Search is not available for this dataset
id
stringlengths
11
16
sequence
stringlengths
11
4.38k
secondary_structure
stringlengths
11
4.38k
structural_annotation
stringlengths
11
4.38k
functional_annotation
stringlengths
11
4.38k
bpRNA_PDB_234
GGACUUCGGUCC
............
EEEEEEEEEEEE
NNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_235
GGCCGAAAGGCC
............
EEEEEEEEEEEE
NNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_236
GGCGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCGCC
(((((...(((((..)))))...)))))
SSSSSIIISSSSSHHSSSSSIIISSSSS
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_239
GCGGCACCGUCCGCUCAAACAAACGG
((((..[[[.)))).........]]]
SSSSHHHHHHSSSSEEEEEEEEEEEE
NNNNNNKKKNNNNNNNNNNNNNNKKK
bpRNA_PDB_242
GGAGCGGGGGUGUAAACCUAUCGCUCC
((((((.(((((..)))))..))))))
SSSSSSISSSSSHHSSSSSIISSSSSS
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_245
GGGACGAAGUGGUUGGGCGCUUCGGCGUGUGAAAACGUCCC
((((((.([.)..((](((((..)))))...))..))))))
SSSSSSMSHHSMMSSISSSSSHHSSSSSIIISSMMSSSSSS
NNNNNNNNKNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_248
GGAGGCUCUGGCAGCUUUC
(((((((.....)))))))
SSSSSSSHHHHHSSSSSSS
NNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_258
GGAGAGGCUCUGGCAGCUUUUCC
((((((((((..).)))))))))
SSSSSSSSSSHHSBSSSSSSSSS
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_259
GGCCUUAGGAAACAGUUCGCUGUGCCGAAAGGUC
((((((..((((((((..))))))))..))))))
SSSSSSIISSSSSSSSHHSSSSSSSSIISSSSSS
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_260
GGUAUGCUAGUACC
((((((..))))))
SSSSSSHHSSSSSS
NNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_261
GGCUGAAGGGCC
(((((..)))))
SSSSSHHSSSSS
NNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_263
GGUUGUACGUCGCUUUGGAUAAAAGCGUCUGCGACC
((((((..(((((((.(...).))))))).))))))
SSSSSSIISSSSSSSISHHHSISSSSSSSISSSSSS
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_264
GAGACUAUCGACAUUUGAUACACUAUUUAUCAAUGGAUGUCUC
(((((...(..(((..((((....(.))))).))))..)))))
SSSSSIIISBBSSSIISSSSBBBBSHSSSSSISSSSIISSSSS
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_265
ACGGGCUCAUAACCCGU
(((((((...)))))))
SSSSSSSHHHSSSSSSS
NNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_266
GGGGUGGCUCCCCUAACAGCCG
((((.[[[.)))).....]]].
SSSSHHHHHSSSSEEEEEEEEE
NNNNNKKKNNNNNNNNNNKKKN
bpRNA_PDB_268
XGGGCUAAGUUGAAAAAUUAGCCC
.(((((((..))))))).......
ESSSSSSSHHSSSSSSSEEEEEEE
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_269
GGCCAUCUUGCUCUUCGGAGGAUUUGGCC
((((((.(((((((..)))))))))))))
SSSSSSBSSSSSSSHHSSSSSSSSSSSSS
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_273
GGCCAGACUCCCGAAUCUGGCC
(((((((.(.....))))))))
SSSSSSSBSHHHHHSSSSSSSS
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_275
GAGGUCGGGAUGGAUCUC
((((((......))))))
SSSSSSHHHHHHSSSSSS
NNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_276
GGGAAGGCGCUUCGGCGUCGGCCC
(((((((((((..)))))))))))
SSSSSSSSSSSHHSSSSSSSSSSS
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_277
GGCGUGAUCAAGUGAUCGCGCC
(((((((((....)))))))))
SSSSSSSSSHHHHSSSSSSSSS
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_278
gCGACUCGGGGUGCCCUUCUGCGUGAAGGCUGAGAAAuACCCGUAucACCUGAUCUGGAUAAUGCCAGCGuAGGGAAGUCGCa
(((((((((([((((............)))(..]).)..)))).(..(((((..((((......)))).).))))))))))).
SSSSSSSSSSISSSSHHHHHHHHHHHHSSSSHHHSMSIISSSSMSBBSSSSSIISSSSHHHHHHSSSSISBSSSSSSSSSSSE
NNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_284
GGCCUCCAGCGACGGCCUUCGGGACUAGCAAACGGAGGCC
((((((((((((.(((((..)))))))))...))))))))
