tokens
listlengths 2
123
| ner_tags
listlengths 2
123
|
---|---|
[
"By",
"haplotype",
"analysis",
",",
"our",
"data",
"indicate",
"a",
"minimum",
"crossover",
"frequency",
"of",
"22",
"%",
"between",
"the",
"SAA",
"gene",
"marker",
"and",
"FMF",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O"
] |
[
"By",
"conventional",
"linkage",
"analysis",
"this",
"eliminates",
"a",
"minimum",
"of",
"10",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"4",
"cM",
"including",
"and",
"surrounding",
"the",
"SAA",
"gene",
"cluster",
"as",
"the",
"site",
"of",
"the",
"FMF",
"mutation",
"although",
"SAA",
"proteins",
"are",
"prominent",
"physiologic",
"markers",
"of",
"the",
"acute",
"attacks",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"PRAD1",
",",
"a",
"candidate",
"BCL1",
"oncogene",
":",
"mapping",
"and",
"expression",
"in",
"centrocytic",
"lymphoma",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O"
] |
[
"Rearrangement",
"of",
"the",
"BCL1",
"(",
"B",
"-",
"cell",
"lymphoma",
"1",
")",
"region",
"on",
"chromosome",
"11q13",
"appears",
"to",
"be",
"highly",
"characteristic",
"of",
"centrocytic",
"lymphoma",
"and",
"also",
"is",
"found",
"infrequently",
"in",
"other",
"B",
"-",
"cell",
"neoplasms",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O"
] |
[
"Rearrangement",
"is",
"thought",
"to",
"deregulate",
"a",
"nearby",
"protooncogene",
",",
"but",
"transcribed",
"sequences",
"in",
"the",
"immediate",
"vicinity",
"of",
"BCL1",
"breakpoints",
"had",
"not",
"been",
"identified",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"PRAD1",
",",
"previously",
"designated",
"D11S287E",
",",
"was",
"identified",
"on",
"11q13",
"as",
"a",
"chromosomal",
"breakpoint",
"region",
"rearranged",
"with",
"the",
"parathyroid",
"hormone",
"gene",
"in",
"a",
"subset",
"of",
"parathyroid",
"adenomas",
";",
"this",
"highly",
"conserved",
"putative",
"oncogene",
",",
"which",
"encodes",
"a",
"novel",
"cyclin",
",",
"has",
"been",
"linked",
"to",
"BCL1",
"and",
"implicated",
"also",
"in",
"subsets",
"of",
"breast",
"and",
"squamous",
"cell",
"neoplasms",
"with",
"11q13",
"amplification",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"report",
"pulsed",
"-",
"field",
"gel",
"electrophoresis",
"data",
"showing",
"BCL1",
"and",
"PRAD1",
"to",
"be",
"no",
"more",
"than",
"130",
"kilobases",
"apart",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"PRAD1",
"mRNA",
"is",
"abundantly",
"expressed",
"in",
"seven",
"of",
"seven",
"centrocytic",
"lymphomas",
"(",
"Kiel",
"classification",
")",
",",
"in",
"contrast",
"to",
"13",
"closely",
"related",
"but",
"noncentrocytic",
"lymphomas",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O"
] |
[
"Three",
"of",
"the",
"seven",
"centrocytic",
"lymphomas",
"had",
"detectable",
"BCL1",
"DNA",
"rearrangement",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Also",
",",
"two",
"unusual",
"cases",
"of",
"CLL",
"with",
"BCL1",
"rearrangement",
"overexpressed",
"PRAD1",
",",
"in",
"contrast",
"to",
"five",
"CLL",
"controls",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Thus",
",",
"PRAD1",
"is",
"an",
"excellent",
"candidate",
"\"",
"BCL1",
"oncogene",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"\"",
"Its",
"overexpression",
"may",
"be",
"a",
"key",
"consequence",
"of",
"rearrangement",
"of",
"the",
"BCL1",
"vicinity",
"in",
"B",
"-",
"cell",
"neoplasms",
"and",
"a",
"unifying",
"pathogenetic",
"feature",
"in",
"centrocytic",
"lymphoma",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O"
] |
[
"Two",
"new",
"arylsulfatase",
"A",
"(",
"ARSA",
")",
"mutations",
"in",
"a",
"juvenile",
"metachromatic",
"leukodystrophy",
"(",
"MLD",
")",
"patient",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Fragments",
