tokens
listlengths 2
123
| ner_tags
listlengths 2
123
|
---|---|
[
"The",
"mutation",
"was",
"not",
"observed",
"in",
"DNA",
"from",
"either",
"of",
"the",
"clinically",
"unaffected",
"parents",
"of",
"the",
"proband",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Protein",
"microsequencing",
"demonstrated",
"expression",
"of",
"the",
"abnormal",
"allele",
"in",
"cartilage",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"These",
"data",
"demonstrate",
"that",
"point",
"mutations",
"which",
"result",
"in",
"single",
"amino",
"acid",
"substitutions",
"can",
"produce",
"Kniest",
"dysplasia",
"and",
"further",
"support",
"the",
"hypothesis",
"that",
"alteration",
"of",
"a",
"domain",
",",
"which",
"includes",
"the",
"region",
"encoded",
"by",
"exon",
"12",
",",
"in",
"the",
"type",
"II",
"collagen",
"protein",
"leads",
"to",
"this",
"disorder",
".",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"CAG",
"expansions",
"in",
"a",
"novel",
"gene",
"for",
"Machado",
"-",
"Joseph",
"disease",
"at",
"chromosome",
"14q32",
".",
"1",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"have",
"identified",
"a",
"novel",
"gene",
"containing",
"CAG",
"repeats",
"and",
"mapped",
"it",
"to",
"chromosome",
"14q32",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"1",
",",
"the",
"genetic",
"locus",
"for",
"Machado",
"-",
"Joseph",
"disease",
"(",
"MJD",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"normal",
"individuals",
"the",
"gene",
"contains",
"between",
"13",
"and",
"36",
"CAG",
"repeats",
",",
"whereas",
"most",
"of",
"the",
"clinically",
"diagnosed",
"patients",
"and",
"all",
"of",
"the",
"affected",
"members",
"of",
"a",
"family",
"with",
"the",
"clinical",
"and",
"pathological",
"diagnosis",
"of",
"MJD",
"show",
"expansion",
"of",
"the",
"repeat",
"-",
"number",
"(",
"from",
"68",
"-",
"79",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Southern",
"blot",
"analyses",
"and",
"genomic",
"cloning",
"demonstrates",
"the",
"existence",
"of",
"related",
"genes",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"These",
"results",
"raise",
"the",
"possibility",
"that",
"similar",
"abnormalities",
"in",
"related",
"genes",
"may",
"give",
"rise",
"to",
"diseases",
"similar",
"to",
"MJD",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O"
] |
[
"Mutations",
"in",
"the",
"BRCA1",
"gene",
"in",
"families",
"with",
"early",
"-",
"onset",
"breast",
"and",
"ovarian",
"cancer",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O"
] |
[
"We",
"analysed",
"50",
"probands",
"with",
"a",
"family",
"history",
"of",
"breast",
"and",
"/",
"or",
"ovarian",
"cancer",
"for",
"germline",
"mutations",
"in",
"the",
"coding",
"region",
"of",
"the",
"BRCA1",
"candidate",
"gene",
",",
"using",
"single",
"-",
"strand",
"conformation",
"polymorphism",
"(",
"SSCP",
")",
"analysis",
"on",
"PCR",
"-",
"amplified",
"genomic",
"DNA",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"A",
"total",
"of",
"eight",
"putative",
"disease",
"-",
"causing",
"alterations",
"were",
"identified",
"four",
"of",
"these",
"are",
"frameshifts",
"and",
"two",
"are",
"nonsense",
"mutations",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"addition",
",",
"we",
"found",
"two",
"missense",
"mutations",
",",
"one",
"of",
"which",
"changes",
"the",
"final",
"cysteine",
"of",
"the",
"BRCA1",
"zinc",
"finger",
"motif",
"to",
"glycine",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"These",
"data",
"are",
"consistent",
"with",
"a",
"tumour",
"suppressor",
"model",
",",
"and",
"support",
"the",
"notion",
"that",
"this",
"candidate",
"gene",
"is",
"in",
"fact",
