
"I-DNA",
"I-DNA",
"I-DNA",
"O",
"O",
"B-RNA",
"I-RNA",
"I-RNA",
"I-RNA",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA",
"I-DNA",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CELL_LINE",
"I-CELL_LINE",
"O"
] |
[
"Reinsertion",
"of",
"these",
"sequences",
"into",
"zeta-luciferase",
"constructs",
"missing",
"the",
"-417",
"to",
"-207",
"region",
"showed",
"that",
"the",
"sequences",
"lack",
"classical",
"enhancer",
"activity",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA",
"I-DNA",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Point",
"mutation",
"of",
"a",
"GATA-1",
"site",
"at",
"-230",
"reduced",
"promoter",
"activity",
"by",
"37",
"%",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA",
"I-DNA",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Point",
"mutation",
"of",
"a",
"CCACC",
"site",
"at",
"-240",
"had",
"no",
"effect",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA",
"I-DNA",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Electrophoretic",
"mobility",
"shift",
"assays",
"indicated",
"that",
"the",
"-230",
"GATA-1",
"site",
"has",
"a",
"relatively",
"low",
"affinity",
"for",
"GATA-1",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA",
"I-DNA",
"I-DNA",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O"
] |
[
"These",
"experiments",
"show",
"the",
"presence",
"of",
"a",
"strong",
"positive-acting",
"element",
",",
"located",
"between",
"-417",
"and",
"-207",
"bp",
"5",
"'",
"to",
"the",
"zeta-globin",
"mRNA",
"cap",
"site",
",",
"is",
"necessary",
"for",
"high-level",
"promoter",
"activity",
"in",
"K562",
"cells",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA",
"I-DNA",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA",
"I-DNA",
"I-DNA",
"I-DNA",
"I-DNA",
"I-DNA",
"O",
"O",
"B-DNA",
"I-DNA",
"I-DNA",
"I-DNA",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CELL_LINE",
"I-CELL_LINE",
"O"
] |
[
"This",
"element",
"requires",
"GATA-1",
"and",
"additional",
"unknown",
"factors",
"for",
"maximal",
"activity",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Analysis",
"of",
"the",
"role",
"of",
"protein",
"kinase",
"C-alpha",
",",
"-epsilon",
",",
"and",
"-zeta",
"in",
"T",
"cell",
"activation",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"T",
"cells",
"express",
"multiple",
"isotypes",
"of",
"protein",
"kinase",
"C",
"(",
"PKC",
")",
"and",
"although",
"it",
"is",
"well",
"accepted",
"that",
"PKCs",
"have",
"an",
"important",
"role",
"in",
"T",
"cell",
"activation",
",",
"little",
"is",
"known",
"about",
"the",
"function",
"of",
"individual",
"PKC",
"isotypes",
"."
] |
[
"B-CELL_TYPE",
"I-CELL_TYPE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O"
] |
[
"To",
"address",
"this",
"issue",
",",
"mutationally",
"active",
"PKC-alpha",
",",
"-epsilon",
",",
"or",
"-zeta",
"have",
"been",
"transfected",
"into",
"T",
"cells",
"and",
"the",
"consequences",
"for",
"T",
"cell",
"activation",
"determined",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CELL_TYPE",
"I-CELL_TYPE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"p21ras",
"plays",
"an",
"essential",
"role",
"in",
"T",
"cell",
"activation",
"."
] |
[
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Accordingly",
",",
"the",
"effects",
"of",
"the",
"constitutively",
"active",
"PKCs",
"were",
"compared",
"to",
"the",
"effects",
"of",
"mutationally",
"activated",
"p21ras",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O"
] |
[
"The",
"data",
"indicate",
"that",
"PKC-epsilon",
"and",
",",
"to",
"a",
"lesser",
"extent",
"PKC-alpha",
"but",
"not",
"-zeta",
",",
"can",
"regulate",
"the",
"transcription",
"factors",
"AP-1",
"and",
"nuclear",
"factor",
"of",
"activated",
"T",
"cells",
"(",
"NF-AT-1",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"ability",
"of",
"PKC-epsilon",
"to",
"induce",
"transactivation",
"of",
"NF-AT-1",
"and",
"AP-1",
"was",
"similar",
"to",
"the",
"stimulatory",
"effect",
"of",
"a",
"constitutively",
"activated",
"p21ras",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O"
] |
[
"PKC-epsilon",
",",
"but",
"not",
"PKC-alpha",
"nor",
"activated",
"p21ras",
",",
"was",
"able",
"to",
"induce",
"NF-KB",
"activity",
"."
