disi-unibo-nlp/ncbi · Datasets at Hugging Face

tokens listlengths 2 123	ner_tags listlengths 2 123
[ "Mucopolysaccharidosis", "IVA", "(", "MPS", "IVA", ")", "is", "an", "autosomal", "recessive", "disorder", "caused", "by", "a", "deficiency", "in", "N", "-", "acetylgalactosamine", "-", "6", "-", "sulfatase", "(", "GALNS", ")", "." ]	[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "found", "two", "separate", "deletions", "of", "nearly", "8", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "0", "and", "6", "." ]	[ "O", "O", "O", "O" ]
[ "0", "kb", "in", "the", "GALNS", "gene", ",", "including", "some", "exons", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "There", "are", "Alu", "repetitive", "elements", "near", "the", "breakpoints", "of", "the", "8", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "0", "-", "kb", "deletion", ",", "and", "this", "deletion", "resulted", "from", "an", "Alu", "-", "Alu", "recombination", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "other", "6", "." ]	[ "O", "O", "O", "O" ]
[ "0", "-", "kb", "deletion", "involved", "illegitimate", "recombinational", "events", "between", "incomplete", "short", "direct", "repeats", "of", "8", "bp", "at", "deletion", "breakpoints", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "same", "rearrangement", "has", "been", "observed", "in", "a", "heteroallelic", "state", "in", "four", "unrelated", "patients", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "is", "the", "first", "documentation", "of", "a", "common", "double", "deletion", "a", "gene", "that", "is", "not", "a", "member", "of", "a", "gene", "cluster", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Detection", "of", "eight", "BRCA1", "mutations", "in", "10", "breast", "/", "ovarian", "cancer", "families", ",", "including", "1", "family", "with", "male", "breast", "cancer", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]
[ "Genetic", "epidemiological", "evidence", "suggests", "that", "mutations", "in", "BRCA1", "may", "be", "responsible", "for", "approximately", "one", "half", "of", "early", "onset", "familial", "breast", "cancer", "and", "the", "majority", "of", "familial", "breast", "/", "ovarian", "cancer", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]
[ "The", "recent", "cloning", "of", "BRCA1", "allows", "for", "the", "direct", "detection", "of", "mutations", ",", "but", "the", "feasibility", "of", "presymptomatic", "screening", "for", "cancer", "susceptibility", "is", "unknown", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "analyzed", "genomic", "DNA", "from", "one", "affected", "individual", "from", "each", "of", "24", "families", "with", "at", "least", "three", "cases", "of", "ovarian", "or", "breast", "cancer", ",", "using", "SSCP", "assays", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Variant", "SSCP", "bands", "were", "subcloned", "and", "sequenced", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Allele", "-", "specific", "oligonucleotide", "hybridization", "was", "used", "to", "verify", "sequence", "changes", "and", "to", "screen", "DNA", "from", "control", "individuals", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Six", "frameshift", "and", "two", "missense", "mutations", "were", "detected", "in", "10", "different", "families", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "A", "frameshift", "mutation", "was", "detected", "in", "a", "male", "proband", "affected", "with", "both", "breast", "and", "prostate", "cancer", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]
[ "A", "40", "-", "bp", "deletion", "was", "detected", "in", "a", "patient", "who", "developed", "intra", "-", "abdominal", "carcinomatosis", "1", "year", "after", "prophylactic", "oophorectomy", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Mutations", "were", "detected", "throughout", "the", "gene", ",", "and", "only", "one", "was", "detected", "in", "more", "than", "a", "single", "family", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "These", "results", "provide", "further", "evidence", "that", "inherited", "breast", "and", "ovarian", "cancer", "can", "occur", "as", "a", "consequence", "of", "a", "wide", "array", "of", "BRCA1", "mutations", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "These", "results", "suggests", "that", "development", "of", "a", "screening", "test", "for", "BRCA1", "mutations", "will", "be", "technically", "challenging", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "finding", "of", "a", "mutation", "in", "a", "family", "with", "male", "breast", "cancer", ",", "not", "previously", "thought", "to", "be", "related", "to", "BRCA1", ",", "also", "illustrates", "the", "potential", "difficulties", "of", "genetic", "counseling", "for", "individuals", "known", "to", "carry", "mutations", ".", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Natural", "selection", "of", "hemi", "-", "and", "heterozygotes", "for", "G6PD", "deficiency", "in", "Africa", "by", "resistance", "to", "severe", "malaria", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O" ]
[ "Glucose", "-", "6", "-", "phosphate", "dehydrogenase", "(", "G6PD", ")", "deficiency", ",", "the", "most", "common", "enzymopathy", "of", "humans", ",", "affects", "over", "400", "million", "people", "." ]	[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "geographical", "correlation", "of", "its", "distribution", "with", "the", "historical", "endemicity", "of", "malaria", "suggests", "that", "this", "disorder", "has", "risen", "in", "frequency", "through", "natural", "selection", "by", "malaria", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O" ]
[ "However", ",", "attempts", "to", "confirm", "that", "G6PD", "deficiency", "is", "protective", "in", "case", "-", "control", "studies", "of", "malaria", "have", "yielded", "conflicting", "results", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Hence", ",", "for", "this", "X", "-", "linked", "disorder", ",", "it", "is", "unclear", "whether", "both", "male", "hemizygotes", "and", "female", "heterozygotes", "are", "protected", "or", ",", "as", "frequently", "suggested", ",", "only", "females", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Furthermore", ",", "how", "much", "protection", "may", "be", "afforded", "is", "unknown", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Here", "we", "report", "that", ",", "in", "two", "large", "case", "-", "control", "studies", "of", "over", "2", ",", "000", "African", "children", ",", "the", "common", "African", "form", "of", "G6PD", "deficiency", "(", "G6PD", "A", "-", ")", "is", "associated", "with", "a", "46", "-", "58", "%", "reduction", "in", "risk", "of", "severe", "malaria", "for", "both", "female", "heterozygotes", "and", "male", "hemizygotes", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "A", "mathematical", "model", "incorporating", "the", "measured", "selective", "advantage", "against", "malaria", "suggests", "that", "a", "counterbalancing", "selective", "disadvantage", ",", "associated", "with", "this", "enzyme", "deficiency", ",", "has", "retarded", "its", "rise", "in", "frequency", "in", "malaria", "-", "endemic", "regions", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Although", "G6PD", "deficiency", "is", "now", "regarded", "as", "a", "generally", "benign", "disorder", ",", "in", "earlier", "environmental", "conditions", "it", "could", "have", "been", "significantly", "disadvantageous", ".", "." ]	