SSSSSSSSSSSSBSSSSSHHSSSSSSSSSBBBSSSSSSSS
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_285
GGCCUCCAAGCUGUGCCUUGGGUGGCC
(((((((((((...).)))))).))))
SSSSSSSSSSSHHHSBSSSSSSBSSSS
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_287
CCUCCCUUACAAGGAGG
((((((.....))))))
SSSSSSHHHHHSSSSSS
NNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_288
CCUCCCUNACNAGGAGG
(((((.......)))))
SSSSSHHHHHHHSSSSS
NNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_289
CCUCCCUNACAAGGAGG
(((((.......)))))
SSSSSHHHHHHHSSSSS
NNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_290
GGAGUGGCCGAAAGGCAUCUCC
((((..((((..))))..))))
SSSSIISSSSHHSSSSIISSSS
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_292
GGAUGGGGAAAGAAGCCCCGCAAUUUCCCCAUCC
((((((((((((..((...)).))))))))))))
SSSSSSSSSSSSIISSHHHSSISSSSSSSSSSSS
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_294
GAUACUUGAAACUGUAAGGUUGGCGUAUC
(((((...((((((..))))))..)))))
SSSSSIIISSSSSSHHSSSSSSIISSSSS
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_296
GGCUCGCAGCAGGUCUGGAGUC
(((((.((((..).))))))))
SSSSSBSSSSHHSBSSSSSSSS
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_298
GGUCUACAUUGCUGUUGUCGUGUGUGACC
(((((((((.((....)).))))).))))
SSSSSSSSSISSHHHHSSISSSSSBSSSS
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_299
GGAGUAUGUGAAAGCAUACUCC
((((((((((..))))))))))
SSSSSSSSSSHHSSSSSSSSSS
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_300
GGGCUGUUUUUCUCGCUGACUUUCAGCCCCAAACAAAAAAUGUCAGCA
[[[[[[{.......(((((((((]]]]]].......}))).)))))).
EEEEEEEEEEEEEESSSSSSSSSHHHHHHHHHHHHHHSSSBSSSSSSE
KKKKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNKKKKKKNNNNNNNKNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_302
GGAUGGUUGGGGUUAGCCAUCC
(((((((((....)))))))))
SSSSSSSSSHHHHSSSSSSSSS
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_303
GGCUUGAUUGUAUUUUUAAAUUAAUUCUUAAAAACUACAAAUUAAGCC
(((((.(((((((((((((.(....).))))))).))).))).)))))
SSSSSISSSSSSSSSSSSSISHHHHSISSSSSSSBSSSBSSSISSSSS
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_307
GGGAUCACAAGUAGGACUUCGGUCCGAAUACAGAUCUC
((((((..(..((((((....)))))))....))))))
SSSSSSIISBBSSSSSSHHHHSSSSSSSIIIISSSSSS
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_308
GGCACUUCGGUGCC
((((((..))))))
SSSSSSHHSSSSSS
NNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_309
UGAGCACAGUUUGCUCA
(((((((...)))))))
SSSSSSSHHHSSSSSSS
NNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_311
GGAGGUAGUAGGUCGAAAGACCGUUCUACACUCC
((((((((.(((((....)))).).)))).))))
SSSSSSSSISSSSSHHHHSSSSBSISSSSBSSSS
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_312
GGACGGUGGCAGCACUGUCUAGCUGCGGGCAUUAGACUGGAAAACUAGUGCUCUUUGGGUAACCACUAAAAUCCCGAAAGGGUGGGCUGUGGUGACCCUCCG
.((((((((..)))))))).......(((((((((..[.[[...)))))))))......(((((((.....((.((.).).).)....)))))))...]].]
ESSSSSSSSHHSSSSSSSSXXXXXXXSSSSSSSSSHHHHHHHHHSSSSSSSSSXXXXXXSSSSSSSIIIIISSISSHSBSISBSIIIISSSSSSSEEEEEEE
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKNK
bpRNA_PDB_313
CUCGGCUACGAACCGAG
(((((.......)))))
SSSSSHHHHHHHSSSSS
NNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_314
CUCGGCUICGAACCGAG
((((((.....))))))
SSSSSSHHHHHSSSSSS
NNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_315
CUCGGXUICGAACCGAG
(((((.......)))))