] |
[
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O"
] |
[
"Phorbol",
"esters",
"induce",
"expression",
"of",
"CD69",
"whereas",
"none",
"of",
"the",
"activated",
"PKC",
"isotypes",
"tested",
"were",
"able",
"to",
"have",
"this",
"effect",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Activated",
"Src",
"and",
"p21ras",
"were",
"able",
"to",
"induce",
"CD69",
"expression",
"."
] |
[
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O"
] |
[
"These",
"results",
"indicate",
"selective",
"functions",
"for",
"different",
"PKC",
"isotypes",
"in",
"T",
"cells",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"B-CELL_TYPE",
"I-CELL_TYPE",
"O"
] |
[
"Moreover",
",",
"the",
"data",
"comparing",
"the",
"effects",
"of",
"activated",
"Ras",
"and",
"PKC",
"mutants",
"suggest",
"that",
"PKC-alpha",
",",
"p21ras",
",",
"and",
"PKC-epsilon",
"are",
"not",
"positioned",
"linearly",
"on",
"a",
"single",
"signal",
"transduction",
"pathway",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Differences",
"in",
"binding",
"of",
"glucocorticoid",
"receptor",
"to",
"DNA",
"in",
"steroid-resistant",
"asthma",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Although",
"glucocorticosteroids",
"are",
"a",
"very",
"effective",
"treatment",
"for",
"asthma",
"and",
"other",
"chronic",
"inflammatory",
"diseases",
",",
"a",
"small",
"proportion",
"of",
"patients",
"are",
"resistant",
"to",
"their",
"therapeutic",
"effects",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"molecular",
"mechanism",
"for",
"this",
"steroid",
"resistance",
"is",
"unclear",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Steroid",
"resistance",
"can",
"not",
"be",
"explained",
"by",
"pharmacokinetic",
"mechanisms",
",",
"by",
"a",
"defect",
"in",
"the",
"binding",
"of",
"steroids",
"to",
"glucocorticoid",
"receptors",
",",
"nor",
"by",
"defective",
"nuclear",
"translocation",
"of",
"this",
"receptor",
",",
"thereby",
"suggesting",
"that",
"the",
"molecular",
"abnormality",
"lies",
"distal",
"to",
"nuclear",
"translocation",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"examined",
"the",
"ability",
"of",
"nuclear",
"translocated",
"glucocorticoid",
"receptors",
"to",
"bind",
"to",
"their",
"DNA",
"binding",
"sites",
"(",
"GRE",
")",
"using",
"electrophoretic",
"mobility",
"shift",
"assays",
"in",
"PBMC",
"from",
"patients",
"with",
"steroid-sensitive",
"and",
"steroid-resistant",
"asthma",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA",
"I-DNA",
"I-DNA",
"O",
"B-DNA",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CELL_TYPE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"binding",
"of",
"the",
"glucocorticoid",
"receptor",
"to",
"DNA",
"in",
"these",
"patients",
"was",
"also",
"studied",
"using",
"Scatchard",
"analysis",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Dexamethasone",
"induced",
"a",
"significant",
"rapid",
"and",
"sustained",
"twofold",
"increase",
"in",
"GRE",
"binding",
"in",
"PBMCs",
"from",
"steroid-sensitive",
"asthmatic",
"patients",
"and",
"nonasthmatic",
"individuals",
",",
"but",
"this",
"was",
"markedly",
"reduced",
"in",
"steroid-resistant",
"asthmatic",
"patients",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA",
"O",
"O",
"B-CELL_TYPE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Scatchard",
"analysis",
"of",
"glucocorticoid",
"receptor",
"-",
"GRE",
"binding",
"showed",
"no",
"change",
"in",
"binding",
"affinity",
"but",
"did",
"show",
"a",
"reduced",
"number",
"of",
"receptors",
"available",
"for",
"DNA",
"binding",
"in",
"the",
"steroid-resistant",
"patients",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"B-DNA",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"These",
"results",
"suggest",
"that",
"the",
"ability",
"of",
"the",
"glucocorticoid",
"receptor",
"to",
"bind",
"to",
"GRE",
"is",
"impaired",
"in",
"steroid-resistant",
"patients",
"because",
"of",
"a",
"reduced",
"number",
"of",
"receptors",
"available",
"for",
"binding",
"to",
"DNA",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Interleukin-5",
"signaling",
"in",
"human",
"eosinophils",
"involves",
"JAK2",
"tyrosine",
"kinase",
"and",
"Stat1",
"alpha",
"."
