disi-unibo-nlp/ncbi · Datasets at Hugging Face

tokens listlengths 2 123	ner_tags listlengths 2 123
[ "Our", "results", "support", "linkage", "of", "vWS", "within", "a", "region", "of", "tightly", "linked", "markers", "and", "do", "not", "favour", "locus", "heterogeneity", "of", "the", "disease", "trait", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Null", "mutation", "of", "the", "murine", "ATP7B", "(", "Wilson", "disease", ")", "gene", "results", "in", "intracellular", "copper", "accumulation", "and", "late", "-", "onset", "hepatic", "nodular", "transformation", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]
[ "The", "Atp7b", "protein", "is", "a", "copper", "-", "transporting", "ATPase", "expressed", "predominantly", "in", "the", "liver", "and", "to", "a", "lesser", "extent", "in", "most", "other", "tissues", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Mutations", "in", "the", "ATP7B", "gene", "lead", "to", "Wilson", "disease", ",", "a", "copper", "toxicity", "disorder", "characterized", "by", "dramatic", "build", "-", "up", "of", "intracellular", "hepatic", "copper", "with", "subsequent", "hepatic", "and", "neuro", "-", "logical", "abnormalities", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]
[ "Using", "homologous", "recombination", "to", "disrupt", "the", "normal", "translation", "of", "ATP7B", ",", "we", "have", "generated", "a", "strain", "of", "mice", "that", "are", "homozygous", "mutants", "(", "null", ")", "for", "the", "Wilson", "disease", "gene", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O" ]
[ "The", "ATP7B", "null", "mice", "display", "a", "gradual", "accumulation", "of", "hepatic", "copper", "that", "increases", "to", "a", "level", "60", "-", "fold", "greater", "than", "normal", "by", "5", "months", "of", "age", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "An", "increase", "in", "copper", "concentration", "was", "also", "observed", "in", "the", "kidney", ",", "brain", ",", "placenta", "and", "lactating", "mammary", "glands", "of", "homo", "-", "zygous", "mutants", ",", "although", "milk", "from", "the", "mutant", "glands", "was", "copper", "deficient", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]
[ "Morphological", "abnormalities", "resembling", "cirrhosis", "developed", "in", "the", "majority", "of", "the", "livers", "from", "homozygous", "mutants", "older", "than", "7", "months", "of", "age", "." ]	[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Progeny", "of", "the", "homozygous", "mutant", "females", "demonstrated", "neurological", "abnormalities", "and", "growth", "retardation", "characteristic", "of", "copper", "deficiency", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]
[ "Copper", "concentration", "in", "the", "livers", "of", "the", "newborn", "homozygous", "null", "mutants", "was", "decreased", "dramatically", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "summary", ",", "inactivation", "of", "the", "murine", "ATP7B", "gene", "produces", "a", "form", "of", "cirrhotic", "liver", "disease", "that", "resembles", "Wilson", "disease", "in", "humans", "and", "the", "toxic", "milk", "phenotype", "in", "the", "mouse", ".", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "French", "Machado", "-", "Joseph", "disease", "patients", "do", "not", "exhibit", "gametic", "segregation", "distortion", ":", "a", "sperm", "typing", "analysis", "." ]	[ "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Segregation", "distortion", "has", "been", "reported", "to", "occur", "in", "a", "number", "of", "the", "trinucleotide", "repeat", "disorders", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]
[ "On", "the", "basis", "of", "a", "sperm", "typing", "study", "performed", "in", "patients", "of", "Japanese", "descent", "with", "Machado", "-", "Joseph", "disease", "(", "MJD", ")", ",", "it", "was", "reported", "that", "disease", "alleles", "are", "preferentially", "transmitted", "during", "meiosis", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "performed", "a", "sperm", "typing", "study", "of", "five", "MJD", "patients", "of", "French", "descent", "and", "analysis", "of", "the", "pooled", "data", "shows", "a", "ratio", "of", "mutant", "to", "normal", "alleles", "of", "379", "436", "(", "46", ".", "5", "53", ".", "5", "%", ")", ",", "which", "does", "not", "support", "meiotic", "segregation", "distortion", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "To", "confirm", "these", "results", ",", "sperm", "typing", "analysis", "was", "also", "performed", "using", "a", "polymorphic", "marker", ",", "D14S1050", ",", "closely", "linked", "to", "the", "MJD1", "gene", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Among", "910", "sperm", "analyzed", ",", "the", "allele", "linked", "to", "the", "disease", "chromosome", "was", "detected", "in", "50", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "3", "%", "of", "the", "samples", "and", "the", "allele", "linked", "to", "the", "normal", "chromosome", "was", "found", "in", "49", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "6", "%", "of", "the", "sperm", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "difference", "in", "frequency", "of", "these", "two", "alleles", "is", "not", "significant", "(", "P", "=", "0", ".", "8423", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Likelihood", "-", "based", "analysis", "of", "segregation", "distortion", "in", "the", "single", "sperm", "data", "using", "the", "SPERMSEG", "program", "also", "showed", "no", "support", "for", "segregation", "distortion", "at", "the", "gamete", "level", "in", "this", "patient", "population", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "previous", "report", "on", "the", "Japanese", "patients", "also", "suggested", "that", "disease", "allele", "stability", "may", "be", "influenced", "by", "a", "trans", "effect", "of", "an", "intragenic", "polymorphism", "(", "987", "G", "/", "C", ")", "in", "the", "wild", "-", "type", "allele", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "All", "of", "the", "French", "patients", "were", "heterozygous", "for", "this", "polymorphism", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "However", ",", "analysis", "of", "the", "variance", "in", "repeat", "number", "in", "sperm", "from", "the", "French", "MJD", "patients", "overlapped", "significantly", "with", "the", "variance", "in", "repeat", "number", "observed", "in", "the", "C", "/", "C", "homozygous", "Japanese", "patients", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Missense", "mutation", "in", "the", "alternative", "splice", "region", "of", "the", "PAX6", "gene", "in", "eye", "anomalies", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]
