tokens
listlengths 2
123
| ner_tags
listlengths 2
123
|
---|---|
[
"Cytotoxic",
"T",
"lymphocyte",
"-",
"associated",
"antigen",
"4",
"(",
"CTLA",
"-",
"4",
",",
"also",
"known",
"as",
"CD152",
")",
"has",
"been",
"shown",
"to",
"play",
"a",
"major",
"role",
"in",
"the",
"regulation",
"of",
"T",
"cell",
"activation",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Its",
"membrane",
"expression",
"is",
"highly",
"regulated",
"by",
"endocytosis",
"and",
"trafficking",
"through",
"the",
"secretory",
"lysosome",
"pathway",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Chediak",
"-",
"Higashi",
"syndrome",
"(",
"CHS",
")",
"is",
"an",
"inherited",
"disorder",
"caused",
"by",
"mutations",
"in",
"the",
"lysosomal",
"trafficking",
"regulator",
"gene",
",",
"LYST",
"."
] |
[
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"It",
"results",
"in",
"defective",
"membrane",
"targeting",
"of",
"the",
"proteins",
"present",
"in",
"secretory",
"lysosomes",
",",
"and",
"it",
"is",
"associated",
"with",
"a",
"variety",
"of",
"features",
",",
"including",
"a",
"lymphoproliferative",
"syndrome",
"with",
"hemophagocytosis",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"O"
] |
[
"The",
"murine",
"equivalent",
"of",
"CHS",
",",
"beige",
"mice",
",",
"present",
"similar",
"characteristics",
"but",
"do",
"not",
"develop",
"the",
"lymphoproliferative",
"syndrome",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O"
] |
[
"We",
"show",
"herein",
"that",
"CTLA",
"-",
"4",
"is",
"present",
"in",
"enlarged",
",",
"abnormal",
"vesicles",
"in",
"CHS",
"T",
"cells",
"and",
"is",
"not",
"properly",
"expressed",
"at",
"the",
"cell",
"surface",
"after",
"T",
"cell",
"activation",
",",
"whereas",
"its",
"surface",
"expression",
"is",
"not",
"impaired",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"It",
"is",
"therefore",
"proposed",
"that",
"the",
"defective",
"surface",
"expression",
"of",
"CTLA",
"-",
"4",
"by",
"CHS",
"T",
"cells",
"is",
"involved",
"in",
"the",
"generation",
"of",
"lymphoproliferative",
"disease",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O"
] |
[
"This",
"observation",
"may",
"provide",
"insight",
"into",
"the",
"role",
"of",
"CTLA",
"-",
"4",
"in",
"humans",
".",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Proteolipoprotein",
"gene",
"analysis",
"in",
"82",
"patients",
"with",
"sporadic",
"Pelizaeus",
"-",
"Merzbacher",
"Disease",
":",
"duplications",
",",
"the",
"major",
"cause",
"of",
"the",
"disease",
",",
"originate",
"more",
"frequently",
"in",
"male",
"germ",
"cells",
",",
"but",
"point",
"mutations",
"do",
"not",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"Clinical",
"European",
"Network",
"on",
"Brain",
"Dysmyelinating",
"Disease",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O"
] |
[
"Pelizaeus",
"-",
"Merzbacher",
"Disease",
"(",
"PMD",
")",
"is",
"an",
"X",
"-",
"linked",
"developmental",
"defect",
"of",
"myelination",
"affecting",
"the",
"central",
"nervous",
"system",
"and",
"segregating",
"with",
"the",
"proteolipoprotein",
"(",
"PLP",
")",
"locus",
"."
