disi-unibo-nlp/ncbi · Datasets at Hugging Face

tokens listlengths 2 123	ner_tags listlengths 2 123
[ "The", "history", "further", "indicated", "intrauterine", "growth", "retardation", "at", "the", "end", "of", "the", "pregnancy", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "His", "mother", "was", "44", "years", "of", "age", "at", "the", "time", "of", "his", "birth", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "After", "birth", "he", "showed", "hypotonia", "with", "poor", "sucking", ",", "for", "which", "gavage", "feeding", "was", "needed", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Motor", "development", "was", "delayed", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "After", "1", "year", "he", "became", "obese", "despite", "a", "normal", "appetite", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Recurrent", "middle", "ear", "infections", ",", "a", "high", "pain", "threshold", ",", "and", "a", "great", "skill", "with", "jigsaw", "puzzles", "were", "reported", "." ]	[ "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "There", "were", "no", "behavioural", "problems", "or", "sleep", "disturbance", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Chromosomal", "analysis", "was", "normal", "(", "46", ",", "XY", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "DNA", "analysis", "for", "Prader", "-", "Willi", "syndrome", "showed", "no", "abnormalities", "." ]	[ "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Two", "years", "later", "he", "was", "re", "-", "examined", "because", "we", "thought", "his", "features", "fitted", "the", "PWS", "-", "like", "phenotype", "associated", "with", "maternal", "UPD", "(", "14", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O" ]
[ "At", "that", "time", "precocious", "puberty", "was", "evident", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "DNA", "analysis", "showed", "maternal", "heterodisomy", "for", "chromosome", "14", "." ]	[ "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "all", "the", "previously", "described", "11", "cases", "with", "maternal", "UPD", "(", "14", ")", ",", "a", "Robertsonian", "translocation", "involving", "chromosome", "14", "was", "detected", "cytogenetically", "before", "DNA", "analysis", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "is", "the", "first", "report", "of", "diagnosis", "of", "maternal", "UPD", "(", "14", ")", "based", "on", "clinical", "features", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "finding", "underlines", "the", "importance", "of", "DNA", "analysis", "for", "maternal", "UPD", "(", "14", ")", "in", "patients", "with", "a", "similar", "PWS", "-", "like", "phenotype", "even", "without", "previous", "identification", "of", "a", "Robertsonian", "translocation", "involving", "chromosome", "14", ".", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Clinical", "and", "genetic", "study", "of", "Friedreich", "ataxia", "in", "an", "Australian", "population", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Friedreich", "ataxia", "is", "an", "autosomal", "recessive", "disorder", "caused", "by", "mutations", "in", "the", "FRDA", "gene", "that", "encodes", "a", "210", "-", "amino", "acid", "protein", "called", "frataxin", "." ]	[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "An", "expansion", "of", "a", "GAA", "trinucleotide", "repeat", "in", "intron", "1", "of", "the", "gene", "is", "present", "in", "more", "than", "95", "%", "of", "mutant", "alleles", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Of", "the", "83", "people", "we", "studied", "who", "have", "mutations", "in", "FRDA", ",", "78", "are", "homozygous", "for", "an", "expanded", "GAA", "repeat", ";", "the", "other", "five", "patients", "have", "an", "expansion", "in", "one", "allele", "and", "a", "point", "mutation", "in", "the", "other", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Here", "we", "present", "a", "detailed", "clinical", "and", "genetic", "study", "of", "a", "subset", "of", "51", "patients", "homozygous", "for", "an", "expansion", "of", "the", "GAA", "repeat", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "found", "a", "correlation", "between", "the", "size", "of", "the", "smaller", "of", "the", "two", "expanded", "alleles", "and", "age", "at", "onset", ",", "age", "into", "wheelchair", ",", "scoliosis", ",", "impaired", "vibration", "sense", ",", "and", "the", "presence", "of", "foot", "deformity", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]
[ "There", "was", "no", "significant", "correlation", "between", "the", "size", "of", "the", "smaller", "allele", "and", "cardiomyopathy", ",", "diabetes", "mellitus", ",", "loss", "of", "proprioception", ",", "or", "bladder", "symptoms", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]
[ "The", "larger", "allele", "size", "correlated", "with", "bladder", "symptoms", "and", "the", "presence", "of", "foot", "deformity", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]
[ "The", "duration", "of", "disease", "is", "correlated", "with", "wheelchair", "use", "and", "the", "presence", "of", "diabetes", ",", "scoliosis", ",", "bladder", "symptoms", "and", "impaired", "proprioception", ",", "and", "vibration", "sense", "but", "no", "other", "complications", "studied", ".", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Novel", "mutations", "in", "XLRS1", "causing", "retinoschisis", ",", "including", "first", "evidence", "of", "putative", "leader", "sequence", "change", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Juvenile", "retinoschisis", "is", "an", "X", "-", "linked", "recessive", "disease", "caused", "by", "mutations", "in", "the", "XLRS1", "gene", "." ]	