"of",
"the",
"arylsulfatase",
"A",
"(",
"ARSA",
")",
"gene",
"from",
"a",
"patient",
"with",
"juvenile",
"-",
"onset",
"metachromatic",
"leukodystrophy",
"(",
"MLD",
")",
"were",
"amplified",
"by",
"PCR",
"and",
"ligated",
"into",
"MP13",
"cloning",
"vectors",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Clones",
"hybridizing",
"with",
"cDNA",
"for",
"human",
"ARSA",
"were",
"selected",
",",
"examined",
"for",
"appropriate",
"size",
"inserts",
",",
"and",
"used",
"to",
"prepare",
"single",
"-",
"stranded",
"phage",
"DNA",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Examination",
"of",
"the",
"entire",
"coding",
"and",
"most",
"of",
"the",
"intronic",
"sequence",
"revealed",
"two",
"putative",
"disease",
"-",
"related",
"mutations",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"One",
",",
"a",
"point",
"mutation",
"in",
"exon",
"3",
",",
"resulted",
"in",
"the",
"substitution",
"of",
"isoleucine",
"by",
"serine",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Introduction",
"of",
"this",
"alteration",
"into",
"the",
"normal",
"ARSA",
"cDNA",
"sequence",
"resulted",
"in",
"a",
"substantial",
"decrease",
"in",
"ARSA",
"activity",
"on",
"transient",
"expression",
"in",
"cultured",
"baby",
"hamster",
"kidney",
"cells",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"About",
"5",
"%",
"of",
"the",
"control",
"expression",
"was",
"observed",
",",
"suggesting",
"a",
"small",
"residual",
"activity",
"in",
"the",
"mutated",
"ARSA",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"second",
"mutation",
",",
"a",
"G",
"-",
"to",
"-",
"A",
"transition",
",",
"occurred",
"in",
"the",
"other",
"allele",
"and",
"resulted",
"in",
"an",
"altered",
"splice",
"-",
"recognition",
"sequence",
"between",
"exon",
"7",
"and",
"the",
"following",
"intron",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"mutation",
"also",
"resulted",
"in",
"the",
"loss",
"of",
"a",
"restriction",
"site",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Apparently",
"normal",
"levels",
"of",
"mRNA",
"were",
"generated",
"from",
"this",
"allele",
",",
"but",
"no",
"ARSA",
"activity",
"or",
"immuno",
"-",
"cross",
"-",
"reactive",
"material",
"could",
"be",
"detected",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"A",
"collection",
"of",
"DNA",
"samples",
"from",
"known",
"or",
"suspected",
"MLD",
"patients",
",",
"members",
"of",
"their",
"families",
",",
"and",
"normal",
"controls",
"was",
"screened",
"for",
"these",
"mutations",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Four",
"additional",
"individuals",
"carrying",
"each",
"of",
"the",
"mutations",
"were",
"found",
"among",
"the",
"nearly",
"100",
"MLD",
"patients",
"in",
"the",
"sample",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Gene",
"segregation",
"in",
"the",
"original",
"patients",
"family",
"was",
"consistent",
"with",
"available",
"clinical",
"and",
"biochemical",
"data",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"No",
"individuals",
"homozygous",
"for",
"either",
"of",
"these",
"two",
"mutations",
"were",
"identified",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"However",
",",
"combinations",
"with",
"other",
"MLD",
"mutations",
"suggest",
"that",
"the",
"point",
"mutation",
"in",
"exon",
"3",
"does",
"result",
"in",
"some",
"residual",
"enzyme",
"activity",
"and",
"is",
"associated",
"with",
"late",
"-",
"onset",
"forms",
"of",
"the",
"disease",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"splice",
"-",
"site",
"mutation",
"following",
"exon",
"7",
"produces",
"late",
"-",
"infantile",
"MLD",
"when",
"combined",
"with",
"other",
"enzyme",
"-",
"null",
"mutations",
",",
"implying",
"that",
"it",
"is",
"completely",
"silent",
