tokens
listlengths 2
123
| ner_tags
listlengths 2
123
|
---|---|
[
"7",
"times",
"higher",
"than",
"in",
"controls",
",",
"but",
"the",
"serum",
"lathosterol",
"level",
"was",
"within",
"the",
"normal",
"range",
",",
"indicating",
"that",
"the",
"enhancement",
"of",
"overall",
"cholesterol",
"synthesis",
"in",
"the",
"patients",
"was",
"sufficiently",
"suppressed",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Plant",
"sterol",
"levels",
"were",
"also",
"within",
"the",
"normal",
"range",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"combination",
"of",
"CDCA",
"and",
"pravastatin",
"was",
"a",
"good",
"treatment",
"for",
"CTX",
",",
"based",
"on",
"the",
"improvement",
"of",
"serum",
"lipoprotein",
"metabolism",
",",
"the",
"suppression",
"of",
"cholesterol",
"synthesis",
",",
"and",
"reductions",
"of",
"cholestanol",
"and",
"plant",
"sterol",
"levels",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"all",
"of",
"7",
"patients",
",",
"the",
"progression",
"of",
"disease",
"was",
"arrested",
",",
"but",
"dramatic",
"effects",
"on",
"clinical",
"manifestations",
",",
"xanthoma",
",",
"and",
"electrophysiological",
"findings",
"could",
"not",
"be",
"found",
"after",
"the",
"treatment",
"of",
"these",
"drugs"
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Mutation",
"spectrum",
"in",
"the",
"CHM",
"gene",
"of",
"Danish",
"and",
"Swedish",
"choroideremia",
"patients",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"recent",
"isolation",
"of",
"the",
"complete",
"open",
"reading",
"frame",
"of",
"the",
"choroideremia",
"(",
"CHM",
")",
"gene",
"and",
"the",
"characterization",
"of",
"the",
"exon",
"-",
"intron",
"boundaries",
"has",
"paved",
"the",
"way",
"to",
"mutation",
"detection",
"in",
"patients",
"with",
"classical",
"choroideremia",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O"
] |
[
"We",
"have",
"performed",
"mutation",
"screening",
"in",
"patients",
"from",
"15",
"Danish",
"and",
"Swedish",
"families",
"by",
"using",
"Southern",
"blot",
"hybridization",
"and",
"the",
"polymerase",
"chain",
"reaction",
"single",
"-",
"strand",
"conformation",
"polymorphism",
"(",
"PCR",
"-",
"SSCP",
")",
"technique",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Causative",
"mutations",
"in",
"the",
"CHM",
"gene",
"were",
"detected",
"in",
"at",
"least",
"12",
"families",
",",
"indicating",
"that",
"a",
"substantial",
"part",
"of",
"the",
"mutations",
"can",
"be",
"identified",
"by",
"this",
"approach",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"four",
"of",
"these",
"families",
"deletions",
"of",
"different",
"sizes",
"were",
"found",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Thus",
",",
"in",
"one",
"patient",
",",
"the",
"deletion",
"resulted",
"in",
"the",
"absence",
"of",
"only",
"one",
"exon",
",",
"while",
"in",
"another",
"the",
"deletion",
"comprised",
"the",
"entire",
"CHM",
"gene",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O"
] |
[
"Mapping",
"of",
"the",
"deletion",
"endpoints",
"in",
"these",
"four",
"patients",
"and",
"in",
"another",
"11",
"male",
"patients",
"with",
"sizeable",
"deletions",
"enabled",
"us",
"to",
"construct",
"a",
"very",
"detailed",
"map",
"of",
"intervals",
"2",
"and",
"3",
"of",
"Xq21",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"the",
"remaining",
"11",
"Danish",
"and",
"Swedish",
"families",
"at",
"least",
"8",
"causative",
"mutations",
"were",
"found",
"by",
"PCR",
"-",
"SSCP",
"analysis",
"and",
"direct",
"sequencing",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Interestingly",
",",
"all",
"CHM",
"gene",
"mutations",
"detected",
"thus",
"far",
"in",
"choroideremia",
"patients",
"give",
"rise",
"to",
"the",
"introduction",
"of",
"a",
"premature",
"stop",
"codon",
".",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Predominance",
"of",
"the",
"adrenomyeloneuropathy",
"phenotype",
"of",
"X",
"-",
"linked",
"adrenoleukodystrophy",
"in",
"The",
"Netherlands",
":",
"a",
"survey",
"of",
"30",
"kindreds",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"X",
"-",
"linked",
"adrenoleukodystrophy",
"(",
"X",
"-",
"ALD",
")",
"is",
"an",
"inherited",
"disorder",
"of",
"peroxisomal",
"beta",
"-",
"oxidation",
"associated",
"with",
"accumulation",
"of",
"saturated",
"very",
"long",
"-",
"chain",
"fatty",
"acids",
",",
"which",
"results",
"in",
"central",
"and",
"peripheral",
"demyelination",
"and",
"in",
"impaired",
"function",
"of",
"adrenal",
"cortex",
"and",
"testes",
"."
