tokens
listlengths 2
123
| ner_tags
listlengths 2
123
|
---|---|
[
"These",
"observations",
"provide",
"a",
"mechanistic",
"basis",
"for",
"the",
"A",
"-",
"T",
"phenotype",
"and",
"lay",
"a",
"rational",
"foundation",
"for",
"therapeutic",
"intervention",
".",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Recessively",
"inherited",
"multiple",
"epiphyseal",
"dysplasia",
"with",
"normal",
"stature",
",",
"club",
"foot",
",",
"and",
"double",
"layered",
"patella",
"caused",
"by",
"a",
"DTDST",
"mutation",
"."
] |
[
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"have",
"observed",
"over",
"25",
"different",
"mutations",
"in",
"the",
"diastrophic",
"dysplasia",
"sulphate",
"transporter",
"gene",
"(",
"DTDST",
")",
"in",
"association",
"with",
"the",
"recessive",
"disorders",
"achondrogenesis",
"1B",
",",
"atelosteogenesis",
"2",
",",
"and",
"diastrophic",
"dysplasia",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O"
] |
[
"The",
"c862t",
"(",
"R279W",
")",
"transition",
"is",
"the",
"most",
"common",
"mutation",
"in",
"non",
"-",
"Finnish",
"patients",
",",
"but",
"in",
"these",
"disorders",
"it",
"is",
"usually",
"combined",
"with",
"other",
"DTDST",
"mutations",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"had",
"not",
"seen",
"a",
"case",
"of",
"homozygosity",
"for",
"c862t",
"(",
"R279W",
")",
"until",
"we",
"analysed",
"DNA",
"from",
"a",
"36",
"year",
"old",
"male",
"with",
"tall",
"-",
"normal",
"stature",
"(",
"180",
"cm",
")",
"who",
"asked",
"for",
"genetic",
"counselling",
"for",
"suspected",
"multiple",
"epiphyseal",
"dysplasia",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O"
] |
[
"He",
"was",
"treated",
"for",
"club",
"foot",
"and",
"hip",
"dysplasia",
"at",
"birth",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Skeletal",
"changes",
"consistent",
"with",
"multiple",
"epiphyseal",
"dysplasia",
",",
"with",
"the",
"peculiar",
"finding",
"of",
"a",
"double",
"layered",
"patella",
",",
"were",
"recognised",
"during",
"childhood",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Cleft",
"palate",
",",
"swelling",
"of",
"the",
"ear",
"pinna",
",",
"and",
"hitch",
"hiker",
"thumb",
"were",
"absent",
"."
] |
[
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"He",
"was",
"found",
"to",
"be",
"homozygous",
",",
"and",
"both",
"healthy",
"parents",
"heterozygous",
",",
"for",
"the",
"R279W",
"mutation",
"in",
"DTDST",
",",
"and",
"his",
"fibroblasts",
"showed",
"a",
"sulphate",
"incorporation",
"defect",
"typical",
"of",
"DTDST",
"disorders",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O"
] |
[
"Counselling",
"was",
"given",
"for",
"a",
"recessive",
"disorder",
",",
"thereby",
"considerably",
"reducing",
"the",
"probability",
"of",
"affected",
"offspring",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Multiple",
"epiphyseal",
"dysplasia",
"is",
"more",
"frequently",
"caused",
"by",
"dominant",
"mutations",
"in",
"the",
"COMP",
"(",
"EDM1",
",",
"McKusick",
"132400",
")",
"and",
"COL9A2",
"genes",
"(",
"EDM2",
",",
"McKusick",
"600204",
")",
"."