] |
[
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Investigating",
"82",
"strictly",
"selected",
"sporadic",
"cases",
"of",
"PMD",
",",
"we",
"found",
"PLP",
"mutations",
"in",
"77",
"%",
";",
"complete",
"PLP",
"-",
"gene",
"duplications",
"were",
"the",
"most",
"frequent",
"abnormality",
"(",
"62",
"%",
")",
",",
"whereas",
"point",
"mutations",
"in",
"coding",
"or",
"splice",
"-",
"site",
"regions",
"of",
"the",
"gene",
"were",
"involved",
"less",
"frequently",
"(",
"38",
"%",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"analyzed",
"the",
"maternal",
"status",
"of",
"56",
"cases",
"to",
"determine",
"the",
"origin",
"of",
"both",
"types",
"of",
"PLP",
"mutation",
",",
"since",
"this",
"is",
"relevant",
"to",
"genetic",
"counseling",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"the",
"22",
"point",
"mutations",
",",
"68",
"%",
"of",
"mothers",
"were",
"heterozygous",
"for",
"the",
"mutation",
",",
"a",
"value",
"identical",
"to",
"the",
"two",
"-",
"thirds",
"of",
"carrier",
"mothers",
"that",
"would",
"be",
"expected",
"if",
"there",
"were",
"an",
"equal",
"mutation",
"rate",
"in",
"male",
"and",
"female",
"germ",
"cells",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"sharp",
"contrast",
",",
"among",
"the",
"34",
"duplicated",
"cases",
",",
"91",
"%",
"of",
"mothers",
"were",
"carriers",
",",
"a",
"value",
"significantly",
"(",
"chi2",
"=",
"9",
".",
"20",
",",
"P",
"<",
".",
"01",
")",
"in",
"favor",
"of",
"a",
"male",
"bias",
",",
"with",
"an",
"estimation",
"of",
"the",
"male",
"/",
"female",
"mutation",
"frequency",
"(",
"k",
")",
"of",
"9",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"3",
"3",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Moreover",
",",
"we",
"observed",
"the",
"occurrence",
"of",
"de",
"novo",
"mutations",
"between",
"parental",
"and",
"grandparental",
"generations",
"in",
"17",
"three",
"-",
"generation",
"families",
",",
"which",
"allowed",
"a",
"direct",
"estimation",
"of",
"the",
"k",
"value",
"(",
"k",
"=",
"11",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Again",
",",
"a",
"significant",
"male",
"mutation",
"imbalance",
"was",
"observed",
"only",
"for",
"the",
"duplications",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Chromosome",
"breakage",
"in",
"the",
"Prader",
"-",
"Willi",
"and",
"Angelman",
"syndromes",
"involves",
"recombination",
"between",
"large",
",",
"transcribed",
"repeats",
"at",
"proximal",
"and",
"distal",
"breakpoints",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Prader",
"-",
"Willi",
"syndrome",
"(",
"PWS",
")",
"and",
"Angelman",
"syndrome",
"(",
"AS",
")",
"are",
"distinct",
"neurobehavioral",
"disorders",
"that",
"most",
"often",
"arise",
"from",
"a",
"4",
"-",
"Mb",
"deletion",
"of",
"chromosome",
"15q11",
"-",
"q13",
"during",
"paternal",
"or",
"maternal",
"gametogenesis",
",",
"respectively",
"."
] |
[
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"At",
"a",
"de",
"novo",
"frequency",
"of",
"approximately",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"67",
"-",
"1",
"/",
"10",
",",
"000",
"births",
",",
"these",
"deletions",
"represent",
"a",
"common",
"structural",
"chromosome",
"change",
"in",
"the",
"human",
"genome",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"To",
"elucidate",
"the",
"mechanism",
"underlying",
"these",
"events",
",",
"we",
"characterized",
"the",
"regions",
"that",
"contain",
"two",
"proximal",
"breakpoint",
"clusters",
"and",
"a",
"distal",
"cluster",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Novel",
"DNA",
"sequences",
"potentially",
"associated",
"with",
"the",
"breakpoints",
"were",
"positionally",
"cloned",
"from",
"YACs",
"within",
"or",
"near",
"these",
"regions",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Analyses",
"of",
"rodent",
"-",
"human",
"somatic",
"-",
"cell",
"hybrids",
",",
"YAC",
"contigs",
",",
"and",
"FISH",
"of",
"normal",
"or",
"rearranged",
"chromosomes",
"15",
"identified",
