disi-unibo-nlp/JNLPBA · Datasets at Hugging Face

tokens listlengths 2 204	ner_tags listlengths 2 204
[ "Jak", "2", "coprecipitated", "with", "the", "beta-subunit", "of", "the", "IL-5", "receptor", ",", "suggesting", "a", "physical", "association", "of", "the", "kinase", "with", "the", "receptor", "." ]	[ "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "nuclear", "factor", "STAT-1", "(", "p91", ")", "was", "investigated", "by", "immunoprecipitation", "followed", "by", "immunoblotting", "for", "tyrosine", "phosphorylation", "." ]	[ "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "STAT-1", "was", "tyrosine", "phosphorylated", "within", "15", "min", "of", "IL-5", "stimulation", "." ]	[ "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "O" ]
[ "The", "presence", "of", "STAT-1", "in", "the", "nuclear", "extract", "was", "studied", "by", "electrophoretic", "mobility", "shift", "assay", "." ]	[ "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "IL-5", "induced", "two", "proteins", "that", "bound", "to", "the", "gamma-activating", "sequence", "." ]	[ "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "O" ]
[ "In", "the", "presence", "of", "an", "anti-STAT-1", "Ab", ",", "the", "band", "was", "supershifted", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Thus", ",", "we", "demonstrated", "that", "IL-5", "activated", "the", "Jak", "2", "-STAT", "1", "signaling", "pathway", "in", "eosinophils", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "B-CELL_TYPE", "O" ]
[ "We", "speculate", "that", "the", "Jak", "2", "-STAT", "1", "pathway", "may", "be", "involved", "in", "the", "activation", "of", "IL-5-inducible", "genes", "in", "eosinophils", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "O", "B-CELL_TYPE", "O" ]
[ "Reduced", "mitogenic", "stimulation", "of", "peripheral", "blood", "mononuclear", "cells", "as", "a", "prognostic", "parameter", "for", "the", "course", "of", "breast", "cancer", ":", "a", "prospective", "longitudinal", "study", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-CELL_TYPE", "I-CELL_TYPE", "I-CELL_TYPE", "I-CELL_TYPE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Immunosuppression", "has", "been", "often", "associated", "with", "the", "course", "of", "malignant", "diseases", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "the", "present", "study", ",", "the", "proliferation", "of", "peripheral", "blood", "mononuclear", "cells", "(", "PBMCs", ")", "in", "response", "to", "mitogenic", "stimulation", "with", "phytohaemagglutinin", "(", "PHA", ")", "was", "assessed", "prospectively", "in", "90", "patients", "with", "stage", "I-III", "breast", "cancer", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CELL_TYPE", "I-CELL_TYPE", "I-CELL_TYPE", "I-CELL_TYPE", "O", "B-CELL_TYPE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Whereas", "PHA", "-induced", "proliferation", "of", "PBMCs", "derived", "from", "patients", "with", "breast", "cancer", "preoperatively", "was", "significantly", "decreased", "when", "compared", "with", "data", "obtained", "in", "healthy", "control", "individuals", "(", "P", "<", "0.001", ")", ",", "the", "degree", "of", "the", "defect", "in", "PHA", "-induced", "proliferation", "of", "PBMCs", "depended", "upon", "the", "tumour", "burden", "as", "manifested", "by", "tumour", "size", "and", "axillary", "lymph", "node", "involvement", "(", "P", "<", "0.003", "in", "each", "case", ")", "." ]	[ "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "B-CELL_TYPE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "B-CELL_TYPE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "PHA", "-induced", "proliferation", "of", "PBMCs", "dropped", "significantly", "in", "patients", "who", "received", "adjuvant", "chemotherapy", "consisting", "of", "cyclophosphamide", ",", "methotrexate", "and", "fluorouracil", "(", "CMF", ")", "after", "an", "observation", "period", "of", "6", "months", "(", "P", "<", "0.01", ")", ",", "but", "not", "in", "patients", "under", "adjuvant", "treatment", "with", "tamoxifen", "only", "." ]	[ "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "B-CELL_TYPE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "After", "an", "additional", "6", "months", "(", "i.e.", "12", "months", "after", "surgery", ")", ",", "PHA", "-induced", "proliferation", "of", "PBMCs", "was", "similar", "in", "patients", "after", "adjuvant", "chemotherapy", "with", "CMF", "and", "in", "those", "receiving", "continued", "adjuvant", "tamoxifen", "treatment", "(", "P", ">", "0.1", ")", ",", "but", "in", "all", "patients", "still", "significantly", "decreased", "as", "compared", "with", "healthy", "controls", "(", "P", "<", "0.001", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "B-CELL_TYPE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "When", "data", "obtained", "preoperatively", "and", "after", "12", "months", "were", "compared", ",", "it", "was", "found", "that", "out", "of", "23", "patients", "whose", "PBMCs", "had", "experienced", "a", "drop", "in", "their", "PHA", "-induced", "proliferation", ",", "14", "(", "61", "%", ")", "had", "developed", "metastatic", "disease", "within", "the", "subsequent", "24", "months", "(", "i.e.", "36", "months", "after", "surgery", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CELL_TYPE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "contrast", ",", "out", "of", "59", "patients", "whose", "PBMCs", "showed", "an", "increase", "in", "their", "PHA", "-induced", "proliferation", "within", "the", "first", "12", "months", "after", "surgery", ",", "only", "one", "(", "2", "%", ")", "presented", "with", "disease", "progression", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CELL_TYPE", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "thus", "conclude", "that", "PHA", "-induced", "proliferation", "of", "PBMCs", "derived", "from", "patients", "with", "breast", "cancer", "depends", "upon", "the", "tumour", "load", "and", "is", "a", "good", "clinical", "predictor", "for", "the", "further", "course", "of", "the", "disease", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "B-CELL_TYPE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Activation", "of", "transcription", "by", "binding", "of", "NF-E1", "(", "YY1", ")", "to", "a", "newly", "identified", "element", "in", "the", "first", "exon", "of", "the", "human", "DR", "alpha", "gene", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "O" ]
[ "A", "previously", "unrecognized", "element", ",", "located", "downstream", "of", "the", "start", "site", "of", "transcription", "in", "the", "first", "exon", "of", "the", "DR", "alpha", "gene", ",", "has", "been", "defined", "that", "enhances", "promoter", "activity", "up", "to", "eightfold", "in", "a", "position-dependent", "manner", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "O", "O", "O", "B-DNA", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Mutations", "in", "this", "DNA-binding", "site", "abolished", "binding", "of", "a", "nuclear", "factor", "in", "human", "B", "cell", "nuclear", "extract", "and", "decreased", "the", "activity", "of", "the", "DR", "alpha", "promoter", "to", "a", "basal", "level", "." ]	[ "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Significant", "sequence", "homology", "of", "this", "element", "was", "found", "in", "the", "DNA", "of", "the", "DR", "beta", ",", "DP", "alpha", "and", "-beta", ",", "and", "DQ", "alpha", "genes", ",", "always", "located", "downstream", "of", "the", "transcriptional", "start", "site", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "O" ]
[ "The", "nuclear", "factor", "binds", "to", "the", "DR", "alpha", "and", "DP", "alpha", "element", "but", "not", "to", "the", "element", "in", "the", "DQ", "alpha", "gene", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "O" ]
[ "It", "was", "identified", "as", "NF-E1", "(", "YY1", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "O", "O" ]