[ "The", "PAX6", "gene", "is", "involved", "in", "ocular", "morphogenesis", ",", "and", "PAX6", "mutations", "have", "been", "detected", "in", "various", "types", "of", "ocular", "anomalies", ",", "including", "aniridia", ",", "Peters", "anomaly", ",", "corneal", "dystrophy", ",", "congenital", "cataract", ",", "and", "foveal", "hypoplasia", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]
[ "The", "gene", "encodes", "a", "transcriptional", "regulator", "that", "recognizes", "target", "genes", "through", "its", "paired", "-", "type", "DNA", "-", "binding", "domain", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "paired", "domain", "is", "composed", "of", "two", "distinct", "DNA", "-", "binding", "subdomains", ",", "the", "N", "-", "terminal", "subdomain", "(", "NTS", ")", "and", "the", "C", "-", "terminal", "subdomain", "(", "CTS", ")", ",", "which", "bind", "respective", "consensus", "DNA", "sequences", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "human", "PAX6", "gene", "produces", "two", "alternative", "splice", "isoforms", "that", "have", "the", "distinct", "structure", "of", "the", "paired", "domain", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "insertion", ",", "into", "the", "NTS", ",", "of", "14", "additional", "amino", "acids", "encoded", "by", "exon", "5a", "abolishes", "the", "DNA", "-", "binding", "activity", "of", "the", "NTS", "and", "unmasks", "the", "DNA", "-", "binding", "ability", "of", "the", "CTS", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Thus", ",", "exon", "5a", "appears", "to", "function", "as", "a", "molecular", "switch", "that", "specifies", "target", "genes", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "ascertained", "a", "novel", "missense", "mutation", "in", "four", "pedigrees", "with", "Peters", "anomaly", ",", "congenital", "cataract", ",", "Axenfeldt", "anomaly", ",", "and", "/", "or", "foveal", "hypoplasia", ",", "which", ",", "to", "our", "knowledge", ",", "is", "the", "first", "mutation", "identified", "in", "the", "splice", "-", "variant", "region", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "A", "T", "-", "-", ">", "A", "transition", "at", "the", "20th", "nucleotide", "position", "of", "exon", "5a", "results", "in", "a", "Val", "-", "-", ">", "Asp", "(", "GTC", "-", "-", ">", "GAC", ")", "substitution", "at", "the", "7th", "codon", "of", "the", "alternative", "splice", "region", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Functional", "analyses", "demonstrated", "that", "the", "V54D", "mutation", "slightly", "increased", "NTS", "binding", "and", "decreased", "CTS", "transactivation", "activity", "to", "almost", "half", ".", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Penetrances", "of", "BRCA1", "1675delA", "and", "1135insA", "with", "respect", "to", "breast", "cancer", "and", "ovarian", "cancer", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]
[ "For", "genetic", "counseling", "and", "predictive", "testing", "in", "families", "with", "inherited", "breast", "-", "ovarian", "cancer", ",", "penetrances", "and", "expressions", "of", "the", "underlying", "mutations", "should", "be", "known", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "have", "previously", "reported", "two", "BRCA1", "founder", "mutations", "in", "the", "Norwegian", "population", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Index", "cases", "for", "the", "present", "study", "were", "found", "two", "different", "ways", "through", "a", "series", "of", "consecutive", "ovarian", "cancers", "(", "n", "=", "16", ")", "and", "through", "our", "family", "cancer", "clinic", "(", "n", "=", "14", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Altogether", ",", "20", "of", "the", "patients", "had", "BRCA1", "1675delA", ",", "and", "10", "had", "1135insA", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Their", "relatives", "were", "described", "with", "respect", "to", "absence", "/", "presence", "of", "breast", "and", "/", "or", "ovarian", "cancer", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]
[ "Of", "133", "living", "female", "relatives", ",", "83", "(", "62", "%", ")", "were", "tested", "for", "the", "presence", "of", "a", "mutation", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "No", "difference", ",", "in", "penetrance", "and", "expression", ",", "between", "the", "two", "mutations", "were", "found", ",", "whereas", "differences", "according", "to", "method", "of", "ascertainment", "were", "seen", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "overall", "findings", "were", "that", "disease", "started", "to", "occur", "at", "age", "30", "years", "and", "that", "by", "age", "50", "years", "48", "%", "of", "the", "mutation", "-", "carrying", "women", "had", "experienced", "breast", "and", "/", "or", "ovarian", "cancer", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]
[ "More", "ovarian", "cancers", "than", "breast", "cancers", "were", "recorded", "." ]	[ "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O" ]
[ "Both", "penetrance", "and", "expression", "(", "breast", "cancer", "vs", ".", "ovarian", "cancer", ")", "were", "different", "from", "those", "in", "reports", "of", "the", "Ashkenazi", "founder", "mutations", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Whether", "the", "reported", "differences", "reflect", "true", "differences", "and", "/", "or", "methodological", "problems", "is", "discussed", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "An", "observed", "excess", "of", "mutation", "carriers", "could", "not", "be", "accounted", "for", "by", "methodological", "problems", ";", "possible", "explanations", "were", "a", "\"", "true", "\"", "low", "penetrance", "or", "preferential", "segregation", ".", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "dermatofibrosarcoma", "protuberans", "-", "associated", "collagen", "type", "Ialpha1", "/", "platelet", "-", "derived", "growth", "factor", "(", "PDGF", ")", "B", "-", "chain", "fusion", "gene", "generates", "a", "transforming", "protein", "that", "is", "processed", "to", "functional", "PDGF", "-", "BB", "." ]	[ "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Dermatofibrosarcoma", "protuberans", "(", "DFSP", ")", "displays", "chromosomal", "rearrangements", "involving", "chromosome", "17", "and", "22", ",", "which", "fuse", "the", "collagen", "type", "Ialpha1", "(", "COLIA1", ")", "gene", "to", "the", "platelet", "-", "derived", "growth", "factor", "(", "PDGF", ")", "B", "-", "chain", "(", "PDGFB", ")", "gene", "." ]	