disi-unibo-nlp/ncbi · Datasets at Hugging Face

tokens listlengths 2 123	ner_tags listlengths 2 123
[ "Therefore", ",", "the", "isolation", "of", "new", "genes", "in", "this", "region", "remains", "crucial", "for", "a", "better", "understanding", "of", "the", "molecular", "basis", "of", "PWS", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O" ]
[ "In", "this", "manuscript", ",", "we", "report", "the", "characterization", "of", "MAGEL2", "and", "its", "mouse", "homologue", "Magel2", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "These", "are", "located", "in", "the", "human", "15q11", "-", "q13", "and", "mouse", "7C", "regions", ",", "in", "close", "proximity", "to", "NDN", "/", "Ndn", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "By", "northern", "blot", "analysis", "we", "did", "not", "detect", "any", "expression", "of", "MAGEL2", "/", "Magel2", "but", "by", "RT", "-", "PCR", "analysis", ",", "specific", "expression", "was", "detected", "in", "fetal", "and", "adult", "brain", "and", "in", "placenta", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Both", "genes", "are", "intronless", "with", "tandem", "direct", "repeat", "sequences", "contained", "within", "a", "CpG", "island", "in", "the", "5", "-", "untranscribed", "region", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "transcripts", "encode", "putative", "proteins", "that", "are", "homologous", "to", "the", "MAGE", "proteins", "and", "NDN", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Moreover", ",", "MAGEL2", "/", "Magel2", "are", "expressed", "only", "from", "the", "paternal", "allele", "in", "brain", ",", "suggesting", "a", "potential", "role", "in", "the", "aetiology", "of", "PWS", "and", "its", "mouse", "model", ",", "respectively", ".", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "cDNA", "microarrays", "detect", "activation", "of", "a", "myogenic", "transcription", "program", "by", "the", "PAX3", "-", "FKHR", "fusion", "oncogene", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Alveolar", "rhabdomyosarcoma", "is", "an", "aggressive", "pediatric", "cancer", "of", "striated", "muscle", "characterized", "in", "60", "%", "of", "cases", "by", "a", "t", "(", "2", ";", "13", ")", "(", "q35", ";", "q14", ")", "." ]	[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "results", "in", "the", "fusion", "of", "PAX3", ",", "a", "developmental", "transcription", "factor", "required", "for", "limb", "myogenesis", ",", "with", "FKHR", ",", "a", "member", "of", "the", "forkhead", "family", "of", "transcription", "factors", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "resultant", "PAX3", "-", "FKHR", "gene", "possesses", "transforming", "properties", ";", "however", ",", "the", "effects", "of", "this", "chimeric", "oncogene", "on", "gene", "expression", "are", "largely", "unknown", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "To", "investigate", "the", "actions", "of", "these", "transcription", "factors", ",", "both", "Pax3", "and", "PAX3", "-", "FKHR", "were", "introduced", "into", "NIH", "3T3", "cells", ",", "and", "the", "resultant", "gene", "expression", "changes", "were", "analyzed", "with", "a", "murine", "cDNA", "microarray", "containing", "2", ",", "225", "elements", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "found", "that", "PAX3", "-", "FKHR", "but", "not", "PAX3", "activated", "a", "myogenic", "transcription", "program", "including", "the", "induction", "of", "transcription", "factors", "MyoD", ",", "Myogenin", ",", "Six1", ",", "and", "Slug", "as", "well", "as", "a", "battery", "of", "genes", "involved", "in", "several", "aspects", "of", "muscle", "function", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Notable", "among", "this", "group", "were", "the", "growth", "factor", "gene", "Igf2", "and", "its", "binding", "protein", "Igfbp5", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Relevance", "of", "this", "model", "was", "suggested", "by", "verification", "that", "three", "of", "these", "genes", "(", "IGFBP5", ",", "HSIX1", ",", "and", "Slug", ")", "were", "also", "expressed", "in", "alveolar", "rhabdomyosarcoma", "cell", "lines", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O" ]
[ "This", "study", "utilizes", "cDNA", "microarrays", "to", "elucidate", "the", "pattern", "of", "gene", "expression", "induced", "by", "an", "oncogenic", "transcription", "factor", "and", "demonstrates", "the", "profound", "myogenic", "properties", "of", "PAX3", "-", "FKHR", "in", "NIH", "3T3", "cells", ".", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Experimental", "hemochromatosis", "due", "to", "MHC", "class", "I", "HFE", "deficiency", ":", "immune", "status", "and", "iron", "metabolism", "." ]	[ "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "puzzling", "linkage", "between", "genetic", "hemochromatosis", "and", "histocompatibility", "loci", "became", "even", "more", "so", "when", "the", "gene", "involved", ",", "HFE", ",", "was", "identified", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Indeed", ",", "within", "the", "well", "defined", ",", "mainly", "peptide", "-", "binding", ",", "MHC", "class", "I", "family", "of", "molecules", ",", "HFE", "seems", "to", "perform", "an", "unusual", "yet", "essential", "function", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "As", "yet", ",", "our", "understanding", "of", "HFE", "function", "in", "iron", "homeostasis", "is", "only", "partial", ";", "an", "even", "more", "open", "question", "is", "its", "possible", "role", "in", "the", "immune", "system", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "To", "advance", "on", "both", "of", "these", "avenues", ",", "we", "report", "the", "deletion", "of", "HFE", "alpha1", "and", "alpha2", "putative", "ligand", "binding", "domains", "in", "vivo", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "HFE", "-", "deficient", "animals", "were", "analyzed", "for", "a", "comprehensive", "set", "of", "metabolic", "and", "immune", "parameters", "." ]	[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Faithfully", "mimicking", "human", "hemochromatosis", ",", "mice", "homozygous", "for", "this", "deletion", "develop", "iron", "overload", ",", "characterized", "by", "a", "higher", "plasma", "iron", "content", "and", "a", "raised", "transferrin", "saturation", "as", "well", "as", "an", "elevated", "hepatic", "iron", "load", "." ]	[ "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "primary", "defect", "could", ",", "indeed", ",", "be", "traced", "to", "an", "augmented", "duodenal", "iron", "absorption", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "parallel", ",", "measurement", "of", "the", "gut", "mucosal", "iron", "content", "as", "well", "as", "iron", "regulatory", "proteins", "allows", "a", "more", "informed", "evaluation", "of", "various", "hypotheses", "regarding", "the", "precise", "role", "of", "HFE", "in", "iron", "homeostasis", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Finally", ",", "an", "extensive", "phenotyping", "of", "primary", "and", "secondary", "lymphoid", "organs", "including", "the", "gut", "provides", "no", "compelling", "evidence", "for", "an", "obvious", "immune", "-", "linked", "function", "for", "HFE", ".", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Somatic", "rearrangement", "of", "chromosome", "14", "in", "human", "lymphocytes", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Ataxia", "-", "telangiectasia", "is", "a", "rare", "genetic", "disorder", "associated", "with", "immune", "deficiency", ",", "chromosome", "instability", ",", "and", "a", "predisposition", "to", "lymphoid", "malignancy", "." ]	[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]
[ "We", "have", "detected", "chromosomally", "anomalous", "clones", "of", "lymphocytes", "in", "eight", "patients", "with", "this", "disorder", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Chromosome", "banding", "disclosed", "that", "the", "clones", "are", "consistently", "marked", "by", "structural", "rearrangement", "of", "the", "long", "arm", "(", "q", ")", "of", "chromosome", "14", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "A", "translocation", "involving", "14q", "was", "found", "in", "clones", "obtained", "from", "seven", "of", "the", "eight", "patients", "whereas", "a", "ring", "14", "chromosome", "was", "found", "in", "a", "clone", "obtained", "from", "the", "other", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "These", "findings", "as", "well", "as", "data", "obtained", "by", "others", "for", "patients", "with", "ataxia", "-", "telangiectasia", "suggest", "that", "structural", "rearrangement", "of", "14q", "is", "the", "initial", "chromosomal", "change", "in", "lymphocyte", "clones", "of", "patients", "with", "this", "disorder", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Chromosomes", "of", "lymphocytes", "from", "one", "of", "the", "patients", "were", "studied", "before", "and", "after", "the", "onset", "of", "chronic", "lymphocytic", "leukemia", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]
