tokens
listlengths 2
123
| ner_tags
listlengths 2
123
|
---|---|
[
"The",
"Wiskott",
"-",
"Aldrich",
"syndrome",
"(",
"WAS",
")",
"is",
"caused",
"by",
"defects",
"in",
"the",
"WAS",
"protein",
"(",
"WASP",
")",
"gene",
"on",
"the",
"X",
"chromosome",
"."
] |
[
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Previous",
"study",
"disclosed",
"that",
"flow",
"cytometric",
"analysis",
"of",
"intracellular",
"WASP",
"expression",
"(",
"FCM",
"-",
"WASP",
"analysis",
")",
"in",
"lymphocytes",
"was",
"useful",
"for",
"the",
"diagnosis",
"of",
"WAS",
"patients",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Lymphocytes",
"from",
"all",
"WAS",
"patients",
"showed",
"WASPdim",
"instead",
"of",
"WASPbright",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Here",
"we",
"report",
"that",
"FCM",
"-",
"WASP",
"analysis",
"in",
"monocytes",
"could",
"be",
"a",
"useful",
"tool",
"for",
"the",
"WAS",
"carrier",
"diagnosis",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Monocytes",
"from",
"all",
"nine",
"WAS",
"carriers",
"showed",
"varied",
"population",
"of",
"WASPdim",
"together",
"with",
"WASPbright",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"None",
"of",
"control",
"individuals",
"possessed",
"the",
"WASPdim",
"population",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"contrast",
",",
"lymphocytes",
"from",
"all",
"the",
"carriers",
"except",
"two",
"lacked",
"the",
"WASPdim",
"population",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"difference",
"of",
"the",
"WASPdim",
"population",
"in",
"monocytes",
"and",
"lymphocytes",
"observed",
"in",
"WAS",
"carriers",
"suggests",
"that",
"WASP",
"plays",
"a",
"more",
"critical",
"role",
"in",
"the",
"development",
"of",
"lymphocytes",
"than",
"in",
"that",
"of",
"monocytes",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"present",
"studies",
"suggest",
"that",
"a",
"skewed",
"X",
"-",
"chromosomal",
"inactivation",
"pattern",
"observed",
"in",
"WAS",
"carrier",
"peripheral",
"blood",
"cells",
"is",
"not",
"fixed",
"at",
"the",
"hemopoietic",
"stem",
"cell",
"level",
"but",
"progresses",
"after",
"the",
"lineage",
"commitment",
".",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Restoration",
"of",
"photoreceptor",
"ultrastructure",
"and",
"function",
"in",
"retinal",
"degeneration",
"slow",
"mice",
"by",
"gene",
"therapy",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"gene",
"Prph2",
"encodes",
"a",
"photoreceptor",
"-",
"specific",
"membrane",
"glycoprotein",
",",
"peripherin",
"-",
"2",
"(",
"also",
"known",
"as",
"peripherin",
"/",
"rds",
")",
",",
"which",
"is",
"inserted",
"into",
"the",
"rims",
"of",
"photoreceptor",
"outer",
"segment",
"discs",
"in",
"a",
"complex",
"with",
"rom",
"-",
"1",
"(",
"ref",
".",
"2",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"complex",
"is",
"necessary",
"for",
"the",
"stabilization",
"of",
"the",
"discs",
",",
"which",
"are",