] |
[
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O"
] |
[
"The",
"phenotypic",
"expression",
"is",
"highly",
"variable",
",",
"childhood",
"cerebral",
"ALD",
"(",
"CCALD",
")",
"and",
"adrenomyeloneuropathy",
"(",
"AMN",
")",
"being",
"the",
"main",
"variants",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"explored",
"the",
"30",
"Dutch",
"kindreds",
"well",
"known",
"to",
"the",
"Dutch",
"X",
"-",
"ALD",
"/",
"AMN",
"Study",
"Group",
"and",
"phenotyped",
"77",
"male",
"patients",
"35",
"(",
"46",
"%",
")",
"had",
"AMN",
"and",
"24",
"(",
"31",
"%",
")",
"CCALD",
"or",
"adolescent",
"cerebral",
"ALD",
"(",
"AdolCALD",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O"
] |
[
"These",
"percentages",
"differ",
"significantly",
"from",
"previous",
"reports",
",",
"in",
"which",
"25",
"to",
"28",
"%",
"of",
"the",
"patients",
"developed",
"AMN",
"and",
"53",
"to",
"57",
"%",
"CCALD",
"or",
"AdolCALD",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"O"
] |
[
"Our",
"findings",
"indicate",
"that",
"-",
"-",
"at",
"least",
"in",
"the",
"Netherlands",
"-",
"-",
"AMN",
"may",
"be",
"the",
"most",
"frequent",
"phenotype",
"of",
"X",
"-",
"ALD",
".",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O"
] |
[
"Adrenoleukodystrophy",
"gene",
"encodes",
"an",
"80",
"kDa",
"membrane",
"protein",
"."
] |
[
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"An",
"antibody",
"against",
"the",
"synthetic",
"C",
"-",
"terminal",
"peptides",
"deduced",
"from",
"the",
"cDNA",
"of",
"the",
"gene",
"responsible",
"for",
"X",
"-",
"linked",
"adrenoleukodystrophy",
"(",
"ALD",
")",
"was",
"produced",
"to",
"characterize",
"the",
"product",
"of",
"the",
"ALD",
"gene",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"antibody",
"reacted",
"with",
"the",
"80",
"kDa",
"band",
"protein",
"in",
"control",
"fibroblasts",
",",
"while",
"no",
"bands",
"were",
"detected",
"in",
"the",
"fibroblasts",
"from",
"a",
"patient",
"with",
"ALD",
"(",
"#",
"163",
")",
",",
"in",
"which",
"mRNA",
"of",
"the",
"ALD",
"gene",
"was",
"undetectable",
"based",
"on",
"Northern",
"blot",
"analysis",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"293T",
"cells",
"transfected",
"with",
"the",
"full",
"-",
"coding",
"cDNA",
"inserted",
"in",
"the",
"expression",
"vector",
"produced",
"a",
"new",
"80",
"kDa",
"protein",
",",
"as",
"detected",
"by",
"Western",
"blot",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"an",
"immunocytological",
"study",
",",
"the",
"staining",
"was",
"in",
"a",
"punctate",
"pattern",
",",
"in",
"the",
"normal",
"fibroblasts",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"However",
",",
"there",
"was",
"no",
"punctate",
"staining",
"in",
"the",
"#",
"163",
"cells",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"These",
"data",
"thus",
"indicate",
"that",
"the",
"ALD",
"gene",
"encodes",
"an",
"80",
"kDa",
"membrane",
"protein",
".",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Isolation",
"of",
"the",
"gene",
"for",
"McLeod",
"syndrome",
"that",
"encodes",
"a",
"novel",
"membrane",
"transport",
"protein",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"McLeod",
"syndrome",
"is",
"an",
"X",
"-",
"linked",
"multisystem",
"disorder",
"characterized",
"by",
"abnormalities",
"in",
"the",
"neuromuscular",
"and",
"hematopoietic",
"systems",
"."
