disi-unibo-nlp/ncbi · Datasets at Hugging Face

tokens listlengths 2 123	ner_tags listlengths 2 123
[ "3", "GK", "gene", "resulted", "in", "a", "peak", "LOD", "score", "of", "3", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "46", ",", "centered", "around", "marker", "DXS8039", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "addition", ",", "since", "all", "of", "the", "families", "originated", "in", "a", "population", "with", "a", "proven", "founder", "effect", "-", "the", "Saguenay", "Lac", "-", "St", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "-", "Jean", "region", "of", "Quebec", "-", "a", "common", "disease", "haplotype", "was", "sought", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Indeed", ",", "a", "six", "-", "marker", "haplotype", "extending", "over", "a", "region", "of", "5", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "5", "cM", "was", "observed", "in", "all", "families", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Resequencing", "of", "the", "GK", "gene", "in", "family", "members", "led", "to", "the", "discovery", "of", "a", "N288D", "missense", "mutation", "in", "exon", "10", ",", "which", "resulted", "in", "the", "substitution", "of", "a", "highly", "conserved", "asparagine", "residue", "by", "a", "negatively", "charged", "aspartic", "acid", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Clinical", "and", "molecular", "genetics", "of", "primary", "dystonias", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]
[ "Primary", "dystonias", "are", "movement", "disorders", "with", "dystonia", "as", "a", "major", "symptom", "." ]	[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "They", "are", "frequently", "inherited", "as", "Mendelian", "traits", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "There", "are", "at", "least", "eight", "clinically", "distinct", "autosomal", "dominant", "and", "two", "X", "-", "linked", "recessive", "forms", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "addition", ",", "pedigree", "analyses", "suggest", "the", "occurrence", "of", "an", "autosomal", "recessive", "variant", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "clinical", "classification", "is", "increasingly", "being", "replaced", "by", "a", "genetic", "one", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "To", "date", "gene", "loci", "have", "been", "identified", "in", "at", "least", "six", "autosomal", "dominant", "forms", ",", "i", ".", "e", ".", ",", "in", "idiopathic", "torsion", "dystonia", "(", "9q34", ")", ",", "focal", "dystonia", "(", "18p", ")", ",", "adult", "-", "onset", "idiopathic", "torsion", "dystonia", "of", "mixed", "type", "(", "8p21", "-", "q22", ")", ",", "dopa", "-", "responsive", "dystonia", "(", "14q22", ".", "1", "-", "q22", ".", "2", ")", ",", "and", "paroxysmal", "dystonic", "choreoathetosis", "(", "2q25", "-", "q33", ";", "1p21", "-", "p13", ".", "3", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Gene", "loci", "in", "the", "X", "-", "linked", "recessive", "forms", "have", "been", "assigned", "to", "Xq13", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "1", "in", "the", "X", "-", "linked", "dystonia", "parkinsonism", "syndrome", "and", "to", "Xq22", "in", "X", "-", "linked", "sensorineural", "deafness", ",", "dystonia", ",", "and", "mental", "retardation", "." ]	[ "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]
[ "The", "disease", "genes", "have", "been", "identified", "in", "two", "autosomal", "dominant", "forms", "and", "in", "one", "X", "-", "linked", "recessive", "form", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Mutations", "in", "a", "gene", "coding", "for", "an", "ATP", "-", "binding", "protein", "were", "detected", "in", "idiopathic", "torsion", "dystonia", "(", "DYT1", ")", ",", "and", "the", "GTP", "cyclohydrolase", "1", "gene", "is", "mutated", "in", "dopa", "-", "responsive", "dystonia", "(", "DYT5", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "sensorineural", "deafness", ",", "dystonia", ",", "and", "mental", "retardation", ",", "mutations", "were", "found", "in", "the", "gene", "DDP", "coding", "for", "a", "polypeptide", "of", "unknown", "function", "." ]	[ "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "article", "reviews", "the", "clinical", "and", "molecular", "genetics", "of", "primary", "dystonias", ",", "critically", "discusses", "present", "findings", ",", "and", "proposes", "referring", "to", "the", "known", "forms", ",", "most", "of", "which", "can", "be", "distinguished", "by", "genetic", "criteria", ",", "as", "dystonias", "1", "-", "12", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]
[ "Determination", "of", "30", "X", "-", "linked", "adrenoleukodystrophy", "mutations", ",", "including", "15", "not", "previously", "described", "." ]	[ "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "X", "-", "linked", "Adrenoleukodystrophy", "(", "X", "-", "ALD", ")", "is", "the", "most", "frequent", "peroxisomal", "disease", "." ]	[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]
[ "It", "mainly", "involves", "the", "nervous", "system", "white", "matter", ",", "adrenal", "cortex", "and", "testes", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Several", "distinct", "clinical", "phenotypes", "are", "known", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "principal", "biochemical", "abnormality", "is", "the", "accumulation", "of", "saturated", "very", "-", "long", "-", "chain", "fatty", "acids", "(", "VLCFAs", ">", "C22", "0", ",", "mainly", "C26", "0", ")", ",", "which", "is", "due", "to", "impaired", "capacity", "for", "beta", "-", "oxidation", "in", "peroxisomes", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Diagnosis", "is", "usually", "based", "on", "the", "VLCFA", "levels", "in", "plasma", "or", "cultured", "skin", "fibroblasts", "in", "both", "patients", "and", "carriers", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "0", "." ]	[ "O", "O", "O" ]
[ "1", "%", "of", "affected", "males", ",", "however", ",", "the", "plasma", "C26", "0", "level", "is", "borderline", "normal", ",", "and", "15", "%", "of", "obligate", "female", "carriers", "have", "normal", "results", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Effective", "mutation", "detection", "in", "these", "families", "is", "therefore", "fundamental", "to", "unambiguously", "determine", "the", "genetic", "status", "of", "each", "individual", "at", "risk", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Of", "particular", "concern", "are", "female", "members", "of", "kindreds", "segregating", "X", "-", "ALD", "mutations", ",", "because", "normal", "VLCFA", "levels", "do", "not", "guarantee", "lack", "of", "carrier", "status", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "describe", "a", "fast", "method", "for", "detection", "of", "X", "-", "ALD", "mutations", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O" ]