"duplicated",
"sequences",
"(",
"the",
"END",
"repeats",
")",
"at",
"or",
"near",
"the",
"breakpoints",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"END",
"-",
"repeat",
"units",
"are",
"derived",
"from",
"large",
"genomic",
"duplications",
"of",
"a",
"novel",
"gene",
"(",
"HERC2",
")",
",",
"many",
"copies",
"of",
"which",
"are",
"transcriptionally",
"active",
"in",
"germline",
"tissues",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"One",
"of",
"five",
"PWS",
"/",
"AS",
"patients",
"analyzed",
"to",
"date",
"has",
"an",
"identifiable",
",",
"rearranged",
"HERC2",
"transcript",
"derived",
"from",
"the",
"deletion",
"event",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"postulate",
"that",
"the",
"END",
"repeats",
"flanking",
"15q11",
"-",
"q13",
"mediate",
"homologous",
"recombination",
"resulting",
"in",
"deletion",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Furthermore",
",",
"we",
"propose",
"that",
"active",
"transcription",
"of",
"these",
"repeats",
"in",
"male",
"and",
"female",
"germ",
"cells",
"may",
"facilitate",
"the",
"homologous",
"recombination",
"process",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Linkage",
"analysis",
"in",
"a",
"large",
"Brazilian",
"family",
"with",
"van",
"der",
"Woude",
"syndrome",
"suggests",
"the",
"existence",
"of",
"a",
"susceptibility",
"locus",
"for",
"cleft",
"palate",
"at",
"17p11",
".",
"2",
"-",
"11",
".",
"1",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"van",
"der",
"Woude",
"syndrome",
"(",
"VWS",
")",
",",
"which",
"has",
"been",
"mapped",
"to",
"1q32",
"-",
"41",
",",
"is",
"characterized",
"by",
"pits",
"and",
"/",
"or",
"sinuses",
"of",
"the",
"lower",
"lip",
",",
"cleft",
"lip",
"/",
"palate",
"(",
"CL",
"/",
"P",
")",
",",
"cleft",
"palate",
"(",
"CP",
")",
",",
"bifid",
"uvula",
",",
"and",
"hypodontia",
"(",
"H",
")",
"."
] |
[
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"expression",
"of",
"VWS",
",",
"which",
"has",
"incomplete",
"penetrance",
",",
"is",
"highly",
"variable",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Both",
"the",
"occurrence",
"of",
"CL",
"/",
"P",
"and",
"CP",
"within",
"the",
"same",
"genealogy",
"and",
"a",
"recurrence",
"risk",
"<",
"40",
"%",
"for",
"CP",
"among",
"descendants",
"with",
"VWS",
"have",
"suggested",
"that",
"the",
"development",
"of",
"clefts",
"in",
"this",
"syndrome",
"is",
"influenced",
"by",
"modifying",
"genes",
"at",
"other",
"loci",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"To",
"test",
"this",
"hypothesis",
",",
"we",
"have",
"conducted",
"linkage",
"analysis",
"in",
"a",
"large",
"Brazilian",
"kindred",
"with",
"VWS",
",",
"considering",
"as",
"affected",
"the",
"individuals",
"with",
"CP",
",",
"regardless",
"of",
"whether",
"it",
"is",
"associated",
"with",
"other",
"clinical",
"signs",
"of",
"VWS",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O"
] |
[
"Our",
"results",
"suggest",
"that",
"a",
"gene",
"at",
"17p11",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"2",
"-",
"11",
"2",
"-",
"11",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"1",
",",
"together",
"with",
"the",
"VWS",
"gene",
"at",
"1p32",
"-",
"41",
",",
"enhances",
"the",
"probability",
"of",
"CP",
"in",
"an",
"individual",
"carrying",
"the",
"two",
"at",
"-",
"risk",
"genes",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"If",
"this",
"hypothesis",
"is",
"confirmed",
"in",
"other",
"VWS",
"pedigrees",
",",
"it",
"will",
"represent",
"one",
"of",
"the",
"first",
"examples",
"of",
"a",
"gene",
",",
"mapped",
"through",
"linkage",
"analysis",
",",
"which",
"modifies",
"the",
"expression",
"of",
"a",
"major",
"gene",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"New",
"mutations",
",",
"polymorphisms",
",",
"and",
"rare",
"variants",
"in",
"the",
"ATM",
"gene",
"detected",
"by",
"a",
"novel",
"SSCP",
"strategy",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"gene",
"for",
"ataxia",
"-",
"telangiectasia",
",",
