disi-unibo-nlp/ncbi · Datasets at Hugging Face

tokens listlengths 2 123	ner_tags listlengths 2 123
[ "Analysis", "of", "mosaic", "mice", "showed", "that", "in", "heart", ",", "lung", ",", "kidney", ",", "brain", ",", "and", "liver", ",", "mainly", "wild", "-", "type", "Piga", "is", "active", ",", "suggesting", "that", "these", "tissues", "require", "GPI", "-", "linked", "proteins", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "salient", "exceptions", "were", "spleen", ",", "thymus", ",", "and", "red", "blood", "cells", ",", "which", "had", "almost", "equal", "numbers", "of", "cells", "expressing", "the", "wild", "-", "type", "or", "the", "recombined", "allele", ",", "implying", "that", "GPI", "-", "linked", "proteins", "are", "not", "essential", "for", "the", "derivation", "of", "these", "tissues", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "PIGA", "(", "-", ")", "cells", "had", "no", "growth", "advantage", ",", "suggesting", "that", "other", "factors", "are", "needed", "for", "their", "clonal", "dominance", "in", "patients", "with", "paroxysmal", "nocturnal", "hemoglobinuria", ".", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O" ]
[ "The", "C282Y", "mutation", "causing", "hereditary", "hemochromatosis", "does", "not", "produce", "a", "null", "allele", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Targeted", "mutagenesis", "was", "used", "to", "produce", "two", "mutations", "in", "the", "murine", "hemochromatosis", "gene", "(", "Hfe", ")", "locus", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "first", "mutation", "deletes", "a", "large", "portion", "of", "the", "coding", "sequence", ",", "generating", "a", "null", "allele", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "second", "mutation", "introduces", "a", "missense", "mutation", "(", "C282Y", ")", "into", "the", "Hfe", "locus", ",", "but", "otherwise", "leaves", "the", "gene", "intact", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "mutation", "is", "identical", "to", "the", "disease", "-", "causing", "mutation", "in", "patients", "with", "hereditary", "hemochromatosis", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]
[ "Mice", "carrying", "each", "of", "the", "two", "mutations", "were", "bred", "and", "analyzed", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Homozygosity", "for", "either", "mutation", "results", "in", "postnatal", "iron", "loading", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "effects", "of", "the", "null", "mutation", "are", "more", "severe", "than", "the", "effects", "of", "the", "C282Y", "mutation", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Mice", "heterozygous", "for", "either", "mutation", "accumulate", "more", "iron", "than", "normal", "controls", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Interestingly", ",", "although", "liver", "iron", "stores", "are", "greatly", "increased", ",", "splenic", "iron", "is", "decreased", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "conclude", "that", "the", "C282Y", "mutation", "does", "not", "result", "in", "a", "null", "allele", ".", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Genotype", "-", "phenotype", "analysis", "in", "X", "-", "linked", "Emery", "-", "Dreifuss", "muscular", "dystrophy", "and", "identification", "of", "a", "missense", "mutation", "associated", "with", "a", "milder", "phenotype", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Direct", "sequencing", "of", "the", "emerin", "gene", "in", "22", "families", "with", "Emery", "-", "Dreifuss", "muscular", "dystrophy", "(", "EMD", ")", "revealed", "mutations", "in", "21", "(", "95", "%", ")", ",", "confirming", "that", "emerin", "mutations", "can", "be", "identified", "in", "the", "majority", "of", "families", "with", "X", "-", "linked", "EMD", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]
[ "Most", "emerin", "mutations", "result", "in", "absence", "of", "the", "protein", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "this", "study", "three", "mutations", "(", "a", "missense", "mutation", "Pro183Thr", "and", "two", "in", "-", "frame", "deletions", "removing", "residues", "95", "-", "99", "and", "236", "-", "241", ",", "respectively", ")", "were", "unusual", "in", "being", "associated", "with", "expression", "of", "mutant", "protein", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "phenotype", "in", "these", "families", "was", "compared", "in", "detail", "with", "the", "clinical", "features", "in", "cases", "with", "typical", "null", "mutations", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "For", "the", "in", "-", "frame", "deletions", "there", "were", "no", "significant", "differences", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "the", "family", "with", "the", "missense", "mutation", "the", "phenotype", "was", "milder", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Age", "at", "onset", "was", "later", "for", "first", "symptoms", "and", "for", "development", "of", "ankle", "contractures", "and", "muscle", "weakness", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]
[ "These", "findings", "have", "diagnostic", "implications", "as", "well", "as", "pointing", "to", "functionally", "important", "regions", "of", "the", "emerin", "protein", ".", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Severe", "clinical", "expression", "in", "X", "-", "linked", "Emery", "-", "Dreifuss", "muscular", "dystrophy", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]
[ "X", "-", "linked", "Emery", "-", "Dreifuss", "muscular", "dystrophy", "(", "EDMD", ")", "is", "a", "relatively", "rare", "benign", "neuromuscular", "disorder", "which", "can", "vary", "remarkably", "in", "onset", ",", "course", "and", "severity", "." ]	[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "the", "present", "study", ",", "a", "TCTAC", "deletion", "spanning", "the", "nucleotides", "631", "-", "635", "of", "the", "emerin", "gene", "caused", "an", "unusually", "severe", "disease", "phenotype", "including", "loss", "of", "ambulation", "and", "severe", "muscle", "wasting", "in", "two", "affected", "brothers", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "same", "mutation", "has", "been", "reported", "previously", "in", "an", "unrelated", "family", "showing", "a", "significantly", "milder", "phenotype", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "interfamilial", "heterogeneity", "in", "distribution", "and", "in", "severity", "of", "the", "features", "in", "the", "two", "families", "point", "to", "environmental", "or", "genetic", "modification", "as", "the", "cause", "of", "clinical", "variability", "in", "Emery", "-", "Dreifuss", "muscular", "dystrophy", ".", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O" ]