[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "To", "characterize", "the", "functional", "and", "structural", "properties", "of", "the", "COLIA1", "/", "PDGFB", "fusion", "protein", ",", "we", "generated", "a", "stable", "NIH3T3", "cell", "line", "that", "contained", "a", "tumor", "-", "derived", "chimeric", "gene", "resulting", "from", "a", "COIA1", "intron", "7", "-", "PDGFB", "intron", "1", "fusion", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Expression", "of", "the", "fusion", "protein", "led", "to", "morphological", "transformation", "and", "increased", "growth", "rate", "of", "these", "cells", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "PDGF", "receptor", "kinase", "inhibitor", "CGP57148B", "reversed", "the", "transformed", "phenotype", "and", "reduced", "the", "growth", "rate", "of", "COLIA1", "/", "PDGFB", "-", "expressing", "cells", "but", "had", "no", "effects", "on", "control", "cells", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "presence", "of", "dimeric", "COLIA1", "/", "PDGFB", "precursors", "was", "demonstrated", "through", "PDGFB", "immunoprecipitations", "of", "metabolically", "labeled", "cells", "and", "also", "by", "PDGFB", "immunoprecipitations", "followed", "by", "immunoblotting", "with", "COLIA1", "antibodies", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Pulse", "-", "chase", "studies", "demonstrated", "that", "the", "COLIA1", "/", "PDGFB", "precursor", "was", "processed", "to", "an", "end", "product", "that", "was", "indistinguishable", "from", "wild", "-", "type", "PDGF", "-", "BB", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Finally", ",", "COLIA1", "/", "PDGFB", "-", "expressing", "cells", "generated", "tumors", "after", "s", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O" ]
[ "c", "c", ".", "injection", "into", "nude", "mice", ",", "and", "tumor", "growth", "was", "reduced", "by", "treatment", "with", "CGP57148B", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "conclude", "that", "the", "COLIA1", "/", "PDGFB", "fusion", "associated", "with", "DFSP", "contributes", "to", "tumor", "development", "through", "ectopic", "production", "of", "PDGF", "-", "BB", "and", "the", "formation", "of", "an", "autocrine", "loop", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Our", "findings", ",", "thus", ",", "suggest", "that", "PDGF", "receptors", "could", "be", "a", "target", "for", "pharmacological", "treatment", "of", "DFSP", "and", "giant", "cell", "fibroblastoma", ",", "e", ".", "g", ".", ",", "through", "the", "use", "of", "PDGF", "receptor", "kinase", "inhibitors", "such", "as", "CGP57148B", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Identification", "of", "a", "common", "PEX1", "mutation", "in", "Zellweger", "syndrome", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]
[ "The", "Zellweger", "spectrum", "of", "disease", ",", "encompassing", "Zellweger", "syndrome", "and", "the", "progressively", "milder", "phenotypes", "of", "neonatal", "adrenoleukodystrophy", "and", "infantile", "Refsum", "disease", ",", "is", "due", "to", "a", "failure", "to", "form", "functional", "peroxisomes", "." ]	[ "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Cell", "fusion", "complementation", "studies", "demonstrated", "that", "these", "diseases", "are", "genetically", "heterogeneous", ",", "with", "two", "-", "thirds", "of", "all", "patients", "lying", "within", "a", "single", "complementation", "group", ",", "CG1", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Molecular", "genetic", "and", "cell", "biology", "studies", "have", "shown", "that", "PEX1", "is", "deficient", "in", "many", "CG1", "patients", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "However", ",", "previous", "studies", "have", "focused", "on", "mildly", "affected", "patients", "and", "there", "is", "still", "no", "report", "of", "two", "mutant", "PEX1", "alleles", "in", "any", "Zellweger", "syndrome", "patient", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O" ]
[ "Furthermore", ",", "mutations", "in", "the", "PMP70", "gene", "have", "also", "been", "identified", "in", "two", "Zellweger", "syndrome", "patients", "from", "CG1", ",", "raising", "the", "possibility", "that", "CG1", "patients", "may", "represent", "a", "mixture", "of", "PEX1", "-", "deficient", "and", "PMP70", "-", "deficient", "individuals", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "To", "address", "the", "molecular", "basis", "of", "disease", "in", "Zellweger", "syndrome", "patients", "from", "CG1", ",", "we", "examined", "all", "24", "PEX1", "exons", "in", "four", "patients", ",", "including", "both", "patients", "that", "have", "mutations", "in", "PMP70", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "PEX1", "mutations", "were", "detected", "in", "all", "four", "patients", ",", "including", "a", "1", "-", "bp", "insertion", "(", "c", ".", "2097insT", ")", "in", "exon", "13", "that", "was", "present", "in", "three", "of", "the", "four", "patients", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Subsequent", "studies", "demonstrated", "that", "this", "mutation", "is", "present", "in", "one", "-", "half", "of", "all", "CG1", "patients", "and", "correlates", "with", "the", "Zellweger", "syndrome", "phenotype", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O" ]
[ "As", "this", "mutation", "leads", "to", "a", "loss", "of", "protein", "function", "its", "frequency", "makes", "it", "the", "most", "common", "cause", "of", "Zellweger", "syndrome", ",", "helping", "to", "explain", "the", "high", "percentage", "of", "patients", "that", "belong", "to", "CG1", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Novel", "mutations", "in", "the", "Wiskott", "-", "Aldrich", "syndrome", "protein", "gene", "and", "their", "effects", "on", "transcriptional", ",", "translational", ",", "and", "clinical", "phenotypes", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Wiskott", "-", "Aldrich", "syndrome", "(", "WAS", ")", "is", "an", "X", "-", "linked", "recessive", "immunodeficiency", "characterized", "by", "thrombocytopenia", ",", "eczema", ",", "and", "recurrent", "infections", ",", "and", "caused", "by", "mutations", "in", "the", "WAS", "protein", "(", "WASP", ")", "gene", "." ]	