[ "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "alveolar", "rhabdomyosarcoma", "PAX3", "/", "FKHR", "fusion", "protein", "is", "a", "transcriptional", "activator", "." ]	[ "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Chimeric", "transcription", "factors", ",", "created", "by", "gene", "fusions", "as", "the", "result", "of", "chromosomal", "translocations", ",", "have", "been", "implicated", "in", "the", "pathogenesis", "of", "several", "pathologically", "disparate", "solid", "tumors", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]
[ "The", "PAX3", "/", "FKHR", "fusion", "gene", ",", "formed", "by", "a", "t", "(", "2", ";", "13", ")", "(", "q35", ";", "q14", ")", "in", "alveolar", "rhabdomyosarcoma", ",", "encodes", "a", "hybrid", "protein", "that", "contains", "both", "PAX3", "DNA", "binding", "domains", ",", "the", "paired", "box", "and", "homeodomain", ",", "linked", "to", "the", "bisected", "DNA", "binding", "domain", "of", "FKHR", ",", "a", "member", "of", "the", "forkhead", "family", "of", "transcription", "factors", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Here", "we", "report", "that", "PAX3", "and", "PAX3", "/", "FKHR", "display", "similar", ",", "but", "not", "identical", "transactivation", "activities", "when", "tested", "with", "model", "Pax", "recognition", "sequences", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "No", "functional", "role", "could", "be", "ascribed", "solely", "to", "the", "residual", "FKHR", "binding", "domain", "present", "in", "the", "fusion", "protein", ",", "but", "FKHR", "was", "found", "to", "contribute", "a", "strong", "carboxyl", "terminal", "activation", "domain", "replacing", "the", "one", "located", "in", "the", "unrearranged", "PAX3", "gene", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "show", "that", "the", "native", "PAX3", "/", "FKHR", "protein", "present", "in", "tumor", "cells", "with", "this", "translocation", "has", "transcriptional", "characteristics", "similar", "to", "the", "in", "vitro", "expressed", "protein", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "ability", "of", "the", "PAX3", "/", "FKHR", "hybrid", "protein", "to", "bind", "DNA", "in", "a", "sequence", "specific", "manner", "and", "to", "transactivate", "the", "expression", "of", "artificial", "reporter", "genes", "suggests", "that", "its", "aberrant", "expression", "could", "subvert", "the", "transcriptional", "programs", "that", "normally", "control", "the", "growth", ",", "differentiation", ",", "and", "survival", "of", "primitive", "myogenic", "precursors", "in", "vivo", ".", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "A", "p16INK4a", "-", "insensitive", "CDK4", "mutant", "targeted", "by", "cytolytic", "T", "lymphocytes", "in", "a", "human", "melanoma", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O" ]
[ "A", "mutated", "cyclin", "-", "dependent", "kinase", "4", "(", "CDK4", ")", "was", "identified", "as", "a", "tumor", "-", "specific", "antigen", "recognized", "by", "HLA", "-", "A2", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "1", "-", "restricted", "autologous", "cytolytic", "T", "lymphocytes", "(", "CTLs", ")", "in", "a", "human", "melanoma", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O" ]
[ "The", "mutated", "CDK4", "allele", "was", "present", "in", "autologous", "cultured", "melanoma", "cells", "and", "metastasis", "tissue", ",", "but", "not", "in", "the", "patients", "lymphocytes", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "mutation", ",", "an", "arginine", "-", "to", "-", "cysteine", "exchange", "at", "residue", "24", ",", "was", "part", "of", "the", "CDK4", "peptide", "recognized", "by", "CTLs", "and", "prevented", "binding", "of", "the", "CDK4", "inhibitor", "p16INK4a", ",", "but", "not", "of", "p21", "or", "of", "p27KIP1", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "same", "mutation", "was", "found", "in", "one", "additional", "melanoma", "among", "28", "melanomas", "analyzed", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O" ]
[ "These", "results", "suggest", "that", "mutation", "of", "CDK4", "can", "create", "a", "tumor", "-", "specific", "antigen", "and", "can", "disrupt", "the", "cell", "-", "cycle", "regulation", "exerted", "by", "the", "tumor", "suppressor", "p16INK4a", ".", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Rapid", "detection", "of", "BRCA1", "mutations", "by", "the", "protein", "truncation", "test", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "More", "than", "75", "%", "of", "the", "reported", "mutations", "in", "the", "hereditary", "breast", "and", "ovarian", "cancer", "gene", ",", "BRCA1", ",", "result", "in", "truncated", "proteins", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "have", "used", "the", "protein", "truncation", "test", "(", "PTT", ")", "to", "screen", "for", "mutations", "in", "exon", "11", ",", "which", "encodes", "61", "%", "of", "BRCA1", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "45", "patients", "from", "breast", "and", "/", "or", "ovarian", "cancer", "families", "we", "found", "six", "novel", "mutations", "two", "single", "nucleotide", "insertions", ",", "three", "small", "deletions", "(", "1", "-", "5", "bp", ")", "and", "a", "nonsense", "mutation", "identified", "two", "unrelated", "families", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Furthermore", ",", "we", "were", "able", "to", "amplify", "the", "remaining", "coding", "region", "by", "RT", "-", "PCR", "using", "lymphocyte", "RNA", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Combined", "with", "PTT", ",", "we", "detected", "aberrantly", "spliced", "products", "affecting", "exons", "5", "and", "6", "in", "one", "of", "two", "BRCA1", "-", "linked", "families", "examined", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "protein", "truncation", "test", "promises", "to", "become", "a", "valuable", "technique