[ "Before", "leukemia", "was", "diagnosed", ",", "the", "patient", "had", "a", "lymphocyte", "clone", "with", "a", "14q", "translocation", "." ]	[ "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "clone", "appears", "to", "have", "given", "rise", "to", "the", "leukemic", "cells", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O" ]
[ "We", "hypothesize", "that", "structural", "rearrangement", "of", "14q", "is", "directly", "related", "to", "abnormal", "growth", "of", "lymphocytes", "and", "that", "it", "may", "be", "a", "step", "toward", "the", "development", "of", "lymphoid", "malignancies", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]
[ "Increasing", "evidence", ",", "provided", "by", "others", ",", "for", "the", "nonrandom", "involvement", "of", "14q", "in", "African", "-", "type", "Burkitts", "lymphoma", "and", "other", "lymphoid", "neoplasms", "further", "strengthens", "this", "hypothesis", ".", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Exon", "9", "mutations", "in", "the", "WT1", "gene", ",", "without", "influencing", "KTS", "splice", "isoforms", ",", "are", "also", "responsible", "for", "Frasier", "syndrome", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]
[ "We", "report", "new", "mutations", "in", "exon", "9", "of", "the", "WT1", "gene", "that", "did", "not", "alter", "the", "ratio", "of", "+", "/", "-", "KTS", "splice", "isoforms", "in", "two", "unrelated", "patients", "with", "Frasier", "syndrome", "(", "FS", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O" ]
[ "The", "mutation", "of", "intron", "9", "inducing", "defective", "alternative", "splicing", "was", "reported", "to", "be", "responsible", "for", "this", "syndrome", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "mutations", "found", "in", "our", "cases", "occurred", "in", "the", "same", "exon", "of", "the", "WT1", "gene", "as", "detected", "in", "Denys", "-", "Drash", "syndrome", "(", "DDS", ")", "and", "could", "not", "be", "explained", "by", "the", "previously", "proposed", "mechanism", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "results", "suggest", "that", "the", "two", "syndromes", "originate", "from", "the", "same", "WT1", "gene", "abnormality", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]
[ "From", "a", "molecular", "biological", "point", "of", "view", ",", "we", "concluded", "that", "the", "two", "diseases", "were", "not", "separable", ",", "and", "that", "FS", "should", "be", "included", "as", "an", "atypical", "form", "of", "DDS", ".", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O" ]
[ "Splice", "-", "site", "mutation", "in", "the", "PDS", "gene", "may", "result", "in", "intrafamilial", "variability", "for", "deafness", "in", "Pendred", "syndrome", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]
[ "Pendred", "syndrome", "is", "a", "recessive", "inherited", "disorder", "that", "consists", "of", "developmental", "abnormalities", "of", "the", "cochlea", ",", "sensorineural", "hearing", "loss", ",", "and", "diffuse", "thyroid", "enlargement", "(", "goiter", ")", "." ]	[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O" ]
[ "This", "disorder", "may", "account", "for", "up", "to", "10", "%", "of", "cases", "of", "hereditary", "deafness", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]
[ "The", "disease", "gene", "(", "PDS", ")", "has", "been", "mapped", "to", "chromosome", "7q22", "-", "q31", ",", "and", "encodes", "a", "chloride", "-", "iodide", "transport", "protein", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "performed", "mutation", "analysis", "of", "individual", "exons", "of", "the", "PDS", "gene", "in", "one", "Spanish", "family", "that", "shows", "intrafamilial", "variability", "of", "the", "deafness", "phenotype", "(", "two", "patients", "with", "profound", "and", "one", "with", "moderate", "-", "severe", "deafness", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O" ]
[ "We", "identified", "a", "new", "splice", "-", "site", "mutation", "affecting", "intron", "4", "of", "the", "PDS", "gene", ",", "at", "nucleotide", "position", "639", "+", "7", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "RNA", "analysis", "from", "lymphocytes", "of", "the", "affected", "patients", "showed", "that", "mutation", "639", "+", "7A", "-", "-", ">", "G", "generates", "a", "new", "donor", "splice", "site", ",", "leading", "to", "an", "mRNA", "with", "an", "insertion", "of", "six", "nucleotides", "from", "intron", "4", "of", "PDS", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Since", "the", "newly", "created", "donor", "splice", "site", "is", "likely", "to", "compete", "with", "the", "normal", "one", ",", "variations", "of", "the", "levels", "of", "normal", "and", "aberrant", "transcripts", "of", "the", "PDS", "gene", "in", "the", "cochlea", "may", "explain", "the", "variability", "in", "the", "deafness", "presentation", ".", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O" ]
[ "The", "molecular", "basis", "of", "Sjogren", "-", "Larsson", "syndrome", ":", "mutation", "analysis", "of", "the", "fatty", "aldehyde", "dehydrogenase", "gene", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Sjogren", "-", "Larsson", "syndrome", "(", "SLS", ")", "is", "an", "autosomal", "recessive", "disorder", "characterized", "by", "ichthyosis", ",", "mental", "retardation", ",", "spasticity", ",", "and", "deficient", "activity", "of", "fatty", "aldehyde", "dehydrogenase", "(", "FALDH", ")", "." ]	[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O" ]
[ "To", "define", "the", "molecular", "defects", "causing", "SLS", ",", "we", "performed", "mutation", "analysis", "of", "the", "FALDH", "gene", "in", "probands", "from", "63", "kindreds", "with", "SLS", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O" ]
[ "Among", "these", "patients", ",", "49", "different", "mutations", "-", "including", "10", "deletions", ",", "2", "insertions", ",", "22", "amino", "acid", "substitutions", ",", "3", "nonsense", "mutations", ",", "9", "splice", "-", "site", "defects", ",", "and", "3", "complex", "mutations", "-", "were", "found", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "All", "of", "the", "patients", "with", "SLS", "were", "found", "to", "carry", "mutations", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Nineteen", "of", "the", "missense", "mutations", "resulted", "in", "a", "severe", "reduction", "of", "FALDH", "enzyme", "catalytic", "activity", "when", "expressed", "in", "mammalian", "cells", ",", "but", "one", "mutation", "(", "798G", "-", "-", ">", "C", "[", "K266N", "]", ")", "seemed", "to", "have", "a", "greater", "effect", "on", "mRNA", "stability", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "splice", "-", "site", "mutations", "led", "to", "exon", "skipping", "or", "utilization", "of", "cryptic", "acceptor", "-", "splice", "sites", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Thirty", "-", "seven", "mutations", "were", "private", ",", "and", "12", "mutations", "were", "seen", "in", "two", "or", "more", "probands", "of", "European", "or", "Middle", "Eastern", "descent", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Four", "single", "-", "nucleotide", "polymorphisms", "(", "SNPs", ")", "were", "found", "in", "the", "FALDH", "gene", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "At", "least", "four", "of", "the", "common", "mutations", "(", "551C", "-", "-", ">", "T", ",", "682C", "-", "-", ">", "T", ",", "733G", "-", "-", ">", "A", ",", "and", "798", "+", "1delG", ")", "were", "associated", "with", "multiple", "SNP", "haplotypes", ",", "suggesting", "that", "these", "mutations", "originated", "independently", "on", "more", "than", "one", "occasion", "or", "were", "ancient", "SLS", "genes", "that", "had", "undergone", "intragenic", "recombination", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Our", "results", "demonstrate", "that", "SLS", "is", "caused", "by", "a", "strikingly", "heterogeneous", "group", "of", "mutations", "in", "the", "FALDH", "gene", "and", "provide", "a", "framework", "for", "understanding", "the", "genetic", "basis", "of", "SLS", "and", "the", "development", "of", "DNA", "-", "based", "diagnostic", "tests", ".", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Loss", "-", "of", "-", "function", "mutations", "in", "the", "cathepsin", "C", "gene", "result", "in", "periodontal", "disease", "and", "palmoplantar", "keratosis", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]
[ "Papillon", "-", "Lefevre", "syndrome", ",", "or", "keratosis", "palmoplantaris", "with", "periodontopathia", "(", "PLS", ",", "MIM", "245000", ")", ",", "is", "an", "autosomal", "recessive", "disorder", "that", "is", "mainly", "ascertained", "by", "dentists", "because", "of", "the", "severe", "periodontitis", "that", "afflicts", "patients", "." ]	[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Both", "the", "deciduous", "and", "permanent", "dentitions", "are", "affected", ",", "resulting", "in", "premature", "tooth", "loss", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]
