multimolecule/bprna-90 · Datasets at Hugging Face

id stringlengths 11 16	sequence stringlengths 11 4.38k	secondary_structure stringlengths 11 4.38k	structural_annotation stringlengths 11 4.38k	functional_annotation stringlengths 11 4.38k
bpRNA_PDB_396	GGAAUUUAUGAGUACCUUCGGAUACUUAUAGAUUCC	(((((((((((((((((..)))))))))))))))))	SSSSSSSSSSSSSSSSSHHSSSSSSSSSSSSSSSSS	NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_397	GGGUAGAGUAUAAUUAGUCUUCGGACUUCCUUAUACUUAUCC	((.(...(((((..((((((..))))))...)))))..).))	SSISIIISSSSSIISSSSSSHHSSSSSSIIISSSSSIISISS	NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_398	GGAAUUUAUGAGUACGUAGAGUAUAAUUAGUCUUCGGACUUCCUUAUACUUAUAUACUUAUAGAUUCC	(((((((((((((((....((((((..((((((..))))))...))))).).).))))))))))))))	SSSSSSSSSSSSSSSIIIISSSSSSIISSSSSSHHSSSSSSIIISSSSSBSISBSSSSSSSSSSSSSS	NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_399	GGUGAGUACGUAGAGUAUACUUCGGUAUACUUAUAUACUUACC	((((((((...(.((((((((..)))))))).)..))))))))	SSSSSSSSIIISISSSSSSSSHHSSSSSSSSISIISSSSSSSS	NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_400	GGCCUUAUGCACGGGAAAUACGCAUAUCAGUGAGGAUUCGUCCGAGAUUGUGUUUUUGCUGGUGUAAAUCAGCAGUUCCCCUGCAUAAGGCU	(((((((((((.(((((..(((((.((((...(((((..))))))))))))))...((((((((..)))))))).))))).)))))))))))	SSSSSSSSSSSISSSSSMMSSSSSBSSSSBBBSSSSSHHSSSSSSSSSSSSSSMMMSSSSSSSSHHSSSSSSSSMSSSSSISSSSSSSSSSS	NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_401	GGUAGUUUUGGCAUGACUCUACC	(((((((((.....)))))))))	SSSSSSSSSHHHHHSSSSSSSSS	NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_402	GGAACAGCUGUACUGGGCAGUUACAGCAGUCGUAUGGUAACACAUGCGGCGUUCCGAAAUACCAUGCCUG	(((((((((((((.[[[[[).)))))))(((((((((....)))))))))))))).........]]]]].	SSSSSSSSSSSSSHHHHHHSBSSSSSSSSSSSSSSSSHHHHSSSSSSSSSSSSSSEEEEEEEEEEEEEEE	NNNNNNNNNNNNNNKKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKKKKN
bpRNA_PDB_403	GGGGCUGAAGGAUGCCCAGAAGGUACCCCAUUGUAUGGGAUCUGAUCUGGGGCCUCGGUGCACAUGCUUUACAUGUGUUUAGUCGAGGUUAAAAAACGUCUAGGCCCC	((((((..(((((((((((((((.(((((((...)))))))))).))))))((((((((((((((((...)))))))).)..)))))))((...))))))))))))))	SSSSSSBBSSSSSSSSSSSSSSSBSSSSSSSHHHSSSSSSSSSSBSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSHHHSSSSSSSSBSBBSSSSSSSSSHHHSSSSSSSSSSSSSS	NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_404	GGGCAGAAGGUACCCCAUUGUAUGGGAUCUGAUCUGCCC	((((((((((.(((((((...)))))))))).)))))))	SSSSSSSSSSBSSSSSSSHHHSSSSSSSSSSBSSSSSSS	NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_405	GGGCUCGGUGCACAUGCUUUACAUGUGUUUAGUCGAGCCC	(((((((((((((((((...)))))))).)..))))))))	SSSSSSSSSSSSSSSSSHHHSSSSSSSSBSBBSSSSSSSS	NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_406	GGGCUGAAGGAUGGAGACGUCUAGGCCC	(((((..(((((((..))))))))))))	SSSSSBBSSSSSSSHHSSSSSSSSSSSS	NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_407	GGGGCUGAAGGAUGCCCAGAGAGAUCUGGGGCCUCGGGAGAUCGAGGUUAAAAAACGUCUAGGCCCC	((((((...((((((((((((..)))))))((((((((..))))))))((...))))))).))))))	SSSSSSIIISSSSSSSSSSSSHHSSSSSSSSSSSSSSSHHSSSSSSSSSSHHHSSSSSSSISSSSSS	NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_408	GGACGUUAAAAGGCUUCGGCCUACGUCC	(((((..(...((((..)))).))))))	SSSSSBBSIIISSSSHHSSSSISSSSSS	NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_409	UCUCGGCCUUUUGGCUAAGA	((((((((....))))))))	SSSSSSSSHHHHSSSSSSSS	NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_410	GGUUUGCCUUUUGGCUUACC	((((((((....))))))))	SSSSSSSSHHHHSSSSSSSS	NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_416	GGACCCGCCACUGCAGAGAUGCAAUCCAGUGGUCC	(((((......((((....)))).......)))))	SSSSSIIIIIISSSSHHHHSSSSIIIIIIISSSSS	NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_417	CGCGAAUUAGCG	............	EEEEEEEEEEEE	NNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_419	GGAGUGCCUGAGCUGUGGCACUCC	(((((((((.....).))))))))	SSSSSSSSSHHHHHSBSSSSSSSS	NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_421	GGCACAGAGUUAUGUGCC	((((((()....))))))	SSSSSSSSBBBBSSSSSS	NNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_422	GGUUGCGGGUCUCGCAACC	((((((((..).)))))))	SSSSSSSSHHSBSSSSSSS	NNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_423	GGGAGACCUGAAGUGGGUUUCCC	(((((((((.....)))))))))	SSSSSSSSSHHHHHSSSSSSSSS	NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_426	GGGAUCCAUGACAGGAUCCC	(((((((......)))))))	SSSSSSSHHHHHHSSSSSSS	NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_427	GGCCCGCCGAAAGGCCGGCC	((((.(((....))).))))	SSSSISSSHHHHSSSISSSS	NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_428	GGACCCACCACGGCGAGGUCCA	(((((((((..)))).))))).	SSSSSSSSSHHSSSSBSSSSSE	NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_429	GGCGCUUUGACACAAUCUACAUUGUAAAAGCGCC	(((((((((..(((((....))))))))))))))	SSSSSSSSSBBSSSSSHHHHSSSSSSSSSSSSSS	NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_430	ACUUGGUUUAGGUAAUGAGU	((((.(((....)).)))))	SSSSBSSSHHHHSSBSSSSS	NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_431	GCUGACCAGCUAUGAGGUCAUACAUCGUCAUAGCAC	..[[[[[.(((((((]]]]].......)))))))..	EEEEEEEESSSSSSSHHHHHHHHHHHHSSSSSSSEE	NNKKKKKNNNNNNNNKKKKKNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_435	GACAUAUUAUCGCGUGGAUAAGGGCACGCAGGUUUUUACGGGCAACGGUAAAUGUCCGAUUAUGUCC	(((((([..(((((((.{{{.{{)))))))(....<])((((((}}()}}}))))))..))))))>.	SSSSSSMMMSSSSSSSHHHHHHHSSSSSSSSHHHHHHSSSSSSSIISSIIISSSSSSMMSSSSSSEE	NNNNNNKNNNNNNNNNNKKKNKKNNNNNNNNNNNNKKNNNNNNNKKNNKKKNNNNNNNNNNNNNNKN
bpRNA_PDB_438	GGCGCAUCGGCGCC	(((((....)))))	SSSSSHHHHSSSSS	NNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_441	GCCCGGAUAGUGUCCUUGGGAAACCGAGUCCGGGCACCA	((((((((((.(...........)))).)))))))....	SSSSSSSSSSBSHHHHHHHHHHHSSSSBSSSSSSSEEEE	NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_443	UCCGAAGUGCAACGGGAAAAUGCACU	(((((......))))..)........	SSSSSHHHHHHSSSSBBSEEEEEEEE	NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_446	CGCGUCACCUCGAGCAAGUCGC	......................	EEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEE	NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_450	GUGGUCUGAUGAGGCC	................	EEEEEEEEEEEEEEEE	NNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_454	gUUAAUCAUGCUCGGGUAAUCGCUGCGGCCGGUUUCGGCCGUAGAGGAAAGUCCAUGCUCGCACGGUGCUGAGAUGCCCGUAGUGUUCGUGGAAACACGAgCGAGAAACCCAAAUGAUGGUaGGGGCACCUUCCCGAAGGAAAUGAACGGAGGGAAGGACAGGCGGCGCAUGCAGCCUGUAGAUAGAUGAUUACCGCCGGAGUACGAGGCGCAAAGCCGCUUGCAGuACGAAGGUACAGAACAUGGCUUAUAGAGCAUGAUUAAC	.((((((((((((([[[[[[[.(((((((((....))))))))).{.(<((.((((((((((((((.((([..).))))))...................)))))..((((...........))))..(((((((()(((.]....)))..)))))))(((((((........)))))))[(....].]]]]]]]((((.((..........................)).)))).}>..))))))))).).)))))))))))).	ESSSSSSSSSSSSSMMMMMMMMSSSSSSSSSHHHHSSSSSSSSSMMMSBSSBSSSSSSSSSSSSSSBSSSHHHSBSSSSSSBBBBBBBBBBBBBBBBBBBSSSSSMMSSSSHHHHHHHHHHHSSSSMMSSSSSSSSSSSSHHHHHHSSSMMSSSSSSSSSSSSSSHHHHHHHHSSSSSSSMSIIIIIIIIIIIIISSSSISSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSSISSSSIIIIISSSSSSSSSMSBSSSSSSSSSSSSE	NNNNNNNNNNNNNNKKKKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNKNKKKKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_455	gGCCGACGGAGGCGCGCCCGAGAUGAGUAGGCUGUCCCAUCAGGGGAGGAAUCGGGGACGGCUGAAAGGCGAGGGCGCCGAAGGGUGCAGAGUUCCUCCCGCUCUGCAUGCCUGGGGGUAUGGGGAAUACCCAUACCACUGUCACGGAGGUCUCUCCGUGGAGAGCCGUCGGUc	((((((((((((.((((((((((.((.(((((.(((((.[((.{{{{{{).].)))))).)))))))[)))))))))))..((((((((((((.}}}}}}))))))))).)))((((((((((((]..))))))))))))(((((((((....)))))))))).))))))))))	SSSSSSSSSSSSBSSSSSSSSSSISSBSSSSSISSSSSBBSSHHHHHHHSBBBSSSSSSISSSSSSSISSSSSSSSSSSMMSSSSSSSSSSSSHHHHHHHSSSSSSSSSBSSSSSSSSSSSSSSSHHHSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSHHHHSSSSSSSSSSBSSSSSSSSSS	NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNKKKKKKNNKNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_472	GUUCCCGAAAGGAUGGCGGAAACGCCAGAUGCCUUGUAACCGAAAGGGGGAAU	((((((.((((((((((((..)))))))...)))))...(((..)))))))))	SSSSSSMSSSSSSSSSSSSHHSSSSSSSBBBSSSSSMMMSSSHHSSSSSSSSS	NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_485	CUGGGUCGCAGUAACCCCAGUUAACAAAACAAG	((((([.{<<{....))))).......].}}>>	SSSSSHHHHHHHHHHSSSSSEEEEEEEEEEEEE	NNNNNKNKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNKNKKKK
bpRNA_PDB_494	GGCUUCGCAAGAGAGGUGGAGGGACUGGCCCGACGAAACCCGGCAACCAGAAAUGGUGCCAAUUCCUGCAGCGGAAACGUUGAAAGCGGAGCCG	((((((((....(.(((((((((.[[[[)))...)))))))(((..(((....))).)))...(]]]]((((((..))))))..))))))))).	SSSSSSSSMMMMSBSSSSSSSSSHHHHHSSSBBBSSSSSSSSSSIISSSHHHHSSSISSSMMMSIIIISSSSSSHHSSSSSSIISSSSSSSSSE	NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_499	GGUCGgGUAGUGAGgGCCUUGGUCAGACGCAGCGGGCGUGCUUGUGGACUGCUUGGUGGGGCUUGCUCUGCUAGGCGGACUACUUGCGUGCCUUGUUGUAGACGGCCUUGGUaGGUCUCUUGUAGACCgucgCUUGCUACaauuaaCGAUC	(((((.((((((((.(((..((((.((((((((.(((((((.(((((((((((((((((((....))))))))))))))))))).)))))))..)))))))).))))..))).((((.......))))....))))))))......)))))	SSSSSISSSSSSSSMSSSIISSSSISSSSSSSSISSSSSSSISSSSSSSSSSSSSSSSSSSHHHHSSSSSSSSSSSSSSSSSSSISSSSSSSIISSSSSSSSISSSSIISSSMSSSSHHHHHHHSSSSMMMMSSSSSSSSIIIIIISSSSS	NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_511	GGCUUCAUAUAAUCCGAAUGAUAUGGUUUCGGAGCUUCCACCAAGAGCCUUAAACUCUUGACUAUGGAGUC	((((((((([..(((((((.{{{.{{)))))))(.....])((((((}}..}}}))))))..)))))))))	SSSSSSSSSMMMSSSSSSSHHHHHHHSSSSSSSSHHHHHHSSSSSSSHHHHHHHSSSSSSMMSSSSSSSSS	NNNNNNNNNKNNNNNNNNNNKKKNKKNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNKKNNKKKNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_512	UAGGGUUAGGGU	..[{(...]}).	EEEESHHHHHSE	NNKKNNNNKKNN
bpRNA_PDB_513	AGAGAAGAUUUUUUUU	................	EEEEEEEEEEEEEEEE	NNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_514	AGAGAAGAUCUUCUCU	................	EEEEEEEEEEEEEEEE	NNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_516	GGACGAGGAGCGUUGCAAGCGAAAGCCCAGGCUAGUCCGUUCAAACGGCGCUCA	...[[[[((((((({[.((((..)))).)(]]]]]......).)))))).}...	EEEEEEESSSSSSSIIISSSSHHSSSSISSHHHHHHHHHHHSMSSSSSSEEEEE	NNNKKKKNNNNNNNKKNNNNNNNNNNNNNNKKKKKNNNNNNNNNNNNNNNKNNN
bpRNA_PDB_517	GGUUCCGAGGGUCAUCGGAACCA	((((((((......)))))))).	SSSSSSSSHHHHHHSSSSSSSSE	NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_520	GGCGUGUAUGUGGGGAAACCCUGAUUGAGUUCAGCCCACAUACUUUGUUGAUGGUUGUCAAUCGCC	((((((((((((((......(((((....)))))))))))))))..((((((....))))))))))	SSSSSSSSSSSSSSBBBBBBSSSSSHHHHSSSSSSSSSSSSSSSMMSSSSSSHHHHSSSSSSSSSS	NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_522	UGCUCCUAGUACGAGAGGACCGGXGUG	.(((((..()(((..)))...))))).	ESSSSSMMSSSSSHHSSSMMMSSSSSE	NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_523	GGAGAGUAGAUGAUUCGCGUUAAGCGUGUGUGAAUGGGAUGUCGUCACACAACGAAGCGAGAGCGCGGUGAAUCAUUGCAUCCGCUCCA	(((((..[((((((((((((..((.((((((((.(.{{{{{).])))))))).)).(((..)))))).))))))))).}}}}}))))).	SSSSSIIISSSSSSSSSSSSMMSSISSSSSSSSISHHHHHHSIISSSSSSSSISSMSSSHHSSSSSSBSSSSSSSSSIIIIIISSSSSE	NNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKKKKNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKKKKNNNNNN
bpRNA_PDB_524	GGACAGAGUAGGUAAACGUGCGUAAAGUGCCUGAGGGACGGGGAGUUGUCCUCAGGACGAACACCGAAAGGUGGCGGUACGUUUACCGCAUCUCGCUGUUC	.........((((((((((((((..((.(((((((((.(.[[[[.)..))))))))).)).(((((..)))))))).)))))))))))..]]]].......	EEEEEEEEESSSSSSSSSSSSSSMMSSISSSSSSSSSISHHHHHHSIISSSSSSSSSISSMSSSSSHHSSSSSSSSBSSSSSSSSSSSEEEEEEEEEEEEE	NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKKKNNNNNNN
bpRNA_PDB_527	cCUCCCGGGAGAGCCGCUAAGGGGGAAACUCUAUGCGGUACUGCCUGAUAGGGUGCUUGCGAGUGCCCCGGGAGGuCUCGUAGa	(((((((((((.((((((()((((....))))).)))))[))(((((.])))))((..[[[[[.))))))))))).]]]]]...	SSSSSSSSSSSISSSSSSSSSSSSHHHHSSSSSBSSSSSISSSSSSSHHSSSSSSSHHHHHHHHSSSSSSSSSSSEEEEEEEEE	NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNKNNNNNNNNNKKKKKNNNNNNNNNNNNNKKKKKNNN
bpRNA_PDB_530	UGAGCUUCGGCUC	.............	EEEEEEEEEEEEE	NNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_535	gGACCCGGCUAACGCUGGGUCC	((((((((((..))))))))))	SSSSSSSSSSHHSSSSSSSSSS	NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_541	GGCGAAGAACCGGGGAGCC	...................	EEEEEEEEEEEEEEEEEEE	NNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_544	GUUAUAUGUGCCCGGCACGGGUGCAGUCUCUAGGGUGUGAGAGUCCCACUGUGAAAGCAGAAAAGUAACAUAGCCUCACGCGAGGGUGUCCGUGGGGCGACAUGGAAUCUGAAGAAAGCGGACGGCACCUUCGGUCUGUGGGGAACACGCAUCUCAUAAGGCGCGGUAUCAAUGGAUGAGUUUUUGCAUAACAAAACAAAGUCCUUUCUGCCAAAGUUGGUACAGAGUAAAUGAAGCAGAUUGAUGAAGGGAAAGACUGCAUUCUUACCCGGAGGUCUGGGGAAACAGAAGUCAGAAGUCGUAAUACCCCGCUGUUCGCAGGGGAAGGACGCAAGUAGGGCGGCGUUCGCGACUAAGCUCCACCGUAUACCGACCGAACGGUACGUACGGUGGUGUGAGAGGAGUUCGCUCUACUCUAUUAG	[[[[...{[{((((({(.(((((((((((.((((((<..)..)))))(((((((<.AAAAAA.)))))))((((((.((((.(((((.(((((((..))))))))))))..]}.{)))).))))))((((((((((((.((...))...(.((.....([((..(((((((((((((((((((.].]]]].)))))).))))>aaaaaa....)))))))))..)))...)).))))))...)))))))>.))))))))))))}}})))))(((((((((..)))))))))..(.(((((.((.(.(((.(....).))).)))))))).)((.(((.((((....)))))())).)).(((((((((((((..))))..))))))))).................................	EEEEEEEEEESSSSSISBSSSSSSSSSSSMSSSSSSHHHSBBSSSSSSSSSSSSHHHHHHHHHSSSSSSSSSSSSSISSSSISSSSSBSSSSSSSHHSSSSSSSSSSSSIIIIIISSSSISSSSSSSSSSSSSSSSSSMSSHHHSSMMMSISSIIIIISBSSIISSSSSSSSSSSSSSSSSSSHHHHHHHHSSSSSSBSSSSBBBBBBBBBBBSSSSSSSSSIISSSIIISSISSSSSSBBBSSSSSSSMMSSSSSSSSSSSSIIISSSSSSSSSSSSSSHHSSSSSSSSSMMSISSSSSBSSBSISSSISHHHHSISSSISSSSSSSSISSSISSSBSSSSHHHHSSSSSSSSSISSMSSSSSSSSSSSSSHHSSSSBBSSSSSSSSSEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEE	KKKKNNNKKKNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNKNKKKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNKKKKNNNNNNNNNNNNKKKKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_550	GGUGCCCGGCAGGGGUGCAGGCUGUAGGGUGGGUGAGAGUCCCUGUCUGGGCAGACAGAAGUAAUAGCCAGACGCAAGGGAGUCCGUGGGUGGCGACAUGGAAUCUGAAGGAAGCGGACGACCAACGUUCUGUGGGAGGAACACUUAAUUCAAGGCAGGGUAUCAAUGGAUGGGUUUGUUUGCAUAACAAAACAAAGUCCUUUCUGCCAAAGUUGGUACAGAGUAAAUGAAGCAGAUUGAUGAAGGGAAAGACUGCAUUCUUACCGGGGUCUGGCUGGAAACAGAAGUCGAAGGCAUACUACCCAGCCUGUUCGCAGGGGAAGGACCAAGUAAGGCGUGCGUUCGCGCCUAAGCAUGGCCGUAUGCAGACCGAACGGUACGUACGGUGGUGUG	.[[{((((({(..(((((((.((.((((((<..)..))))).((((...<<<<<<....)))).(..((..(((((((((..(((((((..))))))).))))..]})[))))..))..)(((...(.((((.((.[.))...(((.(]...([((...(..(.(((((.((.((((.]......)))).).).))..>>>>>>...))).)...)..)))..).)))))))....)...)))>.)).))))))).)]}])))))(..((((((..))))))..)....((((.(.((.(((((.(....).)))))))).)))).(((((..(((((..)))))...))))).(..(((((((.(.(..).)...)))))))..).......	EEEESSSSSISIISSSSSSSISSMSSSSSSHHHSBBSSSSSMSSSSHHHHHHHHHHHHHSSSSMSIISSIISSSSSSSSSIISSSSSSSHHSSSSSSSISSSSBBBBSBSSSSIISSIISSSSIIISISSSSMSSHHHSSMMMSSSISIIIISBSSIIISIISISSSSSISSISSSSHHHHHHHHSSSSISBSISSBBBBBBBBBBBSSSISIIISIISSSIISISSSSSSSIIIISIIISSSMMSSISSSSSSSISIIISSSSSSIISSSSSSHHSSSSSSIISXXXXSSSSISBSSBSSSSSISHHHHSISSSSSSSSISSSSXSSSSSIISSSSSHHSSSSSIIISSSSSXSIISSSSSSSISISHHSISIIISSSSSSSIISEEEEEEE	NKKKNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNKNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_567	CUGCUGGCUAAGGCAUGAAAGUGCUAUGCCUGCUG	((((.((([.(((((((..))))))])))).))))	SSSSISSSBBSSSSSSSHHSSSSSSBSSSSISSSS	NNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_568	GGUUAAAGCCUUAUGGUCGCUACCAUUGCACUCCGGUAGCGUUAAAAGGGAAGACGGGUGAGAAUCCCGCGCAGCCCCCGCUACUGUGAGGGAGGACGAAGCCCUAGUAAGCCACUGCCGAAAGGUGGGAAGGCAGGGUGGAGGAUGAGUCCCGAGCCAGGAGACCUGCCAUAAGGUUUUAGAAGUUCGCCUUCGGGGGGAAGGUGAACA	.....(.(((((((([((((((((..........)))))))(..])(.....(.(((((...)..)))))[[(({{{{{{))(((((..(((((.((((...(((.....(((.((((((..))))))...)))).))..)))...).))))).)]])))).....)).)))))))))......((.(.((((}}}}}.})))).).)).	EEEEESBSSSSSSSSISSSSSSSSHHHHHHHHHHSSSSSSSSHHHSSMMMMMSBSSSSSHHHSBBSSSSSMMSSHHHHHHSSSSSSSIISSSSSISSSSIIISSSBBBBBSSSISSSSSSHHSSSSSSIIISSSSBSSIISSSBBBSISSSSSISBBSSSSMMMMMSSISSSSSSSSSXXXXXXSSISISSSSHHHHHHHSSSSISISSE	NNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKNNKKKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKKKKNKNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_570	GGAACCGCGAAAGCGGUUCCACGACGAUACUUAUUUCCUUUGAUCGUCGUUAUUACUGGCUUCGGCCACAAAGGAGA	(((((((((..)))))))))(((((((((......[[[[[.)))))))))....(.(((((..)))))).]]]]]..	SSSSSSSSSHHSSSSSSSSSSSSSSSSSSHHHHHHHHHHHHSSSSSSSSSXXXXSBSSSSSHHSSSSSSEEEEEEEE	NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKKKKNN
bpRNA_PDB_572	GCCCCUGCCUGCCUGCAGCUAAGGAUGAAAGUCUAUGCUGCCUGCCUGCCUGGGC	((((..((((((((((((((()(((((..)))))).)))))))))))))..))))	SSSSIISSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSHHSSSSSSBSSSSSSSSSSSSSIISSSS	NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_591	CCGCCUAACACUGCCAAUGCCGGUCCCAAGCCCGGAUAAAAGUGGAGGGGGCGG	(((((..((((([[(...)((((({{{{)]])))).....)))))}}}})))))	SSSSSIISSSSSMMSHHHSSSSSSHHHHSBBSSSSMMMMMSSSSSIIIISSSSS	NNNNNNNNNNNNKKNNNNNNNNNNKKKKNKKNNNNNNNNNNNNNNKKKKNNNNN
bpRNA_PDB_592	GGAUCACGAGGGGGAGACCCCGGCAACCUGGGACGGACACCCAAGGUGCUCACACCGGAGACGGUGGAUCCGGCCCGAGAGGGCAACGAAGGUCCGA	(((((....((((....))))(((..((((((.[[[[[.))).))).)))..(((((....))))))))))((((((..))))))......]]]]].	SSSSSMMMMSSSSHHHHSSSSSSSIISSSSSSHHHHHHHSSSBSSSISSSMMSSSSSHHHHSSSSSSSSSSSSSSSSHHSSSSSSEEEEEEEEEEEE	NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKKKKN
bpRNA_PDB_593	UUAGCUCGCCAGUUAGCGAGGUCUGUCUCGACACGACAGAUAAUCGGGUGCAACUCCCGCCCCUCUUCCGAGGGUCAUCGGAACCa	...[((((([[{...)))))(((((((.......)))))))...(((((]}.)].))))[[[..(((((((]]].].)))))).).	EEEESSSSSHHHHHHSSSSSSSSSSSSHHHHHHHSSSSSSSXXXSSSSSHHHSBBSSSSXXXXXSSSSSSSHHHHHHSSSSSSBSE	NNNKNNNNNKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKNNKNNNNNKKKNNNNNNNNNKKKNKNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_595	cAUCCGGUAUCCCAAGACAAUCUUCGGGUUGGGUUGGGAAGUAUCAUGGCUAAUCACCAUGAUGCAAUCGGGUUGAACACUUAAUUGGGUUAAAACGGUGGGGGACGAUCCCGUAACAUCCGUCCUAACGGCGACAGACUGCACGGCCCUGCCUCUUAGGUGUGUCCAAUGAacAGUCGUUCCGAAAGGAAG	[.[(((({..((((((((((((....))))))))))))..((((((((((..{{{))))))))))..))))((((((((((...)((((((][.(((((.(((...}}}))).....).))))((...])).....<<<<<]()))))))((((...))))))))))))).}.>>>>>.((((....)))).	EEESSSSMMMSSSSSSSSSSSSHHHHSSSSSSSSSSSSMMSSSSSSSSSSHHHHHSSSSSSSSSSMMSSSSSSSSSSSSSSHHHSSSSSSSMMMSSSSSISSSHHHHHHSSSIIIIISBSSSSSSHHHHSSMMMMMMMMMMMSSSSSSSSSSSSHHHSSSSSSSSSSSSSMMMMMMMMMSSSSHHHHSSSSE	KNKNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKNNNNNNNNNNNNNKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNKKKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNKKKKKNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_598	GGGUCAGAUCGGCGAAAGUCGCCACUUCGCCGAGGAGUGCAAUCUGUGAGGCCCCAGGAGGACUGGGU	..[[((((((((((..))))).(]((((.....)))).)].)))))(.)...((((((...)))))).	EEEESSSSSSSSSSHHSSSSSMSISSSSHHHHHSSSSISMMSSSSSSHSMMMSSSSSSHHHSSSSSSE	NNKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_600	GCGCUGAAUUCCCUGAAGGGAAACGGGGGACCCAAUCUUCAGGGGUGAAUCCCACGUAAGUGGGUAGGGCUAGUCUCUUUCGGCCCGAACCCGUCAGCUAACCUCGUAAGCGUGGAAAGAGGga	.(((((..(((((....)))))(((((((..((........((((((..(((((((..)))))))(((((([..{{{{{{{)))))))))))..).))..))))))))))))].}}}}}}}...	ESSSSSMMSSSSSHHHHSSSSSSSSSSSSIISSIIIIIIIISSSSSSMMSSSSSSSHHSSSSSSSSSSSSSHHHHHHHHHHSSSSSSSSSSSBBSISSIISSSSSSSSSSSSEEEEEEEEEEEE	NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNKKKKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNKKKKKKKNNN
bpRNA_PDB_602	GGAUCGCUGAACCCGAAAGGGGCGGGGGACCCAGAAAUGGGGCGAAUCUCUUCCGAAAGGAAGAGUAGGGUUACUCCUUCGACCCGAGCCCGUCAGCUAACCUCGCAAGCGUCCGAAGGAGAAUCaa	....(((((............(((((((...(......((((((..((((((((....))))))))(((((([{{{{{{{)))))))))))..).)...))))))))))))]..}}}}}}}......	EEEESSSSSBBBBBBBBBBBBSSSSSSSIIISIIIIIISSSSSSMMSSSSSSSSHHHHSSSSSSSSSSSSSSHHHHHHHHSSSSSSSSSSSBBSISIIISSSSSSSSSSSSEEEEEEEEEEEEEEEE	NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKKKKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNKKKKKKKNNNNNN
bpRNA_PDB_604	GGCGCUGUGUCGCAAUCUGCGAAGGGCGUCGUCGGCCCGAGCGGUAGUAAGCAGGGAACUCACCUCCAAUGAAACACAUUGUCGUAGCAGUUGACUACUGUUAUGUGAUUGGUAGAGGCUAAGUGACGGUAUUGGCGUAAGCCAAUACCGCGGCACAGCACAAGCCCGCUUGCGAGAUUACAGCGC	.(.(((((.((..((.(((((..((((.......)))).)))))))(((((([((((.(((((((((((((.....)))))..(((((((.......)))))))....))))).)))(((].(((((((..((((......))))..)))..)))))))....))))))))))..))..))))).)	ESISSSSSISSMMSSBSSSSSIISSSSHHHHHHHSSSSISSSSSSSSSSSSSBSSSSMSSSSSSSSSSSSSHHHHHSSSSSMMSSSSSSSHHHHHHHSSSSSSSMMMMSSSSSBSSSSSSBBSSSSSSSIISSSSHHHHHHSSSSIISSSBBSSSSSSSMMMMSSSSSSSSSSMMSSIISSSSSIS	NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_606	AGAGAAGAAAGGGAAAUUUUUUUUUUUUUUUU	................................	EEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEE	NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_607	CGCXAAUUAGCG	............	EEEEEEEEEEEE	NNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_608	CGCGAXUUAGCG	............	EEEEEEEEEEEE	NNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_609	CGCGAAUUAXCG	............	EEEEEEEEEEEE	NNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_610	gGGAACUGAGCAGGCAAUGACCAGAGCGGUCAUGCAGCCGGGCUGCGAAAGCGGCAACAGAUGAUUACACGCACAUCUGUGGGACAGUUCCCAc	(((((((((.(((((.(((((((..).))))))...)))).((((((..))))))((((((((..........)))))))).))))))))))..	SSSSSSSSSBSSSSSISSSSSSSHHSBSSSSSSIIISSSSMSSSSSSHHSSSSSSSSSSSSSSHHHHHHHHHHSSSSSSSSMSSSSSSSSSSEE	NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_611	GAGCAACUUAGGAUUUUAGGCUCCCCGGCGUGUCUCGAACCAUGCCGGGCAACCCAUAGGGGGCUGGCGGUCCCUGUGCGGUCAAAAUUCAUCCGCCGGAG	[[[[[.(...((((((..]]]]](((((((((......)))))))))...(((((((((((........))))))).)))).))))))...........).	EEEEEESIIISSSSSSMMMMMMMSSSSSSSSSHHHHHHSSSSSSSSSMMMSSSSSSSSSSSHHHHHHHHSSSSSSSBSSSSMSSSSSSIIIIIIIIIIISE	KKKKKNNNNNNNNNNNNNKKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_614	GGGAAGAUAUAAUCCUAAUGAUAUGGUUUGGGAGUUUCUACCAAGAGCCUUAAACUCUUGAUUAUCUUCCC	((((((((([..(((((((.{{..{{)))))))(.....])((((((}}...}}))))))..)))))))))	SSSSSSSSSMMMSSSSSSSHHHHHHHSSSSSSSSHHHHHHSSSSSSSHHHHHHHSSSSSSMMSSSSSSSSS	NNNNNNNNNKNNNNNNNNNNKKNNKKNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNKKNNNKKNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_616	uGCCGUGCUAAGCGGGGAGGUAGCGGUGCCCUGUACCUGCAAUCCGCUCUAGCAGGGCCGAAUCCCUUCUCGAGGUUCGGUAACGAAUCGACAGAAGGUGCACGGUc	.(((((((((((((((((...[[[[[.)))))(.)(((((...]]]]]...))))))))))(..((((((((((((((((..)))))))))))))))))))))))).	ESSSSSSSSSSSSSSSSSHHHHHHHHHSSSSSSHSSSSSSHHHHHHHHHHHSSSSSSSSSSSBBSSSSSSSSSSSSSSSSHHSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSE	NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNKKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_619	GGGUCGUGACUGGCGAACAGGUGGGAAACCACCGGGGAGCGACCCUUGCCGCCCGCCUGGGCAA	((((((((((([......((((((...])))))))))))))))))(((((.........)))))	SSSSSSSSSSSBBBBBBBSSSSSSHHHHSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSHHHHHHHHHSSSSS	NNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_622	GACGAUAUCGAGCAUCAAGAGUGAAUAUCGUC	(((((((((((((.....))))).))))))))	SSSSSSSSSSSSSHHHHHSSSSSBSSSSSSSS	NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_624	CCUGAGUUCAAUUCUAGCG	...................	EEEEEEEEEEEEEEEEEEE	NNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_630	CGCGAAUUXXCG	............	EEEEEEEEEEEE	NNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_631	UUUUUAAUGAAGCCACAGGCUGUGAGGGUCCUAAGCCCCUAAUUCAGAAGGGAA	.(((..((((([[(((((.)))))((((({{{.)]]))))..))))))}}}.))	ESSSBBSSSSSMMSSSSSHSSSSSSSSSSHHHHSBBSSSSMMSSSSSSBBBBSS	NNNNNNNNNNNKKNNNNNNNNNNNNNNNNKKKNNKKNNNNNNNNNNNNKKKNNN
bpRNA_PDB_635	gGCUUAUCaAGAGAGGGCGAGCGACUGGCGCGAAGACCCCCGGCAACCAGAAAUGGUGCCAAUUCCUGCAGCGGAAACGUUGAAAGAUGAGCCGa	((((((((....(.(((((((((.[[[[)))...)))))))((({.(((....))).)))...(]]]]((((((..))))))..))))))))).}	SSSSSSSSMMMMSBSSSSSSSSSHHHHHSSSBBBSSSSSSSSSSIISSSHHHHSSSISSSMMMSIIIISSSSSSHHSSSSSSIISSSSSSSSSEE	NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNK
bpRNA_PDB_644	AUGCGCCCAGAUAGGGUGUUAAGUCAAGUAGUUUAAGGUACUACUCUGUAAGAUAACACAGAAAACAGCCAACCUAACCGAAAAGCGAAAGCUGAUACGGGAACAGAGCACGGUUGGAAAGCGAUGAGUUACCUAAAGACAAUCGGGUACGACUGAGUCGCAAUGUUAAUCAGAUAUAAGGUAUAAGUUGUGUUUACUGAACGCAAGUUUCUAAUUUCGGUUAUGUGUCGAUAGAGGAAAGUGUCUGAAACCUCUAGUACAAAGAAAGGUAAGUUAUGGUUGUGGACUUAUCUGUUAUCACCACAUUUGUACAAUCUGUAGGAGAACCUAUGGGAACGAAACGAAAGCGAUGCCGAGAAUCUGAAUUUACCAAGACUUAACACUAACUGGGGAUACCCUAAACAAGAAUGCCUAaAGGAGGAAAAAGGCUAUAGCACUAGAGCUUGAAAAUCUUGCAAGGGUACGGAGUACUCGUAGUAGUCUGAGAAGGGUAACGCCCUUUACAUGGCAAAGGGGUACAGUUAUUGUGUACUAAAAUUAAAAAUUGAUUAGGGAGGAAAACCUCAAACCAACAAUGGCAAUUUUAGaCAAUAACAGAGCCGUAUACUCCGAGAGGGGUACGUACGGUUCCCGAAGAGGGUGGUGCAAACCAGUCACAGUAAUGUGAACAAGGCGGUACCUCCCUACUUCAC	.........(....[....(.(((.............()........(..........)......(...(((((..(.(....((......)).....)...).....]..)))))...(..(.....(..........[...........)......)..)..)......(((.................................(((...(...................(.(......]........).)....((.......(((.(.(().........).).)))................)).......(((........))).).....)))............[.....)))............))).)........).......(.........(....(......).................{...............)........)....{..(.((..............(...(....[.)..).............)).)..(.(..(...............................................................)..)....(.(.]....(.(.(.]).).)..)......}.).).(.....(.(..(...}...(....)(..)..............)..).)......)...	EEEEEEEEESIIIIIIIIISISSSMMMMMMMMMMMMMSSMMMMMMMMSHHHHHHHHHHSMMMMMMSMMMSSSSSIISISIIIISSHHHHHHSSIIIIISIIISIIIIIIIISSSSSMMMSIISIIIIISHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSIIIIIISIISMMSMMMMMMSSSIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIISSSIIISMMMMMMMMMMMMMMMMMMMSISHHHHHHHHHHHHHHHSISMMMMSSIIIIIIISSSISISSSBBBBBBBBBSISISSSIIIIIIIIIIIIIIIISSMMMMMMMSSSHHHHHHHHSSSMSIIIIISSSIIIIIIIIIIIIIIIIIISSSMMMMMMMMMMMMSSSISIIIIIIIISMMMMMMMSIIIIIIIIISIIIISHHHHHHSIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIISIIIIIIIISMMMMMMMSISSIIIIIIIIIIIIIISIIISHHHHHHSIISIIIIIIIIIIIIISSISMMSMSIISHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSIISMMMMSISIIIIIISISISHHSISISIISIIIIIIIISMSMSIIIIISISIISMMMMMMMSHHHHSSHHSMMMMMMMMMMMMMMSIISISIIIIIISEEE	NNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_645	NNNGACUUAAGUC	.............	EEEEEEEEEEEEE	NNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_646	GGGAUCUGUCACCCCAUUGAUCGCCUUCGGGCUGAUCUGGCUGGCUAGGCGGGUCCC	(((((((((((((((...((((((((..)))).)))).))..))..)))))))))))	SSSSSSSSSSSSSSSIIISSSSSSSSHHSSSSBSSSSISSBBSSBBSSSSSSSSSSS	NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_647	GUGUGCCCGGCAUGGGUGCAGUCUAUAGGGUGAGAGUCCCGAACUGUGAAGGCAGAAGUAACAGUUAGCCUAACGCAACUGCGCCGUGGCGACAUGGCGUGGGAAGGAAGCGGACGGCAAACCUUCGGUCUGAGGAACACGAACUUCAUAUGAGGCUAGGUAUCAAUGGAUGAGUUUGCAUaACAAAACAAAGUCCUUUCUGCCAAAGUUGGUACAGAGUAAAUGAAGCAGAUUGAUGAAGGGAAAGACUGCAUUCUUACCCGGGGAGGUCUGGAAACAGAAGUCAGCAGAAGUCAUAGUACCCUGUUCgCAGGGGAAGGACGGAACAAGUAUGGCGUUCGCGCCUAAGCUUGAACCGCCGUAUACCGAACGGUACGUACGGUGGUGUGGCAGGGGCGCUUCGGCCCCCUAUGCCGAU	[[[[{((((({(.(((((((((((.((((((<..)..)))))(((((((<AAAAAAA.)))))))(((((..(((((((((((((((((..))))))))))))..]})[))))..)))))((((((..(((((((.[.)))..(((((]..(([(((.(((((((((((((((((((.]......)))))).))))>aaaaaaa...))))))))).)))).)))))))))).....))))))>.))))))))))))]}])))))(((((((((..)))))))))(..(..((((.((.(((((((....)))))))))))))..)((((([(((((....))))].))))))((((((((((((((....)))].))))))))))).((((((((.((....)))))))..))).])	EEEEESSSSSISBSSSSSSSSSSSMSSSSSSHHHSBBSSSSSSSSSSSSHHHHHHHHHSSSSSSSSSSSSIISSSSSSSSSSSSSSSSSHHSSSSSSSSSSSSBBBBSBSSSSIISSSSSSSSSSSIISSSSSSSHHHSSSMMSSSSSBBBSSBSSSISSSSSSSSSSSSSSSSSSSHHHHHHHHSSSSSSBSSSSBBBBBBBBBBBSSSSSSSSSISSSSBSSSSSSSSSSIIIIISSSSSSMMSSSSSSSSSSSSIIISSSSSSSSSSSSSSHHSSSSSSSSSSMMSIISSSSBSSBSSSSSSSHHHHSSSSSSSSSSSSSIISSSSSSBSSSSSHHHHSSSSBBSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSHHHHSSSBBSSSSSSSSSSSMSSSSSSSSBSSHHHHSSSSSSSBBSSSMMS	KKKKKNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNKKKKKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNKNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNKKKKKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKN
bpRNA_PDB_649	AACCUUCACCAAUUAGGUUCAAAUAAGUGGU	[[[[..{((((.(((]]]]....)))}))))	EEEEEEESSSSISSSHHHHHHHHSSSISSSS	KKKKNNKNNNNNNNNKKKKNNNNNNNKNNNN
bpRNA_PDB_650	GGACACUGAUGAUCGCGUGGAUAUGGCACGCAUUGAAUUGUUGGACACCGUAAAUGUCCUAACACGUGUCC	((((((.([({((.(((((..<<.<<))))))(.A.).]}..(((((>>()>>.))))).))a).))))))	SSSSSSISISBSSBSSSSSHHHHHHHSSSSSSSHHHSMMMMMSSSSSIISSIIISSSSSMSSISISSSSSS	NNNNNNNNKNKNNNNNNNNNNKKNKKNNNNNNNNKNNNKKNNNNNNNKKNNKKNNNNNNNNNKNNNNNNNN
bpRNA_PDB_651	GGGUGUACUUAACGUUUGCUUCGGCAAACUACAUCC	((((((.....(.(((((((..))))))))))))))	SSSSSSBBBBBSBSSSSSSSHHSSSSSSSSSSSSSS	NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_652	aGCGGGGcGGAGCAGCCUGGUAGCUCGUCGGGcUCAUAACCCGAAGAUCGUCGGuUCAAAUCCGGCCCCCGCUACC	((((((([.((((][...{<..))))(((((((.....)))))))...]((((((}>.)..))))))))))))...	SSSSSSSMMSSSSHHHHHHHHHSSSSSSSSSSSHHHHHSSSSSSSMMMMSSSSSSHHHSBBSSSSSSSSSSSSEEE	NNNNNNNKNNNNNKKNNNKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_653	GGCAGCCAGAAGAGCACGUAUACGCAAGGCUGUC	(((((((((.)[.((..(.)..])).))))))))	SSSSSSSSSHSMMSSIISHSIIISSMSSSSSSSS	NNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_654	GAUAACUGAAUCGCUAAGGAUGAAAGUCUAUGCGACAUUAUC	(.(((.((..(((((()(((((..)))))).))))))))).)	SISSSBSSBBSSSSSSSSSSSSHHSSSSSSBSSSSSSSSSIS	NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_655	GCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGC	..........................	EEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEE	NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_656	GGUGGGGACGACCCCACC	(((((((....)))))))	SSSSSSSHHHHSSSSSSS	NNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_663	GUCUAAAGUUUGCUAGGGUUCCGCGUCAuAGGUGGUCUGGUCCAAGAGCAAACGGCUUUCACAAAGCCACACGGAAGGAUAAAAGCCUGGGAGAU	......(((((((((((...((((((((.)))))..).)).))))[.))))))(((((.....)))))){](((.(((((..)).))).})))..	EEEEEESSSSSSSSSSSIIISSSSSSSSHSSSSSBBSBSSISSSSBBSSSSSSSSSSSHHHHHSSSSSSXXSSSISSSSSHHSSBSSSIISSSEE	NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNN
bpRNA_PDB_664	GGGUCAGGCCGGCGAAAGUCGCCACAGUUUGGGGAAAGCUGUGCAGCCUGUAACCCCCCCACGAAAGUGGG	..[.((((((((((..))))).(((((((.{{{{.){))))))].)))))}..}}}}((((((..))))))	EEEESSSSSSSSSSHHSSSSSMSSSSSSSHHHHHHSBSSSSSSMMSSSSSXXXXXXXSSSSSSHHSSSSSS	NNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKKKNNKNNNNNNKNNNNNNKNNKKKKNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_665	GGUGACUAGGGUUCCGGCGAAAGCCGGUCCGAGAGUUACCGACCGCCGAAAGGCGGUUACACGGCGGGAAAAAAGCCCGGGAGGA	(((((((((((..((((((..)))))))))))[.)))))).(((((((..)))))))..{](((.((((....).))).})))()	SSSSSSSSSSSBBSSSSSSHHSSSSSSSSSSSBBSSSSSSXSSSSSSSHHSSSSSSSXXXXSSSISSSSHHHHSBSSSIISSSSS	NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNN
bpRNA_PDB_666	GGACAUAAGGAAAACCUAUGUCC	(((((((.((....)))))))))	SSSSSSSBSSHHHHSSSSSSSSS	NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_PDB_667	GGUGUUGACUGUUGAAUCUCAUGGCAACACC	(((((((.((...(.)......)))))))))	SSSSSSSBSSIIISHSIIIIIISSSSSSSSS	NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_RFAM_3	UCUGGUGAUUUUAGCGAAGUGGUCACACCUGUUCCCAUCUCGAACACAGAAGUUAAGCACUUUAGCGGCGACAAUAUCUAGCCACGCGCUAGUGAAGAUAGUUCAUCGCCAGGU	.((((((((....((.(((((...((..((((((.......))..))))..))....)))))..))(((.((..(.((.....(()).....)).).)).))).))))))))..	ESSSSSSSSMMMMSSISSSSSIIISSIISSSSSSHHHHHHHSSBBSSSSIISSIIIISSSSSIISSSSSISSIISISSIIIIISSSSIIIIISSISISSISSSMSSSSSSSSEE	NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
bpRNA_RFAM_5	UCUGGUGAUGAUGUUCUUUAGGGUAACACCCGUUCCCAUUCCGAACACGACGGUUAAGCCUUUAGAAGCCGAUGGUACUGCACGGGAGACUGUGUGGGAGAGUAGGUGGUCGCCAGGU	.((((((((....((..(((((...((..((((((.......))..))))..))....)))))..))(((.((..(.((....((....)).....)).).)).))).))))))))..	ESSSSSSSSMMMMSSIISSSSSIIISSIISSSSSSHHHHHHHSSBBSSSSIISSIIIISSSSSIISSSSSISSIISISSIIIISSHHHHSSIIIIISSISISSISSSMSSSSSSSSEE	NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_396