[ "This", "protein", ",", "previously", "identified", "by", "its", "binding", "to", "the", "Ig", "kappa", "3", "'", "enhancer", "and", "the", "Ig", "heavy", "chain", "mu", "E1", "site", ",", "thus", "also", "appears", "to", "be", "quite", "important", "in", "the", "regulation", "of", "MHC", "class", "II", "gene", "expression", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "O", "O" ]
[ "Transcriptional", "activity", "of", "core", "binding", "factor-alpha", "(", "AML1", ")", "and", "beta", "subunits", "on", "murine", "leukemia", "virus", "enhancer", "cores", "." ]	[ "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "O" ]
[ "Core", "binding", "factor", "(", "CBF", ")", ",", "also", "known", "as", "polyomavirus", "enhancer-binding", "protein", "2", "and", "SL3", "enhancer", "factor", "1", ",", "is", "a", "mammalian", "transcription", "factor", "that", "binds", "to", "an", "element", "termed", "the", "core", "within", "the", "enhancers", "of", "the", "murine", "leukemia", "virus", "family", "of", "retroviruses", "." ]	[ "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "core", "elements", "of", "the", "SL3", "virus", "are", "important", "genetic", "determinants", "of", "the", "ability", "of", "this", "virus", "to", "induce", "T-cell", "lymphomas", "and", "the", "transcriptional", "activity", "of", "the", "viral", "long", "terminal", "repeat", "in", "T", "lymphocytes", "." ]	[ "O", "B-DNA", "I-DNA", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "O", "B-CELL_TYPE", "I-CELL_TYPE", "O" ]
[ "CBF", "consists", "of", "two", "subunits", ",", "a", "DNA", "binding", "subunit", ",", "CBF", "alpha", ",", "and", "a", "second", "subunit", ",", "CBF", "beta", ",", "that", "stimulates", "the", "DNA", "binding", "activity", "of", "CBF", "alpha", "." ]	[ "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O" ]
[ "One", "of", "the", "genes", "that", "encodes", "a", "CBF", "alpha", "subunit", "is", "AML1", ",", "also", "called", "Cbf", "alpha", "2", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O" ]
[ "This", "locus", "is", "rearranged", "by", "chromosomal", "translocations", "in", "human", "myeloproliferative", "disorders", "and", "leukemias", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "An", "exogenously", "expressed", "Cbf", "alpha", "2-encoded", "subunit", "(", "CBF", "alpha", "2-451", ")", "stimulated", "transcription", "from", "the", "SL3", "enhancer", "in", "P19", "and", "HeLa", "cells", "." ]	[ "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "O", "B-PROTEIN", "O", "B-CELL_LINE", "I-CELL_LINE", "O" ]
[ "Activity", "was", "mediated", "through", "the", "core", "elements", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "O" ]
[ "Three", "different", "isoforms", "of", "CBF", "beta", "were", "also", "tested", "for", "transcriptional", "activity", "on", "the", "SL3", "enhancer", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "O" ]
[ "The", "longest", "form", ",", "CBF", "beta-187", ",", "increased", "the", "transcriptional", "stimulation", "by", "CBF", "alpha", "2-451", "twofold", "in", "HeLa", "cells", ",", "although", "it", "had", "no", "effect", "in", "P19", "cells", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "B-CELL_LINE", "I-CELL_LINE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CELL_LINE", "I-CELL_LINE", "O" ]
[ "Transcriptional", "activation", "by", "CBF", "beta", "required", "binding", "to", "the", "CBF", "alpha", "subunit", ",", "as", "a", "form", "of", "CBF", "beta", "that", "lacked", "binding", "ability", ",", "CBF", "beta-148", ",", "failed", "to", "increase", "activity", "." ]	[ "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "These", "results", "indicated", "that", "at", "least", "in", "certain", "cell", "types", ",", "the", "maximum", "activity", "of", "CBF", "required", "both", "subunits", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O" ]
[ "They", "also", "provided", "support", "for", "the", "hypothesis", "that", "CBF", "is", "a", "factor", "in", "T", "lymphocytes", "that", "is", "responsible", "for", "recognition", "of", "the", "SL3", "cores", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "B-CELL_TYPE", "I-CELL_TYPE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "O" ]
[ "We", "also", "examined", "whether", "CBF", "could", "distinguish", "a", "1-bp", "difference", "between", "the", "enhancer", "core", "of", "SL3", "and", "the", "core", "of", "the", "nonleukemogenic", "virus", ",", "Akv", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "difference", "strongly", "affects", "transcription", "in", "T", "cells", "and", "leukemogenicity", "of", "SL3", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "O" ]
[ "However", ",", "no", "combination", "of", "CBF", "alpha", "and", "CBF", "beta", "subunits", "that", "we", "tested", "was", "able", "to", "distinguish", "the", "1-bp", "difference", "in", "transcription", "assays", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Thus", ",", "a", "complete", "understanding", "of", "how", "T", "cells", "recognize", "the", "SL3", "core", "remains", "to", "be", "elucidated", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CELL_TYPE", "I-CELL_TYPE", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Interleukin", "(", "IL", ")", "-10", "inhibits", "nuclear", "factor", "kappa", "B", "(", "NF", "kappa", "B", ")", "activation", "in", "human", "monocytes", "." ]	[ "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "B-CELL_TYPE", "I-CELL_TYPE", "O" ]
[ "IL-10", "and", "IL-4", "suppress", "cytokine", "synthesis", "by", "different", "mechanisms", "." ]	[ "B-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Our", "previous", "studies", "in", "human", "monocytes", "have", "demonstrated", "that", "interleukin", "(", "IL", ")", "-10", "inhibits", "lipopolysaccharide", "(", "LPS", ")", "-stimulated", "production", "of", "inflammatory", "cytokines", ",", "IL-1", "beta", ",", "IL-6", ",", "IL-8", ",", "and", "tumor", "necrosis", "factor", "(", "TNF", ")", "-alpha", "by", "blocking", "gene", "transcription", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-CELL_TYPE", "I-CELL_TYPE", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Using", "electrophoretic", "mobility", "shift", "assays", "(", "EMSA", ")", ",", "we", "now", "show", "that", ",", "in", "monocytes", "stimulated", "with", "LPS", "or", "TNF", "alpha", ",", "IL-10", "inhibits", "nuclear", "stimulation", "of", "nuclear", "factor", "kappa", "B", "(", "NF", "kappa", "B", ")", ",", "a", "transcription", "factor", "involved", "in", "the", "expression", "of", "inflammatory", "cytokine", "genes", ".", "Several", "other", "transcription", "factors", "including", "NF-", "IL-6", ",", "AP-1", ",", "AP-2", ",", "GR", ",", "CREB", ",", "Oct-1", ",", "and", "Sp-1", "are", "not", "affected", "by", "IL-10", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O" ]
[ "This", "selective", "inhibition", "by", "IL-10", "of", "NF", "kappa", "B", "activation", "occurs", "rapidly", "and", "in", "a", "dose-dependent", "manner", "and", "correlates", "well", "with", "IL-10", "'s", "cytokine", "synthesis", "inhibitory", "activity", "in", "terms", "of", "both", "kinetics", "and", "dose", "responsiveness", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Furthermore", ",", "compounds", "such", "as", "tosylphenylalanyl", "chloromethyl", "ketone", "and", "pyrrolidinedithiocarbamate", "that", "are", "known", "to", "selectively", "inhibit", "NF", "kappa", "B", "activation", "block", "cytokine", "gene", "transcription", "in", "LPS-stimulated", "monocytes", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CELL_LINE", "I-CELL_LINE", "O" ]
[ "Taken", "together", ",", "these", "results", "suggest", "that", "inhibition", "of", "NF", "kappa", "B", "activation", "may", "be", "an", "important", "mechanism", "for", "IL-10", "suppression", "of", "cytokine", "gene", "transcription", "in", "human", "monocytes", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CELL_TYPE", "I-CELL_TYPE", "O" ]
[ "IL-4", ",", "another", "cytokine", "that", "inhibits", "cytokine", "mRNA", "accumulation", "in", "monocytes", ",", "shows", "little", "inhibitory", "effect", "on", "LPS-induced", "NF", "kappa", "B", "activation", "." ]	[ "B-PROTEIN", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "B-RNA", "I-RNA", "O", "O", "B-CELL_TYPE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O" ]