[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "screened", "31", "new", "unrelated", "patients", "and", "families", "for", "XLRS1", "mutations", "in", "addition", "to", "previously", "reported", "mutations", "for", "60", "of", "our", "families", "(", "Retinoschisis", "Consortium", ",", "Hum", "Mol", "Genet", "1998", ";", "7", "1185", "-", "1192", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Twenty", "-", "three", "different", "mutations", "including", "12", "novel", "ones", "were", "identified", "in", "28", "patients", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Mutations", "identified", "in", "this", "study", "include", "19", "missense", "mutations", ",", "two", "nonsense", "mutations", ",", "one", "intragenic", "deletion", ",", "four", "microdeletions", ",", "one", "insertion", ",", "and", "one", "intronic", "sequence", "substitution", "that", "is", "likely", "to", "result", "in", "a", "splice", "site", "defect", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Two", "novel", "mutations", ",", "c", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "38T", "-", "-", ">", "C", "(", "L13P", ")", "and", "c", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "667T", "-", "-", ">", "C", "(", "C223R", ")", ",", "respectively", ",", "present", "the", "first", "genetic", "evidence", "for", "the", "functional", "significance", "of", "the", "putative", "leader", "peptide", "sequence", "and", "for", "the", "functional", "significance", "at", "the", "carboxyl", "terminal", "of", "the", "XLRS1", "protein", "beyond", "the", "discoidin", "domain", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Mutations", "in", "25", "of", "the", "families", "were", "localized", "to", "exons", "4", "-", "6", ",", "emphasizing", "the", "critical", "functional", "significance", "of", "the", "discoidin", "domain", "of", "the", "XLRS1", "protein" ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Growth", "hormone", "treatment", "increases", "CO", "(", "2", ")", "response", ",", "ventilation", "and", "central", "inspiratory", "drive", "in", "children", "with", "Prader", "-", "Willi", "syndrome", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]
[ "We", "studied", "whether", "the", "beneficial", "effects", "of", "growth", "hormone", "(", "GH", ")", "treatment", "on", "growth", "and", "body", "composition", "in", "PWS", "are", "accompanied", "by", "an", "improvement", "in", "respiratory", "function", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "measured", "resting", "ventilation", ",", "airway", "occlusion", "pressure", "(", "P", "(", "0", ".", "1", ")", ")", "and", "ventilatory", "response", "to", "CO", "(", "2", ")", "in", "nine", "children", ",", "aged", "7", "-", "14", "years", ",", "before", "and", "6", "-", "9", "months", "after", "the", "start", "of", "GH", "treatment", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "During", "GH", "treatment", ",", "resting", "ventilation", "increased", "by", "26", "%", ",", "P", "(", "0", ".", "1", ")", "by", "72", "%", "and", "the", "response", "to", "CO", "(", "2", ")", "by", "65", "%", "(", "P", "<", "0", ".", "002", ",", "<", "0", ".", "04", "and", "<", "0", ".", "02", ",", "respectively", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "observed", "increase", "in", "ventilatory", "output", "was", "not", "correlated", "to", "changes", "in", "body", "mass", "index", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "CONCLUSION", "Treatment", "of", "children", "with", "Prader", "-", "Willi", "syndrome", "(", "PWS", ")", "seems", "to", "have", "a", "stimulatory", "effect", "on", "central", "respiratory", "structures", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "observed", "increase", "in", "ventilation", "and", "inspiratory", "drive", "may", "contribute", "to", "the", "improved", "activity", "level", "reported", "by", "parents", "of", "PWS", "children", "during", "growth", "hormone", "therapy" ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "G130V", ",", "a", "common", "FRDA", "point", "mutation", ",", "appears", "to", "have", "arisen", "from", "a", "common", "founder", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Friedreich", "ataxia", "(", "FRDA", ")", "is", "the", "most", "common", "inherited", "ataxia", "." ]	[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]
[ "About", "98", "%", "of", "mutant", "alleles", "have", "an", "expansion", "of", "a", "GAA", "trinucleotide", "repeat", "in", "intron", "1", "of", "the", "affected", "gene", ",", "FRDA", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "other", "2", "%", "are", "point", "mutations", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Of", "the", "17", "point", "mutations", "so", "far", "described", ",", "three", "appear", "to", "be", "more", "common", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "One", "of", "these", "is", "the", "G130V", "mutation", "in", "exon", "4", "of", "FRDA", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "G130V", ",", "when", "present", "with", "an", "expanded", "GAA", "repeat", "on", "the", "other", "allele", ",", "is", "associated", "with", "an", "atypical", "FRDA", "phenotype", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O" ]
[ "Haplotype", "analysis", "was", "undertaken", "on", "the", "four", "families", "who", "have", "been", "described", "with", "this", "mutation", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "results", "suggest", "a", "common", "founder", "for", "this", "mutation", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Although", "marked", "differences", "in", "extragenic", "marker", "haplotypes", "were", "seen", "in", "one", "family", ",", "similar", "intragenic", "haplotyping", "suggests", "the", "same", "mutation", "founder", "for", "this", "family", "with", "the", "differences", "explicable", "by", "two", "recombination", "events", ".", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Synergistic", "effect", "of", "histone", "hyperacetylation", "and", "DNA", "demethylation", "in", "the", "reactivation", "of", "the", "FMR1", "gene", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Most", "fragile", "X", "syndrome", "patients", "have", "expansion", "of", "a", "(", "CGG", ")", "(", "n", ")", "sequence", "with", ">", "200", "repeats", "(", "full", "mutation", ")", "in", "the", "FMR1", "gene", "responsible", "for", "this", "condition", "." ]	[ "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Hypermethylation", "of", "the", "expanded", "repeat", "and", "of", "the", "FMR1", "promoter", "is", "almost", "always", "present", "and", "apparently", "suppresses", "transcription", ",", "resulting", "in", "absence", "of", "the", "FMR1", "protein", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "recently", "showed", "that", "transcriptional", "reactivation", "of", "FMR1", "full", "mutations", "can", "be", "achieved", "by", "inducing", "DNA", "demethylation", "with", "5", "-", "azadeoxycytidine", "(", "5", "-", "azadC", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "level", "of", "histone", "acetylation", "is", "another", "important", "factor", "in", "regulating", "gene", "expression", ";", "therefore", ",", "we", "treated", "lymphoblastoid", "cell", "lines", "of", "non", "-", "mosaic", "full", "mutation", "patients", "with", "three", "drugs", "capable", "of", "inducing", "histone", "hyperacetylation", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "observed", "a", "consistent", ",", "although", "modest", ",", "reactivation", "of", "the", "FMR1", "gene", "with", "4", "-", "phenylbutyrate", ",", "sodium", "butyrate", "and", "trichostatin", "A", ",", "as", "shown", "by", "RT", "-", "PCR", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "However", ",", "we", "report", "that", "combining", "these", "drugs", "with", "5", "-", "azadC", "results", "in", "a", "2", "-", "to", "5", "-", "fold", "increase", "in", "FMR1", "mRNA", "levels", "obtained", "with", "5", "-", "azadC", "alone", ",", "thus", "showing", "a", "marked", "synergistic", "effect", "of", "histone", "hyperacetylation", "and", "DNA", "demethylation", "in", "the", "reactivation", "of", "FMR1", "full", "mutations", ".", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Constitutional", "von", "Hippel", "-", "Lindau", "(", "VHL", ")", "gene", "deletions", "detected", "in", "VHL", "families", "by", "fluorescence", "in", "situ", "hybridization", "." ]	