disi-unibo-nlp/ncbi · Datasets at Hugging Face

tokens listlengths 2 123	ner_tags listlengths 2 123
[ "Five", "imprinted", ",", "paternally", "expressed", "genes", "map", "to", "the", "PWS", "region", ",", "MKRN3", "(", "ref", ".", "3", ")", ",", "NDN", "(", "ref", ".", "4", ")", ",", "NDNL1", "(", "ref", ".", "5", ")", ",", "SNRPN", "(", "refs", "6", "-", "8", ")", "and", "IPW", "(", "ref", ".", "9", ")", ",", "as", "well", "as", "two", "poorly", "characterized", "framents", "designated", "PAR", "-", "1", "and", "PAR", "-", "5", "(", "ref", ".", "10", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Imprinting", "of", "this", "region", "involves", "a", "bipartite", "imprinting", "centre", "(", "IC", ")", ",", "which", "overlaps", "SNRPN", "(", "refs", "10", ",", "11", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Deletion", "of", "the", "SNRPN", "promoter", "/", "exon", "1", "region", "(", "the", "PWS", "IC", "element", ")", "appears", "to", "impair", "the", "establishment", "of", "the", "paternal", "imprint", "in", "the", "male", "germ", "line", "and", "leads", "to", "PWS", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O" ]
[ "Here", "we", "report", "a", "PWS", "family", "in", "which", "the", "father", "is", "mosaic", "for", "an", "IC", "deletion", "on", "his", "paternal", "chromosome", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "deletion", "chromosome", "has", "acquired", "a", "maternal", "methylation", "imprint", "in", "his", "somatic", "cells", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "have", "made", "identical", "findings", "in", "chimaeric", "mice", "generated", "from", "two", "independent", "embryonic", "stem", "(", "ES", ")", "cell", "lines", "harbouring", "a", "similar", "deletion", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Our", "studies", "demonstrate", "that", "the", "PWS", "IC", "element", "is", "not", "only", "required", "for", "the", "establishment", "of", "the", "paternal", "imprint", ",", "but", "also", "for", "its", "postzygotic", "maintenance", ".", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Mice", "deficient", "in", "Six5", "develop", "cataracts", ":", "implications", "for", "myotonic", "dystrophy", "." ]	[ "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]
[ "Expansion", "of", "a", "CTG", "trinucleotide", "repeat", "in", "the", "3", "UTR", "of", "the", "gene", "DMPK", "at", "the", "DM1", "locus", "on", "chromosome", "19", "causes", "myotonic", "dystrophy", ",", "a", "dominantly", "inherited", "disease", "characterized", "by", "skeletal", "muscle", "dystrophy", "and", "myotonia", ",", "cataracts", "and", "cardiac", "conduction", "defects", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]
[ "Targeted", "deletion", "of", "Dm15", ",", "the", "mouse", "orthologue", "of", "human", "DMPK", ",", "produced", "mice", "with", "a", "mild", "myopathy", "and", "cardiac", "conduction", "abnormalities", ",", "but", "without", "other", "features", "of", "myotonic", "dystrophy", ",", "such", "as", "myotonia", "and", "cataracts", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O" ]
[ "We", ",", "and", "others", ",", "have", "demonstrated", "that", "repeat", "expansion", "decreases", "expression", "of", "the", "adjacent", "gene", "SIX5", "(", "refs", "7", ",", "8", ")", ",", "which", "encodes", "a", "homeodomain", "transcription", "factor", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "To", "determine", "whether", "SIX5", "deficiency", "contributes", "to", "the", "myotonic", "dystrophy", "phenotype", ",", "we", "disrupted", "mouse", "Six5", "by", "replacing", "the", "first", "exon", "with", "a", "beta", "-", "galactosidase", "reporter", "." ]	[ "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Six5", "-", "mutant", "mice", "showed", "reporter", "expression", "in", "multiple", "tissues", ",", "including", "the", "developing", "lens", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Homozygous", "mutant", "mice", "had", "no", "apparent", "abnormalities", "of", "skeletal", "muscle", "function", ",", "but", "developed", "lenticular", "opacities", "at", "a", "higher", "rate", "than", "controls", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Our", "results", "suggest", "that", "SIX5", "deficiency", "contributes", "to", "the", "cataract", "phenotype", "in", "myotonic", "dystrophy", ",", "and", "that", "myotonic", "dystrophy", "represents", "a", "multigenic", "disorder", ".", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O" ]
[ "Heterozygous", "loss", "of", "Six5", "in", "mice", "is", "sufficient", "to", "cause", "ocular", "cataracts", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O" ]
[ "Myotonic", "dystrophy", "(", "DM", ")", "is", "an", "autosomal", "dominant", "disorder", "characterized", "by", "skeletal", "muscle", "wasting", ",", "myotonia", ",", "cardiac", "arrhythmia", ",", "hyperinsulinaemia", ",", "mental", "retardation", "and", "ocular", "cataracts", "." ]	[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "O" ]
[ "The", "genetic", "defect", "in", "DM", "is", "a", "CTG", "repeat", "expansion", "located", "in", "the", "3", "untranslated", "region", "of", "DMPK", "and", "5", "of", "a", "homeodomain", "-", "encoding", "gene", ",", "SIX5", "(", "formerly", "DMAHP", ";", "refs", "2", "-", "5", ")", "." ]	[ "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "There", "are", "three", "mechanisms", "by", "which", "CTG", "expansion", "can", "result", "in", "DM", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O" ]
[ "First", ",", "repeat", "expansion", "may", "alter", "the", "processing", "or", "transport", "of", "the", "mutant", "DMPK", "mRNA", "and", "consequently", "reduce", "DMPK", "levels", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Second", ",", "CTG", "expansion", "may", "establish", "a", "region", "of", "heterochromatin", "3", "of", "the", "repeat", "sequence", "and", "decrease", "SIX5", "transcription", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Third", ",", "toxic", "effects", "of", "the", "repeat", "expansion", "may", "be", "intrinsic", "to", "the", "repeated", "elements", "at", "the", "level", "of", "DNA", "or", "RNA", "(", "refs", "10", ",", "11", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Previous", "studies", "have", "demonstrated", "that", "a", "dose", "-", "dependent", "loss", "of", "Dm15", "(", "the", "mouse", "DMPK", "homologue", ")", "in", "mice", "produces", "a", "partial", "DM", "phenotype", "characterized", "by", "decreased", "development", "of", "skeletal", "muscle", "force", "and", "cardiac", "conduction", "disorders", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]
[ "To", "test", "the", "role", "of", "Six5", "loss", "in", "DM", ",", "we", "have", "analysed", "a", "strain", "of", "mice", "in", "which", "Six5", "was", "deleted", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Our", "results", "demonstrate", "that", "the", "rate", "and", "severity", "of", "cataract", "formation", "is", "inversely", "related", "to", "Six5", "dosage", "and", "is", "temporally", "progressive", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Six5", "+", "/", "-", "and", "Six5", "-", "/", "-", "mice", "show", "increased", "steady", "-", "state", "levels", "of", "the", "Na", "+", "/", "K", "+", "-", "ATPase", "alpha", "-", "1", "subunit", "and", "decreased", "Dm15", "mRNA", "levels", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Thus", ",", "altered", "ion", "homeostasis", "within", "the", "lens", "may", "contribute", "to", "cataract", "formation", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O" ]
