tokens
listlengths 2
123
| ner_tags
listlengths 2
123
|
---|---|
[
"A",
"genetic",
"recombinant",
"in",
"a",
"breast",
"-",
"ovarian",
"cancer",
"family",
"indicates",
"a",
"placement",
"of",
"BRCA1",
"telomeric",
"to",
"D17S776",
",",
"and",
"helps",
"to",
"define",
"the",
"region",
"of",
"assignment",
"of",
"the",
"cancer",
"susceptibility",
"gene",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Other",
"cancers",
"of",
"interest",
"that",
"appeared",
"in",
"the",
"BRCA1",
"-",
"linked",
"families",
"included",
"primary",
"peritoneal",
"cancer",
",",
"cancer",
"of",
"the",
"fallopian",
"tube",
",",
"and",
"malignant",
"melanoma",
".",
"."
] |
[
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O"
] |
[
"Structural",
"analysis",
"of",
"the",
"5",
"'",
"region",
"of",
"mouse",
"and",
"human",
"Huntington",
"disease",
"genes",
"reveals",
"conservation",
"of",
"putative",
"promoter",
"region",
"and",
"di",
"-",
"and",
"trinucleotide",
"polymorphisms",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"have",
"previously",
"cloned",
"and",
"characterized",
"the",
"murine",
"homologue",
"of",
"the",
"Huntington",
"disease",
"(",
"HD",
")",
"gene",
"and",
"shown",
"that",
"it",
"maps",
"to",
"mouse",
"chromosome",
"5",
"within",
"a",
"region",
"of",
"conserved",
"synteny",
"with",
"human",
"chromosome",
"4p16",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"3",
"3",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Here",
"we",
"present",
"a",
"detailed",
"comparison",
"of",
"the",
"sequence",
"of",
"the",
"putative",
"promoter",
"and",
"the",
"organization",
"of",
"the",
"5",
"genomic",
"region",
"of",
"the",
"murine",
"(",
"Hdh",
")",
"and",
"human",
"HD",
"genes",
"encompassing",
"the",
"first",
"five",
"exons",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"show",
"that",
"in",
"this",
"region",
"these",
"two",
"genes",
"share",
"identical",
"exon",
"boundaries",
",",
"but",
"have",
"different",
"-",
"size",
"introns",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Two",
"dinucleotide",
"(",
"CT",
")",
"and",
"one",
"trinucleotide",
"intronic",
"polymorphism",
"in",
"Hdh",
"and",
"an",
"intronic",
"CA",
"polymorphism",
"in",
"the",
"HD",
"gene",
"were",
"identified",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Comparison",
"of",
"940",
"-",
"bp",
"sequence",
"5",
"to",
"the",
"putative",
"translation",
"start",
"site",
"reveals",
"a",
"highly",
"conserved",
"region",
"(",
"78",
".",
"8",
"%",
"nucleotide",
"identity",
")",
"between",
"Hdh",
"and",
"the",
"HD",
"gene",
"from",
"nucleotide",
"-",
"56",
"to",
"-",
"206",
"(",
"of",
"Hdh",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Neither",
"Hdh",
"nor",
"the",
"HD",
"gene",
"have",
"typical",
"TATA",
"or",
"CCAAT",
"elements",
",",
"but",
"both",
"show",
"one",
"putative",
"AP2",
"binding",
"site",
"and",
"numerous",
"potential",
"Sp1",
"binding",
"sites",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"high",
"sequence",
"identity",
"between",
"Hdh",
"and",
"the",
"HD",
"gene",
"for",
"approximately",
"200",
"bp",
"5",
"to",
"the",
"putative",
"translation",
"start",
"site",
"indicates",
"that",
"these",
"sequences",
"may",
"play",
"a",
"role",
"in",
"regulating",
"expression",
"of",
"the",
"Huntington",
"disease",
"gene"
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O"
] |
[
"The",
"protein",
"deficient",
"in",
"Lowe",
"syndrome",
"is",
"a",
"phosphatidylinositol",
"-",
"4",
",",
"5",
"-",
"bisphosphate",
"5",
"-",
"phosphatase",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Lowe",
"syndrome",
",",
"also",
"known",
"as",
"oculocerebrorenal",
"syndrome",
",",
"is",
"caused",
"by",
"mutations",
"in",
"the",
"X",
"chromosome",
"-",
"encoded",
"OCRL",
"gene",
"."