[ "Common", "mutations", "in", "BRCA1", "and", "BRCA2", "do", "not", "contribute", "to", "early", "prostate", "cancer", "in", "Jewish", "men", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O" ]
[ "BACKGROUND", "Families", "with", "a", "high", "incidence", "of", "hereditary", "breast", "cancer", ",", "and", "subsequently", "shown", "to", "have", "terminating", "mutations", "in", "BRCA1", "or", "BRCA2", ",", "appear", "to", "have", "a", "higher", "incidence", "of", "prostate", "cancer", "among", "male", "relatives", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "aimed", "to", "determine", "whether", "the", "common", "germline", "mutations", "of", "BRCA1", "or", "BRCA2", "in", "Ashkenazi", "Jewish", "men", "predisposed", "them", "to", "prostate", "cancer", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]
[ "METHODS", "We", "examined", "genomic", "DNA", "from", "83", "(", "for", "BRCA1", "185delAG", ")", "or", "82", "(", "for", "BRCA2", "6174delT", ")", "Ashkenazi", "Jewish", "prostate", "cancer", "patients", ",", "most", "of", "whom", "were", "treated", "at", "a", "relatively", "young", "age", ",", "for", "the", "most", "common", "germline", "mutation", "in", "each", "gene", "seen", "in", "the", "Ashkenazi", "population", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "RESULTS", "Our", "study", "should", "have", "been", "able", "to", "detect", "a", "4", "-", "5", "-", "fold", "increase", "in", "the", "risk", "of", "prostate", "cancer", "due", "to", "mutation", "of", "BRCA1", "or", "BRCA2", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "However", ",", "only", "one", "(", "1", ".", "15", "%", ";", "95", "%", "confidence", "interval", ",", "0", "-", "3", ".", "6", "%", ")", "of", "the", "patients", "was", "heterozygous", "for", "the", "BRCA1", "mutant", "allele", ",", "and", "only", "two", "were", "heterozygous", "for", "the", "BRCA2", "mutation", "(", "2", ".", "4", "%", ";", "95", "%", "confidence", "interval", ",", "0", "-", "6", ".", "2", "%", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "CONCLUSIONS", "The", "incidence", "of", "each", "of", "the", "germline", "mutations", "in", "these", "prostate", "cancer", "patients", "closely", "matched", "their", "incidence", "(", "about", "1", "%", ")", "in", "the", "general", "Ashkenazi", "Jewish", "population", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "suggests", "that", "unlike", "cases", "of", "breast", "and", "ovarian", "cancers", ",", "mutations", "in", "BRCA1", "or", "BRCA2", "do", "not", "significantly", "predispose", "men", "to", "prostate", "cancer" ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Beta", "-", "catenin", "accumulation", "and", "mutation", "of", "the", "CTNNB1", "gene", "in", "hepatoblastoma", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O" ]
[ "Hepatoblastoma", "is", "a", "rare", "malignant", "tumor", "of", "the", "liver", "that", "occurs", "in", "children", "at", "an", "average", "age", "of", "2", "to", "3", "years", "." ]	[ "B-DISEASE", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Epidemiologic", "studies", "have", "shown", "an", "increased", "frequency", "of", "this", "tumor", "type", "in", "families", "affected", "by", "adenomatous", "polyposis", "coli", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]
[ "In", "addition", "to", "the", "epidemiologic", "data", ",", "molecular", "genetic", "studies", "suggest", "that", "inactivation", "of", "the", "APC", "tumor", "suppressor", "may", "be", "involved", "in", "hepatoblastoma", "tumorigenesis", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O" ]
[ "A", "major", "function", "of", "APC", "is", "the", "downregulation", "of", "beta", "-", "catenin", ",", "a", "transcription", "-", "activating", "protein", "with", "oncogenic", "potential", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "an", "ongoing", "immunohistochemical", "study", "of", "beta", "-", "catenin", "expression", "in", "sporadic", "cases", "of", "tumor", "types", "that", "are", "associated", "with", "adenomatous", "polyposis", "coli", ",", "we", "observed", "increased", "beta", "-", "catenin", "levels", "in", "the", "cytoplasm", "and", "in", "the", "nuclei", "of", "three", "investigated", "hepatoblastomas", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O" ]
[ "Sequencing", "of", "exon", "3", "of", "the", "beta", "-", "catenin", "gene", "(", "CTNNB1", ")", "revealed", "an", "activating", "mutation", "in", "one", "of", "the", "tumor", "samples", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O" ]
[ "Our", "data", "indicate", "for", "the", "first", "time", "that", "beta", "-", "catenin", "accumulation", "may", "play", "a", "role", "in", "the", "development", "of", "hepatoblastoma", "and", "that", "activating", "mutations", "of", "the", "beta", "-", "catenin", "gene", "may", "substitute", "biallelic", "APC", "inactivation", "in", "this", "tumor", "type", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O" ]
[ "Genes", "Chromosomes", "Cancer", "25", "399", "-", "402", ",", "1999", ".", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Decrease", "in", "GTP", "cyclohydrolase", "I", "gene", "expression", "caused", "by", "inactivation", "of", "one", "allele", "in", "hereditary", "progressive", "dystonia", "with", "marked", "diurnal", "fluctuation", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Hereditary", "progressive", "dystonia", "with", "marked", "diurnal", "fluctuation", "(", "HPD", ";", "dopa", "-", "responsive", "dystonia", ",", "DRD", ")", "have", "been", "recently", "found", "to", "be", "caused", "by", "a", "genetic", "defect", "in", "the", "GTP", "cyclohydrolase", "I", "(", "GCH1", ")", "gene", "." ]	[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "this", "study", ",", "we", "quantified", "the", "mRNA", "level", "of", "GCH1", "in", "phytohemagglutinin", "(", "PHA", ")", "-", "stimulated", "mononuclear", "blood", "cells", "from", "one", "Japanese", "family", "that", "do", "not", "have", "a", "mutation", "in", "the", "coding", "region", "or", "splice", "junctions", "of", "the", "gene", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "results", "showed", "that", "the", "amounts", "of", "the", "GCH1", "mRNA", "were", "decreased", "to", "about", "40", "%", "of", "the", "normal", "level", "in", "both", "patients", "and", "carriers", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "addition", ",", "we", "found", "that", "the", "GCH1", "mRNA", "was", "transcribed", "from", "only", "one", "allele", ",", "indicating", "that", "the", "other", "allele", "was", "in", "an", "inactive", "state", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "These", "results", "suggest", "that", "some", "novel", "mutations", "should", "exist", "on", "one", "of", "the", "alleles", "in", "some", "unknown", "region", "of", "the", "GCH1", "gene", ",", "and", "may", "decrease", "the", "GCH1", "mRNA", "causing", "the", "HPD", "/", "DRD", "symptoms", ".", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O" ]