[ "As", "ocular", "cataracts", "are", "a", "characteristic", "feature", "of", "DM", ",", "these", "results", "demonstrate", "that", "decreased", "SIX5", "transcription", "is", "important", "in", "the", "aetiology", "of", "DM", "." ]	[ "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O" ]
[ "Our", "data", "support", "the", "hypothesis", "that", "DM", "is", "a", "contiguous", "gene", "syndrome", "associated", "with", "the", "partial", "loss", "of", "both", "DMPK", "and", "SIX5", ".", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "ATM", "-", "dependent", "phosphorylation", "of", "nibrin", "in", "response", "to", "radiation", "exposure", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Mutations", "in", "the", "gene", "ATM", "are", "responsible", "for", "the", "genetic", "disorder", "ataxia", "-", "telangiectasia", "(", "A", "-", "T", ")", ",", "which", "is", "characterized", "by", "cerebellar", "dysfunction", ",", "radiosensitivity", ",", "chromosomal", "instability", "and", "cancer", "predisposition", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O" ]
[ "Both", "the", "A", "-", "T", "phenotype", "and", "the", "similarity", "of", "the", "ATM", "protein", "to", "other", "DNA", "-", "damage", "sensors", "suggests", "a", "role", "for", "ATM", "in", "biochemical", "pathways", "involved", "in", "the", "recognition", ",", "signalling", "and", "repair", "of", "DNA", "double", "-", "strand", "breaks", "(", "DSBs", ")", "." ]	[ "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "There", "are", "strong", "parallels", "between", "the", "pattern", "of", "radiosensitivity", ",", "chromosomal", "instability", "and", "cancer", "predisposition", "in", "A", "-", "T", "patients", "and", "that", "in", "patients", "with", "Nijmegen", "breakage", "syndrome", "(", "NBS", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O" ]
[ "The", "protein", "defective", "in", "NBS", ",", "nibrin", "(", "encoded", "by", "NBS1", ")", ",", "forms", "a", "complex", "with", "MRE11", "and", "RAD50", "(", "refs", "1", ",", "2", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "complex", "localizes", "to", "DSBs", "within", "30", "minutes", "after", "cellular", "exposure", "to", "ionizing", "radiation", "(", "IR", ")", "and", "is", "observed", "in", "brightly", "staining", "nuclear", "foci", "after", "a", "longer", "period", "of", "time", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "overlap", "between", "clinical", "and", "cellular", "phenotypes", "in", "A", "-", "T", "and", "NBS", "suggests", "that", "ATM", "and", "nibrin", "may", "function", "in", "the", "same", "biochemical", "pathway", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Here", "we", "demonstrate", "that", "nibrin", "is", "phosphorylated", "within", "one", "hour", "of", "treatment", "of", "cells", "with", "IR", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "response", "is", "abrogated", "in", "A", "-", "T", "cells", "that", "either", "do", "not", "express", "ATM", "protein", "or", "express", "near", "full", "-", "length", "mutant", "protein", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "also", "show", "that", "ATM", "physically", "interacts", "with", "and", "phosphorylates", "nibrin", "on", "serine", "343", "both", "in", "vivo", "and", "in", "vitro", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Phosphorylation", "of", "this", "site", "appears", "to", "be", "functionally", "important", "because", "mutated", "nibrin", "(", "S343A", ")", "does", "not", "completely", "complement", "radiosensitivity", "in", "NBS", "cells", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O" ]
[ "ATM", "phosphorylation", "of", "nibrin", "does", "not", "affect", "nibrin", "-", "MRE11", "-", "RAD50", "association", "as", "revealed", "by", "radiation", "-", "induced", "foci", "formation", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Our", "data", "provide", "a", "biochemical", "explanation", "for", "the", "similarity", "in", "phenotype", "between", "A", "-", "T", "and", "NBS", ".", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O" ]
[ "Clinicopathologic", "features", "of", "BRCA", "-", "linked", "and", "sporadic", "ovarian", "cancer", "." ]	[ "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]
[ "CONTEXT", "Most", "hereditary", "ovarian", "cancers", "are", "associated", "with", "germline", "mutations", "in", "BRCA1", "or", "BRCA2", "." ]	[ "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Attempts", "to", "define", "the", "clinical", "significance", "of", "BRCA", "mutation", "status", "in", "ovarian", "cancer", "have", "produced", "conflicting", "results", ",", "especially", "regarding", "survival", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "OBJECTIVE", "To", "determine", "whether", "hereditary", "ovarian", "cancers", "have", "distinct", "clinical", "and", "pathological", "features", "compared", "with", "sporadic", "(", "nonhereditary", ")", "ovarian", "cancers", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]
[ "DESIGN", "AND", "SETTING", "Retrospective", "cohort", "study", "of", "a", "consecutive", "series", "of", "933", "ovarian", "cancers", "diagnosed", "and", "treated", "at", "our", "institution", ",", "which", "is", "a", "comprehensive", "cancer", "center", "as", "designated", "by", "the", "National", "Cancer", "Institute", ",", "over", "a", "12", "-", "year", "period", "(", "December", "1986", "to", "August", "1998", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "PATIENTS", "The", "study", "was", "restricted", "to", "patients", "of", "Jewish", "origin", "because", "of", "the", "ease", "of", "BRCA1", "and", "BRCA2", "genotyping", "in", "this", "ethnic", "group", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "From", "the", "189", "patients", "who", "identified", "themselves", "as", "Jewish", ",", "88", "hereditary", "cases", "were", "identified", "with", "the", "presence", "of", "a", "germline", "founder", "mutation", "in", "BRCA1", "or", "BRCA2", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "remaining", "101", "cases", "from", "the", "same", "series", "not", "associated", "with", "a", "BRCA", "mutation", "and", "2", "additional", "groups", "(", "Gynecologic", "Oncology", "Group", "protocols", "52", "and", "111", ")", "with", "ovarian", "cancer", "from", "clinical", "trials", "(", "for", "the", "survival", "analysis", ")", "were", "included", "for", "comparison", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "MAIN", "OUTCOME", "MEASURES", "Age", "at", "diagnosis", ",", "surgical", "stage", ",", "histologic", "cell", "type", "and", "grade", ",", "and", "surgical", "outcome", ";", "and", "response", "to", "chemotherapy", "and", "survival", "for", "advanced", "-", "stage", "(", "II", "and", "IV", ")", "cases", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "RESULTS", "Hereditary", "cancers", "were", "rarely", "diagnosed", "before", "age", "40", "years", "and", "were", "common", "after", "age", "60", "years", ",", "with", "mean", "age", "at", "diagnosis", "being", "significantly", "younger", "for", "BRCA1", "-", "vs", "BRCA2", "-", "linked", "patients", "(", "54", "vs", "62", "years", ";", "P", "=", ".", "04", ")", "." ]	