] |
[
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"have",
"assembled",
"a",
"cosmid",
"contig",
"of",
"360",
"kb",
"that",
"encompasses",
"the",
"McLeod",
"gene",
"locus",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"A",
"50",
"kb",
"deletion",
"was",
"detected",
"by",
"screening",
"DNA",
"from",
"patients",
"with",
"radiolabeled",
"whole",
"cosmids",
",",
"and",
"two",
"transcription",
"units",
"were",
"identified",
"within",
"this",
"deletion",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"mRNA",
"expression",
"pattern",
"of",
"one",
"of",
"them",
",",
"designated",
"as",
"XK",
",",
"correlates",
"closely",
"to",
"the",
"McLeod",
"phenotype",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O"
] |
[
"XK",
"encodes",
"a",
"novel",
"protein",
"with",
"structural",
"characteristics",
"of",
"prokaryotic",
"and",
"eukaryotic",
"membrane",
"transport",
"proteins",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Nucleotide",
"sequence",
"analysis",
"of",
"XK",
"from",
"two",
"unrelated",
"McLeod",
"patients",
"has",
"identified",
"point",
"mutations",
"at",
"conserved",
"splice",
"donor",
"and",
"acceptor",
"sites",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"These",
"findings",
"provide",
"direct",
"evidence",
"that",
"XK",
"is",
"responsible",
"for",
"McLeod",
"syndrome",
".",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O"
] |
[
"X",
"-",
"linked",
"spastic",
"paraplegia",
"and",
"Pelizaeus",
"-",
"Merzbacher",
"disease",
"are",
"allelic",
"disorders",
"at",
"the",
"proteolipid",
"protein",
"locus",
"."
] |
[
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Three",
"forms",
"of",
"X",
"-",
"linked",
"spastic",
"paraplegia",
"(",
"SPG",
")",
"have",
"been",
"defined",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"One",
"locus",
"(",
"SPG",
"1",
")",
"maps",
"to",
"Xq28",
"while",
"two",
"clinically",
"distinct",
"forms",
"map",
"to",
"Xq22",
"(",
"SPG2",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"A",
"rare",
"X",
"-",
"linked",
"dysmyelinating",
"disorder",
"of",
"the",
"central",
"nervous",
"system",
",",
"Pelizaeus",
"-",
"Merzbacher",
"disease",
"(",
"PMD",
")",
",",
"has",
"also",
"been",
"mapped",
"to",
"Xq21",
"-",
"q22",
",",
"and",
"is",
"caused",
"by",
"mutations",
"in",
"the",
"proteolipid",
"protein",
"gene",
"(",
"PLP",
")",
"which",
"encodes",
"two",
"myelin",
"proteins",
",",
"PLP",
"and",
"DM20",
"."
] |
[
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"While",
"narrowing",
"the",
"genetic",
"interval",
"containing",
"SPG2",
"in",
"a",
"large",
"pedigree",
",",
"we",
"found",
"that",
"PLP",
"was",
"the",
"closest",
"marker",
"to",
"the",
"disease",
"locus",
",",
"implicating",
"PLP",
"as",
"a",
"possible",
"candidate",
"gene",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"have",
"found",
"that",
"a",
"point",
"mutation",
"(",
"His139Tyr",
")",
"in",
"exon",
"3B",
"of",
"an",
"affected",
"male",
"produces",
"a",
"mutant",
"PLP",
"but",
"a",
"normal",
"DM20",
",",
"and",
"segregates",
"with",
"the",
"disease",
"(",
"Zmax",
"=",
"6",
".",
"63",
",",
"theta",
"=",
"0",
".",
"00",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"It",
"appears",
",",
"therefore",
",",
"that",
"SPG2",
"and",
"PMD",
"are",
"allelic",
"disorders"
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Canavan",
"disease",
":",
"mutations",
"among",
"Jewish",
"and",
"non",
"-",
"Jewish",
"patients",
"."