[ "Palmoplantar", "keratosis", ",", "varying", "from", "mild", "psoriasiform", "scaly", "skin", "to", "overt", "hyperkeratosis", ",", "typically", "develops", "within", "the", "first", "three", "years", "of", "life", "." ]	[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Keratosis", "also", "affects", "other", "sites", "such", "as", "elbows", "and", "knees", "." ]	[ "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Most", "PLS", "patients", "display", "both", "periodontitis", "and", "hyperkeratosis", "." ]	[ "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O" ]
[ "Some", "patients", "have", "only", "palmoplantar", "keratosis", "or", "periodontitis", ",", "and", "in", "rare", "individuals", "the", "periodontitis", "is", "mild", "and", "of", "late", "onset", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "PLS", "locus", "has", "been", "mapped", "to", "chromosome", "11q14", "-", "q21", "(", "refs", "7", ",", "8", ",", "9", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Using", "homozygosity", "mapping", "in", "eight", "small", "consanguineous", "families", ",", "we", "have", "narrowed", "the", "candidate", "region", "to", "a", "1", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "2", "-", "cM", "interval", "between", "D11S4082", "and", "D11S931", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "gene", "(", "CTSC", ")", "encoding", "the", "lysosomal", "protease", "cathepsin", "C", "(", "or", "dipeptidyl", "aminopeptidase", "I", ")", "lies", "within", "this", "interval", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "defined", "the", "genomic", "structure", "of", "CTSC", "and", "found", "mutations", "in", "all", "eight", "families", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "two", "of", "these", "families", "we", "used", "a", "functional", "assay", "to", "demonstrate", "an", "almost", "total", "loss", "of", "cathepsin", "C", "activity", "in", "PLS", "patients", "and", "reduced", "activity", "in", "obligate", "carriers", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Confirmation", "of", "linkage", "of", "Van", "der", "Woude", "syndrome", "to", "chromosome", "1q32", ":", "evidence", "of", "association", "with", "STR", "alleles", "suggests", "possible", "unique", "origin", "of", "the", "disease", "mutation", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Van", "der", "Woude", "syndrome", "(", "VWS", ")", "is", "an", "autosomal", "dominant", "craniofacial", "disorder", "with", "high", "penetrance", "and", "variable", "expression", "." ]	[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Its", "clinical", "features", "are", "variably", "expressed", ",", "but", "include", "cleft", "lip", "and", "/", "or", "cleft", "palate", ",", "lip", "pits", "and", "hypodontia", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O" ]
[ "All", "VWS", "families", "studied", "to", "date", "map", "the", "disease", "gene", "to", "a", "<", "2", "cM", "region", "of", "chromosome", "1q32", ",", "with", "no", "evidence", "of", "locus", "heterogeneity", "." ]	[ "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "aim", "of", "this", "study", "is", "to", "refine", "the", "localization", "of", "the", "VWS", "gene", "and", "to", "further", "assess", "possible", "heterogeneity", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "analyzed", "four", "multiplex", "VWS", "families", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O" ]
[ "All", "available", "members", "were", "clinically", "assessed", "and", "genotyped", "for", "19", "short", "tandem", "repeat", "markers", "on", "chromosome", "1", "in", "the", "VWS", "candidate", "gene", "region", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "performed", "two", "-", "point", "and", "multipoint", "limit", "of", "detection", "(", "LOD", ")", "score", "analyses", "using", "a", "high", "penetrance", "autosomal", "dominant", "model", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "All", "families", "showed", "positive", "LOD", "scores", "without", "any", "recombination", "in", "the", "candidate", "region", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "largest", "two", "-", "point", "LOD", "score", "was", "5", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "87", "87", "." ]	[ "O", "O", "O" ]
[ "Our", "assay", "method", "for", "short", "tandem", "repeat", "(", "STR", ")", "markers", "provided", "highly", "accurate", "size", "estimation", "of", "marker", "allele", "fragment", "sizes", ",", "and", "therefore", "enabled", "us", "to", "determine", "the", "specific", "alleles", "segregating", "with", "the", "VWS", "gene", "in", "each", "of", "our", "four", "families", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "observed", "a", "striking", "pattern", "of", "STR", "allele", "sharing", "at", "several", "closely", "linked", "loci", "among", "our", "four", "Caucasian", "VWS", "families", "recruited", "at", "three", "different", "locations", "in", "the", "US", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "These", "results", "suggest", "the", "possibility", "of", "a", "unique", "origin", "for", "a", "mutation", "responsible", "for", "many", "or", "most", "cases", "of", "VWS", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O" ]
[ "A", "point", "mutation", "Thr", "(", "799", ")", "Met", "on", "the", "alpha", "(", "2", ")", "integrin", "leads", "to", "the", "formation", "of", "new", "human", "platelet", "alloantigen", "Sit", "(", "a", ")", "and", "affects", "collagen", "-", "induced", "aggregation", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "A", "new", "platelet", "-", "specific", "alloantigen", ",", "termed", "Sit", "(", "a", ")", ",", "was", "identified", "in", "a", "severe", "case", "of", "neonatal", "alloimmune", "thrombocytopenia", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]
[ "The", "Sit", "(", "a", ")", "alloantigen", "is", "of", "low", "frequency", "(", "1", "/", "400", ")", "in", "the", "German", "population", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Immunochemical", "studies", "demonstrated", "that", "the", "Sit", "(", "a", ")", "epitopes", "reside", "on", "platelet", "glycoprotein", "(", "GP", ")", "Ia", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Nucleotide", "sequence", "analysis", "of", "GPIa", "cDNA", "derived", "from", "Sit", "(", "a", ")", "-", "positive", "platelets", "showed", "C", "(", "2531", ")", "-", "-", ">", "T", "(", "2531", ")", "point", "mutation", ",", "resulting", "in", "Thr", "(", "799", ")", "Met", "dimorphism", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Analysis", "of", "genomic", "DNA", "from", "22", "Sit", "(", "a", ")", "-", "negative", "normal", "individuals", "showed", "that", "the", "Thr", "(", "799", ")", "is", "encoded", "by", "ACG", "(", "2532", ")", "(", "90", ".", "9", "%", ")", "or", "ACA", "(", "2532", ")", "(", "9", ".", "1", "%", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "To", "establish", "a", "DNA", "typing", "technique", ",", "we", "elucidated", "the", "organization", "of", "the", "GPIa", "gene", "adjacent", "to", "the", "polymorphic", "bases", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "introns", "(", "421", "bp", "and", "1", ".", "2", "kb", ")", "encompass", "a", "142", "-", "bp", "exon", "with", "the", "2", "polymorphic", "bases", "2531", "and", "2532", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Polymerase", "chain", "reaction", "-", "restriction", "fragment", "length", "polymorphism", "analysis", "on", "DNA", "derived", "from", "100", "donors", "using", "the", "restriction", "enzyme", "Mae", "III", "showed", "that", "the", "Met", "(", "799", ")", "form", "of", "GPIa", "is", "restricted", "to", "Sit", "(", "a", ")", "(", "+", ")", "phenotype", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Analysis", "of", "stable", "Chinese", "hamster", "ovary", "transfectants", "expressing", "allele", "-", "specific", "recombinant", "forms", "of", "GPIa", "showed", "that", "anti", "-", "Sit", "(", "a", ")", "exclusively", "reacted", "with", "the", "Glu", "(", "505", ")", "Met", "(", "799", ")", ",", "but", "not", "with", "the", "Glu", "(", "505", ")", "Thr", "(", "799", ")", "and", "the", "Lys", "(", "505", ")", "Thr", "(", "799", ")", "isoforms", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "contrast", ",", "anti", "-", "Br", "(", "a", ")", "(", "HPA", "-", "5b", ")", "only", "recognized", "the", "Lys", "(", "505", ")", "Thr", "(", "799", ")", "form", ",", "whereas", "anti", "-", "Br", "(", "b", ")", "(", "HPA", "-", "5a", ")", "reacted", "with", "both", "Glu", "(", "505", ")", "Thr", "(", "799", ")", "and", "Glu", "(", "505", ")", "Met", "(", "799", ")", "isoforms", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Therefore", ",", "the", "isolation", "of", "new", "genes", "in", "this", "region", "remains", "crucial", "for", "a", "better", "understanding", "of", "the", "molecular", "basis", "of", "PWS", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O" ]