[ "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Histology", ",", "grade", ",", "stage", ",", "and", "success", "of", "cytoreductive", "surgery", "were", "similar", "for", "hereditary", "and", "sporadic", "cases", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "hereditary", "group", "had", "a", "longer", "disease", "-", "free", "interval", "following", "primary", "chemotherapy", "in", "comparison", "with", "the", "nonhereditary", "group", ",", "with", "a", "median", "time", "to", "recurrence", "of", "14", "months", "and", "7", "months", ",", "respectively", "(", "P", "<", ".", "001", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Those", "with", "hereditary", "cancers", "had", "improved", "survival", "compared", "with", "the", "nonhereditary", "group", "(", "P", "=", ".", "004", ")", "." ]	[ "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "For", "stage", "III", "cancers", ",", "BRCA", "mutation", "status", "was", "an", "independent", "prognostic", "variable", "(", "P", "=", ".", "03", ")", "." ]	[ "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "CONCLUSIONS", "Although", "BRCA", "-", "associated", "hereditary", "ovarian", "cancers", "in", "this", "population", "have", "surgical", "and", "pathological", "characteristics", "similar", "to", "those", "of", "sporadic", "cancers", ",", "advanced", "-", "stage", "hereditary", "cancer", "patients", "survive", "longer", "than", "nonhereditary", "cancer", "patients", "." ]	[ "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O" ]
[ "Age", "penetrance", "is", "greater", "for", "BRCA1", "-", "linked", "than", "for", "BRCA2", "-", "linked", "cancers", "in", "this", "population", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "gene", "for", "familial", "Mediterranean", "fever", ",", "MEFV", ",", "is", "expressed", "in", "early", "leukocyte", "development", "and", "is", "regulated", "in", "response", "to", "inflammatory", "mediators", "." ]	[ "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Familial", "Mediterranean", "fever", "(", "FMF", ")", "is", "a", "recessive", "disorder", "characterized", "by", "episodes", "of", "fever", "and", "neutrophil", "-", "mediated", "serosal", "inflammation", "." ]	[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]
[ "We", "recently", "identified", "the", "gene", "causing", "FMF", ",", "designated", "MEFV", ",", "and", "found", "it", "to", "be", "expressed", "in", "mature", "neutrophils", ",", "suggesting", "that", "it", "functions", "as", "an", "inflammatory", "regulator", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "To", "facilitate", "our", "understanding", "of", "the", "normal", "function", "of", "MEFV", ",", "we", "extended", "our", "previous", "studies", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "MEFV", "messenger", "RNA", "was", "detected", "by", "reverse", "transcriptase", "-", "polymerase", "chain", "reaction", "in", "bone", "marrow", "leukocytes", ",", "with", "differential", "expression", "observed", "among", "cells", "by", "in", "situ", "hybridization", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "CD34", "hematopoietic", "stem", "-", "cell", "cultures", "induced", "toward", "the", "granulocytic", "lineage", "expressed", "MEFV", "at", "the", "myelocyte", "stage", ",", "concurrently", "with", "lineage", "commitment", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "prepromyelocytic", "cell", "line", "HL60", "expressed", "MEFV", "only", "at", "granulocytic", "and", "monocytic", "differentiation", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "MEFV", "was", "also", "expressed", "in", "the", "monocytic", "cell", "lines", "U937", "and", "THP", "-", "1", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Among", "peripheral", "blood", "leukocytes", ",", "MEFV", "expression", "was", "detected", "in", "neutrophils", ",", "eosinophils", ",", "and", "to", "varying", "degrees", ",", "monocytes", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Consistent", "with", "the", "tissue", "specificity", "of", "expression", ",", "complete", "sequencing", "and", "analysis", "of", "upstream", "regulatory", "regions", "of", "MEFV", "revealed", "homology", "to", "myeloid", "-", "specific", "promoters", "and", "to", "more", "broadly", "expressed", "inflammatory", "promoter", "elements", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "vitro", "stimulation", "of", "monocytes", "with", "the", "proinflammatory", "agents", "interferon", "(", "IFN", ")", "gamma", ",", "tumor", "necrosis", "factor", ",", "and", "lipopolysaccharide", "induced", "MEFV", "expression", ",", "whereas", "the", "antiinflammatory", "cytokines", "interleukin", "(", "IL", ")", "4", ",", "IL", "-", "10", ",", "and", "transforming", "growth", "factor", "beta", "inhibited", "such", "expression", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Induction", "by", "IFN", "-", "gamma", "occurred", "rapidly", "and", "was", "resistant", "to", "cycloheximide", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "IFN", "-", "alpha", "also", "induced", "MEFV", "expression", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "granulocytes", ",", "MEFV", "was", "up", "-", "regulated", "by", "IFN", "-", "gamma", "and", "the", "combination", "of", "IFN", "-", "alpha", "and", "colchicine", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "These", "results", "refine", "understanding", "of", "MEFV", "by", "placing", "the", "gene", "in", "the", "myelomonocytic", "-", "specific", "proinflammatory", "pathway", "and", "identifying", "it", "as", "an", "IFN", "-", "gamma", "immediate", "early", "gene", ".", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Biochemical", "and", "structural", "analysis", "of", "missense", "mutations", "in", "N", "-", "acetylgalactosamine", "-", "6", "-", "sulfate", "sulfatase", "causing", "mucopolysaccharidosis", "IVA", "phenotypes", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O" ]
[ "Mucopolysaccharidosis", "IVA", "(", "MPS", "IVA", ";", "OMIM", "#", "253000", ")", ",", "a", "lysosomal", "storage", "disorder", "caused", "by", "a", "deficiency", "of", "N", "-", "acetylgalactosamine", "-", "6", "-", "sulfate", "sulfatase", "(", "GALNS", ")", ",", "has", "variable", "clinical", "phenotypes", "." ]	