"BRCA1",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"heterogeneity",
"of",
"mutations",
",",
"coupled",
"with",
"the",
"large",
"size",
"of",
"the",
"gene",
",",
"indicates",
"that",
"clinical",
"application",
"of",
"BRCA1",
"mutation",
"testing",
"will",
"be",
"technically",
"challenging",
".",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Confirmation",
"of",
"BRCA1",
"by",
"analysis",
"of",
"germline",
"mutations",
"linked",
"to",
"breast",
"and",
"ovarian",
"cancer",
"in",
"ten",
"families",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"provide",
"genetic",
"evidence",
"supporting",
"the",
"identity",
"of",
"the",
"candidate",
"gene",
"for",
"BRCA1",
"through",
"the",
"characterization",
"of",
"germline",
"mutations",
"in",
"63",
"breast",
"cancer",
"patients",
"and",
"10",
"ovarian",
"cancer",
"patients",
"in",
"ten",
"families",
"with",
"cancer",
"linked",
"to",
"chromosome",
"17q21",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Nine",
"different",
"mutations",
"were",
"detected",
"by",
"screening",
"BRCA1",
"DNA",
"and",
"RNA",
"by",
"single",
"-",
"strand",
"conformation",
"polymorphism",
"analysis",
"and",
"direct",
"sequencing",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Seven",
"mutations",
"lead",
"to",
"protein",
"truncations",
"at",
"sites",
"throughout",
"the",
"gene",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"One",
"missense",
"mutation",
"(",
"which",
"occurred",
"independently",
"in",
"two",
"families",
")",
"leads",
"to",
"loss",
"of",
"a",
"cysteine",
"in",
"the",
"zinc",
"binding",
"domain",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"An",
"intronic",
"single",
"basepair",
"substitution",
"destroys",
"an",
"acceptor",
"site",
"and",
"activates",
"a",
"cryptic",
"splice",
"site",
",",
"leading",
"to",
"a",
"59",
"basepair",
"insertion",
"and",
"chain",
"termination",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"four",
"families",
"with",
"both",
"breast",
"and",
"ovarian",
"cancer",
"had",
"chain",
"termination",
"mutations",
"in",
"the",
"N",
"-",
"terminal",
"half",
"of",
"the",
"protein",
".",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"High",
"resolution",
"genetic",
"analysis",
"suggests",
"one",
"ancestral",
"predisposing",
"haplotype",
"for",
"the",
"origin",
"of",
"the",
"myotonic",
"dystrophy",
"mutation",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"mutation",
"causing",
"myotonic",
"dystrophy",
"(",
"DM",
")",
"has",
"been",
"identified",
"as",
"an",
"amplification",
"of",
"an",
"unstable",
"trinucleotide",
"(",
"CTG",
")",
"n",
"repeat",
"in",
"over",
"99",
"%",
"of",
"the",
"global",
"DM",
"population",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O"
] |
[
"It",
"is",
"in",
"complete",
"linkage",
"disequilibrium",
"with",
"an",
"Alu",
"element",
"polymorphism",
"within",
"the",
"DM",
"kinase",
"gene",
",",
"suggesting",
"that",
"DM",
"is",
"a",
"consequence",
"of",
"one",
"or",
"few",
"ancestral",
"mutations",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"A",
"recent",
"analysis",
"utilizing",
"this",
"polymorphism",
"as",
"well",
"as",
"a",
"flanking",
"dinucleotide",
"marker",
",",
"suggested",
"that",
"similar",
"to",
"Fragile",
"X",
"syndrome",
",",
"DM",
"exhibited",
"a",
"founder",
"effect",
"(",
"Imbert",
"et",
"al",
".",
",",
"1993",
"Nature",
"Genet",
".",
"4",
",",
"72",
"-",
"76",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"contrast",
",",
"the",
"low",
"reproductive",
"fitness",
"of",
"individuals",
"with",
"congenital",
"DM",
"(",
"the",
"endpoint",
"of",
"genetic",
"anticipation",
"in",
"myotonic",
"dystrophy",