", "in", "detecting", "BRCA1", "mutations", ".", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Cloning", "of", "human", "very", "-", "long", "-", "chain", "acyl", "-", "coenzyme", "A", "dehydrogenase", "and", "molecular", "characterization", "of", "its", "deficiency", "in", "two", "patients", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Two", "overlapping", "cDNA", "clones", "(", "1", ",", "991", "bp", "and", "736", "bp", ",", "respectively", ")", "encoding", "the", "precursor", "of", "human", "mitochondrial", "very", "-", "long", "-", "chain", "acyl", "-", "coenzyme", "A", "dehydrogenase", "(", "VLCAD", ")", "were", "cloned", "and", "sequenced", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "cDNA", "inserts", "of", "these", "clones", "together", "encompass", "a", "region", "of", "2", ",", "177", "bases", ",", "encoding", "the", "entire", "protein", "of", "655", "amino", "acids", ",", "including", "a", "40", "-", "amino", "acid", "leader", "peptide", "and", "a", "615", "-", "amino", "acid", "mature", "polypeptide", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "PCR", "-", "amplified", "VLCAD", "cDNAs", "were", "sequenced", "in", "cultured", "fibroblasts", "from", "two", "VLCAD", "-", "deficient", "patients", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O" ]
[ "In", "both", "patients", ",", "a", "105", "-", "bp", "deletion", "encompassing", "bases", "1078", "-", "1182", "in", "VLCAD", "cDNA", "was", "identified", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "deletion", "seems", "to", "occur", "due", "to", "exon", "skipping", "during", "processing", "of", "VLCAD", "pre", "-", "mRNA", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "is", "the", "first", "demonstration", "of", "a", "mutation", "causing", "VLCAD", "deficiency", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]
[ "Quantitative", "cDNA", "expression", "of", "normal", "human", "VLCAD", "was", "performed", "in", "the", "patients", "fibroblasts", ",", "using", "vaccinia", "viral", "system", ",", "which", "demonstrated", "that", "the", "deficiency", "of", "the", "normal", "VLCAD", "protein", "causes", "impaired", "long", "-", "chain", "fatty", "acid", "beta", "-", "oxidation", "activity", "in", "the", "patients", "fibroblasts", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "patient", "fibroblasts", ",", "raising", "VLCAD", "activity", "to", "approximately", "20", "%", "of", "normal", "control", "fibroblast", "activity", "raised", "palmitic", "acid", "beta", "-", "oxidation", "flux", "to", "the", "level", "found", "in", "control", "fibroblasts", ",", "which", "may", "offer", "important", "information", "for", "the", "rational", "design", "of", "future", "somatic", "gene", "therapy", "for", "VLCAD", "deficiency", ".", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O" ]
[ "Brain", "disease", "and", "molecular", "analysis", "in", "myotonic", "dystrophy", "." ]	[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]
[ "Abnormal", "amplification", "of", "a", "CTG", "repeat", "on", "chromosome", "19", "is", "the", "molecular", "basis", "of", "myotonic", "dystrophy", "(", "DM", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O" ]
[ "Expansion", "of", "the", "repeat", "has", "been", "correlated", "with", "severity", "of", "several", "clinical", "features", "of", "the", "disease", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "performed", "extensive", "cognitive", "testing", ",", "cerebral", "magnetic", "resonance", "imaging", "(", "MRI", ")", "and", "a", "molecular", "analysis", "in", "28", "cases", "of", "DM", "to", "determine", "the", "relationship", "between", "the", "molecular", "defect", "and", "brain", "disease", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]
[ "Performance", "in", "two", "or", "more", "cognitive", "tests", "was", "pathological", "in", "10", "cases", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Fourteen", "patients", "had", "subcortical", "white", "matter", "lesions", "on", "MRI", ",", "14", "had", "cerebral", "atrophy", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]
[ "Amplification", "of", "the", "CTG", "repeat", "showed", "a", "strong", "correlation", "with", "cognitive", "test", "deficits", "when", "exceeding", "a", "length", "of", "over", "1000", "trinucleotides", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "MRI", "lesions", "were", "associated", "with", "impaired", "psychometric", "performance", ",", "but", "MRI", "and", "molecular", "findings", "were", "only", "weakly", "related", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Disease", "duration", "influenced", "the", "appearance", "and", "amount", "of", "white", "matter", "lesions", "on", "MRI", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O" ]
[ "Quantification", "of", "CTG", "repeat", "size", "may", "allow", "an", "early", "estimate", "on", "the", "probability", "of", "brain", "involvement", "in", "DM", ";", "cognitive", "dysfunction", "is", "associated", "with", "white", "matter", "lesions", "and", "cerebral", "atrophy", "later", "on", "in", "the", "course", ".", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Mutations", "in", "the", "gene", "for", "X", "-", "linked", "adrenoleukodystrophy", "in", "patients", "with", "different", "clinical", "phenotypes", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Recently", ",", "the", "gene", "for", "the", "most", "common", "peroxisomal", "disorder", ",", "X", "-", "linked", "adrenoleukodystrophy", "(", "X", "-", "ALD", ")", ",", "has", "been", "described", "encoding", "a", "peroxisomal", "membrane", "transporter", "protein", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "analyzed", "the", "entire", "protein", "-", "coding", "sequence", "of", "this", "gene", "by", "reverse", "-", "transcription", "PCR", ",", "SSCP", ",", "and", "DNA", "sequencing", "in", "five", "patients", "with", "different", "clinical", "expression", "of", "X", "-", "ALD", "and", "in", "their", "female", "relatives", ";", "these", "clinical", "expressions", "were", "cerebral", "childhood", "ALD", ",", "adrenomyeloneuropathy", "(", "AMN", ")", ",", "and", "\"", "Addison", "disease", "only", "\"", "(", "ADO", ")", "phenotype", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O" ]