[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "To", "date", "we", "have", "identified", "65", "missense", "mutations", "in", "the", "GALNS", "gene", "from", "MPS", "IVA", "patients", ",", "but", "the", "correlation", "between", "genotype", "and", "phenotype", "has", "remained", "unclear", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "studied", "17", "missense", "mutations", "using", "biochemical", "approaches", "and", "32", "missense", "mutations", ",", "using", "structural", "analyses", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Fifteen", "missense", "mutations", "and", "two", "newly", "engineered", "active", "site", "mutations", "(", "C79S", ",", "C79T", ")", "were", "characterized", "by", "transient", "expression", "analysis", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Mutant", "proteins", ",", "except", "for", "C79S", "and", "C79T", ",", "were", "destabilized", "and", "detected", "as", "insoluble", "precursor", "forms", "while", "the", "C79S", "and", "C79T", "mutants", "were", "of", "a", "soluble", "mature", "size", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Mutants", "found", "in", "the", "severe", "phenotype", "had", "no", "activity", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Mutants", "found", "in", "the", "mild", "phenotype", "had", "a", "considerable", "residual", "activity", "(", "1", ".", "3", "-", "13", ".", "3", "%", "of", "wild", "-", "type", "GALNS", "activity", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Sulfatases", ",", "including", "GALNS", ",", "are", "members", "of", "a", "highly", "conserved", "gene", "family", "sharing", "an", "extensive", "sequence", "homology", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Thus", ",", "a", "tertiary", "structural", "model", "of", "human", "GALNS", "was", "constructed", "from", "the", "X", "-", "ray", "crystal", "structure", "of", "N", "-", "acetylgalacto", "-", "samine", "-", "4", "-", "sulfatase", "and", "arylsulfatase", "A", ",", "using", "homology", "modeling", ",", "and", "32", "missense", "mutations", "were", "investigated", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Consequently", ",", "we", "propose", "that", "there", "are", "at", "least", "three", "different", "reasons", "for", "the", "severe", "phenotype", "(", "i", ")", "destruction", "of", "the", "hydrophobic", "core", "or", "modification", "of", "the", "packing", ";", "(", "ii", ")", "removal", "of", "a", "salt", "bridge", "to", "destabilize", "the", "entire", "conformation", ";", "(", "iii", ")", "modification", "of", "the", "active", "site", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "contrast", ",", "mild", "mutations", "were", "mostly", "located", "on", "the", "surface", "of", "the", "GALNS", "protein", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "These", "studies", "shed", "further", "light", "on", "the", "genotype", "-", "phenotype", "correlation", "of", "MPS", "IVA", "and", "structure", "-", "function", "relationship", "in", "the", "sulfatase", "family", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Mutations", "at", "the", "ataxia", "-", "telangiectasia", "locus", "and", "clinical", "phenotypes", "of", "A", "-", "T", "patients", "." ]	[ "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O" ]
[ "Mutations", "at", "the", "ataxia", "-", "telangiectasia", "(", "A", "-", "T", ")", "locus", "on", "chromosome", "band", "11q22", "cause", "a", "distinctive", "autosomal", "recessive", "syndrome", "in", "homozygotes", "and", "predispose", "heterozygotes", "to", "cancer", ",", "ischemic", "heart", "disease", ",", "and", "early", "mortality", "." ]	[ "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "PCR", "amplification", "from", "genomic", "DNA", "and", "automated", "sequencing", "of", "the", "entire", "coding", "region", "(", "66", "exons", ")", "and", "splice", "junctions", "detected", "77", "mutations", "(", "85", "%", ")", "in", "90", "A", "-", "T", "chromosomes", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O" ]
[ "Heteroduplex", "analysis", "detected", "another", "42", "mutations", "at", "the", "A", "-", "T", "locus", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O" ]
[ "Out", "of", "a", "total", "of", "71", "unique", "mutations", ",", "50", "were", "found", "only", "in", "a", "single", "family", ",", "and", "51", "had", "not", "been", "reported", "previously", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Most", "(", "58", "/", "71", ",", "82", "%", ")", "mutations", "were", "frameshift", "and", "nonsense", "mutations", "that", "are", "predicted", "to", "cause", "truncation", "of", "the", "A", "-", "T", "protein", ";", "the", "less", "common", "mutation", "types", "were", "missense", "(", "9", "/", "71", ",", "13", "%", ")", ",", "splicing", "(", "3", "/", "71", ",", "4", "%", ")", "and", "one", "in", "-", "frame", "deletion", ",", "2546", "3", "(", "1", "/", "71", ",", "1", "%", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "mean", "survival", "and", "height", "distribution", "of", "134", "A", "-", "T", "patients", "correlated", "significantly", "with", "the", "specific", "mutations", "present", "in", "the", "patients", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Patients", "homozygous", "for", "a", "single", "truncating", "mutation", ",", "typically", "near", "the", "N", "-", "terminal", "end", "of", "the", "gene", ",", "or", "heterozygous", "for", "the", "in", "-", "frame", "deletion", "2546", "3", ",", "were", "shorter", "and", "had", "significantly", "shorter", "survival", "than", "those", "heterozygous", "for", "a", "splice", "site", "or", "missense", "mutation", ",", "or", "heterozygous", "for", "two", "truncating", "mutations", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Alterations", "of", "the", "length", "or", "amino", "acid", "composition", "of", "the", "A", "-", "T", "gene", "product", "affect", "the", "A", "-", "T", "clinical", "phenotype", "in", "different", "ways", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Mutation", "analysis", "at", "the", "A", "-", "T", "locus", "may", "help", "estimate", "the", "prognosis", "of", "A", "-", "T", "patients", ".", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O" ]
[ "Isolation", ",", "genomic", "organization", ",", "and", "expression", "analysis", "of", "the", "mouse", "and", "rat", "homologs", "of", "MEFV", ",", "the", "gene", "for", "familial", "mediterranean", "fever", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]
[ "Familial", "Mediterranean", "fever", "(", "FMF", ")", "is", "a", "recessive", "disorder", "characterized", "by", "episodes", "of", "fever", "with", "serositis", "or", "synovitis", "." ]	[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O" ]
[ "Recently", "the", "FMF", "gene", "(", "MEFV", ")", "was", "cloned", ";", "the", "protein", "product", ",", "pyrin", "/", "marenostrin", ",", "is", "thought", "to", "regulate", "inflammation", "in", "myeloid", "cells", "." ]	[ "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "this", "manuscript", "we", "report", "the", "mouse", "and", "rat", "homologs", "of", "MEFV", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Five", "imprinted", ",", "paternally", "expressed", "genes", "map", "to", "the", "PWS", "region", ",", "MKRN3", "(", "ref", ".", "3", ")", ",", "NDN", "(", "ref", ".", "4", ")", ",", "NDNL1", "(", "ref", ".", "5", ")", ",", "SNRPN", "(", "refs", "6", "-", "8", ")", "and", "IPW", "(", "ref", ".", "9", ")", ",", "as", "well", "as", "two", "poorly", "characterized", "framents", "designated", "PAR", "-", "1", "and", "PAR", "-", "5", "(", "ref", ".", "10", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Imprinting", "of", "this", "region", "involves", "a", "bipartite", "imprinting", "centre", "(", "IC", ")", ",", "which", "overlaps", "SNRPN", "(", "refs", "10", ",", "11", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Deletion", "of", "the", "SNRPN", "promoter", "/", "exon", "1", "region", "(", "the", "PWS", "IC", "element", ")", "appears", "to", "impair", "the", "establishment", "of", "the", "paternal", "imprint", "in", "the", "male", "germ", "line", "and", "leads", "to", "PWS", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O" ]