")",
"suggests",
"a",
"higher",
"rate",
"of",
"new",
"mutations",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"present",
"a",
"high",
"resolution",
"genetic",
"analysis",
"of",
"the",
"DM",
"locus",
"using",
"PCR",
"based",
"assays",
"of",
"nine",
"polymorphisms",
",",
"spanning",
"a",
"physical",
"distance",
"of",
"30",
"kb",
",",
"within",
"and",
"immediately",
"flanking",
"the",
"DM",
"kinase",
"gene",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"persistent",
"complete",
"allelic",
"association",
"of",
"the",
"DM",
"mutation",
"with",
"all",
"these",
"polymorphisms",
"provides",
"further",
"support",
"to",
"previous",
"observations",
"and",
"suggests",
"more",
"strongly",
"that",
"the",
"DM",
"mutation",
"occurred",
"on",
"the",
"background",
"of",
"a",
"particular",
"haplotype",
"in",
"which",
"the",
"(",
"CTG",
")",
"n",
"repeat",
"became",
"inherently",
"unstable",
"and",
"therefore",
"predisposed",
"to",
"amplification",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Genetic",
"instability",
"in",
"human",
"ovarian",
"cancer",
"cell",
"lines",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"have",
"analyzed",
"the",
"stability",
"of",
"microsatellites",
"in",
"cell",
"lines",
"derived",
"from",
"human",
"ovarian",
"cancers",
"and",
"found",
"that",
"5",
"out",
"of",
"10",
"of",
"the",
"ovarian",
"tumor",
"cell",
"lines",
"are",
"genetically",
"unstable",
"at",
"the",
"majority",
"of",
"the",
"loci",
"analyzed",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"clones",
"and",
"subclones",
"derived",
"serially",
"from",
"one",
"of",
"these",
"cell",
"lines",
"(",
"2774",
";",
"serous",
"cystadenocarcinoma",
")",
",",
"a",
"very",
"high",
"proportion",
"of",
"microsatellites",
"distributed",
"in",
"many",
"different",
"regions",
"of",
"the",
"genome",
"change",
"their",
"size",
"in",
"a",
"mercurial",
"fashion",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"conclude",
"that",
"genomic",
"instability",
"in",
"ovarian",
"tumors",
"is",
"a",
"dynamic",
"and",
"ongoing",
"process",
"whose",
"high",
"frequency",
"may",
"have",
"been",
"previously",
"underestimated",
"by",
"PCR",
"-",
"based",
"allelotyping",
"of",
"bulk",
"tumor",
"tissue",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"have",
"identified",
"the",
"source",
"of",
"the",
"genetic",
"instability",
"in",
"one",
"ovarian",
"tumor",
"as",
"a",
"point",
"mutation",
"(",
"R524P",
")",
"in",
"the",
"human",
"mismatch",
"-",
"repair",
"gene",
"MSH2",
"(",
"Salmonella",
"MutS",
"homologue",
")",
",",
"which",
"has",
"recently",
"been",
"shown",
"to",
"be",
"involved",
"in",
"hereditary",
"nonpolyposis",
"colorectal",
"cancer",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O"
] |
[
"Patient",
"2774",
"was",
"a",
"38",
"-",
"year",
"-",
"old",
"heterozygote",
",",
"and",
"her",
"normal",
"tissue",
"carried",
"both",
"mutant",
"and",
"wild",
"-",
"type",
"alleles",
"of",
"the",
"human",
"MSH2",
"gene",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"However",
"the",
"wild",
"-",
"type",
"allele",
"was",
"lost",
"at",
"some",
"point",
"early",
"during",
"tumorigenesis",
"so",
"that",
"DNA",
"isolated",
"either",
"from",
"the",
"patients",
"ovarian",
"tumor",
"or",
"from",
"the",
"2774",
"cell",
"line",
"carries",
"only",
"the",
"mutant",
"allele",
"of",
"the",
"human",
"MSH2",
"gene",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"genetic",
"instability",
"observed",
"in",
"the",
"tumor",
"and",
"cell",
"line",
"DNA",
",",
"together",
"with",
"the",
"germ",
"-",
"line",
"mutation",
"in",
"a",
"mismatch",
"-",
"repair",
"gene",
",",
"suggest",