[ "Further", "examination", "reveals", "that", ",", "unlike", "IL-10", ",", "IL-4", "enhances", "mRNA", "degradation", "and", "does", "not", "suppress", "cytokine", "gene", "transcription", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "O", "B-RNA", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "These", "data", "indicate", "that", "IL-10", "and", "IL-4", "inhibit", "cytokine", "production", "by", "different", "mechanisms", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "LMP-1", "activates", "NF-kappa", "B", "by", "targeting", "the", "inhibitory", "molecule", "I", "kappa", "B", "alpha", "." ]	[ "B-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O" ]
[ "LMP-1", ",", "an", "Epstein-Barr", "virus", "membrane", "protein", "expressed", "during", "latent", "infection", ",", "has", "oncogenic", "properties", ",", "as", "judged", "from", "its", "ability", "to", "transform", "B", "lymphocytes", "and", "rodent", "fibroblasts", "." ]	[ "B-PROTEIN", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CELL_TYPE", "O", "B-CELL_TYPE", "I-CELL_TYPE", "O" ]
[ "LMP-1", "induces", "the", "expression", "of", "bcl2", ",", "an", "oncogene", "which", "protects", "cells", "from", "apoptosis", ",", "as", "well", "as", "of", "genes", "encoding", "other", "proteins", "involved", "in", "cell", "regulation", "and", "growth", "control", "." ]	[ "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "O", "O", "B-DNA", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "mechanisms", "by", "which", "LMP-1", "upregulates", "these", "proteins", "is", "unknown", ",", "but", "it", "is", "plausible", "that", "LMP-1", "modifies", "signal", "transduction", "pathways", "that", "result", "in", "the", "activation", "of", "one", "or", "more", "transcription", "factors", "that", "ultimately", "regulate", "transcription", "of", "oncogenic", "genes", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "O" ]
[ "NF-kappa", "B", ",", "a", "transcription", "factor", "controlling", "the", "expression", "of", "genes", "involved", "in", "cell", "activation", "and", "growth", "control", ",", "has", "been", "shown", "to", "be", "activated", "by", "LMP-1", "." ]	[ "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O" ]
[ "The", "mechanism", "(", "s", ")", "regulating", "this", "activation", "remains", "unknown", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Our", "data", "indicate", "that", "increased", "NF-kappa", "B", "DNA", "binding", "and", "functional", "activity", "are", "present", "in", "B-lymphoid", "cells", "stably", "or", "transiently", "expressing", "LMP-1", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CELL_TYPE", "I-CELL_TYPE", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O" ]
[ "I", "kappa", "B", "alpha", "is", "selectively", "modified", "in", "LMP-1-expressing", "B", "cells", "." ]	[ "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "B-CELL_LINE", "I-CELL_LINE", "I-CELL_LINE", "O" ]
[ "A", "phosphorylated", "form", "of", "I", "kappa", "B", "alpha", "and", "increased", "protein", "turnover-degradation", "correlate", "with", "increased", "NF-kappa", "B", "nuclear", "translocation", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O" ]
[ "This", "results", "in", "increased", "transcription", "of", "NF-kappa", "B-dependent-genes", ",", "including", "those", "encoding", "p105", "and", "I", "kappa", "B", "alpha", "(", "MAD3", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "B-DNA", "O", "O" ]
[ "These", "results", "indicate", "that", "LMP-1", "activates", "NF-kappa", "B", "in", "B-cell", "lines", "by", "targeting", "I", "kappa", "B", "alpha", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "B-CELL_LINE", "I-CELL_LINE", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O" ]
[ "Identification", "of", "the", "pathways", "activated", "by", "LMP-1", "to", "result", "in", "posttranslational", "modifications", "of", "I", "kappa", "B", "alpha", "will", "aid", "in", "determining", "the", "role", "of", "this", "virus-host", "cell", "protein", "interaction", "in", "Epstein-Barr", "virus-mediated", "oncogenesis", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Identification", "of", "human", "TR2", "orphan", "receptor", "response", "element", "in", "the", "transcriptional", "initiation", "site", "of", "the", "simian", "virus", "40", "major", "late", "promoter", "[", "published", "erratum", "appears", "in", "J", "Biol", "Chem", "1995", "Nov", "3", ";", "270", "(", "44", ")", ":", "26721", "]" ]	[ "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "A", "DNA", "response", "element", "(", "TR2RE-SV40", ")", "for", "the", "TR2", "orphan", "receptor", ",", "a", "member", "of", "the", "steroid-thyroid", "hormone", "receptor", "superfamily", ",", "has", "been", "identified", "in", "the", "simian", "virus", "40", "(", "SV40", ")", "+55", "region", "(", "nucleotide", "numbers", "368-389", ",", "5'-GTTAAGGTTCGTAGGTCATGGA-3", "'", ")", "." ]	[ "O", "B-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "O", "B-DNA", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "O", "B-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Electrophoretic", "mobility", "shift", "assay", ",", "using", "in", "vitro", "translated", "TR2", "orphan", "receptor", "with", "a", "molecular", "mass", "of", "67", "kilodaltons", ",", "showed", "a", "specific", "binding", "with", "high", "affinity", "(", "dissociation", "constant", "=", "9", "nM", ")", "for", "this", "DNA", "sequence", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "DNA-swap", "experiments", "using", "chloramphenicol", "acetyl-transferase", "assay", "demonstrated", "that", "androgen", "can", "suppress", "the", "transcriptional", "activities", "of", "SV40", "early", "promoter", "via", "the", "interaction", "between", "this", "TR2RE-SV40", "and", "the", "chimeric", "receptor", "AR/TR2/AR", "with", "the", "DNA-binding", "domain", "of", "the", "TR2", "orphan", "receptor", "flanked", "by", "the", "N-terminal", "and", "androgen-binding", "domains", "of", "the", "androgen", "receptor", "." ]	[ "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O" ]
[ "In", "addition", ",", "this", "TR2RE-SV40", "can", "function", "as", "a", "repressor", "to", "suppress", "the", "transcriptional", "activities", "of", "both", "SV40", "early", "and", "late", "promoters", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "O" ]
[ "Together", ",", "these", "data", "suggest", "the", "TR2RE-SV40", "may", "represent", "the", "first", "identified", "natural", "DNA", "response", "element", "for", "the", "TR2", "orphan", "receptor", "that", "may", "function", "as", "a", "repressor", "for", "the", "SV40", "gene", "expression", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Detection", "of", "the", "chromosome", "16", "CBF", "beta-MYH11", "fusion", "transcript", "in", "myelomonocytic", "leukemias", "." ]	[ "O", "O", "O", "B-RNA", "I-RNA", "I-RNA", "I-RNA", "I-RNA", "I-RNA", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Karyotypic", "detection", "of", "chromosomal", "16", "abnormalities", "classically", "associated", "with", "AML", "M4Eo", "can", "be", "difficult", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Characterization", "of", "the", "two", "genes", "involved", "in", "the", "inv", "(", "16", ")", "(", "p13q22", ")", ",", "CBF", "beta", "and", "MYH11", ",", "has", "allowed", "the", "detection", "of", "fusion", "transcripts", "by", "reverse-transcriptase", "polymerase", "chain", "reaction", "(", "RT-PCR", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "O", "B-DNA", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-RNA", "I-RNA", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "have", "analyzed", "CBF", "beta-MYH11", "fusion", "transcripts", "by", "RT-PCR", "in", "myelomonocytic", "leukemias", ",", "with", "or", "without", "eosinophilia", ",", "to", "determine", "whether", "their", "presence", "correlates", "with", "morphology", "." ]	[ "O", "O", "O", "B-RNA", "I-RNA", "I-RNA", "I-RNA", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Fifty-three", "cases", "(", "11", "AML", "M4Eo", ";", "1", "AML", "M4", "with", "atypical", "abnormal", "eosinophils", "(", "AML", "M4", "``", "Eo", "''", ")", ";", "29", "AML", "M4", ";", "8", "AML", "M5", ";", "3", "CMML", ";", "and", "1", "AML", "M2", "with", "eosinophilia", ")", "were", "analyzed", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CELL_TYPE", "I-CELL_TYPE", "I-CELL_TYPE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "All", "11", "typical", "AML", "M4Eo", "were", "CBF", "beta", "-MYH11", "positive", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "B-DNA", "O", "O" ]