] |
[
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"OCRL",
"protein",
"is",
"51",
"%",
"identical",
"to",
"inositol",
"polyphosphate",
"5",
"-",
"phosphatase",
"II",
"(",
"5",
"-",
"phosphatase",
"II",
")",
"from",
"human",
"platelets",
"over",
"a",
"span",
"of",
"744",
"aa",
",",
"suggesting",
"that",
"OCRL",
"may",
"be",
"a",
"similar",
"enzyme",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"engineered",
"a",
"construct",
"of",
"the",
"OCRL",
"cDNA",
"that",
"encodes",
"amino",
"acids",
"homologous",
"to",
"the",
"platelet",
"5",
"-",
"phosphatase",
"for",
"expression",
"in",
"baculovirus",
"-",
"infected",
"Sf9",
"insect",
"cells",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"This",
"cDNA",
"encodes",
"aa",
"264",
"-",
"968",
"of",
"the",
"OCRL",
"protein",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"recombinant",
"protein",
"was",
"found",
"to",
"catalyze",
"the",
"reactions",
"also",
"carried",
"out",
"by",
"platelet",
"5",
"-",
"phosphatase",
"II",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Thus",
"OCRL",
"converts",
"inositol",
"1",
",",
"4",
",",
"5",
"-",
"trisphosphate",
"to",
"inositol",
"1",
",",
"4",
"-",
"bisphosphate",
",",
"and",
"it",
"converts",
"inositol",
"1",
",",
"3",
",",
"4",
",",
"5",
"-",
"tetrakisphosphate",
"to",
"inositol",
"1",
",",
"3",
",",
"4",
"-",
"trisphosphate",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Most",
"important",
",",
"the",
"enzyme",
"converts",
"phosphatidylinositol",
"4",
",",
"5",
"-",
"bisphosphate",
"to",
"phosphatidylinositol",
"4",
"-",
"phosphate",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"relative",
"ability",
"of",
"OCRL",
"to",
"catalyze",
"the",
"three",
"reactions",
"is",
"different",
"from",
"that",
"of",
"5",
"-",
"phosphatase",
"II",
"and",
"from",
"that",
"of",
"another",
"5",
"-",
"phosphatase",
"isoenzyme",
"from",
"platelets",
",",
"5",
"-",
"phosphatase",
"I",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"recombinant",
"OCRL",
"protein",
"hydrolyzes",
"the",
"phospholipid",
"substrate",
"10",
"-",
"to",
"30",
"-",
"fold",
"better",
"than",
"5",
"-",
"phosphatase",
"II",
",",
"and",
"5",
"-",
"phosphatase",
"I",
"does",
"not",
"cleave",
"the",
"lipid",
"at",
"all",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"also",
"show",
"that",
"OCRL",
"functions",
"as",
"a",
"phosphatidylinositol",
"4",
",",
"5",
"-",
"bisphosphate",
"5",
"-",
"phosphatase",
"in",
"OCRL",
"-",
"expressing",
"Sf9",
"cells",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"These",
"results",
"suggest",
"that",
"OCRL",
"is",
"mainly",
"a",
"lipid",
"phosphatase",
"that",
"may",
"control",
"cellular",
"levels",
"of",
"a",
"critical",
"metabolite",
",",
"phosphatidylinositol",
"4",
",",
"5",
"-",
"bisphosphate",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Deficiency",
"of",
"this",
"enzyme",
"apparently",
"causes",
"the",
"protean",
"manifestations",
"of",
"Lowe",
"syndrome",
".",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O"