] |
[
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"A",
"few",
"other",
"patients",
"and",
"families",
"with",
"features",
"similar",
"to",
"our",
"proband",
"have",
"been",
"described",
"previously",
"and",
"considered",
"to",
"have",
"autosomal",
"recessive",
"MED",
"(",
"EDM4",
",",
"McKusick",
"226900",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"This",
"observation",
"confirms",
"the",
"existence",
"of",
"this",
"entity",
"and",
"assigns",
"it",
"to",
"the",
"phenotypic",
"spectrum",
"associated",
"with",
"mutations",
"at",
"the",
"DTDST",
"locus",
".",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Homozygosity",
"for",
"a",
"novel",
"DTDST",
"mutation",
"in",
"a",
"child",
"with",
"a",
"'",
"broad",
"bone",
"-",
"platyspondylic",
"'",
"variant",
"of",
"diastrophic",
"dysplasia",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O"
] |
[
"Atypical",
"or",
"variant",
"forms",
"of",
"well",
"-",
"known",
"chondrodysplasias",
"may",
"pose",
"diagnostic",
"problems",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"report",
"on",
"a",
"girl",
"with",
"clinical",
"features",
"suggesting",
"diastrophic",
"dysplasia",
"but",
"with",
"unusual",
"radiographic",
"features",
"including",
"severe",
"platyspondyly",
",",
"wide",
"metaphyses",
",",
"and",
"fibular",
"overgrowth",
",",
"which",
"are",
"partially",
"reminiscent",
"of",
"metatropic",
"dysplasia",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O"
] |
[
"The",
"diagnosis",
"was",
"clarified",
"by",
"molecular",
"analysis",
"of",
"the",
"DTDST",
"gene",
",",
"which",
"revealed",
"homozygosity",
"for",
"a",
"previously",
"undescribed",
"mutation",
"leading",
"to",
"a",
"Q454P",
"substitution",
"in",
"the",
"10th",
"transmembrane",
"domain",
"of",
"the",
"DTDST",
"sulfate",
"transporter",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Molecular",
"analysis",
"may",
"be",
"of",
"particular",
"value",
"in",
"such",
"atypical",
"cases",
".",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"type",
"of",
"somatic",
"mutation",
"at",
"APC",
"in",
"familial",
"adenomatous",
"polyposis",
"is",
"determined",
"by",
"the",
"site",
"of",
"the",
"germline",
"mutation",
":",
"a",
"new",
"facet",
"to",
"Knudson",
"'",
"s",
"'",
"two",
"-",
"hit",
"'",
"hypothesis",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"APC",
"is",
"often",
"cited",
"as",
"a",
"prime",
"example",
"of",
"a",
"tumor",
"suppressor",
"gene",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Truncating",
"germline",
"and",
"somatic",
"mutations",
"(",
"or",
",",
"infrequently",
",",
"allelic",
"loss",
")",
"occur",
"in",
"tumors",
"in",
"FAP",
"(",
"familial",
"adenomatous",
"polyposis",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O"
] |
[
"Most",
"sporadic",
"colorectal",
"cancers",
"also",
"have",
"two",
"APC",
"mutations",
"."
] |
[
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O"
] |
[
"Clues",
"from",
"attenuated",
"polyposis",
",",
"missense",
"germline",
"variants",
"with",
"mild",
"disease",
"and",
"the",
"somatic",
"mutation",
"cluster",
"region",
"(",
"codons",
"1",
",",
"250",
"-",
"1",
",",
"450",
")",
"indicate",
",",
"however",
",",
"that",
"APC",
"mutations",
"might",
"not",
"result",
"in",
"simple",
"loss",
"of",
"protein",
"function",
"."
] |
[
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"have",
"found",
"that",
"FAP",
"patients",
"with",
"germline",
"APC",
"mutations",
"within",
"a",
"small",
"region",
"(",
"codons",
"1",
",",
"194",
"-",
"1",
",",
"392",
"at",
"most",
")",
"mainly",
"show",
"allelic",
"loss",
"in",
"their",
"colorectal",
"adenomas",
",",
"in",
"contrast",
"to",
"other",
"FAP",
"patients",
",",
"whose",
"second",
"hits",
"tend",
"to",
"occur",
"by",
"truncating",
"mutations",
"in",
"the",
"mutation",
"cluster",
"region",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Our",
"results",
"indicate",
"that",
"different",
"APC",
"mutations",
"provide",
"cells",
"with",
"different",
"selective",
"advantages",
",",
"with",
"mutations",
"close",
"to",
"codon",
"1",
",",
"300",
"providing",
"the",
"greatest",
"advantage",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Allelic",
"loss",
"is",
"selected",
"strongly",
"in",
"cells",
"with",
"one",
"mutation",
"near",
"codon",
"1",
",",
"300",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"A",
"different",
"germline",
"-",
"somatic",
"APC",
"mutation",
"association",
"exists",
"in",
"FAP",
"desmoids",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O"
] |
[
"APC",
"is",
"not",
",",
"therefore",
",",
"a",
"classical",
"tumor",
"suppressor",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O"
] |
[
"Our",
"findings",
"also",
"indicate",
"a",
"new",
"mechanism",
"for",
"disease",
"severity",
"if",
"a",
"broader",
"spectrum",
"of",
"mutations",
"is",
"selected",
"in",
"tumors",
",",
"the",
"somatic",
"mutation",
"rate",
"is",
"effectively",
"higher",
"and",
"more",
"tumors",
"grow",
".",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Mxi1",
"mutations",
"in",
"human",
"neurofibrosarcomas",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O"
] |
[
"Mxi1",
"is",
"thought",
"to",
"negatively",
"regulate",
"Myc",
"function",
"and",
"may",
"therefore",
"be",
"a",
"potential",
"tumor",
"suppressor",
"gene",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Little",
"effort",
"has",
"yet",
"been",
"made",
"to",
"find",
"alterations",
"involving",
"this",
"gene",
"in",
"human",
"solid",
"tumors",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O"
] |
[
"We",
"screened",
"31",
"human",
"gastric",
"cancers",
",",
"7",
"esophageal",
"cancers",
",",
"85",
"bone",
"and",
"soft",
"tissue",
"tumors",
"of",
"various",
"types",
",",
"including",
"4",
"neurofibrosarcomas",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O"
] |
[
"We",
"also",
"examined",
"29",
"human",
"tumor",
"cell",
"lines",
"consisting",
"of",
"12",
"esophageal",
"cancers",
",",
"7",
"glioma",
"/",
"glioblastomas",
"and",
"10",
"others",
"for",
"Mxi1",
"mutations",
"in",
"exons",
"1",
",",
"2",
",",
"4",
"(",
"HLH",
"domain",
")",
",",
"5",
"and",
"6",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Polymerase",
"chain",
"reaction",
"-",
"single",
"-",
"strand",
"conformation",
"polymorphism",
"(",
"PCR",
"-",
"SSCP",
")",
"and",
"subsequent",
"sequencing",
"revealed",
"three",
"distinct",
"polymorphisms",
"in",
"the",
"intron",
"-",
"exon",
"boundary",
"upstream",
"from",
"exon",
"6",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"discovered",
"a",
"missense",
"mutation",
",",
"GCA",
"to",
"GTA",
"(",
"Ala",
"54",
"Val",
")",
",",
"in",
"exon",
"2",
"in",
"a",
"neurofibrosarcoma",
"patient",
"(",
"case",
"1",
")",
",",
"two",
"missense",
"mutations",
",",
"AAA",
"to",
"CAA",
"(",
"Lys",
"118",
"Gln",
")",
"and",
"GAA",
"to",
"GGA",
"(",
"Glu",
"154",
"Gly",
")",
"in",
"exon",
"5",
"of",
"another",
"neurofibrosarcoma",
"patient",
"(",
"case",
"2",
")",
",",
"and",
"3",