[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "WASP", "contains", "several", "functional", "domains", "through", "which", "it", "interacts", "with", "proteins", "involved", "in", "intracellular", "signaling", "and", "regulation", "of", "the", "actin", "cytoskeleton", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "this", "report", ",", "17", "WASP", "gene", "mutations", "were", "identified", ",", "12", "of", "which", "are", "novel", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "DNA", "of", "affected", "males", "and", "obligate", "carriers", "was", "PCR", "amplified", "and", "analyzed", "by", "SSCA", ",", "heteroduplex", "analysis", ",", "and", "direct", "sequencing", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "effects", "of", "the", "mutations", "at", "the", "mRNA", "and", "protein", "level", "were", "ascertained", "by", "RT", "-", "PCR", "and", "Western", "blot", "analyses", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "All", "missense", "mutations", "were", "located", "in", "exons", "1", "-", "4", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Most", "of", "the", "nonsense", ",", "frameshift", "and", "splice", "site", "mutations", "were", "found", "in", "exons", "6", "-", "11", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Mutations", "that", "alter", "splice", "sites", "led", "to", "the", "synthesis", "of", "several", "types", "of", "mRNAs", ",", "a", "fraction", "of", "which", "represented", "the", "normally", "spliced", "product", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "presence", "of", "normally", "spliced", "transcripts", "was", "correlated", "with", "a", "milder", "phenotype", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "When", "one", "such", "case", "was", "studied", "by", "Western", "blotting", ",", "reduced", "amounts", "of", "normal", "-", "size", "WASP", "were", "present", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "other", "cases", "as", "well", ",", "a", "correlation", "was", "found", "between", "the", "amount", "of", "normal", "or", "mutant", "WASP", "present", "and", "the", "phenotypes", "of", "the", "affected", "individuals", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "No", "protein", "was", "detected", "in", "two", "individuals", "with", "severe", "WAS", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O" ]
[ "Reduced", "levels", "of", "a", "normal", "-", "size", "WASP", "with", "a", "missense", "mutation", "were", "seen", "in", "two", "individuals", "with", "XLT", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O" ]
[ "It", "is", "concluded", "that", "mutation", "analysis", "at", "the", "DNA", "level", "is", "not", "sufficient", "for", "predicting", "clinical", "course", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Studies", "at", "the", "transcript", "and", "protein", "level", "are", "needed", "for", "a", "better", "assessment", ".", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Aminoglycoside", "antibiotics", "restore", "dystrophin", "function", "to", "skeletal", "muscles", "of", "mdx", "mice", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Duchenne", "muscular", "dystrophy", "(", "DMD", ")", "is", "caused", "by", "mutations", "in", "the", "dystrophin", "gene", ",", "leading", "to", "the", "absence", "of", "the", "dystrophin", "protein", "in", "striated", "muscle", "." ]	[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "A", "significant", "number", "of", "these", "mutations", "are", "premature", "stop", "codons", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "On", "the", "basis", "of", "the", "observation", "that", "aminoglycoside", "treatment", "can", "suppress", "stop", "codons", "in", "cultured", "cells", ",", "we", "tested", "the", "effect", "of", "gentamicin", "on", "cultured", "muscle", "cells", "from", "the", "mdx", "mouse", "-", "an", "animal", "model", "for", "DMD", "that", "possesses", "a", "premature", "stop", "codon", "in", "the", "dystrophin", "gene", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Exposure", "of", "mdx", "myotubes", "to", "gentamicin", "led", "to", "the", "expression", "and", "localization", "of", "dystrophin", "to", "the", "cell", "membrane", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "then", "evaluated", "the", "effects", "of", "differing", "dosages", "of", "gentamicin", "on", "expression", "and", "functional", "protection", "of", "the", "muscles", "of", "mdx", "mice", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "identified", "a", "treatment", "regimen", "that", "resulted", "in", "the", "presence", "of", "dystrophin", "in", "the", "cell", "membrane", "in", "all", "striated", "muscles", "examined", "and", "that", "provided", "functional", "protection", "against", "muscular", "injury", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]
[ "To", "our", "knowledge", ",", "our", "results", "are", "the", "first", "to", "demonstrate", "that", "aminoglycosides", "can", "suppress", "stop", "codons", "not", "only", "in", "vitro", "but", "also", "in", "vivo", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Furthermore", ",", "these", "results", "raise", "the", "possibility", "of", "a", "novel", "treatment", "regimen", "for", "muscular", "dystrophy", "and", "other", "diseases", "caused", "by", "premature", "stop", "codon", "mutations", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "treatment", "could", "prove", "effective", "in", "up", "to", "15", "%", "of", "patients", "with", "DMD", ".", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O" ]
[ "Loss", "of", "the", "ataxia", "-", "telangiectasia", "gene", "product", "causes", "oxidative", "damage", "in", "target", "organs", "." ]	[ "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Ataxia", "-", "telangiectasia", "(", "A", "-", "T", ")", "is", "characterized", "by", "a", "markedly", "increased", "sensitivity", "to", "ionizing", "radiation", ",", "increased", "incidence", "of", "cancer", ",", "and", "neurodegeneration", ",", "especially", "of", "the", "cerebellar", "Purkinje", "cells", "." ]	[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Ionizing", "radiation", "oxidizes", "macromolecules", "and", "causes", "tissue", "damage", "through", "the", "generation", "of", "reactive", "oxygen", "species", "(", "ROS", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "therefore", "hypothesized", "that", "A", "-", "T", "is", "due", "to", "oxidative", "damage", "resulting", "from", "loss", "of", "function", "of", "the", "A", "-", "T", "gene", "product", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O" ]
[ "To", "assess", "this", "hypothesis", ",", "we", "employed", "an", "animal", "model", "of", "A", "-", "T", ",", "the", "mouse", "with", "a", "disrupted", "Atm", "gene", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "show", "that", "organs", "which", "develop", "pathologic", "changes", "in", "the", "Atm", "-", "deficient", "mice", "are", "targets", "of", "oxidative", "damage", ",", "and", "that", "cerebellar", "Purkinje", "cells", "are", "particularly", "affected", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Our", "results", "support", "linkage", "of", "vWS", "within", "a", "region", "of", "tightly", "linked", "markers", "and", "do", "not", "favour", "locus", "heterogeneity", "of", "the", "disease", "trait", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Null", "mutation", "of", "the", "murine", "ATP7B", "(", "Wilson", "disease", ")", "gene", "results", "in", "intracellular", "copper", "accumulation", "and", "late", "-", "onset", "hepatic", "nodular", "transformation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]