[ "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "von", "Hippel", "-", "Lindau", "(", "VHL", ")", "disease", "is", "an", "autosomal", "dominantly", "inherited", "cancer", "syndrome", "predisposing", "to", "a", "variety", "of", "tumor", "types", "that", "include", "retinal", "hemangioblastomas", ",", "hemangioblastomas", "of", "the", "central", "nervous", "system", ",", "renal", "cell", "carcinomas", ",", "pancreatic", "cysts", "and", "tumors", ",", "pheochromocytomas", ",", "endolymphatic", "sac", "tumors", ",", "and", "epididymal", "cystadenomas", "[", "W", "." ]	[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O" ]
[ "M", "." ]	[ "O", "O" ]
[ "Linehan", "et", "al", ".", ",", "J", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Am", ".", "Med", ".", "Assoc", ".", ",", "273", "564", "-", "570", ",", "1995", ";", "E", ".", "A", ".", "Maher", "and", "W", ".", "G", ".", "Kaelin", ",", "Jr", ".", ",", "Medicine", "(", "Baltimore", ")", ",", "76", "381", "-", "391", ",", "1997", ";", "W", ".", "M", ".", "Linehan", "and", "R", ".", "D", ".", "Klausner", ",", "In", "B", ".", "Vogelstein", "and", "K", ".", "Kinzler", "(", "eds", ".", ")", ",", "The", "Genetic", "Basis", "of", "Human", "Cancer", ",", "pp", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "455", "-", "473", ",", "McGraw", "-", "Hill", ",", "1998", "]", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "VHL", "gene", "was", "localized", "to", "chromosome", "3p25", "-", "26", "and", "cloned", "[", "F", ".", "Latif", "et", "al", ".", ",", "Science", "(", "Washington", "DC", ")", ",", "260", "1317", "-", "1320", ",", "1993", "]", "." ]	[ "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Germline", "mutations", "in", "the", "VHL", "gene", "have", "been", "detected", "in", "the", "majority", "of", "VHL", "kindreds", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O" ]
[ "The", "reported", "frequency", "of", "detection", "of", "VHL", "germline", "mutations", "has", "varied", "from", "39", "to", "80", "%", "(", "J", ".", "M", ".", "Whaley", "et", "al", ".", ",", "Am", ".", "J", ".", "Hum", ".", "Genet", ".", ",", "55", "1092", "-", "1102", ",", "1994", ";", "Clinical", "Research", "Group", "for", "Japan", ",", "Hum", ".", "Mol", ".", "Genet", ".", ",", "4", "2233", "-", "2237", ",", "1995", ";", "F", ".", "Chen", "et", "al", ".", ",", "Hum", ".", "Mutat", ".", ",", "5", "66", "-", "75", ",", "1995", ";", "E", ".", "R", ".", "Maher", "et", "al", ".", ",", "J", ".", "Med", ".", "Genet", ".", ",", "33", "328", "-", "332", ",", "1996", ";", "B", ".", "Zbar", ",", "Cancer", "Surv", ".", ",", "25", "219", "-", "232", ",", "1995", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Recently", "a", "quantitative", "Southern", "blotting", "procedure", "was", "found", "to", "improve", "this", "frequency", "(", "C", ".", "Stolle", "et", "al", ".", ",", "Hum", ".", "Mutat", ".", ",", "12", "417", "-", "423", ",", "1998", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "the", "present", "study", ",", "we", "report", "the", "use", "of", "fluorescence", "in", "situ", "hybridization", "(", "FISH", ")", "as", "a", "method", "to", "detect", "and", "characterize", "VHL", "germline", "deletions", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O" ]
[ "We", "reexamined", "a", "group", "of", "VHL", "patients", "shown", "previously", "by", "single", "-", "strand", "conformation", "and", "sequencing", "analysis", "not", "to", "harbor", "point", "mutations", "in", "the", "VHL", "locus", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O" ]
[ "We", "found", "constitutional", "deletions", "in", "29", "of", "30", "VHL", "patients", "in", "this", "group", "using", "cosmid", "and", "P1", "probes", "that", "cover", "the", "VHL", "locus", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O" ]
[ "We", "then", "tested", "six", "phenotypically", "normal", "offspring", "from", "four", "of", "these", "VHL", "families", "two", "were", "found", "to", "carry", "the", "deletion", "and", "the", "other", "four", "were", "deletion", "-", "free", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "addition", ",", "germline", "mosaicism", "of", "the", "VHL", "gene", "was", "identified", "in", "one", "family", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "sum", ",", "FISH", "was", "found", "to", "be", "a", "simple", "and", "reliable", "method", "to", "detect", "VHL", "germline", "deletions", "and", "practically", "useful", "in", "cases", "where", "other", "methods", "of", "screening", "have", "failed", "to", "detect", "a", "VHL", "gene", "abnormality" ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Spectrum", "of", "hSNF5", "/", "INI1", "somatic", "mutations", "in", "human", "cancer", "and", "genotype", "-", "phenotype", "correlations", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "hSNF5", "/", "INI1", "gene", "which", "encodes", "a", "member", "of", "the", "SWI", "/", "SNF", "chromatin", "ATP", "-", "dependent", "remodeling", "complex", ",", "is", "a", "new", "tumor", "suppressor", "gene", "localized", "on", "chromosome", "22q11", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "2", "and", "recently", "shown", "to", "be", "mutated", "in", "malignant", "rhabdoid", "tumors", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]