] |
[
"New",
"founder",
"haplotypes",
"at",
"the",
"myotonic",
"dystrophy",
"locus",
"in",
"southern",
"Africa",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"association",
"between",
"normal",
"alleles",
"at",
"the",
"CTG",
"repeat",
"and",
"two",
"nearby",
"polymorphisms",
"in",
"the",
"myotonin",
"protein",
"kinase",
"gene",
",",
"the",
"Alu",
"insertion",
"/",
"deletion",
"polymorphism",
"and",
"the",
"myotonic",
"dystrophy",
"kinase",
"(",
"DMK",
")",
"(",
"G",
"/",
"T",
")",
"intron",
"9",
"/",
"HinfI",
"polymorphism",
",",
"has",
"been",
"analyzed",
"in",
"South",
"African",
"Negroids",
",",
"a",
"population",
"in",
"which",
"myotonic",
"dystrophy",
"(",
"DM",
")",
"has",
"not",
"been",
"described",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"South",
"African",
"Negroids",
"have",
"a",
"CTG",
"allelic",
"distribution",
"that",
"is",
"significantly",
"different",
"from",
"that",
"in",
"Caucasoids",
"and",
"Japanese",
"the",
"CTG",
"repeat",
"lengths",
"of",
">",
"or",
"=",
"19",
"are",
"very",
"rare",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"striking",
"linkage",
"disequilibrium",
"between",
"specific",
"alleles",
"at",
"the",
"Alu",
"polymorphism",
"(",
"Alu",
"(",
"ins",
")",
"and",
"Alu",
"(",
"del",
")",
")",
",",
"the",
"HinfI",
"polymorphism",
"(",
"HinfI",
"-",
"1",
"and",
"HinfI",
"-",
"2",
")",
",",
"and",
"the",
"CTG",
"repeat",
"polymorphism",
"seen",
"in",
"Caucasoid",
"(",
"Europeans",
"and",
"Canadians",
")",
"populations",
"was",
"also",
"found",
"in",
"the",
"South",
"African",
"Negroid",
"population",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Numerous",
"haplotypes",
",",
"not",
"previously",
"described",
"in",
"Europeans",
",",
"were",
",",
"however",
",",
"found",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"It",
"thus",
"seems",
"likely",
"that",
"only",
"a",
"small",
"number",
"of",
"these",
"\"",
"African",
"\"",
"chromosomes",
"were",
"present",
"in",
"the",
"progenitors",
"of",
"all",
"non",
"-",
"African",
"peoples",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"These",
"data",
"provide",
"support",
"for",
"the",
"\"",
"out",
"of",
"Africa",
"\"",
"model",
"for",
"the",
"origin",
"of",
"modern",
"humans",
"and",
"suggest",
"that",
"the",
"rare",
"ancestral",
"DM",
"mutation",
"event",
"may",
"have",
"occurred",
"after",
"the",
"migration",
"from",
"Africa",
",",
"hence",
"the",
"absence",
"of",
"DM",
"in",
"sub",
"-",
"Saharan",
"Negroid",
"peoples",
".",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Discordant",
"clinical",
"outcome",
"in",
"myotonic",
"dystrophy",
"relatives",
"showing",
"(",
"CTG",
")",
"n",
">",
"700",
"repeats",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"A",
"myotonic",
"dystrophy",
"(",
"DM",
")",
"family",
"is",
"described",
"in",
"which",
"discordant",
"DM",
"phenotypes",
"were",
"found",
"in",
"the",
"children",
"of",
"two",
"affected",
"sisters",
"with",
"similar",
"CTG",
"expansion",
"and",
"clinical",
"manifestations",
"."