] |
[
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"B-CELL_TYPE",
"I-CELL_TYPE",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O"
] |
[
"Signaling",
"by",
"a",
"wide",
"variety",
"of",
"cytokines",
",",
"including",
"interferons",
",",
"interleukins",
",",
"and",
"growth",
"factors",
",",
"involves",
"activation",
"of",
"JAK",
"kinases",
"and",
"Stat",
"(",
"Signal",
"transducers",
"and",
"activators",
"of",
"transcription",
")",
"proteins",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O"
] |
[
"At",
"present",
",",
"not",
"much",
"is",
"known",
"about",
"the",
"molecular",
"mechanisms",
"by",
"which",
"interleukin-5",
"(",
"IL-5",
")",
"exerts",
"its",
"diverse",
"biologic",
"effects",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Human",
"eosinophils",
"are",
"one",
"of",
"the",
"most",
"important",
"target",
"cells",
"for",
"IL-5",
"and",
"were",
"used",
"here",
"to",
"study",
"IL-5",
"signaling",
"in",
"a",
"primary",
"human",
"cell",
"."
] |
[
"B-CELL_TYPE",
"I-CELL_TYPE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CELL_TYPE",
"I-CELL_TYPE",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"B-CELL_TYPE",
"I-CELL_TYPE",
"I-CELL_TYPE",
"O"
] |
[
"IL-5",
"induced",
"rapid",
"and",
"transient",
"tyrosine",
"phosphorylation",
"of",
"JAK2",
"."
] |
[
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O"
] |
[
"Moreover",
",",
"IL-5",
"induced",
"at",
"least",
"two",
"DNA-binding",
"complexes",
",",
"using",
"nuclear",
"extracts",
"from",
"normal",
"human",
"eosinophils",
"and",
"the",
"IL-6/interferon-gamma",
"response",
"element",
"of",
"the",
"ICAM-1",
"promoter",
"(",
"ICAM-1",
"pIRE",
")",
"in",
"an",
"electromobility",
"shift",
"assay",
"."
] |
[
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CELL_TYPE",
"I-CELL_TYPE",
"O",
"O",
"B-DNA",
"I-DNA",
"I-DNA",
"O",
"O",
"B-DNA",
"I-DNA",
"O",
"B-DNA",
"I-DNA",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"From",
"supershift",
"experiments",
"it",
"was",
"concluded",
"that",
"one",
"DNA-binding",
"complex",
"contained",
"Stat1",
"alpha",
",",
"probably",
"as",
"a",
"homodimer",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Both",
"DNA-binding",
"complexes",
"were",
"inhibited",
"by",
"a",
"phosphotyrosine",
"antibody",
"(",
"4G10",
")",
",",
"suggesting",
"that",
"tyrosine",
"phosphorylation",
"is",
"required",
"for",
"complex",
"formation",
"."
] |
[
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"IL-3",
"and",
"granulocyte-macrophage",
"colony-stimulating",
"factor",
"induced",
",",
"similar",
"to",
"IL-5",
",",
"two",
"DNA-binding",
"complexes",
"in",
"human",
"eosinophils",
",",
"including",
"Stat1",
"alpha",
"."