[ "The", "method", "is", "based", "on", "SSCP", "analysis", "of", "nested", "PCR", "fragments", "followed", "by", "sequence", "-", "determination", "reactions", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Using", "this", "methodology", "we", "have", "found", "X", "-", "ALD", "mutations", "in", "30", "kindreds", ",", "including", "15", "not", "previously", "reported", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "beta", "-", "galactosidase", "gene", "mutations", "affecting", "the", "lysosomal", "enzyme", "and", "the", "elastin", "-", "binding", "protein", "in", "GM1", "-", "gangliosidosis", "patients", "with", "cardiac", "involvement", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]
[ "GM1", "-", "gangliosidosis", "is", "a", "lysosomal", "storage", "disorder", "caused", "by", "deficiency", "of", "acid", "beta", "-", "galactosidase", "(", "GLB1", ")", "." ]	[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "report", "five", "new", "beta", "-", "galactosidase", "gene", "mutations", "in", "nine", "Italian", "patients", "and", "one", "fetus", ",", "segregating", "in", "seven", "unrelated", "families", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Six", "of", "the", "eight", "patients", "with", "the", "infantile", ",", "severe", "form", "of", "the", "disease", "presented", "cardiac", "involvement", ",", "a", "feature", "rarely", "associated", "with", "GM1", "-", "gangliosidosis", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]
[ "Molecular", "analysis", "of", "the", "patients", "RNA", "and", "DNA", "identified", "two", "new", "RNA", "splicing", "defects", ",", "three", "new", "and", "three", "previously", "described", "amino", "acid", "substitutions", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Interestingly", ",", "all", "patients", "with", "cardiac", "involvement", "were", "homozygous", "for", "one", "of", "these", "mutations", "R59H", ",", "Y591C", ",", "Y591N", ",", "or", "IVS14", "-", "2A", ">", "G", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "contrast", ",", "all", "other", "patients", "were", "compound", "heterozygous", "for", "one", "of", "the", "following", "mutations", "R201H", ",", "R482H", ",", "G579D", ",", "IVS8", "+", "2T", ">", "C", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Although", "we", "could", "not", "directly", "correlate", "the", "presence", "of", "cardiac", "abnormalities", "with", "specific", "genetic", "lesions", ",", "the", "mutations", "identified", "in", "patients", "with", "cardiomyopathy", "fell", "in", "the", "GLB1", "cDNA", "region", "common", "to", "the", "lysosomal", "enzyme", "and", "the", "Hbeta", "-", "Gal", "-", "related", "protein", ",", "also", "known", "as", "the", "elastin", "binding", "protein", "(", "EBP", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Consequently", ",", "both", "molecules", "are", "affected", "by", "the", "mutations", ",", "and", "they", "may", "contribute", "differently", "to", "the", "occurrence", "of", "specific", "clinical", "manifestations", ".", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "vivo", "modulation", "of", "Hmgic", "reduces", "obesity", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O" ]
[ "The", "HMGI", "family", "of", "proteins", "consists", "of", "three", "members", ",", "HMGIC", ",", "HMGI", "and", "HMGI", "(", "Y", ")", ",", "that", "function", "as", "architectural", "factors", "and", "are", "essential", "components", "of", "the", "enhancesome", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "HMGIC", "is", "predominantly", "expressed", "in", "proliferating", ",", "undifferentiated", "mesenchymal", "cells", "and", "is", "not", "detected", "in", "adult", "tissues", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "It", "is", "disrupted", "and", "misexpressed", "in", "a", "number", "of", "mesenchymal", "tumour", "cell", "types", ",", "including", "fat", "-", "cell", "tumours", "(", "lipomas", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O" ]
[ "In", "addition", "Hmgic", "-", "/", "-", "mice", "have", "a", "deficiency", "in", "fat", "tissue", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "To", "study", "its", "role", "in", "adipogenesis", "and", "obesity", ",", "we", "examined", "Hmgic", "expression", "in", "the", "adipose", "tissue", "of", "adult", ",", "obese", "mice", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O" ]
[ "Mice", "with", "a", "partial", "or", "complete", "deficiency", "of", "Hmgic", "resisted", "diet", "-", "induced", "obesity", "." ]	[ "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O" ]
[ "Disruption", "of", "Hmgic", "caused", "a", "reduction", "in", "the", "obesity", "induced", "by", "leptin", "deficiency", "(", "Lepob", "/", "Lepob", ")", "in", "a", "gene", "-", "dose", "-", "dependent", "manner", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Our", "studies", "implicate", "a", "role", "for", "HMGIC", "in", "fat", "-", "cell", "proliferation", ",", "indicating", "that", "it", "may", "be", "an", "adipose", "-", "specific", "target", "for", "the", "treatment", "of", "obesity", ".", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O" ]
[ "Molecular", "analysis", "of", "the", "genotype", "-", "phenotype", "relationship", "in", "factor", "X", "deficiency", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]
[ "Factor", "X", "deficiency", "is", "a", "rare", "haemorrhagic", "condition", ",", "normally", "inherited", "as", "an", "autosomal", "recessive", "trait", ",", "in", "which", "a", "variable", "clinical", "presentation", "correlates", "poorly", "with", "laboratory", "phenotype", "." ]	[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "factor", "X", "(", "F10", ")", "genes", "of", "14", "unrelated", "individuals", "with", "factor", "X", "deficiency", "(", "12", "familial", "and", "two", "sporadic", "cases", ")", "were", "sequenced", "yielding", "a", "total", "of", "13", "novel", "mutations", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Family", "studies", "were", "performed", "in", "order", "to", "distinguish", "the", "contributions", "of", "individual", "mutant", "F10", "alleles", "to", "the", "clinical", "and", "laboratory", "phenotypes", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Missense", "mutations", "were", "studied", "by", "means", "of", "molecular", "modelling", ",", "whereas", "single", "basepair", "substitutions", "in", "splice", "sites", "and", "the", "5", "flanking", "region", "were", "examined", "by", "in", "vitro", "splicing", "assay", "and", "luciferase", "reporter", "gene", "assay", "respectively", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "deletion", "allele", "of", "a", "novel", "hexanucleotide", "insertion", "/", "deletion", "polymorphism", "in", "the", "F10", "gene", "promoter", "region", "was", "shown", "by", "reporter", "gene", "assay", ",", "to", "reduce", "promoter", "activity", "by", "approximately", "20", "%", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "One", "family", "manifesting", "an", "autosomal", "dominant", "pattern", "of", "inheritance", "possessed", "three", "clinically", "affected", "members", "who", "were", "heterozygous", "for", "a", "splice", "-", "site", "mutation", "that", "was", "predicted", "to", "lead", "to", "the", "production", "of", "a", "truncated", "protein", "product", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "A", "model", "which", "accounts", "for", "the", "dominant", "negative", "effect", "of", "this", "lesion", "is", "presented", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Variation", "in", "the", "antigen", "level", "of", "heterozygous", "relatives", "of", "probands", "was", "found", "to", "be", "significantly", "higher", "between", "families", "than", "within", "families", ",", "consistent", "with", "the", "view", "that", "the", "nature", "of", "the", "F10", "lesion", "(", "s", ")", "segregating", "in", "a", "given", "family", "is", "a", "prime", "determinant", "of", "the", "laboratory", "phenotype", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "By", "contrast", ",", "no", "such", "relationship", "could", "be", "discerned", "between", "laboratory", "phenotype", "and", "polymorphism", "genotype", ".", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Transgenic", "mice", "expressing", "a", "truncated", "form", "of", "the", "high", "mobility", "group", "I", "-", "C", "protein", "develop", "adiposity", "and", "an", "abnormally", "high", "prevalence", "of", "lipomas", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O" ]
[ "Chromosomal", "translocations", "in", "human", "lipomas", "frequently", "create", "fusion", "transcripts", "encoding", "high", "mobility", "group", "(", "HMG", ")", "I", "-", "C", "DNA", "-", "binding", "domains", "and", "C", "-", "terminal", "sequences", "from", "different", "presumed", "transcription", "factors", ",", "suggesting", "a", "potential", "role", "for", "HMG", "I", "-", "C", "in", "the", "development", "of", "lipomas", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O" ]
[ "To", "evaluate", "the", "role", "of", "the", "HMG", "I", "-", "C", "component", ",", "the", "three", "DNA", "-", "binding", "domains", "of", "HMG", "I", "-", "C", "have", "now", "been", "expressed", "in", "transgenic", "mice", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Despite", "the", "ubiquitous", "expression", "of", "the", "truncated", "HMG", "I", "-", "C", "protein", ",", "the", "transgenic", "mice", "develop", "a", "selective", "abundance", "of", "fat", "tissue", "early", "in", "life", ",", "show", "marked", "adipose", "tissue", "inflammation", ",", "and", "have", "an", "abnormally", "high", "incidence", "of", "lipomas", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O" ]
[ "These", "findings", "demonstrate", "that", "the", "DNA", "-", "binding", "domains", "of", "HMG", "I", "-", "C", ",", "in", "the", "absence", "of", "a", "C", "-", "terminal", "fusion", "partner", ",", "are", "sufficient", "to", "perturb", "adipogenesis", "and", "predispose", "to", "lipomas", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O" ]
[ "We", "provide", "data", "supporting", "the", "central", "utility", "of", "this", "animal", "model", "as", "a", "tool", "to", "understand", "the", "molecular", "mechanisms", "underlying", "the", "development", "of", "one", "of", "the", "most", "common", "kind", "of", "human", "benign", "tumors", ".", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O" ]
[ "ATM", "phosphorylates", "p95", "/", "nbs1", "in", "an", "S", "-", "phase", "checkpoint", "pathway", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "rare", "diseases", "ataxia", "-", "telangiectasia", "(", "AT", ")", ",", "caused", "by", "mutations", "in", "the", "ATM", "gene", ",", "and", "Nijmegen", "breakage", "syndrome", "(", "NBS", ")", ",", "with", "mutations", "in", "the", "p95", "/", "nbs1", "gene", ",", "share", "a", "variety", "of", "phenotypic", "abnormalities", "such", "as", "chromosomal", "instability", ",", "radiation", "sensitivity", "and", "defects", "in", "cell", "-", "cycle", "checkpoints", "in", "response", "to", "ionizing", "radiation", "." ]	[ "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "ATM", "gene", "encodes", "a", "protein", "kinase", "that", "is", "activated", "by", "ionizing", "radiation", "or", "radiomimetic", "drugs", ",", "whereas", "p95", "/", "nbs1", "is", "part", "of", "a", "protein", "complex", "that", "is", "involved", "in", "responses", "to", "DNA", "double", "-", "strand", "breaks", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Here", ",", "because", "of", "the", "similarities", "between", "AT", "and", "NBS", ",", "we", "evaluated", "the", "functional", "interactions", "between", "ATM", "and", "p95", "/", "nbs1", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Activation", "of", "the", "ATM", "kinase", "by", "ionizing", "radiation", "and", "induction", "of", "ATM", "-", "dependent", "responses", "in", "NBS", "cells", "indicated", "that", "p95", "/", "nbs1", "may", "not", "be", "required", "for", "signalling", "to", "ATM", "after", "ionizing", "radiation", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "However", ",", "p95", "/", "nbs1", "was", "phosphorylated", "on", "serine", "343", "in", "an", "ATM", "-", "dependent", "manner", "in", "vitro", "and", "in", "vivo", "after", "ionizing", "radiation", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "A", "p95", "/", "nbs1", "construct", "mutated", "at", "the", "ATM", "phosphorylation", "site", "abrogated", "an", "S", "-", "phase", "checkpoint", "induced", "by", "ionizing", "radiation", "in", "normal", "cells", "and", "failed", "to", "compensate", "for", "this", "functional", "deficiency", "in", "NBS", "cells", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O" ]
[ "These", "observations", "link", "ATM", "and", "p95", "/", "nbs1", "in", "a", "common", "signalling", "pathway", "and", "provide", "an", "explanation", "for", "phenotypic", "similarities", "in", "these", "two", "diseases", ".", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Understanding", "the", "molecular", "basis", "of", "fragile", "X", "syndrome", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]
[ "Fragile", "X", "syndrome", ",", "a", "common", "form", "of", "inherited", "mental", "retardation", ",", "is", "mainly", "caused", "by", "massive", "expansion", "of", "CGG", "triplet", "repeats", "located", "in", "the", "5", "-", "untranslated", "region", "of", "the", "fragile", "X", "mental", "retardation", "-", "1", "(", "FMR1", ")", "gene", "." ]	[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "patients", "with", "fragile", "X", "syndrome", ",", "the", "expanded", "CGG", "triplet", "repeats", "are", "hypermethylated", "and", "the", "expression", "of", "the", "FMR1", "gene", "is", "repressed", ",", "which", "leads", "to", "the", "absence", "of", "FMR1", "protein", "(", "FMRP", ")", "and", "subsequent", "mental", "retardation", "." ]	[ "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]