[ "Here", "we", "report", "a", "PWS", "family", "in", "which", "the", "father", "is", "mosaic", "for", "an", "IC", "deletion", "on", "his", "paternal", "chromosome", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "deletion", "chromosome", "has", "acquired", "a", "maternal", "methylation", "imprint", "in", "his", "somatic", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "have", "made", "identical", "findings", "in", "chimaeric", "mice", "generated", "from", "two", "independent", "embryonic", "stem", "(", "ES", ")", "cell", "lines", "harbouring", "a", "similar", "deletion", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Our", "studies", "demonstrate", "that", "the", "PWS", "IC", "element", "is", "not", "only", "required", "for", "the", "establishment", "of", "the", "paternal", "imprint", ",", "but", "also", "for", "its", "postzygotic", "maintenance", ".", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Mice", "deficient", "in", "Six5", "develop", "cataracts", ":", "implications", "for", "myotonic", "dystrophy", "." ]

[ "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]

[ "Expansion", "of", "a", "CTG", "trinucleotide", "repeat", "in", "the", "3", "UTR", "of", "the", "gene", "DMPK", "at", "the", "DM1", "locus", "on", "chromosome", "19", "causes", "myotonic", "dystrophy", ",", "a", "dominantly", "inherited", "disease", "characterized", "by", "skeletal", "muscle", "dystrophy", "and", "myotonia", ",", "cataracts", "and", "cardiac", "conduction", "defects", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]

[ "Targeted", "deletion", "of", "Dm15", ",", "the", "mouse", "orthologue", "of", "human", "DMPK", ",", "produced", "mice", "with", "a", "mild", "myopathy", "and", "cardiac", "conduction", "abnormalities", ",", "but", "without", "other", "features", "of", "myotonic", "dystrophy", ",", "such", "as", "myotonia", "and", "cataracts", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O" ]

[ "We", ",", "and", "others", ",", "have", "demonstrated", "that", "repeat", "expansion", "decreases", "expression", "of", "the", "adjacent", "gene", "SIX5", "(", "refs", "7", ",", "8", ")", ",", "which", "encodes", "a", "homeodomain", "transcription", "factor", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "To", "determine", "whether", "SIX5", "deficiency", "contributes", "to", "the", "myotonic", "dystrophy", "phenotype", ",", "we", "disrupted", "mouse", "Six5", "by", "replacing", "the", "first", "exon", "with", "a", "beta", "-", "galactosidase", "reporter", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Six5", "-", "mutant", "mice", "showed", "reporter", "expression", "in", "multiple", "tissues", ",", "including", "the", "developing", "lens", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Homozygous", "mutant", "mice", "had", "no", "apparent", "abnormalities", "of", "skeletal", "muscle", "function", ",", "but", "developed", "lenticular", "opacities", "at", "a", "higher", "rate", "than", "controls", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Our", "results", "suggest", "that", "SIX5", "deficiency", "contributes", "to", "the", "cataract", "phenotype", "in", "myotonic", "dystrophy", ",", "and", "that", "myotonic", "dystrophy", "represents", "a", "multigenic", "disorder", ".", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O" ]

[ "Heterozygous", "loss", "of", "Six5", "in", "mice", "is", "sufficient", "to", "cause", "ocular", "cataracts", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O" ]

[ "Myotonic", "dystrophy", "(", "DM", ")", "is", "an", "autosomal", "dominant", "disorder", "characterized", "by", "skeletal", "muscle", "wasting", ",", "myotonia", ",", "cardiac", "arrhythmia", ",", "hyperinsulinaemia", ",", "mental", "retardation", "and", "ocular", "cataracts", "." ]

[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "O" ]

[ "The", "genetic", "defect", "in", "DM", "is", "a", "CTG", "repeat", "expansion", "located", "in", "the", "3", "untranslated", "region", "of", "DMPK", "and", "5", "of", "a", "homeodomain", "-", "encoding", "gene", ",", "SIX5", "(", "formerly", "DMAHP", ";", "refs", "2", "-", "5", ")", "." ]

[ "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "There", "are", "three", "mechanisms", "by", "which", "CTG", "expansion", "can", "result", "in", "DM", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O" ]

[ "First", ",", "repeat", "expansion", "may", "alter", "the", "processing", "or", "transport", "of", "the", "mutant", "DMPK", "mRNA", "and", "consequently", "reduce", "DMPK", "levels", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Second", ",", "CTG", "expansion", "may", "establish", "a", "region", "of", "heterochromatin", "3", "of", "the", "repeat", "sequence", "and", "decrease", "SIX5", "transcription", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Third", ",", "toxic", "effects", "of", "the", "repeat", "expansion", "may", "be", "intrinsic", "to", "the", "repeated", "elements", "at", "the", "level", "of", "DNA", "or", "RNA", "(", "refs", "10", ",", "11", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Previous", "studies", "have", "demonstrated", "that", "a", "dose", "-", "dependent", "loss", "of", "Dm15", "(", "the", "mouse", "DMPK", "homologue", ")", "in", "mice", "produces", "a", "partial", "DM", "phenotype", "characterized", "by", "decreased", "development", "of", "skeletal", "muscle", "force", "and", "cardiac", "conduction", "disorders", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]