] |
[
"B-PROTEIN",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"B-CELL_TYPE",
"I-CELL_TYPE",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O"
] |
[
"These",
"data",
"show",
"for",
"the",
"first",
"time",
"that",
"molecular",
"mechanisms",
"of",
"IL-5",
"signaling",
"in",
"human",
"eosinophils",
"involve",
"members",
"of",
"the",
"JAK",
"kinase",
"family",
"as",
"well",
"as",
"members",
"of",
"the",
"Stat",
"family",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"B-CELL_TYPE",
"I-CELL_TYPE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O"
] |
[
"Infection",
"and",
"replication",
"of",
"Tat-",
"human",
"immunodeficiency",
"viruses",
":",
"genetic",
"analyses",
"of",
"LTR",
"and",
"tat",
"mutations",
"in",
"primary",
"and",
"long-term",
"human",
"lymphoid",
"cells",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"B-CELL_TYPE",
"I-CELL_TYPE",
"I-CELL_TYPE",
"I-CELL_TYPE",
"I-CELL_TYPE",
"I-CELL_TYPE",
"O"
] |
[
"Tat",
"is",
"an",
"essential",
"regulatory",
"protein",
"for",
"the",
"replication",
"of",
"human",
"immunodeficiency",
"virus",
"(",
"HIV",
")",
"."
] |
[
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Mutations",
"in",
"the",
"tat",
"gene",
"have",
"been",
"shown",
"to",
"block",
"HIV",
"replication",
"in",
"human",
"T",
"cells",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B-DNA",
"I-DNA",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CELL_TYPE",
"I-CELL_TYPE",
"I-CELL_TYPE",
"O"
] |
[
"Several",
"studies",
"have",
"established",
"that",
"Tat",
"releases",
"an",
"elongation",
"block",
"to",
"the",
"transcription",
"of",
"HIV",
"long",
"terminal",
"repeat",
"(",
"LTR",
")",
";",
"however",
",",
"it",
"is",
"not",
"known",
"whether",
"this",
"mechanism",
"alone",
"is",
"sufficient",
"to",
"explain",
"the",
"block",
"to",
"HIV",
"replication",
"in",
"human",
"T",
"cells",
"when",
"Tat",
"is",
"absent",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA",
"I-DNA",
"I-DNA",
"I-DNA",
"O",
"B-DNA",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CELL_TYPE",
"I-CELL_TYPE",
"I-CELL_TYPE",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"It",
"is",
"possible",
"that",
"Tat",
"is",
"also",
"needed",
"for",
"other",
"functions",
"during",
"HIV",
"replication",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"To",
"test",
"these",
"hypotheses",
",",
"we",
"studied",
"several",
"tat",
"mutants",
",",
"including",
"two",
"stop",
"codon",
"mutants",
"and",
"one",
"deletion",
"mutant",
"using",
"replication-competent",
"HIV-1",
"constructs",
"carrying",
"wild-type",
"or",
"mutant",
"LTRs",
"with",
"modifications",
"in",
"the",
"NF-kappa",
"B",
"and/or",
"Sp1",
"binding",
"sites",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"B-DNA",
"I-DNA",
"I-DNA",
"O",
"B-DNA",
"I-DNA",
"I-DNA",
"I-DNA",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA",
"I-DNA",
"I-DNA",
"I-DNA",
"I-DNA",
"I-DNA",
"O"
] |
[
"In",
"this",
"study",
",",
"we",
"show",
"that",
"Tat-",
"HIV-1",
"with",
"wild-type",
"LTRs",
"can",
"replicate",
"in",
"HeLa",
"cells",
",",
"and",
"the",
"virus",
"produced",
"from",
"HeLa",
"cells",
"can",
"infect",
"primary",
"peripheral",
"blood",
"lymphocytes",
"and",
"macrophages",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA",
"I-DNA",
"O",
"O",
"O",
"B-CELL_LINE",
"I-CELL_LINE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CELL_LINE",
"I-CELL_LINE",
"O",
"O",
"O",
"B-CELL_TYPE",
"I-CELL_TYPE",
"I-CELL_TYPE",
"O",
"B-CELL_TYPE",
"O"
] |
[
"It",
"was",
"found",
"that",
"the",
"propagation",
"of",
"the",
"Tat",
"mutants",
"containing",
"wild-type",
"LTRs",
"was",
"less",
"efficient",
"than",
"that",
"of",
"the",
"LTR-modified",
"Tat",
"mutants",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"B-DNA",
"I-DNA",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O"