"renewed",
"constantly",
"throughout",
"life",
",",
"and",
"which",
"contain",
"the",
"visual",
"pigments",
"necessary",
"for",
"photon",
"capture",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Mutations",
"in",
"Prph2",
"have",
"been",
"shown",
"to",
"result",
"in",
"a",
"variety",
"of",
"photoreceptor",
"dystrophies",
",",
"including",
"autosomal",
"dominant",
"retinitis",
"pigmentosa",
"and",
"macular",
"dystrophy",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O"
] |
[
"A",
"common",
"feature",
"of",
"these",
"diseases",
"is",
"the",
"loss",
"of",
"photoreceptor",
"function",
",",
"also",
"seen",
"in",
"the",
"retinal",
"degeneration",
"slow",
"(",
"rds",
"or",
"Prph2",
"Rd2",
"/",
"Rd2",
")",
"mouse",
",",
"which",
"is",
"homozygous",
"for",
"a",
"null",
"mutation",
"in",
"Prph2",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"It",
"is",
"characterized",
"by",
"a",
"complete",
"failure",
"to",
"develop",
"photoreceptor",
"discs",
"and",
"outer",
"segments",
",",
"downregulation",
"of",
"rhodopsin",
"and",
"apoptotic",
"loss",
"of",
"photoreceptor",
"cells",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"electroretinograms",
"(",
"ERGs",
")",
"of",
"Prph2Rd2",
"/",
"Rd2",
"mice",
"have",
"greatly",
"diminished",
"a",
"-",
"wave",
"and",
"b",
"-",
"wave",
"amplitudes",
",",
"which",
"decline",
"to",
"virtually",
"undetectable",
"concentrations",
"by",
"two",
"months",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Subretinal",
"injection",
"of",
"recombinant",
"adeno",
"-",
"associated",
"virus",
"(",
"AAV",
")",
"encoding",
"a",
"Prph2",
"transgene",
"results",
"in",
"stable",
"generation",
"of",
"outer",
"segment",
"structures",
"and",
"formation",
"of",
"new",
"stacks",
"of",
"discs",
"containing",
"both",
"perpherin",
"-",
"2",
"and",
"rhodopsin",
",",
"which",
"in",
"many",
"cases",
"are",
"morphologically",
"similar",
"to",
"normal",
"outer",
"segments",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Moreover",
",",
"the",
"re",
"-",
"establishment",
"of",
"the",
"structural",
"integrity",
"of",
"the",
"photoreceptor",
"layer",
"also",
"results",
"in",
"electrophysiological",
"correction",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"These",
"studies",
"demonstrate",
"for",
"the",
"first",
"time",
"that",
"a",
"complex",
"ultrastructural",
"cell",
"defect",
"can",
"be",
"corrected",
"both",
"morphologically",
"and",
"functionally",
"by",
"in",
"vivo",
"gene",
"transfer",
".",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Mutations",
"in",
"the",
"fibrinogen",
"aalpha",
"gene",
"account",
"for",
"the",
"majority",
"of",
"cases",
"of",
"congenital",
"afibrinogenemia",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O"
] |
[
"Congenital",
"afibrinogenemia",
"is",
"a",
"rare",
",",
"autosomal",
",",
"recessive",
"disorder",
"characterized",
"by",
"the",
"complete",
"absence",
"of",
"detectable",
"fibrinogen",
"."