[ "FMRP", "is", "an", "RNA", "-", "binding", "protein", "that", "shuttles", "between", "the", "nucleus", "and", "cytoplasm", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "protein", "has", "been", "implicated", "in", "protein", "translation", "as", "it", "is", "found", "associated", "with", "polyribosomes", "and", "the", "rough", "endoplasmic", "reticulum", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "discuss", "here", "the", "recent", "progress", "made", "towards", "understanding", "the", "molecular", "mechanism", "of", "CGG", "repeat", "expansion", "and", "physiological", "function", "(", "s", ")", "of", "FMRP", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "These", "studies", "will", "not", "only", "help", "to", "illuminate", "the", "molecular", "basis", "of", "the", "general", "class", "of", "human", "diseases", "with", "trinucleotide", "repeat", "expansion", "but", "also", "provide", "an", "avenue", "to", "understand", "aspects", "of", "human", "cognition", "and", "intelligence", ".", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Haploinsufficiency", "of", "the", "transcription", "factors", "FOXC1", "and", "FOXC2", "results", "in", "aberrant", "ocular", "development", "." ]	[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Anterior", "segment", "developmental", "disorders", ",", "including", "Axenfeld", "-", "Rieger", "anomaly", "(", "ARA", ")", ",", "variably", "associate", "with", "harmfully", "elevated", "intraocular", "pressure", "(", "IOP", ")", ",", "which", "causes", "glaucoma", "." ]	[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O" ]
[ "Clinically", "observed", "dysgenesis", "does", "not", "correlate", "with", "IOP", ",", "however", ",", "and", "the", "etiology", "of", "glaucoma", "development", "is", "not", "understood", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "forkhead", "transcription", "factor", "genes", "Foxc1", "(", "formerly", "Mf1", ")", "and", "Foxc2", "(", "formerly", "Mfh1", ")", "are", "expressed", "in", "the", "mesenchyme", "from", "which", "the", "ocular", "drainage", "structures", "derive", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Mutations", "in", "the", "human", "homolog", "of", "Foxc1", ",", "FKHL7", ",", "cause", "dominant", "anterior", "segment", "defects", "and", "glaucoma", "in", "various", "families", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "show", "that", "Foxc1", "(", "+", "/", "-", ")", "mice", "have", "anterior", "segment", "abnormalities", "similar", "to", "those", "reported", "in", "human", "patients", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "These", "abnormalities", "include", "small", "or", "absent", "Schlemms", "canal", ",", "aberrantly", "developed", "trabecular", "meshwork", ",", "iris", "hypoplasia", ",", "severely", "eccentric", "pupils", "and", "displaced", "Schwalbes", "line", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "penetrance", "of", "clinically", "obvious", "abnormalities", "varies", "with", "genetic", "background", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "some", "affected", "eyes", ",", "collagen", "bundles", "were", "half", "normal", "diameter", ",", "or", "collagen", "and", "elastic", "tissue", "were", "very", "sparse", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Thus", ",", "abnormalities", "in", "extracellular", "matrix", "synthesis", "or", "organization", "may", "contribute", "to", "development", "of", "the", "ocular", "phenotypes", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Despite", "the", "abnormalities", "in", "ocular", "drainage", "structures", "in", "Foxc1", "(", "+", "/", "-", ")", "mice", ",", "IOP", "was", "normal", "in", "almost", "all", "mice", "analyzed", ",", "on", "all", "genetic", "backgrounds", "and", "at", "all", "ages", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Similar", "abnormalities", "were", "found", "in", "Foxc2", "(", "+", "/", "-", ")", "mice", ",", "but", "no", "disease", "-", "associated", "mutations", "were", "identified", "in", "the", "human", "homolog", "FKHL14", "in", "32", "ARA", "patients", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O" ]
[ "Foxc1", "(", "+", "/", "-", ")", "and", "Foxc2", "(", "+", "/", "-", ")", "mice", "are", "useful", "models", "for", "studying", "anterior", "segment", "development", "and", "its", "anomalies", ",", "and", "may", "allow", "identification", "of", "genes", "that", "interact", "with", "Foxc1", "and", "Foxc2", "(", "or", "FKHL7", "and", "FKHL14", ")", "to", "produce", "a", "phenotype", "with", "elevated", "IOP", "and", "glaucoma", ".", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O" ]
[ "(", "Over", ")", "correction", "of", "FMR1", "deficiency", "with", "YAC", "transgenics", ":", "behavioral", "and", "physical", "features", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Fragile", "X", "syndrome", "is", "a", "common", "cause", "of", "mental", "retardation", "involving", "loss", "of", "expression", "of", "the", "FMR1", "gene", "." ]	[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "role", "of", "FMR1", "remains", "undetermined", "but", "the", "protein", "appears", "to", "be", "involved", "in", "RNA", "metabolism", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Fmr1", "knockout", "mice", "exhibit", "a", "phenotype", "with", "some", "similarities", "to", "humans", ",", "such", "as", "macroorchidism", "and", "behavioral", "abnormalities", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O" ]
[ "As", "a", "step", "toward", "understanding", "the", "function", "of", "FMR1", "and", "the", "determination", "of", "the", "potential", "for", "therapeutic", "approaches", "to", "fragile", "X", "syndrome", ",", "yeast", "artificial", "chromosome", "(", "YAC", ")", "transgenic", "mice", "were", "generated", "in", "order", "to", "determine", "whether", "the", "Fmr1", "knockout", "mouse", "phenotype", "could", "be", "rescued", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "3", "GK", "gene", "resulted", "in", "a", "peak", "LOD", "score", "of", "3", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "46", ",", "centered", "around", "marker", "DXS8039", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "addition", ",", "since", "all", "of", "the", "families", "originated", "in", "a", "population", "with", "a", "proven", "founder", "effect", "-", "the", "Saguenay", "Lac", "-", "St", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "-", "Jean", "region", "of", "Quebec", "-", "a", "common", "disease", "haplotype", "was", "sought", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Indeed", ",", "a", "six", "-", "marker", "haplotype", "extending", "over", "a", "region", "of", "5", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "5", "cM", "was", "observed", "in", "all", "families", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Resequencing", "of", "the", "GK", "gene", "in", "family", "members", "led", "to", "the", "discovery", "of", "a", "N288D", "missense", "mutation", "in", "exon", "10", ",", "which", "resulted", "in", "the", "substitution", "of", "a", "highly", "conserved", "asparagine", "residue", "by", "a", "negatively", "charged", "aspartic", "acid", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Clinical", "and", "molecular", "genetics", "of", "primary", "dystonias", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]

[ "Primary", "dystonias", "are", "movement", "disorders", "with", "dystonia", "as", "a", "major", "symptom", "." ]

[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "They", "are", "frequently", "inherited", "as", "Mendelian", "traits", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "There", "are", "at", "least", "eight", "clinically", "distinct", "autosomal", "dominant", "and", "two", "X", "-", "linked", "recessive", "forms", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "addition", ",", "pedigree", "analyses", "suggest", "the", "occurrence", "of", "an", "autosomal", "recessive", "variant", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "clinical", "classification", "is", "increasingly", "being", "replaced", "by", "a", "genetic", "one", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "To", "date", "gene", "loci", "have", "been", "identified", "in", "at", "least", "six", "autosomal", "dominant", "forms", ",", "i", ".", "e", ".", ",", "in", "idiopathic", "torsion", "dystonia", "(", "9q34", ")", ",", "focal", "dystonia", "(", "18p", ")", ",", "adult", "-", "onset", "idiopathic", "torsion", "dystonia", "of", "mixed", "type", "(", "8p21", "-", "q22", ")", ",", "dopa", "-", "responsive", "dystonia", "(", "14q22", ".", "1", "-", "q22", ".", "2", ")", ",", "and", "paroxysmal", "dystonic", "choreoathetosis", "(", "2q25", "-", "q33", ";", "1p21", "-", "p13", ".", "3", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Gene", "loci", "in", "the", "X", "-", "linked", "recessive", "forms", "have", "been", "assigned", "to", "Xq13", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "1", "in", "the", "X", "-", "linked", "dystonia", "parkinsonism", "syndrome", "and", "to", "Xq22", "in", "X", "-", "linked", "sensorineural", "deafness", ",", "dystonia", ",", "and", "mental", "retardation", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]

[ "The", "disease", "genes", "have", "been", "identified", "in", "two", "autosomal", "dominant", "forms", "and", "in", "one", "X", "-", "linked", "recessive", "form", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Mutations", "in", "a", "gene", "coding", "for", "an", "ATP", "-", "binding", "protein", "were", "detected", "in", "idiopathic", "torsion", "dystonia", "(", "DYT1", ")", ",", "and", "the", "GTP", "cyclohydrolase", "1", "gene", "is", "mutated", "in", "dopa", "-", "responsive", "dystonia", "(", "DYT5", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "sensorineural", "deafness", ",", "dystonia", ",", "and", "mental", "retardation", ",", "mutations", "were", "found", "in", "the", "gene", "DDP", "coding", "for", "a", "polypeptide", "of", "unknown", "function", "." ]

[ "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "article", "reviews", "the", "clinical", "and", "molecular", "genetics", "of", "primary", "dystonias", ",", "critically", "discusses", "present", "findings", ",", "and", "proposes", "referring", "to", "the", "known", "forms", ",", "most", "of", "which", "can", "be", "distinguished", "by", "genetic", "criteria", ",", "as", "dystonias", "1", "-", "12", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]

[ "Determination", "of", "30", "X", "-", "linked", "adrenoleukodystrophy", "mutations", ",", "including", "15", "not", "previously", "described", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "X", "-", "linked", "Adrenoleukodystrophy", "(", "X", "-", "ALD", ")", "is", "the", "most", "frequent", "peroxisomal", "disease", "." ]

[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]

[ "It", "mainly", "involves", "the", "nervous", "system", "white", "matter", ",", "adrenal", "cortex", "and", "testes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Several", "distinct", "clinical", "phenotypes", "are", "known", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "principal", "biochemical", "abnormality", "is", "the", "accumulation", "of", "saturated", "very", "-", "long", "-", "chain", "fatty", "acids", "(", "VLCFAs", ">", "C22", "0", ",", "mainly", "C26", "0", ")", ",", "which", "is", "due", "to", "impaired", "capacity", "for", "beta", "-", "oxidation", "in", "peroxisomes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Diagnosis", "is", "usually", "based", "on", "the", "VLCFA", "levels", "in", "plasma", "or", "cultured", "skin", "fibroblasts", "in", "both", "patients", "and", "carriers", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "0", "." ]

[ "O", "O", "O" ]

[ "1", "%", "of", "affected", "males", ",", "however", ",", "the", "plasma", "C26", "0", "level", "is", "borderline", "normal", ",", "and", "15", "%", "of", "obligate", "female", "carriers", "have", "normal", "results", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Effective", "mutation", "detection", "in", "these", "families", "is", "therefore", "fundamental", "to", "unambiguously", "determine", "the", "genetic", "status", "of", "each", "individual", "at", "risk", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Of", "particular", "concern", "are", "female", "members", "of", "kindreds", "segregating", "X", "-", "ALD", "mutations", ",", "because", "normal", "VLCFA", "levels", "do", "not", "guarantee", "lack", "of", "carrier", "status", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "describe", "a", "fast", "method", "for", "detection", "of", "X", "-", "ALD", "mutations", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O" ]

[ "The", "method", "is", "based", "on", "SSCP", "analysis", "of", "nested", "PCR", "fragments", "followed", "by", "sequence", "-", "determination", "reactions", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Using", "this", "methodology", "we", "have", "found", "X", "-", "ALD", "mutations", "in", "30", "kindreds", ",", "including", "15", "not", "previously", "reported", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "beta", "-", "galactosidase", "gene", "mutations", "affecting", "the", "lysosomal", "enzyme", "and", "the", "elastin", "-", "binding", "protein", "in", "GM1", "-", "gangliosidosis", "patients", "with", "cardiac", "involvement", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]

[ "GM1", "-", "gangliosidosis", "is", "a", "lysosomal", "storage", "disorder", "caused", "by", "deficiency", "of", "acid", "beta", "-", "galactosidase", "(", "GLB1", ")", "." ]

[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "report", "five", "new", "beta", "-", "galactosidase", "gene", "mutations", "in", "nine", "Italian", "patients", "and", "one", "fetus", ",", "segregating", "in", "seven", "unrelated", "families", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Six", "of", "the", "eight", "patients", "with", "the", "infantile", ",", "severe", "form", "of", "the", "disease", "presented", "cardiac", "involvement", ",", "a", "feature", "rarely", "associated", "with", "GM1", "-", "gangliosidosis", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]

[ "Molecular", "analysis", "of", "the", "patients", "RNA", "and", "DNA", "identified", "two", "new", "RNA", "splicing", "defects", ",", "three", "new", "and", "three", "previously", "described", "amino", "acid", "substitutions", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Interestingly", ",", "all", "patients", "with", "cardiac", "involvement", "were", "homozygous", "for", "one", "of", "these", "mutations", "R59H", ",", "Y591C", ",", "Y591N", ",", "or", "IVS14", "-", "2A", ">", "G", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "contrast", ",", "all", "other", "patients", "were", "compound", "heterozygous", "for", "one", "of", "the", "following", "mutations", "R201H", ",", "R482H", ",", "G579D", ",", "IVS8", "+", "2T", ">", "C", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Although", "we", "could", "not", "directly", "correlate", "the", "presence", "of", "cardiac", "abnormalities", "with", "specific", "genetic", "lesions", ",", "the", "mutations", "identified", "in", "patients", "with", "cardiomyopathy", "fell", "in", "the", "GLB1", "cDNA", "region", "common", "to", "the", "lysosomal", "enzyme", "and", "the", "Hbeta", "-", "Gal", "-", "related", "protein", ",", "also", "known", "as", "the", "elastin", "binding", "protein", "(", "EBP", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Consequently", ",", "both", "molecules", "are", "affected", "by", "the", "mutations", ",", "and", "they", "may", "contribute", "differently", "to", "the", "occurrence", "of", "specific", "clinical", "manifestations", ".", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "vivo", "modulation", "of", "Hmgic", "reduces", "obesity", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O" ]

[ "The", "HMGI", "family", "of", "proteins", "consists", "of", "three", "members", ",", "HMGIC", ",", "HMGI", "and", "HMGI", "(", "Y", ")", ",", "that", "function", "as", "architectural", "factors", "and", "are", "essential", "components", "of", "the", "enhancesome", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "HMGIC", "is", "predominantly", "expressed", "in", "proliferating", ",", "undifferentiated", "mesenchymal", "cells", "and", "is", "not", "detected", "in", "adult", "tissues", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "It", "is", "disrupted", "and", "misexpressed", "in", "a", "number", "of", "mesenchymal", "tumour", "cell", "types", ",", "including", "fat", "-", "cell", "tumours", "(", "lipomas", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O" ]

[ "In", "addition", "Hmgic", "-", "/", "-", "mice", "have", "a", "deficiency", "in", "fat", "tissue", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "To", "study", "its", "role", "in", "adipogenesis", "and", "obesity", ",", "we", "examined", "Hmgic", "expression", "in", "the", "adipose", "tissue", "of", "adult", ",", "obese", "mice", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O" ]

[ "Mice", "with", "a", "partial", "or", "complete", "deficiency", "of", "Hmgic", "resisted", "diet", "-", "induced", "obesity", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O" ]

[ "Disruption", "of", "Hmgic", "caused", "a", "reduction", "in", "the", "obesity", "induced", "by", "leptin", "deficiency", "(", "Lepob", "/", "Lepob", ")", "in", "a", "gene", "-", "dose", "-", "dependent", "manner", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Our", "studies", "implicate", "a", "role", "for", "HMGIC", "in", "fat", "-", "cell", "proliferation", ",", "indicating", "that", "it", "may", "be", "an", "adipose", "-", "specific", "target", "for", "the", "treatment", "of", "obesity", ".", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O" ]

[ "Molecular", "analysis", "of", "the", "genotype", "-", "phenotype", "relationship", "in", "factor", "X", "deficiency", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]

[ "Factor", "X", "deficiency", "is", "a", "rare", "haemorrhagic", "condition", ",", "normally", "inherited", "as", "an", "autosomal", "recessive", "trait", ",", "in", "which", "a", "variable", "clinical", "presentation", "correlates", "poorly", "with", "laboratory", "phenotype", "." ]

[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "factor", "X", "(", "F10", ")", "genes", "of", "14", "unrelated", "individuals", "with", "factor", "X", "deficiency", "(", "12", "familial", "and", "two", "sporadic", "cases", ")", "were", "sequenced", "yielding", "a", "total", "of", "13", "novel", "mutations", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Family", "studies", "were", "performed", "in", "order", "to", "distinguish", "the", "contributions", "of", "individual", "mutant", "F10", "alleles", "to", "the", "clinical", "and", "laboratory", "phenotypes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Missense", "mutations", "were", "studied", "by", "means", "of", "molecular", "modelling", ",", "whereas", "single", "basepair", "substitutions", "in", "splice", "sites", "and", "the", "5", "flanking", "region", "were", "examined", "by", "in", "vitro", "splicing", "assay", "and", "luciferase", "reporter", "gene", "assay", "respectively", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "deletion", "allele", "of", "a", "novel", "hexanucleotide", "insertion", "/", "deletion", "polymorphism", "in", "the", "F10", "gene", "promoter", "region", "was", "shown", "by", "reporter", "gene", "assay", ",", "to", "reduce", "promoter", "activity", "by", "approximately", "20", "%", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "One", "family", "manifesting", "an", "autosomal", "dominant", "pattern", "of", "inheritance", "possessed", "three", "clinically", "affected", "members", "who", "were", "heterozygous", "for", "a", "splice", "-", "site", "mutation", "that", "was", "predicted", "to", "lead", "to", "the", "production", "of", "a", "truncated", "protein", "product", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "A", "model", "which", "accounts", "for", "the", "dominant", "negative", "effect", "of", "this", "lesion", "is", "presented", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Variation", "in", "the", "antigen", "level", "of", "heterozygous", "relatives", "of", "probands", "was", "found", "to", "be", "significantly", "higher", "between", "families", "than", "within", "families", ",", "consistent", "with", "the", "view", "that", "the", "nature", "of", "the", "F10", "lesion", "(", "s", ")", "segregating", "in", "a", "given", "family", "is", "a", "prime", "determinant", "of", "the", "laboratory", "phenotype", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "By", "contrast", ",", "no", "such", "relationship", "could", "be", "discerned", "between", "laboratory", "phenotype", "and", "polymorphism", "genotype", ".", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Transgenic", "mice", "expressing", "a", "truncated", "form", "of", "the", "high", "mobility", "group", "I", "-", "C", "protein", "develop", "adiposity", "and", "an", "abnormally", "high", "prevalence", "of", "lipomas", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O" ]

[ "Chromosomal", "translocations", "in", "human", "lipomas", "frequently", "create", "fusion", "transcripts", "encoding", "high", "mobility", "group", "(", "HMG", ")", "I", "-", "C", "DNA", "-", "binding", "domains", "and", "C", "-", "terminal", "sequences", "from", "different", "presumed", "transcription", "factors", ",", "suggesting", "a", "potential", "role", "for", "HMG", "I", "-", "C", "in", "the", "development", "of", "lipomas", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O" ]

[ "To", "evaluate", "the", "role", "of", "the", "HMG", "I", "-", "C", "component", ",", "the", "three", "DNA", "-", "binding", "domains", "of", "HMG", "I", "-", "C", "have", "now", "been", "expressed", "in", "transgenic", "mice", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Despite", "the", "ubiquitous", "expression", "of", "the", "truncated", "HMG", "I", "-", "C", "protein", ",", "the", "transgenic", "mice", "develop", "a", "selective", "abundance", "of", "fat", "tissue", "early", "in", "life", ",", "show", "marked", "adipose", "tissue", "inflammation", ",", "and", "have", "an", "abnormally", "high", "incidence", "of", "lipomas", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O" ]

[ "These", "findings", "demonstrate", "that", "the", "DNA", "-", "binding", "domains", "of", "HMG", "I", "-", "C", ",", "in", "the", "absence", "of", "a", "C", "-", "terminal", "fusion", "partner", ",", "are", "sufficient", "to", "perturb", "adipogenesis", "and", "predispose", "to", "lipomas", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O" ]

[ "We", "provide", "data", "supporting", "the", "central", "utility", "of", "this", "animal", "model", "as", "a", "tool", "to", "understand", "the", "molecular", "mechanisms", "underlying", "the", "development", "of", "one", "of", "the", "most", "common", "kind", "of", "human", "benign", "tumors", ".", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O" ]

[ "ATM", "phosphorylates", "p95", "/", "nbs1", "in", "an", "S", "-", "phase", "checkpoint", "pathway", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "rare", "diseases", "ataxia", "-", "telangiectasia", "(", "AT", ")", ",", "caused", "by", "mutations", "in", "the", "ATM", "gene", ",", "and", "Nijmegen", "breakage", "syndrome", "(", "NBS", ")", ",", "with", "mutations", "in", "the", "p95", "/", "nbs1", "gene", ",", "share", "a", "variety", "of", "phenotypic", "abnormalities", "such", "as", "chromosomal", "instability", ",", "radiation", "sensitivity", "and", "defects", "in", "cell", "-", "cycle", "checkpoints", "in", "response", "to", "ionizing", "radiation", "." ]

[ "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "ATM", "gene", "encodes", "a", "protein", "kinase", "that", "is", "activated", "by", "ionizing", "radiation", "or", "radiomimetic", "drugs", ",", "whereas", "p95", "/", "nbs1", "is", "part", "of", "a", "protein", "complex", "that", "is", "involved", "in", "responses", "to", "DNA", "double", "-", "strand", "breaks", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Here", ",", "because", "of", "the", "similarities", "between", "AT", "and", "NBS", ",", "we", "evaluated", "the", "functional", "interactions", "between", "ATM", "and", "p95", "/", "nbs1", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Activation", "of", "the", "ATM", "kinase", "by", "ionizing", "radiation", "and", "induction", "of", "ATM", "-", "dependent", "responses", "in", "NBS", "cells", "indicated", "that", "p95", "/", "nbs1", "may", "not", "be", "required", "for", "signalling", "to", "ATM", "after", "ionizing", "radiation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "However", ",", "p95", "/", "nbs1", "was", "phosphorylated", "on", "serine", "343", "in", "an", "ATM", "-", "dependent", "manner", "in", "vitro", "and", "in", "vivo", "after", "ionizing", "radiation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "A", "p95", "/", "nbs1", "construct", "mutated", "at", "the", "ATM", "phosphorylation", "site", "abrogated", "an", "S", "-", "phase", "checkpoint", "induced", "by", "ionizing", "radiation", "in", "normal", "cells", "and", "failed", "to", "compensate", "for", "this", "functional", "deficiency", "in", "NBS", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O" ]

[ "These", "observations", "link", "ATM", "and", "p95", "/", "nbs1", "in", "a", "common", "signalling", "pathway", "and", "provide", "an", "explanation", "for", "phenotypic", "similarities", "in", "these", "two", "diseases", ".", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Understanding", "the", "molecular", "basis", "of", "fragile", "X", "syndrome", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]

[ "Fragile", "X", "syndrome", ",", "a", "common", "form", "of", "inherited", "mental", "retardation", ",", "is", "mainly", "caused", "by", "massive", "expansion", "of", "CGG", "triplet", "repeats", "located", "in", "the", "5", "-", "untranslated", "region", "of", "the", "fragile", "X", "mental", "retardation", "-", "1", "(", "FMR1", ")", "gene", "." ]

[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "patients", "with", "fragile", "X", "syndrome", ",", "the", "expanded", "CGG", "triplet", "repeats", "are", "hypermethylated", "and", "the", "expression", "of", "the", "FMR1", "gene", "is", "repressed", ",", "which", "leads", "to", "the", "absence", "of", "FMR1", "protein", "(", "FMRP", ")", "and", "subsequent", "mental", "retardation", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]

[ "FMRP", "is", "an", "RNA", "-", "binding", "protein", "that", "shuttles", "between", "the", "nucleus", "and", "cytoplasm", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "protein", "has", "been", "implicated", "in", "protein", "translation", "as", "it", "is", "found", "associated", "with", "polyribosomes", "and", "the", "rough", "endoplasmic", "reticulum", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "discuss", "here", "the", "recent", "progress", "made", "towards", "understanding", "the", "molecular", "mechanism", "of", "CGG", "repeat", "expansion", "and", "physiological", "function", "(", "s", ")", "of", "FMRP", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "studies", "will", "not", "only", "help", "to", "illuminate", "the", "molecular", "basis", "of", "the", "general", "class", "of", "human", "diseases", "with", "trinucleotide", "repeat", "expansion", "but", "also", "provide", "an", "avenue", "to", "understand", "aspects", "of", "human", "cognition", "and", "intelligence", ".", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Haploinsufficiency", "of", "the", "transcription", "factors", "FOXC1", "and", "FOXC2", "results", "in", "aberrant", "ocular", "development", "." ]

[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Anterior", "segment", "developmental", "disorders", ",", "including", "Axenfeld", "-", "Rieger", "anomaly", "(", "ARA", ")", ",", "variably", "associate", "with", "harmfully", "elevated", "intraocular", "pressure", "(", "IOP", ")", ",", "which", "causes", "glaucoma", "." ]

[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O" ]

[ "Clinically", "observed", "dysgenesis", "does", "not", "correlate", "with", "IOP", ",", "however", ",", "and", "the", "etiology", "of", "glaucoma", "development", "is", "not", "understood", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "forkhead", "transcription", "factor", "genes", "Foxc1", "(", "formerly", "Mf1", ")", "and", "Foxc2", "(", "formerly", "Mfh1", ")", "are", "expressed", "in", "the", "mesenchyme", "from", "which", "the", "ocular", "drainage", "structures", "derive", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Mutations", "in", "the", "human", "homolog", "of", "Foxc1", ",", "FKHL7", ",", "cause", "dominant", "anterior", "segment", "defects", "and", "glaucoma", "in", "various", "families", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "show", "that", "Foxc1", "(", "+", "/", "-", ")", "mice", "have", "anterior", "segment", "abnormalities", "similar", "to", "those", "reported", "in", "human", "patients", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "abnormalities", "include", "small", "or", "absent", "Schlemms", "canal", ",", "aberrantly", "developed", "trabecular", "meshwork", ",", "iris", "hypoplasia", ",", "severely", "eccentric", "pupils", "and", "displaced", "Schwalbes", "line", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "penetrance", "of", "clinically", "obvious", "abnormalities", "varies", "with", "genetic", "background", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "some", "affected", "eyes", ",", "collagen", "bundles", "were", "half", "normal", "diameter", ",", "or", "collagen", "and", "elastic", "tissue", "were", "very", "sparse", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Thus", ",", "abnormalities", "in", "extracellular", "matrix", "synthesis", "or", "organization", "may", "contribute", "to", "development", "of", "the", "ocular", "phenotypes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Despite", "the", "abnormalities", "in", "ocular", "drainage", "structures", "in", "Foxc1", "(", "+", "/", "-", ")", "mice", ",", "IOP", "was", "normal", "in", "almost", "all", "mice", "analyzed", ",", "on", "all", "genetic", "backgrounds", "and", "at", "all", "ages", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Similar", "abnormalities", "were", "found", "in", "Foxc2", "(", "+", "/", "-", ")", "mice", ",", "but", "no", "disease", "-", "associated", "mutations", "were", "identified", "in", "the", "human", "homolog", "FKHL14", "in", "32", "ARA", "patients", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O" ]

[ "Foxc1", "(", "+", "/", "-", ")", "and", "Foxc2", "(", "+", "/", "-", ")", "mice", "are", "useful", "models", "for", "studying", "anterior", "segment", "development", "and", "its", "anomalies", ",", "and", "may", "allow", "identification", "of", "genes", "that", "interact", "with", "Foxc1", "and", "Foxc2", "(", "or", "FKHL7", "and", "FKHL14", ")", "to", "produce", "a", "phenotype", "with", "elevated", "IOP", "and", "glaucoma", ".", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O" ]

[ "(", "Over", ")", "correction", "of", "FMR1", "deficiency", "with", "YAC", "transgenics", ":", "behavioral", "and", "physical", "features", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Fragile", "X", "syndrome", "is", "a", "common", "cause", "of", "mental", "retardation", "involving", "loss", "of", "expression", "of", "the", "FMR1", "gene", "." ]

[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "role", "of", "FMR1", "remains", "undetermined", "but", "the", "protein", "appears", "to", "be", "involved", "in", "RNA", "metabolism", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Fmr1", "knockout", "mice", "exhibit", "a", "phenotype", "with", "some", "similarities", "to", "humans", ",", "such", "as", "macroorchidism", "and", "behavioral", "abnormalities", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O" ]

[ "As", "a", "step", "toward", "understanding", "the", "function", "of", "FMR1", "and", "the", "determination", "of", "the", "potential", "for", "therapeutic", "approaches", "to", "fragile", "X", "syndrome", ",", "yeast", "artificial", "chromosome", "(", "YAC", ")", "transgenic", "mice", "were", "generated", "in", "order", "to", "determine", "whether", "the", "Fmr1", "knockout", "mouse", "phenotype", "could", "be", "rescued", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]