[ "To", "test", "the", "role", "of", "Six5", "loss", "in", "DM", ",", "we", "have", "analysed", "a", "strain", "of", "mice", "in", "which", "Six5", "was", "deleted", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Our", "results", "demonstrate", "that", "the", "rate", "and", "severity", "of", "cataract", "formation", "is", "inversely", "related", "to", "Six5", "dosage", "and", "is", "temporally", "progressive", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Six5", "+", "/", "-", "and", "Six5", "-", "/", "-", "mice", "show", "increased", "steady", "-", "state", "levels", "of", "the", "Na", "+", "/", "K", "+", "-", "ATPase", "alpha", "-", "1", "subunit", "and", "decreased", "Dm15", "mRNA", "levels", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Thus", ",", "altered", "ion", "homeostasis", "within", "the", "lens", "may", "contribute", "to", "cataract", "formation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O" ]

[ "As", "ocular", "cataracts", "are", "a", "characteristic", "feature", "of", "DM", ",", "these", "results", "demonstrate", "that", "decreased", "SIX5", "transcription", "is", "important", "in", "the", "aetiology", "of", "DM", "." ]

[ "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O" ]

[ "Our", "data", "support", "the", "hypothesis", "that", "DM", "is", "a", "contiguous", "gene", "syndrome", "associated", "with", "the", "partial", "loss", "of", "both", "DMPK", "and", "SIX5", ".", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "ATM", "-", "dependent", "phosphorylation", "of", "nibrin", "in", "response", "to", "radiation", "exposure", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Mutations", "in", "the", "gene", "ATM", "are", "responsible", "for", "the", "genetic", "disorder", "ataxia", "-", "telangiectasia", "(", "A", "-", "T", ")", ",", "which", "is", "characterized", "by", "cerebellar", "dysfunction", ",", "radiosensitivity", ",", "chromosomal", "instability", "and", "cancer", "predisposition", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O" ]

[ "Both", "the", "A", "-", "T", "phenotype", "and", "the", "similarity", "of", "the", "ATM", "protein", "to", "other", "DNA", "-", "damage", "sensors", "suggests", "a", "role", "for", "ATM", "in", "biochemical", "pathways", "involved", "in", "the", "recognition", ",", "signalling", "and", "repair", "of", "DNA", "double", "-", "strand", "breaks", "(", "DSBs", ")", "." ]

[ "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "There", "are", "strong", "parallels", "between", "the", "pattern", "of", "radiosensitivity", ",", "chromosomal", "instability", "and", "cancer", "predisposition", "in", "A", "-", "T", "patients", "and", "that", "in", "patients", "with", "Nijmegen", "breakage", "syndrome", "(", "NBS", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O" ]

[ "The", "protein", "defective", "in", "NBS", ",", "nibrin", "(", "encoded", "by", "NBS1", ")", ",", "forms", "a", "complex", "with", "MRE11", "and", "RAD50", "(", "refs", "1", ",", "2", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "complex", "localizes", "to", "DSBs", "within", "30", "minutes", "after", "cellular", "exposure", "to", "ionizing", "radiation", "(", "IR", ")", "and", "is", "observed", "in", "brightly", "staining", "nuclear", "foci", "after", "a", "longer", "period", "of", "time", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "overlap", "between", "clinical", "and", "cellular", "phenotypes", "in", "A", "-", "T", "and", "NBS", "suggests", "that", "ATM", "and", "nibrin", "may", "function", "in", "the", "same", "biochemical", "pathway", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Here", "we", "demonstrate", "that", "nibrin", "is", "phosphorylated", "within", "one", "hour", "of", "treatment", "of", "cells", "with", "IR", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "response", "is", "abrogated", "in", "A", "-", "T", "cells", "that", "either", "do", "not", "express", "ATM", "protein", "or", "express", "near", "full", "-", "length", "mutant", "protein", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "also", "show", "that", "ATM", "physically", "interacts", "with", "and", "phosphorylates", "nibrin", "on", "serine", "343", "both", "in", "vivo", "and", "in", "vitro", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Phosphorylation", "of", "this", "site", "appears", "to", "be", "functionally", "important", "because", "mutated", "nibrin", "(", "S343A", ")", "does", "not", "completely", "complement", "radiosensitivity", "in", "NBS", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O" ]

[ "ATM", "phosphorylation", "of", "nibrin", "does", "not", "affect", "nibrin", "-", "MRE11", "-", "RAD50", "association", "as", "revealed", "by", "radiation", "-", "induced", "foci", "formation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Our", "data", "provide", "a", "biochemical", "explanation", "for", "the", "similarity", "in", "phenotype", "between", "A", "-", "T", "and", "NBS", ".", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O" ]

[ "Clinicopathologic", "features", "of", "BRCA", "-", "linked", "and", "sporadic", "ovarian", "cancer", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]

[ "CONTEXT", "Most", "hereditary", "ovarian", "cancers", "are", "associated", "with", "germline", "mutations", "in", "BRCA1", "or", "BRCA2", "." ]

[ "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Attempts", "to", "define", "the", "clinical", "significance", "of", "BRCA", "mutation", "status", "in", "ovarian", "cancer", "have", "produced", "conflicting", "results", ",", "especially", "regarding", "survival", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "OBJECTIVE", "To", "determine", "whether", "hereditary", "ovarian", "cancers", "have", "distinct", "clinical", "and", "pathological", "features", "compared", "with", "sporadic", "(", "nonhereditary", ")", "ovarian", "cancers", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]

[ "DESIGN", "AND", "SETTING", "Retrospective", "cohort", "study", "of", "a", "consecutive", "series", "of", "933", "ovarian", "cancers", "diagnosed", "and", "treated", "at", "our", "institution", ",", "which", "is", "a", "comprehensive", "cancer", "center", "as", "designated", "by", "the", "National", "Cancer", "Institute", ",", "over", "a", "12", "-", "year", "period", "(", "December", "1986", "to", "August", "1998", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "PATIENTS", "The", "study", "was", "restricted", "to", "patients", "of", "Jewish", "origin", "because", "of", "the", "ease", "of", "BRCA1", "and", "BRCA2", "genotyping", "in", "this", "ethnic", "group", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "From", "the", "189", "patients", "who", "identified", "themselves", "as", "Jewish", ",", "88", "hereditary", "cases", "were", "identified", "with", "the", "presence", "of", "a", "germline", "founder", "mutation", "in", "BRCA1", "or", "BRCA2", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "remaining", "101", "cases", "from", "the", "same", "series", "not", "associated", "with", "a", "BRCA", "mutation", "and", "2", "additional", "groups", "(", "Gynecologic", "Oncology", "Group", "protocols", "52", "and", "111", ")", "with", "ovarian", "cancer", "from", "clinical", "trials", "(", "for", "the", "survival", "analysis", ")", "were", "included", "for", "comparison", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "MAIN", "OUTCOME", "MEASURES", "Age", "at", "diagnosis", ",", "surgical", "stage", ",", "histologic", "cell", "type", "and", "grade", ",", "and", "surgical", "outcome", ";", "and", "response", "to", "chemotherapy", "and", "survival", "for", "advanced", "-", "stage", "(", "II", "and", "IV", ")", "cases", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "RESULTS", "Hereditary", "cancers", "were", "rarely", "diagnosed", "before", "age", "40", "years", "and", "were", "common", "after", "age", "60", "years", ",", "with", "mean", "age", "at", "diagnosis", "being", "significantly", "younger", "for", "BRCA1", "-", "vs", "BRCA2", "-", "linked", "patients", "(", "54", "vs", "62", "years", ";", "P", "=", ".", "04", ")", "." ]