"amino",
"acid",
"substitutions",
",",
"GTG",
"to",
"GCG",
"(",
"Val",
"179",
"Ala",
")",
",",
"GTT",
"to",
"GCT",
"(",
"Val",
"181",
"Ala",
")",
"and",
"TTC",
"to",
"CTC",
"(",
"Phe",
"186",
"Leu",
")",
",",
"in",
"a",
"third",
"neurofibrosarcoma",
"patient",
"(",
"case",
"3",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"case",
"3",
",",
"loss",
"of",
"heterozygosity",
"was",
"also",
"demonstrated",
"by",
"informative",
"(",
"TTC",
")",
"3",
"/",
"(",
"TTC",
")",
"2",
"polymorphism",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Our",
"data",
"demonstrate",
"that",
"mutations",
"occur",
"in",
"the",
"Mxi1",
"gene",
"in",
"neurofibrosarcoma",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O"
] |
[
"Missense",
"mutations",
"in",
"the",
"functional",
"domain",
"of",
"Mxi1",
"in",
"these",
"cases",
"may",
"be",
"involved",
"in",
"the",
"pathogenesis",
"of",
"neurofibrosarcoma",
".",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O"
] |
[
"A",
"population",
"-",
"based",
"study",
"of",
"the",
"clinical",
"expression",
"of",
"the",
"hemochromatosis",
"gene",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O"
] |
[
"BACKGROUND",
"AND",
"METHODS",
"Hereditary",
"hemochromatosis",
"is",
"associated",
"with",
"homozygosity",
"for",
"the",
"C282Y",
"mutation",
"in",
"the",
"hemochromatosis",
"(",
"HFE",
")",
"gene",
"on",
"chromosome",
"6",
",",
"elevated",
"serum",
"transferrin",
"saturation",
",",
"and",
"excess",
"iron",
"deposits",
"throughout",
"the",
"body",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"To",
"assess",
"the",
"prevalence",
"and",
"clinical",
"expression",
"of",
"the",
"HFE",
"gene",
",",
"we",
"conducted",
"a",
"population",
"-",
"based",
"study",
"in",
"Busselton",
",",
"Australia",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"1994",
",",
"we",
"obtained",
"blood",
"samples",
"for",
"the",
"determination",
"of",
"serum",
"transferrin",
"saturation",
"and",
"ferritin",
"levels",
"and",
"the",
"presence",
"or",
"absence",
"of",
"the",
"C282Y",
"mutation",
"and",
"the",
"H63D",
"mutation",
"(",
"which",
"may",
"contribute",
"to",
"increased",
"hepatic",
"iron",
"levels",
")",
"in",
"3011",
"unrelated",
"white",
"adults",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"evaluated",
"all",
"subjects",
"who",
"had",
"persistently",
"elevated",
"transferrin",
"-",
"saturation",
"values",
"(",
"45",
"percent",
"or",
"higher",
")",
"or",
"were",
"homozygous",
"for",
"the",
"C282Y",
"mutation",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"recommended",
"liver",
"biopsy",
"for",
"subjects",
"with",
"serum",
"ferritin",
"levels",
"of",
"300",
"ng",
"per",
"milliliter",
"or",
"higher",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"subjects",
"were",
"followed",
"for",
"up",
"to",
"four",
"years",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"RESULTS",
"Sixteen",
"of",
"the",
"subjects",
"(",
"0",
".",
"5",
"percent",
")",
"were",
"homozygous",
"for",
"the",
"C282Y",
"mutation",
",",
"and",
"424",
"(",
"14",
".",
"1",
"percent",
")",
"were",
"heterozygous",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"serum",
"transferrin",
"saturation",
"was",
"45",
"percent",
"or",
"higher",
"in",
"15",
"of",
"the",
"16",
"who",
"were",
"homozygous",
";",
"in",
"1",
"subject",
"it",
"was",
"43",
"percent",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Four",
"of",
"the",
"homozygous",
"subjects",
"had",
"previously",
"been",
"given",
"a",
"diagnosis",
"of",
"hemochromatosis",
",",
"and",
"12",
"had",
"not",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Seven",
"of",
"these",
"12",
"patients",
"had",
"elevated",
"serum",
"ferritin",