[ "Sulfate", "transport", "is", "not", "impaired", "in", "pendred", "syndrome", "thyrocytes", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O" ]
[ "Pendred", "syndrome", "is", "the", "most", "common", "form", "of", "syndromic", "deafness", ",", "characterized", "by", "dyshormonogenic", "goiter", "associated", "with", "sensory", "-", "neural", "deafness", "." ]	[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]
[ "The", "gene", "responsible", "for", "the", "disease", "(", "PDS", ")", "has", "been", "cloned", ",", "but", "its", "function", "is", "as", "yet", "unknown", "and", "the", "connection", "between", "thyroid", "goiter", "and", "sensory", "-", "neural", "deafness", "remains", "an", "enigma", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O" ]
[ "PDS", "codes", "for", "a", "novel", "protein", ",", "pendrin", ",", "which", "is", "closely", "related", "to", "a", "number", "of", "sufate", "transporters", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Mechanisms", "by", "which", "abnormal", "sulfate", "transport", "could", "deleteriously", "affect", "iodide", "organification", "have", "been", "proposed", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "tested", "sulfate", "transport", "in", "thyrocytes", "obtained", "from", "Pendred", "syndrome", "patients", "and", "found", "that", "it", "was", "not", "defective", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "suggests", "that", "pendrin", "in", "fact", "may", "not", "be", "a", "sulfate", "transporter", ",", "and", "emphasizes", "the", "importance", "of", "functional", "studies", "on", "this", "novel", "protein", ".", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Small", "deletions", "in", "the", "type", "II", "collagen", "triple", "helix", "produce", "kniest", "dysplasia", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]
[ "Kniest", "dysplasia", "is", "a", "moderately", "severe", "type", "II", "collagenopathy", ",", "characterized", "by", "short", "trunk", "and", "limbs", ",", "kyphoscoliosis", ",", "midface", "hypoplasia", ",", "severe", "myopia", ",", "and", "hearing", "loss", "." ]	[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]
[ "Mutations", "in", "the", "gene", "that", "encodes", "type", "II", "collagen", "(", "COL2A1", ")", ",", "the", "predominant", "protein", "of", "cartilage", ",", "have", "been", "identified", "in", "a", "number", "of", "individuals", "with", "Kniest", "dysplasia", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]
[ "All", "but", "two", "of", "these", "previously", "described", "mutations", "cause", "in", "-", "frame", "deletions", "in", "type", "II", "collagen", ",", "either", "by", "small", "deletions", "in", "the", "gene", "or", "splice", "site", "alterations", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Furthermore", ",", "all", "but", "one", "of", "these", "mutations", "is", "located", "between", "exons", "12", "and", "24", "in", "the", "COL2A1", "gene", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "used", "heteroduplex", "analysis", "to", "identify", "sequence", "anomalies", "in", "five", "individuals", "with", "Kniest", "dysplasia", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]
[ "Sequencing", "of", "the", "index", "patients", "genomic", "DNA", "identified", "four", "new", "dominant", "mutations", "in", "COL2A1", "that", "result", "in", "Kniest", "dysplasia", "a", "21", "-", "bp", "deletion", "in", "exon", "16", ",", "an", "18", "-", "bp", "deletion", "in", "exon", "19", ",", "and", "4", "-", "bp", "deletions", "in", "the", "splice", "donor", "sites", "of", "introns", "14", "and", "20", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "A", "previously", "described", "28", "-", "bp", "deletion", "at", "the", "COL2A1", "exon", "12", "-", "intron", "12", "junction", ",", "deleting", "the", "splice", "donor", "site", ",", "was", "identified", "in", "the", "fifth", "case", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "latter", "three", "mutations", "are", "predicted", "to", "result", "in", "exon", "skipping", "in", "the", "mRNA", "encoded", "from", "the", "mutant", "allele", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "These", "data", "suggest", "that", "Kniest", "dysplasia", "results", "from", "shorter", "type", "II", "collagen", "monomers", ",", "and", "support", "the", "hypothesis", "that", "alteration", "of", "a", "specific", "COL2A1", "domain", ",", "which", "may", "span", "from", "exons", "12", "to", "24", ",", "leads", "to", "the", "Kniest", "dysplasia", "phenotype", ".", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O" ]
[ "Classical", "galactosemia", "and", "mutations", "at", "the", "galactose", "-", "1", "-", "phosphate", "uridyl", "transferase", "(", "GALT", ")", "gene", "." ]	[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Classical", "galactosemia", "is", "caused", "by", "a", "deficiency", "in", "activity", "of", "the", "enzyme", "galactose", "-", "1", "-", "phosphate", "uridyl", "transferase", "(", "GALT", ")", ",", "which", ",", "in", "turn", ",", "is", "caused", "by", "mutations", "at", "the", "GALT", "gene", "." ]	[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "disorder", "exhibits", "considerable", "allelic", "heterogeneity", "and", ",", "at", "the", "end", "of", "1998", ",", "more", "than", "150", "different", "base", "changes", "were", "recorded", "in", "24", "different", "populations", "and", "ethnic", "groups", "in", "15", "countries", "worldwide", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "mutations", "most", "frequently", "cited", "are", "Q188R", ",", "K285N", ",", "S135L", ",", "and", "N314D", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Q188R", "is", "the", "most", "common", "mutation", "in", "European", "populations", "or", "in", "those", "predominantly", "of", "European", "descent", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Overall", ",", "it", "accounts", "for", "60", "-", "70", "%", "of", "mutant", "chromosomes", ",", "but", "there", "are", "significant", "differences", "in", "its", "relative", "frequency", "in", "individual", "populations", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Individuals", "homoallelic", "for", "Q188R", "tend", "to", "have", "a", "severe", "phenotype", "and", "this", "is", "in", "keeping", "with", "the", "virtually", "complete", "loss", "of", "enzyme", "activity", "observed", "in", "in", "vitro", "expression", "systems", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Globally", ",", "K285N", "is", "rarer", ",", "but", "in", "many", "European", "populations", "it", "can", "be", "found", "on", "25", "-", "40", "%", "of", "mutant", "chromosomes", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "It", "is", "invariably", "associated", "with", "a", "severe", "phenotype", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "S135L", "is", "found", "almost", "exclusively", "in", "African", "Americans", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "vitro", "expression", "results", "are", "discrepant", ",", "but", "some", "individuals", "carrying", "S135L", "appear", "to", "exhibit", "GALT", "activity", "in", "some", "tissues", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Duarte", "1", "(", "or", "Los", "Angeles", ")", "and", "Duarte", "2", "(", "or", "Duarte", ")", "variants", "carry", "the", "same", "amino", "acid", "substitution", ",", "N314D", ",", "even", "though", "D1", "is", "associated", "with", "increased", "erythrocyte", "GALT", "activity", "and", "D2", "with", "reduced", "activity", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "N314D", "is", "in", "linkage", "disequilibrium", "with", "other", "base", "changes", "that", "differ", "on", "the", "D1", "and", "D2", "alleles", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "N314D", "does", "not", "impair", "GALT", "activity", "in", "in", "vitro", "expression", "systems", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "However", ",", "there", "are", "differences", "in", "the", "abundance", "of", "GALT", "protein", "in", "lymphoblastoid", "cells", "lines", "from", "D2", "and", "D1", "individuals", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "It", "is", "unclear", "whether", "the", "specific", "molecular", "changes", "that", "distinguish", "the", "D1", "and", "D2", "alleles", "account", "for", "the", "different", "activities", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "considerable", "genetic", "heterogeneity", "documented", "to", "date", "undoubtedly", "contributes", "to", "the", "phenotypic", "heterogeneity", "that", "is", "observed", "in", "galactosemia", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O" ]
[ "The", "additional", "effects", "of", "nonallelic", "variation", "and", "other", "constitutional", "factors", "on", "phenotypic", "variability", "remain", "to", "be", "elucidated", ".", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Mutations", "of", "the", "VHL", "gene", "in", "sporadic", "renal", "cell", "carcinoma", ":", "definition", "of", "a", "risk", "factor", "for", "VHL", "patients", "to", "develop", "an", "RCC", "." ]	[ "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O" ]
[ "To", "investigate", "the", "nature", "of", "somatic", "von", "Hippel", "-", "Lindau", "(", "VHL", ")", "mutations", ",", "we", "analyzed", "173", "primary", "sporadic", "human", "renal", "cell", "carcinomas", "for", "mutations", "of", "the", "VHL", "tumor", "suppressor", "gene", ",", "using", "polymerase", "chain", "reaction", "(", "PCR", ")", "and", "single", "-", "strand", "conformational", "polymorphism", "analysis", "(", "SSCP", ")", "of", "DNA", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "detected", "abnormal", "SSCP", "pattern", "in", "73", "samples", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "After", "sequencing", ",", "we", "identified", "microdeletions", "in", "58", "%", "of", "cases", ",", "microinsertions", "in", "17", "%", ",", "nonsense", "mutations", "in", "8", "%", ",", "and", "missense", "mutations", "in", "17", "%", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Among", "these", "mutations", ",", "50", "%", "correspond", "to", "new", "mutations", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "VHL", "mutations", "were", "found", "only", "in", "the", "nonpapillary", "renal", "cell", "carcinoma", "(", "RCC", ")", "subtype", ",", "as", "previously", "reported", "." ]	[ "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "To", "compare", "somatic", "and", "germline", "mutations", ",", "we", "used", "the", "VHL", "database", ",", "which", "includes", "507", "mutations", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "study", "of", "mutational", "events", "revealed", "a", "significant", "difference", "between", "somatic", "and", "germline", "mutations", "with", "mutations", "leading", "to", "truncated", "proteins", "observed", "in", "78", "%", "of", "somatic", "mutations", "vs", "only", "37", "%", "in", "germline", "mutations", "(", "P", "<", "0", ".", "001", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "postulated", "that", "a", "specific", "pattern", "of", "VHL", "mutations", "is", "associated", "with", "sporadic", "RCC", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]
[ "This", "pattern", "corresponds", "to", "mutations", "leading", "mainly", "to", "truncated", "proteins", "with", "few", "specific", "missense", "mutations", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "then", "analyzed", "the", "occurrence", "of", "RCC", "in", "VHL", "families", ",", "based", "on", "the", "nature", "of", "mutations", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "observed", "RCC", "in", "at", "least", "one", "member", "of", "the", "VHL", "families", "in", "77", "%", "of", "cases", "with", "mutations", "leading", "to", "truncated", "proteins", "versus", "55", "%", "in", "cases", "with", "missense", "mutations", "(", "P", "<", "0", ".", "05", ")", "." ]	[ "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Thus", ",", "mutations", "resulting", "in", "truncated", "proteins", "may", "lead", "to", "a", "higher", "risk", "of", "RCC", "in", "VHL", "patients" ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O" ]
[ "Defective", "CTLA", "-", "4", "cycling", "pathway", "in", "Chediak", "-", "Higashi", "syndrome", ":", "a", "possible", "mechanism", "for", "deregulation", "of", "T", "lymphocyte", "activation", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Analysis", "of", "mosaic", "mice", "showed", "that", "in", "heart", ",", "lung", ",", "kidney", ",", "brain", ",", "and", "liver", ",", "mainly", "wild", "-", "type", "Piga", "is", "active", ",", "suggesting", "that", "these", "tissues", "require", "GPI", "-", "linked", "proteins", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "salient", "exceptions", "were", "spleen", ",", "thymus", ",", "and", "red", "blood", "cells", ",", "which", "had", "almost", "equal", "numbers", "of", "cells", "expressing", "the", "wild", "-", "type", "or", "the", "recombined", "allele", ",", "implying", "that", "GPI", "-", "linked", "proteins", "are", "not", "essential", "for", "the", "derivation", "of", "these", "tissues", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "PIGA", "(", "-", ")", "cells", "had", "no", "growth", "advantage", ",", "suggesting", "that", "other", "factors", "are", "needed", "for", "their", "clonal", "dominance", "in", "patients", "with", "paroxysmal", "nocturnal", "hemoglobinuria", ".", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O" ]