"enzymatically",
".",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Analysis",
"of",
"X",
"-",
"chromosome",
"inactivation",
"and",
"presumptive",
"expression",
"of",
"the",
"Wiskott",
"-",
"Aldrich",
"syndrome",
"(",
"WAS",
")",
"gene",
"in",
"hematopoietic",
"cell",
"lineages",
"of",
"a",
"thrombocytopenic",
"carrier",
"female",
"of",
"WAS",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O"
] |
[
"We",
"report",
"on",
"a",
"thrombocytopenic",
"female",
"belonging",
"to",
"a",
"pedigree",
"with",
"the",
"Wiskott",
"-",
"Aldrich",
"syndrome",
"(",
"WAS",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O"
] |
[
"Restriction",
"fragment",
"length",
"polymorphism",
"(",
"RFLP",
")",
"analysis",
"with",
"probe",
"M27",
"beta",
",",
"closely",
"linked",
"to",
"the",
"WAS",
"gene",
",",
"demonstrated",
"that",
"she",
"is",
"a",
"carrier",
"of",
"WAS",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O"
] |
[
"Both",
"small",
"-",
"sized",
"and",
"normal",
"-",
"sized",
"platelets",
"were",
"present",
",",
"suggesting",
"that",
",",
"unlike",
"the",
"vast",
"majority",
"of",
"WAS",
"carriers",
",",
"she",
"does",
"not",
"manifest",
"nonrandom",
"X",
"-",
"chromosome",
"inactivation",
"in",
"the",
"thrombopoietic",
"cell",
"lineage",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Study",
"of",
"X",
"-",
"chromosome",
"inactivation",
"by",
"means",
"of",
"RFLP",
"and",
"methylation",
"analysis",
"demonstrated",
"that",
"the",
"pattern",
"of",
"X",
"-",
"chromosome",
"inactivation",
"was",
"nonrandom",
"in",
"T",
"lymphocytes",
",",
"but",
"random",
"in",
"granulocytes",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"While",
"this",
"is",
"the",
"first",
"complete",
"report",
"on",
"the",
"occurrence",
"of",
"thrombocytopenia",
"in",
"a",
"carrier",
"female",
"of",
"WAS",
"as",
"the",
"result",
"of",
"atypical",
"lyonization",
",",
"it",
"also",
"suggests",
"that",
"expression",
"of",
"the",
"WAS",
"gene",
"occurs",
"at",
"(",
"or",
"extends",
"up",
"to",
")",
"a",
"later",
"stage",
"than",
"the",
"multipotent",
"stem",
"cell",
"along",
"the",
"hematopoietic",
"differentiation",
"pathway",
".",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"A",
"new",
"mutation",
"in",
"the",
"proteolipid",
"protein",
"(",
"PLP",
")",
"gene",
"in",
"a",
"German",
"family",
"with",
"Pelizaeus",
"-",
"Merzbacher",
"disease",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O"
] |
[
"A",
"C",
"-",
"to",
"-",
"T",
"transition",
"in",
"exon",
"4",
"of",
"the",
"PLP",
"gene",
"was",
"found",
"in",
"2",
"affected",
"males",
"and",
"two",
"obligate",
"carriers",
"in",
"a",
"German",
"family",
"with",
"Pelizaeus",
"-",
"Merzbacher",
"disease",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O"
] |
[
"The",
"mutation",
",",
"which",
"causes",
"loss",
"of",
"an",
"HphI",
"site",
"and",
"changes",
"amino",
"acid",
"155",
"from",
"threonine",
"to",
"isoleucine",
",",
"was",
"absent",
"from",
"108",
"normal",
"chromosomes",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"There",
"are",
"5",
"concordances",
"and",
"1",
"discrepancy",
"between",
"these",
"results",
"and",
"those",
"obtained",
"by",
"magnetic",
"resonance",
"imaging",
"in",
"this",
"family",
".",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"A",
"3",
"-",
"base",
"pair",
"in",
"-",
"frame",
"deletion",
"of",
"the",
"phenylalanine",
"hydroxylase",
"gene",
"results",
"in",
"a",
"kinetic",
"variant",
"of",
"phenylketonuria",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O"
] |
[
"Phenylketonuria",
"(",
"PKU",
")",
"is",
"an",
"autosomal",
"recessive",
"disease",
"due",
"to",
"deficiency",
"of",
"a",
"hepatic",
"enzyme",
",",
"phenylalanine",
"hydroxylase",
"(",
"PAH",
")",
"."