[ "We", "have", "searched", "for", "hSNF5", "/", "INI1", "mutations", "in", "229", "tumors", "of", "various", "origins", "using", "a", "screening", "method", "based", "on", "denaturing", "high", "-", "performance", "liquid", "chromatography", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "A", "total", "of", "31", "homozygous", "deletions", "and", "36", "point", "alterations", "were", "identified", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Point", "mutations", "were", "scattered", "along", "the", "coding", "sequence", "and", "included", "15", "nonsense", ",", "15", "frameshift", ",", "three", "splice", "site", ",", "two", "missense", "and", "one", "editing", "mutations", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Mutations", "were", "retrieved", "in", "most", "rhabdoid", "tumors", ",", "whatever", "their", "sites", "of", "occurrence", ",", "indicating", "the", "common", "pathogenetic", "origin", "of", "these", "tumors", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O" ]
[ "Recurrent", "hSNF5", "/", "INI1", "alterations", "were", "also", "observed", "in", "choroid", "plexus", "carcinomas", "and", "in", "a", "subset", "of", "central", "primitive", "neuroectodermal", "tumors", "(", "cPNETs", ")", "and", "medulloblastomas", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O" ]
[ "In", "contrast", ",", "hSNF5", "/", "INI1", "point", "mutations", "were", "not", "detected", "in", "breast", "cancers", ",", "Wilms", "tumors", ",", "gliomas", ",", "ependymomas", ",", "sarcomas", "and", "other", "tumor", "types", ",", "even", "though", "most", "analyzed", "cases", "harbored", "loss", "of", "heterozygosity", "at", "22q11", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "2", "loci", "." ]	[ "O", "O", "O" ]
[ "These", "results", "suggest", "that", "rhabdoid", "tumors", ",", "choroid", "plexus", "carcinomas", "and", "a", "subset", "of", "medulloblastomas", "and", "cPNETs", "share", "common", "pathways", "of", "oncogenesis", "related", "to", "hSNF5", "/", "INI1", "alteration", "and", "that", "hSNF5", "/", "INI1", "mutations", "define", "a", "genetically", "homogeneous", "family", "of", "highly", "aggressive", "cancers", "mainly", "occurring", "in", "young", "children", "and", "frequently", ",", "but", "not", "always", ",", "exhibiting", "a", "rhabdoid", "phenotype" ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O" ]
[ "Ataxin", "-", "3", "with", "an", "altered", "conformation", "that", "exposes", "the", "polyglutamine", "domain", "is", "associated", "with", "the", "nuclear", "matrix", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Spinocerebellar", "ataxia", "type", "-", "3", "or", "Machado", "-", "Joseph", "disease", "(", "SCA3", "/", "MJD", ")", "is", "a", "member", "of", "the", "CAG", "/", "polyglutamine", "repeat", "disease", "family", "." ]	[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O" ]
[ "In", "this", "family", "of", "disorders", ",", "a", "normally", "polymorphic", "CAG", "repeat", "becomes", "expanded", ",", "resulting", "in", "expression", "of", "an", "expanded", "polyglutamine", "domain", "in", "the", "disease", "gene", "product", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Experimental", "models", "of", "polyglutamine", "disease", "implicate", "the", "nucleus", "in", "pathogenesis", ";", "however", ",", "the", "link", "between", "intranuclear", "expression", "of", "expanded", "polyglutamine", "and", "neuronal", "dysfunction", "remains", "unclear", "." ]	[ "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O" ]
[ "Here", "we", "demonstrate", "that", "ataxin", "-", "3", ",", "the", "disease", "protein", "in", "SCA3", "/", "MJD", ",", "adopts", "a", "unique", "conformation", "when", "expressed", "within", "the", "nucleus", "of", "transfected", "cells", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "monoclonal", "antibody", "1C2", "is", "known", "preferentially", "to", "bind", "expanded", "polyglutamine", ",", "but", "we", "find", "that", "it", "also", "binds", "a", "fragment", "of", "ataxin", "-", "3", "containing", "a", "normal", "glutamine", "repeat", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "addition", ",", "expression", "of", "ataxin", "-", "3", "within", "the", "nucleus", "exposes", "the", "glutamine", "domain", "of", "the", "full", "-", "length", "non", "-", "pathological", "protein", ",", "allowing", "it", "to", "bind", "the", "monoclonal", "antibody", "1C2", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Fractionation", "and", "immunochemical", "experiments", "indicate", "that", "this", "novel", "conformation", "of", "intranuclear", "ataxin", "-", "3", "is", "not", "due", "to", "proteolysis", ",", "suggesting", "instead", "that", "association", "with", "nuclear", "protein", "(", "s", ")", "alters", "the", "structure", "of", "full", "-", "length", "ataxin", "-", "3", "which", "exposes", "the", "polyglutamine", "domain", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "conformationally", "altered", "ataxin", "-", "3", "is", "bound", "to", "the", "nuclear", "matrix", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "pathological", "form", "of", "ataxin", "-", "3", "with", "an", "expanded", "polyglutamine", "domain", "also", "associates", "with", "the", "nuclear", "matrix", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "These", "data", "suggest", "that", "an", "early", "event", "in", "the", "pathogenesis", "of", "SCA3", "/", "MJD", "may", "be", "an", "altered", "conformation", "of", "ataxin", "-", "3", "within", "the", "nucleus", "that", "exposes", "the", "polyglutamine", "domain", ".", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "human", "MAGEL2", "gene", "and", "its", "mouse", "homologue", "are", "paternally", "expressed", "and", "mapped", "to", "the", "Prader", "-", "Willi", "region", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O" ]
[ "Prader", "-", "Willi", "syndrome", "(", "PWS", ")", "is", "a", "complex", "neurogenetic", "disorder", "." ]	[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]
[ "The", "phenotype", "is", "likely", "to", "be", "a", "contiguous", "gene", "syndrome", "involving", "genes", "which", "are", "paternally", "expressed", "only", ",", "located", "in", "the", "human", "15q11", "-", "q13", "region", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Four", "mouse", "models", "of", "PWS", "have", "been", "reported", "but", "these", "do", "not", "definitively", "allow", "the", "delineation", "of", "the", "critical", "region", "and", "the", "associated", "genes", "involved", "in", "the", "aetiology", "of", "PWS", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O" ]
[ "Moreover", ",", "targeted", "mutagenesis", "of", "mouse", "homologues", "of", "the", "human", "candidate", "PWS", "genes", "does", "not", "appear", "to", "result", "in", "any", "of", "the", "features", "of", "PWS", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O" ]