[ "In", "this", "manuscript", ",", "we", "report", "the", "characterization", "of", "MAGEL2", "and", "its", "mouse", "homologue", "Magel2", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "are", "located", "in", "the", "human", "15q11", "-", "q13", "and", "mouse", "7C", "regions", ",", "in", "close", "proximity", "to", "NDN", "/", "Ndn", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "By", "northern", "blot", "analysis", "we", "did", "not", "detect", "any", "expression", "of", "MAGEL2", "/", "Magel2", "but", "by", "RT", "-", "PCR", "analysis", ",", "specific", "expression", "was", "detected", "in", "fetal", "and", "adult", "brain", "and", "in", "placenta", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Both", "genes", "are", "intronless", "with", "tandem", "direct", "repeat", "sequences", "contained", "within", "a", "CpG", "island", "in", "the", "5", "-", "untranscribed", "region", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "transcripts", "encode", "putative", "proteins", "that", "are", "homologous", "to", "the", "MAGE", "proteins", "and", "NDN", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Moreover", ",", "MAGEL2", "/", "Magel2", "are", "expressed", "only", "from", "the", "paternal", "allele", "in", "brain", ",", "suggesting", "a", "potential", "role", "in", "the", "aetiology", "of", "PWS", "and", "its", "mouse", "model", ",", "respectively", ".", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "cDNA", "microarrays", "detect", "activation", "of", "a", "myogenic", "transcription", "program", "by", "the", "PAX3", "-", "FKHR", "fusion", "oncogene", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Alveolar", "rhabdomyosarcoma", "is", "an", "aggressive", "pediatric", "cancer", "of", "striated", "muscle", "characterized", "in", "60", "%", "of", "cases", "by", "a", "t", "(", "2", ";", "13", ")", "(", "q35", ";", "q14", ")", "." ]