[ "In", "the", "three", "patients", "exhibiting", "the", "classical", "picture", "of", "severe", "childhood", "ALD", "we", "identified", "in", "the", "5", "portion", "of", "the", "X", "-", "ALD", "gene", "a", "38", "-", "bp", "deletion", "that", "causes", "a", "frameshift", "mutation", ",", "a", "3", "-", "bp", "deletion", "leading", "to", "a", "deletion", "of", "an", "amino", "acid", "in", "the", "ATP", "-", "binding", "domain", "of", "the", "ALD", "protein", ",", "and", "a", "missense", "mutation", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "the", "patient", "with", "the", "clinical", "phenotype", "of", "AMN", ",", "a", "nonsense", "mutation", "in", "codon", "212", ",", "along", "with", "a", "second", "site", "mutation", "at", "codon", "178", ",", "was", "observed", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Analysis", "of", "the", "patient", "with", "the", "ADO", "phenotype", "revealed", "a", "further", "missense", "mutation", "at", "a", "highly", "conserved", "position", "in", "the", "ALDP", "/", "PMP70", "comparison", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "disruptive", "nature", "of", "two", "mutations", "(", "i", ".", "e", ".", ",", "the", "frameshift", "and", "the", "nonsense", "mutation", ")", "in", "patients", "with", "biochemically", "proved", "childhood", "ALD", "and", "AMN", "further", "strongly", "supports", "the", "hypothesis", "that", "alterations", "in", "this", "gene", "play", "a", "crucial", "role", "in", "the", "pathogenesis", "of", "X", "-", "ALD", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]
[ "Since", "the", "current", "biochemical", "techniques", "for", "X", "-", "ALD", "carrier", "detection", "in", "affected", "families", "lack", "sufficient", "reliability", ",", "our", "procedure", "described", "for", "systematic", "mutation", "scanning", "is", "also", "capable", "of", "improving", "genetic", "counseling", "and", "prenatal", "diagnosis" ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Duchenne", "muscular", "dystrophy", "and", "myotonic", "dystrophy", "in", "the", "same", "patient", "." ]	[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "report", "on", "the", "first", "patient", "identified", "with", "myotonic", "dystrophy", "and", "Duchenne", "muscular", "dystrophy", "(", "DMD", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O" ]
[ "The", "family", "of", "the", "propositus", "had", "a", "strong", "history", "of", "myotonic", "dystrophy", ",", "and", "there", "was", "an", "intrafamilial", "pathological", "expansion", "of", "the", "responsible", "CTG", "repeat", "between", "the", "mildly", "affected", "mother", "(", "160", "repeats", ";", "normal", "27", "repeats", ")", "and", "her", "more", "severely", "affected", "son", "(", "650", "repeats", ")", ",", "and", "his", "sister", "(", "650", "repeats", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "propositus", "was", "an", "isolated", "case", "of", "Duchenne", "muscular", "dystrophy", "with", "marked", "dystrophin", "deficiency", "in", "muscle", "biopsy", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "patient", "was", "still", "ambulatory", "post", "age", "16", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Myotonic", "dystrophy", "could", "interfere", "to", "some", "extent", "with", "the", "progression", "of", "Duchenne", "dystrophy", "." ]	[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]
[ "However", ",", "other", "interpretations", "are", "possible", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Twelve", "percent", "of", "dystrophin", "revertant", "fibers", "as", "observed", "by", "immunohistochemistry", "could", "be", "sufficient", "to", "ameliorate", "typical", "DMD", "clinical", "severity", ",", "or", "the", "patient", "may", "present", "a", "somatic", "mosaic", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "pathophysiological", "interactions", "of", "these", "two", "unlinked", "disorders", "are", "discussed", "at", "the", "clinical", "and", "histopathological", "levels", ".", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Age", "at", "diagnosis", "as", "an", "indicator", "of", "eligibility", "for", "BRCA1", "DNA", "testing", "in", "familial", "breast", "cancer", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]
[ "We", "searched", "for", "criteria", "that", "could", "indicate", "breast", "cancer", "families", "with", "a", "high", "prior", "probability", "of", "being", "caused", "by", "the", "breast", "/", "ovarian", "cancer", "susceptibility", "locus", "BRCA1", "on", "chromosome", "17", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "To", "this", "end", ",", "we", "performed", "a", "linkage", "study", "with", "59", "consecutively", "collected", "Dutch", "breast", "cancer", "families", ",", "including", "16", "with", "at", "least", "one", "case", "of", "ovarian", "cancer", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]
[ "We", "used", "an", "intake", "cut", "-", "off", "of", "at", "least", "three", "first", "-", "degree", "relatives", "with", "breast", "and", "/", "or", "ovarian", "cancer", "at", "any", "age", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Significant", "evidence", "for", "linkage", "was", "found", "only", "among", "the", "13", "breast", "cancer", "families", "with", "a", "mean", "age", "at", "diagnosis", "of", "less", "than", "45", "years", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "An", "unexpectedly", "low", "proportion", "of", "the", "breast", "-", "ovarian", "cancer", "families", "were", "estimated", "to", "be", "linked", "to", "BRCA1", ",", "which", "could", "be", "due", "to", "a", "founder", "effect", "in", "the", "Dutch", "population", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Given", "the", "expected", "logistical", "problems", "in", "clinical", "management", "now", "that", "BRCA1", "has", "been", "identified", ",", "we", "propose", "an", "interim", "period", "in", "which", "only", "families", "with", "a", "strong", "positive", "family", "history", "for", "early", "onset", "breast", "and", "/", "or", "ovarian", "cancer", "will", "be", "offered", "BRCA1", "mutation", "testing", ".", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Linkage", "analysis", "of", "26", "Canadian", "breast", "and", "breast", "-", "ovarian", "cancer", "families", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O" ]
[ "We", "have", "examined", "26", "Canadian", "families", "with", "hereditary", "breast", "or", "ovarian", "cancer", "for", "linkage", "to", "markers", "flanking", "the", "BRCA1", "gene", "on", "chromosome", "17q12", "-", "q21", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Of", "the", "15", "families", "that", "contain", "cases", "of", "ovarian", "cancer", ",", "94", "%", "were", "estimated", "to", "be", "linked", "to", "BRCA1", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "contrast", ",", "there", "was", "no", "overall", "evidence", "of", "linkage", "in", "the", "group", "of", "10", "families", "with", "breast", "cancer", "without", "ovarian", "cancer", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]