] |
[
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Canavan",
"disease",
"is",
"an",
"autosomal",
"recessive",
"leukodystrophy",
"caused",
"by",
"the",
"deficiency",
"of",
"aspartoacylase",
"(",
"ASPA",
")",
"."
] |
[
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Sixty",
"-",
"four",
"probands",
"were",
"analyzed",
"for",
"mutations",
"in",
"the",
"ASPA",
"gene",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Three",
"point",
"mutations",
"-",
"-",
"693C",
"-",
"-",
">",
"A",
",",
"854A",
"-",
"-",
">",
"C",
",",
"and",
"914C",
"-",
"-",
">",
"A",
"-",
"-",
"were",
"identified",
"in",
"the",
"coding",
"sequence",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"693C",
"-",
"-",
">",
"A",
"and",
"914C",
"-",
"-",
">",
"A",
"base",
"changes",
",",
"resulting",
"in",
"nonsense",
"tyr231",
"-",
"-",
">",
"ter",
"and",
"missense",
"ala305",
"-",
"-",
">",
"glu",
"mutations",
",",
"respectively",
",",
"lead",
"to",
"complete",
"loss",
"of",
"ASPA",
"activity",
"in",
"in",
"vitro",
"expression",
"studies",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"854A",
"-",
"-",
">",
"C",
"transversion",
"converted",
"glu",
"to",
"ala",
"in",
"codon",
"285",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"glu285",
"-",
"-",
">",
"ala",
"mutant",
"ASPA",
"has",
"2",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"5",
"%",
"of",
"the",
"activity",
"expressed",
"by",
"the",
"wild",
"-",
"type",
"enzyme",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"A",
"fourth",
"mutation",
",",
"433",
"-",
"-",
"2",
"(",
"A",
"-",
"-",
">",
"G",
")",
"transition",
",",
"was",
"identified",
"at",
"the",
"splice",
"-",
"acceptor",
"site",
"in",
"intron",
"2",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"splice",
"-",
"site",
"mutation",
"would",
"lead",
"to",
"skipping",
"of",
"exon",
"3",
",",
"accompanied",
"by",
"a",
"frameshift",
",",
"and",
"thus",
"would",
"produce",
"aberrant",
"ASPA",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Of",
"the",
"128",
"unrelated",
"Canavan",
"chromosomes",
"analyzed",
",",
"88",
"were",
"from",
"probands",
"of",
"Ashkenazi",
"Jewish",
"descent",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"glu285",
"-",
"-",
">",
"ala",
"mutation",
"was",
"predominant",
"(",
"82",
".",
"9",
"%",
")",
"in",
"this",
"population",
",",
"followed",
"by",
"the",
"tyr231",
"-",
"-",
">",
"ter",
"(",
"14",
".",
"8",
"%",
")",
"and",
"433",
"-",
"-",
"2",
"(",
"A",
"-",
"-",
">",
"G",
")",
"(",
"1",
".",
"1",
"%",
")",
"mutations",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"three",
"mutations",
"account",
"for",
"98",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"8",
"%",
"of",
"the",
"Canavan",
"chromosomes",
"of",
"Ashkenazi",
"Jewish",
"origin",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"ala305",
"-",
"-",
">",
"glu",
"mutation",
"was",
"found",
"exclusively",
"in",
"non",
"-",
"Jewish",
"probands",
"of",
"European",
"descent",
"and",
"constituted",
"60",
"%",
"of",
"the",
"40",
"mutant",
"chromosomes",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Predominant",
"occurrence",
"of",
"certain",
"mutations",
"among",
"Ashkenazi",
"Jewish",
"and",
"non",
"-",
"Jewish",
"patients",
"with",
"Canavan",
"disease",
"would",
"suggest",
"a",
"founding",
"-",
"father",
"effect",
"in",
"propagation",
"of",
"these",
"mutant",
"chromosomes"
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Intelligence",
"quotient",
"profile",
"in",
"myotonic",
"dystrophy",
",",
"intergenerational",
"deficit",
",",
"and",
"correlation",
"with",
"CTG",
"amplification",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"An",