[ "The", "Atp7b", "protein", "is", "a", "copper", "-", "transporting", "ATPase", "expressed", "predominantly", "in", "the", "liver", "and", "to", "a", "lesser", "extent", "in", "most", "other", "tissues", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Mutations", "in", "the", "ATP7B", "gene", "lead", "to", "Wilson", "disease", ",", "a", "copper", "toxicity", "disorder", "characterized", "by", "dramatic", "build", "-", "up", "of", "intracellular", "hepatic", "copper", "with", "subsequent", "hepatic", "and", "neuro", "-", "logical", "abnormalities", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]

[ "Using", "homologous", "recombination", "to", "disrupt", "the", "normal", "translation", "of", "ATP7B", ",", "we", "have", "generated", "a", "strain", "of", "mice", "that", "are", "homozygous", "mutants", "(", "null", ")", "for", "the", "Wilson", "disease", "gene", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O" ]

[ "The", "ATP7B", "null", "mice", "display", "a", "gradual", "accumulation", "of", "hepatic", "copper", "that", "increases", "to", "a", "level", "60", "-", "fold", "greater", "than", "normal", "by", "5", "months", "of", "age", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "An", "increase", "in", "copper", "concentration", "was", "also", "observed", "in", "the", "kidney", ",", "brain", ",", "placenta", "and", "lactating", "mammary", "glands", "of", "homo", "-", "zygous", "mutants", ",", "although", "milk", "from", "the", "mutant", "glands", "was", "copper", "deficient", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]

[ "Morphological", "abnormalities", "resembling", "cirrhosis", "developed", "in", "the", "majority", "of", "the", "livers", "from", "homozygous", "mutants", "older", "than", "7", "months", "of", "age", "." ]

[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Progeny", "of", "the", "homozygous", "mutant", "females", "demonstrated", "neurological", "abnormalities", "and", "growth", "retardation", "characteristic", "of", "copper", "deficiency", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]

[ "Copper", "concentration", "in", "the", "livers", "of", "the", "newborn", "homozygous", "null", "mutants", "was", "decreased", "dramatically", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "summary", ",", "inactivation", "of", "the", "murine", "ATP7B", "gene", "produces", "a", "form", "of", "cirrhotic", "liver", "disease", "that", "resembles", "Wilson", "disease", "in", "humans", "and", "the", "toxic", "milk", "phenotype", "in", "the", "mouse", ".", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "French", "Machado", "-", "Joseph", "disease", "patients", "do", "not", "exhibit", "gametic", "segregation", "distortion", ":", "a", "sperm", "typing", "analysis", "." ]

[ "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Segregation", "distortion", "has", "been", "reported", "to", "occur", "in", "a", "number", "of", "the", "trinucleotide", "repeat", "disorders", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]

[ "On", "the", "basis", "of", "a", "sperm", "typing", "study", "performed", "in", "patients", "of", "Japanese", "descent", "with", "Machado", "-", "Joseph", "disease", "(", "MJD", ")", ",", "it", "was", "reported", "that", "disease", "alleles", "are", "preferentially", "transmitted", "during", "meiosis", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "performed", "a", "sperm", "typing", "study", "of", "five", "MJD", "patients", "of", "French", "descent", "and", "analysis", "of", "the", "pooled", "data", "shows", "a", "ratio", "of", "mutant", "to", "normal", "alleles", "of", "379", "436", "(", "46", ".", "5", "53", ".", "5", "%", ")", ",", "which", "does", "not", "support", "meiotic", "segregation", "distortion", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "To", "confirm", "these", "results", ",", "sperm", "typing", "analysis", "was", "also", "performed", "using", "a", "polymorphic", "marker", ",", "D14S1050", ",", "closely", "linked", "to", "the", "MJD1", "gene", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Among", "910", "sperm", "analyzed", ",", "the", "allele", "linked", "to", "the", "disease", "chromosome", "was", "detected", "in", "50", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "3", "%", "of", "the", "samples", "and", "the", "allele", "linked", "to", "the", "normal", "chromosome", "was", "found", "in", "49", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "6", "%", "of", "the", "sperm", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "difference", "in", "frequency", "of", "these", "two", "alleles", "is", "not", "significant", "(", "P", "=", "0", ".", "8423", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Likelihood", "-", "based", "analysis", "of", "segregation", "distortion", "in", "the", "single", "sperm", "data", "using", "the", "SPERMSEG", "program", "also", "showed", "no", "support", "for", "segregation", "distortion", "at", "the", "gamete", "level", "in", "this", "patient", "population", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "previous", "report", "on", "the", "Japanese", "patients", "also", "suggested", "that", "disease", "allele", "stability", "may", "be", "influenced", "by", "a", "trans", "effect", "of", "an", "intragenic", "polymorphism", "(", "987", "G", "/", "C", ")", "in", "the", "wild", "-", "type", "allele", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "All", "of", "the", "French", "patients", "were", "heterozygous", "for", "this", "polymorphism", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "However", ",", "analysis", "of", "the", "variance", "in", "repeat", "number", "in", "sperm", "from", "the", "French", "MJD", "patients", "overlapped", "significantly", "with", "the", "variance", "in", "repeat", "number", "observed", "in", "the", "C", "/", "C", "homozygous", "Japanese", "patients", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Missense", "mutation", "in", "the", "alternative", "splice", "region", "of", "the", "PAX6", "gene", "in", "eye", "anomalies", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]