[ "Mucopolysaccharidosis", "IVA", "(", "MPS", "IVA", ")", "is", "an", "autosomal", "recessive", "disorder", "caused", "by", "a", "deficiency", "in", "N", "-", "acetylgalactosamine", "-", "6", "-", "sulfatase", "(", "GALNS", ")", "." ]

[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "found", "two", "separate", "deletions", "of", "nearly", "8", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "0", "and", "6", "." ]

[ "O", "O", "O", "O" ]

[ "0", "kb", "in", "the", "GALNS", "gene", ",", "including", "some", "exons", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "There", "are", "Alu", "repetitive", "elements", "near", "the", "breakpoints", "of", "the", "8", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "0", "-", "kb", "deletion", ",", "and", "this", "deletion", "resulted", "from", "an", "Alu", "-", "Alu", "recombination", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "other", "6", "." ]

[ "O", "O", "O", "O" ]

[ "0", "-", "kb", "deletion", "involved", "illegitimate", "recombinational", "events", "between", "incomplete", "short", "direct", "repeats", "of", "8", "bp", "at", "deletion", "breakpoints", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "same", "rearrangement", "has", "been", "observed", "in", "a", "heteroallelic", "state", "in", "four", "unrelated", "patients", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "is", "the", "first", "documentation", "of", "a", "common", "double", "deletion", "a", "gene", "that", "is", "not", "a", "member", "of", "a", "gene", "cluster", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Detection", "of", "eight", "BRCA1", "mutations", "in", "10", "breast", "/", "ovarian", "cancer", "families", ",", "including", "1", "family", "with", "male", "breast", "cancer", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]

[ "Genetic", "epidemiological", "evidence", "suggests", "that", "mutations", "in", "BRCA1", "may", "be", "responsible", "for", "approximately", "one", "half", "of", "early", "onset", "familial", "breast", "cancer", "and", "the", "majority", "of", "familial", "breast", "/", "ovarian", "cancer", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]

[ "The", "recent", "cloning", "of", "BRCA1", "allows", "for", "the", "direct", "detection", "of", "mutations", ",", "but", "the", "feasibility", "of", "presymptomatic", "screening", "for", "cancer", "susceptibility", "is", "unknown", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "analyzed", "genomic", "DNA", "from", "one", "affected", "individual", "from", "each", "of", "24", "families", "with", "at", "least", "three", "cases", "of", "ovarian", "or", "breast", "cancer", ",", "using", "SSCP", "assays", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Variant", "SSCP", "bands", "were", "subcloned", "and", "sequenced", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Allele", "-", "specific", "oligonucleotide", "hybridization", "was", "used", "to", "verify", "sequence", "changes", "and", "to", "screen", "DNA", "from", "control", "individuals", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Six", "frameshift", "and", "two", "missense", "mutations", "were", "detected", "in", "10", "different", "families", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "A", "frameshift", "mutation", "was", "detected", "in", "a", "male", "proband", "affected", "with", "both", "breast", "and", "prostate", "cancer", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]

[ "A", "40", "-", "bp", "deletion", "was", "detected", "in", "a", "patient", "who", "developed", "intra", "-", "abdominal", "carcinomatosis", "1", "year", "after", "prophylactic", "oophorectomy", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Mutations", "were", "detected", "throughout", "the", "gene", ",", "and", "only", "one", "was", "detected", "in", "more", "than", "a", "single", "family", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "results", "provide", "further", "evidence", "that", "inherited", "breast", "and", "ovarian", "cancer", "can", "occur", "as", "a", "consequence", "of", "a", "wide", "array", "of", "BRCA1", "mutations", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "results", "suggests", "that", "development", "of", "a", "screening", "test", "for", "BRCA1", "mutations", "will", "be", "technically", "challenging", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "finding", "of", "a", "mutation", "in", "a", "family", "with", "male", "breast", "cancer", ",", "not", "previously", "thought", "to", "be", "related", "to", "BRCA1", ",", "also", "illustrates", "the", "potential", "difficulties", "of", "genetic", "counseling", "for", "individuals", "known", "to", "carry", "mutations", ".", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Natural", "selection", "of", "hemi", "-", "and", "heterozygotes", "for", "G6PD", "deficiency", "in", "Africa", "by", "resistance", "to", "severe", "malaria", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O" ]

[ "Glucose", "-", "6", "-", "phosphate", "dehydrogenase", "(", "G6PD", ")", "deficiency", ",", "the", "most", "common", "enzymopathy", "of", "humans", ",", "affects", "over", "400", "million", "people", "." ]

[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "geographical", "correlation", "of", "its", "distribution", "with", "the", "historical", "endemicity", "of", "malaria", "suggests", "that", "this", "disorder", "has", "risen", "in", "frequency", "through", "natural", "selection", "by", "malaria", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O" ]

[ "However", ",", "attempts", "to", "confirm", "that", "G6PD", "deficiency", "is", "protective", "in", "case", "-", "control", "studies", "of", "malaria", "have", "yielded", "conflicting", "results", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Hence", ",", "for", "this", "X", "-", "linked", "disorder", ",", "it", "is", "unclear", "whether", "both", "male", "hemizygotes", "and", "female", "heterozygotes", "are", "protected", "or", ",", "as", "frequently", "suggested", ",", "only", "females", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Furthermore", ",", "how", "much", "protection", "may", "be", "afforded", "is", "unknown", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Here", "we", "report", "that", ",", "in", "two", "large", "case", "-", "control", "studies", "of", "over", "2", ",", "000", "African", "children", ",", "the", "common", "African", "form", "of", "G6PD", "deficiency", "(", "G6PD", "A", "-", ")", "is", "associated", "with", "a", "46", "-", "58", "%", "reduction", "in", "risk", "of", "severe", "malaria", "for", "both", "female", "heterozygotes", "and", "male", "hemizygotes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "A", "mathematical", "model", "incorporating", "the", "measured", "selective", "advantage", "against", "malaria", "suggests", "that", "a", "counterbalancing", "selective", "disadvantage", ",", "associated", "with", "this", "enzyme", "deficiency", ",", "has", "retarded", "its", "rise", "in", "frequency", "in", "malaria", "-", "endemic", "regions", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Although", "G6PD", "deficiency", "is", "now", "regarded", "as", "a", "generally", "benign", "disorder", ",", "in", "earlier", "environmental", "conditions", "it", "could", "have", "been", "significantly", "disadvantageous", ".", "." ]