[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "results", "in", "the", "fusion", "of", "PAX3", ",", "a", "developmental", "transcription", "factor", "required", "for", "limb", "myogenesis", ",", "with", "FKHR", ",", "a", "member", "of", "the", "forkhead", "family", "of", "transcription", "factors", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "resultant", "PAX3", "-", "FKHR", "gene", "possesses", "transforming", "properties", ";", "however", ",", "the", "effects", "of", "this", "chimeric", "oncogene", "on", "gene", "expression", "are", "largely", "unknown", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "To", "investigate", "the", "actions", "of", "these", "transcription", "factors", ",", "both", "Pax3", "and", "PAX3", "-", "FKHR", "were", "introduced", "into", "NIH", "3T3", "cells", ",", "and", "the", "resultant", "gene", "expression", "changes", "were", "analyzed", "with", "a", "murine", "cDNA", "microarray", "containing", "2", ",", "225", "elements", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "found", "that", "PAX3", "-", "FKHR", "but", "not", "PAX3", "activated", "a", "myogenic", "transcription", "program", "including", "the", "induction", "of", "transcription", "factors", "MyoD", ",", "Myogenin", ",", "Six1", ",", "and", "Slug", "as", "well", "as", "a", "battery", "of", "genes", "involved", "in", "several", "aspects", "of", "muscle", "function", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Notable", "among", "this", "group", "were", "the", "growth", "factor", "gene", "Igf2", "and", "its", "binding", "protein", "Igfbp5", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Relevance", "of", "this", "model", "was", "suggested", "by", "verification", "that", "three", "of", "these", "genes", "(", "IGFBP5", ",", "HSIX1", ",", "and", "Slug", ")", "were", "also", "expressed", "in", "alveolar", "rhabdomyosarcoma", "cell", "lines", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O" ]

[ "This", "study", "utilizes", "cDNA", "microarrays", "to", "elucidate", "the", "pattern", "of", "gene", "expression", "induced", "by", "an", "oncogenic", "transcription", "factor", "and", "demonstrates", "the", "profound", "myogenic", "properties", "of", "PAX3", "-", "FKHR", "in", "NIH", "3T3", "cells", ".", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Experimental", "hemochromatosis", "due", "to", "MHC", "class", "I", "HFE", "deficiency", ":", "immune", "status", "and", "iron", "metabolism", "." ]

[ "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "puzzling", "linkage", "between", "genetic", "hemochromatosis", "and", "histocompatibility", "loci", "became", "even", "more", "so", "when", "the", "gene", "involved", ",", "HFE", ",", "was", "identified", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Indeed", ",", "within", "the", "well", "defined", ",", "mainly", "peptide", "-", "binding", ",", "MHC", "class", "I", "family", "of", "molecules", ",", "HFE", "seems", "to", "perform", "an", "unusual", "yet", "essential", "function", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "As", "yet", ",", "our", "understanding", "of", "HFE", "function", "in", "iron", "homeostasis", "is", "only", "partial", ";", "an", "even", "more", "open", "question", "is", "its", "possible", "role", "in", "the", "immune", "system", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "To", "advance", "on", "both", "of", "these", "avenues", ",", "we", "report", "the", "deletion", "of", "HFE", "alpha1", "and", "alpha2", "putative", "ligand", "binding", "domains", "in", "vivo", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "HFE", "-", "deficient", "animals", "were", "analyzed", "for", "a", "comprehensive", "set", "of", "metabolic", "and", "immune", "parameters", "." ]