[ "The", "single", "case", "of", "AML", "M4", "with", "distinctive", "eosinophil", "abnormalities", "was", "negative", "by", "karyotype", ",", "RT-PCR", "and", "fluorescent", "in", "situ", "hybridization", "(", "FISH", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Three", "of", "29", "(", "10", "%", ")", "AML", "M4", "without", "abnormal", "eosinophils", "were", "CBF", "beta", "-MYH11", "positive", ",", "1", "of", "which", "did", "not", "show", "any", "apparent", "chromosome", "16", "abnormalities", "by", "classical", "metaphase", "analysis", "(", "2", "not", "tested", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CELL_TYPE", "I-CELL_TYPE", "O", "B-DNA", "I-DNA", "B-DNA", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Both", "cases", "tested", "also", "showed", "MYH11", "genomic", "rearrangement", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "O", "O", "O" ]
[ "None", "of", "the", "other", "leukemias", "were", "RT-PCR", "positive", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Follow-up", "of", "three", "patient", "showed", "residual", "positivity", "in", "apparent", "complete", "remission", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "These", "data", "show", "that", "CBF", "beta-MYH11", "fusion", "transcripts", "occur", "not", "only", "in", "the", "vast", "majority", "of", "typical", "AML", "M4Eo", ",", "but", "also", "in", "approximately", "10", "%", "of", "AML", "M4", "without", "eosinophilic", "abnormalities", ",", "a", "much", "higher", "incidence", "than", "the", "sporadic", "reports", "of", "chromosome", "16", "abnormalities", "in", "AML", "M4", "would", "suggest", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-RNA", "I-RNA", "I-RNA", "I-RNA", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Taken", "together", "with", "the", "detection", "of", "CBF", "beta", "-", "MYH11", "transcripts", "in", "the", "absence", "of", "apparent", "chromosome", "16", "abnormalities", "by", "classical", "banding", "techniques", ",", "these", "data", "show", "that", "additional", "screening", "by", "either", "RT-PCR", "or", "FISH", "should", "be", "performed", "in", "all", "AML", "M4", ",", "regardless", "of", "morphologic", "features", ",", "to", "allow", "accurate", "evaluation", "of", "the", "prognostic", "importance", "of", "this", "fusion", "transcript", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "O", "B-RNA", "I-RNA", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-RNA", "I-RNA", "O" ]
[ "HIV-1", "Tat", "potentiates", "TNF", "-induced", "NF-kappa", "B", "activation", "and", "cytotoxicity", "by", "altering", "the", "cellular", "redox", "state", "." ]	[ "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "study", "demonstrates", "that", "human", "immunodeficiency", "virus", "type", "1", "(", "HIV-1", ")", "Tat", "protein", "amplifies", "the", "activity", "of", "tumor", "necrosis", "factor", "(", "TNF", ")", ",", "a", "cytokine", "that", "stimulates", "HIV-1", "replication", "through", "activation", "of", "NF-kappa", "B", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O" ]
[ "In", "HeLa", "cells", "stably", "transfected", "with", "the", "HIV-1", "tat", "gene", "(", "HeLa-tat", "cells", ")", ",", "expression", "of", "the", "Tat", "protein", "enhanced", "both", "TNF", "-induced", "activation", "of", "NF-kappa", "B", "and", "TNF", "-mediated", "cytotoxicity", "." ]	[ "O", "B-CELL_LINE", "I-CELL_LINE", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "O", "B-CELL_LINE", "I-CELL_LINE", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O" ]
[ "A", "similar", "potentiation", "of", "TNF", "effects", "was", "observed", "in", "Jurkat", "T", "cells", "and", "HeLa", "cells", "treated", "with", "soluble", "Tat", "protein", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CELL_LINE", "I-CELL_LINE", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O" ]
[ "TNF", "-mediated", "activation", "of", "NF-kappa", "B", "and", "cytotoxicity", "involves", "the", "intracellular", "formation", "of", "reactive", "oxygen", "intermediates", "." ]	[ "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Therefore", ",", "Tat", "-mediated", "effects", "on", "the", "cellular", "redox", "state", "were", "analyzed", "." ]	[ "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "both", "T", "cells", "and", "HeLa", "cells", "HIV-1", "Tat", "suppressed", "the", "expression", "of", "Mn-dependent", "superoxide", "dismutase", "(", "Mn-SOD", ")", ",", "a", "mitochondrial", "enzyme", "that", "is", "part", "of", "the", "cellular", "defense", "system", "against", "oxidative", "stress", "." ]	[ "O", "O", "B-CELL_TYPE", "I-CELL_TYPE", "O", "B-CELL_LINE", "I-CELL_LINE", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Thus", ",", "Mn-SOD", "RNA", "protein", "levels", "and", "activity", "were", "markedly", "reduced", "in", "the", "presence", "of", "Tat", "." ]	[ "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O" ]
[ "Decreased", "Mn-SOD", "expression", "was", "associated", "with", "decreased", "levels", "of", "glutathione", "and", "a", "lower", "ratio", "of", "reduced", ":", "oxidized", "glutathione", "." ]	[ "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "A", "truncated", "Tat", "protein", "(", "Tat1-72", ")", ",", "known", "to", "transactivate", "the", "HIV-1", "long", "terminal", "repeat", "(", "LTR", ")", ",", "no", "longer", "affected", "Mn-SOD", "expression", ",", "the", "cellular", "redox", "state", "or", "TNF", "-mediated", "cytotoxicity", "." ]	[ "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "O", "B-DNA", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O" ]
[ "Thus", ",", "our", "experiments", "demonstrate", "that", "the", "C-terminal", "region", "of", "HIV-1", "Tat", "is", "required", "to", "suppress", "Mn-SOD", "expression", "and", "to", "induce", "pro-oxidative", "conditions", "reflected", "by", "a", "drop", "in", "reduced", "glutathione", "(", "GSH", ")", "and", "the", "GSH", ":", "oxidized", "GSH", "(", "GSSG", ")", "ratio", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "(", "ABSTRACT", "TRUNCATED", "AT", "250", "WORDS", ")" ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "use", "of", "glucocorticoids", "in", "acute", "lymphoblastic", "leukemia", "of", "childhood", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Molecular", ",", "cellular", ",", "and", "clinical", "considerations", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Glucocorticoids", "have", "been", "included", "in", "almost", "all", "treatment", "regimens", "for", "childhood", "acute", "lymphoblastic", "leukemia", "for", "decades", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "However", ",", "optimal", "agents", ",", "doses", ",", "and/or", "schedules", "have", "yet", "to", "be", "defined", "despite", "extensive", "clinical", "application", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "New", "data", "on", "the", "pharmacokinetics", ",", "pharmacodynamics", ",", "and", "molecular", "mechanisms", "of", "action", "of", "glucocorticoids", "have", "suggested", "alternative", "approaches", "in", "ALL", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "These", "suggest", "that", "prolonged", ",", "i.e.", "28", "day", ",", "glucocorticoid", "therapy", "may", "be", "unnecessary", "as", "exposure", "to", "glucocorticoid", "induces", "down-regulation", "of", "glucocorticoid", "receptors", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O" ]