"abbreviated",
"Wechsler",
"Adult",
"Intelligence",
"Scale",
"Revised",
"(",
"WAIS",
"-",
"R",
")",
"was",
"used",
"to",
"assess",
"verbal",
"and",
"arithmetical",
"cognitive",
"performance",
"in",
"55",
"subjects",
"with",
"myotonic",
"dystrophy",
"(",
"DM",
")",
",",
"covering",
"all",
"grades",
"of",
"disease",
"severity",
",",
"and",
"31",
"controls",
"at",
"50",
"%",
"risk",
"of",
"inheriting",
"DM",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O"
] |
[
"Scaled",
"scores",
"from",
"the",
"assessment",
"were",
"converted",
"into",
"an",
"intelligence",
"quotient",
"(",
"IQ",
")",
"estimation",
"on",
"each",
"person",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Significant",
"IQ",
"differences",
"were",
"found",
"between",
"(",
"1",
")",
"all",
"55",
"DM",
"subjects",
"(",
"mean",
"90",
".",
"2",
",",
"SD",
"16",
".",
"1",
")",
"and",
"31",
"controls",
"(",
"102",
".",
"6",
",",
"SD",
"9",
".",
"4",
")",
",",
"with",
"no",
"sex",
"differences",
"in",
"either",
"group",
";",
"(",
"2",
")",
"15",
"affected",
"parents",
"(",
"99",
".",
"3",
",",
"SD",
"12",
".",
"2",
")",
"and",
"their",
"affected",
"children",
"(",
"88",
".",
"1",
",",
"SD",
"17",
".",
"2",
")",
",",
"where",
"significance",
"was",
"dependent",
"on",
"parental",
"sex",
"being",
"female",
";",
"and",
"(",
"3",
")",
"15",
"pairs",
"of",
"affected",
"sibs",
"(",
"89",
".",
"6",
",",
"SD",
"13",
".",
"2",
")",
"and",
"their",
"normal",
"sibs",
"(",
"100",
".",
"2",
",",
"SD",
"7",
".",
"6",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"IQ",
"steadily",
"declined",
"as",
"(",
"1",
")",
"the",
"age",
"of",
"onset",
"of",
"signs",
"and",
"symptoms",
"decreased",
",",
"and",
"(",
"2",
")",
"the",
"CTG",
"expansion",
"size",
"increased",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"correlation",
"appeared",
"to",
"be",
"more",
"linear",
"with",
"age",
"of",
"onset",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"correlation",
"of",
"IQ",
"difference",
"and",
"CTG",
"expansion",
"difference",
"in",
"both",
"the",
"DM",
"parent",
"-",
"child",
"pairs",
"and",
"normal",
"sib",
"-",
"affected",
"sib",
"pairs",
"was",
"poor",
",",
"indicating",
"that",
"CTG",
"expansion",
"is",
"not",
"a",
"reliable",
"predictor",
"of",
"IQ",
"either",
"in",
"individual",
"persons",
"or",
"families",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Further",
"analysis",
"of",
"cognitive",
"function",
"in",
"DM",
"is",
"required",
"to",
"clarify",
"specific",
"deficits",
"characteristic",
"of",
"this",
"patient",
"group"
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Adenomatous",
"polyposis",
"coli",
"and",
"a",
"cytogenetic",
"deletion",
"of",
"chromosome",
"5",
"resulting",
"from",
"a",
"maternal",
"intrachromosomal",
"insertion",
"."
] |
[
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"present",
"the",
"clinical",
"and",
"laboratory",
"findings",
"in",
"an",
"institutionalised",
"adult",
"patient",
"originally",
"referred",
"for",
"autism",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O"
] |
[
"A",
"high",
"risk",
"of",
"colorectal",
"cancer",
"was",
"predicted",
"when",
"an",
"interstitial",
"deletion",
"of",
"the",
"long",
"arm",
"of",
"chromosome",
"5",
",",
"del",
"(",
"5",
")",
"(",
"q15q22",
".",
"3",
")",
",",
"was",
"detected",
"in",
"her",
"lymphocytes",
"and",
"deletion",
"of",
"the",
"MCC",
"and",
"APC",
"genes",
"confirmed",
"by",
"molecular",
"analysis",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Adenomatous",
"polyposis",
"coli",
"and",
"carcinoma",
"of",
"the",
"rectum",
"were",
"subsequently",
"diagnosed",
"in",
"the",
"patient",
"."