] |
[
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"previously",
"identified",
"the",
"first",
"causative",
"mutations",
"in",
"a",
"nonconsanguineous",
"Swiss",
"family",
";",
"the",
"4",
"affected",
"persons",
"have",
"homozygous",
"deletions",
"of",
"approximately",
"11",
"kb",
"of",
"the",
"fibrinogen",
"alpha",
"(",
"FGA",
")",
"gene",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Haplotype",
"data",
"implied",
"that",
"these",
"deletions",
"occurred",
"on",
"distinct",
"ancestral",
"chromosomes",
",",
"suggesting",
"that",
"this",
"region",
"may",
"be",
"susceptible",
"to",
"deletion",
"by",
"a",
"common",
"mechanism",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"subsequently",
"showed",
"that",
"all",
"the",
"deletions",
"were",
"identical",
"to",
"the",
"base",
"pair",
"and",
"probably",
"resulted",
"from",
"a",
"nonhomologous",
"recombination",
"mediated",
"by",
"7",
"-",
"bp",
"direct",
"repeats",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"this",
"study",
",",
"we",
"have",
"collected",
"data",
"on",
"13",
"additional",
"unrelated",
"patients",
"to",
"identify",
"the",
"causative",
"mutations",
"and",
"to",
"determine",
"the",
"prevalence",
"of",
"the",
"11",
"-",
"kb",
"deletion",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"A",
"common",
"recurrent",
"mutation",
",",
"at",
"the",
"donor",
"splice",
"site",
"of",
"FGA",
"intron",
"4",
"(",
"IVS4",
"+",
"1",
"G",
">",
"T",
")",
",",
"accounted",
"for",
"14",
"of",
"the",
"26",
"(",
"54",
"%",
")",
"alleles",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"One",
"patient",
"was",
"heterozygous",
"for",
"the",
"previously",
"identified",
"deletion",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Three",
"more",
"frameshift",
"mutations",
",",
"2",
"nonsense",
"mutations",
",",
"and",
"a",
"second",
"splice",
"site",
"mutation",
"were",
"also",
"identified",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Consequently",
",",
"86",
"%",
"of",
"afibrinogenemia",
"alleles",
"analyzed",
"to",
"date",
"have",
"truncating",
"mutations",
"of",
"FGA",
",",
"though",
"mutations",
"in",
"all",
"3",
"fibrinogen",
"genes",
",",
"FGG",
",",
"FGA",
",",
"and",
"FGB",
",",
"might",
"be",
"predicted",
"to",
"cause",
"congenital",
"afibrinogenemia",
".",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O"
] |
[
"Myotonic",
"dystrophy",
":",
"the",
"role",
"of",
"the",
"CUG",
"triplet",
"repeats",
"in",
"splicing",
"of",
"a",
"novel",
"DMPK",
"exon",
"and",
"altered",
"cytoplasmic",
"DMPK",
"mRNA",
"isoform",
"ratios",
"."
] |
[
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"mechanism",
"by",
"which",
"(",
"CTG",
")",
"n",
"expansion",
"in",
"the",
"3",
"UTR",
"of",
"the",
"DMPK",
"gene",
"causes",
"myotonic",
"dystrophy",
"(",
"DM",
")",
"is",
"unknown",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"identified",
"four",
"RNA",
"splicing",
"factors",
"-",
"-",
"hnRNP",
"C",
",",
"U2AF",
"(",
"U2",
"auxiliary",
"factor",
")",
",",
"PTB",
"(",
"polypyrimidine",
"tract",
"binding",
"protein",
")",
",",
"and",
"PSF",
"(",
"PTB",
"associated",
"splicing",
"factor",
")",
"-",
"-",
"that",
"bind",
"to",
"two",
"short",
"regions",
"3",
"of",
"the",
"(",
"CUG",
")",
"n",
",",
"and",
"found",
"a",
"novel",
"3",
"DMPK",
"exon",
"resulting",
"in",
"an",
"mRNA",
"lacking",
"the",
"repeats",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"propose",
"that",
"the",
"(",
"CUG",
")",
"n",
"is",
"an",
"essential",
"cis",
"acting",
"element",
"for",
"this",
"splicing",
"event",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"contrast",
"to",
"(",
"CUG",
")",
"n",
"containing",
"mRNAs",
",",
"the",
"novel",
"isoform",
"is",
"not",
"retained",
"in",
"the",
"nucleus",
"in",
"DM",
"cells",
",",
"resulting",
"in",
"imbalances",
"in",
"relative",
"levels",
"of",
"cytoplasmic",
"DMPK",
"mRNA",
"isoforms",
"and",
"a",
"new",
"dominant",
"effect",
"of",
"the",
"mutation",
"on",
"DMPK",
".",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Expression",
"and",
"imprinting",
"of",
"MAGEL2",
"suggest",
"a",
"role",
"in",
"Prader",
"-",
"willi",
"syndrome",
"and",
"the",
"homologous",
"murine",
"imprinting",
"phenotype",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Prader",
"-",
"Willi",
"syndrome",
"(",
"PWS",
")",
"is",
"caused",
"by",
"the",
"loss",
"of",
"expression",
"of",
"imprinted",
"genes",
"in",
"chromosome",
"15q11",
"-",
"q13",
"."