"levels",
"in",
"1994",
";",
"6",
"of",
"the",
"7",
"had",
"further",
"increases",
"in",
"1998",
",",
"and",
"1",
"had",
"a",
"decrease",
",",
"although",
"the",
"value",
"remained",
"elevated",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"serum",
"ferritin",
"levels",
"in",
"the",
"four",
"other",
"homozygous",
"patients",
"remained",
"in",
"the",
"normal",
"range",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Eleven",
"of",
"the",
"16",
"homozygous",
"subjects",
"underwent",
"liver",
"biopsy",
";",
"3",
"had",
"hepatic",
"fibrosis",
",",
"and",
"1",
",",
"who",
"had",
"a",
"history",
"of",
"excessive",
"alcohol",
"consumption",
",",
"had",
"cirrhosis",
"and",
"mild",
"microvesicular",
"steatosis",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O"
] |
[
"Eight",
"of",
"the",
"16",
"homozygous",
"subjects",
"had",
"clinical",
"findings",
"that",
"were",
"consistent",
"with",
"the",
"presence",
"of",
"hereditary",
"hemochromatosis",
",",
"such",
"as",
"hepatomegaly",
",",
"skin",
"pigmentation",
",",
"and",
"arthritis",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O"
] |
[
"CONCLUSIONS",
"In",
"a",
"population",
"of",
"white",
"adults",
"of",
"northern",
"European",
"ancestry",
",",
"0",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"5",
"percent",
"were",
"homozygous",
"for",
"the",
"C282Y",
"mutation",
"in",
"the",
"HFE",
"gene",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"However",
",",
"only",
"half",
"of",
"those",
"who",
"were",
"homozygous",
"had",
"clinical",
"features",
"of",
"hemochromatosis",
",",
"and",
"one",
"quarter",
"had",
"serum",
"ferritin",
"levels",
"that",
"remained",
"normal",
"over",
"a",
"four",
"-",
"year",
"period",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Large",
"heterozygous",
"deletion",
"masquerading",
"as",
"homozygous",
"missense",
"mutation",
":",
"a",
"pitfall",
"in",
"diagnostic",
"mutation",
"analysis",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"clinical",
"use",
"of",
"molecular",
"analyses",
"in",
"recessive",
"disorders",
"relies",
"on",
"the",
"exact",
"characterization",
"of",
"both",
"mutant",
"alleles",
"in",
"the",
"affected",
"patient",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"This",
"can",
"be",
"problematic",
"when",
"only",
"part",
"of",
"the",
"gene",
"is",
"examined",
"or",
"when",
"relevant",
"DNA",
"alterations",
"are",
"not",
"recognized",
"by",
"standard",
"methods",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"present",
"a",
"child",
"in",
"whom",
"phenylketonuria",
"was",
"apparently",
"caused",
"by",
"homozygosity",
"for",
"the",
"mutation",
"E390G",
"in",
"exon",
"11",
"of",
"the",
"phenylalanine",
"hydroxylase",
"(",
"PAH",
")",
"gene",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"However",
",",
"the",
"clinical",
"severity",
"of",
"the",
"disease",
"was",
"not",
"quite",
"as",
"mild",
"as",
"expected",
",",
"the",
"mutation",
"was",
"not",
"identified",
"in",
"the",
"father",
"despite",
"confirmed",
"paternity",
",",
"and",
"the",
"paternal",
"allele",
"showed",
"a",
"highly",
"unusual",
"pattern",
"of",
"polymorphic",
"markers",
"in",
"the",
"PAH",
"gene",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Presence",
"of",
"a",
"large",
"deletion",
"involving",
"exons",
"9",
",",
"10",
"and",
"11",
"of",
"the",
"phenylalanine",
"hydroxylase",
"gene",
"was",
"confirmed",
"by",
"long",
"-",
"range",
"PCR",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Diagnostic",
"DNA",
"analyses",
"should",
"include",
"a",
"comprehensive",
"examination",
"of",
"the",
"whole",
"relevant",
"gene",
"in",
"the",
"patient",
"and",
"confirmation",
"of",
"carrier",