GGAAUUUAUGAGUACCUUCGGAUACUUAUAGAUUCC

(((((((((((((((((..)))))))))))))))))

SSSSSSSSSSSSSSSSSHHSSSSSSSSSSSSSSSSS

NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_397

GGGUAGAGUAUAAUUAGUCUUCGGACUUCCUUAUACUUAUCC

((.(...(((((..((((((..))))))...)))))..).))

SSISIIISSSSSIISSSSSSHHSSSSSSIIISSSSSIISISS

NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_398

GGAAUUUAUGAGUACGUAGAGUAUAAUUAGUCUUCGGACUUCCUUAUACUUAUAUACUUAUAGAUUCC

(((((((((((((((....((((((..((((((..))))))...))))).).).))))))))))))))

SSSSSSSSSSSSSSSIIIISSSSSSIISSSSSSHHSSSSSSIIISSSSSBSISBSSSSSSSSSSSSSS

NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_399

GGUGAGUACGUAGAGUAUACUUCGGUAUACUUAUAUACUUACC

((((((((...(.((((((((..)))))))).)..))))))))

SSSSSSSSIIISISSSSSSSSHHSSSSSSSSISIISSSSSSSS

NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_400

GGCCUUAUGCACGGGAAAUACGCAUAUCAGUGAGGAUUCGUCCGAGAUUGUGUUUUUGCUGGUGUAAAUCAGCAGUUCCCCUGCAUAAGGCU

(((((((((((.(((((..(((((.((((...(((((..))))))))))))))...((((((((..)))))))).))))).)))))))))))

SSSSSSSSSSSISSSSSMMSSSSSBSSSSBBBSSSSSHHSSSSSSSSSSSSSSMMMSSSSSSSSHHSSSSSSSSMSSSSSISSSSSSSSSSS

NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_401

GGUAGUUUUGGCAUGACUCUACC

(((((((((.....)))))))))

SSSSSSSSSHHHHHSSSSSSSSS

NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_402

GGAACAGCUGUACUGGGCAGUUACAGCAGUCGUAUGGUAACACAUGCGGCGUUCCGAAAUACCAUGCCUG

(((((((((((((.[[[[[).)))))))(((((((((....)))))))))))))).........]]]]].

SSSSSSSSSSSSSHHHHHHSBSSSSSSSSSSSSSSSSHHHHSSSSSSSSSSSSSSEEEEEEEEEEEEEEE

NNNNNNNNNNNNNNKKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKKKKN

bpRNA_PDB_403

GGGGCUGAAGGAUGCCCAGAAGGUACCCCAUUGUAUGGGAUCUGAUCUGGGGCCUCGGUGCACAUGCUUUACAUGUGUUUAGUCGAGGUUAAAAAACGUCUAGGCCCC

((((((..(((((((((((((((.(((((((...)))))))))).))))))((((((((((((((((...)))))))).)..)))))))((...))))))))))))))

SSSSSSBBSSSSSSSSSSSSSSSBSSSSSSSHHHSSSSSSSSSSBSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSHHHSSSSSSSSBSBBSSSSSSSSSHHHSSSSSSSSSSSSSS

NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_404

GGGCAGAAGGUACCCCAUUGUAUGGGAUCUGAUCUGCCC

((((((((((.(((((((...)))))))))).)))))))

SSSSSSSSSSBSSSSSSSHHHSSSSSSSSSSBSSSSSSS

NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_405

GGGCUCGGUGCACAUGCUUUACAUGUGUUUAGUCGAGCCC

(((((((((((((((((...)))))))).)..))))))))

SSSSSSSSSSSSSSSSSHHHSSSSSSSSBSBBSSSSSSSS

NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_406

GGGCUGAAGGAUGGAGACGUCUAGGCCC

(((((..(((((((..))))))))))))

SSSSSBBSSSSSSSHHSSSSSSSSSSSS

NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_407

GGGGCUGAAGGAUGCCCAGAGAGAUCUGGGGCCUCGGGAGAUCGAGGUUAAAAAACGUCUAGGCCCC

((((((...((((((((((((..)))))))((((((((..))))))))((...))))))).))))))

SSSSSSIIISSSSSSSSSSSSHHSSSSSSSSSSSSSSSHHSSSSSSSSSSHHHSSSSSSSISSSSSS

NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_408

GGACGUUAAAAGGCUUCGGCCUACGUCC

(((((..(...((((..)))).))))))

SSSSSBBSIIISSSSHHSSSSISSSSSS

NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_409

UCUCGGCCUUUUGGCUAAGA

((((((((....))))))))

SSSSSSSSHHHHSSSSSSSS

NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_410

GGUUUGCCUUUUGGCUUACC

((((((((....))))))))

SSSSSSSSHHHHSSSSSSSS

NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_416

GGACCCGCCACUGCAGAGAUGCAAUCCAGUGGUCC

(((((......((((....)))).......)))))

SSSSSIIIIIISSSSHHHHSSSSIIIIIIISSSSS

NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_417

CGCGAAUUAGCG

............

EEEEEEEEEEEE

NNNNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_419

GGAGUGCCUGAGCUGUGGCACUCC

(((((((((.....).))))))))

SSSSSSSSSHHHHHSBSSSSSSSS

NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_421

GGCACAGAGUUAUGUGCC

((((((()....))))))

SSSSSSSSBBBBSSSSSS

NNNNNNNNNNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_422

GGUUGCGGGUCUCGCAACC

((((((((..).)))))))

SSSSSSSSHHSBSSSSSSS

NNNNNNNNNNNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_423

GGGAGACCUGAAGUGGGUUUCCC

(((((((((.....)))))))))

SSSSSSSSSHHHHHSSSSSSSSS

NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_426

GGGAUCCAUGACAGGAUCCC

(((((((......)))))))

SSSSSSSHHHHHHSSSSSSS

NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_427

GGCCCGCCGAAAGGCCGGCC

((((.(((....))).))))

SSSSISSSHHHHSSSISSSS

NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_428

GGACCCACCACGGCGAGGUCCA

(((((((((..)))).))))).

SSSSSSSSSHHSSSSBSSSSSE

NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_429

GGCGCUUUGACACAAUCUACAUUGUAAAAGCGCC

(((((((((..(((((....))))))))))))))

SSSSSSSSSBBSSSSSHHHHSSSSSSSSSSSSSS

NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_430

ACUUGGUUUAGGUAAUGAGU

((((.(((....)).)))))

SSSSBSSSHHHHSSBSSSSS

NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_431

GCUGACCAGCUAUGAGGUCAUACAUCGUCAUAGCAC

..[[[[[.(((((((]]]]].......)))))))..

EEEEEEEESSSSSSSHHHHHHHHHHHHSSSSSSSEE

NNKKKKKNNNNNNNNKKKKKNNNNNNNNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_435

GACAUAUUAUCGCGUGGAUAAGGGCACGCAGGUUUUUACGGGCAACGGUAAAUGUCCGAUUAUGUCC

(((((([..(((((((.{{{.{{)))))))(....<])((((((}}()}}}))))))..))))))>.

SSSSSSMMMSSSSSSSHHHHHHHSSSSSSSSHHHHHHSSSSSSSIISSIIISSSSSSMMSSSSSSEE

NNNNNNKNNNNNNNNNNKKKNKKNNNNNNNNNNNNKKNNNNNNNKKNNKKKNNNNNNNNNNNNNNKN

bpRNA_PDB_438

GGCGCAUCGGCGCC

(((((....)))))

SSSSSHHHHSSSSS

NNNNNNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_441

GCCCGGAUAGUGUCCUUGGGAAACCGAGUCCGGGCACCA

((((((((((.(...........)))).)))))))....

SSSSSSSSSSBSHHHHHHHHHHHSSSSBSSSSSSSEEEE

NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_443

UCCGAAGUGCAACGGGAAAAUGCACU

(((((......))))..)........

SSSSSHHHHHHSSSSBBSEEEEEEEE

NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_446

CGCGUCACCUCGAGCAAGUCGC

......................

EEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEE

NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_450

GUGGUCUGAUGAGGCC

................

EEEEEEEEEEEEEEEE

NNNNNNNNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_454

gUUAAUCAUGCUCGGGUAAUCGCUGCGGCCGGUUUCGGCCGUAGAGGAAAGUCCAUGCUCGCACGGUGCUGAGAUGCCCGUAGUGUUCGUGGAAACACGAgCGAGAAACCCAAAUGAUGGUaGGGGCACCUUCCCGAAGGAAAUGAACGGAGGGAAGGACAGGCGGCGCAUGCAGCCUGUAGAUAGAUGAUUACCGCCGGAGUACGAGGCGCAAAGCCGCUUGCAGuACGAAGGUACAGAACAUGGCUUAUAGAGCAUGAUUAAC

.((((((((((((([[[[[[[.(((((((((....))))))))).{.(<((.((((((((((((((.((([..).))))))...................)))))..((((...........))))..(((((((()(((.]....)))..)))))))(((((((........)))))))[(....].]]]]]]]((((.((..........................)).)))).}>..))))))))).).)))))))))))).

ESSSSSSSSSSSSSMMMMMMMMSSSSSSSSSHHHHSSSSSSSSSMMMSBSSBSSSSSSSSSSSSSSBSSSHHHSBSSSSSSBBBBBBBBBBBBBBBBBBBSSSSSMMSSSSHHHHHHHHHHHSSSSMMSSSSSSSSSSSSHHHHHHSSSMMSSSSSSSSSSSSSSHHHHHHHHSSSSSSSMSIIIIIIIIIIIIISSSSISSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSSISSSSIIIIISSSSSSSSSMSBSSSSSSSSSSSSE

NNNNNNNNNNNNNNKKKKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNKNKKKKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_455

gGCCGACGGAGGCGCGCCCGAGAUGAGUAGGCUGUCCCAUCAGGGGAGGAAUCGGGGACGGCUGAAAGGCGAGGGCGCCGAAGGGUGCAGAGUUCCUCCCGCUCUGCAUGCCUGGGGGUAUGGGGAAUACCCAUACCACUGUCACGGAGGUCUCUCCGUGGAGAGCCGUCGGUc

((((((((((((.((((((((((.((.(((((.(((((.[((.{{{{{{).].)))))).)))))))[)))))))))))..((((((((((((.}}}}}}))))))))).)))((((((((((((]..))))))))))))(((((((((....)))))))))).))))))))))

SSSSSSSSSSSSBSSSSSSSSSSISSBSSSSSISSSSSBBSSHHHHHHHSBBBSSSSSSISSSSSSSISSSSSSSSSSSMMSSSSSSSSSSSSHHHHHHHSSSSSSSSSBSSSSSSSSSSSSSSSHHHSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSHHHHSSSSSSSSSSBSSSSSSSSSS

NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNKKKKKKNNKNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_472

GUUCCCGAAAGGAUGGCGGAAACGCCAGAUGCCUUGUAACCGAAAGGGGGAAU

((((((.((((((((((((..)))))))...)))))...(((..)))))))))

SSSSSSMSSSSSSSSSSSSHHSSSSSSSBBBSSSSSMMMSSSHHSSSSSSSSS

NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_485

CUGGGUCGCAGUAACCCCAGUUAACAAAACAAG

((((([.{<<{....))))).......].}}>>

SSSSSHHHHHHHHHHSSSSSEEEEEEEEEEEEE

NNNNNKNKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNKNKKKK

bpRNA_PDB_494

GGCUUCGCAAGAGAGGUGGAGGGACUGGCCCGACGAAACCCGGCAACCAGAAAUGGUGCCAAUUCCUGCAGCGGAAACGUUGAAAGCGGAGCCG

((((((((....(.(((((((((.[[[[)))...)))))))(((..(((....))).)))...(]]]]((((((..))))))..))))))))).