] |
[
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Affected",
"individuals",
"exhibit",
"neonatal",
"hypotonia",
",",
"developmental",
"delay",
"and",
"childhood",
"-",
"onset",
"obesity",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O"
] |
[
"Necdin",
",",
"a",
"protein",
"implicated",
"in",
"the",
"terminal",
"differentiation",
"of",
"neurons",
",",
"is",
"the",
"only",
"PWS",
"candidate",
"gene",
"to",
"reduce",
"viability",
"when",
"disrupted",
"in",
"a",
"mouse",
"model",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"this",
"study",
",",
"we",
"have",
"characterized",
"MAGEL2",
"(",
"also",
"known",
"as",
"NDNL1",
")",
",",
"a",
"gene",
"with",
"51",
"%",
"amino",
"acid",
"sequence",
"similarity",
"to",
"necdin",
"and",
"located",
"41",
"kb",
"distal",
"to",
"NDN",
"in",
"the",
"PWS",
"deletion",
"region",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"MAGEL2",
"is",
"expressed",
"predominantly",
"in",
"brain",
",",
"the",
"primary",
"tissue",
"affected",
"in",
"PWS",
"and",
"in",
"several",
"fetal",
"tissues",
"as",
"shown",
"by",
"northern",
"blot",
"analysis",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"MAGEL2",
"is",
"imprinted",
"with",
"monoallelic",
"expression",
"in",
"control",
"brain",
",",
"and",
"paternal",
"-",
"only",
"expression",
"in",
"the",
"central",
"nervous",
"system",
"as",
"demonstrated",
"by",
"its",
"lack",
"of",
"expression",
"in",
"brain",
"from",
"a",
"PWS",
"-",
"affected",
"individual",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"orthologous",
"mouse",
"gene",
"(",
"Magel2",
")",
"is",
"located",
"within",
"150",
"kb",
"of",
"NDN",
",",
"is",
"imprinted",
"with",
"paternal",
"-",
"only",
"expression",
"and",
"is",
"expressed",
"predominantly",
"in",
"late",
"developmental",
"stages",
"and",
"adult",
"brain",
"as",
"shown",
"by",
"northern",
"blotting",
",",
"RT",
"-",
"PCR",
"and",
"whole",
"-",
"mount",
"RNA",
"in",
"situ",
"hybridization",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Magel2",
"distribution",
"partially",
"overlaps",
"that",
"of",
"NDN",
",",
"with",
"strong",
"expression",
"being",
"detected",
"in",
"the",
"central",
"nervous",
"system",
"in",
"mid",
"-",
"gestation",
"mouse",
"embryos",
"by",
"in",
"situ",
"hybridization",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"hypothesize",
"that",
",",
"although",
"loss",
"of",
"necdin",
"expression",
"may",
"be",
"important",
"in",
"the",
"neonatal",
"presentation",
"of",
"PWS",
",",
"loss",
"of",
"MAGEL2",
"may",
"be",
"critical",
"to",
"abnormalities",
"in",
"brain",
"development",
"and",
"dysmorphic",
"features",
"in",
"individuals",
"with",
"PWS",
".",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O"
] |
[
"Retinoschisin",
",",
"the",
"X",
"-",
"linked",
"retinoschisis",
"protein",
",",
"is",
"a",
"secreted",
"photoreceptor",
"protein",
",",
"and",
"is",
"expressed",
"and",
"released",
"by",
"Weri",
"-",
"Rb1",
"cells",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"X",
"-",
"linked",
"retinoschisis",
"is",
"characterized",
"by",
"microcystic",
"-",
"like",
"changes",
"of",
"the",
"macular",
"region",
"and",
"schisis",
"within",
"the",
"inner",
"retinal",
"layers",
",",
"leading",
"to",
"visual",
"deterioration",
"in",
"males",
"."