[ "The", "PAX6", "gene", "is", "involved", "in", "ocular", "morphogenesis", ",", "and", "PAX6", "mutations", "have", "been", "detected", "in", "various", "types", "of", "ocular", "anomalies", ",", "including", "aniridia", ",", "Peters", "anomaly", ",", "corneal", "dystrophy", ",", "congenital", "cataract", ",", "and", "foveal", "hypoplasia", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]

[ "The", "gene", "encodes", "a", "transcriptional", "regulator", "that", "recognizes", "target", "genes", "through", "its", "paired", "-", "type", "DNA", "-", "binding", "domain", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "paired", "domain", "is", "composed", "of", "two", "distinct", "DNA", "-", "binding", "subdomains", ",", "the", "N", "-", "terminal", "subdomain", "(", "NTS", ")", "and", "the", "C", "-", "terminal", "subdomain", "(", "CTS", ")", ",", "which", "bind", "respective", "consensus", "DNA", "sequences", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "human", "PAX6", "gene", "produces", "two", "alternative", "splice", "isoforms", "that", "have", "the", "distinct", "structure", "of", "the", "paired", "domain", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "insertion", ",", "into", "the", "NTS", ",", "of", "14", "additional", "amino", "acids", "encoded", "by", "exon", "5a", "abolishes", "the", "DNA", "-", "binding", "activity", "of", "the", "NTS", "and", "unmasks", "the", "DNA", "-", "binding", "ability", "of", "the", "CTS", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Thus", ",", "exon", "5a", "appears", "to", "function", "as", "a", "molecular", "switch", "that", "specifies", "target", "genes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "ascertained", "a", "novel", "missense", "mutation", "in", "four", "pedigrees", "with", "Peters", "anomaly", ",", "congenital", "cataract", ",", "Axenfeldt", "anomaly", ",", "and", "/", "or", "foveal", "hypoplasia", ",", "which", ",", "to", "our", "knowledge", ",", "is", "the", "first", "mutation", "identified", "in", "the", "splice", "-", "variant", "region", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "A", "T", "-", "-", ">", "A", "transition", "at", "the", "20th", "nucleotide", "position", "of", "exon", "5a", "results", "in", "a", "Val", "-", "-", ">", "Asp", "(", "GTC", "-", "-", ">", "GAC", ")", "substitution", "at", "the", "7th", "codon", "of", "the", "alternative", "splice", "region", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Functional", "analyses", "demonstrated", "that", "the", "V54D", "mutation", "slightly", "increased", "NTS", "binding", "and", "decreased", "CTS", "transactivation", "activity", "to", "almost", "half", ".", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Penetrances", "of", "BRCA1", "1675delA", "and", "1135insA", "with", "respect", "to", "breast", "cancer", "and", "ovarian", "cancer", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]

[ "For", "genetic", "counseling", "and", "predictive", "testing", "in", "families", "with", "inherited", "breast", "-", "ovarian", "cancer", ",", "penetrances", "and", "expressions", "of", "the", "underlying", "mutations", "should", "be", "known", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "have", "previously", "reported", "two", "BRCA1", "founder", "mutations", "in", "the", "Norwegian", "population", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Index", "cases", "for", "the", "present", "study", "were", "found", "two", "different", "ways", "through", "a", "series", "of", "consecutive", "ovarian", "cancers", "(", "n", "=", "16", ")", "and", "through", "our", "family", "cancer", "clinic", "(", "n", "=", "14", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Altogether", ",", "20", "of", "the", "patients", "had", "BRCA1", "1675delA", ",", "and", "10", "had", "1135insA", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Their", "relatives", "were", "described", "with", "respect", "to", "absence", "/", "presence", "of", "breast", "and", "/", "or", "ovarian", "cancer", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]

[ "Of", "133", "living", "female", "relatives", ",", "83", "(", "62", "%", ")", "were", "tested", "for", "the", "presence", "of", "a", "mutation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "No", "difference", ",", "in", "penetrance", "and", "expression", ",", "between", "the", "two", "mutations", "were", "found", ",", "whereas", "differences", "according", "to", "method", "of", "ascertainment", "were", "seen", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "overall", "findings", "were", "that", "disease", "started", "to", "occur", "at", "age", "30", "years", "and", "that", "by", "age", "50", "years", "48", "%", "of", "the", "mutation", "-", "carrying", "women", "had", "experienced", "breast", "and", "/", "or", "ovarian", "cancer", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]

[ "More", "ovarian", "cancers", "than", "breast", "cancers", "were", "recorded", "." ]

[ "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O" ]

[ "Both", "penetrance", "and", "expression", "(", "breast", "cancer", "vs", ".", "ovarian", "cancer", ")", "were", "different", "from", "those", "in", "reports", "of", "the", "Ashkenazi", "founder", "mutations", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Whether", "the", "reported", "differences", "reflect", "true", "differences", "and", "/", "or", "methodological", "problems", "is", "discussed", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "An", "observed", "excess", "of", "mutation", "carriers", "could", "not", "be", "accounted", "for", "by", "methodological", "problems", ";", "possible", "explanations", "were", "a", "\"", "true", "\"", "low", "penetrance", "or", "preferential", "segregation", ".", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "dermatofibrosarcoma", "protuberans", "-", "associated", "collagen", "type", "Ialpha1", "/", "platelet", "-", "derived", "growth", "factor", "(", "PDGF", ")", "B", "-", "chain", "fusion", "gene", "generates", "a", "transforming", "protein", "that", "is", "processed", "to", "functional", "PDGF", "-", "BB", "." ]

[ "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Dermatofibrosarcoma", "protuberans", "(", "DFSP", ")", "displays", "chromosomal", "rearrangements", "involving", "chromosome", "17", "and", "22", ",", "which", "fuse", "the", "collagen", "type", "Ialpha1", "(", "COLIA1", ")", "gene", "to", "the", "platelet", "-", "derived", "growth", "factor", "(", "PDGF", ")", "B", "-", "chain", "(", "PDGFB", ")", "gene", "." ]

[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "To", "characterize", "the", "functional", "and", "structural", "properties", "of", "the", "COLIA1", "/", "PDGFB", "fusion", "protein", ",", "we", "generated", "a", "stable", "NIH3T3", "cell", "line", "that", "contained", "a", "tumor", "-", "derived", "chimeric", "gene", "resulting", "from", "a", "COIA1", "intron", "7", "-", "PDGFB", "intron", "1", "fusion", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Expression", "of", "the", "fusion", "protein", "led", "to", "morphological", "transformation", "and", "increased", "growth", "rate", "of", "these", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "PDGF", "receptor", "kinase", "inhibitor", "CGP57148B", "reversed", "the", "transformed", "phenotype", "and", "reduced", "the", "growth", "rate", "of", "COLIA1", "/", "PDGFB", "-", "expressing", "cells", "but", "had", "no", "effects", "on", "control", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "presence", "of", "dimeric", "COLIA1", "/", "PDGFB", "precursors", "was", "demonstrated", "through", "PDGFB", "immunoprecipitations", "of", "metabolically", "labeled", "cells", "and", "also", "by", "PDGFB", "immunoprecipitations", "followed", "by", "immunoblotting", "with", "COLIA1", "antibodies", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Pulse", "-", "chase", "studies", "demonstrated", "that", "the", "COLIA1", "/", "PDGFB", "precursor", "was", "processed", "to", "an", "end", "product", "that", "was", "indistinguishable", "from", "wild", "-", "type", "PDGF", "-", "BB", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Finally", ",", "COLIA1", "/", "PDGFB", "-", "expressing", "cells", "generated", "tumors", "after", "s", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O" ]

[ "c", "c", ".", "injection", "into", "nude", "mice", ",", "and", "tumor", "growth", "was", "reduced", "by", "treatment", "with", "CGP57148B", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "conclude", "that", "the", "COLIA1", "/", "PDGFB", "fusion", "associated", "with", "DFSP", "contributes", "to", "tumor", "development", "through", "ectopic", "production", "of", "PDGF", "-", "BB", "and", "the", "formation", "of", "an", "autocrine", "loop", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Our", "findings", ",", "thus", ",", "suggest", "that", "PDGF", "receptors", "could", "be", "a", "target", "for", "pharmacological", "treatment", "of", "DFSP", "and", "giant", "cell", "fibroblastoma", ",", "e", ".", "g", ".", ",", "through", "the", "use", "of", "PDGF", "receptor", "kinase", "inhibitors", "such", "as", "CGP57148B", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Identification", "of", "a", "common", "PEX1", "mutation", "in", "Zellweger", "syndrome", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]

[ "The", "Zellweger", "spectrum", "of", "disease", ",", "encompassing", "Zellweger", "syndrome", "and", "the", "progressively", "milder", "phenotypes", "of", "neonatal", "adrenoleukodystrophy", "and", "infantile", "Refsum", "disease", ",", "is", "due", "to", "a", "failure", "to", "form", "functional", "peroxisomes", "." ]

[ "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Cell", "fusion", "complementation", "studies", "demonstrated", "that", "these", "diseases", "are", "genetically", "heterogeneous", ",", "with", "two", "-", "thirds", "of", "all", "patients", "lying", "within", "a", "single", "complementation", "group", ",", "CG1", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Molecular", "genetic", "and", "cell", "biology", "studies", "have", "shown", "that", "PEX1", "is", "deficient", "in", "many", "CG1", "patients", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "However", ",", "previous", "studies", "have", "focused", "on", "mildly", "affected", "patients", "and", "there", "is", "still", "no", "report", "of", "two", "mutant", "PEX1", "alleles", "in", "any", "Zellweger", "syndrome", "patient", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O" ]

[ "Furthermore", ",", "mutations", "in", "the", "PMP70", "gene", "have", "also", "been", "identified", "in", "two", "Zellweger", "syndrome", "patients", "from", "CG1", ",", "raising", "the", "possibility", "that", "CG1", "patients", "may", "represent", "a", "mixture", "of", "PEX1", "-", "deficient", "and", "PMP70", "-", "deficient", "individuals", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "To", "address", "the", "molecular", "basis", "of", "disease", "in", "Zellweger", "syndrome", "patients", "from", "CG1", ",", "we", "examined", "all", "24", "PEX1", "exons", "in", "four", "patients", ",", "including", "both", "patients", "that", "have", "mutations", "in", "PMP70", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "PEX1", "mutations", "were", "detected", "in", "all", "four", "patients", ",", "including", "a", "1", "-", "bp", "insertion", "(", "c", ".", "2097insT", ")", "in", "exon", "13", "that", "was", "present", "in", "three", "of", "the", "four", "patients", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Subsequent", "studies", "demonstrated", "that", "this", "mutation", "is", "present", "in", "one", "-", "half", "of", "all", "CG1", "patients", "and", "correlates", "with", "the", "Zellweger", "syndrome", "phenotype", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O" ]

[ "As", "this", "mutation", "leads", "to", "a", "loss", "of", "protein", "function", "its", "frequency", "makes", "it", "the", "most", "common", "cause", "of", "Zellweger", "syndrome", ",", "helping", "to", "explain", "the", "high", "percentage", "of", "patients", "that", "belong", "to", "CG1", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Novel", "mutations", "in", "the", "Wiskott", "-", "Aldrich", "syndrome", "protein", "gene", "and", "their", "effects", "on", "transcriptional", ",", "translational", ",", "and", "clinical", "phenotypes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Wiskott", "-", "Aldrich", "syndrome", "(", "WAS", ")", "is", "an", "X", "-", "linked", "recessive", "immunodeficiency", "characterized", "by", "thrombocytopenia", ",", "eczema", ",", "and", "recurrent", "infections", ",", "and", "caused", "by", "mutations", "in", "the", "WAS", "protein", "(", "WASP", ")", "gene", "." ]