"that",
"the",
"MSH2",
"gene",
"is",
"involved",
"in",
"the",
"onset",
"and",
"/",
"or",
"progression",
"in",
"a",
"subset",
"of",
"ovarian",
"cancer",
".",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O"
] |
[
"BRCA1",
"mutations",
"in",
"primary",
"breast",
"and",
"ovarian",
"carcinomas",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O"
] |
[
"Loss",
"of",
"heterozygosity",
"data",
"from",
"familial",
"tumors",
"suggest",
"that",
"BRCA1",
",",
"a",
"gene",
"that",
"confers",
"susceptibility",
"to",
"ovarian",
"and",
"early",
"-",
"onset",
"breast",
"cancer",
",",
"encodes",
"a",
"tumor",
"suppressor",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"BRCA1",
"region",
"is",
"also",
"subject",
"to",
"allelic",
"loss",
"in",
"sporadic",
"breast",
"and",
"ovarian",
"cancers",
",",
"an",
"indication",
"that",
"BRCA1",
"mutations",
"may",
"occur",
"somatically",
"in",
"these",
"tumors",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O"
] |
[
"The",
"BRCA1",
"coding",
"region",
"was",
"examined",
"for",
"mutations",
"in",
"primary",
"breast",
"and",
"ovarian",
"tumors",
"that",
"show",
"allele",
"loss",
"at",
"the",
"BRCA1",
"locus",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Mutations",
"were",
"detected",
"in",
"3",
"of",
"32",
"breast",
"and",
"1",
"of",
"12",
"ovarian",
"carcinomas",
";",
"all",
"four",
"mutations",
"were",
"germline",
"alterations",
"and",
"occurred",
"in",
"early",
"-",
"onset",
"cancers",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O"
] |
[
"These",
"results",
"suggest",
"that",
"mutation",
"of",
"BRCA1",
"may",
"not",
"be",
"critical",
"in",
"the",
"development",
"of",
"the",
"majority",
"of",
"breast",
"and",
"ovarian",
"cancers",
"that",
"arise",
"in",
"the",
"absence",
"of",
"a",
"mutant",
"germline",
"allele",
".",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"PAX6",
"gene",
"dosage",
"effect",
"in",
"a",
"family",
"with",
"congenital",
"cataracts",
",",
"aniridia",
",",
"anophthalmia",
"and",
"central",
"nervous",
"system",
"defects",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O"
] |
[
"The",
"human",
"eye",
"malformation",
"aniridia",
"results",
"from",
"haploinsufficiency",
"of",
"PAX6",
",",
"a",
"paired",
"box",
"DNA",
"-",
"binding",
"protein",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"To",
"study",
"this",
"dosage",
"effect",
",",
"we",
"characterized",
"two",
"PAX6",
"mutations",
"in",
"a",
"family",
"segregating",
"aniridia",
"and",
"a",
"milder",
"syndrome",
"consisting",
"of",
"congenital",
"cataracts",
"and",
"late",
"onset",
"corneal",
"dystrophy",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O"
] |
[
"The",
"nonsense",
"mutations",
",",
"at",
"codons",
"103",
"and",
"353",
",",
"truncate",
"PAX6",
"within",
"the",
"N",
"-",
"terminal",
"paired",
"and",
"C",
"-",
"terminal",
"PST",
"domains",
",",
"respectively",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"wild",
"-",
"type",
"PST",
"domain",
"activates",
"transcription",
"autonomously",
"and",
"the",
"mutant",
"form",
"has",
"partial",
"activity",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"A",
"compound",
"heterozygote",
"had",
"severe",
"craniofacial",
"and",
"central",
"nervous",
"system",
"defects",
"and",
"no",
"eyes",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O"
] |
[
"The",
"pattern",
"of",
"malformations",
"is",
"similar",
"to",
"that",
"in",
"homozygous",
"Sey",
"mice",
"and",
"suggests",
"a",
"critical",
"role",
"for",
"PAX6",
"in",
"controlling",
"the",
"migration",
"and",
"differentiation",
"of",
"specific",
"neuronal",
"progenitor",
"cells",
"in",