[ "The", "history", "further", "indicated", "intrauterine", "growth", "retardation", "at", "the", "end", "of", "the", "pregnancy", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "His", "mother", "was", "44", "years", "of", "age", "at", "the", "time", "of", "his", "birth", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "After", "birth", "he", "showed", "hypotonia", "with", "poor", "sucking", ",", "for", "which", "gavage", "feeding", "was", "needed", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Motor", "development", "was", "delayed", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "After", "1", "year", "he", "became", "obese", "despite", "a", "normal", "appetite", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Recurrent", "middle", "ear", "infections", ",", "a", "high", "pain", "threshold", ",", "and", "a", "great", "skill", "with", "jigsaw", "puzzles", "were", "reported", "." ]

[ "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "There", "were", "no", "behavioural", "problems", "or", "sleep", "disturbance", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Chromosomal", "analysis", "was", "normal", "(", "46", ",", "XY", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "DNA", "analysis", "for", "Prader", "-", "Willi", "syndrome", "showed", "no", "abnormalities", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Two", "years", "later", "he", "was", "re", "-", "examined", "because", "we", "thought", "his", "features", "fitted", "the", "PWS", "-", "like", "phenotype", "associated", "with", "maternal", "UPD", "(", "14", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O" ]

[ "At", "that", "time", "precocious", "puberty", "was", "evident", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "DNA", "analysis", "showed", "maternal", "heterodisomy", "for", "chromosome", "14", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "all", "the", "previously", "described", "11", "cases", "with", "maternal", "UPD", "(", "14", ")", ",", "a", "Robertsonian", "translocation", "involving", "chromosome", "14", "was", "detected", "cytogenetically", "before", "DNA", "analysis", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "is", "the", "first", "report", "of", "diagnosis", "of", "maternal", "UPD", "(", "14", ")", "based", "on", "clinical", "features", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "finding", "underlines", "the", "importance", "of", "DNA", "analysis", "for", "maternal", "UPD", "(", "14", ")", "in", "patients", "with", "a", "similar", "PWS", "-", "like", "phenotype", "even", "without", "previous", "identification", "of", "a", "Robertsonian", "translocation", "involving", "chromosome", "14", ".", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Clinical", "and", "genetic", "study", "of", "Friedreich", "ataxia", "in", "an", "Australian", "population", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Friedreich", "ataxia", "is", "an", "autosomal", "recessive", "disorder", "caused", "by", "mutations", "in", "the", "FRDA", "gene", "that", "encodes", "a", "210", "-", "amino", "acid", "protein", "called", "frataxin", "." ]

[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "An", "expansion", "of", "a", "GAA", "trinucleotide", "repeat", "in", "intron", "1", "of", "the", "gene", "is", "present", "in", "more", "than", "95", "%", "of", "mutant", "alleles", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Of", "the", "83", "people", "we", "studied", "who", "have", "mutations", "in", "FRDA", ",", "78", "are", "homozygous", "for", "an", "expanded", "GAA", "repeat", ";", "the", "other", "five", "patients", "have", "an", "expansion", "in", "one", "allele", "and", "a", "point", "mutation", "in", "the", "other", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Here", "we", "present", "a", "detailed", "clinical", "and", "genetic", "study", "of", "a", "subset", "of", "51", "patients", "homozygous", "for", "an", "expansion", "of", "the", "GAA", "repeat", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "found", "a", "correlation", "between", "the", "size", "of", "the", "smaller", "of", "the", "two", "expanded", "alleles", "and", "age", "at", "onset", ",", "age", "into", "wheelchair", ",", "scoliosis", ",", "impaired", "vibration", "sense", ",", "and", "the", "presence", "of", "foot", "deformity", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]

[ "There", "was", "no", "significant", "correlation", "between", "the", "size", "of", "the", "smaller", "allele", "and", "cardiomyopathy", ",", "diabetes", "mellitus", ",", "loss", "of", "proprioception", ",", "or", "bladder", "symptoms", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]

[ "The", "larger", "allele", "size", "correlated", "with", "bladder", "symptoms", "and", "the", "presence", "of", "foot", "deformity", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]

[ "The", "duration", "of", "disease", "is", "correlated", "with", "wheelchair", "use", "and", "the", "presence", "of", "diabetes", ",", "scoliosis", ",", "bladder", "symptoms", "and", "impaired", "proprioception", ",", "and", "vibration", "sense", "but", "no", "other", "complications", "studied", ".", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Novel", "mutations", "in", "XLRS1", "causing", "retinoschisis", ",", "including", "first", "evidence", "of", "putative", "leader", "sequence", "change", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Juvenile", "retinoschisis", "is", "an", "X", "-", "linked", "recessive", "disease", "caused", "by", "mutations", "in", "the", "XLRS1", "gene", "." ]

[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "screened", "31", "new", "unrelated", "patients", "and", "families", "for", "XLRS1", "mutations", "in", "addition", "to", "previously", "reported", "mutations", "for", "60", "of", "our", "families", "(", "Retinoschisis", "Consortium", ",", "Hum", "Mol", "Genet", "1998", ";", "7", "1185", "-", "1192", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Twenty", "-", "three", "different", "mutations", "including", "12", "novel", "ones", "were", "identified", "in", "28", "patients", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Mutations", "identified", "in", "this", "study", "include", "19", "missense", "mutations", ",", "two", "nonsense", "mutations", ",", "one", "intragenic", "deletion", ",", "four", "microdeletions", ",", "one", "insertion", ",", "and", "one", "intronic", "sequence", "substitution", "that", "is", "likely", "to", "result", "in", "a", "splice", "site", "defect", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Two", "novel", "mutations", ",", "c", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "38T", "-", "-", ">", "C", "(", "L13P", ")", "and", "c", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "667T", "-", "-", ">", "C", "(", "C223R", ")", ",", "respectively", ",", "present", "the", "first", "genetic", "evidence", "for", "the", "functional", "significance", "of", "the", "putative", "leader", "peptide", "sequence", "and", "for", "the", "functional", "significance", "at", "the", "carboxyl", "terminal", "of", "the", "XLRS1", "protein", "beyond", "the", "discoidin", "domain", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Mutations", "in", "25", "of", "the", "families", "were", "localized", "to", "exons", "4", "-", "6", ",", "emphasizing", "the", "critical", "functional", "significance", "of", "the", "discoidin", "domain", "of", "the", "XLRS1", "protein" ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Growth", "hormone", "treatment", "increases", "CO", "(", "2", ")", "response", ",", "ventilation", "and", "central", "inspiratory", "drive", "in", "children", "with", "Prader", "-", "Willi", "syndrome", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]