"status",
"in",
"both",
"parents",
".",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Early",
"onset",
"of",
"X",
"-",
"linked",
"Emery",
"-",
"Dreifuss",
"muscular",
"dystrophy",
"in",
"a",
"boy",
"with",
"emerin",
"gene",
"deletion",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"A",
"boy",
"developed",
"contractures",
"of",
"the",
"Achilles",
"tendons",
"at",
"3",
"years",
"and",
"of",
"the",
"postcervical",
"muscles",
"at",
"7",
"years",
",",
"although",
"neither",
"contractures",
"of",
"the",
"elbows",
"nor",
"cardiac",
"abnormality",
"were",
"recognized",
"by",
"the",
"age",
"of",
"9",
"years",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Muscle",
"computed",
"tomography",
"scanning",
"revealed",
"changes",
"characteristic",
"of",
"muscle",
"involvement",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Emerin",
"was",
"not",
"detected",
"in",
"the",
"biopsied",
"muscle",
",",
"and",
"RT",
"-",
"PCR",
"and",
"PCR",
"-",
"based",
"genomic",
"DNA",
"analyses",
"of",
"the",
"emerin",
"gene",
"demonstrated",
"no",
"amplification",
"product",
"in",
"the",
"patient",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"These",
"results",
"confirmed",
"the",
"diagnosis",
"of",
"X",
"-",
"linked",
"Emery",
"-",
"Dreifuss",
"muscular",
"dystrophy",
"(",
"EDMD",
")",
",",
"and",
"reinforce",
"the",
"necessity",
"of",
"molecular",
"genetic",
"diagnosis",
"of",
"the",
"membrane",
"protein",
"emerin",
"in",
"younger",
"patients",
"with",
"possible",
"EDMD",
"before",
"appearance",
"of",
"the",
"typical",
"symptoms",
",",
"to",
"avoid",
"sudden",
"cardiac",
"death",
".",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O"
] |
[
"Duchenne",
"/",
"Becker",
"muscular",
"dystrophy",
":",
"correlation",
"of",
"phenotype",
"by",
"electroretinography",
"with",
"sites",
"of",
"dystrophin",
"mutations",
"."
] |
[
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"dark",
"-",
"adapted",
"electroretinogram",
"(",
"ERG",
")",
"of",
"patients",
"with",
"Duchenne",
"and",
"Becker",
"muscular",
"dystrophy",
"(",
"DMD",
"/",
"BMD",
")",
"shows",
"a",
"marked",
"reduction",
"in",
"b",
"-",
"wave",
"amplitude",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Genotype",
"-",
"phenotype",
"studies",
"of",
"mouse",
"models",
"for",
"DMD",
"show",
"position",
"-",
"specific",
"effects",
"of",
"the",
"mutations",
"upon",
"the",
"phenotype",
"mice",
"with",
"5",
"defects",
"of",
"dystrophin",
"have",
"normal",
"ERGs",
",",
"those",
"with",
"defects",
"in",
"the",
"central",
"region",
"have",
"a",
"normal",
"b",
"-",
"wave",
"amplitude",
"associated",
"with",
"prolonged",
"implicit",
"times",
"for",
"both",
"the",
"b",
"-",
"wave",
"and",
"oscillatory",
"potentials",
",",
"and",
"mice",
"with",
"3",
"defects",
"have",
"a",
"phenotype",
"similar",
"to",
"that",
"seen",
"in",
"DMD",
"/",
"BMD",
"patients",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"mouse",
"studies",
"suggest",
"a",
"key",
"role",
"for",
"the",
"carboxyl",
"terminal",
"dystrophin",
"isoform",
",",
"Dp260",
",",
"in",
"retinal",
"electrophysiology",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"have",
"undertaken",
"a",
"systematic",
"evaluation",
"of",
"DMD",
"/",
"BMD",
"patients",
"through",
"clinical",
"examination",
"and",
"review",
"of",
"the",
"literature",
"in",
"order",
"to",
"determine",
"whether",
"the",
"position",
"-",
"specific",
"effects",
"of",
"mutations",
"noted",
"in",
"the",
"mouse",
"are",
"present",
"in",
"man",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"have",
"found",
"that",
",",
"in",
"man",
",",
"a",
"wider",
"variation",
"of",
"DMD",
"defects",
"correlate",
"with",
"reductions",
"in",