"the",
"brain",
".",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"A",
"physical",
"map",
"and",
"candidate",
"genes",
"in",
"the",
"BRCA1",
"region",
"on",
"chromosome",
"17q12",
"-",
"21",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"have",
"constructed",
"a",
"physical",
"map",
"of",
"a",
"4",
"cM",
"region",
"on",
"chromosome",
"17q12",
"-",
"21",
"that",
"contains",
"the",
"hereditary",
"breast",
"and",
"ovarian",
"cancer",
"gene",
"BRCA1",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"map",
"comprises",
"a",
"contig",
"of",
"137",
"overlapping",
"yeast",
"artificial",
"chromosomes",
"and",
"P1",
"clones",
",",
"onto",
"which",
"we",
"have",
"placed",
"112",
"PCR",
"markers",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"have",
"localized",
"more",
"than",
"20",
"genes",
"on",
"this",
"map",
",",
"ten",
"of",
"which",
"had",
"not",
"been",
"mapped",
"to",
"the",
"region",
"previously",
",",
"and",
"have",
"isolated",
"30",
"cDNA",
"clones",
"representing",
"partial",
"sequences",
"of",
"as",
"yet",
"unidentified",
"genes",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Two",
"genes",
"that",
"lie",
"within",
"a",
"narrow",
"region",
"defined",
"by",
"meiotic",
"breakpoints",
"in",
"BRCA1",
"patients",
"have",
"been",
"sequenced",
"in",
"breast",
"cancer",
"patients",
"without",
"revealing",
"any",
"deleterious",
"mutations",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"These",
"new",
"reagents",
"should",
"facilitate",
"the",
"identification",
"of",
"BRCA1",
".",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"LEC",
"rat",
"has",
"a",
"deletion",
"in",
"the",
"copper",
"transporting",
"ATPase",
"gene",
"homologous",
"to",
"the",
"Wilson",
"disease",
"gene",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"Long",
"-",
"Evans",
"Cinnamon",
"(",
"LEC",
")",
"rat",
"shows",
"similarity",
"to",
"Wilson",
"disease",
"in",
"many",
"clinical",
"and",
"biochemical",
"features",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"have",
"cloned",
"cDNAs",
"for",
"the",
"rat",
"gene",
"(",
"Atp7b",
")",
"homologous",
"to",
"the",
"human",
"Wilson",
"disease",
"gene",
"(",
"ATP7B",
")",
"and",
"have",
"used",
"them",
"to",
"identify",
"a",
"partial",
"deletion",
"in",
"the",
"Atp7b",
"gene",
"in",
"the",
"LEC",
"rat",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"deletion",
"removes",
"at",
"least",
"900",
"bp",
"of",
"the",
"coding",
"region",
"at",
"the",
"3",
"end",
",",
"includes",
"the",
"crucial",
"ATP",
"binding",
"domain",
"and",
"extends",
"downstream",
"of",
"the",
"gene",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Our",
"results",
"provide",
"convincing",
"evidence",
"for",
"defining",
"the",
"LEC",
"rat",
"as",
"an",
"animal",
"model",
"for",
"Wilson",
"disease",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O"
] |
[
"This",
"model",
"will",
"be",
"important",
"for",
"studying",
"liver",
"pathophysiology",
",",
"for",
"developing",
"therapy",
"for",
"Wilson",
"disease",
"and",
"for",
"studying",
"the",
"pathway",
"of",
"copper",
"transport",
"and",
"its",
"possible",
"interaction",
"with",
"other",
"heavy",
"metals",
".",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Genomic",
"organization",
"of",
"the",
"adrenoleukodystrophy",
"gene",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O"
] |
[
"Adrenoleukodystrophy",
"(",
"ALD",
")",
",",
"the",
"most",
"frequent",
"peroxisomal",
"disorder",
",",
"is",
"a",
"severe",
"neurodegenerative",
"disease",
"associated",
"with",
"an",
"impairment",
"of",
"very",
"long",
"chain",
"fatty",
"acids",
"beta",
"-",
"oxidation",
"."