[ "We", "studied", "whether", "the", "beneficial", "effects", "of", "growth", "hormone", "(", "GH", ")", "treatment", "on", "growth", "and", "body", "composition", "in", "PWS", "are", "accompanied", "by", "an", "improvement", "in", "respiratory", "function", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "measured", "resting", "ventilation", ",", "airway", "occlusion", "pressure", "(", "P", "(", "0", ".", "1", ")", ")", "and", "ventilatory", "response", "to", "CO", "(", "2", ")", "in", "nine", "children", ",", "aged", "7", "-", "14", "years", ",", "before", "and", "6", "-", "9", "months", "after", "the", "start", "of", "GH", "treatment", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "During", "GH", "treatment", ",", "resting", "ventilation", "increased", "by", "26", "%", ",", "P", "(", "0", ".", "1", ")", "by", "72", "%", "and", "the", "response", "to", "CO", "(", "2", ")", "by", "65", "%", "(", "P", "<", "0", ".", "002", ",", "<", "0", ".", "04", "and", "<", "0", ".", "02", ",", "respectively", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "observed", "increase", "in", "ventilatory", "output", "was", "not", "correlated", "to", "changes", "in", "body", "mass", "index", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "CONCLUSION", "Treatment", "of", "children", "with", "Prader", "-", "Willi", "syndrome", "(", "PWS", ")", "seems", "to", "have", "a", "stimulatory", "effect", "on", "central", "respiratory", "structures", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "observed", "increase", "in", "ventilation", "and", "inspiratory", "drive", "may", "contribute", "to", "the", "improved", "activity", "level", "reported", "by", "parents", "of", "PWS", "children", "during", "growth", "hormone", "therapy" ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "G130V", ",", "a", "common", "FRDA", "point", "mutation", ",", "appears", "to", "have", "arisen", "from", "a", "common", "founder", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Friedreich", "ataxia", "(", "FRDA", ")", "is", "the", "most", "common", "inherited", "ataxia", "." ]

[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]

[ "About", "98", "%", "of", "mutant", "alleles", "have", "an", "expansion", "of", "a", "GAA", "trinucleotide", "repeat", "in", "intron", "1", "of", "the", "affected", "gene", ",", "FRDA", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "other", "2", "%", "are", "point", "mutations", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Of", "the", "17", "point", "mutations", "so", "far", "described", ",", "three", "appear", "to", "be", "more", "common", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "One", "of", "these", "is", "the", "G130V", "mutation", "in", "exon", "4", "of", "FRDA", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "G130V", ",", "when", "present", "with", "an", "expanded", "GAA", "repeat", "on", "the", "other", "allele", ",", "is", "associated", "with", "an", "atypical", "FRDA", "phenotype", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O" ]

[ "Haplotype", "analysis", "was", "undertaken", "on", "the", "four", "families", "who", "have", "been", "described", "with", "this", "mutation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "results", "suggest", "a", "common", "founder", "for", "this", "mutation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Although", "marked", "differences", "in", "extragenic", "marker", "haplotypes", "were", "seen", "in", "one", "family", ",", "similar", "intragenic", "haplotyping", "suggests", "the", "same", "mutation", "founder", "for", "this", "family", "with", "the", "differences", "explicable", "by", "two", "recombination", "events", ".", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Synergistic", "effect", "of", "histone", "hyperacetylation", "and", "DNA", "demethylation", "in", "the", "reactivation", "of", "the", "FMR1", "gene", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Most", "fragile", "X", "syndrome", "patients", "have", "expansion", "of", "a", "(", "CGG", ")", "(", "n", ")", "sequence", "with", ">", "200", "repeats", "(", "full", "mutation", ")", "in", "the", "FMR1", "gene", "responsible", "for", "this", "condition", "." ]

[ "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Hypermethylation", "of", "the", "expanded", "repeat", "and", "of", "the", "FMR1", "promoter", "is", "almost", "always", "present", "and", "apparently", "suppresses", "transcription", ",", "resulting", "in", "absence", "of", "the", "FMR1", "protein", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "recently", "showed", "that", "transcriptional", "reactivation", "of", "FMR1", "full", "mutations", "can", "be", "achieved", "by", "inducing", "DNA", "demethylation", "with", "5", "-", "azadeoxycytidine", "(", "5", "-", "azadC", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "level", "of", "histone", "acetylation", "is", "another", "important", "factor", "in", "regulating", "gene", "expression", ";", "therefore", ",", "we", "treated", "lymphoblastoid", "cell", "lines", "of", "non", "-", "mosaic", "full", "mutation", "patients", "with", "three", "drugs", "capable", "of", "inducing", "histone", "hyperacetylation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "observed", "a", "consistent", ",", "although", "modest", ",", "reactivation", "of", "the", "FMR1", "gene", "with", "4", "-", "phenylbutyrate", ",", "sodium", "butyrate", "and", "trichostatin", "A", ",", "as", "shown", "by", "RT", "-", "PCR", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "However", ",", "we", "report", "that", "combining", "these", "drugs", "with", "5", "-", "azadC", "results", "in", "a", "2", "-", "to", "5", "-", "fold", "increase", "in", "FMR1", "mRNA", "levels", "obtained", "with", "5", "-", "azadC", "alone", ",", "thus", "showing", "a", "marked", "synergistic", "effect", "of", "histone", "hyperacetylation", "and", "DNA", "demethylation", "in", "the", "reactivation", "of", "FMR1", "full", "mutations", ".", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Constitutional", "von", "Hippel", "-", "Lindau", "(", "VHL", ")", "gene", "deletions", "detected", "in", "VHL", "families", "by", "fluorescence", "in", "situ", "hybridization", "." ]