] |
[
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"this",
"family",
",",
"congenital",
"as",
"well",
"as",
"early",
"severe",
"childhood",
"and",
"later",
"childhood",
"onset",
"DM",
"coexist",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O"
] |
[
"This",
"observation",
"strengthens",
"the",
"limited",
"ability",
"of",
"lymphocytes",
"CTG",
"repeat",
"number",
"analysis",
"in",
"predicting",
"genotype",
"-",
"phenotype",
"correlations",
"in",
"DM",
"patients",
".",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Purification",
"of",
"human",
"very",
"-",
"long",
"-",
"chain",
"acyl",
"-",
"coenzyme",
"A",
"dehydrogenase",
"and",
"characterization",
"of",
"its",
"deficiency",
"in",
"seven",
"patients",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Mitochondrial",
"very",
"-",
"long",
"-",
"chain",
"acyl",
"-",
"coenzyme",
"A",
"dehydrogenase",
"(",
"VLCAD",
")",
"was",
"purified",
"from",
"human",
"liver",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"molecular",
"masses",
"of",
"the",
"native",
"enzyme",
"and",
"the",
"subunit",
"were",
"estimated",
"to",
"be",
"154",
"and",
"70",
"kD",
",",
"respectively",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"enzyme",
"was",
"found",
"to",
"catalyze",
"the",
"major",
"part",
"of",
"mitochondrial",
"palmitoylcoenzyme",
"A",
"dehydrogenation",
"in",
"liver",
",",
"heart",
",",
"skeletal",
"muscle",
",",
"and",
"skin",
"fibroblasts",
"(",
"89",
"-",
"97",
",",
"86",
"-",
"99",
",",
"96",
"-",
"99",
",",
"and",
"78",
"-",
"87",
"%",
",",
"respectively",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Skin",
"fibroblasts",
"from",
"26",
"patients",
"suspected",
"of",
"having",
"a",
"disorder",
"of",
"mitochondrial",
"beta",
"-",
"oxidation",
"were",
"analyzed",
"for",
"VLCAD",
"protein",
"using",
"immunoblotting",
",",
"and",
"7",
"of",
"them",
"contained",
"undetectable",
"or",
"trace",
"levels",
"of",
"the",
"enzyme",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"seven",
"deficient",
"fibroblast",
"lines",
"were",
"characterized",
"by",
"measuring",
"acyl",
"-",
"coenzyme",
"A",
"dehydrogenation",
"activities",
",",
"overall",
"palmitic",
"acid",
"oxidation",
",",
"and",
"VLCAD",
"protein",
"synthesis",
"using",
"pulse",
"-",
"chase",
",",
"further",
"confirming",
"the",
"diagnosis",
"of",
"VLCAD",
"deficiency",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O"
] |
[
"These",
"results",
"suggested",
"the",
"heterogenous",
"nature",
"of",
"the",
"mutations",
"causing",
"the",
"deficiency",
"in",
"the",
"seven",
"patients",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Clinically",
",",
"all",
"patients",
"with",
"VLCAD",
"deficiency",
"exhibited",
"cardiac",
"disease",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O"
] |
[
"At",
"least",
"four",
"of",
"them",
"presented",
"with",
"hypertrophic",
"cardiomyopathy",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O"
] |
[
"This",
"frequency",
"(",
">",
"57",
"%",
")",
"was",
"much",
"higher",
"than",
"that",
"observed",
"in",
"patients",
"with",
"other",
"disorders",
"of",
"mitochondrial",
"long",
"-",
"chain",
"fatty",
"acid",
"oxidation",
"that",
"may",
"be",
"accompanied",
"by",
"cardiac",
"disease",
"in",
"infants",
".",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Hereditary",
"deficiency",
"of",
"the",
"fifth",
"component",
"of",
"complement",
"in",
"man",
"."
] |
[
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"II",
"."