[ "Jak", "2", "coprecipitated", "with", "the", "beta-subunit", "of", "the", "IL-5", "receptor", ",", "suggesting", "a", "physical", "association", "of", "the", "kinase", "with", "the", "receptor", "." ]

[ "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "nuclear", "factor", "STAT-1", "(", "p91", ")", "was", "investigated", "by", "immunoprecipitation", "followed", "by", "immunoblotting", "for", "tyrosine", "phosphorylation", "." ]

[ "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "STAT-1", "was", "tyrosine", "phosphorylated", "within", "15", "min", "of", "IL-5", "stimulation", "." ]

[ "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "O" ]

[ "The", "presence", "of", "STAT-1", "in", "the", "nuclear", "extract", "was", "studied", "by", "electrophoretic", "mobility", "shift", "assay", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "IL-5", "induced", "two", "proteins", "that", "bound", "to", "the", "gamma-activating", "sequence", "." ]

[ "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "O" ]

[ "In", "the", "presence", "of", "an", "anti-STAT-1", "Ab", ",", "the", "band", "was", "supershifted", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Thus", ",", "we", "demonstrated", "that", "IL-5", "activated", "the", "Jak", "2", "-STAT", "1", "signaling", "pathway", "in", "eosinophils", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "B-CELL_TYPE", "O" ]

[ "We", "speculate", "that", "the", "Jak", "2", "-STAT", "1", "pathway", "may", "be", "involved", "in", "the", "activation", "of", "IL-5-inducible", "genes", "in", "eosinophils", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "O", "B-CELL_TYPE", "O" ]

[ "Reduced", "mitogenic", "stimulation", "of", "peripheral", "blood", "mononuclear", "cells", "as", "a", "prognostic", "parameter", "for", "the", "course", "of", "breast", "cancer", ":", "a", "prospective", "longitudinal", "study", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-CELL_TYPE", "I-CELL_TYPE", "I-CELL_TYPE", "I-CELL_TYPE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Immunosuppression", "has", "been", "often", "associated", "with", "the", "course", "of", "malignant", "diseases", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "the", "present", "study", ",", "the", "proliferation", "of", "peripheral", "blood", "mononuclear", "cells", "(", "PBMCs", ")", "in", "response", "to", "mitogenic", "stimulation", "with", "phytohaemagglutinin", "(", "PHA", ")", "was", "assessed", "prospectively", "in", "90", "patients", "with", "stage", "I-III", "breast", "cancer", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CELL_TYPE", "I-CELL_TYPE", "I-CELL_TYPE", "I-CELL_TYPE", "O", "B-CELL_TYPE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Whereas", "PHA", "-induced", "proliferation", "of", "PBMCs", "derived", "from", "patients", "with", "breast", "cancer", "preoperatively", "was", "significantly", "decreased", "when", "compared", "with", "data", "obtained", "in", "healthy", "control", "individuals", "(", "P", "<", "0.001", ")", ",", "the", "degree", "of", "the", "defect", "in", "PHA", "-induced", "proliferation", "of", "PBMCs", "depended", "upon", "the", "tumour", "burden", "as", "manifested", "by", "tumour", "size", "and", "axillary", "lymph", "node", "involvement", "(", "P", "<", "0.003", "in", "each", "case", ")", "." ]

[ "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "B-CELL_TYPE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "B-CELL_TYPE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "PHA", "-induced", "proliferation", "of", "PBMCs", "dropped", "significantly", "in", "patients", "who", "received", "adjuvant", "chemotherapy", "consisting", "of", "cyclophosphamide", ",", "methotrexate", "and", "fluorouracil", "(", "CMF", ")", "after", "an", "observation", "period", "of", "6", "months", "(", "P", "<", "0.01", ")", ",", "but", "not", "in", "patients", "under", "adjuvant", "treatment", "with", "tamoxifen", "only", "." ]

[ "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "B-CELL_TYPE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "After", "an", "additional", "6", "months", "(", "i.e.", "12", "months", "after", "surgery", ")", ",", "PHA", "-induced", "proliferation", "of", "PBMCs", "was", "similar", "in", "patients", "after", "adjuvant", "chemotherapy", "with", "CMF", "and", "in", "those", "receiving", "continued", "adjuvant", "tamoxifen", "treatment", "(", "P", ">", "0.1", ")", ",", "but", "in", "all", "patients", "still", "significantly", "decreased", "as", "compared", "with", "healthy", "controls", "(", "P", "<", "0.001", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "B-CELL_TYPE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "When", "data", "obtained", "preoperatively", "and", "after", "12", "months", "were", "compared", ",", "it", "was", "found", "that", "out", "of", "23", "patients", "whose", "PBMCs", "had", "experienced", "a", "drop", "in", "their", "PHA", "-induced", "proliferation", ",", "14", "(", "61", "%", ")", "had", "developed", "metastatic", "disease", "within", "the", "subsequent", "24", "months", "(", "i.e.", "36", "months", "after", "surgery", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CELL_TYPE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "contrast", ",", "out", "of", "59", "patients", "whose", "PBMCs", "showed", "an", "increase", "in", "their", "PHA", "-induced", "proliferation", "within", "the", "first", "12", "months", "after", "surgery", ",", "only", "one", "(", "2", "%", ")", "presented", "with", "disease", "progression", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CELL_TYPE", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "thus", "conclude", "that", "PHA", "-induced", "proliferation", "of", "PBMCs", "derived", "from", "patients", "with", "breast", "cancer", "depends", "upon", "the", "tumour", "load", "and", "is", "a", "good", "clinical", "predictor", "for", "the", "further", "course", "of", "the", "disease", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "B-CELL_TYPE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Activation", "of", "transcription", "by", "binding", "of", "NF-E1", "(", "YY1", ")", "to", "a", "newly", "identified", "element", "in", "the", "first", "exon", "of", "the", "human", "DR", "alpha", "gene", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "O" ]

[ "A", "previously", "unrecognized", "element", ",", "located", "downstream", "of", "the", "start", "site", "of", "transcription", "in", "the", "first", "exon", "of", "the", "DR", "alpha", "gene", ",", "has", "been", "defined", "that", "enhances", "promoter", "activity", "up", "to", "eightfold", "in", "a", "position-dependent", "manner", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "O", "O", "O", "B-DNA", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Mutations", "in", "this", "DNA-binding", "site", "abolished", "binding", "of", "a", "nuclear", "factor", "in", "human", "B", "cell", "nuclear", "extract", "and", "decreased", "the", "activity", "of", "the", "DR", "alpha", "promoter", "to", "a", "basal", "level", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Significant", "sequence", "homology", "of", "this", "element", "was", "found", "in", "the", "DNA", "of", "the", "DR", "beta", ",", "DP", "alpha", "and", "-beta", ",", "and", "DQ", "alpha", "genes", ",", "always", "located", "downstream", "of", "the", "transcriptional", "start", "site", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "O" ]

[ "The", "nuclear", "factor", "binds", "to", "the", "DR", "alpha", "and", "DP", "alpha", "element", "but", "not", "to", "the", "element", "in", "the", "DQ", "alpha", "gene", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "O" ]

[ "It", "was", "identified", "as", "NF-E1", "(", "YY1", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "O", "O" ]

[ "This", "protein", ",", "previously", "identified", "by", "its", "binding", "to", "the", "Ig", "kappa", "3", "'", "enhancer", "and", "the", "Ig", "heavy", "chain", "mu", "E1", "site", ",", "thus", "also", "appears", "to", "be", "quite", "important", "in", "the", "regulation", "of", "MHC", "class", "II", "gene", "expression", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "O", "O" ]