[ "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "von", "Hippel", "-", "Lindau", "(", "VHL", ")", "disease", "is", "an", "autosomal", "dominantly", "inherited", "cancer", "syndrome", "predisposing", "to", "a", "variety", "of", "tumor", "types", "that", "include", "retinal", "hemangioblastomas", ",", "hemangioblastomas", "of", "the", "central", "nervous", "system", ",", "renal", "cell", "carcinomas", ",", "pancreatic", "cysts", "and", "tumors", ",", "pheochromocytomas", ",", "endolymphatic", "sac", "tumors", ",", "and", "epididymal", "cystadenomas", "[", "W", "." ]

[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O" ]

[ "M", "." ]

[ "O", "O" ]

[ "Linehan", "et", "al", ".", ",", "J", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Am", ".", "Med", ".", "Assoc", ".", ",", "273", "564", "-", "570", ",", "1995", ";", "E", ".", "A", ".", "Maher", "and", "W", ".", "G", ".", "Kaelin", ",", "Jr", ".", ",", "Medicine", "(", "Baltimore", ")", ",", "76", "381", "-", "391", ",", "1997", ";", "W", ".", "M", ".", "Linehan", "and", "R", ".", "D", ".", "Klausner", ",", "In", "B", ".", "Vogelstein", "and", "K", ".", "Kinzler", "(", "eds", ".", ")", ",", "The", "Genetic", "Basis", "of", "Human", "Cancer", ",", "pp", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "455", "-", "473", ",", "McGraw", "-", "Hill", ",", "1998", "]", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "VHL", "gene", "was", "localized", "to", "chromosome", "3p25", "-", "26", "and", "cloned", "[", "F", ".", "Latif", "et", "al", ".", ",", "Science", "(", "Washington", "DC", ")", ",", "260", "1317", "-", "1320", ",", "1993", "]", "." ]

[ "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Germline", "mutations", "in", "the", "VHL", "gene", "have", "been", "detected", "in", "the", "majority", "of", "VHL", "kindreds", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O" ]

[ "The", "reported", "frequency", "of", "detection", "of", "VHL", "germline", "mutations", "has", "varied", "from", "39", "to", "80", "%", "(", "J", ".", "M", ".", "Whaley", "et", "al", ".", ",", "Am", ".", "J", ".", "Hum", ".", "Genet", ".", ",", "55", "1092", "-", "1102", ",", "1994", ";", "Clinical", "Research", "Group", "for", "Japan", ",", "Hum", ".", "Mol", ".", "Genet", ".", ",", "4", "2233", "-", "2237", ",", "1995", ";", "F", ".", "Chen", "et", "al", ".", ",", "Hum", ".", "Mutat", ".", ",", "5", "66", "-", "75", ",", "1995", ";", "E", ".", "R", ".", "Maher", "et", "al", ".", ",", "J", ".", "Med", ".", "Genet", ".", ",", "33", "328", "-", "332", ",", "1996", ";", "B", ".", "Zbar", ",", "Cancer", "Surv", ".", ",", "25", "219", "-", "232", ",", "1995", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Recently", "a", "quantitative", "Southern", "blotting", "procedure", "was", "found", "to", "improve", "this", "frequency", "(", "C", ".", "Stolle", "et", "al", ".", ",", "Hum", ".", "Mutat", ".", ",", "12", "417", "-", "423", ",", "1998", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "the", "present", "study", ",", "we", "report", "the", "use", "of", "fluorescence", "in", "situ", "hybridization", "(", "FISH", ")", "as", "a", "method", "to", "detect", "and", "characterize", "VHL", "germline", "deletions", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O" ]

[ "We", "reexamined", "a", "group", "of", "VHL", "patients", "shown", "previously", "by", "single", "-", "strand", "conformation", "and", "sequencing", "analysis", "not", "to", "harbor", "point", "mutations", "in", "the", "VHL", "locus", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O" ]

[ "We", "found", "constitutional", "deletions", "in", "29", "of", "30", "VHL", "patients", "in", "this", "group", "using", "cosmid", "and", "P1", "probes", "that", "cover", "the", "VHL", "locus", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O" ]

[ "We", "then", "tested", "six", "phenotypically", "normal", "offspring", "from", "four", "of", "these", "VHL", "families", "two", "were", "found", "to", "carry", "the", "deletion", "and", "the", "other", "four", "were", "deletion", "-", "free", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "addition", ",", "germline", "mosaicism", "of", "the", "VHL", "gene", "was", "identified", "in", "one", "family", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "sum", ",", "FISH", "was", "found", "to", "be", "a", "simple", "and", "reliable", "method", "to", "detect", "VHL", "germline", "deletions", "and", "practically", "useful", "in", "cases", "where", "other", "methods", "of", "screening", "have", "failed", "to", "detect", "a", "VHL", "gene", "abnormality" ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Spectrum", "of", "hSNF5", "/", "INI1", "somatic", "mutations", "in", "human", "cancer", "and", "genotype", "-", "phenotype", "correlations", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "hSNF5", "/", "INI1", "gene", "which", "encodes", "a", "member", "of", "the", "SWI", "/", "SNF", "chromatin", "ATP", "-", "dependent", "remodeling", "complex", ",", "is", "a", "new", "tumor", "suppressor", "gene", "localized", "on", "chromosome", "22q11", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "2", "and", "recently", "shown", "to", "be", "mutated", "in", "malignant", "rhabdoid", "tumors", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]

[ "We", "have", "searched", "for", "hSNF5", "/", "INI1", "mutations", "in", "229", "tumors", "of", "various", "origins", "using", "a", "screening", "method", "based", "on", "denaturing", "high", "-", "performance", "liquid", "chromatography", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "A", "total", "of", "31", "homozygous", "deletions", "and", "36", "point", "alterations", "were", "identified", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Point", "mutations", "were", "scattered", "along", "the", "coding", "sequence", "and", "included", "15", "nonsense", ",", "15", "frameshift", ",", "three", "splice", "site", ",", "two", "missense", "and", "one", "editing", "mutations", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Mutations", "were", "retrieved", "in", "most", "rhabdoid", "tumors", ",", "whatever", "their", "sites", "of", "occurrence", ",", "indicating", "the", "common", "pathogenetic", "origin", "of", "these", "tumors", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O" ]

[ "Recurrent", "hSNF5", "/", "INI1", "alterations", "were", "also", "observed", "in", "choroid", "plexus", "carcinomas", "and", "in", "a", "subset", "of", "central", "primitive", "neuroectodermal", "tumors", "(", "cPNETs", ")", "and", "medulloblastomas", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O" ]

[ "In", "contrast", ",", "hSNF5", "/", "INI1", "point", "mutations", "were", "not", "detected", "in", "breast", "cancers", ",", "Wilms", "tumors", ",", "gliomas", ",", "ependymomas", ",", "sarcomas", "and", "other", "tumor", "types", ",", "even", "though", "most", "analyzed", "cases", "harbored", "loss", "of", "heterozygosity", "at", "22q11", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "2", "loci", "." ]

[ "O", "O", "O" ]

[ "These", "results", "suggest", "that", "rhabdoid", "tumors", ",", "choroid", "plexus", "carcinomas", "and", "a", "subset", "of", "medulloblastomas", "and", "cPNETs", "share", "common", "pathways", "of", "oncogenesis", "related", "to", "hSNF5", "/", "INI1", "alteration", "and", "that", "hSNF5", "/", "INI1", "mutations", "define", "a", "genetically", "homogeneous", "family", "of", "highly", "aggressive", "cancers", "mainly", "occurring", "in", "young", "children", "and", "frequently", ",", "but", "not", "always", ",", "exhibiting", "a", "rhabdoid", "phenotype" ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O" ]

[ "Ataxin", "-", "3", "with", "an", "altered", "conformation", "that", "exposes", "the", "polyglutamine", "domain", "is", "associated", "with", "the", "nuclear", "matrix", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Spinocerebellar", "ataxia", "type", "-", "3", "or", "Machado", "-", "Joseph", "disease", "(", "SCA3", "/", "MJD", ")", "is", "a", "member", "of", "the", "CAG", "/", "polyglutamine", "repeat", "disease", "family", "." ]

[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O" ]

[ "In", "this", "family", "of", "disorders", ",", "a", "normally", "polymorphic", "CAG", "repeat", "becomes", "expanded", ",", "resulting", "in", "expression", "of", "an", "expanded", "polyglutamine", "domain", "in", "the", "disease", "gene", "product", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Experimental", "models", "of", "polyglutamine", "disease", "implicate", "the", "nucleus", "in", "pathogenesis", ";", "however", ",", "the", "link", "between", "intranuclear", "expression", "of", "expanded", "polyglutamine", "and", "neuronal", "dysfunction", "remains", "unclear", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O" ]

[ "Here", "we", "demonstrate", "that", "ataxin", "-", "3", ",", "the", "disease", "protein", "in", "SCA3", "/", "MJD", ",", "adopts", "a", "unique", "conformation", "when", "expressed", "within", "the", "nucleus", "of", "transfected", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "monoclonal", "antibody", "1C2", "is", "known", "preferentially", "to", "bind", "expanded", "polyglutamine", ",", "but", "we", "find", "that", "it", "also", "binds", "a", "fragment", "of", "ataxin", "-", "3", "containing", "a", "normal", "glutamine", "repeat", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "addition", ",", "expression", "of", "ataxin", "-", "3", "within", "the", "nucleus", "exposes", "the", "glutamine", "domain", "of", "the", "full", "-", "length", "non", "-", "pathological", "protein", ",", "allowing", "it", "to", "bind", "the", "monoclonal", "antibody", "1C2", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Fractionation", "and", "immunochemical", "experiments", "indicate", "that", "this", "novel", "conformation", "of", "intranuclear", "ataxin", "-", "3", "is", "not", "due", "to", "proteolysis", ",", "suggesting", "instead", "that", "association", "with", "nuclear", "protein", "(", "s", ")", "alters", "the", "structure", "of", "full", "-", "length", "ataxin", "-", "3", "which", "exposes", "the", "polyglutamine", "domain", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "conformationally", "altered", "ataxin", "-", "3", "is", "bound", "to", "the", "nuclear", "matrix", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "pathological", "form", "of", "ataxin", "-", "3", "with", "an", "expanded", "polyglutamine", "domain", "also", "associates", "with", "the", "nuclear", "matrix", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "data", "suggest", "that", "an", "early", "event", "in", "the", "pathogenesis", "of", "SCA3", "/", "MJD", "may", "be", "an", "altered", "conformation", "of", "ataxin", "-", "3", "within", "the", "nucleus", "that", "exposes", "the", "polyglutamine", "domain", ".", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "human", "MAGEL2", "gene", "and", "its", "mouse", "homologue", "are", "paternally", "expressed", "and", "mapped", "to", "the", "Prader", "-", "Willi", "region", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O" ]

[ "Prader", "-", "Willi", "syndrome", "(", "PWS", ")", "is", "a", "complex", "neurogenetic", "disorder", "." ]

[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]

[ "The", "phenotype", "is", "likely", "to", "be", "a", "contiguous", "gene", "syndrome", "involving", "genes", "which", "are", "paternally", "expressed", "only", ",", "located", "in", "the", "human", "15q11", "-", "q13", "region", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Four", "mouse", "models", "of", "PWS", "have", "been", "reported", "but", "these", "do", "not", "definitively", "allow", "the", "delineation", "of", "the", "critical", "region", "and", "the", "associated", "genes", "involved", "in", "the", "aetiology", "of", "PWS", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O" ]

[ "Moreover", ",", "targeted", "mutagenesis", "of", "mouse", "homologues", "of", "the", "human", "candidate", "PWS", "genes", "does", "not", "appear", "to", "result", "in", "any", "of", "the", "features", "of", "PWS", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O" ]