"the",
"b",
"-",
"wave",
"amplitude",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Individuals",
"with",
"normal",
"ERGs",
"have",
"mutations",
"predominantly",
"located",
"5",
"of",
"the",
"transcript",
"initiation",
"site",
"of",
"Dp260",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Our",
"results",
"suggest",
"that",
"the",
"most",
"important",
"determinant",
"in",
"the",
"ERG",
"b",
"-",
"wave",
"phenotype",
"is",
"the",
"mutation",
"position",
",",
"rather",
"than",
"muscle",
"disease",
"severity",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O"
] |
[
"Forty",
"-",
"six",
"per",
"cent",
"of",
"patients",
"with",
"mutations",
"5",
"of",
"the",
"Dp260",
"transcript",
"start",
"site",
"have",
"abnormal",
"ERGs",
",",
"as",
"opposed",
"to",
"94",
"%",
"with",
"more",
"distal",
"mutations",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"human",
"genotype",
"-",
"phenotype",
"correlations",
"are",
"consistent",
"with",
"a",
"role",
"for",
"Dp260",
"in",
"normal",
"retinal",
"electrophysiology",
"and",
"may",
"also",
"reflect",
"the",
"expression",
"of",
"other",
"C",
"-",
"terminal",
"dystrophin",
"isoforms",
"and",
"their",
"contributions",
"to",
"retinal",
"signal",
"transmission",
".",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Cis",
"and",
"trans",
"effects",
"of",
"the",
"myotonic",
"dystrophy",
"(",
"DM",
")",
"mutation",
"in",
"a",
"cell",
"culture",
"model",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"mutation",
"causing",
"myotonic",
"dystrophy",
"(",
"DM",
")",
"has",
"been",
"identified",
"as",
"a",
"CTG",
"expansion",
"in",
"the",
"3",
"-",
"untranslated",
"region",
"(",
"3",
"-",
"UTR",
")",
"of",
"the",
"DM",
"protein",
"kinase",
"gene",
"(",
"DMPK",
")",
",",
"but",
"the",
"mechanism",
"(",
"s",
")",
"of",
"pathogenesis",
"remain",
"unknown",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Studies",
"using",
"DM",
"patient",
"materials",
"have",
"often",
"produced",
"confusing",
"results",
"."
] |
[
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Therefore",
",",
"to",
"study",
"the",
"effects",
"of",
"the",
"DM",
"mutation",
"in",
"a",
"controlled",
"environment",
",",
"we",
"have",
"established",
"a",
"cell",
"culture",
"model",
"system",
"using",
"C2C12",
"mouse",
"myoblasts",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"By",
"expressing",
"chimeric",
"reporter",
"constructs",
"containing",
"a",
"reporter",
"gene",
"fused",
"to",
"a",
"human",
"DMPK",
"3",
"-",
"UTR",
",",
"we",
"identified",
"both",
"cis",
"and",
"trans",
"effects",
"that",
"are",
"mediated",
"by",
"the",
"DM",
"mutation",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Our",
"data",
"show",
"that",
"a",
"mutant",
"DMPK",
"3",
"-",
"UTR",
",",
"with",
"as",
"few",
"as",
"57",
"CTGs",
",",
"had",
"a",
"negative",
"cis",
"effect",
"on",
"protein",
"expression",
"and",
"resulted",
"in",
"the",
"aggregation",
"of",
"reporter",
"transcripts",
"into",
"discrete",
"nuclear",
"foci",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"determined",
"by",
"deletion",
"analysis",
"that",
"an",
"expanded",
"(",
"CTG",
")",
"(",
"n",
")",
"tract",
"alone",
"was",
"sufficient",
"to",
"mediate",
"these",
"cis",
"effects",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Furthermore",
",",
"in",
"contrast",
"to",
"the",
"normal",
"DMPK",
"3",
"-",
"UTR",
"mRNA",
",",
"a",
"mutant",
"DMPK",
"3",
"-",
"UTR",
"mRNA",
"with",
"(",
"CUG",
")",
"(",
"200",
")",
"selectively",
"inhibited",
"myogenic",
"differentiation",
"of",
"C2C12",
"myoblasts",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Genetic",
"analysis",
"and",
"the",
"Cre",
"-",
"loxP",
"system",