SSSSSHHHHHHHSSSSS
NNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_317
UCGGGCCXAUACCCCGA
.((((.......)))).
ESSSSHHHHHHHSSSSE
NNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_318
UCGGGCCCAUACCCCGA
(((((.......)))))
SSSSSHHHHHHHSSSSS
NNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_319
GGAGGAACUACUGUCUUCCUUCGGGUCGUGCAGCCUCC
((((((..).((((((((((..)))))).)))))))))
SSSSSSHHSMSSSSSSSSSSHHSSSSSSBSSSSSSSSS
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_324
GGGGUUGGUGUAUUUUUAAAUUAAUUCUUAAAAACUACAAUCAGCUCC
(((((((((((((((((((.(....).))))))).))).)))))))))
SSSSSSSSSSSSSSSSSSSISHHHHSISSSSSSSBSSSBSSSSSSSSS
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_325
GGUGAUUGAGUUCACCA
(((((.(...)))))).
SSSSSBSHHHSSSSSSE
NNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_326
GGGAAAUGAGGCGCUGCAUGUGGCAGUCUGCCUUUCUUUCCC
(((((((((((((((((.....)))))..))))).)))))))
SSSSSSSSSSSSSSSSSHHHHHSSSSSBBSSSSSBSSSSSSS
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_327
GGCUGCUUGUCCUUUAAUGGUCCAGUC
(((((...(((((....))))))))))
SSSSSBBBSSSSSHHHHSSSSSSSSSS
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_328
GAGAGPUGGGCUCUC
((((((...))))))
SSSSSSHHHSSSSSS
NNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_329
GGGAGUAAAGAUUGAGACAAGUAGGACUUCGGUCCGAAUACACUCAUGAACUCCC
((((((...((.((((...(.((((((....)))))))....)))).))))))))
SSSSSSBBBSSISSSSIIISBSSSSSSHHHHSSSSSSSIIIISSSSISSSSSSSS
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_331
GGUAAGGUGGGUGGAAUCCUUCGGGAUCCCACCUACCCUGCC
((((((((((((((((((((..))))))))))))))))))))
SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSHHSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_332
GGCUUUUGCUCCCCGUGCUUCGGCACGGAAAAGCC
(((((((......((((((..)))))).)))))))
SSSSSSSIIIIIISSSSSSHHSSSSSSISSSSSSS
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_333
GAGCUGCAGCACGAAAGUGACGGCUC
(((((((.)((((..)))).))))))
SSSSSSSHSSSSSHHSSSSMSSSSSS
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_334
GAUCUCUUGUAGAUCA
((((((..).))))).
SSSSSSHHSBSSSSSE
NNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_337
GCAGACUUUUAAUCUGC
((((((.....))))))
SSSSSSHHHHHSSSSSS
NNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_338
GGGGACUGUAAAUCCCC
(((((((().)))))))
SSSSSSSSSBSSSSSSS
NNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_340
GGGCCUUGCCAAGGUCC
((.((((...)))).))
SSISSSSHHHSSSSISS
NNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_341
GGGACCUUCCCGGUCUC
((((((.....))))))
SSSSSSHHHHHSSSSSS
NNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_342
GGGACCUUCCAAGUCUC
(((((.......)))))
SSSSSHHHHHHHSSSSS
NNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_345
GGAGGUCAGGGUCAGGAGCCCCCCCCUGAACCCAGGAUAACCCUCAAAGUCGGGGGGCAACCC
....((((((((((((.[[[[[[[)))).))))).))).............]]]]]]].....
EEEESSSSSSSSSSSSHHHHHHHHSSSSBSSSSSBSSSEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEE
NNNNNNNNNNNNNNNNNKKKKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKKKKKKNNNNN
bpRNA_PDB_346
GGAUCCAUUCGAUUAGUGAACGGAUCC
((((((((((.......))))))))))
SSSSSSSSSSHHHHHHHSSSSSSSSSS
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_347
GGGGAGUACGGCCGCAAGGUUAAAACUCCCC
((((((((.(((((..))))).).)))))))
SSSSSSSSISSSSSHHSSSSSISBSSSSSSS
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_349
GGGUGAAAUGGAGGACUUCGGUCCUCAAAUUUCACCC
(((((((((.(((((((..)))))))..)))))))))
SSSSSSSSSISSSSSSSHHSSSSSSSIISSSSSSSSS
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_350
GGACCGAUAAGGUAGAAAUGCCUUAUCGGUCC
(((((((((((((((.).))))))))))))))