"ATM",
",",
"spans",
"about",
"150",
"kb",
"of",
"genomic",
"DNA",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"ATM",
"mutations",
"are",
"found",
"along",
"the",
"entire",
"gene",
",",
"with",
"no",
"evidence",
"of",
"a",
"mutational",
"hot",
"spot",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Using",
"DNA",
"as",
"the",
"starting",
"material",
",",
"we",
"screened",
"the",
"ATM",
"gene",
"in",
"92",
"A",
"-",
"T",
"patients",
",",
"using",
"an",
"optimized",
"single",
"-",
"strand",
"conformation",
"polymorphism",
"(",
"SSCP",
")",
"technique",
"that",
"detected",
"all",
"previously",
"known",
"mutations",
"in",
"the",
"polymerase",
"chain",
"reaction",
"(",
"PCR",
")",
"segments",
"being",
"analyzed",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"To",
"expedite",
"screening",
",",
"we",
"sequentially",
"loaded",
"the",
"SSCP",
"gels",
"with",
"three",
"different",
"sets",
"of",
"PCR",
"products",
"that",
"were",
"pretested",
"to",
"avoid",
"overlapping",
"patterns",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Many",
"of",
"the",
"DNA",
"changes",
"we",
"detected",
"were",
"intragenic",
"polymorphisms",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Of",
"an",
"expected",
"177",
"unknown",
"mutations",
",",
"we",
"detected",
"approximately",
"70",
"%",
",",
"mostly",
"protein",
"truncating",
"mutations",
"(",
"that",
"would",
"have",
"been",
"detectable",
"by",
"protein",
"truncation",
"testing",
"if",
"RNA",
"starting",
"material",
"had",
"been",
"available",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Mutations",
"have",
"now",
"been",
"defined",
"for",
"every",
"exon",
"of",
"the",
"ATM",
"gene",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Herein",
",",
"we",
"present",
"35",
"new",
"mutations",
"and",
"34",
"new",
"intragenic",
"polymorphisms",
"or",
"rare",
"variants",
"within",
"the",
"ATM",
"gene",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"This",
"is",
"the",
"most",
"comprehensive",
"compilation",
"of",
"ATM",
"polymorphisms",
"assembled",
"to",
"date",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Defining",
"polymorphic",
"sites",
"as",
"well",
"as",
"mutations",
"in",
"the",
"ATM",
"gene",
"will",
"be",
"of",
"great",
"importance",
"in",
"designing",
"automated",
"methods",
"for",
"detecting",
"mutations",
".",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"A",
"novel",
"frameshift",
"mutation",
"in",
"the",
"McLeod",
"syndrome",
"gene",
"in",
"a",
"Japanese",
"family",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"report",
"a",
"novel",
"mutation",
"in",
"the",
"XK",
"gene",
"(",
"XK",
")",
"in",
"a",
"Japanese",
"patient",
"with",
"McLeod",
"syndrome",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O"
] |
[
"A",
"50",
"-",
"year",
"-",
"old",
"man",
"showed",
"progressive",
"muscular",
"atrophy",
",",
"choreic",
"movement",
",",
"elevated",
"level",
"of",
"serum",
"creatinine",
"kinase",
",",
"and",
"acanthocytosis",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O"
] |
[
"The",
"expression",
"level",
"of",
"all",
"the",
"Kell",
"antigens",
"in",
"erythrocyte",
"was",
"decreased",
"and",
"molecular",
"analysis",
"revealed",
"a",
"single",
"-",
"base",
"(",
"T",
")",
"deletion",
"at",
"the",
"nucleotide",
"position",
"1095",
"in",
"XK",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"This",
"deletion",
"caused",
"a",
"frameshift",
"in",
"translation",
",",
"leading",
"to",
"a",
"premature",
"stop",
"codon",
"at",
"the",
"amino",
"acid",
"position",
"408",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"conclude",
"this",
"single",
"-",
"base",
"deletion",
"causes",
"defective",
"Kx",
"protein",
",",
"which",
"is",
"responsible",
"for",
"the",
"McLeod",
"phenotype",
"in",
"this",
"patient",
".",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Association",
"of",
"BRCA1",
"with",
"the",
"hRad50",
"-",
"hMre11",
"-",
"p95",
"complex",
"and",
"the",
"DNA",
"damage",
"response",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"BRCA1",
"encodes",
"a",
"tumor",
"suppressor",
"that",
"is",
"mutated",
"in",
"familial",
"breast",
"and",
"ovarian",
"cancers",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O"
] |
[
"Here",
",",
"it",
"is",
"shown",
"that",
"BRCA1",
"interacts",
"in",
"vitro",
"and",
"in",
"vivo",
"with",
"hRad50",
",",
"which",
"forms",
"a",
"complex",
"with",
"hMre11",
"and",
"p95",
"/",
"nibrin",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Upon",
"irradiation",
",",
"BRCA1",
"was",
"detected",
"in",
"discrete",
"foci",
"in",
"the",
"nucleus",
",",
"which",
"colocalize",
"with",
"hRad50",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Formation",
"of",
"irradiation",
"-",
"induced",
"foci",
"positive",
"for",
"BRCA1",
",",
"hRad50",
",",
"hMre11",
",",
"or",
"p95",
"was",
"dramatically",
"reduced",
"in",
"HCC",
"/",
"1937",
"breast",
"cancer",
"cells",
"carrying",
"a",
"homozygous",
"mutation",
"in",
"BRCA1",
"but",
"was",
"restored",
"by",
"transfection",
"of",
"wild",
"-",
"type",
"BRCA1",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Ectopic",
"expression",
"of",
"wild",
"-",
"type",
",",
"but",
"not",
"mutated",
",",
"BRCA1",
"in",
"these",
"cells",
"rendered",
"them",
"less",
"sensitive",
"to",
"the",
"DNA",
"damage",
"agent",
",",
"methyl",
"methanesulfonate",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"These",
"data",
"suggest",
"that",
"BRCA1",
"is",
"important",
"for",
"the",
"cellular",
"responses",
"to",
"DNA",
"damage",
"that",
"are",
"mediated",
"by",
"the",
"hRad50",
"-",
"hMre11",
"-",
"p95",
"complex",
".",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Relationship",
"among",
"genotype",
",",
"biochemical",
"phenotype",
",",
"and",
"cognitive",
"performance",
"in",
"females",
"with",
"phenylalanine",
"hydroxylase",
"deficiency",
":",
"report",
"from",
"the",
"Maternal",
"Phenylketonuria",
"Collaborative",
"Study",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"OBJECTIVE",
"To",
"examine",
"the",
"relationship",
"of",
"phenylalanine",
"hydroxylase",
"(",
"PAH",
")",
"genotypes",
"to",
"biochemical",
"phenotype",
"and",
"cognitive",
"development",
"in",
"maternal",
"phenylketonuria",
"(",
"PKU",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O"
] |
[
"METHODOLOGY",
"PAH",
"gene",
"mutations",
"were",
"examined",
"in",
"222",
"hyperphenylalaninemic",
"females",
"enrolled",
"in",
"the",
"Maternal",
"PKU",
"Collaborative",
"Study",
"(",
"MPKUCS",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"A",
"total",
"of",
"84",
"different",
"mutations",
"were",
"detected",
",",
"and",
"complete",
"genotype",
"was",
"obtained",
"in",
"199",
"individuals",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Based",
"on",
"previous",
"knowledge",
"about",
"mutation",
"-",
"phenotype",
"associations",
",",
"78",
"of",
"the",
"mutations",
"could",
"be",
"assigned",
"to",
"one",
"of",
"four",
"classes",
"of",
"severity",
"(",
"severe",
"PKU",
",",
"moderate",
"PKU",
",",
"mild",
"PKU",
",",
"and",
"mild",
"hyperphenylalaninemia",
"[",
"MHP",
"]",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Then",
",",
"189",
"MPKUCS",
"subjects",
"were",
"grouped",
"according",
"to",
"the",
"various",
"combinations",
"of",
"mutation",
"classifications",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"sample",
"sizes",
"were",
"large",
"enough",
"for",
"statistical",
"testing",
"in",
"four",
"groups",
"with",
"at",
"least",
"one",
"mutation",
"that",
"completely",
"abolishes",
"enzyme",
"activity",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"These",
"patients",
"are",
"considered",
"functionally",
"hemizygous",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"RESULTS",
"The",
"biochemical",
"phenotype",
"predicted",
"from",
"the",
"genotype",
"in",
"functionally",
"hemizygous",
"patients",
"was",
"related",
"significantly",
"to",
"the",
"assigned",
"phenylalanine",