[ "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Histology", ",", "grade", ",", "stage", ",", "and", "success", "of", "cytoreductive", "surgery", "were", "similar", "for", "hereditary", "and", "sporadic", "cases", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "hereditary", "group", "had", "a", "longer", "disease", "-", "free", "interval", "following", "primary", "chemotherapy", "in", "comparison", "with", "the", "nonhereditary", "group", ",", "with", "a", "median", "time", "to", "recurrence", "of", "14", "months", "and", "7", "months", ",", "respectively", "(", "P", "<", ".", "001", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Those", "with", "hereditary", "cancers", "had", "improved", "survival", "compared", "with", "the", "nonhereditary", "group", "(", "P", "=", ".", "004", ")", "." ]

[ "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "For", "stage", "III", "cancers", ",", "BRCA", "mutation", "status", "was", "an", "independent", "prognostic", "variable", "(", "P", "=", ".", "03", ")", "." ]

[ "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "CONCLUSIONS", "Although", "BRCA", "-", "associated", "hereditary", "ovarian", "cancers", "in", "this", "population", "have", "surgical", "and", "pathological", "characteristics", "similar", "to", "those", "of", "sporadic", "cancers", ",", "advanced", "-", "stage", "hereditary", "cancer", "patients", "survive", "longer", "than", "nonhereditary", "cancer", "patients", "." ]

[ "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O" ]

[ "Age", "penetrance", "is", "greater", "for", "BRCA1", "-", "linked", "than", "for", "BRCA2", "-", "linked", "cancers", "in", "this", "population", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "gene", "for", "familial", "Mediterranean", "fever", ",", "MEFV", ",", "is", "expressed", "in", "early", "leukocyte", "development", "and", "is", "regulated", "in", "response", "to", "inflammatory", "mediators", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Familial", "Mediterranean", "fever", "(", "FMF", ")", "is", "a", "recessive", "disorder", "characterized", "by", "episodes", "of", "fever", "and", "neutrophil", "-", "mediated", "serosal", "inflammation", "." ]

[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]

[ "We", "recently", "identified", "the", "gene", "causing", "FMF", ",", "designated", "MEFV", ",", "and", "found", "it", "to", "be", "expressed", "in", "mature", "neutrophils", ",", "suggesting", "that", "it", "functions", "as", "an", "inflammatory", "regulator", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "To", "facilitate", "our", "understanding", "of", "the", "normal", "function", "of", "MEFV", ",", "we", "extended", "our", "previous", "studies", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "MEFV", "messenger", "RNA", "was", "detected", "by", "reverse", "transcriptase", "-", "polymerase", "chain", "reaction", "in", "bone", "marrow", "leukocytes", ",", "with", "differential", "expression", "observed", "among", "cells", "by", "in", "situ", "hybridization", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "CD34", "hematopoietic", "stem", "-", "cell", "cultures", "induced", "toward", "the", "granulocytic", "lineage", "expressed", "MEFV", "at", "the", "myelocyte", "stage", ",", "concurrently", "with", "lineage", "commitment", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "prepromyelocytic", "cell", "line", "HL60", "expressed", "MEFV", "only", "at", "granulocytic", "and", "monocytic", "differentiation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "MEFV", "was", "also", "expressed", "in", "the", "monocytic", "cell", "lines", "U937", "and", "THP", "-", "1", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Among", "peripheral", "blood", "leukocytes", ",", "MEFV", "expression", "was", "detected", "in", "neutrophils", ",", "eosinophils", ",", "and", "to", "varying", "degrees", ",", "monocytes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Consistent", "with", "the", "tissue", "specificity", "of", "expression", ",", "complete", "sequencing", "and", "analysis", "of", "upstream", "regulatory", "regions", "of", "MEFV", "revealed", "homology", "to", "myeloid", "-", "specific", "promoters", "and", "to", "more", "broadly", "expressed", "inflammatory", "promoter", "elements", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "vitro", "stimulation", "of", "monocytes", "with", "the", "proinflammatory", "agents", "interferon", "(", "IFN", ")", "gamma", ",", "tumor", "necrosis", "factor", ",", "and", "lipopolysaccharide", "induced", "MEFV", "expression", ",", "whereas", "the", "antiinflammatory", "cytokines", "interleukin", "(", "IL", ")", "4", ",", "IL", "-", "10", ",", "and", "transforming", "growth", "factor", "beta", "inhibited", "such", "expression", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Induction", "by", "IFN", "-", "gamma", "occurred", "rapidly", "and", "was", "resistant", "to", "cycloheximide", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "IFN", "-", "alpha", "also", "induced", "MEFV", "expression", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "granulocytes", ",", "MEFV", "was", "up", "-", "regulated", "by", "IFN", "-", "gamma", "and", "the", "combination", "of", "IFN", "-", "alpha", "and", "colchicine", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "results", "refine", "understanding", "of", "MEFV", "by", "placing", "the", "gene", "in", "the", "myelomonocytic", "-", "specific", "proinflammatory", "pathway", "and", "identifying", "it", "as", "an", "IFN", "-", "gamma", "immediate", "early", "gene", ".", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Biochemical", "and", "structural", "analysis", "of", "missense", "mutations", "in", "N", "-", "acetylgalactosamine", "-", "6", "-", "sulfate", "sulfatase", "causing", "mucopolysaccharidosis", "IVA", "phenotypes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O" ]

[ "Mucopolysaccharidosis", "IVA", "(", "MPS", "IVA", ";", "OMIM", "#", "253000", ")", ",", "a", "lysosomal", "storage", "disorder", "caused", "by", "a", "deficiency", "of", "N", "-", "acetylgalactosamine", "-", "6", "-", "sulfate", "sulfatase", "(", "GALNS", ")", ",", "has", "variable", "clinical", "phenotypes", "." ]