[ "Transcriptional", "activity", "of", "core", "binding", "factor-alpha", "(", "AML1", ")", "and", "beta", "subunits", "on", "murine", "leukemia", "virus", "enhancer", "cores", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "O" ]

[ "Core", "binding", "factor", "(", "CBF", ")", ",", "also", "known", "as", "polyomavirus", "enhancer-binding", "protein", "2", "and", "SL3", "enhancer", "factor", "1", ",", "is", "a", "mammalian", "transcription", "factor", "that", "binds", "to", "an", "element", "termed", "the", "core", "within", "the", "enhancers", "of", "the", "murine", "leukemia", "virus", "family", "of", "retroviruses", "." ]

[ "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "core", "elements", "of", "the", "SL3", "virus", "are", "important", "genetic", "determinants", "of", "the", "ability", "of", "this", "virus", "to", "induce", "T-cell", "lymphomas", "and", "the", "transcriptional", "activity", "of", "the", "viral", "long", "terminal", "repeat", "in", "T", "lymphocytes", "." ]

[ "O", "B-DNA", "I-DNA", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "O", "B-CELL_TYPE", "I-CELL_TYPE", "O" ]

[ "CBF", "consists", "of", "two", "subunits", ",", "a", "DNA", "binding", "subunit", ",", "CBF", "alpha", ",", "and", "a", "second", "subunit", ",", "CBF", "beta", ",", "that", "stimulates", "the", "DNA", "binding", "activity", "of", "CBF", "alpha", "." ]

[ "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O" ]

[ "One", "of", "the", "genes", "that", "encodes", "a", "CBF", "alpha", "subunit", "is", "AML1", ",", "also", "called", "Cbf", "alpha", "2", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O" ]

[ "This", "locus", "is", "rearranged", "by", "chromosomal", "translocations", "in", "human", "myeloproliferative", "disorders", "and", "leukemias", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "An", "exogenously", "expressed", "Cbf", "alpha", "2-encoded", "subunit", "(", "CBF", "alpha", "2-451", ")", "stimulated", "transcription", "from", "the", "SL3", "enhancer", "in", "P19", "and", "HeLa", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "O", "B-PROTEIN", "O", "B-CELL_LINE", "I-CELL_LINE", "O" ]

[ "Activity", "was", "mediated", "through", "the", "core", "elements", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "O" ]

[ "Three", "different", "isoforms", "of", "CBF", "beta", "were", "also", "tested", "for", "transcriptional", "activity", "on", "the", "SL3", "enhancer", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "O" ]

[ "The", "longest", "form", ",", "CBF", "beta-187", ",", "increased", "the", "transcriptional", "stimulation", "by", "CBF", "alpha", "2-451", "twofold", "in", "HeLa", "cells", ",", "although", "it", "had", "no", "effect", "in", "P19", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "B-CELL_LINE", "I-CELL_LINE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CELL_LINE", "I-CELL_LINE", "O" ]

[ "Transcriptional", "activation", "by", "CBF", "beta", "required", "binding", "to", "the", "CBF", "alpha", "subunit", ",", "as", "a", "form", "of", "CBF", "beta", "that", "lacked", "binding", "ability", ",", "CBF", "beta-148", ",", "failed", "to", "increase", "activity", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "results", "indicated", "that", "at", "least", "in", "certain", "cell", "types", ",", "the", "maximum", "activity", "of", "CBF", "required", "both", "subunits", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O" ]

[ "They", "also", "provided", "support", "for", "the", "hypothesis", "that", "CBF", "is", "a", "factor", "in", "T", "lymphocytes", "that", "is", "responsible", "for", "recognition", "of", "the", "SL3", "cores", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "B-CELL_TYPE", "I-CELL_TYPE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "O" ]

[ "We", "also", "examined", "whether", "CBF", "could", "distinguish", "a", "1-bp", "difference", "between", "the", "enhancer", "core", "of", "SL3", "and", "the", "core", "of", "the", "nonleukemogenic", "virus", ",", "Akv", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "difference", "strongly", "affects", "transcription", "in", "T", "cells", "and", "leukemogenicity", "of", "SL3", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "O" ]

[ "However", ",", "no", "combination", "of", "CBF", "alpha", "and", "CBF", "beta", "subunits", "that", "we", "tested", "was", "able", "to", "distinguish", "the", "1-bp", "difference", "in", "transcription", "assays", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Thus", ",", "a", "complete", "understanding", "of", "how", "T", "cells", "recognize", "the", "SL3", "core", "remains", "to", "be", "elucidated", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CELL_TYPE", "I-CELL_TYPE", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Interleukin", "(", "IL", ")", "-10", "inhibits", "nuclear", "factor", "kappa", "B", "(", "NF", "kappa", "B", ")", "activation", "in", "human", "monocytes", "." ]

[ "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "B-CELL_TYPE", "I-CELL_TYPE", "O" ]

[ "IL-10", "and", "IL-4", "suppress", "cytokine", "synthesis", "by", "different", "mechanisms", "." ]

[ "B-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Our", "previous", "studies", "in", "human", "monocytes", "have", "demonstrated", "that", "interleukin", "(", "IL", ")", "-10", "inhibits", "lipopolysaccharide", "(", "LPS", ")", "-stimulated", "production", "of", "inflammatory", "cytokines", ",", "IL-1", "beta", ",", "IL-6", ",", "IL-8", ",", "and", "tumor", "necrosis", "factor", "(", "TNF", ")", "-alpha", "by", "blocking", "gene", "transcription", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-CELL_TYPE", "I-CELL_TYPE", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Using", "electrophoretic", "mobility", "shift", "assays", "(", "EMSA", ")", ",", "we", "now", "show", "that", ",", "in", "monocytes", "stimulated", "with", "LPS", "or", "TNF", "alpha", ",", "IL-10", "inhibits", "nuclear", "stimulation", "of", "nuclear", "factor", "kappa", "B", "(", "NF", "kappa", "B", ")", ",", "a", "transcription", "factor", "involved", "in", "the", "expression", "of", "inflammatory", "cytokine", "genes", ".", "Several", "other", "transcription", "factors", "including", "NF-", "IL-6", ",", "AP-1", ",", "AP-2", ",", "GR", ",", "CREB", ",", "Oct-1", ",", "and", "Sp-1", "are", "not", "affected", "by", "IL-10", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O" ]

[ "This", "selective", "inhibition", "by", "IL-10", "of", "NF", "kappa", "B", "activation", "occurs", "rapidly", "and", "in", "a", "dose-dependent", "manner", "and", "correlates", "well", "with", "IL-10", "'s", "cytokine", "synthesis", "inhibitory", "activity", "in", "terms", "of", "both", "kinetics", "and", "dose", "responsiveness", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Furthermore", ",", "compounds", "such", "as", "tosylphenylalanyl", "chloromethyl", "ketone", "and", "pyrrolidinedithiocarbamate", "that", "are", "known", "to", "selectively", "inhibit", "NF", "kappa", "B", "activation", "block", "cytokine", "gene", "transcription", "in", "LPS-stimulated", "monocytes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CELL_LINE", "I-CELL_LINE", "O" ]

[ "Taken", "together", ",", "these", "results", "suggest", "that", "inhibition", "of", "NF", "kappa", "B", "activation", "may", "be", "an", "important", "mechanism", "for", "IL-10", "suppression", "of", "cytokine", "gene", "transcription", "in", "human", "monocytes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CELL_TYPE", "I-CELL_TYPE", "O" ]

[ "IL-4", ",", "another", "cytokine", "that", "inhibits", "cytokine", "mRNA", "accumulation", "in", "monocytes", ",", "shows", "little", "inhibitory", "effect", "on", "LPS-induced", "NF", "kappa", "B", "activation", "." ]