] |
[
"Large",
"amounts",
"of",
"viral",
"RNA",
"and",
"particles",
"were",
"synthesized",
"in",
"infections",
"established",
"using",
"the",
"tat",
"mutants",
"that",
"contain",
"modified",
"LTRs",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B-RNA",
"I-RNA",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"O",
"B-DNA",
"I-DNA",
"O"
] |
[
"However",
",",
"this",
"efficient",
"propagation",
"of",
"the",
"LTR-modified",
"tat",
"mutants",
"was",
"restricted",
"to",
"some",
"lymphoid",
"cell",
"lines",
"that",
"have",
"been",
"transformed",
"with",
"other",
"viruses",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CELL_LINE",
"I-CELL_LINE",
"I-CELL_LINE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Thus",
",",
"despite",
"its",
"essential",
"role",
"for",
"releasing",
"an",
"elongation",
"block",
",",
"Tat",
"is",
"not",
"otherwise",
"absolutely",
"required",
"for",
"synthesis",
"of",
"full-length",
"HIV",
"transcripts",
"and",
"assembly",
"of",
"virus",
"particles",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-RNA",
"I-RNA",
"I-RNA",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Direct",
"sequencing",
"of",
"the",
"viral",
"genomes",
"and",
"reinfection",
"kinetics",
"showed",
"no",
"evidence",
"of",
"wild-type",
"reversion",
"even",
"after",
"prolonged",
"infection",
"with",
"the",
"Tat",
"-virus",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA",
"I-DNA",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"implications",
"for",
"in",
"vivo",
"HIV-1",
"replication",
"and",
"potential",
"application",
"of",
"this",
"system",
"to",
"the",
"study",
"of",
"alternative",
"Tat",
"function",
"are",
"discussed",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Functional",
"roles",
"of",
"the",
"transcription",
"factor",
"Oct-2A",
"and",
"the",
"high",
"mobility",
"group",
"protein",
"I/Y",
"in",
"HLA-DRA",
"gene",
"expression",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"B-PROTEIN",
"O",
"B-DNA",
"I-DNA",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"class",
"II",
"major",
"histocompatibility",
"complex",
"gene",
"HLA-DRA",
"is",
"expressed",
"in",
"B",
"cells",
",",
"activated",
"T",
"lymphocytes",
",",
"and",
"in",
"antigen-presenting",
"cells",
"."
] |
[
"O",
"B-DNA",
"I-DNA",
"I-DNA",
"I-DNA",
"I-DNA",
"I-DNA",
"B-DNA",
"O",
"O",
"O",
"B-CELL_TYPE",
"I-CELL_TYPE",
"O",
"O",
"B-CELL_TYPE",
"I-CELL_TYPE",
"O",
"O",
"O",
"B-CELL_TYPE",
"I-CELL_TYPE",
"O"
] |
[
"In",
"addition",
",",
"HLA-DRA",
"gene",
"expression",
"is",
"inducible",
"in",
"a",
"variety",
"of",
"cell",
"types",
"by",
"interferon-gamma",
"(",
"IFN-gamma",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B-DNA",
"I-DNA",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O"
] |
[
"Here",
"we",
"show",
"that",
"the",
"lymphoid-specific",
"transcription",
"factor",
"Oct-2A",
"plays",
"a",
"critical",
"role",
"in",
"HLA-DRA",
"gene",
"expression",
"in",
"class",
"II-positive",
"B",
"cell",
"lines",
",",
"and",
"that",
"the",
"high",
"mobility",
"group",
"protein",
"(",
"HMG",
")",
"I/Y",
"binds",
"to",
"multiple",
"sites",
"within",
"the",
"DRA",
"promoter",
",",
"including",
"the",
"Oct-2A",
"binding",
"site",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA",
"I-DNA",
"O",
"O",
"B-CELL_LINE",
"I-CELL_LINE",
"I-CELL_LINE",
"I-CELL_LINE",
"I-CELL_LINE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA",
"I-DNA",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA",
"I-DNA",
"I-DNA",
"O"
] |
[
"Coexpression",
"of",
"HMG",
"I/Y",
"and",
"Oct-2",
"in",
"cell",
"lines",
"lacking",
"Oct-2",
"results",
"in",
"high",
"levels",
"of",
"HLA-DRA",
"gene",
"expression",
",",
"and",
"in",
"vitro",
"DNA-binding",
"studies",
"reveal",
"that",
"HMG",
"I/Y",
"stimulates",
"Oct-2A",
"binding",
"to",
"the",
"HLA-DRA",
"promoter",
"."