[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Faithfully", "mimicking", "human", "hemochromatosis", ",", "mice", "homozygous", "for", "this", "deletion", "develop", "iron", "overload", ",", "characterized", "by", "a", "higher", "plasma", "iron", "content", "and", "a", "raised", "transferrin", "saturation", "as", "well", "as", "an", "elevated", "hepatic", "iron", "load", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "primary", "defect", "could", ",", "indeed", ",", "be", "traced", "to", "an", "augmented", "duodenal", "iron", "absorption", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "parallel", ",", "measurement", "of", "the", "gut", "mucosal", "iron", "content", "as", "well", "as", "iron", "regulatory", "proteins", "allows", "a", "more", "informed", "evaluation", "of", "various", "hypotheses", "regarding", "the", "precise", "role", "of", "HFE", "in", "iron", "homeostasis", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Finally", ",", "an", "extensive", "phenotyping", "of", "primary", "and", "secondary", "lymphoid", "organs", "including", "the", "gut", "provides", "no", "compelling", "evidence", "for", "an", "obvious", "immune", "-", "linked", "function", "for", "HFE", ".", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Somatic", "rearrangement", "of", "chromosome", "14", "in", "human", "lymphocytes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Ataxia", "-", "telangiectasia", "is", "a", "rare", "genetic", "disorder", "associated", "with", "immune", "deficiency", ",", "chromosome", "instability", ",", "and", "a", "predisposition", "to", "lymphoid", "malignancy", "." ]

[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]

[ "We", "have", "detected", "chromosomally", "anomalous", "clones", "of", "lymphocytes", "in", "eight", "patients", "with", "this", "disorder", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Chromosome", "banding", "disclosed", "that", "the", "clones", "are", "consistently", "marked", "by", "structural", "rearrangement", "of", "the", "long", "arm", "(", "q", ")", "of", "chromosome", "14", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "A", "translocation", "involving", "14q", "was", "found", "in", "clones", "obtained", "from", "seven", "of", "the", "eight", "patients", "whereas", "a", "ring", "14", "chromosome", "was", "found", "in", "a", "clone", "obtained", "from", "the", "other", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "findings", "as", "well", "as", "data", "obtained", "by", "others", "for", "patients", "with", "ataxia", "-", "telangiectasia", "suggest", "that", "structural", "rearrangement", "of", "14q", "is", "the", "initial", "chromosomal", "change", "in", "lymphocyte", "clones", "of", "patients", "with", "this", "disorder", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Chromosomes", "of", "lymphocytes", "from", "one", "of", "the", "patients", "were", "studied", "before", "and", "after", "the", "onset", "of", "chronic", "lymphocytic", "leukemia", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]

[ "Before", "leukemia", "was", "diagnosed", ",", "the", "patient", "had", "a", "lymphocyte", "clone", "with", "a", "14q", "translocation", "." ]

[ "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "clone", "appears", "to", "have", "given", "rise", "to", "the", "leukemic", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O" ]

[ "We", "hypothesize", "that", "structural", "rearrangement", "of", "14q", "is", "directly", "related", "to", "abnormal", "growth", "of", "lymphocytes", "and", "that", "it", "may", "be", "a", "step", "toward", "the", "development", "of", "lymphoid", "malignancies", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]

[ "Increasing", "evidence", ",", "provided", "by", "others", ",", "for", "the", "nonrandom", "involvement", "of", "14q", "in", "African", "-", "type", "Burkitts", "lymphoma", "and", "other", "lymphoid", "neoplasms", "further", "strengthens", "this", "hypothesis", ".", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Exon", "9", "mutations", "in", "the", "WT1", "gene", ",", "without", "influencing", "KTS", "splice", "isoforms", ",", "are", "also", "responsible", "for", "Frasier", "syndrome", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]

[ "We", "report", "new", "mutations", "in", "exon", "9", "of", "the", "WT1", "gene", "that", "did", "not", "alter", "the", "ratio", "of", "+", "/", "-", "KTS", "splice", "isoforms", "in", "two", "unrelated", "patients", "with", "Frasier", "syndrome", "(", "FS", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O" ]

[ "The", "mutation", "of", "intron", "9", "inducing", "defective", "alternative", "splicing", "was", "reported", "to", "be", "responsible", "for", "this", "syndrome", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "mutations", "found", "in", "our", "cases", "occurred", "in", "the", "same", "exon", "of", "the", "WT1", "gene", "as", "detected", "in", "Denys", "-", "Drash", "syndrome", "(", "DDS", ")", "and", "could", "not", "be", "explained", "by", "the", "previously", "proposed", "mechanism", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "results", "suggest", "that", "the", "two", "syndromes", "originate", "from", "the", "same", "WT1", "gene", "abnormality", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]

[ "From", "a", "molecular", "biological", "point", "of", "view", ",", "we", "concluded", "that", "the", "two", "diseases", "were", "not", "separable", ",", "and", "that", "FS", "should", "be", "included", "as", "an", "atypical", "form", "of", "DDS", ".", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O" ]

[ "Splice", "-", "site", "mutation", "in", "the", "PDS", "gene", "may", "result", "in", "intrafamilial", "variability", "for", "deafness", "in", "Pendred", "syndrome", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]

[ "Pendred", "syndrome", "is", "a", "recessive", "inherited", "disorder", "that", "consists", "of", "developmental", "abnormalities", "of", "the", "cochlea", ",", "sensorineural", "hearing", "loss", ",", "and", "diffuse", "thyroid", "enlargement", "(", "goiter", ")", "." ]

[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O" ]

[ "This", "disorder", "may", "account", "for", "up", "to", "10", "%", "of", "cases", "of", "hereditary", "deafness", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]

[ "The", "disease", "gene", "(", "PDS", ")", "has", "been", "mapped", "to", "chromosome", "7q22", "-", "q31", ",", "and", "encodes", "a", "chloride", "-", "iodide", "transport", "protein", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "performed", "mutation", "analysis", "of", "individual", "exons", "of", "the", "PDS", "gene", "in", "one", "Spanish", "family", "that", "shows", "intrafamilial", "variability", "of", "the", "deafness", "phenotype", "(", "two", "patients", "with", "profound", "and", "one", "with", "moderate", "-", "severe", "deafness", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O" ]

[ "We", "identified", "a", "new", "splice", "-", "site", "mutation", "affecting", "intron", "4", "of", "the", "PDS", "gene", ",", "at", "nucleotide", "position", "639", "+", "7", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "RNA", "analysis", "from", "lymphocytes", "of", "the", "affected", "patients", "showed", "that", "mutation", "639", "+", "7A", "-", "-", ">", "G", "generates", "a", "new", "donor", "splice", "site", ",", "leading", "to", "an", "mRNA", "with", "an", "insertion", "of", "six", "nucleotides", "from", "intron", "4", "of", "PDS", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Since", "the", "newly", "created", "donor", "splice", "site", "is", "likely", "to", "compete", "with", "the", "normal", "one", ",", "variations", "of", "the", "levels", "of", "normal", "and", "aberrant", "transcripts", "of", "the", "PDS", "gene", "in", "the", "cochlea", "may", "explain", "the", "variability", "in", "the", "deafness", "presentation", ".", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O" ]