[ "B-PROTEIN", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "B-RNA", "I-RNA", "O", "O", "B-CELL_TYPE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O" ]

[ "Further", "examination", "reveals", "that", ",", "unlike", "IL-10", ",", "IL-4", "enhances", "mRNA", "degradation", "and", "does", "not", "suppress", "cytokine", "gene", "transcription", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "O", "B-RNA", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "data", "indicate", "that", "IL-10", "and", "IL-4", "inhibit", "cytokine", "production", "by", "different", "mechanisms", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "LMP-1", "activates", "NF-kappa", "B", "by", "targeting", "the", "inhibitory", "molecule", "I", "kappa", "B", "alpha", "." ]

[ "B-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O" ]

[ "LMP-1", ",", "an", "Epstein-Barr", "virus", "membrane", "protein", "expressed", "during", "latent", "infection", ",", "has", "oncogenic", "properties", ",", "as", "judged", "from", "its", "ability", "to", "transform", "B", "lymphocytes", "and", "rodent", "fibroblasts", "." ]

[ "B-PROTEIN", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CELL_TYPE", "O", "B-CELL_TYPE", "I-CELL_TYPE", "O" ]

[ "LMP-1", "induces", "the", "expression", "of", "bcl2", ",", "an", "oncogene", "which", "protects", "cells", "from", "apoptosis", ",", "as", "well", "as", "of", "genes", "encoding", "other", "proteins", "involved", "in", "cell", "regulation", "and", "growth", "control", "." ]

[ "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "O", "O", "B-DNA", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "mechanisms", "by", "which", "LMP-1", "upregulates", "these", "proteins", "is", "unknown", ",", "but", "it", "is", "plausible", "that", "LMP-1", "modifies", "signal", "transduction", "pathways", "that", "result", "in", "the", "activation", "of", "one", "or", "more", "transcription", "factors", "that", "ultimately", "regulate", "transcription", "of", "oncogenic", "genes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "O" ]

[ "NF-kappa", "B", ",", "a", "transcription", "factor", "controlling", "the", "expression", "of", "genes", "involved", "in", "cell", "activation", "and", "growth", "control", ",", "has", "been", "shown", "to", "be", "activated", "by", "LMP-1", "." ]

[ "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O" ]

[ "The", "mechanism", "(", "s", ")", "regulating", "this", "activation", "remains", "unknown", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Our", "data", "indicate", "that", "increased", "NF-kappa", "B", "DNA", "binding", "and", "functional", "activity", "are", "present", "in", "B-lymphoid", "cells", "stably", "or", "transiently", "expressing", "LMP-1", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CELL_TYPE", "I-CELL_TYPE", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O" ]

[ "I", "kappa", "B", "alpha", "is", "selectively", "modified", "in", "LMP-1-expressing", "B", "cells", "." ]

[ "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "B-CELL_LINE", "I-CELL_LINE", "I-CELL_LINE", "O" ]

[ "A", "phosphorylated", "form", "of", "I", "kappa", "B", "alpha", "and", "increased", "protein", "turnover-degradation", "correlate", "with", "increased", "NF-kappa", "B", "nuclear", "translocation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O" ]

[ "This", "results", "in", "increased", "transcription", "of", "NF-kappa", "B-dependent-genes", ",", "including", "those", "encoding", "p105", "and", "I", "kappa", "B", "alpha", "(", "MAD3", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "B-DNA", "O", "O" ]

[ "These", "results", "indicate", "that", "LMP-1", "activates", "NF-kappa", "B", "in", "B-cell", "lines", "by", "targeting", "I", "kappa", "B", "alpha", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "B-CELL_LINE", "I-CELL_LINE", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O" ]

[ "Identification", "of", "the", "pathways", "activated", "by", "LMP-1", "to", "result", "in", "posttranslational", "modifications", "of", "I", "kappa", "B", "alpha", "will", "aid", "in", "determining", "the", "role", "of", "this", "virus-host", "cell", "protein", "interaction", "in", "Epstein-Barr", "virus-mediated", "oncogenesis", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Identification", "of", "human", "TR2", "orphan", "receptor", "response", "element", "in", "the", "transcriptional", "initiation", "site", "of", "the", "simian", "virus", "40", "major", "late", "promoter", "[", "published", "erratum", "appears", "in", "J", "Biol", "Chem", "1995", "Nov", "3", ";", "270", "(", "44", ")", ":", "26721", "]" ]

[ "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "A", "DNA", "response", "element", "(", "TR2RE-SV40", ")", "for", "the", "TR2", "orphan", "receptor", ",", "a", "member", "of", "the", "steroid-thyroid", "hormone", "receptor", "superfamily", ",", "has", "been", "identified", "in", "the", "simian", "virus", "40", "(", "SV40", ")", "+55", "region", "(", "nucleotide", "numbers", "368-389", ",", "5'-GTTAAGGTTCGTAGGTCATGGA-3", "'", ")", "." ]

[ "O", "B-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "O", "B-DNA", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "O", "B-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Electrophoretic", "mobility", "shift", "assay", ",", "using", "in", "vitro", "translated", "TR2", "orphan", "receptor", "with", "a", "molecular", "mass", "of", "67", "kilodaltons", ",", "showed", "a", "specific", "binding", "with", "high", "affinity", "(", "dissociation", "constant", "=", "9", "nM", ")", "for", "this", "DNA", "sequence", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "DNA-swap", "experiments", "using", "chloramphenicol", "acetyl-transferase", "assay", "demonstrated", "that", "androgen", "can", "suppress", "the", "transcriptional", "activities", "of", "SV40", "early", "promoter", "via", "the", "interaction", "between", "this", "TR2RE-SV40", "and", "the", "chimeric", "receptor", "AR/TR2/AR", "with", "the", "DNA-binding", "domain", "of", "the", "TR2", "orphan", "receptor", "flanked", "by", "the", "N-terminal", "and", "androgen-binding", "domains", "of", "the", "androgen", "receptor", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O" ]

[ "In", "addition", ",", "this", "TR2RE-SV40", "can", "function", "as", "a", "repressor", "to", "suppress", "the", "transcriptional", "activities", "of", "both", "SV40", "early", "and", "late", "promoters", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "O" ]

[ "Together", ",", "these", "data", "suggest", "the", "TR2RE-SV40", "may", "represent", "the", "first", "identified", "natural", "DNA", "response", "element", "for", "the", "TR2", "orphan", "receptor", "that", "may", "function", "as", "a", "repressor", "for", "the", "SV40", "gene", "expression", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Detection", "of", "the", "chromosome", "16", "CBF", "beta-MYH11", "fusion", "transcript", "in", "myelomonocytic", "leukemias", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-RNA", "I-RNA", "I-RNA", "I-RNA", "I-RNA", "I-RNA", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Karyotypic", "detection", "of", "chromosomal", "16", "abnormalities", "classically", "associated", "with", "AML", "M4Eo", "can", "be", "difficult", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Characterization", "of", "the", "two", "genes", "involved", "in", "the", "inv", "(", "16", ")", "(", "p13q22", ")", ",", "CBF", "beta", "and", "MYH11", ",", "has", "allowed", "the", "detection", "of", "fusion", "transcripts", "by", "reverse-transcriptase", "polymerase", "chain", "reaction", "(", "RT-PCR", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "O", "B-DNA", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-RNA", "I-RNA", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "have", "analyzed", "CBF", "beta-MYH11", "fusion", "transcripts", "by", "RT-PCR", "in", "myelomonocytic", "leukemias", ",", "with", "or", "without", "eosinophilia", ",", "to", "determine", "whether", "their", "presence", "correlates", "with", "morphology", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-RNA", "I-RNA", "I-RNA", "I-RNA", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Fifty-three", "cases", "(", "11", "AML", "M4Eo", ";", "1", "AML", "M4", "with", "atypical", "abnormal", "eosinophils", "(", "AML", "M4", "``", "Eo", "''", ")", ";", "29", "AML", "M4", ";", "8", "AML", "M5", ";", "3", "CMML", ";", "and", "1", "AML", "M2", "with", "eosinophilia", ")", "were", "analyzed", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CELL_TYPE", "I-CELL_TYPE", "I-CELL_TYPE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "All", "11", "typical", "AML", "M4Eo", "were", "CBF", "beta", "-MYH11", "positive", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "B-DNA", "O", "O" ]