] |
[
"B-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"absence",
"of",
"PAH",
"activity",
"results",
"in",
"typical",
"PKU",
"while",
"persistence",
"of",
"a",
"residual",
"enzyme",
"activity",
"gives",
"rise",
"to",
"variant",
"forms",
"of",
"the",
"disease",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"report",
"here",
"a",
"3",
"-",
"base",
"pair",
"in",
"-",
"frame",
"deletion",
"of",
"the",
"PAH",
"gene",
"(",
"delta",
"194",
")",
"in",
"a",
"mild",
"variant",
",",
"with",
"markedly",
"reduced",
"affinity",
"of",
"the",
"enzyme",
"for",
"phenylalanine",
"(",
"Km",
"=",
"160",
"nM",
")",
",",
"and",
"we",
"provide",
"functional",
"evidence",
"for",
"responsibility",
"of",
"the",
"deletion",
"in",
"the",
"mutant",
"phenotype",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Since",
"the",
"deletion",
"was",
"located",
"in",
"the",
"third",
"exon",
"of",
"the",
"gene",
",",
"which",
"presents",
"no",
"homology",
"with",
"other",
"hydroxylases",
",",
"we",
"suggest",
"that",
"exon",
"3",
"is",
"involved",
"in",
"the",
"specificity",
"of",
"the",
"enzyme",
"for",
"phenylalanine",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Finally",
",",
"since",
"none",
"of",
"the",
"98",
"PKU",
"patients",
"tested",
"were",
"found",
"to",
"carry",
"this",
"particular",
"deletion",
",",
"our",
"study",
"suggests",
"that",
"this",
"molecular",
"event",
"probably",
"occurred",
"recently",
"on",
"the",
"background",
"of",
"a",
"haplotype",
"2",
"gene",
"in",
"Portugal",
".",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Mutation",
"of",
"the",
"KIT",
"(",
"mast",
"/",
"stem",
"cell",
"growth",
"factor",
"receptor",
")",
"protooncogene",
"in",
"human",
"piebaldism",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O"
] |
[
"Piebaldism",
"is",
"an",
"autosomal",
"dominant",
"genetic",
"disorder",
"characterized",
"by",
"cogenital",
"patches",
"of",
"skin",
"and",
"hair",
"from",
"which",
"melanocytes",
"are",
"completely",
"absent",
"."