[ "The", "molecular", "basis", "of", "Sjogren", "-", "Larsson", "syndrome", ":", "mutation", "analysis", "of", "the", "fatty", "aldehyde", "dehydrogenase", "gene", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Sjogren", "-", "Larsson", "syndrome", "(", "SLS", ")", "is", "an", "autosomal", "recessive", "disorder", "characterized", "by", "ichthyosis", ",", "mental", "retardation", ",", "spasticity", ",", "and", "deficient", "activity", "of", "fatty", "aldehyde", "dehydrogenase", "(", "FALDH", ")", "." ]

[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O" ]

[ "To", "define", "the", "molecular", "defects", "causing", "SLS", ",", "we", "performed", "mutation", "analysis", "of", "the", "FALDH", "gene", "in", "probands", "from", "63", "kindreds", "with", "SLS", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O" ]

[ "Among", "these", "patients", ",", "49", "different", "mutations", "-", "including", "10", "deletions", ",", "2", "insertions", ",", "22", "amino", "acid", "substitutions", ",", "3", "nonsense", "mutations", ",", "9", "splice", "-", "site", "defects", ",", "and", "3", "complex", "mutations", "-", "were", "found", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "All", "of", "the", "patients", "with", "SLS", "were", "found", "to", "carry", "mutations", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Nineteen", "of", "the", "missense", "mutations", "resulted", "in", "a", "severe", "reduction", "of", "FALDH", "enzyme", "catalytic", "activity", "when", "expressed", "in", "mammalian", "cells", ",", "but", "one", "mutation", "(", "798G", "-", "-", ">", "C", "[", "K266N", "]", ")", "seemed", "to", "have", "a", "greater", "effect", "on", "mRNA", "stability", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "splice", "-", "site", "mutations", "led", "to", "exon", "skipping", "or", "utilization", "of", "cryptic", "acceptor", "-", "splice", "sites", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Thirty", "-", "seven", "mutations", "were", "private", ",", "and", "12", "mutations", "were", "seen", "in", "two", "or", "more", "probands", "of", "European", "or", "Middle", "Eastern", "descent", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Four", "single", "-", "nucleotide", "polymorphisms", "(", "SNPs", ")", "were", "found", "in", "the", "FALDH", "gene", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "At", "least", "four", "of", "the", "common", "mutations", "(", "551C", "-", "-", ">", "T", ",", "682C", "-", "-", ">", "T", ",", "733G", "-", "-", ">", "A", ",", "and", "798", "+", "1delG", ")", "were", "associated", "with", "multiple", "SNP", "haplotypes", ",", "suggesting", "that", "these", "mutations", "originated", "independently", "on", "more", "than", "one", "occasion", "or", "were", "ancient", "SLS", "genes", "that", "had", "undergone", "intragenic", "recombination", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Our", "results", "demonstrate", "that", "SLS", "is", "caused", "by", "a", "strikingly", "heterogeneous", "group", "of", "mutations", "in", "the", "FALDH", "gene", "and", "provide", "a", "framework", "for", "understanding", "the", "genetic", "basis", "of", "SLS", "and", "the", "development", "of", "DNA", "-", "based", "diagnostic", "tests", ".", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Loss", "-", "of", "-", "function", "mutations", "in", "the", "cathepsin", "C", "gene", "result", "in", "periodontal", "disease", "and", "palmoplantar", "keratosis", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]

[ "Papillon", "-", "Lefevre", "syndrome", ",", "or", "keratosis", "palmoplantaris", "with", "periodontopathia", "(", "PLS", ",", "MIM", "245000", ")", ",", "is", "an", "autosomal", "recessive", "disorder", "that", "is", "mainly", "ascertained", "by", "dentists", "because", "of", "the", "severe", "periodontitis", "that", "afflicts", "patients", "." ]

[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Both", "the", "deciduous", "and", "permanent", "dentitions", "are", "affected", ",", "resulting", "in", "premature", "tooth", "loss", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]

[ "Palmoplantar", "keratosis", ",", "varying", "from", "mild", "psoriasiform", "scaly", "skin", "to", "overt", "hyperkeratosis", ",", "typically", "develops", "within", "the", "first", "three", "years", "of", "life", "." ]

[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Keratosis", "also", "affects", "other", "sites", "such", "as", "elbows", "and", "knees", "." ]

[ "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Most", "PLS", "patients", "display", "both", "periodontitis", "and", "hyperkeratosis", "." ]

[ "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O" ]

[ "Some", "patients", "have", "only", "palmoplantar", "keratosis", "or", "periodontitis", ",", "and", "in", "rare", "individuals", "the", "periodontitis", "is", "mild", "and", "of", "late", "onset", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "PLS", "locus", "has", "been", "mapped", "to", "chromosome", "11q14", "-", "q21", "(", "refs", "7", ",", "8", ",", "9", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Using", "homozygosity", "mapping", "in", "eight", "small", "consanguineous", "families", ",", "we", "have", "narrowed", "the", "candidate", "region", "to", "a", "1", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "2", "-", "cM", "interval", "between", "D11S4082", "and", "D11S931", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "gene", "(", "CTSC", ")", "encoding", "the", "lysosomal", "protease", "cathepsin", "C", "(", "or", "dipeptidyl", "aminopeptidase", "I", ")", "lies", "within", "this", "interval", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "defined", "the", "genomic", "structure", "of", "CTSC", "and", "found", "mutations", "in", "all", "eight", "families", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "two", "of", "these", "families", "we", "used", "a", "functional", "assay", "to", "demonstrate", "an", "almost", "total", "loss", "of", "cathepsin", "C", "activity", "in", "PLS", "patients", "and", "reduced", "activity", "in", "obligate", "carriers", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Confirmation", "of", "linkage", "of", "Van", "der", "Woude", "syndrome", "to", "chromosome", "1q32", ":", "evidence", "of", "association", "with", "STR", "alleles", "suggests", "possible", "unique", "origin", "of", "the", "disease", "mutation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Van", "der", "Woude", "syndrome", "(", "VWS", ")", "is", "an", "autosomal", "dominant", "craniofacial", "disorder", "with", "high", "penetrance", "and", "variable", "expression", "." ]