] |
[
"B-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O"
] |
[
"We",
"have",
"recently",
"identified",
"by",
"positional",
"cloning",
"the",
"gene",
"responsible",
"for",
"ALD",
",",
"located",
"in",
"Xq28",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"It",
"encodes",
"a",
"new",
"member",
"of",
"the",
"\"",
"ABC",
"\"",
"superfamily",
"of",
"membrane",
"-",
"associated",
"transporters",
"that",
"shows",
",",
"in",
"particular",
",",
"significant",
"homology",
"to",
"the",
"70",
"-",
"kDa",
"peroxisomal",
"membrane",
"protein",
"(",
"PMP70",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"report",
"here",
"a",
"detailed",
"characterization",
"of",
"the",
"ALD",
"gene",
"structure",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"It",
"extends",
"over",
"21",
"kb",
"and",
"consists",
"of",
"10",
"exons",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"To",
"facilitate",
"the",
"detection",
"of",
"mutations",
"in",
"ALD",
"patients",
",",
"we",
"have",
"determined",
"the",
"intronic",
"sequences",
"flanking",
"the",
"exons",
"as",
"well",
"as",
"the",
"sequence",
"of",
"the",
"3",
"untranslated",
"region",
"and",
"of",
"the",
"immediate",
"5",
"promoter",
"region",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Sequences",
"present",
"in",
"distal",
"exons",
"cross",
"-",
"hybridize",
"strongly",
"to",
"additional",
"sequences",
"in",
"the",
"human",
"genome",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"ALD",
"gene",
"has",
"been",
"positioned",
"on",
"a",
"pulsed",
"-",
"field",
"map",
"between",
"DXS15",
"and",
"the",
"L1CAM",
"gene",
",",
"about",
"650",
"kb",
"upstream",
"from",
"the",
"color",
"pigment",
"genes",
"."
] |
[
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"frequent",
"occurrence",
"of",
"color",
"vision",
"anomalies",
"observed",
"in",
"patients",
"with",
"adrenomyeloneuropathy",
"(",
"the",
"adult",
"onset",
"form",
"of",
"ALD",
")",
"thus",
"does",
"not",
"represent",
"a",
"contiguous",
"gene",
"syndrome",
"but",
"a",
"secondary",
"manifestation",
"of",
"ALD",
".",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"murine",
"homologues",
"of",
"the",
"Huntington",
"disease",
"gene",
"(",
"Hdh",
")",
"and",
"the",
"alpha",
"-",
"adducin",
"gene",
"(",
"Add1",
")",
"map",
"to",
"mouse",
"chromosome",
"5",
"within",
"a",
"region",
"of",
"conserved",
"synteny",
"with",
"human",
"chromosome",
"4p16",
".",
"3",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Huntington",
"disease",
"(",
"HD",
")",
"is",
"a",
"severe",
"autosomal",
"dominant",
"neurodegenerative",
"disorder",
"associated",
"with",
"a",
"novel",
"gene",
"(",
"IT15",
")",
"."
] |
[
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Recently",
",",
"we",
"reported",
"the",
"cloning",
"of",
"Hdh",
",",
"the",
"murine",
"homologue",
"of",
"IT15",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Here",
",",
"using",
"an",
"interspecific",
"backcross",
",",
"we",
"have",
"mapped",
"both",
"Hdh",
"and",
"the",
"mouse",
"homologue",
"of",
"human",
"alpha",
"-",
"adducin",
"(",
"Add1",
")",
",",
"a",
"membrane",
"-",
"associated",
"cytoskeletal",
"protein",
"gene",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Both",
"of",
"these",
"genes",
"map",
"in",
"the",
"same",
"position",
"on",
"mouse",
"chromosome",
"5",
"in",
"a",
"region",
"associated",
"with",
"ancestral",
"chromosomal",
"rearrangements",
"and",
"show",
"no",
"recombination",
"with",
"D5H4S43",
",",
"D5H4S115",
",",
"and",
"D5H4S62",
",",
"the",
"murine",
"homologues",
"of",
"D4S43",
",",
"D4S115",
",",
"and",
"D4S62",
",",
"respectively",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Further",
"mapping",
"studies",
"of",
"humans",
",",
"mice",
",",
"and",
"other",
"mammalian",
"species",
"should",
"reveal",
"the",
"nature",
"of",
"the",
"rearrangements",
"affecting",
"this",
"chromosomal",
"segment",
"during",
"mammalian",
"evolution",
".",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Genetic",
"cholesteryl",
"ester",
"transfer",
"protein",
"deficiency",
"caused",
"by",
"two",
"prevalent",
"mutations",
"as",
"a",
"major",
"determinant",
"of",
"increased",
"levels",
"of",
"high",
"density",
"lipoprotein",
"cholesterol",
"."