] |
[
"O",
"O"
] |
[
"Biological",
"properties",
"of",
"C5",
"-",
"deficient",
"human",
"serum",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"first",
"known",
"human",
"kindred",
"with",
"hereditary",
"deficiency",
"of",
"the",
"fifth",
"component",
"of",
"complement",
"(",
"C5",
")",
"was",
"documented",
"in",
"the",
"accompanying",
"report",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"This",
"study",
"examines",
"several",
"biological",
"properties",
"of",
"C5",
"-",
"deficient",
"(",
"C5D",
")",
"human",
"serum",
",",
"particularly",
"sera",
"obtained",
"from",
"two",
"C5D",
"homozygotes",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"proband",
",",
"who",
"has",
"inactive",
"systemic",
"lupus",
"erythematosus",
"is",
"completely",
"lacking",
"C5",
",",
"while",
"her",
"healthy",
"half",
"-",
"sister",
"has",
"1",
"-",
"2",
"%",
"of",
"normal",
"levels",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Both",
"sera",
"were",
"severely",
"impaired",
"in",
"their",
"ability",
"to",
"generate",
"chemotactic",
"activity",
"for",
"normal",
"human",
"neutrophils",
"upon",
"incubation",
"with",
"aggregated",
"human",
"gamma",
"-",
"globulin",
"or",
"Escherichia",
"coli",
"endotoxin",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"This",
"function",
"was",
"fully",
"restored",
"in",
"the",
"siblings",
"serum",
",",
"and",
"substantially",
"improved",
"in",
"the",
"probands",
"serum",
",",
"by",
"addition",
"of",
"highly",
"purified",
"human",
"C5",
"to",
"normal",
"serum",
"concentrations",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Sera",
"from",
"eight",
"family",
"members",
"who",
"were",
"apparently",
"heterozygous",
"for",
"C5",
"deficiency",
"gave",
"normal",
"chemotactic",
"scores",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"ability",
"of",
"C5D",
"serum",
"to",
"opsonize",
"Saccharomyces",
"cerevisiae",
"(",
"bakers",
"yeast",
")",
"or",
"Candida",
"albicans",
"for",
"ingestion",
"by",
"normal",
"neutrophils",
"was",
"completely",
"normal",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"addition",
",",
"C5D",
"serum",
"was",
"capable",
"of",
"promoting",
"normal",
"phagocytosis",
"and",
"intracellular",
"killing",
"of",
"Staphylococcus",
"aureus",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"probands",
"serum",
"was",
"incapable",
"of",
"mediating",
"lysis",
"of",
"erythrocytes",
"from",
"a",
"patient",
"with",
"paroxysmal",
"nocturnal",
"hemoglobinuria",
"in",
"both",
"the",
"sucrose",
"hemolysia",
"and",
"acid",
"hemolysis",
"tests",
",",
"and",
"also",
"lacked",
"bactericidal",
"activity",
"against",
"sensitized",
"or",
"unsensitized",
"Salmonella",
"typhi",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"siblings",
"serum",
",",
"containing",
"only",
"1",
"-",
"2",
"%",
"of",
"normal",
"C5",
",",
"effectively",
"lysed",
"S",
".",
"typhi",
",",
"but",
"only",
"at",
"eightfold",
"lower",
"serum",
"dilutions",
"as",
"compared",
"to",
"normals",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"These",
"findings",
"underscore",
"the",
"critical",
"role",
"of",
"C5",
"in",
"the",
"generation",
"of",
"chemotactic",
"activity",
"and",
"in",
"cytolytic",
"reactions",
",",
"as",
"opposed",
"to",
"a",
"nonobligatory",
"or",
"minimal",
"role",
"in",
"opsonization",
",",
"at",
"least",
"for",
"the",
"organisms",
"under",
"study",
".",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Human",
"peroxisomal",
"targeting",
"signal",
"-",
"1",
"receptor",
"restores",
"peroxisomal",
"protein",
"import",
"in",
"cells",
"from",
"patients",
"with",
"fatal",
"peroxisomal",