] |
[
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"A",
"similar",
"disorder",
"of",
"mouse",
",",
"dominant",
"white",
"spotting",
"(",
"W",
")",
",",
"results",
"from",
"mutations",
"of",
"the",
"c",
"-",
"Kit",
"protooncogene",
",",
"which",
"encodes",
"and",
"receptor",
"for",
"mast",
"/",
"stem",
"cell",
"growth",
"factor",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"identified",
"a",
"KIT",
"gene",
"mutation",
"in",
"a",
"proband",
"with",
"classic",
"autosomal",
"dominant",
"piebaldism",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O"
] |
[
"This",
"mutation",
"results",
"in",
"a",
"Gly",
"-",
"-",
"-",
"-",
"Arg",
"substitution",
"at",
"codon",
"664",
",",
"within",
"the",
"tyrosine",
"kinase",
"domain",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"This",
"substitution",
"was",
"not",
"seen",
"in",
"any",
"normal",
"individuals",
"and",
"was",
"completely",
"linked",
"to",
"the",
"piebald",
"phenotype",
"in",
"the",
"probands",
"family",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Piebaldism",
"in",
"this",
"family",
"thus",
"appears",
"to",
"be",
"the",
"human",
"homologue",
"to",
"dominant",
"white",
"spotting",
"(",
"W",
")",
"of",
"the",
"mouse",
".",
"."
] |
[
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Genetic",
"analysis",
"of",
"a",
"Japanese",
"family",
"with",
"normotriglyceridemic",
"abetalipoproteinemia",
"indicates",
"a",
"lack",
"of",
"linkage",
"to",
"the",
"apolipoprotein",
"B",
"gene",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Normotriglyceridemic",
"abetalipoproteinemia",
"is",
"a",
"rare",
"familial",
"disorder",
"characterized",
"by",
"an",
"isolated",
"deficiency",
"of",
"apoB",
"-",
"100",
"."
] |
[
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O"
] |
[
"We",
"have",
"previously",
"reported",
"a",
"patient",
"with",
"this",
"disease",
",",
"who",
"had",
"normal",
"apoB",
"-",
"48",
"but",
"no",
"apoB",
"-",
"100",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"To",
"elucidate",
"the",
"genetic",
"abnormalities",
"in",
"this",
"family",
",",
"we",
"studied",
"the",
"linkage",
"of",
"apoB",
"gene",
"using",
"three",
"genetic",
"markers",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"proband",
"and",
"her",
"affected",
"brother",
"showed",
"completely",
"different",
"apoB",
"gene",
"alleles",
",",
"suggesting",
"that",
"the",
"apoB",
"gene",
"itself",
"is",
"not",
"related",
"to",
"this",
"disorder",
"in",
"this",
"family",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"By",
"contrast",
",",
"an",
"American",
"case",
"had",
"a",
"point",
"substitution",
"in",
"the",
"apoB",
"gene",
"generating",
"an",
"in",
"-",
"frame",
"stop",
"codon",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"These",
"results",
"indicate",
"that",
"this",
"disorder",
"can",
"be",
"caused",
"by",
"defect",
"(",
"s",
")",
"of",
"either",
"an",
"apoB",
"gene",
"or",
"other",
"genes",
".",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Localisation",
"of",
"the",
"gene",
"for",
"Norrie",
"disease",
"to",
"between",
"DXS7",
"and",
"DXS426",
"on",
"Xp",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"A",
"highly",
"informative",
"microsatellite",
"marker",
",",
"DXS426",
",",
"which",
"maps",
"proximal",
"to",
"DXS7",
"in",
"the",
"interval",
"Xp11",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"4",
"-",
"Xp11",
"4",
"-",
"Xp11",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"23",
",",
"has",
"been",
"used",
"to",
"refine",
"further",
"the",
"localisation",
"of",
"the",
"gene",
"for",
"Norrie",
"disease",
"(",
"NDP",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"results",
"from",
"a",
"multiply",
"informative",
"crossover",
"localize",
"the",
"NDP",
"gene",
"proximal",
"to",