] |
[
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"She",
"was",
"profoundly",
"mentally",
"retarded",
",",
"autistic",
",",
"and",
"had",
"minor",
"dysmorphic",
"features",
"consistent",
"with",
"those",
"of",
"previous",
"patients",
"with",
"similar",
"deletions",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"deletion",
"arose",
"as",
"a",
"result",
"of",
"recombination",
"within",
"the",
"small",
"insertion",
"loop",
"formed",
"at",
"meiosis",
"by",
"the",
"direct",
"insertion",
"(",
"dir",
"ins",
"(",
"5",
")",
"(",
"q22",
".",
"3q14",
".",
"2q15",
")",
")",
"found",
"in",
"the",
"patients",
"mother",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"This",
"family",
"further",
"confirms",
"the",
"cytogenetic",
"mapping",
"of",
"both",
"MCC",
"and",
"APC",
"genes",
"to",
"5q22",
"and",
"comparison",
"with",
"other",
"recent",
"cases",
"suggests",
"that",
"both",
"genes",
"and",
"their",
"closely",
"linked",
"markers",
"lie",
"within",
"the",
"5q22",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"1",
"subband"
] |
[
"O",
"O"
] |
[
"Familial",
"male",
"breast",
"cancer",
"is",
"not",
"linked",
"to",
"the",
"BRCA1",
"locus",
"on",
"chromosome",
"17q",
"."
] |
[
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Breast",
"cancer",
"in",
"men",
"is",
"about",
"a",
"hundredfold",
"less",
"common",
"than",
"in",
"women",
"and",
"this",
"has",
"hindered",
"research",
"into",
"its",
"genetic",
"basis",
"."
] |
[
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"have",
"examined",
"22",
"families",
"with",
"at",
"least",
"one",
"case",
"of",
"male",
"breast",
"cancer",
"for",
"linkage",
"to",
"the",
"hereditary",
"breast",
"and",
"ovarian",
"cancer",
"locus",
",",
"BRCA1",
",",
"on",
"chromosome",
"17q",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"found",
"strong",
"evidence",
"against",
"linkage",
"to",
"BRCA1",
"(",
"lod",
"score",
"-",
"16",
".",
"63",
")",
"and",
"the",
"best",
"estimate",
"of",
"the",
"proportion",
"of",
"linked",
"families",
"was",
"0",
"%",
"(",
"95",
"%",
"CI",
"0",
"-",
"18",
"%",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Our",
"results",
"indicate",
"that",
"there",
"is",
"a",
"gene",
"(",
"s",
")",
"other",
"than",
"BRCA1",
"which",
"predisposes",
"to",
"early",
"-",
"onset",
"breast",
"cancer",
"in",
"women",
"and",
"which",
"confers",
"a",
"higher",
"risk",
"of",
"male",
"breast",
"cancer",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O"
] |
[
"Identification",
"of",
"additional",
"pedigrees",
"that",
"include",
"cases",
"of",
"male",
"breast",
"cancer",
"may",
"therefore",
"facilitate",
"the",
"mapping",
"and",
"isolation",
"of",
"this",
"gene",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"EWS",
"gene",
",",
"involved",
"in",
"Ewing",
"family",
"of",
"tumors",
",",
"malignant",
"melanoma",
"of",
"soft",
"parts",
"and",
"desmoplastic",
"small",
"round",
"cell",
"tumors",
",",
"codes",
"for",
"an",
"RNA",
"binding",
"protein",
"with",
"novel",
"regulatory",
"domains",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"EWS",
"gene",
",",
"which",
"maps",
"to",
"band",
"q12",
"of",
"human",
"chromosome",
"22",
",",
"is",
"involved",
"in",
"a",
"wide",
"variety",
"of",
"human",
"solid",
"tumors",
"including",
"Ewing",
"sarcoma",
",",
"related",
"primitive",
"neuroectodermal",
"tumors",
",",
"malignant",
"melanoma",
"of",
"soft",
"parts",
"and",
"desmoplastic",
"small",
"round",
"cell",
"tumors",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O"
] |
[
"In",
"these",
"tumors",
",",
"the",
"EWS",
"is",
"fused",
"to",
"genes",
"encoding",
"transcriptional",
"activators",
"/",
"repressors",
",",
"like",
"Fli",
"-",
"1",
"or",
"erg",
"or",
"ATF",
"1",
"or",
"wt1",
"."