"disorders",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O"
] |
[
"Two",
"peroxisomal",
"targeting",
"signals",
",",
"PTS1",
"and",
"PTS2",
",",
"are",
"involved",
"in",
"the",
"import",
"of",
"proteins",
"into",
"the",
"peroxisome",
"matrix",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Human",
"patients",
"with",
"fatal",
"generalized",
"peroxisomal",
"deficiency",
"disorders",
"fall",
"into",
"at",
"least",
"nine",
"genetic",
"complementation",
"groups",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Cells",
"from",
"many",
"of",
"these",
"patients",
"are",
"deficient",
"in",
"the",
"import",
"of",
"PTS1",
"-",
"containing",
"proteins",
",",
"but",
"the",
"causes",
"of",
"the",
"protein",
"-",
"import",
"defect",
"in",
"these",
"patients",
"are",
"unknown",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"have",
"cloned",
"and",
"sequenced",
"the",
"human",
"cDNA",
"homologue",
"(",
"PTS1R",
")",
"of",
"the",
"Pichia",
"pastoris",
"PAS8",
"gene",
",",
"the",
"PTS1",
"receptor",
"(",
"McCollum",
",",
"D",
".",
",",
"E",
".",
"Monosov",
",",
"and",
"S",
".",
"Subramani",
".",
"1993",
".",
"J",
".",
"Cell",
"Biol",
".",
"121",
"761",
"-",
"774",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"PTS1R",
"mRNA",
"is",
"expressed",
"in",
"all",
"human",
"tissues",
"examined",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Antibodies",
"to",
"the",
"human",
"PTS1R",
"recognize",
"this",
"protein",
"in",
"human",
",",
"monkey",
",",
"rat",
",",
"and",
"hamster",
"cells",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"protein",
"is",
"localized",
"mainly",
"in",
"the",
"cytosol",
"but",
"is",
"also",
"found",
"to",
"be",
"associated",
"with",
"peroxisomes",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Part",
"of",
"the",
"peroxisomal",
"PTS1R",
"protein",
"is",
"tightly",
"bound",
"to",
"the",
"peroxisomal",
"membrane",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Antibodies",
"to",
"PTS1R",
"inhibit",
"peroxisomal",
"protein",
"-",
"import",
"of",
"PTS1",
"-",
"containing",
"proteins",
"in",
"a",
"permeabilized",
"CHO",
"cell",
"system",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"vitro",
"-",
"translated",
"PTS1R",
"protein",
"specifically",
"binds",
"a",
"serine",
"-",
"lysine",
"-",
"leucine",
"-",
"peptide",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"A",
"PAS8",
"-",
"PTS1R",
"fusion",
"protein",
"complements",
"the",
"P",
".",
"pastoris",
"pas8",
"mutant",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"PTS1R",
"cDNA",
"also",
"complements",
"the",
"PTS1",
"protein",
"-",
"import",
"defect",
"in",
"skin",
"fibroblasts",
"from",
"patients",
"-",
"-",
"belonging",
"to",
"complementation",
"group",
"two",
"-",
"-",
"diagnosed",
"as",
"having",
"neonatal",
"adrenoleukodystrophy",
"or",
"Zellweger",
"syndrome",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O"
] |
[
"The",
"PTS1R",
"gene",
"has",
"been",
"localized",
"to",
"a",
"chromosomal",
"location",
"where",
"no",
"other",
"peroxisomal",
"disorder",
"genes",
"are",
"known",
"to",
"map",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Our",
"findings",
"represent",
"the",
"only",
"case",
"in",
"which",
"the",
"molecular",
"basis",
"of",
"the",
"protein",
"-",
"import",
"deficiency",
"in",
"human",
"peroxisomal",
"disorders",
"is",
"understood",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Spectrum",
"of",
"germline",
"mutations",
"in",
"the",
"RB1",
"gene",
":",
"a",
"study",
"of",
"232",
"patients",
"with",
"hereditary",
"and",
"non",
"hereditary",
"retinoblastoma",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O"
] |
[
"Germline",
"mutations",