[ "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "alveolar", "rhabdomyosarcoma", "PAX3", "/", "FKHR", "fusion", "protein", "is", "a", "transcriptional", "activator", "." ]

[ "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Chimeric", "transcription", "factors", ",", "created", "by", "gene", "fusions", "as", "the", "result", "of", "chromosomal", "translocations", ",", "have", "been", "implicated", "in", "the", "pathogenesis", "of", "several", "pathologically", "disparate", "solid", "tumors", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]

[ "The", "PAX3", "/", "FKHR", "fusion", "gene", ",", "formed", "by", "a", "t", "(", "2", ";", "13", ")", "(", "q35", ";", "q14", ")", "in", "alveolar", "rhabdomyosarcoma", ",", "encodes", "a", "hybrid", "protein", "that", "contains", "both", "PAX3", "DNA", "binding", "domains", ",", "the", "paired", "box", "and", "homeodomain", ",", "linked", "to", "the", "bisected", "DNA", "binding", "domain", "of", "FKHR", ",", "a", "member", "of", "the", "forkhead", "family", "of", "transcription", "factors", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Here", "we", "report", "that", "PAX3", "and", "PAX3", "/", "FKHR", "display", "similar", ",", "but", "not", "identical", "transactivation", "activities", "when", "tested", "with", "model", "Pax", "recognition", "sequences", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "No", "functional", "role", "could", "be", "ascribed", "solely", "to", "the", "residual", "FKHR", "binding", "domain", "present", "in", "the", "fusion", "protein", ",", "but", "FKHR", "was", "found", "to", "contribute", "a", "strong", "carboxyl", "terminal", "activation", "domain", "replacing", "the", "one", "located", "in", "the", "unrearranged", "PAX3", "gene", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "show", "that", "the", "native", "PAX3", "/", "FKHR", "protein", "present", "in", "tumor", "cells", "with", "this", "translocation", "has", "transcriptional", "characteristics", "similar", "to", "the", "in", "vitro", "expressed", "protein", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "ability", "of", "the", "PAX3", "/", "FKHR", "hybrid", "protein", "to", "bind", "DNA", "in", "a", "sequence", "specific", "manner", "and", "to", "transactivate", "the", "expression", "of", "artificial", "reporter", "genes", "suggests", "that", "its", "aberrant", "expression", "could", "subvert", "the", "transcriptional", "programs", "that", "normally", "control", "the", "growth", ",", "differentiation", ",", "and", "survival", "of", "primitive", "myogenic", "precursors", "in", "vivo", ".", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "A", "p16INK4a", "-", "insensitive", "CDK4", "mutant", "targeted", "by", "cytolytic", "T", "lymphocytes", "in", "a", "human", "melanoma", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O" ]

[ "A", "mutated", "cyclin", "-", "dependent", "kinase", "4", "(", "CDK4", ")", "was", "identified", "as", "a", "tumor", "-", "specific", "antigen", "recognized", "by", "HLA", "-", "A2", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "1", "-", "restricted", "autologous", "cytolytic", "T", "lymphocytes", "(", "CTLs", ")", "in", "a", "human", "melanoma", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O" ]

[ "The", "mutated", "CDK4", "allele", "was", "present", "in", "autologous", "cultured", "melanoma", "cells", "and", "metastasis", "tissue", ",", "but", "not", "in", "the", "patients", "lymphocytes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "mutation", ",", "an", "arginine", "-", "to", "-", "cysteine", "exchange", "at", "residue", "24", ",", "was", "part", "of", "the", "CDK4", "peptide", "recognized", "by", "CTLs", "and", "prevented", "binding", "of", "the", "CDK4", "inhibitor", "p16INK4a", ",", "but", "not", "of", "p21", "or", "of", "p27KIP1", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "same", "mutation", "was", "found", "in", "one", "additional", "melanoma", "among", "28", "melanomas", "analyzed", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O" ]

[ "These", "results", "suggest", "that", "mutation", "of", "CDK4", "can", "create", "a", "tumor", "-", "specific", "antigen", "and", "can", "disrupt", "the", "cell", "-", "cycle", "regulation", "exerted", "by", "the", "tumor", "suppressor", "p16INK4a", ".", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Rapid", "detection", "of", "BRCA1", "mutations", "by", "the", "protein", "truncation", "test", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "More", "than", "75", "%", "of", "the", "reported", "mutations", "in", "the", "hereditary", "breast", "and", "ovarian", "cancer", "gene", ",", "BRCA1", ",", "result", "in", "truncated", "proteins", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "have", "used", "the", "protein", "truncation", "test", "(", "PTT", ")", "to", "screen", "for", "mutations", "in", "exon", "11", ",", "which", "encodes", "61", "%", "of", "BRCA1", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "45", "patients", "from", "breast", "and", "/", "or", "ovarian", "cancer", "families", "we", "found", "six", "novel", "mutations", "two", "single", "nucleotide", "insertions", ",", "three", "small", "deletions", "(", "1", "-", "5", "bp", ")", "and", "a", "nonsense", "mutation", "identified", "two", "unrelated", "families", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Furthermore", ",", "we", "were", "able", "to", "amplify", "the", "remaining", "coding", "region", "by", "RT", "-", "PCR", "using", "lymphocyte", "RNA", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Combined", "with", "PTT", ",", "we", "detected", "aberrantly", "spliced", "products", "affecting", "exons", "5", "and", "6", "in", "one", "of", "two", "BRCA1", "-", "linked", "families", "examined", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "protein", "truncation", "test", "promises", "to", "become", "a", "valuable", "technique", "in", "detecting", "BRCA1", "mutations", ".", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Cloning", "of", "human", "very", "-", "long", "-", "chain", "acyl", "-", "coenzyme", "A", "dehydrogenase", "and", "molecular", "characterization", "of", "its", "deficiency", "in", "two", "patients", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Two", "overlapping", "cDNA", "clones", "(", "1", ",", "991", "bp", "and", "736", "bp", ",", "respectively", ")", "encoding", "the", "precursor", "of", "human", "mitochondrial", "very", "-", "long", "-", "chain", "acyl", "-", "coenzyme", "A", "dehydrogenase", "(", "VLCAD", ")", "were", "cloned", "and", "sequenced", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "cDNA", "inserts", "of", "these", "clones", "together", "encompass", "a", "region", "of", "2", ",", "177", "bases", ",", "encoding", "the", "entire", "protein", "of", "655", "amino", "acids", ",", "including", "a", "40", "-", "amino", "acid", "leader", "peptide", "and", "a", "615", "-", "amino", "acid", "mature", "polypeptide", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "PCR", "-", "amplified", "VLCAD", "cDNAs", "were", "sequenced", "in", "cultured", "fibroblasts", "from", "two", "VLCAD", "-", "deficient", "patients", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O" ]