] |
[
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"B-CELL_LINE",
"I-CELL_LINE",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA",
"I-DNA",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA",
"I-DNA",
"O"
] |
[
"Thus",
",",
"Oct-2A",
"and",
"HMG",
"I/Y",
"may",
"synergize",
"to",
"activate",
"HLA-DRA",
"expression",
"in",
"B",
"cells",
"."
] |
[
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA",
"O",
"O",
"B-CELL_TYPE",
"I-CELL_TYPE",
"O"
] |
[
"By",
"contrast",
",",
"Oct-2A",
"is",
"not",
"involved",
"in",
"the",
"IFN-gamma",
"induction",
"of",
"the",
"HLA-DRA",
"gene",
"in",
"HeLa",
"cells",
",",
"but",
"antisense",
"HMG",
"I/Y",
"dramatically",
"decreases",
"the",
"level",
"of",
"induction",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA",
"I-DNA",
"O",
"B-CELL_LINE",
"I-CELL_LINE",
"O",
"O",
"B-DNA",
"I-DNA",
"I-DNA",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"conclude",
"that",
"distinct",
"sets",
"of",
"transcription",
"factors",
"are",
"involved",
"in",
"the",
"two",
"modes",
"of",
"HLA-DRA",
"expression",
",",
"and",
"that",
"HMG",
"I/Y",
"may",
"be",
"important",
"for",
"B",
"cell-specific",
"expression",
",",
"and",
"is",
"essential",
"for",
"IFN-gamma",
"induction",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O"
] |
[
"Heterogeneous",
"expression",
"of",
"Epstein-Barr",
"virus",
"latent",
"proteins",
"in",
"endemic",
"Burkitt",
"'s",
"lymphoma",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Epstein-Barr",
"virus",
"(",
"EBV",
")",
"-infected",
"cells",
"may",
"sustain",
"three",
"distinct",
"forms",
"of",
"virus",
"latency",
"."
] |
[
"B-CELL_TYPE",
"I-CELL_TYPE",
"I-CELL_TYPE",
"I-CELL_TYPE",
"I-CELL_TYPE",
"I-CELL_TYPE",
"I-CELL_TYPE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"lymphoblastoid",
"cell",
"lines",
",",
"six",
"EBV-encoded",
"nuclear",
"antigens",
"(",
"EBNA1",
",",
"2",
",",
"3A",
",",
"3B",
",",
"3C",
",",
"-LP",
")",
",",
"three",
"latent",
"membrane",
"proteins",
"(",
"LMP1",
",",
"2A",
",",
"2B",
")",
",",
"and",
"two",
"nuclear",
"RNAs",
"(",
"EBERs",
")",
"are",
"expressed",
"."