SSSSSSSSSSSSSSSHSBSSSSSSSSSSSSSS
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_351
GGCCUCAGCACUACCCCAGUGUAGGUC
((((...(((((.....))))).))))
SSSSIIISSSSSHHHHHSSSSSISSSS
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_352
GGCUUAGAUCAGAAAUGAUCAGCC
((((..((((((..))))))))))
SSSSBBSSSSSSHHSSSSSSSSSS
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_353
GGCAAUACAGAGAUGAUCAGCAGUUCCCCUGCAUAAGGAUGAACCGUUUUACAAAGAGAUUUCUUCGGGAAUCUCUUUGCCUUUUGGCUUAGAUCAAGUGUAGUAUCUGUC
((((.(((.....((((((((.((((.((((...))))..)))).......(((((((((((((..))))))))))))).......)))..)))))......)))..))))
SSSSISSSIIIIISSSSSSSSMSSSSISSSSHHHSSSSIISSSSMMMMMMMSSSSSSSSSSSSSHHSSSSSSSSSSSSSMMMMMMMSSSBBSSSSSIIIIIISSSIISSSS
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_354
GAGGACAUAGAUCUUC
(((((((.)).)))))
SSSSSSSHSSBSSSSS
NNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_358
GGACUUCCAUUGCUUCGGCAAAAGUCC
(((((....(((((..))))).)))))
SSSSSIIIISSSSSHHSSSSSISSSSS
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_359
GGAAUAUGCUCAACGAAAGUGAAUCAGCUUCGGCUGAGAGCUAAGUUCC
(((((..((((.(((..)))...((((((..))))))))))...)))))
SSSSSIISSSSMSSSHHSSSMMMSSSSSSHHSSSSSSSSSSIIISSSSS
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_361
GGGCAGUGAUGCUUCGGCAUAUCAGCCC
((((((((((((....))))))))))))
SSSSSSSSSSSSHHHHSSSSSSSSSSSS
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_363
GAGUAGAAACAAGGCUUCGGCCUGCUUUUGCU
.((((((((((.((((..))))))))))))))
ESSSSSSSSSSBSSSSHHSSSSSSSSSSSSSS
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_364
GGGUGUAUUGGAAAUGAGCACCC
((((((.(........)))))))
SSSSSSBSHHHHHHHHSSSSSSS
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_365
GGCGAUACACUAUUUAUCGCC
((((((((.....))))))))
SSSSSSSSHHHHHSSSSSSSS
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_366
GGCAGAUCUGUAAUAGAACUGCC
(((((.(((.....))).)))))
SSSSSISSSHHHHHSSSISSSSS
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_367
GGAGUAUGUAUUGGCACUGAGCAUACUCC
(((((((((...........)))))))))
SSSSSSSSSHHHHHHHHHHHSSSSSSSSS
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_369
GGAAUCGAAAGAUGUCC
((..(((..))).()))
SSMMSSSHHSSSMSSSS
NNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_370
GGAGCCGUAUGCGGUAGUUCCGCACGUACGGAUCU
((..((((..((((.....))))....))))..))
SSIISSSSIISSSSHHHHHSSSSIIIISSSSIISS
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_371
GGAAGAAAGGGCUUCGGCCACUCAAACUACAGAGACGCCAGUCACUCAGAUAUCCUGGU
(((.((((.((((..)))))))).)))....[[[[..((((..]]]].......)))).
SSSISSSSBSSSSHHSSSSSSSSISSSXXXXXXXXXXSSSSHHHHHHHHHHHHHSSSSE
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKKKNNNNNNNNKKKKNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_372
GGCAGAUUCUGGUGAAUCUGCC
(((((((((....)))))))))
SSSSSSSSSHHHHSSSSSSSSS
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_373
GGUUUCUUUUUAGUGAUUUUUCCAAACCCCUUUGUGCAAAAAUCAUUA
[[[[[......((((((((((((]]]]].....).).)))))))))).
EEEEEEEEEEESSSSSSSSSSSSHHHHHHHHHHSBSBSSSSSSSSSSE
KKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_374
GGCCGUAACUAUAACGGUC
((((((.......))))))
SSSSSSHHHHHHHSSSSSS
NNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_376
GGCGUUCGCUUAGAACGUC
((((((((...))))))))