] |
[
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Many",
"missense",
"and",
"protein",
"-",
"truncating",
"mutations",
"of",
"the",
"causative",
"gene",
"RS1",
"have",
"now",
"been",
"identified",
"and",
"are",
"thought",
"to",
"be",
"inactivating",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"RS1",
"encodes",
"a",
"224",
"amino",
"acid",
"protein",
",",
"retinoschisin",
",",
"which",
"contains",
"a",
"discoidin",
"domain",
"but",
"is",
"of",
"unknown",
"function",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"have",
"generated",
"a",
"polyclonal",
"antibody",
"against",
"a",
"peptide",
"from",
"a",
"unique",
"region",
"within",
"retinoschisin",
",",
"which",
"detects",
"a",
"protein",
"of",
"approximately",
"28",
"kDa",
"in",
"retinal",
"samples",
"reduced",
"with",
"dithiothreitol",
",",
"but",
"multimers",
"sized",
">",
"40",
"kDa",
"under",
"non",
"-",
"reducing",
"conditions",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"A",
"screen",
"of",
"human",
"tissues",
"with",
"this",
"antibody",
"reveals",
"retinoschisin",
"to",
"be",
"retina",
"specific",
"and",
"the",
"antibody",
"detects",
"a",
"protein",
"of",
"similar",
"size",
"in",
"bovine",
"and",
"murine",
"retinae",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"investigated",
"the",
"expression",
"pattern",
"in",
"the",
"retina",
"of",
"both",
"RS1",
"mRNA",
"(",
"using",
"in",
"situ",
"hybridization",
"with",
"riboprobes",
")",
"and",
"retinoschisin",
"(",
"using",
"immunohistochemistry",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"antisense",
"riboprobe",
"detected",
"RS1",
"mRNA",
"only",
"in",
"the",
"photoreceptor",
"layer",
"but",
"the",
"protein",
"product",
"of",
"the",
"gene",
"was",
"present",
"both",
"in",
"the",
"photoreceptors",
"and",
"within",
"the",
"inner",
"portions",
"of",
"the",
"retina",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Furthermore",
",",
"differentiated",
"retinoblastoma",
"cells",
"(",
"Weri",
"-",
"Rb1",
"cells",
")",
"were",
"found",
"to",
"express",
"RS1",
"mRNA",
"and",
"to",
"release",
"retinoschisin",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"These",
"results",
"suggest",
"that",
"retinoschisin",
"is",
"released",
"by",
"photo",
"-",
"receptors",
"and",
"has",
"functions",
"within",
"the",
"inner",
"retinal",
"layers",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Thus",
",",
"X",
"-",
"linked",
"retinoschisis",
"is",
"caused",
"by",
"abnormalities",
"in",
"a",
"putative",
"secreted",
"photoreceptor",
"protein",
"and",
"is",
"the",
"first",
"example",
"of",
"a",
"secreted",
"photo",
"-",
"receptor",
"protein",
"associated",
"with",
"a",
"retinal",
"dystrophy",
".",
"."
] |
[
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O"
] |
[
"Study",
"of",
"the",
"voltage",
"-",
"gated",
"sodium",
"channel",
"beta",
"1",
"subunit",
"gene",
"(",
"SCN1B",
")",
"in",
"the",
"benign",
"familial",
"infantile",
"convulsions",
"syndrome",
"(",
"BFIC",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O"
] |
[
"Benign",
"familial",
"infantile",
"convulsions",
"(",
"BFIC",
")",
"is",
"a",
"rare",
"autosomal",
"dominant",
"epilepsy",
"syndrome",
"."
] |
[
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O"
] |
[
"This",
"syndrome",
"has",
"been",
"recently",
"described",
"in",
"Italian",
"and",
"French",
"pedigrees",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Patients",
"present",
"with",
"partial",
",",
"then",
"generalized",
"seizures",
",",
"with",
"onset",
"at",
"age",
"three",
"months",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"seizures",
"usually",
"spontaneously",
"cease",
"after",
"one",
"year",
"without",
"treatment",
",",
"leaving",
"no",
"neurological",
"abnormalities",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O"
] |
[
"We",
"have",
"mapped",
"BFIC",
"to",
"chromosome",
"19q",
"in",
"five",
"Italian",
"pedigrees",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"sodium",
"channel",
"beta1",
"subunit",
"gene",
"(",
"SCN1B",
")",
"maps",
"to",
"this",
"candidate",
"region",
"and",
"has",
"been",
"shown",
"to",
"be",
"involved",
"in",
"one",
"Australian",
"pedigree",
"with",
"generalized",
"epilepsy",
"and",
"febrile",
"seizures",
"\"",
"plus",
"\"",
"(",
"GEFS",
"+",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"this",
"family",
",",
"a",
"missense",
"mutation",
"in",
"SCN1B",
"cosegregates",
"with",
"the",
"GEFS",
"+",
"phenotype",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"BFIC",
"and",
"GEFS",
"+",
"have",
"clinical",
"features",
"in",
"common",
",",
"therefore",
"SCN1B",
"is",
"a",
"candidate",
"gene",
"for",
"BFIC",
"."
] |
[
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O"
] |
[
"We",
"studied",
"SCN1B",
"exons",
"1",
",",
"2",
",",
"3",
",",
"4",
",",
"and",
"5",
",",
"using",
"four",
"SSCP",
"methods",
"in",
"10",
"Caucasian",
"BFIC",
"probands",
"of",
"Western",
"Europe",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"found",
"no",
"exon",
"variants",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"One",
"variant",
"was",
"identified",
"in",
"intron",
"5",
"(",
"IVS5",
"-",
"10C",
">",
"G",
")",
",",
"which",
"did",
"not",
"segregate",
"with",
"BFIC",
"and",
"was",
"observed",
"in",
"9",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"2",
"%",
"controls",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"A",
"second",
"variant",
"in",
"intron",
"5",
"was",
"identified",
"(",
"IVS5",
"+",
"30G",
">",
"A",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"It",
"was",
"rare",
",",
"as",
"not",
"observed",
"in",
"controls",
",",
"but",
"not",
"segregating",
"with",
"the",
"BFIC",
"phenotype",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O"
] |
[
"Inactivation",
"of",
"germline",
"mutant",
"APC",
"alleles",
"by",
"attenuated",
"somatic",
"mutations",
":",
"a",
"molecular",
"genetic",
"mechanism",
"for",
"attenuated",
"familial",
"adenomatous",
"polyposis",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O"
] |
[
"Germline",
"mutations",
"of",
"the",
"adenomatous",
"polyposis",
"coli",
"(",
"APC",
")",
"tumor",
"-",
"suppressor",
"gene",
"result",
"in",
"familial",
"adenomatous",
"polyposis",
"(",
"FAP",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O"
] |
[
"Patients",
"with",
"FAP",
"typically",
"develop",
"hundreds",
"to",
"thousands",
"of",
"benign",
"colorectal",
"tumors",
"and",
"early",
"-",
"onset",
"colorectal",
"cancer",
"."
] |
[
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O"
] |
[
"A",
"subset",
"of",
"germline",
"APC",
"mutations",
"results",
"in",
"an",
"attenuated",
"FAP",
"(",
"AFAP",
")",
"phenotype",
",",
"in",
"which",
"patients",
"develop",
"fewer",
"tumors",
"and",
"develop",
"them",
"at",
"an",
"older",
"age",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Although",
"a",
"genotype",
"-",
"phenotype",
"correlation",
"between",
"the",
"locations",
"of",
"APC",
"germline",
"mutations",
"and",
"the",
"development",
"of",
"AFAP",
"has",
"been",
"well",
"documented",
",",
"the",
"mechanism",
"for",
"AFAP",
"has",
"not",
"been",
"well",
"defined",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"investigated",
"the",
"mechanism",
"for",
"AFAP",
"in",
"patients",
"carrying",
"a",
"mutant",
"APC",
"allele",
"(",
"APC",
"(",
"AS9",
")",
")",
"that",
"has",
"a",
"mutation",
"in",
"the",
"alternatively",
"spliced",
"region",
"of",
"exon",
"9",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"APC",
"(",
"AS9",
")",
"was",
"found",
"to",
"down",
"-",
"regulate",
"beta",
"-",
"catenin",
"-",
"regulated",
"transcription",
",",
"the",
"major",
"tumor",
"-",
"suppressor",
"function",
"of",
"APC",
",",
"as",
"did",
"the",
"wild",
"-",
"type",
"APC",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Mutation",
"analysis",
"showed",
"that",
"both",
"APC",
"(",
"AS9",
")",
"and",
"the",
"wild",
"-",
"type",
"APC",
"alleles",
"were",
"somatically",
"mutated",
"in",
"most",
"colorectal",
"tumors",
"from",
"these",
"patients",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Functional",
"analysis",
"showed",
"that",
"4666insA",
",",
"a",
"common",
"somatic",
"mutation",
"in",
"APC",
"(",
"AS9",
")",
"in",
"these",
"tumors",
",",
"did",
"not",
"inactivate",
"the",
"wild",
"-",
"type",
"APC",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Our",
"results",
"indicate",
"that",
"carriers",
"of",
"APC",
"(",
"AS9",
")",
"develop",
"fewer",
"colorectal",
"tumors",
"than",
"do",
"typical",
"patients",
"with",
"FAP",
"because",
"somatic",
"inactivation",
"of",
"both",
"APC",
"alleles",
"is",
"necessary",
"for",
"colorectal",
"tumorigenesis",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"However",
",",
"these",
"patients",
"develop",
"colorectal",
"tumors",
"more",
"frequently",
"than",
"does",
"the",
"general",
"population",
"because",
"APC",
"(",
"AS9",
")",
"is",
"inactivated",
"by",
"mutations",
"that",
"do",
"not",
"inactivate",
"the",
"wild",
"-",
"type",
"APC",
".",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Iron",
"-",
"dependent",
"self",
"-",
"assembly",
"of",
"recombinant",
"yeast",
"frataxin",
":",
"implications",
"for",
"Friedreich",
"ataxia",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O"
] |
[
"Frataxin",
"deficiency",
"is",
"the",
"primary",
"cause",
"of",
"Friedreich",
"ataxia",
"(",
"FRDA",
")",
",",
"an",
"autosomal",
"recessive",
"cardiodegenerative",
"and",
"neurodegenerative",
"disease",
"."
] |
[
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O"
] |
[
"Frataxin",
"is",
"a",
"nuclear",
"-",
"encoded",
"mitochondrial",
"protein",
"that",
"is",
"widely",
"conserved",
"among",
"eukaryotes",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Genetic",
"inactivation",
"of",
"the",
"yeast",
"frataxin",
"homologue",
"(",
"Yfh1p",
")",
"results",
"in",
"mitochondrial",
"iron",
"accumulation",
"and",
"hypersensitivity",
"to",
"oxidative",
"stress",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O"
] |
[
"Increased",
"iron",
"deposition",
"and",
"evidence",
"of",
"oxidative",
"damage",
"have",
"also",
"been",
"observed",
"in",
"cardiac",
"tissue",
"and",
"cultured",
"fibroblasts",
"from",
"patients",
"with",
"FRDA",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O"
] |
[
"These",
"findings",
"indicate",
"that",
"frataxin",
"is",
"essential",
"for",
"mitochondrial",
"iron",
"homeostasis",
"and",
"protection",
"from",
"iron",
"-",
"induced",
"formation",
"of",
"free",
"radicals",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"functional",
"mechanism",
"of",
"frataxin",
",",
"however",
",",
"is",
"still",
"unknown",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"have",
"expressed",
"the",
"mature",
"form",
"of",
"Yfh1p",
"(",
"mYfh1p",
")",
"in",
"Escherichia",
"coli",
"and",
"have",
"analyzed",
"its",
"function",
"in",
"vitro",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Isolated",
"mYfh1p",
"is",
"a",
"soluble",
"monomer",
"(",
"13",
",",
"783",
"Da",
")",
"that",
"contains",
"no",
"iron",
"and",
"shows",
"no",
"significant",
"tendency",
"to",
"self",
"-",
"associate",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Aerobic",
"addition",
"of",
"ferrous",
"iron",
"to",
"mYfh1p",
"results",
"in",
"assembly",
"of",
"regular",
"spherical",
"multimers",
"with",
"a",
"molecular",
"mass",
"of",
"approximately",
"1",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"1",
"MDa",
"(",
"megadaltons",
")",
"and",
"a",
"diameter",
"of",
"13",
"+",
"/",
"-",
"2",
"nm",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Each",
"multimer",
"consists",
"of",
"approximately",
"60",
"subunits",
"and",
"can",
"sequester",
">",
"3",
",",
"000",
"atoms",
"of",
"iron",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Titration",
"of",
"mYfh1p",
"with",
"increasing",
"iron",
"concentrations",
"supports",
"a",
"stepwise",
"mechanism",
"of",
"multimer",
"assembly",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Sequential",
"addition",
"of",
"an",
"iron",
"chelator",
"and",
"a",
"reducing",
"agent",
"results",
"in",
"quantitative",
"iron",
"release",
"with",
"concomitant",
"disassembly",
"of",
"the",
"multimer",
",",
"indicating",
"that",
"mYfh1p",
"sequesters",
"iron",
"in",
"an",
"available",
"form",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"yeast",
"mitochondria",
",",
"native",
"mYfh1p",
"exists",
"as",
"monomer",
"and",
"a",
"higher",
"-",
"order",
"species",
"with",
"a",
"molecular",
"weight",
">",
"600",
",",
"000",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"After",
"addition",
"of",
"(",
"55",
")",
"Fe",
"to",
"the",
"medium",
",",
"immunoprecipitates",
"of",
"this",
"species",
"contain",
">",
"16",
"atoms",
"of",
"(",
"55",
")",
"Fe",
"per",
"molecule",
"of",
"mYfh1p",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"propose",
"that",
"iron",
"-",
"dependent",
"self",
"-",
"assembly",
"of",
"recombinant",
"mYfh1p",
"reflects",
"a",
"physiological",
"role",
"for",
"frataxin",
"in",
"mitochondrial",
"iron",
"sequestration",
"and",
"bioavailability",
".",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"A",
"mutation",
"in",
"the",
"pleckstrin",
"homology",
"(",
"PH",
")",
"domain",
"of",
"the",
"FGD1",
"gene",
"in",
"an",
"Italian",
"family",
"with",
"faciogenital",
"dysplasia",
"(",
"Aarskog",
"-",
"Scott",
"syndrome",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O"
] |
[
"Aarskog",
"-",
"Scott",
"Syndrome",
"(",
"AAS",
")",
"is",
"an",
"X",
"-",
"linked",
"disorder",
"characterised",
"by",
"short",
"stature",
"and",
"multiple",
"facial",
",",
"limb",
"and",
"genital",
"abnormalities",
"."
] |
[
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O"
] |
Subsets and Splits
No community queries yet
The top public SQL queries from the community will appear here once available.