"level",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Cognitive",
"performance",
"(",
"IQ",
")",
"was",
"also",
"significantly",
"related",
"to",
"genotype",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"IQ",
"of",
"PAH",
"-",
"deficient",
"mothers",
"with",
"a",
"severe",
"PKU",
"mutation",
"in",
"combination",
"with",
"a",
"MHP",
"mutation",
"or",
"a",
"mild",
"PKU",
"mutation",
"was",
"99",
"and",
"96",
",",
"respectively",
",",
"whereas",
"the",
"IQ",
"of",
"PKU",
"mothers",
"with",
"two",
"severe",
"PKU",
"mutations",
"or",
"with",
"one",
"severe",
"and",
"one",
"moderate",
"PKU",
"mutation",
"was",
"83",
"and",
"84",
",",
"respectively",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Of",
"the",
"patients",
"with",
"PKU",
",",
"92",
"%",
"had",
"been",
"treated",
"during",
"childhood",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Those",
"who",
"were",
"untreated",
"or",
"treated",
"late",
"had",
"lower",
"than",
"average",
"IQ",
"scores",
"for",
"their",
"group",
"of",
"mutation",
"combinations",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Females",
"with",
"moderate",
"or",
"mild",
"PKU",
"who",
"were",
"treated",
"early",
"and",
"treated",
"for",
">",
"6",
"years",
"showed",
"IQ",
"scores",
"10",
"points",
"above",
"average",
"for",
"their",
"group",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"CONCLUSIONS",
"The",
"reproductive",
"outcome",
"in",
"maternal",
"phenylketonuria",
"is",
"dependent",
"on",
"prenatal",
"metabolic",
"control",
"and",
"postnatal",
"environmental",
"circumstances",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Both",
"factors",
"depend",
"on",
"the",
"intellectual",
"resources",
"of",
"the",
"mother",
"with",
"PKU",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O"
] |
[
"The",
"significant",
"relationship",
"among",
"genotype",
",",
"biochemical",
"phenotype",
",",
"and",
"cognitive",
"performance",
"observed",
"in",
"the",
"present",
"study",
"is",
"of",
"importance",
"for",
"the",
"development",
"of",
"an",
"optimal",
"strategy",
"for",
"future",
"treatment",
"of",
"females",
"with",
"PKU",
"who",
"plan",
"pregnancy",
".",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Spinal",
"xanthomatosis",
":",
"a",
"variant",
"of",
"cerebrotendinous",
"xanthomatosis",
"."
] |
[
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O"
] |
[
"We",
"describe",
"seven",
"Dutch",
"patients",
"from",
"six",
"families",
"with",
"a",
"slowly",
"progressive",
",",
"mainly",
"spinal",
"cord",
"syndrome",
"that",
"remained",
"for",
"many",
"years",
"the",
"sole",
"expression",
"of",
"cerebrotendinous",
"xanthomatosis",
"(",
"CTX",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O"
] |
[
"MRI",
"demonstrated",
"white",
"matter",
"abnormalities",
"in",
"the",
"lateral",
"and",
"dorsal",
"columns",
"of",
"the",
"spinal",
"cord",
"."
] |
[
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Post",
"-",
"mortem",
"examination",
"of",
"one",
"of",
"the",
"patients",
"showed",
"extensive",
"myelin",
"loss",
"in",
"these",
"columns",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"An",
"array",
"of",
"genotypes",
"was",
"found",
"in",
"these",
"patients",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"conclude",
"that",
"spinal",
"xanthomatosis",
"is",
"a",
"clinical",
"and",
"radiological",
"separate",
"entity",
"of",
"CTX",
"that",
"should",
"be",
"included",
"in",
"the",
"differential",
"diagnosis",
"of",
"chronic",
"myelopathy",
".",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O"
] |
[
"A",
"transgene",
"insertion",
"creating",
"a",
"heritable",
"chromosome",
"deletion",
"mouse",
"model",
"of",
"Prader",
"-",
"Willi",
"and",
"angelman",
"syndromes",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O"
] |
[
"Prader",
"-",
"Willi",
"syndrome",
"(",
"PWS",
")",
"and",
"Angelman",
"syndrome",
"(",
"AS",
")",
"result",
"from",
"the",
"loss",
"of",
"function",
"of",
"imprinted",
"genes",
"in",
"human",
"chromosome",
"15q11",
"-",
"q13",
"."
] |
[
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"central",
"part",
"of",
"mouse",
"chromosome",
"7",
"is",
"homologous",
"to",
"human",
"15q11",
"-",
"q13",
",",
"with",
"conservation",
"of",
"both",
"gene",
"order",
"and",
"imprinted",
"features",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"report",
"here",
"the",
"characterization",
"of",
"a",
"transgene",
"insertion",
"(",
"Epstein",
"-",
"Barr",
"virus",
"Latent",
"Membrane",
"Protein",
"2A",
",",
"LMP2A",
")",
"into",
"mouse",
"chromosome",
"7C",
",",
"which",
"has",
"resulted",
"in",
"mouse",
"models",
"for",
"PWS",
"and",
"AS",
"dependent",
"on",
"the",
"sex",
"of",
"the",
"transmitting",
"parent",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Epigenotype",
"(",
"allelic",
"expression",
"and",
"DNA",
"methylation",
")",
"and",
"fluorescence",
"in",
"situ",
"hybridization",
"analyses",
"indicate",
"that",
"the",
"transgene",
"-",
"induced",
"mutation",
"has",
"generated",
"a",
"complete",
"deletion",
"of",
"the",
"PWS",
"/",
"AS",
"-",
"homologous",
"region",
"but",
"has",
"not",
"deleted",
"flanking",
"loci",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Because",
"the",
"intact",
"chromosome",
"7",
",",
"opposite",
"the",
"deleted",
"homolog",
",",
"maintains",
"the",
"correct",
"imprint",
"in",
"somatic",
"cells",
"of",
"PWS",
"and",
"AS",
"mice",
"and",
"establishes",
"the",
"correct",
"imprint",
"in",
"male",
"and",
"female",
"germ",
"cells",
"of",
"AS",
"mice",
",",
"homologous",
"association",
"and",
"replication",
"asynchrony",
"are",
"not",
"part",
"of",
"the",
"imprinting",
"mechanism",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"This",
"heritable",
"-",
"deletion",
"mouse",
"model",
"will",
"be",
"particularly",
"useful",
"for",
"the",
"identification",
"of",
"the",
"etiological",
"genes",
"and",
"mechanisms",
",",
"phenotypic",
"basis",
",",
"and",
"investigation",
"of",
"therapeutic",
"approaches",
"for",
"PWS",
".",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O"
] |
[
"Linkage",
"analysis",
"of",
"5",
"novel",
"van",
"der",
"Woude",
"syndrome",
"kindreds",
"to",
"1q32",
"-",
"q41",
"markers",
"further",
"supports",
"locus",
"homogeneity",
"of",
"the",
"disease",
"trait",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"van",
"der",
"Woude",
"syndrome",
"(",
"vWS",
",",
"MIM",
"119300",
")",
"is",
"a",
"rare",
"autosomal",
"dominant",
"clefting",
"condition",
"with",
"cardinal",
"features",
"of",
"mucous",
"cysts",
"(",
"lower",
"-",
"lip",
"pits",
")",
"and",
"clefts",
"to",
"the",
"lip",
"and",
"/",
"or",
"palate",
"."
] |
[
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O"
] |
[
"The",
"vWS",
"gene",
"has",
"been",
"assigned",
"to",
"a",
"locus",
"in",
"1q32",
"-",
"q41",
"by",
"linkage",
"analysis",
"and",
"physical",
"mapping",
"."
] |
[
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"have",
"investigated",
"5",
"novel",
"vWS",
"families",
"through",
"probands",
"attended",
"for",
"cleft",
"lip",
"and",
"/",
"or",
"palate",
"repair",
"at",
"the",
"Department",
"of",
"Maxillofacial",
"Surgery",
"of",
"Hopital",
"Trousseau",
",",
"Paris",
",",
"in",
"order",
"to",
"tentatively",
"refine",
"the",
"genetic",
"map",
"of",
"the",
"vWS",
"region",
"in",
"1q32",
"-",
"q41",
"and",
"possibly",
"identify",
"unlinked",
"pedigrees",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Linkage",
"analysis",
"was",
"carried",
"out",
"to",
"6",
"microsatellite",
"markers",
"(",
"D1S249",
",",
"D1S425",
",",
"D1S491",
",",
"D1S205",
",",
"D1S414",
",",
"D1S425",
")",
",",
"yielding",
"a",
"maximum",
"cumulative",
"LOD",
"score",
"of",
"Z",
"=",
"3",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"27",
"at",
"theta",
"=",
"0",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"00",
"for",
"D1S245",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"innermost",
"four",
"markers",
"were",
"found",
"to",
"be",
"tightly",
"linked",
"to",
"one",
"another",
",",
"with",
"no",
"evidence",
"for",
"recombination",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
Subsets and Splits
No community queries yet
The top public SQL queries from the community will appear here once available.