[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "WASP", "contains", "several", "functional", "domains", "through", "which", "it", "interacts", "with", "proteins", "involved", "in", "intracellular", "signaling", "and", "regulation", "of", "the", "actin", "cytoskeleton", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "this", "report", ",", "17", "WASP", "gene", "mutations", "were", "identified", ",", "12", "of", "which", "are", "novel", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "DNA", "of", "affected", "males", "and", "obligate", "carriers", "was", "PCR", "amplified", "and", "analyzed", "by", "SSCA", ",", "heteroduplex", "analysis", ",", "and", "direct", "sequencing", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "effects", "of", "the", "mutations", "at", "the", "mRNA", "and", "protein", "level", "were", "ascertained", "by", "RT", "-", "PCR", "and", "Western", "blot", "analyses", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "All", "missense", "mutations", "were", "located", "in", "exons", "1", "-", "4", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Most", "of", "the", "nonsense", ",", "frameshift", "and", "splice", "site", "mutations", "were", "found", "in", "exons", "6", "-", "11", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Mutations", "that", "alter", "splice", "sites", "led", "to", "the", "synthesis", "of", "several", "types", "of", "mRNAs", ",", "a", "fraction", "of", "which", "represented", "the", "normally", "spliced", "product", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "presence", "of", "normally", "spliced", "transcripts", "was", "correlated", "with", "a", "milder", "phenotype", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "When", "one", "such", "case", "was", "studied", "by", "Western", "blotting", ",", "reduced", "amounts", "of", "normal", "-", "size", "WASP", "were", "present", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "other", "cases", "as", "well", ",", "a", "correlation", "was", "found", "between", "the", "amount", "of", "normal", "or", "mutant", "WASP", "present", "and", "the", "phenotypes", "of", "the", "affected", "individuals", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "No", "protein", "was", "detected", "in", "two", "individuals", "with", "severe", "WAS", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O" ]

[ "Reduced", "levels", "of", "a", "normal", "-", "size", "WASP", "with", "a", "missense", "mutation", "were", "seen", "in", "two", "individuals", "with", "XLT", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O" ]

[ "It", "is", "concluded", "that", "mutation", "analysis", "at", "the", "DNA", "level", "is", "not", "sufficient", "for", "predicting", "clinical", "course", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Studies", "at", "the", "transcript", "and", "protein", "level", "are", "needed", "for", "a", "better", "assessment", ".", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Aminoglycoside", "antibiotics", "restore", "dystrophin", "function", "to", "skeletal", "muscles", "of", "mdx", "mice", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Duchenne", "muscular", "dystrophy", "(", "DMD", ")", "is", "caused", "by", "mutations", "in", "the", "dystrophin", "gene", ",", "leading", "to", "the", "absence", "of", "the", "dystrophin", "protein", "in", "striated", "muscle", "." ]

[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "A", "significant", "number", "of", "these", "mutations", "are", "premature", "stop", "codons", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "On", "the", "basis", "of", "the", "observation", "that", "aminoglycoside", "treatment", "can", "suppress", "stop", "codons", "in", "cultured", "cells", ",", "we", "tested", "the", "effect", "of", "gentamicin", "on", "cultured", "muscle", "cells", "from", "the", "mdx", "mouse", "-", "an", "animal", "model", "for", "DMD", "that", "possesses", "a", "premature", "stop", "codon", "in", "the", "dystrophin", "gene", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Exposure", "of", "mdx", "myotubes", "to", "gentamicin", "led", "to", "the", "expression", "and", "localization", "of", "dystrophin", "to", "the", "cell", "membrane", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "then", "evaluated", "the", "effects", "of", "differing", "dosages", "of", "gentamicin", "on", "expression", "and", "functional", "protection", "of", "the", "muscles", "of", "mdx", "mice", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "identified", "a", "treatment", "regimen", "that", "resulted", "in", "the", "presence", "of", "dystrophin", "in", "the", "cell", "membrane", "in", "all", "striated", "muscles", "examined", "and", "that", "provided", "functional", "protection", "against", "muscular", "injury", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]

[ "To", "our", "knowledge", ",", "our", "results", "are", "the", "first", "to", "demonstrate", "that", "aminoglycosides", "can", "suppress", "stop", "codons", "not", "only", "in", "vitro", "but", "also", "in", "vivo", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Furthermore", ",", "these", "results", "raise", "the", "possibility", "of", "a", "novel", "treatment", "regimen", "for", "muscular", "dystrophy", "and", "other", "diseases", "caused", "by", "premature", "stop", "codon", "mutations", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "treatment", "could", "prove", "effective", "in", "up", "to", "15", "%", "of", "patients", "with", "DMD", ".", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O" ]

[ "Loss", "of", "the", "ataxia", "-", "telangiectasia", "gene", "product", "causes", "oxidative", "damage", "in", "target", "organs", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Ataxia", "-", "telangiectasia", "(", "A", "-", "T", ")", "is", "characterized", "by", "a", "markedly", "increased", "sensitivity", "to", "ionizing", "radiation", ",", "increased", "incidence", "of", "cancer", ",", "and", "neurodegeneration", ",", "especially", "of", "the", "cerebellar", "Purkinje", "cells", "." ]

[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Ionizing", "radiation", "oxidizes", "macromolecules", "and", "causes", "tissue", "damage", "through", "the", "generation", "of", "reactive", "oxygen", "species", "(", "ROS", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "therefore", "hypothesized", "that", "A", "-", "T", "is", "due", "to", "oxidative", "damage", "resulting", "from", "loss", "of", "function", "of", "the", "A", "-", "T", "gene", "product", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O" ]

[ "To", "assess", "this", "hypothesis", ",", "we", "employed", "an", "animal", "model", "of", "A", "-", "T", ",", "the", "mouse", "with", "a", "disrupted", "Atm", "gene", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "show", "that", "organs", "which", "develop", "pathologic", "changes", "in", "the", "Atm", "-", "deficient", "mice", "are", "targets", "of", "oxidative", "damage", ",", "and", "that", "cerebellar", "Purkinje", "cells", "are", "particularly", "affected", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]