] |
[
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Genetic",
"determinants",
"of",
"HDL",
"cholesterol",
"(",
"HDL",
"-",
"C",
")",
"levels",
"in",
"the",
"general",
"population",
"are",
"poorly",
"understood",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"previously",
"described",
"plasma",
"cholesteryl",
"ester",
"transfer",
"protein",
"(",
"CETP",
")",
"deficiency",
"due",
"to",
"an",
"intron",
"14",
"G",
"(",
"+",
"1",
")",
"-",
"to",
"-",
"A",
"mutation",
"(",
"Int14",
"A",
")",
"in",
"several",
"families",
"with",
"very",
"high",
"HDL",
"-",
"C",
"levels",
"in",
"Japan",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Subjects",
"with",
"HDL",
"-",
"C",
">",
"or",
"=",
"100",
"mg",
"/",
"dl",
"(",
"n",
"=",
"130",
")",
"were",
"screened",
"by",
"PCR",
"single",
"strand",
"conformational",
"polymorphism",
"analysis",
"of",
"the",
"CETP",
"gene",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Two",
"other",
"mutations",
"were",
"identified",
"by",
"DNA",
"sequencing",
"or",
"primer",
"-",
"mediated",
"restriction",
"map",
"modification",
"of",
"PCR",
"products",
"a",
"novel",
"intron",
"14",
"splice",
"donor",
"site",
"mutation",
"caused",
"by",
"a",
"T",
"insertion",
"at",
"position",
"+",
"3",
"from",
"the",
"exon14",
"/",
"intron14",
"boundary",
"(",
"Int14",
"T",
")",
"and",
"a",
"missense",
"mutation",
"(",
"Asp442",
"to",
"Gly",
")",
"within",
"exon",
"15",
"(",
"D442G",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"Int14",
"T",
"mutation",
"was",
"only",
"found",
"in",
"one",
"family",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"However",
",",
"the",
"D442G",
"and",
"Int14",
"A",
"mutations",
"were",
"highly",
"prevalent",
"in",
"subjects",
"with",
"HDL",
"-",
"C",
">",
"or",
"=",
"60",
"mg",
"/",
"dl",
",",
"with",
"combined",
"allele",
"frequencies",
"of",
"9",
"%",
",",
"12",
"%",
",",
"21",
"%",
"and",
"43",
"%",
"for",
"HDL",
"-",
"C",
"60",
"-",
"79",
",",
"80",
"-",
"99",
",",
"100",
"-",
"119",
",",
"and",
">",
"or",
"=",
"120",
"mg",
"/",
"dl",
",",
"respectively",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Furthermore",
",",
"prevalences",
"of",
"the",
"D442G",
"and",
"Int14",
"A",
"mutations",
"were",
"extremely",
"high",
"in",
"a",
"general",
"sample",
"of",
"Japanese",
"men",
"(",
"n",
"=",
"236",
")",
",",
"with",
"heterozygote",
"frequencies",
"of",
"7",
"%",
"and",
"2",
"%",
",",
"respectively",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"These",
"two",
"mutations",
"accounted",
"for",
"about",
"10",
"%",
"of",
"the",
"total",
"variance",
"of",
"HDL",
"-",
"C",
"in",
"this",
"population",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"phenotype",
"in",
"a",
"genetic",
"compound",
"heterozygote",
"(",
"Int14",
"T",
"and",
"Int14",
"A",
")",
"was",
"similar",
"to",
"that",
"of",
"Int14",
"A",
"homozygotes",
"(",
"no",
"detectable",
"CETP",
"and",
"markedly",
"increased",
"HDL",
"-",
"C",
")",
",",
"indicating",
"that",
"the",
"Int14",
"T",
"produces",
"a",
"null",
"allele",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"four",
"D442G",
"homozygotes",
",",
"mean",
"HDL",
"-",
"C",
"levels",
"(",
"86",
"+",
"/",
"-",
"26",
"mg",
"/",
"dl",
")",
"were",
"lower",
"than",
"in",
"Int14",
"A",
"homozygotes",
"(",
"158",
"+",
"/",
"-",
"35",
"mg",
"/",
"dl",
")",
",",
"reflecting",
"residual",
"CETP",
"activity",
"in",
"plasma",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"47",
"D442G",
"heterozygotes",
",",
"mean",
"HDL",
"-",
"C",
"levels",
"were",
"91",
"+",
"/",
"-",
"23",
"mg",
"/",
"dl",
",",
"similar",
"to",
"the",
"level",
"in",
"D442G",
"homozygotes",
",",
"and",
"significantly",
"greater",
"than",
"mean",
"HDL",
"-",
"C",
"levels",
"in",
"Int14",
"A",
"heterozygotes",
"(",
"69",
"+",
"/",
"-",
"15",
"mg",
"/",
"dl",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Thus",
",",
"the",
"D442G",
"mutation",
"acts",
"differently",
"to",
"the",
"null",
"mutations",
"with",
"weaker",
"effects",
"on",
"HDL",
"in",
"the",
"homozygous",
"state",
"and",
"stronger",
"effects",
"in",
"the",
"heterozygotes",
",",
"suggesting",
"dominant",
"expression",
"of",
"a",
"partially",
"defective",
"allele",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"CETP",
"deficiency",
",",
"reflecting",
"two",
"prevalent",
"mutations",
"(",
"D442G",
"and",
"Int14",
"A",
")",
",",
"is",
"the",
"first",
"example",
"of",
"a",
"genetic",
"deficiency",
"state",
"which",
"is",
"sufficiently",
"common",
"to",
"explain",
"a",
"significant",
"fraction",
"of",
"the",
"variation",
"in",
"HDL",
"-",
"C",
"in",
"the",
"general",
"population",
".",
"."