] |
[
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"To",
"better",
"understand",
"the",
"function",
"of",
"the",
"EWS",
"protein",
",",
"we",
"cloned",
"the",
"EWS",
"cDNA",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Sequence",
"analysis",
"of",
"this",
"cDNA",
"revealed",
"differential",
"splicing",
"involving",
"two",
"exons",
"encoding",
"72",
"amino",
"acids",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Both",
"alternatively",
"spliced",
"transcripts",
",",
"EWS",
"and",
"EWS",
"-",
"b",
",",
"are",
"expressed",
"in",
"a",
"variety",
"of",
"cells",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Because",
"EWS",
"proteins",
"contain",
"putative",
"conserved",
"RNA",
"binding",
"motifs",
",",
"we",
"studied",
"the",
"RNA",
"binding",
"properties",
"of",
"the",
"EWS",
"protein",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"EWS",
"-",
"b",
"protein",
"binds",
"to",
"RNA",
"in",
"vitro",
"and",
",",
"specifically",
",",
"to",
"poly",
"G",
"and",
"poly",
"U",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"RNA",
"binding",
"activity",
"was",
"localized",
"to",
"the",
"carboxy",
"terminal",
"86",
"amino",
"acids",
",",
"which",
"constitute",
"RGG",
"box",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Thus",
"the",
"amino",
"terminal",
"domain",
"of",
"EWS",
"(",
"NTD",
"-",
"EWS",
")",
",",
"which",
"is",
"involved",
"in",
"chromosome",
"translocation",
"may",
"regulate",
"the",
"specificity",
"of",
"RNA",
"binding",
"activity",
"of",
"EWS",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"An",
"EWS",
"-",
"erg",
"chimeric",
"protein",
",",
"which",
"is",
"found",
"in",
"Ewings",
"sarcoma",
"cells",
",",
"functions",
"as",
"a",
"transcriptional",
"activator",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Mutational",
"analysis",
"of",
"EWS",
"-",
"erg",
"chimeric",
"protein",
"revealed",
"that",
"NTD",
"-",
"EWS",
"functions",
"as",
"a",
"regulatory",
"domain",
"for",
"the",
"transcriptional",
"activation",
"properties",
"of",
"EWS",
"-",
"erg",
"chimeric",
"protein",
".",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Canavan",
"disease",
":",
"genomic",
"organization",
"and",
"localization",
"of",
"human",
"ASPA",
"to",
"17p13",
"-",
"ter",
"and",
"conservation",
"of",
"the",
"ASPA",
"gene",
"during",
"evolution",
"."
] |
[
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Canavan",
"disease",
",",
"or",
"spongy",
"degeneration",
"of",
"the",
"brain",
",",
"is",
"a",
"severe",
"leukodystrophy",
"caused",
"by",
"the",
"deficiency",
"of",
"aspartoacylase",
"(",
"ASPA",
")",
"."
] |
[
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Recently",
",",
"a",
"missense",
"mutation",
"was",
"identified",
"in",
"human",
"ASPA",
"coding",
"sequence",
"from",
"patients",
"with",
"Canavan",
"disease",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DISEASE",
"I-DISEASE",
"O"
] |
[
"The",
"human",
"ASPA",
"gene",
"has",
"been",
"cloned",
"and",
"found",
"to",
"span",
"29",
"kb",
"of",
"the",
"genome",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Human",
"aspartoacylase",
"is",
"coded",
"by",
"six",
"exons",
"intervened",
"by",
"five",
"introns",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"exons",
"vary",
"from",
"94",
"(",
"exon",
"III",
")",
"to",
"514",
"(",
"exon",
"VI",
")",
"bases",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"exon",
"/",
"intron",
"splice",
"junction",
"sites",
"follow",
"the",
"gt",
"/",
"ag",
"consensus",
"sequence",
"rule",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Southern",
"blot",
"analysis",
"of",
"genomic",
"DNA",
"from",
"human",
"/",
"mouse",
"somatic",
"cell",
"hybrid",
"cell",
"lines",
"localized",
"ASPA",
"to",
"human",
"chromosome",
"17",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"human",
"ASPA",
"locus",
"was",
"further",
"mapped",
"in",
"the",
"17p13",
"-",
"ter",
"region",
"by",
"fluorescence",
"in",
"situ",
"hybridization",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
Subsets and Splits
No community queries yet
The top public SQL queries from the community will appear here once available.