SSSSSSSSMMMMSBSSSSSSSSSHHHHHSSSBBBSSSSSSSSSSIISSSHHHHSSSISSSMMMSIIIISSSSSSHHSSSSSSIISSSSSSSSSE

NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_499

GGUCGgGUAGUGAGgGCCUUGGUCAGACGCAGCGGGCGUGCUUGUGGACUGCUUGGUGGGGCUUGCUCUGCUAGGCGGACUACUUGCGUGCCUUGUUGUAGACGGCCUUGGUaGGUCUCUUGUAGACCgucgCUUGCUACaauuaaCGAUC

(((((.((((((((.(((..((((.((((((((.(((((((.(((((((((((((((((((....))))))))))))))))))).)))))))..)))))))).))))..))).((((.......))))....))))))))......)))))

SSSSSISSSSSSSSMSSSIISSSSISSSSSSSSISSSSSSSISSSSSSSSSSSSSSSSSSSHHHHSSSSSSSSSSSSSSSSSSSISSSSSSSIISSSSSSSSISSSSIISSSMSSSSHHHHHHHSSSSMMMMSSSSSSSSIIIIIISSSSS

NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_511

GGCUUCAUAUAAUCCGAAUGAUAUGGUUUCGGAGCUUCCACCAAGAGCCUUAAACUCUUGACUAUGGAGUC

((((((((([..(((((((.{{{.{{)))))))(.....])((((((}}..}}}))))))..)))))))))

SSSSSSSSSMMMSSSSSSSHHHHHHHSSSSSSSSHHHHHHSSSSSSSHHHHHHHSSSSSSMMSSSSSSSSS

NNNNNNNNNKNNNNNNNNNNKKKNKKNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNKKNNKKKNNNNNNNNNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_512

UAGGGUUAGGGU

..[{(...]}).

EEEESHHHHHSE

NNKKNNNNKKNN

bpRNA_PDB_513

AGAGAAGAUUUUUUUU

................

EEEEEEEEEEEEEEEE

NNNNNNNNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_514

AGAGAAGAUCUUCUCU

................

EEEEEEEEEEEEEEEE

NNNNNNNNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_516

GGACGAGGAGCGUUGCAAGCGAAAGCCCAGGCUAGUCCGUUCAAACGGCGCUCA

...[[[[((((((({[.((((..)))).)(]]]]]......).)))))).}...

EEEEEEESSSSSSSIIISSSSHHSSSSISSHHHHHHHHHHHSMSSSSSSEEEEE

NNNKKKKNNNNNNNKKNNNNNNNNNNNNNNKKKKKNNNNNNNNNNNNNNNKNNN

bpRNA_PDB_517

GGUUCCGAGGGUCAUCGGAACCA

((((((((......)))))))).

SSSSSSSSHHHHHHSSSSSSSSE

NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_520

GGCGUGUAUGUGGGGAAACCCUGAUUGAGUUCAGCCCACAUACUUUGUUGAUGGUUGUCAAUCGCC

((((((((((((((......(((((....)))))))))))))))..((((((....))))))))))

SSSSSSSSSSSSSSBBBBBBSSSSSHHHHSSSSSSSSSSSSSSSMMSSSSSSHHHHSSSSSSSSSS

NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_522

UGCUCCUAGUACGAGAGGACCGGXGUG

.(((((..()(((..)))...))))).

ESSSSSMMSSSSSHHSSSMMMSSSSSE

NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_523

GGAGAGUAGAUGAUUCGCGUUAAGCGUGUGUGAAUGGGAUGUCGUCACACAACGAAGCGAGAGCGCGGUGAAUCAUUGCAUCCGCUCCA

(((((..[((((((((((((..((.((((((((.(.{{{{{).])))))))).)).(((..)))))).))))))))).}}}}}))))).

SSSSSIIISSSSSSSSSSSSMMSSISSSSSSSSISHHHHHHSIISSSSSSSSISSMSSSHHSSSSSSBSSSSSSSSSIIIIIISSSSSE

NNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKKKKNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKKKKNNNNNN

bpRNA_PDB_524

GGACAGAGUAGGUAAACGUGCGUAAAGUGCCUGAGGGACGGGGAGUUGUCCUCAGGACGAACACCGAAAGGUGGCGGUACGUUUACCGCAUCUCGCUGUUC

.........((((((((((((((..((.(((((((((.(.[[[[.)..))))))))).)).(((((..)))))))).)))))))))))..]]]].......

EEEEEEEEESSSSSSSSSSSSSSMMSSISSSSSSSSSISHHHHHHSIISSSSSSSSSISSMSSSSSHHSSSSSSSSBSSSSSSSSSSSEEEEEEEEEEEEE

NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKKKNNNNNNN

bpRNA_PDB_527

cCUCCCGGGAGAGCCGCUAAGGGGGAAACUCUAUGCGGUACUGCCUGAUAGGGUGCUUGCGAGUGCCCCGGGAGGuCUCGUAGa

(((((((((((.((((((()((((....))))).)))))[))(((((.])))))((..[[[[[.))))))))))).]]]]]...

SSSSSSSSSSSISSSSSSSSSSSSHHHHSSSSSBSSSSSISSSSSSSHHSSSSSSSHHHHHHHHSSSSSSSSSSSEEEEEEEEE

NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNKNNNNNNNNNKKKKKNNNNNNNNNNNNNKKKKKNNN

bpRNA_PDB_530

UGAGCUUCGGCUC

.............

EEEEEEEEEEEEE

NNNNNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_535

gGACCCGGCUAACGCUGGGUCC

((((((((((..))))))))))

SSSSSSSSSSHHSSSSSSSSSS

NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_541

GGCGAAGAACCGGGGAGCC

...................

EEEEEEEEEEEEEEEEEEE

NNNNNNNNNNNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_544

GUUAUAUGUGCCCGGCACGGGUGCAGUCUCUAGGGUGUGAGAGUCCCACUGUGAAAGCAGAAAAGUAACAUAGCCUCACGCGAGGGUGUCCGUGGGGCGACAUGGAAUCUGAAGAAAGCGGACGGCACCUUCGGUCUGUGGGGAACACGCAUCUCAUAAGGCGCGGUAUCAAUGGAUGAGUUUUUGCAUAACAAAACAAAGUCCUUUCUGCCAAAGUUGGUACAGAGUAAAUGAAGCAGAUUGAUGAAGGGAAAGACUGCAUUCUUACCCGGAGGUCUGGGGAAACAGAAGUCAGAAGUCGUAAUACCCCGCUGUUCGCAGGGGAAGGACGCAAGUAGGGCGGCGUUCGCGACUAAGCUCCACCGUAUACCGACCGAACGGUACGUACGGUGGUGUGAGAGGAGUUCGCUCUACUCUAUUAG

[[[[...{[{((((({(.(((((((((((.((((((<..)..)))))(((((((<.AAAAAA.)))))))((((((.((((.(((((.(((((((..))))))))))))..]}.{)))).))))))((((((((((((.((...))...(.((.....([((..(((((((((((((((((((.].]]]].)))))).))))>aaaaaa....)))))))))..)))...)).))))))...)))))))>.))))))))))))}}})))))(((((((((..)))))))))..(.(((((.((.(.(((.(....).))).)))))))).)((.(((.((((....)))))())).)).(((((((((((((..))))..))))))))).................................

EEEEEEEEEESSSSSISBSSSSSSSSSSSMSSSSSSHHHSBBSSSSSSSSSSSSHHHHHHHHHSSSSSSSSSSSSSISSSSISSSSSBSSSSSSSHHSSSSSSSSSSSSIIIIIISSSSISSSSSSSSSSSSSSSSSSMSSHHHSSMMMSISSIIIIISBSSIISSSSSSSSSSSSSSSSSSSHHHHHHHHSSSSSSBSSSSBBBBBBBBBBBSSSSSSSSSIISSSIIISSISSSSSSBBBSSSSSSSMMSSSSSSSSSSSSIIISSSSSSSSSSSSSSHHSSSSSSSSSMMSISSSSSBSSBSISSSISHHHHSISSSISSSSSSSSISSSISSSBSSSSHHHHSSSSSSSSSISSMSSSSSSSSSSSSSHHSSSSBBSSSSSSSSSEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEE

KKKKNNNKKKNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNKNKKKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNKKKKNNNNNNNNNNNNKKKKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_550

GGUGCCCGGCAGGGGUGCAGGCUGUAGGGUGGGUGAGAGUCCCUGUCUGGGCAGACAGAAGUAAUAGCCAGACGCAAGGGAGUCCGUGGGUGGCGACAUGGAAUCUGAAGGAAGCGGACGACCAACGUUCUGUGGGAGGAACACUUAAUUCAAGGCAGGGUAUCAAUGGAUGGGUUUGUUUGCAUAACAAAACAAAGUCCUUUCUGCCAAAGUUGGUACAGAGUAAAUGAAGCAGAUUGAUGAAGGGAAAGACUGCAUUCUUACCGGGGUCUGGCUGGAAACAGAAGUCGAAGGCAUACUACCCAGCCUGUUCGCAGGGGAAGGACCAAGUAAGGCGUGCGUUCGCGCCUAAGCAUGGCCGUAUGCAGACCGAACGGUACGUACGGUGGUGUG

.[[{((((({(..(((((((.((.((((((<..)..))))).((((...<<<<<<....)))).(..((..(((((((((..(((((((..))))))).))))..]})[))))..))..)(((...(.((((.((.[.))...(((.(]...([((...(..(.(((((.((.((((.]......)))).).).))..>>>>>>...))).)...)..)))..).)))))))....)...)))>.)).))))))).)]}])))))(..((((((..))))))..)....((((.(.((.(((((.(....).)))))))).)))).(((((..(((((..)))))...))))).(..(((((((.(.(..).)...)))))))..).......

EEEESSSSSISIISSSSSSSISSMSSSSSSHHHSBBSSSSSMSSSSHHHHHHHHHHHHHSSSSMSIISSIISSSSSSSSSIISSSSSSSHHSSSSSSSISSSSBBBBSBSSSSIISSIISSSSIIISISSSSMSSHHHSSMMMSSSISIIIISBSSIIISIISISSSSSISSISSSSHHHHHHHHSSSSISBSISSBBBBBBBBBBBSSSISIIISIISSSIISISSSSSSSIIIISIIISSSMMSSISSSSSSSISIIISSSSSSIISSSSSSHHSSSSSSIISXXXXSSSSISBSSBSSSSSISHHHHSISSSSSSSSISSSSXSSSSSIISSSSSHHSSSSSIIISSSSSXSIISSSSSSSISISHHSISIIISSSSSSSIISEEEEEEE

NKKKNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNKNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_567

CUGCUGGCUAAGGCAUGAAAGUGCUAUGCCUGCUG

((((.((([.(((((((..))))))])))).))))

SSSSISSSBBSSSSSSSHHSSSSSSBSSSSISSSS

NNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_568

GGUUAAAGCCUUAUGGUCGCUACCAUUGCACUCCGGUAGCGUUAAAAGGGAAGACGGGUGAGAAUCCCGCGCAGCCCCCGCUACUGUGAGGGAGGACGAAGCCCUAGUAAGCCACUGCCGAAAGGUGGGAAGGCAGGGUGGAGGAUGAGUCCCGAGCCAGGAGACCUGCCAUAAGGUUUUAGAAGUUCGCCUUCGGGGGGAAGGUGAACA

.....(.(((((((([((((((((..........)))))))(..])(.....(.(((((...)..)))))[[(({{{{{{))(((((..(((((.((((...(((.....(((.((((((..))))))...)))).))..)))...).))))).)]])))).....)).)))))))))......((.(.((((}}}}}.})))).).)).

EEEEESBSSSSSSSSISSSSSSSSHHHHHHHHHHSSSSSSSSHHHSSMMMMMSBSSSSSHHHSBBSSSSSMMSSHHHHHHSSSSSSSIISSSSSISSSSIIISSSBBBBBSSSISSSSSSHHSSSSSSIIISSSSBSSIISSSBBBSISSSSSISBBSSSSMMMMMSSISSSSSSSSSXXXXXXSSISISSSSHHHHHHHSSSSISISSE

NNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKNNKKKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKKKKNKNNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_570

GGAACCGCGAAAGCGGUUCCACGACGAUACUUAUUUCCUUUGAUCGUCGUUAUUACUGGCUUCGGCCACAAAGGAGA

(((((((((..)))))))))(((((((((......[[[[[.)))))))))....(.(((((..)))))).]]]]]..