[ "In", "both", "patients", ",", "a", "105", "-", "bp", "deletion", "encompassing", "bases", "1078", "-", "1182", "in", "VLCAD", "cDNA", "was", "identified", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "deletion", "seems", "to", "occur", "due", "to", "exon", "skipping", "during", "processing", "of", "VLCAD", "pre", "-", "mRNA", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "is", "the", "first", "demonstration", "of", "a", "mutation", "causing", "VLCAD", "deficiency", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]

[ "Quantitative", "cDNA", "expression", "of", "normal", "human", "VLCAD", "was", "performed", "in", "the", "patients", "fibroblasts", ",", "using", "vaccinia", "viral", "system", ",", "which", "demonstrated", "that", "the", "deficiency", "of", "the", "normal", "VLCAD", "protein", "causes", "impaired", "long", "-", "chain", "fatty", "acid", "beta", "-", "oxidation", "activity", "in", "the", "patients", "fibroblasts", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "patient", "fibroblasts", ",", "raising", "VLCAD", "activity", "to", "approximately", "20", "%", "of", "normal", "control", "fibroblast", "activity", "raised", "palmitic", "acid", "beta", "-", "oxidation", "flux", "to", "the", "level", "found", "in", "control", "fibroblasts", ",", "which", "may", "offer", "important", "information", "for", "the", "rational", "design", "of", "future", "somatic", "gene", "therapy", "for", "VLCAD", "deficiency", ".", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O" ]

[ "Brain", "disease", "and", "molecular", "analysis", "in", "myotonic", "dystrophy", "." ]

[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]

[ "Abnormal", "amplification", "of", "a", "CTG", "repeat", "on", "chromosome", "19", "is", "the", "molecular", "basis", "of", "myotonic", "dystrophy", "(", "DM", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O" ]

[ "Expansion", "of", "the", "repeat", "has", "been", "correlated", "with", "severity", "of", "several", "clinical", "features", "of", "the", "disease", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "performed", "extensive", "cognitive", "testing", ",", "cerebral", "magnetic", "resonance", "imaging", "(", "MRI", ")", "and", "a", "molecular", "analysis", "in", "28", "cases", "of", "DM", "to", "determine", "the", "relationship", "between", "the", "molecular", "defect", "and", "brain", "disease", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]

[ "Performance", "in", "two", "or", "more", "cognitive", "tests", "was", "pathological", "in", "10", "cases", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Fourteen", "patients", "had", "subcortical", "white", "matter", "lesions", "on", "MRI", ",", "14", "had", "cerebral", "atrophy", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]

[ "Amplification", "of", "the", "CTG", "repeat", "showed", "a", "strong", "correlation", "with", "cognitive", "test", "deficits", "when", "exceeding", "a", "length", "of", "over", "1000", "trinucleotides", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "MRI", "lesions", "were", "associated", "with", "impaired", "psychometric", "performance", ",", "but", "MRI", "and", "molecular", "findings", "were", "only", "weakly", "related", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Disease", "duration", "influenced", "the", "appearance", "and", "amount", "of", "white", "matter", "lesions", "on", "MRI", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O" ]

[ "Quantification", "of", "CTG", "repeat", "size", "may", "allow", "an", "early", "estimate", "on", "the", "probability", "of", "brain", "involvement", "in", "DM", ";", "cognitive", "dysfunction", "is", "associated", "with", "white", "matter", "lesions", "and", "cerebral", "atrophy", "later", "on", "in", "the", "course", ".", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Mutations", "in", "the", "gene", "for", "X", "-", "linked", "adrenoleukodystrophy", "in", "patients", "with", "different", "clinical", "phenotypes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Recently", ",", "the", "gene", "for", "the", "most", "common", "peroxisomal", "disorder", ",", "X", "-", "linked", "adrenoleukodystrophy", "(", "X", "-", "ALD", ")", ",", "has", "been", "described", "encoding", "a", "peroxisomal", "membrane", "transporter", "protein", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "analyzed", "the", "entire", "protein", "-", "coding", "sequence", "of", "this", "gene", "by", "reverse", "-", "transcription", "PCR", ",", "SSCP", ",", "and", "DNA", "sequencing", "in", "five", "patients", "with", "different", "clinical", "expression", "of", "X", "-", "ALD", "and", "in", "their", "female", "relatives", ";", "these", "clinical", "expressions", "were", "cerebral", "childhood", "ALD", ",", "adrenomyeloneuropathy", "(", "AMN", ")", ",", "and", "\"", "Addison", "disease", "only", "\"", "(", "ADO", ")", "phenotype", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O" ]