] |
[
"O",
"B-CELL_LINE",
"I-CELL_LINE",
"I-CELL_LINE",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-RNA",
"I-RNA",
"O",
"B-RNA",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"This",
"form",
"of",
"latency",
",",
"termed",
"latency",
"III",
",",
"is",
"also",
"encountered",
"in",
"some",
"posttransplant",
"lymphoproliferative",
"disorders",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"EBV-positive",
"cases",
"of",
"Hodgkin",
"'s",
"disease",
",",
"the",
"EBERs",
",",
"EBNA1",
",",
"and",
"the",
"LMPs",
"are",
"expressed",
"(",
"latency",
"II",
")",
",",
"whereas",
"in",
"Burkitt",
"'s",
"lymphoma",
"(",
"BL",
")",
"only",
"the",
"EBERs",
"and",
"EBNA1",
"have",
"been",
"detected",
"(",
"latency",
"I",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-RNA",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-RNA",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"have",
"studied",
"the",
"expression",
"of",
"EBV",
"proteins",
"in",
"17",
"cases",
"of",
"EBV-positive",
"endemic",
"BL",
"by",
"immunohistology",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Expression",
"of",
"LMP1",
"was",
"seen",
"in",
"variable",
"proportions",
"of",
"tumor",
"cells",
"in",
"two",
"cases",
"and",
"EBNA2",
"was",
"detected",
"in",
"some",
"tumor",
"cells",
"in",
"three",
"other",
"cases",
"."
] |
[
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CELL_TYPE",
"I-CELL_TYPE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CELL_TYPE",
"I-CELL_TYPE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Also",
",",
"the",
"BZLF1",
"trans-activator",
"protein",
"was",
"expressed",
"in",
"a",
"few",
"tumor",
"cells",
"in",
"6",
"cases",
",",
"indicating",
"entry",
"into",
"the",
"lytic",
"cycle",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CELL_TYPE",
"I-CELL_TYPE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"A",
"phenotypic",
"drift",
"from",
"latency",
"I",
"to",
"latency",
"III",
"has",
"been",
"observed",
"previously",
"in",
"some",
"BL",
"cell",
"lines",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CELL_LINE",
"I-CELL_LINE",
"I-CELL_LINE",
"O"
] |
[
"Our",
"results",
"suggest",
"that",
"a",
"similar",
"phenomenon",
"may",
"occur",
"in",
"BL",
"in",
"vivo",
"and",
"indicate",
"that",
"the",
"operational",
"definition",
"of",
"EBV",
"latencies",
"is",
"not",
"easily",
"applied",
"to",
"human",
"tumors",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"activation",
"of",
"the",
"Jak",
"-STAT",
"1",
"signaling",
"pathway",
"by",
"IL-5",
"in",
"eosinophils",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"B-CELL_TYPE",
"O"
] |
[
"The",
"intracellular",
"signal",
"transduction",
"of",
"IL-5",
"in",
"eosinophils",
"is",
"unknown",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"B-CELL_TYPE",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"objective",
"of",
"this",
"study",
"was",
"to",
"investigate",
"the",
"involvement",
"of",
"the",
"newly",
"discovered",
"Jak",
"-STAT",
"pathway",
"in",
"the",
"IL-5",
"signal",
"transduction",
"mechanism",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Eosinophils",
"were",
"purified",
"from",
"peripheral",
"blood",
"by",
"discontinuous",
"Percoll",
"gradients",
"and",
"stimulated",
"with",
"IL-5",
"."
] |
[
"B-CELL_TYPE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"O"
] |
[
"The",
"involvement",
"of",
"Jak",
"2",
"was",
"investigated",
"by",
"immunoprecipitation",
"followed",
"by",
"immunoblotting",
"for",
"tyrosine",
"phosphorylation",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"activation",
"of",
"Jak",
"2",
"was",
"studied",
"by",
"autophosphorylation",
"of",
"the",
"immunoprecipitated",
"kinase",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O"
] |
[
"Jak",
"2",
"was",
"tyrosine",
"phosphorylated",
"within",
"1",
"to",
"3",
"min",
"after",
"stimulation",
"of",
"eosinophils",
"with",
"IL-5",
"."
] |
[
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CELL_TYPE",
"O",
"B-PROTEIN",
"O"
] |
[
"Further",
",",
"the",
"immunoprecipitated",
"Jak",
"2",
"obtained",
"from",
"IL-5-stimulated",
"cells",
"underwent",
"autophosphorylation",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"I-PROTEIN",
"O",
"O",
"B-CELL_LINE",
"I-CELL_LINE",
"O",
"O",
"O"
] |
Subsets and Splits
No community queries yet
The top public SQL queries from the community will appear here once available.