[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "To", "date", "we", "have", "identified", "65", "missense", "mutations", "in", "the", "GALNS", "gene", "from", "MPS", "IVA", "patients", ",", "but", "the", "correlation", "between", "genotype", "and", "phenotype", "has", "remained", "unclear", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "studied", "17", "missense", "mutations", "using", "biochemical", "approaches", "and", "32", "missense", "mutations", ",", "using", "structural", "analyses", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Fifteen", "missense", "mutations", "and", "two", "newly", "engineered", "active", "site", "mutations", "(", "C79S", ",", "C79T", ")", "were", "characterized", "by", "transient", "expression", "analysis", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Mutant", "proteins", ",", "except", "for", "C79S", "and", "C79T", ",", "were", "destabilized", "and", "detected", "as", "insoluble", "precursor", "forms", "while", "the", "C79S", "and", "C79T", "mutants", "were", "of", "a", "soluble", "mature", "size", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Mutants", "found", "in", "the", "severe", "phenotype", "had", "no", "activity", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Mutants", "found", "in", "the", "mild", "phenotype", "had", "a", "considerable", "residual", "activity", "(", "1", ".", "3", "-", "13", ".", "3", "%", "of", "wild", "-", "type", "GALNS", "activity", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Sulfatases", ",", "including", "GALNS", ",", "are", "members", "of", "a", "highly", "conserved", "gene", "family", "sharing", "an", "extensive", "sequence", "homology", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Thus", ",", "a", "tertiary", "structural", "model", "of", "human", "GALNS", "was", "constructed", "from", "the", "X", "-", "ray", "crystal", "structure", "of", "N", "-", "acetylgalacto", "-", "samine", "-", "4", "-", "sulfatase", "and", "arylsulfatase", "A", ",", "using", "homology", "modeling", ",", "and", "32", "missense", "mutations", "were", "investigated", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Consequently", ",", "we", "propose", "that", "there", "are", "at", "least", "three", "different", "reasons", "for", "the", "severe", "phenotype", "(", "i", ")", "destruction", "of", "the", "hydrophobic", "core", "or", "modification", "of", "the", "packing", ";", "(", "ii", ")", "removal", "of", "a", "salt", "bridge", "to", "destabilize", "the", "entire", "conformation", ";", "(", "iii", ")", "modification", "of", "the", "active", "site", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "contrast", ",", "mild", "mutations", "were", "mostly", "located", "on", "the", "surface", "of", "the", "GALNS", "protein", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "studies", "shed", "further", "light", "on", "the", "genotype", "-", "phenotype", "correlation", "of", "MPS", "IVA", "and", "structure", "-", "function", "relationship", "in", "the", "sulfatase", "family", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Mutations", "at", "the", "ataxia", "-", "telangiectasia", "locus", "and", "clinical", "phenotypes", "of", "A", "-", "T", "patients", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O" ]

[ "Mutations", "at", "the", "ataxia", "-", "telangiectasia", "(", "A", "-", "T", ")", "locus", "on", "chromosome", "band", "11q22", "cause", "a", "distinctive", "autosomal", "recessive", "syndrome", "in", "homozygotes", "and", "predispose", "heterozygotes", "to", "cancer", ",", "ischemic", "heart", "disease", ",", "and", "early", "mortality", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "PCR", "amplification", "from", "genomic", "DNA", "and", "automated", "sequencing", "of", "the", "entire", "coding", "region", "(", "66", "exons", ")", "and", "splice", "junctions", "detected", "77", "mutations", "(", "85", "%", ")", "in", "90", "A", "-", "T", "chromosomes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O" ]

[ "Heteroduplex", "analysis", "detected", "another", "42", "mutations", "at", "the", "A", "-", "T", "locus", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O" ]

[ "Out", "of", "a", "total", "of", "71", "unique", "mutations", ",", "50", "were", "found", "only", "in", "a", "single", "family", ",", "and", "51", "had", "not", "been", "reported", "previously", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Most", "(", "58", "/", "71", ",", "82", "%", ")", "mutations", "were", "frameshift", "and", "nonsense", "mutations", "that", "are", "predicted", "to", "cause", "truncation", "of", "the", "A", "-", "T", "protein", ";", "the", "less", "common", "mutation", "types", "were", "missense", "(", "9", "/", "71", ",", "13", "%", ")", ",", "splicing", "(", "3", "/", "71", ",", "4", "%", ")", "and", "one", "in", "-", "frame", "deletion", ",", "2546", "3", "(", "1", "/", "71", ",", "1", "%", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "mean", "survival", "and", "height", "distribution", "of", "134", "A", "-", "T", "patients", "correlated", "significantly", "with", "the", "specific", "mutations", "present", "in", "the", "patients", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Patients", "homozygous", "for", "a", "single", "truncating", "mutation", ",", "typically", "near", "the", "N", "-", "terminal", "end", "of", "the", "gene", ",", "or", "heterozygous", "for", "the", "in", "-", "frame", "deletion", "2546", "3", ",", "were", "shorter", "and", "had", "significantly", "shorter", "survival", "than", "those", "heterozygous", "for", "a", "splice", "site", "or", "missense", "mutation", ",", "or", "heterozygous", "for", "two", "truncating", "mutations", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Alterations", "of", "the", "length", "or", "amino", "acid", "composition", "of", "the", "A", "-", "T", "gene", "product", "affect", "the", "A", "-", "T", "clinical", "phenotype", "in", "different", "ways", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Mutation", "analysis", "at", "the", "A", "-", "T", "locus", "may", "help", "estimate", "the", "prognosis", "of", "A", "-", "T", "patients", ".", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O" ]

[ "Isolation", ",", "genomic", "organization", ",", "and", "expression", "analysis", "of", "the", "mouse", "and", "rat", "homologs", "of", "MEFV", ",", "the", "gene", "for", "familial", "mediterranean", "fever", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]

[ "Familial", "Mediterranean", "fever", "(", "FMF", ")", "is", "a", "recessive", "disorder", "characterized", "by", "episodes", "of", "fever", "with", "serositis", "or", "synovitis", "." ]

[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O" ]

[ "Recently", "the", "FMF", "gene", "(", "MEFV", ")", "was", "cloned", ";", "the", "protein", "product", ",", "pyrin", "/", "marenostrin", ",", "is", "thought", "to", "regulate", "inflammation", "in", "myeloid", "cells", "." ]

[ "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "this", "manuscript", "we", "report", "the", "mouse", "and", "rat", "homologs", "of", "MEFV", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]