"were",
"used",
"to",
"clearly",
"demonstrate",
"that",
"the",
"myoblast",
"fusion",
"defect",
"could",
"be",
"rescued",
"by",
"eliminating",
"the",
"expression",
"of",
"the",
"mutant",
"DMPK",
"3",
"-",
"UTR",
"transcript",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Characterization",
"of",
"spontaneous",
"deletion",
"events",
"mapped",
"the",
"inhibitory",
"effect",
"to",
"the",
"(",
"CTG",
")",
"(",
"n",
")",
"expansion",
"and",
"/",
"or",
"the",
"3",
"end",
"of",
"the",
"DMPK",
"3",
"-",
"UTR",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"These",
"results",
"provide",
"evidence",
"that",
"the",
"DM",
"mutation",
"acts",
"in",
"cis",
"to",
"reduce",
"protein",
"production",
"(",
"consistent",
"with",
"DMPK",
"haploinsufficiency",
")",
"and",
"in",
"trans",
"as",
"a",
"riboregulator",
"to",
"inhibit",
"myogenesis",
".",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Coats",
"'",
"disease",
"of",
"the",
"retina",
"(",
"unilateral",
"retinal",
"telangiectasis",
")",
"caused",
"by",
"somatic",
"mutation",
"in",
"the",
"NDP",
"gene",
":",
"a",
"role",
"for",
"norrin",
"in",
"retinal",
"angiogenesis",
"."
] |
[
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Coats",
"disease",
"is",
"characterized",
"by",
"abnormal",
"retinal",
"vascular",
"development",
"(",
"so",
"-",
"called",
"retinal",
"telangiectasis",
")",
"which",
"results",
"in",
"massive",
"intraretinal",
"and",
"subretinal",
"lipid",
"accumulation",
"(",
"exudative",
"retinal",
"detachment",
")",
"."
] |
[
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"classical",
"form",
"of",
"Coats",
"disease",
"is",
"almost",
"invariably",
"isolated",
",",
"unilateral",
"and",
"seen",
"in",
"males",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"A",
"female",
"with",
"a",
"unilateral",
"variant",
"of",
"Coats",
"disease",
"gave",
"birth",
"to",
"a",
"son",
"affected",
"by",
"Norrie",
"disease",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O"
] |
[
"Both",
"carried",
"a",
"missense",
"mutation",
"within",
"the",
"NDP",
"gene",
"on",
"chromosome",
"Xp11",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"2",
"2",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Subsequently",
"analysis",
"of",
"the",
"retinas",
"of",
"nine",
"enucleated",
"eyes",
"from",
"males",
"with",
"Coats",
"disease",
"demonstrated",
"in",
"one",
"a",
"somatic",
"mutation",
"in",
"the",
"NDP",
"gene",
"which",
"was",
"not",
"present",
"within",
"non",
"-",
"retinal",
"tissue",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"suggest",
"that",
"Coats",
"telangiectasis",
"is",
"secondary",
"to",
"somatic",
"mutation",
"in",
"the",
"NDP",
"gene",
"which",
"results",
"in",
"a",
"deficiency",
"of",
"norrin",
"(",
"the",
"protein",
"product",
"of",
"the",
"NDP",
"gene",
")",
"within",
"the",
"developing",
"retina",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"This",
"supports",
"recent",
"observations",
"that",
"the",
"protein",
"is",
"critical",
"for",
"normal",
"retinal",
"vasculogenesis",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Hereditary",
"TP53",
"codon",
"292",
"and",
"somatic",
"P16INK4A",
"codon",
"94",
"mutations",
"in",
"a",
"Li",
"-",
"Fraumeni",
"syndrome",
"family",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O"
] |
[
"Li",
"-",
"Fraumeni",
"syndrome",
"is",
"an",
"autosomal",
"dominant",
"disorder",
"that",
"is",
"characterized",
"by",
"various",
"types",
"of",
"cancer",
"in",
"childhood",
"and",
"adult",
"cases",
"."
] |
[
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
Subsets and Splits
No community queries yet
The top public SQL queries from the community will appear here once available.