"in",
"the",
"RB1",
"gene",
"confer",
"hereditary",
"predisposition",
"to",
"retinoblastoma",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O"
] |
[
"We",
"have",
"performed",
"a",
"mutation",
"survey",
"of",
"the",
"RB1",
"gene",
"in",
"232",
"patients",
"with",
"hereditary",
"or",
"non",
"hereditary",
"retinoblastoma",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O"
] |
[
"We",
"systematically",
"explored",
"all",
"27",
"exons",
"and",
"flanking",
"sequences",
"as",
"well",
"as",
"the",
"promotor",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"All",
"types",
"of",
"point",
"mutations",
"are",
"represented",
"and",
"are",
"found",
"unequally",
"distributed",
"along",
"the",
"RB1",
"gene",
"sequence",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"the",
"population",
"we",
"studied",
",",
"exons",
"3",
",",
"8",
",",
"18",
"and",
"19",
"are",
"preferentially",
"altered",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"range",
"of",
"frequency",
"of",
"detection",
"of",
"germline",
"mutations",
"is",
"about",
"20",
"%",
",",
"indicating",
"that",
"other",
"mechanisms",
"of",
"inactivation",
"of",
"RB1",
"should",
"be",
"involved",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"spectrum",
"of",
"mutations",
"presented",
"here",
"should",
"help",
"to",
"improve",
"the",
"clinical",
"management",
"of",
"retinoblastoma",
"and",
"to",
"understand",
"the",
"molecular",
"mechanisms",
"leading",
"to",
"tumorigenesis",
".",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Aniridia",
"-",
"associated",
"cytogenetic",
"rearrangements",
"suggest",
"that",
"a",
"position",
"effect",
"may",
"cause",
"the",
"mutant",
"phenotype",
"."
] |
[
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Current",
"evidence",
"suggests",
"that",
"aniridia",
"(",
"absence",
"of",
"iris",
")",
"is",
"caused",
"by",
"loss",
"of",
"function",
"of",
"one",
"copy",
"of",
"the",
"PAX6",
"gene",
",",
"which",
"maps",
"to",
"11p13",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"present",
"the",
"further",
"characterisation",
"of",
"two",
"aniridia",
"pedigrees",
"in",
"which",
"the",
"disease",
"segregates",
"with",
"chromosomal",
"rearrangements",
"which",
"involve",
"11p13",
"but",
"do",
"not",
"disrupt",
"the",
"PAX6",
"gene",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"have",
"isolated",
"three",
"human",
"YAC",
"clones",
"which",
"encompass",
"the",
"PAX6",
"locus",
"and",
"we",
"have",
"used",
"these",
"to",
"show",
"that",
"in",
"both",
"cases",
"the",
"chromosomal",
"breakpoint",
"is",
"at",
"least",
"85",
"kb",
"distal",
"of",
"the",
"3",
"end",
"of",
"PAX6",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"addition",
",",
"the",
"open",
"reading",
"frame",
"of",
"PAX6",
"is",
"apparently",
"free",
"of",
"mutations",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"propose",
"that",
"the",
"PAX6",
"gene",
"on",
"the",
"rearranged",
"chromosome",
"11",
"is",
"in",
"an",
"inappropriate",
"chromatin",
"environment",
"for",
"normal",
"expression",
"and",
"therefore",
"that",
"a",
"position",
"effect",
"is",
"the",
"underlying",
"mechanism",
"of",
"disease",
"in",
"these",
"families",
".",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Somatic",
"mutations",
"in",
"the",
"BRCA1",
"gene",
"in",
"sporadic",
"ovarian",
"tumours",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O"
] |
[
"The",
"BRCA1",
"gene",
"on",
"chromosome",
"17q21",
"is",
"responsible",
"for",
"an",
"autosomal",
"dominant",
"syndrome",
"of",
"increased",
"susceptibility",
"to",
"breast",
"and",
"ovarian",
"cancer",
"but",
"no",
"somatic",
"mutations",
"in",