[ "The", "C282Y", "mutation", "causing", "hereditary", "hemochromatosis", "does", "not", "produce", "a", "null", "allele", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Targeted", "mutagenesis", "was", "used", "to", "produce", "two", "mutations", "in", "the", "murine", "hemochromatosis", "gene", "(", "Hfe", ")", "locus", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "first", "mutation", "deletes", "a", "large", "portion", "of", "the", "coding", "sequence", ",", "generating", "a", "null", "allele", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "second", "mutation", "introduces", "a", "missense", "mutation", "(", "C282Y", ")", "into", "the", "Hfe", "locus", ",", "but", "otherwise", "leaves", "the", "gene", "intact", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "mutation", "is", "identical", "to", "the", "disease", "-", "causing", "mutation", "in", "patients", "with", "hereditary", "hemochromatosis", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]

[ "Mice", "carrying", "each", "of", "the", "two", "mutations", "were", "bred", "and", "analyzed", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Homozygosity", "for", "either", "mutation", "results", "in", "postnatal", "iron", "loading", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "effects", "of", "the", "null", "mutation", "are", "more", "severe", "than", "the", "effects", "of", "the", "C282Y", "mutation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Mice", "heterozygous", "for", "either", "mutation", "accumulate", "more", "iron", "than", "normal", "controls", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Interestingly", ",", "although", "liver", "iron", "stores", "are", "greatly", "increased", ",", "splenic", "iron", "is", "decreased", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "conclude", "that", "the", "C282Y", "mutation", "does", "not", "result", "in", "a", "null", "allele", ".", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Genotype", "-", "phenotype", "analysis", "in", "X", "-", "linked", "Emery", "-", "Dreifuss", "muscular", "dystrophy", "and", "identification", "of", "a", "missense", "mutation", "associated", "with", "a", "milder", "phenotype", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Direct", "sequencing", "of", "the", "emerin", "gene", "in", "22", "families", "with", "Emery", "-", "Dreifuss", "muscular", "dystrophy", "(", "EMD", ")", "revealed", "mutations", "in", "21", "(", "95", "%", ")", ",", "confirming", "that", "emerin", "mutations", "can", "be", "identified", "in", "the", "majority", "of", "families", "with", "X", "-", "linked", "EMD", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]

[ "Most", "emerin", "mutations", "result", "in", "absence", "of", "the", "protein", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "this", "study", "three", "mutations", "(", "a", "missense", "mutation", "Pro183Thr", "and", "two", "in", "-", "frame", "deletions", "removing", "residues", "95", "-", "99", "and", "236", "-", "241", ",", "respectively", ")", "were", "unusual", "in", "being", "associated", "with", "expression", "of", "mutant", "protein", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "phenotype", "in", "these", "families", "was", "compared", "in", "detail", "with", "the", "clinical", "features", "in", "cases", "with", "typical", "null", "mutations", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "For", "the", "in", "-", "frame", "deletions", "there", "were", "no", "significant", "differences", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "the", "family", "with", "the", "missense", "mutation", "the", "phenotype", "was", "milder", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Age", "at", "onset", "was", "later", "for", "first", "symptoms", "and", "for", "development", "of", "ankle", "contractures", "and", "muscle", "weakness", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]

[ "These", "findings", "have", "diagnostic", "implications", "as", "well", "as", "pointing", "to", "functionally", "important", "regions", "of", "the", "emerin", "protein", ".", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Severe", "clinical", "expression", "in", "X", "-", "linked", "Emery", "-", "Dreifuss", "muscular", "dystrophy", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]

[ "X", "-", "linked", "Emery", "-", "Dreifuss", "muscular", "dystrophy", "(", "EDMD", ")", "is", "a", "relatively", "rare", "benign", "neuromuscular", "disorder", "which", "can", "vary", "remarkably", "in", "onset", ",", "course", "and", "severity", "." ]

[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "the", "present", "study", ",", "a", "TCTAC", "deletion", "spanning", "the", "nucleotides", "631", "-", "635", "of", "the", "emerin", "gene", "caused", "an", "unusually", "severe", "disease", "phenotype", "including", "loss", "of", "ambulation", "and", "severe", "muscle", "wasting", "in", "two", "affected", "brothers", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "same", "mutation", "has", "been", "reported", "previously", "in", "an", "unrelated", "family", "showing", "a", "significantly", "milder", "phenotype", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "interfamilial", "heterogeneity", "in", "distribution", "and", "in", "severity", "of", "the", "features", "in", "the", "two", "families", "point", "to", "environmental", "or", "genetic", "modification", "as", "the", "cause", "of", "clinical", "variability", "in", "Emery", "-", "Dreifuss", "muscular", "dystrophy", ".", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O" ]

[ "Common", "mutations", "in", "BRCA1", "and", "BRCA2", "do", "not", "contribute", "to", "early", "prostate", "cancer", "in", "Jewish", "men", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O" ]