"DXS7",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"conjunction",
"with",
"information",
"from",
"2",
"NDP",
"patients",
"who",
"have",
"a",
"deletion",
"for",
"DXS7",
"but",
"not",
"for",
"DSX426",
",",
"our",
"data",
"indicate",
"that",
"the",
"NDP",
"gene",
"lies",
"between",
"DXS7",
"and",
"DXS426",
"on",
"proximal",
"Xp",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Aberrant",
"splicing",
"of",
"phenylalanine",
"hydroxylase",
"mRNA",
":",
"the",
"major",
"cause",
"for",
"phenylketonuria",
"in",
"parts",
"of",
"southern",
"Europe",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"report",
"a",
"mutation",
"within",
"the",
"phenylalanine",
"hydroxylase",
"(",
"PAH",
")",
"gene",
"that",
"causes",
"aberrant",
"splicing",
"of",
"the",
"mRNA",
"and",
"that",
"is",
"in",
"tight",
"association",
"with",
"chromosomal",
"haplotypes",
"6",
",",
"10",
",",
"and",
"36",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Because",
"of",
"the",
"high",
"frequency",
"of",
"these",
"particular",
"haplotypes",
"in",
"Bulgaria",
",",
"Italy",
",",
"and",
"Turkey",
",",
"it",
"appears",
"to",
"be",
"one",
"of",
"the",
"more",
"frequent",
"defects",
"in",
"the",
"PAH",
"gene",
"causing",
"classical",
"phenylketonuria",
"in",
"this",
"part",
"of",
"Europe",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"mutation",
"is",
"a",
"G",
"to",
"A",
"transition",
"at",
"position",
"546",
"in",
"intron",
"10",
"of",
"the",
"PAH",
"gene",
",",
"11",
"bp",
"upstream",
"from",
"the",
"intron",
"10",
"/",
"exon",
"11",
"boundary",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"It",
"activates",
"a",
"cryptic",
"splice",
"site",
"and",
"results",
"in",
"an",
"in",
"-",
"frame",
"insertion",
"of",
"9",
"nucleotides",
"between",
"exon",
"10",
"and",
"exon",
"11",
"of",
"the",
"processed",
"mRNA",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Normal",
"amounts",
"of",
"liver",
"PAH",
"protein",
"are",
"present",
"in",
"homozygous",
"patients",
",",
"but",
"no",
"catalytic",
"activity",
"can",
"be",
"detected",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"This",
"loss",
"of",
"enzyme",
"activity",
"is",
"probably",
"caused",
"by",
"conformational",
"changes",
"resulting",
"from",
"the",
"insertion",
"of",
"three",
"additional",
"amino",
"acids",
"(",
"Gly",
"-",
"Leu",
"-",
"Gln",
")",
"between",
"the",
"normal",
"sequences",
"encoded",
"by",
"exon",
"10",
"and",
"exon",
"11",
".",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Gardner",
"syndrome",
"in",
"a",
"boy",
"with",
"interstitial",
"deletion",
"of",
"the",
"long",
"arm",
"of",
"chromosome",
"5",
"."
] |
[
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"described",
"a",
"15",
"-",
"year",
"-",
"old",
"boy",
"with",
"Gardner",
"syndrome",
"(",
"GS",
")",
",",
"mental",
"retardation",
",",
"and",
"craniofacial",
"abnormalities",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O"
] |
[
"High",
"-",
"resolution",
"banding",
"analysis",
"showed",
"an",
"interstitial",
"deletion",
"of",
"the",
"long",
"arm",
"of",
"chromosome",
"5",
"(",
"q22",
".",
"1",
"-",
"-",
"-",
"-",
"q31",
"1",
"-",
"-",
"-",
"-",
"q31",
".",
"1",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"breakpoints",
"in",
"the",
"present",
"case",
"and",
"in",
"3",
"previously",
"reported",
"5q",
"-",
"patients",
"with",
"adenomatous",
"polyposis",
"coli",
"suggest",
"that",
"the",
"gene",
"responsible",
"for",
"GS",
"/",
"or",
"familial",
"polyposis",
"coli",
"(",
"FPC",
")",
"is",
"in",
"the",
"5q22",
"region",
",",
"a",
"result",
"consistent",
"with",
"the",
"findings",
"of",
"linkage",
"studies"
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Huntington",
"disease",
"and",
"childhood",
"-",
"onset",
"Tourette",
"syndrome",
"."
] |
[
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O"
] |
[
"A",
"40",
"-",
"year",
"-",
"old",
"man",
"with",
"childhood",
"-",
"onset",
"Tourette",
"syndrome",
"(",
"TS",
")",
"developed",
"Huntington",
"disease",
"(",
"HD",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"believe",
"this",
"to",
"be",
"the",
"first",
"reported",
"case",
"of",
"childhood",
"-",
"onset",
"TS",
"with",
"adult",
"onset",
"HD",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O"
] |
[
"Discovery",
"of",
"other",
"cases",
"with",
"both",
"disorders",
"may",
"provide",
"clues",
"to",
"the",
"pathophysiology",
"of",
"both",
"conditions",
".",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Sequence",
"of",
"DNA",
"flanking",
"the",
"exons",
"of",
"the",
"HEXA",
"gene",
",",
"and",
"identification",
"of",
"mutations",
"in",
"Tay",
"-",
"Sachs",
"disease",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O"
] |
[
"The",
"rapid",
"identification",
"of",
"mutations",
"causing",
"Tay",
"-",
"Sachs",
"disease",
"requires",
"the",
"capacity",
"to",
"readily",
"screen",
"the",
"regions",
"of",
"the",
"HEXA",
"gene",
"most",
"likely",
"to",
"be",
"affected",
"by",
"mutation",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"have",
"sequenced",
"the",
"portions",
"of",
"the",
"introns",
"flanking",
"each",
"of",
"the",
"14",
"HEXA",
"exons",
"in",
"order",
"to",
"specify",
"oligonucleotide",
"primers",
"for",
"the",
"PCR",
"-",
"dependent",
"amplification",
"of",
"each",
"exon",
"and",
"splice",
"-",
"junction",
"sequence",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"amplified",
"products",
"were",
"analyzed",
",",
"by",
"electrophoresis",
"in",
"nondenaturing",
"polyacrylamide",
"gels",
",",
"for",
"the",
"presence",
"of",
"either",
"heteroduplexes",
",",
"derived",
"from",
"the",
"annealing",
"of",
"normal",
"and",
"mutant",
"DNA",
"strands",
",",
"or",
"single",
"-",
"strand",
"conformational",
"polymorphisms",
"(",
"SSCP",
")",
",",
"derived",
"from",
"the",
"renaturation",
"of",
"single",
"-",
"stranded",
"DNA",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Five",
"novel",
"mutations",
"from",
"Tay",
"-",
"Sachs",
"disease",
"patients",
"were",
"detected",
"a",
"5",
"-",
"bp",
"deletion",
"of",
"TCTCC",
"in",
"IVS",
"-",
"9",
";",
"a",
"2",
"-",
"bp",
"deletion",
"of",
"TG",
"in",
"exon",
"5",
";",
"G78",
"to",
"A",
",",
"giving",
"a",
"stop",
"codon",
"in",
"exon",
"1",
";",
"G533",
"to",
"T",
"in",
"exon",
"5",
",",
"producing",
"the",
"third",
"amino",
"acid",
"substitution",
"detected",
"at",
"this",
"site",
";",
"and",
"G",
"to",
"C",
"at",
"position",
"1",
"of",
"IVS",
"-",
"2",
",",
"expected",
"to",
"produce",
"abnormal",
"splicing",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"addition",
",",
"two",
"mutations",
",",
"(",
"G1496",
"to",
"A",
"in",
"exon",
"13",
"and",
"a",
"4",
"-",
"bp",
"insertion",
"in",
"exon",
"11",
")",
"that",
"have",
"previously",
"been",
"reported",
"were",
"identified",
".",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Molecular",
"characterization",
"of",
"two",
"galactosemia",
"mutations",
":",
"correlation",
"of",
"mutations",
"with",
"highly",
"conserved",
"domains",
"in",
"galactose",
"-",
"1",
"-",
"phosphate",
"uridyl",
"transferase",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Galactosemia",
"is",
"an",
"autosomal",
"recessive",
"disorder",
"of",
"human",
"galactose",
"metabolism",
"caused",
"by",
"deficiency",
"of",
"the",
"enzyme",
"galactose",
"-",
"1",
"-",
"phosphate",
"uridyl",
"transferase",
"(",
"GALT",
")",
"."