SSSSSSSSSHHSSSSSSSSSSSSSSSSSSHHHHHHHHHHHHSSSSSSSSSXXXXSBSSSSSHHSSSSSSEEEEEEEE

NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKKKKNN

bpRNA_PDB_572

GCCCCUGCCUGCCUGCAGCUAAGGAUGAAAGUCUAUGCUGCCUGCCUGCCUGGGC

((((..((((((((((((((()(((((..)))))).)))))))))))))..))))

SSSSIISSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSHHSSSSSSBSSSSSSSSSSSSSIISSSS

NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_591

CCGCCUAACACUGCCAAUGCCGGUCCCAAGCCCGGAUAAAAGUGGAGGGGGCGG

(((((..((((([[(...)((((({{{{)]])))).....)))))}}}})))))

SSSSSIISSSSSMMSHHHSSSSSSHHHHSBBSSSSMMMMMSSSSSIIIISSSSS

NNNNNNNNNNNNKKNNNNNNNNNNKKKKNKKNNNNNNNNNNNNNNKKKKNNNNN

bpRNA_PDB_592

GGAUCACGAGGGGGAGACCCCGGCAACCUGGGACGGACACCCAAGGUGCUCACACCGGAGACGGUGGAUCCGGCCCGAGAGGGCAACGAAGGUCCGA

(((((....((((....))))(((..((((((.[[[[[.))).))).)))..(((((....))))))))))((((((..))))))......]]]]].

SSSSSMMMMSSSSHHHHSSSSSSSIISSSSSSHHHHHHHSSSBSSSISSSMMSSSSSHHHHSSSSSSSSSSSSSSSSHHSSSSSSEEEEEEEEEEEE

NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKKKKN

bpRNA_PDB_593

UUAGCUCGCCAGUUAGCGAGGUCUGUCUCGACACGACAGAUAAUCGGGUGCAACUCCCGCCCCUCUUCCGAGGGUCAUCGGAACCa

...[((((([[{...)))))(((((((.......)))))))...(((((]}.)].))))[[[..(((((((]]].].)))))).).

EEEESSSSSHHHHHHSSSSSSSSSSSSHHHHHHHSSSSSSSXXXSSSSSHHHSBBSSSSXXXXXSSSSSSSHHHHHHSSSSSSBSE

NNNKNNNNNKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKNNKNNNNNKKKNNNNNNNNNKKKNKNNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_595

cAUCCGGUAUCCCAAGACAAUCUUCGGGUUGGGUUGGGAAGUAUCAUGGCUAAUCACCAUGAUGCAAUCGGGUUGAACACUUAAUUGGGUUAAAACGGUGGGGGACGAUCCCGUAACAUCCGUCCUAACGGCGACAGACUGCACGGCCCUGCCUCUUAGGUGUGUCCAAUGAacAGUCGUUCCGAAAGGAAG

[.[(((({..((((((((((((....))))))))))))..((((((((((..{{{))))))))))..))))((((((((((...)((((((][.(((((.(((...}}}))).....).))))((...])).....<<<<<]()))))))((((...))))))))))))).}.>>>>>.((((....)))).

EEESSSSMMMSSSSSSSSSSSSHHHHSSSSSSSSSSSSMMSSSSSSSSSSHHHHHSSSSSSSSSSMMSSSSSSSSSSSSSSHHHSSSSSSSMMMSSSSSISSSHHHHHHSSSIIIIISBSSSSSSHHHHSSMMMMMMMMMMMSSSSSSSSSSSSHHHSSSSSSSSSSSSSMMMMMMMMMSSSSHHHHSSSSE

KNKNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKNNNNNNNNNNNNNKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNKKKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNKKKKKNNNNNNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_598

GGGUCAGAUCGGCGAAAGUCGCCACUUCGCCGAGGAGUGCAAUCUGUGAGGCCCCAGGAGGACUGGGU

..[[((((((((((..))))).(]((((.....)))).)].)))))(.)...((((((...)))))).

EEEESSSSSSSSSSHHSSSSSMSISSSSHHHHHSSSSISMMSSSSSSHSMMMSSSSSSHHHSSSSSSE

NNKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_600

GCGCUGAAUUCCCUGAAGGGAAACGGGGGACCCAAUCUUCAGGGGUGAAUCCCACGUAAGUGGGUAGGGCUAGUCUCUUUCGGCCCGAACCCGUCAGCUAACCUCGUAAGCGUGGAAAGAGGga

.(((((..(((((....)))))(((((((..((........((((((..(((((((..)))))))(((((([..{{{{{{{)))))))))))..).))..))))))))))))].}}}}}}}...

ESSSSSMMSSSSSHHHHSSSSSSSSSSSSIISSIIIIIIIISSSSSSMMSSSSSSSHHSSSSSSSSSSSSSHHHHHHHHHHSSSSSSSSSSSBBSISSIISSSSSSSSSSSSEEEEEEEEEEEE

NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNKKKKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNKKKKKKKNNN

bpRNA_PDB_602

GGAUCGCUGAACCCGAAAGGGGCGGGGGACCCAGAAAUGGGGCGAAUCUCUUCCGAAAGGAAGAGUAGGGUUACUCCUUCGACCCGAGCCCGUCAGCUAACCUCGCAAGCGUCCGAAGGAGAAUCaa

....(((((............(((((((...(......((((((..((((((((....))))))))(((((([{{{{{{{)))))))))))..).)...))))))))))))]..}}}}}}}......

EEEESSSSSBBBBBBBBBBBBSSSSSSSIIISIIIIIISSSSSSMMSSSSSSSSHHHHSSSSSSSSSSSSSSHHHHHHHHSSSSSSSSSSSBBSISIIISSSSSSSSSSSSEEEEEEEEEEEEEEEE

NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKKKKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNKKKKKKKNNNNNN

bpRNA_PDB_604

GGCGCUGUGUCGCAAUCUGCGAAGGGCGUCGUCGGCCCGAGCGGUAGUAAGCAGGGAACUCACCUCCAAUGAAACACAUUGUCGUAGCAGUUGACUACUGUUAUGUGAUUGGUAGAGGCUAAGUGACGGUAUUGGCGUAAGCCAAUACCGCGGCACAGCACAAGCCCGCUUGCGAGAUUACAGCGC

.(.(((((.((..((.(((((..((((.......)))).)))))))(((((([((((.(((((((((((((.....)))))..(((((((.......)))))))....))))).)))(((].(((((((..((((......))))..)))..)))))))....))))))))))..))..))))).)

ESISSSSSISSMMSSBSSSSSIISSSSHHHHHHHSSSSISSSSSSSSSSSSSBSSSSMSSSSSSSSSSSSSHHHHHSSSSSMMSSSSSSSHHHHHHHSSSSSSSMMMMSSSSSBSSSSSSBBSSSSSSSIISSSSHHHHHHSSSSIISSSBBSSSSSSSMMMMSSSSSSSSSSMMSSIISSSSSIS

NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_606

AGAGAAGAAAGGGAAAUUUUUUUUUUUUUUUU

................................

EEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEE

NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_607

CGCXAAUUAGCG

............

EEEEEEEEEEEE

NNNNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_608

CGCGAXUUAGCG

............

EEEEEEEEEEEE

NNNNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_609

CGCGAAUUAXCG

............

EEEEEEEEEEEE

NNNNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_610

gGGAACUGAGCAGGCAAUGACCAGAGCGGUCAUGCAGCCGGGCUGCGAAAGCGGCAACAGAUGAUUACACGCACAUCUGUGGGACAGUUCCCAc

(((((((((.(((((.(((((((..).))))))...)))).((((((..))))))((((((((..........)))))))).))))))))))..

SSSSSSSSSBSSSSSISSSSSSSHHSBSSSSSSIIISSSSMSSSSSSHHSSSSSSSSSSSSSSHHHHHHHHHHSSSSSSSSMSSSSSSSSSSEE

NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_611

GAGCAACUUAGGAUUUUAGGCUCCCCGGCGUGUCUCGAACCAUGCCGGGCAACCCAUAGGGGGCUGGCGGUCCCUGUGCGGUCAAAAUUCAUCCGCCGGAG

[[[[[.(...((((((..]]]]](((((((((......)))))))))...(((((((((((........))))))).)))).))))))...........).

EEEEEESIIISSSSSSMMMMMMMSSSSSSSSSHHHHHHSSSSSSSSSMMMSSSSSSSSSSSHHHHHHHHSSSSSSSBSSSSMSSSSSSIIIIIIIIIIISE

KKKKKNNNNNNNNNNNNNKKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_614

GGGAAGAUAUAAUCCUAAUGAUAUGGUUUGGGAGUUUCUACCAAGAGCCUUAAACUCUUGAUUAUCUUCCC

((((((((([..(((((((.{{..{{)))))))(.....])((((((}}...}}))))))..)))))))))

SSSSSSSSSMMMSSSSSSSHHHHHHHSSSSSSSSHHHHHHSSSSSSSHHHHHHHSSSSSSMMSSSSSSSSS

NNNNNNNNNKNNNNNNNNNNKKNNKKNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNKKNNNKKNNNNNNNNNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_616

uGCCGUGCUAAGCGGGGAGGUAGCGGUGCCCUGUACCUGCAAUCCGCUCUAGCAGGGCCGAAUCCCUUCUCGAGGUUCGGUAACGAAUCGACAGAAGGUGCACGGUc

.(((((((((((((((((...[[[[[.)))))(.)(((((...]]]]]...))))))))))(..((((((((((((((((..)))))))))))))))))))))))).

ESSSSSSSSSSSSSSSSSHHHHHHHHHSSSSSSHSSSSSSHHHHHHHHHHHSSSSSSSSSSSBBSSSSSSSSSSSSSSSSHHSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSE

NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNKKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_619

GGGUCGUGACUGGCGAACAGGUGGGAAACCACCGGGGAGCGACCCUUGCCGCCCGCCUGGGCAA

((((((((((([......((((((...])))))))))))))))))(((((.........)))))

SSSSSSSSSSSBBBBBBBSSSSSSHHHHSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSHHHHHHHHHSSSSS

NNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_622

GACGAUAUCGAGCAUCAAGAGUGAAUAUCGUC

(((((((((((((.....))))).))))))))

SSSSSSSSSSSSSHHHHHSSSSSBSSSSSSSS

NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_624

CCUGAGUUCAAUUCUAGCG

...................

EEEEEEEEEEEEEEEEEEE

NNNNNNNNNNNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_630

CGCGAAUUXXCG

............

EEEEEEEEEEEE

NNNNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_631

UUUUUAAUGAAGCCACAGGCUGUGAGGGUCCUAAGCCCCUAAUUCAGAAGGGAA

.(((..((((([[(((((.)))))((((({{{.)]]))))..))))))}}}.))