[ "BACKGROUND", "Families", "with", "a", "high", "incidence", "of", "hereditary", "breast", "cancer", ",", "and", "subsequently", "shown", "to", "have", "terminating", "mutations", "in", "BRCA1", "or", "BRCA2", ",", "appear", "to", "have", "a", "higher", "incidence", "of", "prostate", "cancer", "among", "male", "relatives", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "aimed", "to", "determine", "whether", "the", "common", "germline", "mutations", "of", "BRCA1", "or", "BRCA2", "in", "Ashkenazi", "Jewish", "men", "predisposed", "them", "to", "prostate", "cancer", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]

[ "METHODS", "We", "examined", "genomic", "DNA", "from", "83", "(", "for", "BRCA1", "185delAG", ")", "or", "82", "(", "for", "BRCA2", "6174delT", ")", "Ashkenazi", "Jewish", "prostate", "cancer", "patients", ",", "most", "of", "whom", "were", "treated", "at", "a", "relatively", "young", "age", ",", "for", "the", "most", "common", "germline", "mutation", "in", "each", "gene", "seen", "in", "the", "Ashkenazi", "population", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "RESULTS", "Our", "study", "should", "have", "been", "able", "to", "detect", "a", "4", "-", "5", "-", "fold", "increase", "in", "the", "risk", "of", "prostate", "cancer", "due", "to", "mutation", "of", "BRCA1", "or", "BRCA2", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "However", ",", "only", "one", "(", "1", ".", "15", "%", ";", "95", "%", "confidence", "interval", ",", "0", "-", "3", ".", "6", "%", ")", "of", "the", "patients", "was", "heterozygous", "for", "the", "BRCA1", "mutant", "allele", ",", "and", "only", "two", "were", "heterozygous", "for", "the", "BRCA2", "mutation", "(", "2", ".", "4", "%", ";", "95", "%", "confidence", "interval", ",", "0", "-", "6", ".", "2", "%", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "CONCLUSIONS", "The", "incidence", "of", "each", "of", "the", "germline", "mutations", "in", "these", "prostate", "cancer", "patients", "closely", "matched", "their", "incidence", "(", "about", "1", "%", ")", "in", "the", "general", "Ashkenazi", "Jewish", "population", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "suggests", "that", "unlike", "cases", "of", "breast", "and", "ovarian", "cancers", ",", "mutations", "in", "BRCA1", "or", "BRCA2", "do", "not", "significantly", "predispose", "men", "to", "prostate", "cancer" ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Beta", "-", "catenin", "accumulation", "and", "mutation", "of", "the", "CTNNB1", "gene", "in", "hepatoblastoma", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O" ]

[ "Hepatoblastoma", "is", "a", "rare", "malignant", "tumor", "of", "the", "liver", "that", "occurs", "in", "children", "at", "an", "average", "age", "of", "2", "to", "3", "years", "." ]

[ "B-DISEASE", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Epidemiologic", "studies", "have", "shown", "an", "increased", "frequency", "of", "this", "tumor", "type", "in", "families", "affected", "by", "adenomatous", "polyposis", "coli", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]

[ "In", "addition", "to", "the", "epidemiologic", "data", ",", "molecular", "genetic", "studies", "suggest", "that", "inactivation", "of", "the", "APC", "tumor", "suppressor", "may", "be", "involved", "in", "hepatoblastoma", "tumorigenesis", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O" ]

[ "A", "major", "function", "of", "APC", "is", "the", "downregulation", "of", "beta", "-", "catenin", ",", "a", "transcription", "-", "activating", "protein", "with", "oncogenic", "potential", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "an", "ongoing", "immunohistochemical", "study", "of", "beta", "-", "catenin", "expression", "in", "sporadic", "cases", "of", "tumor", "types", "that", "are", "associated", "with", "adenomatous", "polyposis", "coli", ",", "we", "observed", "increased", "beta", "-", "catenin", "levels", "in", "the", "cytoplasm", "and", "in", "the", "nuclei", "of", "three", "investigated", "hepatoblastomas", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O" ]

[ "Sequencing", "of", "exon", "3", "of", "the", "beta", "-", "catenin", "gene", "(", "CTNNB1", ")", "revealed", "an", "activating", "mutation", "in", "one", "of", "the", "tumor", "samples", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O" ]

[ "Our", "data", "indicate", "for", "the", "first", "time", "that", "beta", "-", "catenin", "accumulation", "may", "play", "a", "role", "in", "the", "development", "of", "hepatoblastoma", "and", "that", "activating", "mutations", "of", "the", "beta", "-", "catenin", "gene", "may", "substitute", "biallelic", "APC", "inactivation", "in", "this", "tumor", "type", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O" ]

[ "Genes", "Chromosomes", "Cancer", "25", "399", "-", "402", ",", "1999", ".", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Decrease", "in", "GTP", "cyclohydrolase", "I", "gene", "expression", "caused", "by", "inactivation", "of", "one", "allele", "in", "hereditary", "progressive", "dystonia", "with", "marked", "diurnal", "fluctuation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Hereditary", "progressive", "dystonia", "with", "marked", "diurnal", "fluctuation", "(", "HPD", ";", "dopa", "-", "responsive", "dystonia", ",", "DRD", ")", "have", "been", "recently", "found", "to", "be", "caused", "by", "a", "genetic", "defect", "in", "the", "GTP", "cyclohydrolase", "I", "(", "GCH1", ")", "gene", "." ]

[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "this", "study", ",", "we", "quantified", "the", "mRNA", "level", "of", "GCH1", "in", "phytohemagglutinin", "(", "PHA", ")", "-", "stimulated", "mononuclear", "blood", "cells", "from", "one", "Japanese", "family", "that", "do", "not", "have", "a", "mutation", "in", "the", "coding", "region", "or", "splice", "junctions", "of", "the", "gene", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "results", "showed", "that", "the", "amounts", "of", "the", "GCH1", "mRNA", "were", "decreased", "to", "about", "40", "%", "of", "the", "normal", "level", "in", "both", "patients", "and", "carriers", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "addition", ",", "we", "found", "that", "the", "GCH1", "mRNA", "was", "transcribed", "from", "only", "one", "allele", ",", "indicating", "that", "the", "other", "allele", "was", "in", "an", "inactive", "state", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "results", "suggest", "that", "some", "novel", "mutations", "should", "exist", "on", "one", "of", "the", "alleles", "in", "some", "unknown", "region", "of", "the", "GCH1", "gene", ",", "and", "may", "decrease", "the", "GCH1", "mRNA", "causing", "the", "HPD", "/", "DRD", "symptoms", ".", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O" ]

[ "Sulfate", "transport", "is", "not", "impaired", "in", "pendred", "syndrome", "thyrocytes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O" ]

[ "Pendred", "syndrome", "is", "the", "most", "common", "form", "of", "syndromic", "deafness", ",", "characterized", "by", "dyshormonogenic", "goiter", "associated", "with", "sensory", "-", "neural", "deafness", "." ]

[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]

[ "The", "gene", "responsible", "for", "the", "disease", "(", "PDS", ")", "has", "been", "cloned", ",", "but", "its", "function", "is", "as", "yet", "unknown", "and", "the", "connection", "between", "thyroid", "goiter", "and", "sensory", "-", "neural", "deafness", "remains", "an", "enigma", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O" ]

[ "PDS", "codes", "for", "a", "novel", "protein", ",", "pendrin", ",", "which", "is", "closely", "related", "to", "a", "number", "of", "sufate", "transporters", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Mechanisms", "by", "which", "abnormal", "sulfate", "transport", "could", "deleteriously", "affect", "iodide", "organification", "have", "been", "proposed", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "tested", "sulfate", "transport", "in", "thyrocytes", "obtained", "from", "Pendred", "syndrome", "patients", "and", "found", "that", "it", "was", "not", "defective", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "suggests", "that", "pendrin", "in", "fact", "may", "not", "be", "a", "sulfate", "transporter", ",", "and", "emphasizes", "the", "importance", "of", "functional", "studies", "on", "this", "novel", "protein", ".", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Small", "deletions", "in", "the", "type", "II", "collagen", "triple", "helix", "produce", "kniest", "dysplasia", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]

[ "Kniest", "dysplasia", "is", "a", "moderately", "severe", "type", "II", "collagenopathy", ",", "characterized", "by", "short", "trunk", "and", "limbs", ",", "kyphoscoliosis", ",", "midface", "hypoplasia", ",", "severe", "myopia", ",", "and", "hearing", "loss", "." ]

[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]

[ "Mutations", "in", "the", "gene", "that", "encodes", "type", "II", "collagen", "(", "COL2A1", ")", ",", "the", "predominant", "protein", "of", "cartilage", ",", "have", "been", "identified", "in", "a", "number", "of", "individuals", "with", "Kniest", "dysplasia", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]

[ "All", "but", "two", "of", "these", "previously", "described", "mutations", "cause", "in", "-", "frame", "deletions", "in", "type", "II", "collagen", ",", "either", "by", "small", "deletions", "in", "the", "gene", "or", "splice", "site", "alterations", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Furthermore", ",", "all", "but", "one", "of", "these", "mutations", "is", "located", "between", "exons", "12", "and", "24", "in", "the", "COL2A1", "gene", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "used", "heteroduplex", "analysis", "to", "identify", "sequence", "anomalies", "in", "five", "individuals", "with", "Kniest", "dysplasia", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]

[ "Sequencing", "of", "the", "index", "patients", "genomic", "DNA", "identified", "four", "new", "dominant", "mutations", "in", "COL2A1", "that", "result", "in", "Kniest", "dysplasia", "a", "21", "-", "bp", "deletion", "in", "exon", "16", ",", "an", "18", "-", "bp", "deletion", "in", "exon", "19", ",", "and", "4", "-", "bp", "deletions", "in", "the", "splice", "donor", "sites", "of", "introns", "14", "and", "20", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "A", "previously", "described", "28", "-", "bp", "deletion", "at", "the", "COL2A1", "exon", "12", "-", "intron", "12", "junction", ",", "deleting", "the", "splice", "donor", "site", ",", "was", "identified", "in", "the", "fifth", "case", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "latter", "three", "mutations", "are", "predicted", "to", "result", "in", "exon", "skipping", "in", "the", "mRNA", "encoded", "from", "the", "mutant", "allele", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "data", "suggest", "that", "Kniest", "dysplasia", "results", "from", "shorter", "type", "II", "collagen", "monomers", ",", "and", "support", "the", "hypothesis", "that", "alteration", "of", "a", "specific", "COL2A1", "domain", ",", "which", "may", "span", "from", "exons", "12", "to", "24", ",", "leads", "to", "the", "Kniest", "dysplasia", "phenotype", ".", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O" ]

[ "Classical", "galactosemia", "and", "mutations", "at", "the", "galactose", "-", "1", "-", "phosphate", "uridyl", "transferase", "(", "GALT", ")", "gene", "." ]

[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Classical", "galactosemia", "is", "caused", "by", "a", "deficiency", "in", "activity", "of", "the", "enzyme", "galactose", "-", "1", "-", "phosphate", "uridyl", "transferase", "(", "GALT", ")", ",", "which", ",", "in", "turn", ",", "is", "caused", "by", "mutations", "at", "the", "GALT", "gene", "." ]

[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "disorder", "exhibits", "considerable", "allelic", "heterogeneity", "and", ",", "at", "the", "end", "of", "1998", ",", "more", "than", "150", "different", "base", "changes", "were", "recorded", "in", "24", "different", "populations", "and", "ethnic", "groups", "in", "15", "countries", "worldwide", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "mutations", "most", "frequently", "cited", "are", "Q188R", ",", "K285N", ",", "S135L", ",", "and", "N314D", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Q188R", "is", "the", "most", "common", "mutation", "in", "European", "populations", "or", "in", "those", "predominantly", "of", "European", "descent", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Overall", ",", "it", "accounts", "for", "60", "-", "70", "%", "of", "mutant", "chromosomes", ",", "but", "there", "are", "significant", "differences", "in", "its", "relative", "frequency", "in", "individual", "populations", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Individuals", "homoallelic", "for", "Q188R", "tend", "to", "have", "a", "severe", "phenotype", "and", "this", "is", "in", "keeping", "with", "the", "virtually", "complete", "loss", "of", "enzyme", "activity", "observed", "in", "in", "vitro", "expression", "systems", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Globally", ",", "K285N", "is", "rarer", ",", "but", "in", "many", "European", "populations", "it", "can", "be", "found", "on", "25", "-", "40", "%", "of", "mutant", "chromosomes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "It", "is", "invariably", "associated", "with", "a", "severe", "phenotype", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "S135L", "is", "found", "almost", "exclusively", "in", "African", "Americans", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "vitro", "expression", "results", "are", "discrepant", ",", "but", "some", "individuals", "carrying", "S135L", "appear", "to", "exhibit", "GALT", "activity", "in", "some", "tissues", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Duarte", "1", "(", "or", "Los", "Angeles", ")", "and", "Duarte", "2", "(", "or", "Duarte", ")", "variants", "carry", "the", "same", "amino", "acid", "substitution", ",", "N314D", ",", "even", "though", "D1", "is", "associated", "with", "increased", "erythrocyte", "GALT", "activity", "and", "D2", "with", "reduced", "activity", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "N314D", "is", "in", "linkage", "disequilibrium", "with", "other", "base", "changes", "that", "differ", "on", "the", "D1", "and", "D2", "alleles", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "N314D", "does", "not", "impair", "GALT", "activity", "in", "in", "vitro", "expression", "systems", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "However", ",", "there", "are", "differences", "in", "the", "abundance", "of", "GALT", "protein", "in", "lymphoblastoid", "cells", "lines", "from", "D2", "and", "D1", "individuals", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "It", "is", "unclear", "whether", "the", "specific", "molecular", "changes", "that", "distinguish", "the", "D1", "and", "D2", "alleles", "account", "for", "the", "different", "activities", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "considerable", "genetic", "heterogeneity", "documented", "to", "date", "undoubtedly", "contributes", "to", "the", "phenotypic", "heterogeneity", "that", "is", "observed", "in", "galactosemia", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O" ]

[ "The", "additional", "effects", "of", "nonallelic", "variation", "and", "other", "constitutional", "factors", "on", "phenotypic", "variability", "remain", "to", "be", "elucidated", ".", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Mutations", "of", "the", "VHL", "gene", "in", "sporadic", "renal", "cell", "carcinoma", ":", "definition", "of", "a", "risk", "factor", "for", "VHL", "patients", "to", "develop", "an", "RCC", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O" ]

[ "To", "investigate", "the", "nature", "of", "somatic", "von", "Hippel", "-", "Lindau", "(", "VHL", ")", "mutations", ",", "we", "analyzed", "173", "primary", "sporadic", "human", "renal", "cell", "carcinomas", "for", "mutations", "of", "the", "VHL", "tumor", "suppressor", "gene", ",", "using", "polymerase", "chain", "reaction", "(", "PCR", ")", "and", "single", "-", "strand", "conformational", "polymorphism", "analysis", "(", "SSCP", ")", "of", "DNA", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "detected", "abnormal", "SSCP", "pattern", "in", "73", "samples", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "After", "sequencing", ",", "we", "identified", "microdeletions", "in", "58", "%", "of", "cases", ",", "microinsertions", "in", "17", "%", ",", "nonsense", "mutations", "in", "8", "%", ",", "and", "missense", "mutations", "in", "17", "%", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Among", "these", "mutations", ",", "50", "%", "correspond", "to", "new", "mutations", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "VHL", "mutations", "were", "found", "only", "in", "the", "nonpapillary", "renal", "cell", "carcinoma", "(", "RCC", ")", "subtype", ",", "as", "previously", "reported", "." ]

[ "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "To", "compare", "somatic", "and", "germline", "mutations", ",", "we", "used", "the", "VHL", "database", ",", "which", "includes", "507", "mutations", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "study", "of", "mutational", "events", "revealed", "a", "significant", "difference", "between", "somatic", "and", "germline", "mutations", "with", "mutations", "leading", "to", "truncated", "proteins", "observed", "in", "78", "%", "of", "somatic", "mutations", "vs", "only", "37", "%", "in", "germline", "mutations", "(", "P", "<", "0", ".", "001", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "postulated", "that", "a", "specific", "pattern", "of", "VHL", "mutations", "is", "associated", "with", "sporadic", "RCC", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]

[ "This", "pattern", "corresponds", "to", "mutations", "leading", "mainly", "to", "truncated", "proteins", "with", "few", "specific", "missense", "mutations", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "then", "analyzed", "the", "occurrence", "of", "RCC", "in", "VHL", "families", ",", "based", "on", "the", "nature", "of", "mutations", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "observed", "RCC", "in", "at", "least", "one", "member", "of", "the", "VHL", "families", "in", "77", "%", "of", "cases", "with", "mutations", "leading", "to", "truncated", "proteins", "versus", "55", "%", "in", "cases", "with", "missense", "mutations", "(", "P", "<", "0", ".", "05", ")", "." ]

[ "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Thus", ",", "mutations", "resulting", "in", "truncated", "proteins", "may", "lead", "to", "a", "higher", "risk", "of", "RCC", "in", "VHL", "patients" ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O" ]

[ "Defective", "CTLA", "-", "4", "cycling", "pathway", "in", "Chediak", "-", "Higashi", "syndrome", ":", "a", "possible", "mechanism", "for", "deregulation", "of", "T", "lymphocyte", "activation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]