[ "The", "single", "case", "of", "AML", "M4", "with", "distinctive", "eosinophil", "abnormalities", "was", "negative", "by", "karyotype", ",", "RT-PCR", "and", "fluorescent", "in", "situ", "hybridization", "(", "FISH", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Three", "of", "29", "(", "10", "%", ")", "AML", "M4", "without", "abnormal", "eosinophils", "were", "CBF", "beta", "-MYH11", "positive", ",", "1", "of", "which", "did", "not", "show", "any", "apparent", "chromosome", "16", "abnormalities", "by", "classical", "metaphase", "analysis", "(", "2", "not", "tested", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CELL_TYPE", "I-CELL_TYPE", "O", "B-DNA", "I-DNA", "B-DNA", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Both", "cases", "tested", "also", "showed", "MYH11", "genomic", "rearrangement", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "O", "O", "O" ]

[ "None", "of", "the", "other", "leukemias", "were", "RT-PCR", "positive", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Follow-up", "of", "three", "patient", "showed", "residual", "positivity", "in", "apparent", "complete", "remission", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "data", "show", "that", "CBF", "beta-MYH11", "fusion", "transcripts", "occur", "not", "only", "in", "the", "vast", "majority", "of", "typical", "AML", "M4Eo", ",", "but", "also", "in", "approximately", "10", "%", "of", "AML", "M4", "without", "eosinophilic", "abnormalities", ",", "a", "much", "higher", "incidence", "than", "the", "sporadic", "reports", "of", "chromosome", "16", "abnormalities", "in", "AML", "M4", "would", "suggest", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-RNA", "I-RNA", "I-RNA", "I-RNA", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Taken", "together", "with", "the", "detection", "of", "CBF", "beta", "-", "MYH11", "transcripts", "in", "the", "absence", "of", "apparent", "chromosome", "16", "abnormalities", "by", "classical", "banding", "techniques", ",", "these", "data", "show", "that", "additional", "screening", "by", "either", "RT-PCR", "or", "FISH", "should", "be", "performed", "in", "all", "AML", "M4", ",", "regardless", "of", "morphologic", "features", ",", "to", "allow", "accurate", "evaluation", "of", "the", "prognostic", "importance", "of", "this", "fusion", "transcript", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "O", "B-RNA", "I-RNA", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-RNA", "I-RNA", "O" ]

[ "HIV-1", "Tat", "potentiates", "TNF", "-induced", "NF-kappa", "B", "activation", "and", "cytotoxicity", "by", "altering", "the", "cellular", "redox", "state", "." ]

[ "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "study", "demonstrates", "that", "human", "immunodeficiency", "virus", "type", "1", "(", "HIV-1", ")", "Tat", "protein", "amplifies", "the", "activity", "of", "tumor", "necrosis", "factor", "(", "TNF", ")", ",", "a", "cytokine", "that", "stimulates", "HIV-1", "replication", "through", "activation", "of", "NF-kappa", "B", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O" ]

[ "In", "HeLa", "cells", "stably", "transfected", "with", "the", "HIV-1", "tat", "gene", "(", "HeLa-tat", "cells", ")", ",", "expression", "of", "the", "Tat", "protein", "enhanced", "both", "TNF", "-induced", "activation", "of", "NF-kappa", "B", "and", "TNF", "-mediated", "cytotoxicity", "." ]

[ "O", "B-CELL_LINE", "I-CELL_LINE", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "O", "B-CELL_LINE", "I-CELL_LINE", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O" ]

[ "A", "similar", "potentiation", "of", "TNF", "effects", "was", "observed", "in", "Jurkat", "T", "cells", "and", "HeLa", "cells", "treated", "with", "soluble", "Tat", "protein", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CELL_LINE", "I-CELL_LINE", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O" ]

[ "TNF", "-mediated", "activation", "of", "NF-kappa", "B", "and", "cytotoxicity", "involves", "the", "intracellular", "formation", "of", "reactive", "oxygen", "intermediates", "." ]

[ "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Therefore", ",", "Tat", "-mediated", "effects", "on", "the", "cellular", "redox", "state", "were", "analyzed", "." ]

[ "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "both", "T", "cells", "and", "HeLa", "cells", "HIV-1", "Tat", "suppressed", "the", "expression", "of", "Mn-dependent", "superoxide", "dismutase", "(", "Mn-SOD", ")", ",", "a", "mitochondrial", "enzyme", "that", "is", "part", "of", "the", "cellular", "defense", "system", "against", "oxidative", "stress", "." ]

[ "O", "O", "B-CELL_TYPE", "I-CELL_TYPE", "O", "B-CELL_LINE", "I-CELL_LINE", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Thus", ",", "Mn-SOD", "RNA", "protein", "levels", "and", "activity", "were", "markedly", "reduced", "in", "the", "presence", "of", "Tat", "." ]

[ "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O" ]

[ "Decreased", "Mn-SOD", "expression", "was", "associated", "with", "decreased", "levels", "of", "glutathione", "and", "a", "lower", "ratio", "of", "reduced", ":", "oxidized", "glutathione", "." ]

[ "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "A", "truncated", "Tat", "protein", "(", "Tat1-72", ")", ",", "known", "to", "transactivate", "the", "HIV-1", "long", "terminal", "repeat", "(", "LTR", ")", ",", "no", "longer", "affected", "Mn-SOD", "expression", ",", "the", "cellular", "redox", "state", "or", "TNF", "-mediated", "cytotoxicity", "." ]

[ "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "I-DNA", "O", "B-DNA", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O" ]

[ "Thus", ",", "our", "experiments", "demonstrate", "that", "the", "C-terminal", "region", "of", "HIV-1", "Tat", "is", "required", "to", "suppress", "Mn-SOD", "expression", "and", "to", "induce", "pro-oxidative", "conditions", "reflected", "by", "a", "drop", "in", "reduced", "glutathione", "(", "GSH", ")", "and", "the", "GSH", ":", "oxidized", "GSH", "(", "GSSG", ")", "ratio", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "(", "ABSTRACT", "TRUNCATED", "AT", "250", "WORDS", ")" ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "use", "of", "glucocorticoids", "in", "acute", "lymphoblastic", "leukemia", "of", "childhood", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Molecular", ",", "cellular", ",", "and", "clinical", "considerations", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Glucocorticoids", "have", "been", "included", "in", "almost", "all", "treatment", "regimens", "for", "childhood", "acute", "lymphoblastic", "leukemia", "for", "decades", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "However", ",", "optimal", "agents", ",", "doses", ",", "and/or", "schedules", "have", "yet", "to", "be", "defined", "despite", "extensive", "clinical", "application", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "New", "data", "on", "the", "pharmacokinetics", ",", "pharmacodynamics", ",", "and", "molecular", "mechanisms", "of", "action", "of", "glucocorticoids", "have", "suggested", "alternative", "approaches", "in", "ALL", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "suggest", "that", "prolonged", ",", "i.e.", "28", "day", ",", "glucocorticoid", "therapy", "may", "be", "unnecessary", "as", "exposure", "to", "glucocorticoid", "induces", "down-regulation", "of", "glucocorticoid", "receptors", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-PROTEIN", "I-PROTEIN", "O" ]