SSSSSSSSHHHSSSSSSSS
NNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_377
GGAAACGCCGCGGUCAGCUCGGCUGCUGCGAAGAGUUCGUCUCUGUUGUUUCC
((((((((.((((.((((...))))))))(..((((..).))))).)))))))
SSSSSSSSMSSSSBSSSSHHHSSSSSSSSSBBSSSSHHSBSSSSSBSSSSSSS
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_379
GCUUGGUGCUUAGCUUCUUUCACCAAGCAUAUUACACGCGGAUAACCGCCAAAGGAGAA
((((((((....[[[[[[[.)))))))).......(.(((((.).))))).]]]]]]].
SSSSSSSSHHHHHHHHHHHHSSSSSSSSXXXXXXXSBSSSSSHSBSSSSSEEEEEEEEE
NNNNNNNNNNNNKKKKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKKKKKKN
bpRNA_PDB_380
GGAGAGUGGAACUCC
((((((...))))))
SSSSSSHHHSSSSSS
NNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_381
GGGUUGACCGUUGAAUCUCACGGCAACCC
.......((((.(.....)))))......
EEEEEEESSSSBSHHHHHSSSSSEEEEEE
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_382
GGGCGAGGGUCUCCUCUGAGUGAUUGACUACCCGUCAGCGGGGGUCUUUCAUUUGGGGGCUCGUGCCC
(((((.((((((((..(..((((((((((.(((((..)))))))))))))))).)))))))).)))))
SSSSSISSSSSSSSIISBBSSSSSSSSSSBSSSSSHHSSSSSSSSSSSSSSSSISSSSSSSSISSSSS
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_383
GGACCUCCCGUCCUUGGACGGUCGAGCGAAAGCUUGUGAUUGGUCCG
(((((.(((((((..))))))..(((((..)))))....).))))).
SSSSSISSSSSSSHHSSSSSSMMSSSSSHHSSSSSMMMMSISSSSSE
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_385
CCAGAAACGGA
((((..)))).
SSSSHHSSSSE
NNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_386
GGAUUUGCAGGCCUACCAGAAACGGAUGGGAGUGCAGAU
..(((((((((((((((((..)))).)))))))))))))
EESSSSSSSSSSSSSSSSSHHSSSSBSSSSSSSSSSSSS
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_389
GCUGAGCUCGAAAGAGCAAUGAUGUC
.((((((((....))))...))))..
ESSSSSSSSHHHHSSSSBBBSSSSEE
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_390
GGUGCCCGUCUGUUGUGUGACUCUGGUGAGAGCCAGAGGAGAUCUCUCGACGCAGGACUCGGCUUGCUGGAGACGGCAAGAGGCGAGGGGCGGCGACUGGUGAGUACGCCAAAAAUUUUGACUAGCGGAGGCUAGAAGGAGAGAGAUGGGUGCCC
((((((((((((((((((.(((((((((..)))))))))..((((((((((((((..(((((((((((((..)))))))))..))))))))))))))))))....)))).).....(((((((((((..))))))))))).))))))))))))).
SSSSSSSSSSSSSSSSSSMSSSSSSSSSHHSSSSSSSSSMMSSSSSSSSSSSSSSBBSSSSSSSSSSSSSHHSSSSSSSSSBBSSSSSSSSSSSSSSSSSSMMMMSSSSBSMMMMMSSSSSSSSSSSHHSSSSSSSSSSSMSSSSSSSSSSSSSE
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_391
GCAUGUUUUCUGUGAAAACGGUU
..(.((((((...)))))).)..
EESISSSSSSHHHSSSSSSISEE
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_392
GCAUGUUUAGUGUCUAAACGGUU
....((((((...))))))....
EEEESSSSSSHHHSSSSSSEEEE
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_393
GCAGCAGGGAACUCACGCUUGCGUAGAGGCUAAGUGCUUCGGCACAGCACAAGCCCGCUGCG
(((((.((((.(((.(((..)))..)))(((..(((((..))))))))....))))))))).
SSSSSBSSSSMSSSISSSHHSSSIISSSSSSBBSSSSSHHSSSSSSSSMMMMSSSSSSSSSE
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_395
GGAAUAUUUUUGCUGUACUUUCUAUAGUGAAUAGAGUUAGGCAGGGAUAUUCC
(((((((((((((((.(((..(((((..).)))))))).))))))))))))))
SSSSSSSSSSSSSSSBSSSBBSSSSSHHSBSSSSSSSSBSSSSSSSSSSSSSS
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN