disi-unibo-nlp/ncbi · Datasets at Hugging Face

tokens listlengths 2 123	ner_tags listlengths 2 123
[ "Several", "transgenic", "lines", "were", "generated", "that", "carried", "the", "entire", "FMR1", "locus", "with", "extensive", "amounts", "of", "flanking", "sequence", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "observed", "that", "the", "YAC", "transgene", "supported", "production", "of", "the", "human", "protein", "(", "FMRP", ")", "which", "was", "present", "at", "levels", "10", "to", "15", "times", "that", "of", "endogenous", "protein", "and", "was", "expressed", "in", "a", "cell", "-", "and", "tissue", "-", "specific", "manner", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Macro", "-", "orchidism", "was", "absent", "in", "knockout", "mice", "carrying", "the", "YAC", "transgene", "indicating", "functional", "rescue", "by", "the", "human", "protein", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Given", "the", "complex", "behavioral", "phenotype", "in", "fragile", "X", "patients", "and", "the", "mild", "phenotype", "previously", "reported", "for", "the", "Fmr1", "knockout", "mouse", ",", "we", "performed", "a", "more", "thorough", "evaluation", "of", "the", "Fmr1", "knockout", "phenotype", "using", "additional", "behavioral", "assays", "that", "had", "not", "previously", "been", "reported", "for", "this", "animal", "model", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "mouse", "displayed", "reduced", "anxiety", "-", "related", "responses", "with", "increased", "exploratory", "behavior", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "FMR1", "YAC", "transgenic", "mice", "overexpressing", "the", "human", "protein", "did", "produce", "opposing", "behavioral", "responses", "and", "additional", "abnormal", "behaviors", "were", "also", "observed", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "These", "findings", "have", "significant", "implications", "for", "gene", "therapy", "for", "fragile", "X", "syndrome", "since", "overexpression", "of", "the", "gene", "may", "harbor", "its", "own", "phenotype", ".", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Transgenic", "mice", "carrying", "large", "human", "genomic", "sequences", "with", "expanded", "CTG", "repeat", "mimic", "closely", "the", "DM", "CTG", "repeat", "intergenerational", "and", "somatic", "instability", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Myotonic", "dystrophy", "(", "DM", ")", "is", "caused", "by", "a", "CTG", "repeat", "expansion", "in", "the", "3UTR", "of", "the", "DM", "protein", "kinase", "(", "DMPK", ")", "gene", "." ]	[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "A", "very", "high", "level", "of", "instability", "is", "observed", "through", "successive", "generations", "and", "the", "size", "of", "the", "repeat", "is", "generally", "correlated", "with", "the", "severity", "of", "the", "disease", "and", "with", "age", "at", "onset", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Furthermore", ",", "tissues", "from", "DM", "patients", "exhibit", "somatic", "mosaicism", "that", "increases", "with", "age", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "generated", "transgenic", "mice", "carrying", "large", "human", "genomic", "sequences", "with", "20", ",", "55", "or", ">", "300", "CTG", ",", "cloned", "from", "patients", "from", "the", "same", "affected", "DM", "family", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O" ]
[ "Using", "large", "human", "flanking", "sequences", "and", "a", "large", "amplification", ",", "we", "demonstrate", "that", "the", "intergenerational", "CTG", "repeat", "instability", "is", "reproduced", "in", "mice", ",", "with", "a", "strong", "bias", "towards", "expansions", "and", "with", "the", "same", "sex", "-", "and", "size", "-", "dependent", "characteristics", "as", "in", "humans", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Moreover", ",", "a", "high", "level", "of", "instability", ",", "increasing", "with", "age", ",", "can", "be", "observed", "in", "tissues", "and", "in", "sperm", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Although", "we", "did", "not", "observe", "dramatic", "expansions", "(", "or", "big", "jumps", "over", "several", "hundred", "CTG", "repeats", ")", "as", "in", "congenital", "forms", "of", "DM", ",", "our", "model", "carrying", ">", "300", "CTG", "is", "the", "first", "to", "show", "instability", "so", "close", "to", "the", "human", "DM", "situation", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O" ]
[ "Our", "three", "models", "carrying", "different", "sizes", "of", "CTG", "repeat", "provide", "insight", "on", "the", "different", "factors", "modulating", "the", "CTG", "repeat", "instability", ".", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Inactivation", "of", "the", "Friedreich", "ataxia", "mouse", "gene", "leads", "to", "early", "embryonic", "lethality", "without", "iron", "accumulation", "." ]	[ "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Friedreich", "ataxia", "(", "FRDA", ")", ",", "the", "most", "common", "autosomal", "recessive", "ataxia", ",", "is", "caused", "in", "almost", "all", "cases", "by", "homozygous", "intronic", "expansions", "resulting", "in", "the", "loss", "of", "frataxin", ",", "a", "mitochondrial", "protein", "conserved", "through", "evolution", ",", "and", "involved", "in", "mitochondrial", "iron", "homeostasis", "." ]	[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Yeast", "knockout", "models", ",", "and", "histological", "and", "biochemical", "data", "from", "patient", "heart", "biopsies", "or", "autopsies", "indicate", "that", "the", "frataxin", "defect", "causes", "a", "specific", "iron", "-", "sulfur", "protein", "deficiency", "and", "mitochondrial", "iron", "accumulation", "leading", "to", "the", "pathological", "changes", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Affected", "human", "tissues", "are", "rarely", "available", "to", "further", "examine", "this", "hypothesis", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "To", "study", "the", "mechanism", "of", "the", "disease", ",", "we", "generated", "a", "mouse", "model", "by", "deletion", "of", "exon", "4", "leading", "to", "inactivation", "of", "the", "Frda", "gene", "product", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O" ]
[ "We", "show", "that", "homozygous", "deletions", "cause", "embryonic", "lethality", "a", "few", "days", "after", "implantation", ",", "demonstrating", "an", "important", "role", "for", "frataxin", "during", "early", "development", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "These", "results", "suggest", "that", "the", "milder", "phenotype", "in", "humans", "is", "due", "to", "residual", "frataxin", "expression", "associated", "with", "the", "expansion", "mutations", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Surprisingly", ",", "in", "the", "frataxin", "knockout", "mouse", ",", "no", "iron", "accumulation", "was", "observed", "during", "embryonic", "resorption", ",", "suggesting", "that", "cell", "death", "could", "be", "due", "to", "a", "mechanism", "independent", "of", "iron", "accumulation", ".", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Gaucher", "disease", ":", "the", "origins", "of", "the", "Ashkenazi", "Jewish", "N370S", "and", "84GG", "acid", "beta", "-", "glucosidase", "mutations", "." ]	[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Type", "1", "Gaucher", "disease", "(", "GD", ")", ",", "a", "non", "-", "neuronopathic", "lysosomal", "storage", "disorder", ",", "results", "from", "the", "deficient", "activity", "of", "acid", "beta", "-", "glucosidase", "(", "GBA", ")", "." ]	[ "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Type", "1", "disease", "is", "panethnic", "but", "is", "more", "prevalent", "in", "individuals", "of", "Ashkenazi", "Jewish", "(", "AJ", ")", "descent", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Of", "the", "causative", "GBA", "mutations", ",", "N370S", "is", "particularly", "frequent", "in", "the", "AJ", "population", ",", "(", "q", "approximately", ".", "03", ")", ",", "whereas", "the", "84GG", "insertion", "(", "q", "approximately", ".", "003", ")", "occurs", "exclusively", "in", "the", "Ashkenazim", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "To", "investigate", "the", "genetic", "history", "of", "these", "mutations", "in", "the", "AJ", "population", ",", "short", "tandem", "repeat", "(", "STR", ")", "markers", "were", "used", "to", "map", "a", "9", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "3", "-", "cM", "region", "containing", "the", "GBA", "locus", "and", "to", "genotype", "261", "AJ", "N370S", "chromosomes", ",", "60", "European", "non", "-", "Jewish", "N370S", "chromosomes", ",", "and", "62", "AJ", "84GG", "chromosomes", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "A", "highly", "conserved", "haplotype", "at", "four", "markers", "flanking", "GBA", "(", "PKLR", ",", "D1S1595", ",", "D1S2721", ",", "and", "D1S2777", ")", "was", "observed", "on", "both", "the", "AJ", "chromosomes", "and", "the", "non", "-", "Jewish", "N370S", "chromosomes", ",", "suggesting", "the", "occurrence", "of", "a", "founder", "common", "to", "both", "populations", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Of", "note", ",", "the", "presence", "of", "different", "divergent", "haplotypes", "suggested", "the", "occurrence", "of", "de", "novo", ",", "recurrent", "N370S", "mutations", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "contrast", ",", "a", "different", "conserved", "haplotype", "at", "these", "markers", "was", "identified", "on", "the", "84GG", "chromosomes", ",", "which", "was", "unique", "to", "the", "AJ", "population", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "On", "the", "basis", "of", "the", "linkage", "disequilibrium", "(", "LD", ")", "delta", "values", ",", "the", "non", "-", "Jewish", "European", "N370S", "chromosomes", "had", "greater", "haplotype", "diversity", "and", "less", "LD", "at", "the", "markers", "flanking", "the", "conserved", "haplotype", "than", "did", "the", "AJ", "N370S", "chromosomes", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "finding", "is", "consistent", "with", "the", "presence", "of", "the", "N370S", "mutation", "in", "the", "non", "-", "Jewish", "European", "population", "prior", "to", "the", "founding", "of", "the", "AJ", "population", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Coalescence", "analyses", "for", "the", "N370S", "and", "84GG", "mutations", "estimated", "similar", "coalescence", "times", ",", "of", "48", "and", "55", ".", "5", "generations", "ago", ",", "respectively", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "results", "of", "these", "studies", "are", "consistent", "with", "a", "significant", "bottleneck", "occurring", "in", "the", "AJ", "population", "during", "the", "first", "millennium", ",", "when", "the", "population", "became", "established", "in", "Europe", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "HLA", "B27", "and", "the", "genetics", "of", "ankylosing", "spondylitis", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]
[ "One", "hundred", "and", "twenty", "-", "eight", "of", "145", "patients", "with", "ankylosing", "spondylitis", "(", "AS", ")", "were", "found", "to", "be", "HLA", "B27", "positive", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Five", "patients", "had", "evidence", "of", "a", "sero", "-", "negative", "peripheral", "arthritis", "resembling", "peripheral", "psoriatic", "arthritis", "and", "3", "of", "these", "were", "B27", "negative", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "One", "further", "B27", "negative", "patients", "had", "a", "sister", "with", "ankylosing", "spondylitis", "and", "ulcerative", "colitis", "and", "a", "mother", "with", "ulcerative", "colitis", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]
[ "There", "was", "evidence", "of", "a", "somewhat", "later", "age", "of", "onset", "of", "symptoms", "in", "B27", "negative", "patients", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "These", "findings", "are", "interpreted", "as", "suggesting", "some", "degree", "of", "clinical", "and", "genetic", "heterogeneity", "in", "ankylosing", "spondylitis", "with", "genes", "for", "psoriasis", "and", "inflammatory", "bowel", "disease", "being", "important", "in", "some", "individuals", ",", "particularly", "those", "who", "are", "B27", "negative", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Twenty", "-", "five", "first", "-", "degree", "relatives", "with", "ankylosing", "spondylitis", "were", "all", "B27", "positive", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "only", "instance", "of", "disassociation", "of", "B27", "and", "spondylitis", "in", "a", "family", "was", "where", "the", "proband", "had", "ulcerative", "colitis", "as", "well", "as", "spondylitis", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O" ]
[ "Of", "13", "B27", "positive", "fathers", "3", "could", "be", "diagnosed", "as", "having", "definite", "ankylosing", "spondylitis", "(", "23", "%", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "These", "findings", "are", "thought", "to", "provide", "evidence", "against", "the", "concept", "that", "the", "gene", "for", "ankylosing", "spondylitis", "is", "not", "B27", "but", "a", "closely", "linked", "gene", "and", "favour", "the", "occurrence", "of", "an", "environmental", "event", "affecting", "approximately", "one", "-", "fifth", "of", "B27", "positive", "males", "to", "result", "in", "disease", ".", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Founder", "mutations", "in", "the", "BRCA1", "gene", "in", "Polish", "families", "with", "breast", "-", "ovarian", "cancer", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]
[ "We", "have", "undertaken", "a", "hospital", "-", "based", "study", ",", "to", "identify", "possible", "BRCA1", "and", "BRCA2", "founder", "mutations", "in", "the", "Polish", "population", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "study", "group", "consisted", "of", "66", "Polish", "families", "with", "cancer", "who", "have", "at", "least", "three", "related", "females", "affected", "with", "breast", "or", "ovarian", "cancer", "and", "who", "had", "cancer", "diagnosed", ",", "in", "at", "least", "one", "of", "the", "three", "affected", "females", ",", "at", "age", "<", "50", "years", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "A", "total", "of", "26", "families", "had", "both", "breast", "and", "ovarian", "cancers", ",", "4", "families", "had", "ovarian", "cancers", "only", ",", "and", "36", "families", "had", "breast", "cancers", "only", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O" ]
[ "Genomic", "DNA", "was", "prepared", "from", "the", "peripheral", "blood", "leukocytes", "of", "at", "least", "one", "affected", "woman", "from", "each", "family", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "entire", "coding", "region", "of", "BRCA1", "and", "BRCA2", "was", "screened", "for", "the", "presence", "of", "germline", "mutations", ",", "by", "use", "of", "SSCP", "followed", "by", "direct", "sequencing", "of", "observed", "variants", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Mutations", "were", "found", "in", "35", "(", "53", "%", ")", "of", "the", "66", "families", "studied", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "All", "but", "one", "of", "the", "mutations", "were", "detected", "within", "the", "BRCA1", "gene", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "BRCA1", "abnormalities", "were", "identified", "in", "all", "four", "families", "with", "ovarian", "cancer", "only", ",", "in", "67", "%", "of", "27", "families", "with", "both", "breast", "and", "ovarian", "cancer", ",", "and", "in", "34", "%", "of", "35", "families", "with", "breast", "cancer", "only", "." ]	[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O" ]
[ "The", "single", "family", "with", "a", "BRCA2", "mutation", "had", "the", "breast", "-", "ovarian", "cancer", "syndrome", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]
[ "Seven", "distinct", "mutations", "were", "identified", ";", "five", "of", "these", "occurred", "in", "two", "or", "more", "families", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "total", ",", "recurrent", "mutations", "were", "found", "in", "33", "(", "94", "%", ")", "of", "the", "35", "families", "with", "detected", "mutations", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Three", "BRCA1", "abnormalities", "-", "5382insC", ",", "C61G", ",", "and", "4153delA", "-", "accounted", "for", "51", "%", ",", "20", "%", ",", "and", "11", "%", "of", "the", "identified", "mutations", ",", "respectively", ".", "." ]	[ "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Molecular", "basis", "of", "very", "long", "chain", "acyl", "-", "CoA", "dehydrogenase", "deficiency", "in", "three", "Israeli", "patients", ":", "identification", "of", "a", "complex", "mutant", "allele", "with", "P65L", "and", "K247Q", "mutations", ",", "the", "former", "being", "an", "exonic", "mutation", "causing", "exon", "3", "skipping", "." ]	[ "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Very", "long", "chain", "acyl", "-", "CoA", "dehydrogenase", "(", "VLCAD", ")", "deficiency", "is", "a", "life", "-", "threatening", "disorder", "of", "mitochondrial", "fatty", "acid", "beta", "-", "oxidation", "." ]	[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "identified", "four", "novel", "mutations", "in", "three", "unrelated", "patients", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "All", "patients", "had", "the", "severe", "childhood", "form", "of", "VLCAD", "deficiency", "with", "early", "onset", "and", "high", "mortality", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Immunoblot", "analysis", "revealed", "that", "VLCAD", "protein", "was", "undetectable", "in", "patients", "2", "and", "3", ",", "whereas", "normal", "-", "size", "VLCAD", "protein", "and", "an", "aberrant", "form", "of", "VLCAD", "(", "4kDa", "smaller", ")", "were", "detected", "in", "patient", "1", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "As", "expected", ",", "null", "mutations", "were", "found", "in", "patients", "2", "and", "3", "patient", "2", "is", "homozygous", "for", "a", "frameshift", "mutation", ",", "del", "4", "bp", "at", "798", "-", "801", ",", "and", "patient", "3", "is", "homozygous", "for", "a", "nonsense", "mutation", "65C", ">", "A", "(", "S22X", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Patient", "1", "was", "homozygous", "for", "a", "complex", "mutant", "allele", "containing", "two", "alterations", ",", "including", "a", "194C", ">", "T", "transition", "(", "P65L", ")", "and", "739A", ">", "C", "transversion", "(", "K247Q", ")", ";", "in", "the", "case", "of", "P65L", ",", "the", "amino", "acid", "change", "does", "not", "reduce", "enzyme", "activity", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "However", ",", "the", "nucleotide", "change", "resulted", "in", "exon", "3", "skipping", ",", "whereas", "the", "latter", "K247Q", "mutation", "had", "a", "drastic", "effect", "on", "enzyme", "activity", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "verified", "these", "events", "by", "in", "vivo", "splicing", "experiments", "and", "transient", "expression", "analysis", "of", "mutant", "cDNAs", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "P65L", "mutation", "locates", "11", "bases", "upstream", "of", "a", "splice", "donor", "site", "of", "intron", "3", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "is", "an", "example", "of", "an", "exonic", "mutation", "which", "affects", "exon", "-", "splicing", ".", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Submicroscopic", "deletion", "in", "cousins", "with", "Prader", "-", "Willi", "syndrome", "causes", "a", "grandmatrilineal", "inheritance", "pattern", ":", "effects", "of", "imprinting", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "Prader", "-", "Willi", "syndrome", "(", "PWS", ")", "critical", "region", "on", "15q11", "-", "q13", "is", "subject", "to", "imprinting", "." ]	[ "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "PWS", "becomes", "apparent", "when", "genes", "on", "the", "paternally", "inherited", "chromosome", "are", "not", "expressed", "." ]	[ "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Familial", "PWS", "is", "rare", "." ]	[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O" ]
[ "We", "report", "on", "a", "family", "in", "which", "a", "male", "and", "a", "female", "paternal", "first", "cousin", "both", "have", "PWS", "with", "cytogenetically", "normal", "karyotypes", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Fluorescence", "in", "situ", "hybridization", "(", "FISH", ")", "analysis", "shows", "a", "submicroscopic", "deletion", "of", "SNRPN", ",", "but", "not", "the", "closely", "associated", "loci", "D15S10", ",", "D15S11", ",", "D15S63", ",", "and", "GABRB3", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "cousins", "fathers", "and", "two", "paternal", "aunts", "have", "the", "same", "deletion", "and", "are", "clinically", "normal", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "grandmother", "of", "the", "cousins", "is", "deceased", "and", "not", "available", "for", "study", ",", "and", "their", "grandfather", "is", "not", "deleted", "for", "SNRPN", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "DNA", "methylation", "analysis", "of", "D15S63", "is", "consistent", "with", "an", "abnormality", "of", "the", "imprinting", "center", "associated", "with", "PWS", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O" ]
[ "\"", "Grandmatrilineal", "\"", "inheritance", "occurs", "when", "a", "woman", "with", "deletion", "of", "an", "imprinted", ",", "paternally", "expressed", "gene", "is", "at", "risk", "of", "having", "affected", "grandchildren", "through", "her", "sons", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "this", "case", ",", "PWS", "does", "not", "become", "evident", "as", "long", "as", "the", "deletion", "is", "passed", "through", "the", "matrilineal", "line", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "represents", "a", "unique", "inheritance", "pattern", "due", "to", "imprinting", ".", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Human", "glycine", "decarboxylase", "gene", "(", "GLDC", ")", "and", "its", "highly", "conserved", "processed", "pseudogene", "(", "psiGLDC", ")", ":", "their", "structure", "and", "expression", ",", "and", "the", "identification", "of", "a", "large", "deletion", "in", "a", "family", "with", "nonketotic", "hyperglycinemia", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]
[ "Mutations", "in", "the", "glycine", "decarboxylase", "gene", "(", "GLDC", ")", "cause", "nonketotic", "hyperglycinemia", "(", "NKH", ")", ",", "an", "in", "-", "born", "error", "of", "metabolism", "characterized", "by", "severe", "neurological", "disturbance", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]
[ "We", "have", "determined", "the", "structure", "of", "GLDC", "and", "of", "its", "pseudogene", "(", "psiGLDC", ")", "and", "studied", "their", "expression", "for", "a", "molecular", "analysis", "of", "NKH", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O" ]
[ "The", "GLDC", "gene", "spans", "at", "least", "135", "kb", "and", "consists", "of", "25", "exons", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "All", "donor", "and", "acceptor", "sites", "adhere", "to", "the", "canonical", "GT", "-", "AG", "rule", ",", "except", "for", "the", "donor", "site", "of", "intron", "21", ",", "where", "a", "variant", "form", "GC", "is", "used", "instead", "of", "GT", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "transcription", "initiation", "site", "has", "been", "assigned", "to", "a", "residue", "163", "bp", "upstream", "from", "the", "translation", "initiation", "triplet", "by", "primer", "extension", "analysis", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "psiGLDC", "gene", "has", "no", "intron", "and", "shares", "97", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "5", "%", "homology", "with", "the", "coding", "region", "of", "functional", "GLDC", ",", "suggesting", "that", "psiGLDC", "is", "a", "processed", "pseudogene", "that", "arose", "from", "the", "GLDC", "transcript", "about", "4", "-", "8", "million", "years", "ago", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "RNA", "blotting", "analysis", "has", "revealed", "that", "GLDC", "is", "expressed", "in", "human", "liver", ",", "kidney", ",", "brain", ",", "and", "placenta", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "have", "also", "examined", "a", "patient", "with", "NKH", "with", "no", "detectable", "GLDC", "mRNA", "in", "his", "lymphoblasts", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Exons", "1", "-", "3", "of", "the", "functional", "GLDC", "gene", "from", "this", "patient", "are", "not", "amplified", "by", "polymerase", "chain", "reaction", "(", "PCR", ")", ",", "whereas", "those", "from", "control", "subjects", "are", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "These", "results", "suggest", "a", "large", "homozygous", "deletion", "(", "at", "least", "30", "kb", ")", "in", "the", "patient", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Furthermore", ",", "we", "have", "devised", "a", "semi", "-", "quantitative", "PCR", "to", "estimate", "the", "number", "of", "GLDC", "alleles", "by", "using", "psiGLDC", "as", "an", "internal", "control", "and", "have", "confirmed", "the", "homozygosity", "and", "heterozygosity", "of", "the", "deletion", "in", "the", "patient", "and", "his", "parents", ",", "respectively", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Structural", "information", "of", "GLDC", "and", "psiGLDC", "should", "facilitate", "the", "molecular", "analysis", "of", "NKH", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O" ]
[ "De", "novo", "deletions", "of", "SNRPN", "exon", "1", "in", "early", "human", "and", "mouse", "embryos", "result", "in", "a", "paternal", "to", "maternal", "imprint", "switch", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Prader", "-", "Willi", "syndrome", "(", "PWS", ")", "is", "a", "neurogenetic", "disease", "characterized", "by", "infantile", "hypotonia", ",", "gonadal", "hypoplasia", ",", "obsessive", "behaviour", "and", "neonatal", "feeding", "difficulties", "followed", "by", "hyperphagia", ",", "leading", "to", "profound", "obesity", "." ]	[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O" ]
[ "PWS", "is", "due", "to", "a", "lack", "of", "paternal", "genetic", "information", "at", "15q11", "-", "q13", "(", "ref", ".", "2", ")", "." ]	[ "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Several", "transgenic", "lines", "were", "generated", "that", "carried", "the", "entire", "FMR1", "locus", "with", "extensive", "amounts", "of", "flanking", "sequence", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "observed", "that", "the", "YAC", "transgene", "supported", "production", "of", "the", "human", "protein", "(", "FMRP", ")", "which", "was", "present", "at", "levels", "10", "to", "15", "times", "that", "of", "endogenous", "protein", "and", "was", "expressed", "in", "a", "cell", "-", "and", "tissue", "-", "specific", "manner", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Macro", "-", "orchidism", "was", "absent", "in", "knockout", "mice", "carrying", "the", "YAC", "transgene", "indicating", "functional", "rescue", "by", "the", "human", "protein", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Given", "the", "complex", "behavioral", "phenotype", "in", "fragile", "X", "patients", "and", "the", "mild", "phenotype", "previously", "reported", "for", "the", "Fmr1", "knockout", "mouse", ",", "we", "performed", "a", "more", "thorough", "evaluation", "of", "the", "Fmr1", "knockout", "phenotype", "using", "additional", "behavioral", "assays", "that", "had", "not", "previously", "been", "reported", "for", "this", "animal", "model", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "mouse", "displayed", "reduced", "anxiety", "-", "related", "responses", "with", "increased", "exploratory", "behavior", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "FMR1", "YAC", "transgenic", "mice", "overexpressing", "the", "human", "protein", "did", "produce", "opposing", "behavioral", "responses", "and", "additional", "abnormal", "behaviors", "were", "also", "observed", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "findings", "have", "significant", "implications", "for", "gene", "therapy", "for", "fragile", "X", "syndrome", "since", "overexpression", "of", "the", "gene", "may", "harbor", "its", "own", "phenotype", ".", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Transgenic", "mice", "carrying", "large", "human", "genomic", "sequences", "with", "expanded", "CTG", "repeat", "mimic", "closely", "the", "DM", "CTG", "repeat", "intergenerational", "and", "somatic", "instability", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Myotonic", "dystrophy", "(", "DM", ")", "is", "caused", "by", "a", "CTG", "repeat", "expansion", "in", "the", "3UTR", "of", "the", "DM", "protein", "kinase", "(", "DMPK", ")", "gene", "." ]

[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "A", "very", "high", "level", "of", "instability", "is", "observed", "through", "successive", "generations", "and", "the", "size", "of", "the", "repeat", "is", "generally", "correlated", "with", "the", "severity", "of", "the", "disease", "and", "with", "age", "at", "onset", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Furthermore", ",", "tissues", "from", "DM", "patients", "exhibit", "somatic", "mosaicism", "that", "increases", "with", "age", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "generated", "transgenic", "mice", "carrying", "large", "human", "genomic", "sequences", "with", "20", ",", "55", "or", ">", "300", "CTG", ",", "cloned", "from", "patients", "from", "the", "same", "affected", "DM", "family", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O" ]

[ "Using", "large", "human", "flanking", "sequences", "and", "a", "large", "amplification", ",", "we", "demonstrate", "that", "the", "intergenerational", "CTG", "repeat", "instability", "is", "reproduced", "in", "mice", ",", "with", "a", "strong", "bias", "towards", "expansions", "and", "with", "the", "same", "sex", "-", "and", "size", "-", "dependent", "characteristics", "as", "in", "humans", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Moreover", ",", "a", "high", "level", "of", "instability", ",", "increasing", "with", "age", ",", "can", "be", "observed", "in", "tissues", "and", "in", "sperm", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Although", "we", "did", "not", "observe", "dramatic", "expansions", "(", "or", "big", "jumps", "over", "several", "hundred", "CTG", "repeats", ")", "as", "in", "congenital", "forms", "of", "DM", ",", "our", "model", "carrying", ">", "300", "CTG", "is", "the", "first", "to", "show", "instability", "so", "close", "to", "the", "human", "DM", "situation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O" ]

[ "Our", "three", "models", "carrying", "different", "sizes", "of", "CTG", "repeat", "provide", "insight", "on", "the", "different", "factors", "modulating", "the", "CTG", "repeat", "instability", ".", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Inactivation", "of", "the", "Friedreich", "ataxia", "mouse", "gene", "leads", "to", "early", "embryonic", "lethality", "without", "iron", "accumulation", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Friedreich", "ataxia", "(", "FRDA", ")", ",", "the", "most", "common", "autosomal", "recessive", "ataxia", ",", "is", "caused", "in", "almost", "all", "cases", "by", "homozygous", "intronic", "expansions", "resulting", "in", "the", "loss", "of", "frataxin", ",", "a", "mitochondrial", "protein", "conserved", "through", "evolution", ",", "and", "involved", "in", "mitochondrial", "iron", "homeostasis", "." ]

[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Yeast", "knockout", "models", ",", "and", "histological", "and", "biochemical", "data", "from", "patient", "heart", "biopsies", "or", "autopsies", "indicate", "that", "the", "frataxin", "defect", "causes", "a", "specific", "iron", "-", "sulfur", "protein", "deficiency", "and", "mitochondrial", "iron", "accumulation", "leading", "to", "the", "pathological", "changes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Affected", "human", "tissues", "are", "rarely", "available", "to", "further", "examine", "this", "hypothesis", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "To", "study", "the", "mechanism", "of", "the", "disease", ",", "we", "generated", "a", "mouse", "model", "by", "deletion", "of", "exon", "4", "leading", "to", "inactivation", "of", "the", "Frda", "gene", "product", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O" ]

[ "We", "show", "that", "homozygous", "deletions", "cause", "embryonic", "lethality", "a", "few", "days", "after", "implantation", ",", "demonstrating", "an", "important", "role", "for", "frataxin", "during", "early", "development", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "results", "suggest", "that", "the", "milder", "phenotype", "in", "humans", "is", "due", "to", "residual", "frataxin", "expression", "associated", "with", "the", "expansion", "mutations", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Surprisingly", ",", "in", "the", "frataxin", "knockout", "mouse", ",", "no", "iron", "accumulation", "was", "observed", "during", "embryonic", "resorption", ",", "suggesting", "that", "cell", "death", "could", "be", "due", "to", "a", "mechanism", "independent", "of", "iron", "accumulation", ".", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Gaucher", "disease", ":", "the", "origins", "of", "the", "Ashkenazi", "Jewish", "N370S", "and", "84GG", "acid", "beta", "-", "glucosidase", "mutations", "." ]

[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Type", "1", "Gaucher", "disease", "(", "GD", ")", ",", "a", "non", "-", "neuronopathic", "lysosomal", "storage", "disorder", ",", "results", "from", "the", "deficient", "activity", "of", "acid", "beta", "-", "glucosidase", "(", "GBA", ")", "." ]

[ "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Type", "1", "disease", "is", "panethnic", "but", "is", "more", "prevalent", "in", "individuals", "of", "Ashkenazi", "Jewish", "(", "AJ", ")", "descent", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Of", "the", "causative", "GBA", "mutations", ",", "N370S", "is", "particularly", "frequent", "in", "the", "AJ", "population", ",", "(", "q", "approximately", ".", "03", ")", ",", "whereas", "the", "84GG", "insertion", "(", "q", "approximately", ".", "003", ")", "occurs", "exclusively", "in", "the", "Ashkenazim", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "To", "investigate", "the", "genetic", "history", "of", "these", "mutations", "in", "the", "AJ", "population", ",", "short", "tandem", "repeat", "(", "STR", ")", "markers", "were", "used", "to", "map", "a", "9", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "3", "-", "cM", "region", "containing", "the", "GBA", "locus", "and", "to", "genotype", "261", "AJ", "N370S", "chromosomes", ",", "60", "European", "non", "-", "Jewish", "N370S", "chromosomes", ",", "and", "62", "AJ", "84GG", "chromosomes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "A", "highly", "conserved", "haplotype", "at", "four", "markers", "flanking", "GBA", "(", "PKLR", ",", "D1S1595", ",", "D1S2721", ",", "and", "D1S2777", ")", "was", "observed", "on", "both", "the", "AJ", "chromosomes", "and", "the", "non", "-", "Jewish", "N370S", "chromosomes", ",", "suggesting", "the", "occurrence", "of", "a", "founder", "common", "to", "both", "populations", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Of", "note", ",", "the", "presence", "of", "different", "divergent", "haplotypes", "suggested", "the", "occurrence", "of", "de", "novo", ",", "recurrent", "N370S", "mutations", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "contrast", ",", "a", "different", "conserved", "haplotype", "at", "these", "markers", "was", "identified", "on", "the", "84GG", "chromosomes", ",", "which", "was", "unique", "to", "the", "AJ", "population", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "On", "the", "basis", "of", "the", "linkage", "disequilibrium", "(", "LD", ")", "delta", "values", ",", "the", "non", "-", "Jewish", "European", "N370S", "chromosomes", "had", "greater", "haplotype", "diversity", "and", "less", "LD", "at", "the", "markers", "flanking", "the", "conserved", "haplotype", "than", "did", "the", "AJ", "N370S", "chromosomes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "finding", "is", "consistent", "with", "the", "presence", "of", "the", "N370S", "mutation", "in", "the", "non", "-", "Jewish", "European", "population", "prior", "to", "the", "founding", "of", "the", "AJ", "population", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Coalescence", "analyses", "for", "the", "N370S", "and", "84GG", "mutations", "estimated", "similar", "coalescence", "times", ",", "of", "48", "and", "55", ".", "5", "generations", "ago", ",", "respectively", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "results", "of", "these", "studies", "are", "consistent", "with", "a", "significant", "bottleneck", "occurring", "in", "the", "AJ", "population", "during", "the", "first", "millennium", ",", "when", "the", "population", "became", "established", "in", "Europe", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "HLA", "B27", "and", "the", "genetics", "of", "ankylosing", "spondylitis", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]

[ "One", "hundred", "and", "twenty", "-", "eight", "of", "145", "patients", "with", "ankylosing", "spondylitis", "(", "AS", ")", "were", "found", "to", "be", "HLA", "B27", "positive", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Five", "patients", "had", "evidence", "of", "a", "sero", "-", "negative", "peripheral", "arthritis", "resembling", "peripheral", "psoriatic", "arthritis", "and", "3", "of", "these", "were", "B27", "negative", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "One", "further", "B27", "negative", "patients", "had", "a", "sister", "with", "ankylosing", "spondylitis", "and", "ulcerative", "colitis", "and", "a", "mother", "with", "ulcerative", "colitis", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]

[ "There", "was", "evidence", "of", "a", "somewhat", "later", "age", "of", "onset", "of", "symptoms", "in", "B27", "negative", "patients", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "findings", "are", "interpreted", "as", "suggesting", "some", "degree", "of", "clinical", "and", "genetic", "heterogeneity", "in", "ankylosing", "spondylitis", "with", "genes", "for", "psoriasis", "and", "inflammatory", "bowel", "disease", "being", "important", "in", "some", "individuals", ",", "particularly", "those", "who", "are", "B27", "negative", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Twenty", "-", "five", "first", "-", "degree", "relatives", "with", "ankylosing", "spondylitis", "were", "all", "B27", "positive", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "only", "instance", "of", "disassociation", "of", "B27", "and", "spondylitis", "in", "a", "family", "was", "where", "the", "proband", "had", "ulcerative", "colitis", "as", "well", "as", "spondylitis", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O" ]

[ "Of", "13", "B27", "positive", "fathers", "3", "could", "be", "diagnosed", "as", "having", "definite", "ankylosing", "spondylitis", "(", "23", "%", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "findings", "are", "thought", "to", "provide", "evidence", "against", "the", "concept", "that", "the", "gene", "for", "ankylosing", "spondylitis", "is", "not", "B27", "but", "a", "closely", "linked", "gene", "and", "favour", "the", "occurrence", "of", "an", "environmental", "event", "affecting", "approximately", "one", "-", "fifth", "of", "B27", "positive", "males", "to", "result", "in", "disease", ".", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Founder", "mutations", "in", "the", "BRCA1", "gene", "in", "Polish", "families", "with", "breast", "-", "ovarian", "cancer", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]

[ "We", "have", "undertaken", "a", "hospital", "-", "based", "study", ",", "to", "identify", "possible", "BRCA1", "and", "BRCA2", "founder", "mutations", "in", "the", "Polish", "population", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "study", "group", "consisted", "of", "66", "Polish", "families", "with", "cancer", "who", "have", "at", "least", "three", "related", "females", "affected", "with", "breast", "or", "ovarian", "cancer", "and", "who", "had", "cancer", "diagnosed", ",", "in", "at", "least", "one", "of", "the", "three", "affected", "females", ",", "at", "age", "<", "50", "years", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "A", "total", "of", "26", "families", "had", "both", "breast", "and", "ovarian", "cancers", ",", "4", "families", "had", "ovarian", "cancers", "only", ",", "and", "36", "families", "had", "breast", "cancers", "only", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O" ]

[ "Genomic", "DNA", "was", "prepared", "from", "the", "peripheral", "blood", "leukocytes", "of", "at", "least", "one", "affected", "woman", "from", "each", "family", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "entire", "coding", "region", "of", "BRCA1", "and", "BRCA2", "was", "screened", "for", "the", "presence", "of", "germline", "mutations", ",", "by", "use", "of", "SSCP", "followed", "by", "direct", "sequencing", "of", "observed", "variants", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Mutations", "were", "found", "in", "35", "(", "53", "%", ")", "of", "the", "66", "families", "studied", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "All", "but", "one", "of", "the", "mutations", "were", "detected", "within", "the", "BRCA1", "gene", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "BRCA1", "abnormalities", "were", "identified", "in", "all", "four", "families", "with", "ovarian", "cancer", "only", ",", "in", "67", "%", "of", "27", "families", "with", "both", "breast", "and", "ovarian", "cancer", ",", "and", "in", "34", "%", "of", "35", "families", "with", "breast", "cancer", "only", "." ]

[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O" ]

[ "The", "single", "family", "with", "a", "BRCA2", "mutation", "had", "the", "breast", "-", "ovarian", "cancer", "syndrome", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]

[ "Seven", "distinct", "mutations", "were", "identified", ";", "five", "of", "these", "occurred", "in", "two", "or", "more", "families", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "total", ",", "recurrent", "mutations", "were", "found", "in", "33", "(", "94", "%", ")", "of", "the", "35", "families", "with", "detected", "mutations", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Three", "BRCA1", "abnormalities", "-", "5382insC", ",", "C61G", ",", "and", "4153delA", "-", "accounted", "for", "51", "%", ",", "20", "%", ",", "and", "11", "%", "of", "the", "identified", "mutations", ",", "respectively", ".", "." ]

[ "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Molecular", "basis", "of", "very", "long", "chain", "acyl", "-", "CoA", "dehydrogenase", "deficiency", "in", "three", "Israeli", "patients", ":", "identification", "of", "a", "complex", "mutant", "allele", "with", "P65L", "and", "K247Q", "mutations", ",", "the", "former", "being", "an", "exonic", "mutation", "causing", "exon", "3", "skipping", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Very", "long", "chain", "acyl", "-", "CoA", "dehydrogenase", "(", "VLCAD", ")", "deficiency", "is", "a", "life", "-", "threatening", "disorder", "of", "mitochondrial", "fatty", "acid", "beta", "-", "oxidation", "." ]

[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "identified", "four", "novel", "mutations", "in", "three", "unrelated", "patients", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "All", "patients", "had", "the", "severe", "childhood", "form", "of", "VLCAD", "deficiency", "with", "early", "onset", "and", "high", "mortality", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Immunoblot", "analysis", "revealed", "that", "VLCAD", "protein", "was", "undetectable", "in", "patients", "2", "and", "3", ",", "whereas", "normal", "-", "size", "VLCAD", "protein", "and", "an", "aberrant", "form", "of", "VLCAD", "(", "4kDa", "smaller", ")", "were", "detected", "in", "patient", "1", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "As", "expected", ",", "null", "mutations", "were", "found", "in", "patients", "2", "and", "3", "patient", "2", "is", "homozygous", "for", "a", "frameshift", "mutation", ",", "del", "4", "bp", "at", "798", "-", "801", ",", "and", "patient", "3", "is", "homozygous", "for", "a", "nonsense", "mutation", "65C", ">", "A", "(", "S22X", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Patient", "1", "was", "homozygous", "for", "a", "complex", "mutant", "allele", "containing", "two", "alterations", ",", "including", "a", "194C", ">", "T", "transition", "(", "P65L", ")", "and", "739A", ">", "C", "transversion", "(", "K247Q", ")", ";", "in", "the", "case", "of", "P65L", ",", "the", "amino", "acid", "change", "does", "not", "reduce", "enzyme", "activity", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "However", ",", "the", "nucleotide", "change", "resulted", "in", "exon", "3", "skipping", ",", "whereas", "the", "latter", "K247Q", "mutation", "had", "a", "drastic", "effect", "on", "enzyme", "activity", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "verified", "these", "events", "by", "in", "vivo", "splicing", "experiments", "and", "transient", "expression", "analysis", "of", "mutant", "cDNAs", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "P65L", "mutation", "locates", "11", "bases", "upstream", "of", "a", "splice", "donor", "site", "of", "intron", "3", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "is", "an", "example", "of", "an", "exonic", "mutation", "which", "affects", "exon", "-", "splicing", ".", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Submicroscopic", "deletion", "in", "cousins", "with", "Prader", "-", "Willi", "syndrome", "causes", "a", "grandmatrilineal", "inheritance", "pattern", ":", "effects", "of", "imprinting", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "Prader", "-", "Willi", "syndrome", "(", "PWS", ")", "critical", "region", "on", "15q11", "-", "q13", "is", "subject", "to", "imprinting", "." ]

[ "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "PWS", "becomes", "apparent", "when", "genes", "on", "the", "paternally", "inherited", "chromosome", "are", "not", "expressed", "." ]

[ "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Familial", "PWS", "is", "rare", "." ]

[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O" ]

[ "We", "report", "on", "a", "family", "in", "which", "a", "male", "and", "a", "female", "paternal", "first", "cousin", "both", "have", "PWS", "with", "cytogenetically", "normal", "karyotypes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Fluorescence", "in", "situ", "hybridization", "(", "FISH", ")", "analysis", "shows", "a", "submicroscopic", "deletion", "of", "SNRPN", ",", "but", "not", "the", "closely", "associated", "loci", "D15S10", ",", "D15S11", ",", "D15S63", ",", "and", "GABRB3", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "cousins", "fathers", "and", "two", "paternal", "aunts", "have", "the", "same", "deletion", "and", "are", "clinically", "normal", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "grandmother", "of", "the", "cousins", "is", "deceased", "and", "not", "available", "for", "study", ",", "and", "their", "grandfather", "is", "not", "deleted", "for", "SNRPN", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "DNA", "methylation", "analysis", "of", "D15S63", "is", "consistent", "with", "an", "abnormality", "of", "the", "imprinting", "center", "associated", "with", "PWS", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O" ]

[ "\"", "Grandmatrilineal", "\"", "inheritance", "occurs", "when", "a", "woman", "with", "deletion", "of", "an", "imprinted", ",", "paternally", "expressed", "gene", "is", "at", "risk", "of", "having", "affected", "grandchildren", "through", "her", "sons", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "this", "case", ",", "PWS", "does", "not", "become", "evident", "as", "long", "as", "the", "deletion", "is", "passed", "through", "the", "matrilineal", "line", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "represents", "a", "unique", "inheritance", "pattern", "due", "to", "imprinting", ".", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Human", "glycine", "decarboxylase", "gene", "(", "GLDC", ")", "and", "its", "highly", "conserved", "processed", "pseudogene", "(", "psiGLDC", ")", ":", "their", "structure", "and", "expression", ",", "and", "the", "identification", "of", "a", "large", "deletion", "in", "a", "family", "with", "nonketotic", "hyperglycinemia", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]

[ "Mutations", "in", "the", "glycine", "decarboxylase", "gene", "(", "GLDC", ")", "cause", "nonketotic", "hyperglycinemia", "(", "NKH", ")", ",", "an", "in", "-", "born", "error", "of", "metabolism", "characterized", "by", "severe", "neurological", "disturbance", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]

[ "We", "have", "determined", "the", "structure", "of", "GLDC", "and", "of", "its", "pseudogene", "(", "psiGLDC", ")", "and", "studied", "their", "expression", "for", "a", "molecular", "analysis", "of", "NKH", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O" ]

[ "The", "GLDC", "gene", "spans", "at", "least", "135", "kb", "and", "consists", "of", "25", "exons", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "All", "donor", "and", "acceptor", "sites", "adhere", "to", "the", "canonical", "GT", "-", "AG", "rule", ",", "except", "for", "the", "donor", "site", "of", "intron", "21", ",", "where", "a", "variant", "form", "GC", "is", "used", "instead", "of", "GT", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "transcription", "initiation", "site", "has", "been", "assigned", "to", "a", "residue", "163", "bp", "upstream", "from", "the", "translation", "initiation", "triplet", "by", "primer", "extension", "analysis", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "psiGLDC", "gene", "has", "no", "intron", "and", "shares", "97", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "5", "%", "homology", "with", "the", "coding", "region", "of", "functional", "GLDC", ",", "suggesting", "that", "psiGLDC", "is", "a", "processed", "pseudogene", "that", "arose", "from", "the", "GLDC", "transcript", "about", "4", "-", "8", "million", "years", "ago", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "RNA", "blotting", "analysis", "has", "revealed", "that", "GLDC", "is", "expressed", "in", "human", "liver", ",", "kidney", ",", "brain", ",", "and", "placenta", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "have", "also", "examined", "a", "patient", "with", "NKH", "with", "no", "detectable", "GLDC", "mRNA", "in", "his", "lymphoblasts", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Exons", "1", "-", "3", "of", "the", "functional", "GLDC", "gene", "from", "this", "patient", "are", "not", "amplified", "by", "polymerase", "chain", "reaction", "(", "PCR", ")", ",", "whereas", "those", "from", "control", "subjects", "are", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "results", "suggest", "a", "large", "homozygous", "deletion", "(", "at", "least", "30", "kb", ")", "in", "the", "patient", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Furthermore", ",", "we", "have", "devised", "a", "semi", "-", "quantitative", "PCR", "to", "estimate", "the", "number", "of", "GLDC", "alleles", "by", "using", "psiGLDC", "as", "an", "internal", "control", "and", "have", "confirmed", "the", "homozygosity", "and", "heterozygosity", "of", "the", "deletion", "in", "the", "patient", "and", "his", "parents", ",", "respectively", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Structural", "information", "of", "GLDC", "and", "psiGLDC", "should", "facilitate", "the", "molecular", "analysis", "of", "NKH", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O" ]

[ "De", "novo", "deletions", "of", "SNRPN", "exon", "1", "in", "early", "human", "and", "mouse", "embryos", "result", "in", "a", "paternal", "to", "maternal", "imprint", "switch", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Prader", "-", "Willi", "syndrome", "(", "PWS", ")", "is", "a", "neurogenetic", "disease", "characterized", "by", "infantile", "hypotonia", ",", "gonadal", "hypoplasia", ",", "obsessive", "behaviour", "and", "neonatal", "feeding", "difficulties", "followed", "by", "hyperphagia", ",", "leading", "to", "profound", "obesity", "." ]

[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O" ]

[ "PWS", "is", "due", "to", "a", "lack", "of", "paternal", "genetic", "information", "at", "15q11", "-", "q13", "(", "ref", ".", "2", ")", "." ]

[ "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]