] |
[
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"molecular",
"basis",
"of",
"this",
"disorder",
"is",
"at",
"present",
"not",
"well",
"understood",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"report",
"here",
"two",
"missense",
"mutations",
"which",
"result",
"in",
"low",
"or",
"undetectable",
"enzymatic",
"activity",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"First",
",",
"we",
"identified",
"at",
"nucleotide",
"591",
"a",
"transition",
"which",
"substitutes",
"glutamine",
"188",
"by",
"arginine",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"mutated",
"glutamine",
"is",
"not",
"only",
"highly",
"conserved",
"in",
"evolution",
"(",
"conserved",
"also",
"in",
"Escherichia",
"coli",
"and",
"Saccharomyces",
"cerevisiae",
")",
",",
"but",
"is",
"also",
"two",
"amino",
"acid",
"residues",
"downstream",
"from",
"the",
"active",
"site",
"histidine",
"-",
"proline",
"-",
"histidine",
"triad",
"and",
"results",
"in",
"about",
"10",
"%",
"of",
"normal",
"enzymatic",
"activity",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"arginine",
"188",
"mutation",
"is",
"the",
"most",
"common",
"galactosemia",
"mutation",
"characterized",
"to",
"date",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"It",
"accounts",
"for",
"one",
"-",
"fourth",
"of",
"the",
"galactosemia",
"alleles",
"studied",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Second",
",",
"we",
"report",
"the",
"substitution",
"of",
"arginine",
"333",
"by",
"tryptophan",
",",
"caused",
"by",
"a",
"transition",
"at",
"nucleotide",
"1025",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"area",
"surrounding",
"this",
"missense",
"mutation",
"is",
"the",
"most",
"highly",
"conserved",
"domain",
"in",
"the",
"homologous",
"enzymes",
"from",
"E",
".",
"coli",
",",
"yeast",
",",
"and",
"humans",
",",
"and",
"this",
"mutation",
"results",
"in",
"undetectable",
"enzymatic",
"activity",
",",
"suggesting",
"that",
"this",
"is",
"a",
"severe",
"mutation",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"This",
"second",
"mutation",
"appears",
"to",
"be",
"rare",
",",
"since",
"it",
"was",
"found",
"only",
"in",
"the",
"patient",
"we",
"sequenced",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Our",
"data",
"provide",
"further",
"evidence",
"for",
"the",
"heterogeneity",
"of",
"galactosemia",
"at",
"the",
"molecular",
"level",
",",
"heterogeneity",
"which",
"might",
"be",
"related",
"to",
"the",
"variable",
"clinical",
"outcome",
"observed",
"in",
"this",
"disorder",
".",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Hypoxanthine",
"-",
"guanine",
"phosphoribosyltransferase",
"deficiency",
":",
"analysis",
"of",
"HPRT",
"mutations",
"by",
"direct",
"sequencing",
"and",
"allele",
"-",
"specific",
"amplification",
"."
] |
[
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"Lesch",
"-",
"Nyhan",
"syndrome",
"is",
"a",
"severe",
"X",
"chromosome",
"-",
"linked",
"human",
"disease",
"caused",
"by",
"a",
"virtual",
"absence",
"of",
"hypoxanthine",
"-",
"guanine",
"phosphoribosyltransferase",
"(",
"HPRT",
")",
"activity",
"."
] |
[
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O"
] |
Subsets and Splits
No community queries yet
The top public SQL queries from the community will appear here once available.