[ "In", "the", "three", "patients", "exhibiting", "the", "classical", "picture", "of", "severe", "childhood", "ALD", "we", "identified", "in", "the", "5", "portion", "of", "the", "X", "-", "ALD", "gene", "a", "38", "-", "bp", "deletion", "that", "causes", "a", "frameshift", "mutation", ",", "a", "3", "-", "bp", "deletion", "leading", "to", "a", "deletion", "of", "an", "amino", "acid", "in", "the", "ATP", "-", "binding", "domain", "of", "the", "ALD", "protein", ",", "and", "a", "missense", "mutation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "the", "patient", "with", "the", "clinical", "phenotype", "of", "AMN", ",", "a", "nonsense", "mutation", "in", "codon", "212", ",", "along", "with", "a", "second", "site", "mutation", "at", "codon", "178", ",", "was", "observed", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Analysis", "of", "the", "patient", "with", "the", "ADO", "phenotype", "revealed", "a", "further", "missense", "mutation", "at", "a", "highly", "conserved", "position", "in", "the", "ALDP", "/", "PMP70", "comparison", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "disruptive", "nature", "of", "two", "mutations", "(", "i", ".", "e", ".", ",", "the", "frameshift", "and", "the", "nonsense", "mutation", ")", "in", "patients", "with", "biochemically", "proved", "childhood", "ALD", "and", "AMN", "further", "strongly", "supports", "the", "hypothesis", "that", "alterations", "in", "this", "gene", "play", "a", "crucial", "role", "in", "the", "pathogenesis", "of", "X", "-", "ALD", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]

[ "Since", "the", "current", "biochemical", "techniques", "for", "X", "-", "ALD", "carrier", "detection", "in", "affected", "families", "lack", "sufficient", "reliability", ",", "our", "procedure", "described", "for", "systematic", "mutation", "scanning", "is", "also", "capable", "of", "improving", "genetic", "counseling", "and", "prenatal", "diagnosis" ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Duchenne", "muscular", "dystrophy", "and", "myotonic", "dystrophy", "in", "the", "same", "patient", "." ]

[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "report", "on", "the", "first", "patient", "identified", "with", "myotonic", "dystrophy", "and", "Duchenne", "muscular", "dystrophy", "(", "DMD", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "O", "O" ]

[ "The", "family", "of", "the", "propositus", "had", "a", "strong", "history", "of", "myotonic", "dystrophy", ",", "and", "there", "was", "an", "intrafamilial", "pathological", "expansion", "of", "the", "responsible", "CTG", "repeat", "between", "the", "mildly", "affected", "mother", "(", "160", "repeats", ";", "normal", "27", "repeats", ")", "and", "her", "more", "severely", "affected", "son", "(", "650", "repeats", ")", ",", "and", "his", "sister", "(", "650", "repeats", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "propositus", "was", "an", "isolated", "case", "of", "Duchenne", "muscular", "dystrophy", "with", "marked", "dystrophin", "deficiency", "in", "muscle", "biopsy", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "patient", "was", "still", "ambulatory", "post", "age", "16", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Myotonic", "dystrophy", "could", "interfere", "to", "some", "extent", "with", "the", "progression", "of", "Duchenne", "dystrophy", "." ]

[ "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]

[ "However", ",", "other", "interpretations", "are", "possible", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Twelve", "percent", "of", "dystrophin", "revertant", "fibers", "as", "observed", "by", "immunohistochemistry", "could", "be", "sufficient", "to", "ameliorate", "typical", "DMD", "clinical", "severity", ",", "or", "the", "patient", "may", "present", "a", "somatic", "mosaic", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "pathophysiological", "interactions", "of", "these", "two", "unlinked", "disorders", "are", "discussed", "at", "the", "clinical", "and", "histopathological", "levels", ".", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Age", "at", "diagnosis", "as", "an", "indicator", "of", "eligibility", "for", "BRCA1", "DNA", "testing", "in", "familial", "breast", "cancer", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]

[ "We", "searched", "for", "criteria", "that", "could", "indicate", "breast", "cancer", "families", "with", "a", "high", "prior", "probability", "of", "being", "caused", "by", "the", "breast", "/", "ovarian", "cancer", "susceptibility", "locus", "BRCA1", "on", "chromosome", "17", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "To", "this", "end", ",", "we", "performed", "a", "linkage", "study", "with", "59", "consecutively", "collected", "Dutch", "breast", "cancer", "families", ",", "including", "16", "with", "at", "least", "one", "case", "of", "ovarian", "cancer", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]

[ "We", "used", "an", "intake", "cut", "-", "off", "of", "at", "least", "three", "first", "-", "degree", "relatives", "with", "breast", "and", "/", "or", "ovarian", "cancer", "at", "any", "age", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Significant", "evidence", "for", "linkage", "was", "found", "only", "among", "the", "13", "breast", "cancer", "families", "with", "a", "mean", "age", "at", "diagnosis", "of", "less", "than", "45", "years", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "An", "unexpectedly", "low", "proportion", "of", "the", "breast", "-", "ovarian", "cancer", "families", "were", "estimated", "to", "be", "linked", "to", "BRCA1", ",", "which", "could", "be", "due", "to", "a", "founder", "effect", "in", "the", "Dutch", "population", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Given", "the", "expected", "logistical", "problems", "in", "clinical", "management", "now", "that", "BRCA1", "has", "been", "identified", ",", "we", "propose", "an", "interim", "period", "in", "which", "only", "families", "with", "a", "strong", "positive", "family", "history", "for", "early", "onset", "breast", "and", "/", "or", "ovarian", "cancer", "will", "be", "offered", "BRCA1", "mutation", "testing", ".", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Linkage", "analysis", "of", "26", "Canadian", "breast", "and", "breast", "-", "ovarian", "cancer", "families", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O" ]

[ "We", "have", "examined", "26", "Canadian", "families", "with", "hereditary", "breast", "or", "ovarian", "cancer", "for", "linkage", "to", "markers", "flanking", "the", "BRCA1", "gene", "on", "chromosome", "17q12", "-", "q21", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Of", "the", "15", "families", "that", "contain", "cases", "of", "ovarian", "cancer", ",", "94", "%", "were", "estimated", "to", "be", "linked", "to", "BRCA1", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "contrast", ",", "there", "was", "no", "overall", "evidence", "of", "linkage", "in", "the", "group", "of", "10", "families", "with", "breast", "cancer", "without", "ovarian", "cancer", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O", "B-DISEASE", "I-DISEASE", "O" ]