ESSSBBSSSSSMMSSSSSHSSSSSSSSSSHHHHSBBSSSSMMSSSSSSBBBBSS

NNNNNNNNNNNKKNNNNNNNNNNNNNNNNKKKNNKKNNNNNNNNNNNNKKKNNN

bpRNA_PDB_635

gGCUUAUCaAGAGAGGGCGAGCGACUGGCGCGAAGACCCCCGGCAACCAGAAAUGGUGCCAAUUCCUGCAGCGGAAACGUUGAAAGAUGAGCCGa

((((((((....(.(((((((((.[[[[)))...)))))))((({.(((....))).)))...(]]]]((((((..))))))..))))))))).}

SSSSSSSSMMMMSBSSSSSSSSSHHHHHSSSBBBSSSSSSSSSSIISSSHHHHSSSISSSMMMSIIIISSSSSSHHSSSSSSIISSSSSSSSSEE

NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNK

bpRNA_PDB_644

AUGCGCCCAGAUAGGGUGUUAAGUCAAGUAGUUUAAGGUACUACUCUGUAAGAUAACACAGAAAACAGCCAACCUAACCGAAAAGCGAAAGCUGAUACGGGAACAGAGCACGGUUGGAAAGCGAUGAGUUACCUAAAGACAAUCGGGUACGACUGAGUCGCAAUGUUAAUCAGAUAUAAGGUAUAAGUUGUGUUUACUGAACGCAAGUUUCUAAUUUCGGUUAUGUGUCGAUAGAGGAAAGUGUCUGAAACCUCUAGUACAAAGAAAGGUAAGUUAUGGUUGUGGACUUAUCUGUUAUCACCACAUUUGUACAAUCUGUAGGAGAACCUAUGGGAACGAAACGAAAGCGAUGCCGAGAAUCUGAAUUUACCAAGACUUAACACUAACUGGGGAUACCCUAAACAAGAAUGCCUAaAGGAGGAAAAAGGCUAUAGCACUAGAGCUUGAAAAUCUUGCAAGGGUACGGAGUACUCGUAGUAGUCUGAGAAGGGUAACGCCCUUUACAUGGCAAAGGGGUACAGUUAUUGUGUACUAAAAUUAAAAAUUGAUUAGGGAGGAAAACCUCAAACCAACAAUGGCAAUUUUAGaCAAUAACAGAGCCGUAUACUCCGAGAGGGGUACGUACGGUUCCCGAAGAGGGUGGUGCAAACCAGUCACAGUAAUGUGAACAAGGCGGUACCUCCCUACUUCAC

.........(....[....(.(((.............()........(..........)......(...(((((..(.(....((......)).....)...).....]..)))))...(..(.....(..........[...........)......)..)..)......(((.................................(((...(...................(.(......]........).)....((.......(((.(.(().........).).)))................)).......(((........))).).....)))............[.....)))............))).)........).......(.........(....(......).................{...............)........)....{..(.((..............(...(....[.)..).............)).)..(.(..(...............................................................)..)....(.(.]....(.(.(.]).).)..)......}.).).(.....(.(..(...}...(....)(..)..............)..).)......)...

EEEEEEEEESIIIIIIIIISISSSMMMMMMMMMMMMMSSMMMMMMMMSHHHHHHHHHHSMMMMMMSMMMSSSSSIISISIIIISSHHHHHHSSIIIIISIIISIIIIIIIISSSSSMMMSIISIIIIISHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSIIIIIISIISMMSMMMMMMSSSIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIISSSIIISMMMMMMMMMMMMMMMMMMMSISHHHHHHHHHHHHHHHSISMMMMSSIIIIIIISSSISISSSBBBBBBBBBSISISSSIIIIIIIIIIIIIIIISSMMMMMMMSSSHHHHHHHHSSSMSIIIIISSSIIIIIIIIIIIIIIIIIISSSMMMMMMMMMMMMSSSISIIIIIIIISMMMMMMMSIIIIIIIIISIIIISHHHHHHSIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIISIIIIIIIISMMMMMMMSISSIIIIIIIIIIIIIISIIISHHHHHHSIISIIIIIIIIIIIIISSISMMSMSIISHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSIISMMMMSISIIIIIISISISHHSISISIISIIIIIIIISMSMSIIIIISISIISMMMMMMMSHHHHSSHHSMMMMMMMMMMMMMMSIISISIIIIIISEEE

NNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_645

NNNGACUUAAGUC

.............

EEEEEEEEEEEEE

NNNNNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_646

GGGAUCUGUCACCCCAUUGAUCGCCUUCGGGCUGAUCUGGCUGGCUAGGCGGGUCCC

(((((((((((((((...((((((((..)))).)))).))..))..)))))))))))

SSSSSSSSSSSSSSSIIISSSSSSSSHHSSSSBSSSSISSBBSSBBSSSSSSSSSSS

NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_647

GUGUGCCCGGCAUGGGUGCAGUCUAUAGGGUGAGAGUCCCGAACUGUGAAGGCAGAAGUAACAGUUAGCCUAACGCAACUGCGCCGUGGCGACAUGGCGUGGGAAGGAAGCGGACGGCAAACCUUCGGUCUGAGGAACACGAACUUCAUAUGAGGCUAGGUAUCAAUGGAUGAGUUUGCAUaACAAAACAAAGUCCUUUCUGCCAAAGUUGGUACAGAGUAAAUGAAGCAGAUUGAUGAAGGGAAAGACUGCAUUCUUACCCGGGGAGGUCUGGAAACAGAAGUCAGCAGAAGUCAUAGUACCCUGUUCgCAGGGGAAGGACGGAACAAGUAUGGCGUUCGCGCCUAAGCUUGAACCGCCGUAUACCGAACGGUACGUACGGUGGUGUGGCAGGGGCGCUUCGGCCCCCUAUGCCGAU

[[[[{((((({(.(((((((((((.((((((<..)..)))))(((((((<AAAAAAA.)))))))(((((..(((((((((((((((((..))))))))))))..]})[))))..)))))((((((..(((((((.[.)))..(((((]..(([(((.(((((((((((((((((((.]......)))))).))))>aaaaaaa...))))))))).)))).)))))))))).....))))))>.))))))))))))]}])))))(((((((((..)))))))))(..(..((((.((.(((((((....)))))))))))))..)((((([(((((....))))].))))))((((((((((((((....)))].))))))))))).((((((((.((....)))))))..))).])

EEEEESSSSSISBSSSSSSSSSSSMSSSSSSHHHSBBSSSSSSSSSSSSHHHHHHHHHSSSSSSSSSSSSIISSSSSSSSSSSSSSSSSHHSSSSSSSSSSSSBBBBSBSSSSIISSSSSSSSSSSIISSSSSSSHHHSSSMMSSSSSBBBSSBSSSISSSSSSSSSSSSSSSSSSSHHHHHHHHSSSSSSBSSSSBBBBBBBBBBBSSSSSSSSSISSSSBSSSSSSSSSSIIIIISSSSSSMMSSSSSSSSSSSSIIISSSSSSSSSSSSSSHHSSSSSSSSSSMMSIISSSSBSSBSSSSSSSHHHHSSSSSSSSSSSSSIISSSSSSBSSSSSHHHHSSSSBBSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSHHHHSSSBBSSSSSSSSSSSMSSSSSSSSBSSHHHHSSSSSSSBBSSSMMS

KKKKKNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNKKKKKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNKNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNKKKKKKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNKKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKN

bpRNA_PDB_649

AACCUUCACCAAUUAGGUUCAAAUAAGUGGU

[[[[..{((((.(((]]]]....)))}))))

EEEEEEESSSSISSSHHHHHHHHSSSISSSS

KKKKNNKNNNNNNNNKKKKNNNNNNNKNNNN

bpRNA_PDB_650

GGACACUGAUGAUCGCGUGGAUAUGGCACGCAUUGAAUUGUUGGACACCGUAAAUGUCCUAACACGUGUCC

((((((.([({((.(((((..<<.<<))))))(.A.).]}..(((((>>()>>.))))).))a).))))))

SSSSSSISISBSSBSSSSSHHHHHHHSSSSSSSHHHSMMMMMSSSSSIISSIIISSSSSMSSISISSSSSS

NNNNNNNNKNKNNNNNNNNNNKKNKKNNNNNNNNKNNNKKNNNNNNNKKNNKKNNNNNNNNNKNNNNNNNN

bpRNA_PDB_651

GGGUGUACUUAACGUUUGCUUCGGCAAACUACAUCC

((((((.....(.(((((((..))))))))))))))

SSSSSSBBBBBSBSSSSSSSHHSSSSSSSSSSSSSS

NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_652

aGCGGGGcGGAGCAGCCUGGUAGCUCGUCGGGcUCAUAACCCGAAGAUCGUCGGuUCAAAUCCGGCCCCCGCUACC

((((((([.((((][...{<..))))(((((((.....)))))))...]((((((}>.)..))))))))))))...

SSSSSSSMMSSSSHHHHHHHHHSSSSSSSSSSSHHHHHSSSSSSSMMMMSSSSSSHHHSBBSSSSSSSSSSSSEEE

NNNNNNNKNNNNNKKNNNKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_653

GGCAGCCAGAAGAGCACGUAUACGCAAGGCUGUC

(((((((((.)[.((..(.)..])).))))))))

SSSSSSSSSHSMMSSIISHSIIISSMSSSSSSSS

NNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_654

GAUAACUGAAUCGCUAAGGAUGAAAGUCUAUGCGACAUUAUC

(.(((.((..(((((()(((((..)))))).))))))))).)

SISSSBSSBBSSSSSSSSSSSSHHSSSSSSBSSSSSSSSSIS

NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_655

GCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGCUGC

..........................

EEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEE

NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_656

GGUGGGGACGACCCCACC

(((((((....)))))))

SSSSSSSHHHHSSSSSSS

NNNNNNNNNNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_663

GUCUAAAGUUUGCUAGGGUUCCGCGUCAuAGGUGGUCUGGUCCAAGAGCAAACGGCUUUCACAAAGCCACACGGAAGGAUAAAAGCCUGGGAGAU

......(((((((((((...((((((((.)))))..).)).))))[.))))))(((((.....)))))){](((.(((((..)).))).})))..

EEEEEESSSSSSSSSSSIIISSSSSSSSHSSSSSBBSBSSISSSSBBSSSSSSSSSSSHHHHHSSSSSSXXSSSISSSSSHHSSBSSSIISSSEE

NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNN

bpRNA_PDB_664

GGGUCAGGCCGGCGAAAGUCGCCACAGUUUGGGGAAAGCUGUGCAGCCUGUAACCCCCCCACGAAAGUGGG

..[.((((((((((..))))).(((((((.{{{{.){))))))].)))))}..}}}}((((((..))))))

EEEESSSSSSSSSSHHSSSSSMSSSSSSSHHHHHHSBSSSSSSMMSSSSSXXXXXXXSSSSSSHHSSSSSS

NNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKKKNNKNNNNNNKNNNNNNKNNKKKKNNNNNNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_665

GGUGACUAGGGUUCCGGCGAAAGCCGGUCCGAGAGUUACCGACCGCCGAAAGGCGGUUACACGGCGGGAAAAAAGCCCGGGAGGA

(((((((((((..((((((..)))))))))))[.)))))).(((((((..)))))))..{](((.((((....).))).})))()

SSSSSSSSSSSBBSSSSSSHHSSSSSSSSSSSBBSSSSSSXSSSSSSSHHSSSSSSSXXXXSSSISSSSHHHHSBSSSIISSSSS

NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKKNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNNNNN

bpRNA_PDB_666

GGACAUAAGGAAAACCUAUGUCC

(((((((.((....)))))))))

SSSSSSSBSSHHHHSSSSSSSSS

NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN

bpRNA_PDB_667

GGUGUUGACUGUUGAAUCUCAUGGCAACACC

(((((((.((...(.)......)))))))))

SSSSSSSBSSIIISHSIIIIIISSSSSSSSS

NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN

bpRNA_RFAM_3

UCUGGUGAUUUUAGCGAAGUGGUCACACCUGUUCCCAUCUCGAACACAGAAGUUAAGCACUUUAGCGGCGACAAUAUCUAGCCACGCGCUAGUGAAGAUAGUUCAUCGCCAGGU

.((((((((....((.(((((...((..((((((.......))..))))..))....)))))..))(((.((..(.((.....(()).....)).).)).))).))))))))..

ESSSSSSSSMMMMSSISSSSSIIISSIISSSSSSHHHHHHHSSBBSSSSIISSIIIISSSSSIISSSSSISSIISISSIIIIISSSSIIIIISSISISSISSSMSSSSSSSSEE

NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN

bpRNA_RFAM_5

UCUGGUGAUGAUGUUCUUUAGGGUAACACCCGUUCCCAUUCCGAACACGACGGUUAAGCCUUUAGAAGCCGAUGGUACUGCACGGGAGACUGUGUGGGAGAGUAGGUGGUCGCCAGGU

.((((((((....((..(((((...((..((((((.......))..))))..))....)))))..))(((.((..(.((....((....)).....)).).)).))).))))))))..

ESSSSSSSSMMMMSSIISSSSSIIISSIISSSSSSHHHHHHHSSBBSSSSIISSIIIISSSSSIISSSSSISSIISISSIIIISSHHHHSSIIIIISSISISSISSSMSSSSSSSSEE

NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN