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dataset_info: |
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features: |
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- name: smiles |
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dtype: string |
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- name: canonsmiles |
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dtype: string |
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- name: isSmilesEqual |
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dtype: bool |
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- name: generic_scaffold |
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dtype: string |
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- name: scaffold |
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dtype: string |
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- name: rdkit_WT |
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dtype: float64 |
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- name: rdkit_MR |
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dtype: float64 |
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- name: rdkit_LogP |
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dtype: float64 |
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- name: rdkit_HA |
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dtype: float64 |
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- name: rdkit_HD |
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dtype: float64 |
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- name: rdkit_NumAtoms |
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dtype: float64 |
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- name: rdkit_TPSA |
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dtype: float64 |
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configs: |
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- config_name: default |
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data_files: |
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- split: train |
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path: train/*/*.arrow |
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- split: test |
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path: test/*/*.arrow |
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- config_name: cls |
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data_files: |
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|
- split: train |
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|
path: train/cls/*.arrow |
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|
- split: test |
|
|
path: test/cls/*.arrow |
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- config_name: cno |
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data_files: |
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|
- split: train |
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|
path: train/cno/*.arrow |
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|
- split: test |
|
|
path: test/cno/*.arrow |
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- config_name: cn |
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data_files: |
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|
- split: train |
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|
path: train/cn/*.arrow |
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|
- split: test |
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|
path: test/cn/*.arrow |
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- config_name: co |
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data_files: |
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|
- split: train |
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|
path: train/co/*.arrow |
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|
- split: test |
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|
path: test/co/*.arrow |
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- config_name: g |
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data_files: |
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|
- split: train |
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|
path: train/g/*.arrow |
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|
- split: test |
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|
path: test/g/*.arrow |
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- config_name: sk |
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|
data_files: |
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|
- split: train |
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|
path: train/sk/*.arrow |
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|
- split: test |
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|
path: test/sk/*.arrow |
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task_categories: |
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- text-generation |
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|
- text2text-generation |
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|
- feature-extraction |
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tags: |
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- chemistry |
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size_categories: |
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- 1B<n<10B |
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# GDB13 |
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## Info |
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dataset com aproximadamente 2 bilhões de moleculas de 13 atomos com 7 por heuristica com rdkit |
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usado para testes de geração condicional baseada nas propriedades ou predição destas. |
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Foi retirado as informações de posição atomica (grafos) e mantido apenas smiles como informação estrutural |
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## Colunas |
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- **smiles**: smiles presente no dataset original |
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- **canonsmiles**: smiles canonizado no rdkit |
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- **isSmilesEqual**: se smiles riginal é canonico |
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- **scaffold**: scaffold baseado nas regras de Murck |
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- **generic_scaffold**: scaffold mantendo apenas lig simples e padronizando todos atomos para carbono |
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- **rdkit_WT**: massa molar (obtida com rdkit) |
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- **rdkit_MR**: refratividade molar (obtida com rdkit) |
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- **rdkit_LogP**: logP (obtida com rdkit) |
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- **rdkit_HA**: numero de aceptores de Hidrogenio (obtida com rdkit) |
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- **rdkit_HD**: numero de doadores de Hidrogenio (obtida com rdkit) |
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- **rdkit_NumAtoms**: numero de atomos na molecula (obtida com rdkit) |
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- **rdkit_TPSA**: topological polar surface area (obtida com rdkit) |