] |
[
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Treatment",
"of",
"cerebrotendinous",
"xanthomatosis",
":",
"effects",
"of",
"chenodeoxycholic",
"acid",
",",
"pravastatin",
",",
"and",
"combined",
"use",
"."
] |
[
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Treatments",
"by",
"oral",
"administration",
"of",
"chenodeoxycholic",
"acid",
"(",
"CDCA",
")",
"alone",
",",
"3",
"-",
"hydroxy",
"-",
"3",
"-",
"methylglutaryl",
"(",
"HMG",
")",
"CoA",
"reductase",
"inhibitor",
"(",
"pravastatin",
")",
"alone",
",",
"and",
"combination",
"of",
"the",
"two",
"drugs",
"were",
"attempted",
"for",
"7",
"patients",
"with",
"cerebrotendinous",
"xanthomatosis",
"(",
"CTX",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O"
] |
[
"CDCA",
"treatment",
"at",
"a",
"dose",
"of",
"300",
"mg",
"/",
"day",
"reduced",
"serum",
"cholestanol",
"(",
"67",
".",
"3",
"%",
"reduction",
")",
",",
"lathosterol",
"(",
"50",
".",
"8",
"%",
")",
",",
"campesterol",
"(",
"61",
".",
"7",
"%",
")",
"and",
"sitosterol",
"(",
"12",
".",
"7",
"%",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"However",
",",
"the",
"sera",
"of",
"the",
"patients",
"changed",
"to",
"be",
"\"",
"atherogenic",
"\"",
";",
"total",
"cholesterol",
",",
"triglyceride",
"and",
"low",
"-",
"density",
"lipoprotein",
"(",
"LDL",
")",
"-",
"cholesterol",
"were",
"increased",
",",
"while",
"high",
"-",
"density",
"lipoprotein",
"(",
"HDL",
")",
"-",
"cholesterol",
"was",
"decreased",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Contrarily",
",",
"pravastatin",
"at",
"a",
"dose",
"of",
"10",
"mg",
"/",
"day",
"improved",
"the",
"sera",
"of",
"the",
"patients",
"to",
"be",
"markedly",
"\"",
"anti",
"-",
"atherogenic",
"\"",
",",
"but",
"the",
"reductions",
"of",
"cholestanol",
"(",
"30",
".",
"4",
"%",
")",
",",
"lathosterol",
"(",
"44",
".",
"0",
"%",
")",
",",
"campesterol",
"(",
"22",
".",
"9",
"%",
")",
"and",
"sitosterol",
"(",
"9",
".",
"6",
"%",
")",
"were",
"inadequate",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Combined",
"treatment",
"with",
"CDCA",
"and",
"pravastatin",
"showed",
"good",
"overlapping",
"of",
"the",
"effects",
"of",
"each",
"drug",
"alone",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"sera",
"of",
"the",
"patients",
"were",
"apparently",
"more",
"\"",
"anti",
"-",
"atherogenic",
"\"",
"than",
"those",
"after",
"CDCA",
"treatment",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Serum",
"cholestanol",
"concentration",
"was",
"still",
"2",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
Subsets and Splits
No community queries yet
The top public SQL queries from the community will appear here once available.