[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Its", "clinical", "features", "are", "variably", "expressed", ",", "but", "include", "cleft", "lip", "and", "/", "or", "cleft", "palate", ",", "lip", "pits", "and", "hypodontia", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O" ]

[ "All", "VWS", "families", "studied", "to", "date", "map", "the", "disease", "gene", "to", "a", "<", "2", "cM", "region", "of", "chromosome", "1q32", ",", "with", "no", "evidence", "of", "locus", "heterogeneity", "." ]

[ "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "aim", "of", "this", "study", "is", "to", "refine", "the", "localization", "of", "the", "VWS", "gene", "and", "to", "further", "assess", "possible", "heterogeneity", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "analyzed", "four", "multiplex", "VWS", "families", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O" ]

[ "All", "available", "members", "were", "clinically", "assessed", "and", "genotyped", "for", "19", "short", "tandem", "repeat", "markers", "on", "chromosome", "1", "in", "the", "VWS", "candidate", "gene", "region", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "performed", "two", "-", "point", "and", "multipoint", "limit", "of", "detection", "(", "LOD", ")", "score", "analyses", "using", "a", "high", "penetrance", "autosomal", "dominant", "model", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "All", "families", "showed", "positive", "LOD", "scores", "without", "any", "recombination", "in", "the", "candidate", "region", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "largest", "two", "-", "point", "LOD", "score", "was", "5", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "87", "87", "." ]

[ "O", "O", "O" ]

[ "Our", "assay", "method", "for", "short", "tandem", "repeat", "(", "STR", ")", "markers", "provided", "highly", "accurate", "size", "estimation", "of", "marker", "allele", "fragment", "sizes", ",", "and", "therefore", "enabled", "us", "to", "determine", "the", "specific", "alleles", "segregating", "with", "the", "VWS", "gene", "in", "each", "of", "our", "four", "families", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "observed", "a", "striking", "pattern", "of", "STR", "allele", "sharing", "at", "several", "closely", "linked", "loci", "among", "our", "four", "Caucasian", "VWS", "families", "recruited", "at", "three", "different", "locations", "in", "the", "US", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "results", "suggest", "the", "possibility", "of", "a", "unique", "origin", "for", "a", "mutation", "responsible", "for", "many", "or", "most", "cases", "of", "VWS", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O" ]

[ "A", "point", "mutation", "Thr", "(", "799", ")", "Met", "on", "the", "alpha", "(", "2", ")", "integrin", "leads", "to", "the", "formation", "of", "new", "human", "platelet", "alloantigen", "Sit", "(", "a", ")", "and", "affects", "collagen", "-", "induced", "aggregation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "A", "new", "platelet", "-", "specific", "alloantigen", ",", "termed", "Sit", "(", "a", ")", ",", "was", "identified", "in", "a", "severe", "case", "of", "neonatal", "alloimmune", "thrombocytopenia", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]

[ "The", "Sit", "(", "a", ")", "alloantigen", "is", "of", "low", "frequency", "(", "1", "/", "400", ")", "in", "the", "German", "population", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Immunochemical", "studies", "demonstrated", "that", "the", "Sit", "(", "a", ")", "epitopes", "reside", "on", "platelet", "glycoprotein", "(", "GP", ")", "Ia", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Nucleotide", "sequence", "analysis", "of", "GPIa", "cDNA", "derived", "from", "Sit", "(", "a", ")", "-", "positive", "platelets", "showed", "C", "(", "2531", ")", "-", "-", ">", "T", "(", "2531", ")", "point", "mutation", ",", "resulting", "in", "Thr", "(", "799", ")", "Met", "dimorphism", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Analysis", "of", "genomic", "DNA", "from", "22", "Sit", "(", "a", ")", "-", "negative", "normal", "individuals", "showed", "that", "the", "Thr", "(", "799", ")", "is", "encoded", "by", "ACG", "(", "2532", ")", "(", "90", ".", "9", "%", ")", "or", "ACA", "(", "2532", ")", "(", "9", ".", "1", "%", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "To", "establish", "a", "DNA", "typing", "technique", ",", "we", "elucidated", "the", "organization", "of", "the", "GPIa", "gene", "adjacent", "to", "the", "polymorphic", "bases", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "introns", "(", "421", "bp", "and", "1", ".", "2", "kb", ")", "encompass", "a", "142", "-", "bp", "exon", "with", "the", "2", "polymorphic", "bases", "2531", "and", "2532", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Polymerase", "chain", "reaction", "-", "restriction", "fragment", "length", "polymorphism", "analysis", "on", "DNA", "derived", "from", "100", "donors", "using", "the", "restriction", "enzyme", "Mae", "III", "showed", "that", "the", "Met", "(", "799", ")", "form", "of", "GPIa", "is", "restricted", "to", "Sit", "(", "a", ")", "(", "+", ")", "phenotype", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Analysis", "of", "stable", "Chinese", "hamster", "ovary", "transfectants", "expressing", "allele", "-", "specific", "recombinant", "forms", "of", "GPIa", "showed", "that", "anti", "-", "Sit", "(", "a", ")", "exclusively", "reacted", "with", "the", "Glu", "(", "505", ")", "Met", "(", "799", ")", ",", "but", "not", "with", "the", "Glu", "(", "505", ")", "Thr", "(", "799", ")", "and", "the", "Lys", "(", "505", ")", "Thr", "(", "799", ")", "isoforms", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "contrast", ",", "anti", "-", "Br", "(", "a", ")", "(", "HPA", "-", "5b", ")", "only", "recognized", "the", "Lys", "(", "505", ")", "Thr", "(", "799", ")", "form", ",", "whereas", "anti", "-", "Br", "(", "b", ")", "(", "HPA", "-", "5a", ")", "reacted", "with", "both", "Glu", "(", "505", ")", "Thr", "(", "799", ")", "and", "Glu", "(", "505", ")", "Met", "(", "799", ")", "isoforms", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]