"tumours",
"have",
"yet",
"been",
"described",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"To",
"study",
"the",
"potential",
"role",
"of",
"BRCA1",
"in",
"sporadic",
"carcinogenesis",
",",
"we",
"analysed",
"the",
"genomic",
"DNA",
"of",
"tumour",
"and",
"normal",
"fractions",
"of",
"47",
"ovarian",
"cancers",
"for",
"mutations",
"in",
"BRCA1",
"using",
"the",
"single",
"-",
"strand",
"conformation",
"polymorphism",
"technique",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"now",
"describe",
"somatic",
"mutations",
"in",
"the",
"DNA",
"of",
"four",
"tumours",
"which",
"also",
"had",
"loss",
"of",
"heterozygosity",
"(",
"LOH",
")",
"at",
"a",
"BRCA1",
"intragenic",
"marker",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Our",
"data",
"support",
"a",
"tumour",
"suppressor",
"mechanism",
"for",
"BRCA1",
";",
"somatic",
"mutations",
"and",
"LOH",
"may",
"result",
"in",
"inactivation",
"of",
"BRCA1",
"in",
"at",
"least",
"a",
"small",
"number",
"of",
"ovarian",
"cancers",
".",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O"
] |
[
"Decreased",
"expression",
"of",
"BRCA1",
"accelerates",
"growth",
"and",
"is",
"often",
"present",
"during",
"sporadic",
"breast",
"cancer",
"progression",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"have",
"characterized",
"expression",
"of",
"the",
"familial",
"breast",
"and",
"ovarian",
"cancer",
"gene",
",",
"BRCA1",
",",
"in",
"cases",
"of",
"non",
"-",
"hereditary",
"(",
"sporadic",
")",
"breast",
"cancer",
"and",
"analyzed",
"the",
"effect",
"of",
"antisense",
"inhibition",
"of",
"BRCA1",
"on",
"the",
"proliferative",
"rate",
"of",
"mammary",
"epithelial",
"cells",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"BRCA1",
"mRNA",
"levels",
"are",
"markedly",
"decreased",
"during",
"the",
"transition",
"from",
"carcinoma",
"in",
"situ",
"to",
"invasive",
"cancer",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O"
] |
[
"Experimental",
"inhibition",
"of",
"BRCA1",
"expression",
"with",
"antisense",
"oligonucleotides",
"produced",
"accelerated",
"growth",
"of",
"normal",
"and",
"malignant",
"mammary",
"cells",
",",
"but",
"had",
"no",
"effect",
"on",
"non",
"-",
"mammary",
"epithelial",
"cells",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"These",
"studies",
"suggest",
"that",
"BRCA1",
"may",
"normally",
"serve",
"as",
"a",
"negative",
"regulator",
"of",
"mammary",
"epithelial",
"cell",
"growth",
"whose",
"function",
"is",
"compromised",
"in",
"breast",
"cancer",
"either",
"by",
"direct",
"mutation",
"or",
"alterations",
"in",
"gene",
"expression",
".",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Additional",
"case",
"of",
"female",
"monozygotic",
"twins",
"discordant",
"for",
"the",
"clinical",
"manifestations",
"of",
"Duchenne",
"muscular",
"dystrophy",
"due",
"to",
"opposite",
"X",
"-",
"chromosome",
"inactivation",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"A",
"pair",
"of",
"female",
"monozygotic",
"(",
"MZ",
")",
"twins",
",",
"heterozygous",
"carriers",
"for",
"a",
"deletion",
"in",
"the",
"DMD",
"gene",
"and",
"discordant",
"for",
"the",
"clinical",
"manifestations",
"of",
"Duchenne",
"muscular",
"dystrophy",
",",
"were",
"analyzed",
"by",
"molecular",
"studies",
",",
"in",
"situ",
"hybridization",
",",
"and",
"methylation",
"pattern",
"of",
"X",
"chromosomes",
"to",
"search",
"for",
"opposite",
"X",
"inactivation",
"as",
"an",
"explanation",
"of",
"their",
"clinical",
"discordance",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
Subsets and Splits
No community queries yet
The top public SQL queries from the community will appear here once available.